odkaz ke stažení
Transkript
odkaz ke stažení
Obsah ČESKÁ ČÁST EDITORIAL 4 Editorial (L. Nátr) 4 Pár slov úvodem k nadcházejícímu roku (J. Albrechtová) 5 Post scriptum elongatum (J. Krekule) 6 Pozvánka na X. sjezd Česke Botanické společnosti (L. Hrouda) 6 AKTUÁLNÍ ZPRÁVY ČSEBR 7 CELOSTÁTNÍ SEMINÁŘ POŘÁDANÝ POŘÁDANÝ K 70. NAROZENINÁM JANA GLOSERA 9 Úvodem – několik souvislostí (L. Nátr) 9 Pozvánka/program 10 Cesty a křižovatky – stručný přehled odborné činnosti prof. Glosera (M. Barták) 11 Přání pro prof. Dr. Jana Glosera k jeho sedmdesátinám (M. Rychnovská) 12 Přání J. Gloserovi od členů ČSEBR (L. Nátr) 13 Přání J. Gloserovi od Katedry experimentální biologie rostlin PřF UK spolupořádající seminář (J. Albrechtová) 13 Jak může fyziologie rostlin přispět k řešení ekologických problémů v polárních oblastech? (J. Gloser) 14 Ekologická úloha sinic a řas v polárních ekosystémech (J. Elster) 16 Klima Antarktidy - které faktory je formují? Proč je tak extrémní a současně časoprostorově stabilní? Jsou jeho změny zneužitelné? (P. Prošek) 19 Co nejvíce omezuje antarktické rostliny? Chlad, mráz, nedostatek vody, živin či proměnlivé záření? (M. Barták) 21 DEN FASCINACE ROSTLINAMI 22 První ročník Dne fascinace rostlinami přilákal v ČR tisíce návštěvníků (J. Kolář) 22 „Kouzlo a moc světa rostlin“ – akce v Botanické zahradě PřF UK v Praze (18.-19.5.2012) (J. Albrechtová) 23 Fotogalerie Dne fascinace rostlinami – akce „Kouzlo a moc světa rostlin“ v Botanické zahradě PřF UK v Praze 24 OCENĚNÁ KNIHA „PŘÍRODA NEBO ČLOVĚK? SLUŽBY EKOSYSTÉMŮ“ LUBOMÍRA NÁTRA (J. Albrechtová) 27 LAUDATIO: Lubomír Nátr: „Příroda, nebo člověk? Služby ekosystémů“, Nakladatelství Karolinum, 2011 (F. Vyskočil) 30 VZPOMÍNÁME 32 Vzpomínka na D. Dykyjovou (J. Květ) 32 Vzpomínka na J. Slavíkovou (O. Votrubová, A. Skalická ) 34 OBHÁJENÉ DISERTAČNÍ A DIPLOMOVÉ PRÁCE 36 ANGLICKÁ ČÁST CANDIDACY TO HOST THE THE PLANT BIOLOGY CONGRESS IN PRAGUE IN 2016 2016 40 Invitation and the Letter of Intent (J. Albrechtová) 40 Local Proposing Committee 42 Guarant International – Congress Organizing Company 45 th THE 10 INTERNATIONAL Ph.D. STUDENT CONFERENCE ON ON EXPERIMENTAL PLANT BIOLOGY - BOOK OF ABSTRACTS 47 Welcome Letter (B. Vyskot) 48 Welcome Address from CSEPB (J. Albrechtová) 50 Czech Society of Experimental Plant Biology: Presentation 51 Commitee 52 Sponsors 53 Invited Talks 53 Conference Venue 54 Programme 55 Abstracts - Invited Talks 58 Abstracts - Oral Presentation 62 Abstracts - Sponsor Talks 90 Abstracts - Posters 92 List of Participants 120 1 Contents CZECH PART EDITORIAL 4 Editorial (L. Nátr) 4 Few words to comming year's events (J. Albrechtová) 5 Post scriptum elongatum (J. Krekule) 6 Invitation to the X Convention of the Czech Botanical Society (L. Hrouda) 6 NEWS OF CSEPB 7 SEMINAR „Ecological plant physiology - research in polar regions“ devoted to J. GLOSER on occasion of his 70th anniversary 9 Introduction – few associations (L. Nátr) 9 th Invitation/programme 10 Roads and Cross Roads – brief overview of scientific contribution of Prof. Gloser (M. Barták) 11 Congratulation to prof. Dr. Jan Gloser to his 70th anniversary (M. Rychnovská) 12 Congratulation to J. Gloser from CSEPB (L. Nátr) 13 Congratulation to J. Gloser from the Department of Experimental Plant Biology co-organizing the seminar (J. Albrechtová) 13 How can plant physiology contribute to solution of ecological problems in polar regions? (J. Gloser) 14 Ecological role of cyanobacteria and algae in polar regions (J. Elster) 16 Climate of Antarctida – what factors determine it? Why is the Antarctic climate so extreme and simultaneously so spacial-time stabile? Are its changes misusable? (P. Prošek) 19 What is the most limiting for Antarctic plants? Cold, frost, water or nutrient deficiencies or changeable irradiation? (M. Barták) 21 FASCINATION OF PLANT S DAYS 22 The first year of Fascination of Plants Days attracted thousands of visitors in the Czech Republic (J. Kolář) 22 „The Magic and Power of Plant Kingdom“ – action organized in the Botanical Garden of the Faculty of Science of Charles University in Prague (18-19 May 2012) (J. Albrechtová) 23 Photogallery 24 AWARDED BOOK „NATURE OR MAN? SERVICES OF ECOSYSTEMS“ of LUBOMÍR NÁTR (J. Albrechtová) 27 LAUDATIO: Lubomír Nátr: „NATURE OR MAN? SERVICES OF ECOSYSTEMS “, Karolinum, 2011 (F. Vyskočil) 30 REMEMBRANCE 32 Remembrance of D. Dykyjová (J. Květ) 32 Remembrance of J. Slavíková (O. Votrubová, A. Skalická ) 34 RECENTLY DEFENDED Ph.D. and Master THESES 36 ENGLISH PART CANDIDACY TO HOST THE THE PLANT BIOLOGY CONGRESS IN PRAGUE IN 2016 2016 40 Invitation and the Letter of Intent (J. Albrechtová) 40 Local Proposing Committee 42 Guarant International – Congress Organizing Company 45 th THE 10 INTERNATIONAL Ph.D. STUDENT CONFERENCE ON ON EXPERIMENTAL PLANT BIOLOGY - BOOK OF ABSTRACTS 47 Welcome Letter (B. Vyskot) 48 Welcome Address from CSEPB (J. Albrechtová) 50 Czech Society of Experimental Plant Biology: Presentation 51 Commitee 52 Sponsors 53 Invited Talks 53 Conference Venue 54 Programme 55 Abstracts - Invited Talks 58 Abstracts - Oral Presentation 62 Abstracts - Sponsor Talks 90 Abstracts - Posters 92 List of Participants 120 2 ČESKÁ ČÁST CZECH PART 3 Editorial Milé kolegyně, vážení kolegové, zase mám to privilegium přivítat Vás v Úvodníku tohoto čísla Bulletinu České společnosti experimentální biologie rostlin. Skončilo pestré počasí letošního jara a pokračuje až neobyčejně rozmarné léto. S jistotou přijde podzim i zima, které s velkou pravděpodobností budou také projevovat netušené či už zapomenuté výkyvy, patrně nejen povětrnostní. Této pestrosti odpovídá i toto číslo Bulletinu. Důvodem není zvyšující se pestrost projevů troposférických jevů, ale bohatost činnosti naší profesní organizace. Dovolím si moc doporučit všem členům i trvalým či náhodným zájemcům o naši organizaci, aby toto číslo alespoň prolistovali. Mnozí zde najdou výrazné stopy svého podílu, jiní snad i podněty pro svoje aktivní zapojení. Úvodní kapitola je věnována tradičnímu půldennímu semináři, který dvakrát ročně organizuje ČSEBR společně s Katedrou experimentální biologie rostlin Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy v Praze. Letos v květnu byl tento seminář věnován 70. výročí narození Jana Glosera, absolventa a profesora fyziologie rostlin Přírodovědecké fakulty Masarykovy Univerzity v Brně. Z bohaté tematické šíře vědeckých aktivit Jana Glosera jsme vybrali výsledky studia rostlin v podmínkách polárních oblastí. Pro mnohé z nás jednotliví přednášející postupně bořili představy o chudosti vyšších i nižších rostlin v těchto extrémních podmínkách. Ostatně podrobnosti jsou v následující kapitole uvedeny. Další kapitolu tvoří „Fascinace rostlinami“. Osobně bych slovo „fascinace“ nahradil více českým výrazem, ale uvědomuji si riziko svého seniorského vyjadřovacího staromilství. Na druhé straně takto tomuto slovu rozumějí i ti, pro které už to druhé slovo znamená cokoliv, tedy nic. Tato „veleakce“ v národním i mezinárodním měřítku si rozhodně zaslouží pozornost našich členů. Je to celosvětově organizovaná snaha ukázat veřejnosti nejrůznější aspekty nenahraditelnosti rostlin. Zvláštní pozornost je přitom věnována mladé generaci s cílem, aby zkusili vstoupit do kouzel věd o rostlinách. Ostatně mnozí jste se osobně aktivně zúčastnili, ostatní si aspoň pročtěte tu kapitolu. Pro většinu členů ČSEBR může být překvapivá další kapitola, kde je seznamujeme s dosavadními aktivitami zaměřenými na konání Konference European Federation of Experimental Plant Biology Societies v naší republice v roce 2016. Mnozí si nepochybně pamatujeme první, a zatím jedinou, konferenci této Federace uspořádanou v roce 1994 v Brně. Byla to velmi úspěšná konference a snad bychom na ni neméně úspěšně mohli navázat i touto další. Samozřejmě, způsob vlastní organizace takového setkání je dnes diametrálně odlišný od způsobů, které pamatují příslušníci starší a nejstarší generace. Profesionální firmy kvalifikovaně zajišťují většinu nevědeckých činností. Ovšem i tak toho zbývá na vlastní práci vědeckých pracovníků nemálo. Přitom jsme si vědomi, že uspořádání velké konference „doma“ má svoje nevýhody: Za prvé již zmíněná nemalá část práce a času na úkor vlastní výuky a vědy, za druhé pak absence cesty do turisticky zajímavé lokality. Ale dovolím si připomenout i nepominutelné kladné stránky, z nichž k nezaplacení bývá návštěva zahraničních kolegů v našich laboratořích a také objevná prezentace úrovně vlastní vědy nebo i architektury, dějin a kultury. Zase doporučuji k seznámení se s jednotlivými částmi příslušné kapitoly. A pokud to kohokoliv podnítí k aktivní účasti při organizaci, bude vítán či vítána. Samozřejmě za předpokladu, že letošní kongres FESPB konaný v červenci nám tuto organizaci pro rok 2016 přidělí. Také další kapitola si zaslouží Vaši dobrou pozornost – „Dny mladých“, které se letos budou konat v Brně. Abstrakta publikovaná v této části Bulletinu mohou leckoho zaujmout možností nové spolupráce, získání nového člena nebo členky výzkumného týmu nebo třeba 4 Editorial i jen podněty pro pozvání některých doktorandů k přednášce na katedrovém či ústavním semináři. Z tradičních, byť už spíše zádumčivých, oblastí připomínám vzpomínku na paní Dr. Dagmar Dykyjovou a paní doc. Zdeňku Slavíkovou. Sám ještě připojuji zprávu, že v závěru loňského roku také zemřel profesor Z. Laštůvka, dlouholetý vedoucí Katedry fyziologie rostlin Přírodovědecké fakulty tehdejší Univerzity J. U. Purkyně (nyní Masarykova) v Brně. Jakkoliv vzpomínky mnoha jeho studentů nejsou vždy jednoznačné (ostatně, kdy bývají?), tak snad se v příštím čísle Bulletinu objeví podrobnější informace. Přeci jen ve své době vypracoval na své katedře vynikající systémy hydroponického pěstování rostlin se zajímavými výsledky z oblasti minerální výživy rostlin atd. Poměrně velmi chudá je kapitola informující o obhájených diplomových a disertačních pracích. Proč asi nemáme zájem o tuto propagaci? Snad mě tento stručný přehled tohoto čísla Bulletinu opravňuje k tvrzení, že pestrost výkyvů počasí jakoby korelovala s košatostí aktivit naší profesní organizace. Prosím, nahlédněte podrobněji do jednotlivých kapitol. Snad mi pak dáte za pravdu i v tom, že můj úvod je jen vybledlým stínem barevné košatosti života České společnosti experimentální biologie rostlin. Krásné léto. Také podzim. A pak zimu a nové začátky. Červen 2012. Lubomír Nátr Vážení a milí, dovolte mi pár drobných poznámek úvodem motivovaných úhlem pohledu do budoucna. V příštím roce 2013 se bude konat 11. Konference experimentální biologie rostlin (11. KEBR) na Univerzitě Pavla Jozefa Šafárika v Košicích na Slovensku pod vedením prof. Miroslava Repčáka. Dny studentů v oboru experimentální biologie rostlin v r. 2013 „The 11th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology“ budou organizovány jako doprovodná konference 11. KEBR v Košicích a organizační pomoc košickým kolegům předběžně přislíbili i bratislavští kolegové z Univerzity Komenského pod vedením Alexandra Luxe. Doufám, že od slovenských kolegů již brzy budeme vědět data konání a že se sejdeme ve velkém počtu na obě dvě akce. Letošní 10. konference studentů se koná v Brně pod taktovkou Borise Vyskota a konference se účastní přes 120 účastníků (!). Je to nesmírně potěšivé – děkujeme brněnským organizátorům! Laťku se podařilo dát hodně vysoko, jak uvidíte ze sborníku akce v tomto čísle Bulletinu ČSEBR a FS SBS, a přejeme organizátorům v příštím roce, aby se jim dařilo neméně. V letošním roce uplyne 155 let od světově první habilitace v oboru rostlinné fyziologie, habilitace Julia von Sachse na tehdejší Karlo-Ferdinandově univerzitě v Praze. ČSEBR se snaží toto výročí připomenout i pro popularizaci našeho oboru. Uvítáme vaše zapojení – více v Aktualitách ČSEBR v tomto čísle. Česká botanická společnost, ze které naše společnost vzešla, letos slaví 100. výročí svého založení. Její předseda, Lubomír Hrouda, nám tlumočí pozvání na jubilejní X. sjezd ČBS – je na následující straně hned za úvodníkem Jana Krekuleho. Snad je předzvěstí užší spolupráce rostlinných biologů v obou vědeckých společnostech. Jistě mohu za členy ČSEBR tlumočit ČBS přání hodně zdaru a vzkaz, že jsme otevřeni spolupráci a těšíme se na společná setkání. Ať se daří! Jana Albrechtová 5 Editorial Post scriptum elongatum Oproti dřívějším žánrům doprovodných textů Lubošových úvodníků jsem zvolil, milé kolegyně a milí kolegové, tuhle nestandardní formu. Lépe odpovídá připomínce (upomínce?), jíž mám na mysli. Je léto na jehož konci slaví naše mateřská organizace Česká botanická společnost sto let od svého založení. Téměř celou druhou polovinu minulého století jsme představovali jako Fyziologická sekce jeden z jejích údů. V podstatě poklidný epifytní vztah. Částečně cizorodý útvaru opírající se o mohutný kmen pravověrných botaniků. Méně administrování, pravda, i méně činnosti. Byly zaznamenány, zůstaňme u té terminologie, i jakési nesmělé mutualistické tendence. Občasný výskyt přednášky s fyziologickou tématikou v pravidelných podzimních či jarních cyklech ČBS. Někdy v osmdesátých letech i mezioborový seminář v objektu v Riegrových sadech, demonstrující společné či příbuzné zájmy metodologické i přesahy tematické. Celkem ani souznění, ani odcizování, občas pocit vzájemné inerce, která tak domácky specifickým způsobem oddělovala (odděluje?)pražská pracoviště horní (Viničná) od dolních (Benátská). Počátkem devadesátých let přišla do všech oblastí zasahující funkční diferenciace, abych si vypůjčil ze slovníku Václava Bělohradského. Narůstající autonomie, svébytnost jednotek státních, veřejného života, profesních, ale i nová dělení vědních území, specializace. A tak jsme rozdělili stát i vydělili fyziology. Nemnozí, jako pisatel, zůstali sedět na dvou židlích. Nešlo o koncepční či principiální důvody, ale pragmatický zájem zůstat ve spojení s těmi, kdož kromě jiného za rostlinami do přírody chodí, umí je pojmenovat a rádi o nich hovoří. Amatérský zájem. V roce 2008 vznikl v definitivní, tj. dnešní, podobě ČSEBR o jehož úspěšných aktivitách viz výše. Zatím tedy vše v pořádku. Ne tak docela. V mezidobí jsme se spíše přiblížili. Společně obcujeme s genomikou, na botanické straně se ve zvýšené míře vyskytují ekofyziologické etudy, společně používáme matematických modelů, lze pokračovat. Ten zvyšující se potenciál vzájemných podnětů a motivací je jistě využíván ve spolupráci na konkrétních projektech a nenutí k pseudoaktivitám zastřešujícím profesní organizace. V jedné věci máme ale společnou odpovědnost. Kdo jiný by měl veřejnosti demonstrovat (tiše dodávám i politikům) význam nejrůznějších aspektů života rostlin pro udržitelnou existenci našeho druhu, našeho prostředí, kdo jiný by měl verbovat mladé adepty ke studiu rostlin. Zní to banálně, ale není to banalita. Domnívám se, že by ČSEBR měla projevit více zájmu o dění u sousedů a koordinovat s nimi některé aktivity společenského zájmu, jejichž příklady nalezne čtenář i v tomto úvodníku. (Drobné varování: zatím se nepodařilo ani časově koordinovat konání jubilea ČBS s „našimi“ Dny mladých v Brně, vzájemně se ruší). V tuto chvíli popřejme naší matce ČBS úspěšné prožití jubilea, úspěchy v další práci a vyjádřeme ochotu podílet se na společné res publica botanica (neskloňuji). Osobně i poděkování, že nás občas kolegové „botanici“ z našich modelových situací vyvedou do reálné přírody. Jan Krekule Česká botanická společnost, jejíž součástí byla ČSEBR jako fyziologická sekce v létech 19721992, oslaví v letošním roce 100. výročí svého založení. Vrcholnou událostí jubilejního roku bude X. sjezd ČBS na téma „Nové poznatky o flóře a vegetaci střední Evropy a o jejich změnách“, který se uskuteční od 3. do 7. září 2012 v Praze. K datu sjezdu jsou směřována též jubilejní čísla mezinárodního vědeckého časopisu Společnosti Preslia a odborného biologického časopisu Živa. Preslia uveřejní zásadní články týkající se historie, přehledy flory a vegetace, inovovaný Červený seznam a Checklist české flóry. Čtvrté, rozšířené číslo letošní Živy se zabývá historií i současností botanických oborů, vlivem českých botaniků v minulosti ve světě i současnými projekty, kterými čeští vědci přispívají k výzkumu různých částí světa. Jak Preslia, tak Živa budou k zakoupení i samostatně. Více na http://web.natur.cuni.cz/CBS. Lubomír Hrouda 6 Aktuální zprávy ČSEBR Aktuality ČSEBR 1. ČSEBR spolupořádá dny mladých studentů v oboru experimentální biologie rostlin „The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology“. Letos se konají v Brně 3.-5. září pod patronací prof. Borise Vyskota. Hlavní pořadatel je Biofyzikální ústav AVČR, v.v.i., dále Biomania. Více od str. 47. 2. ČSEBR kandiduje na pořádání kongresu Plant Biology Congress FESPBFESPB -EPSO 2016. Kandidaturu vypracovává za výbor ČSEBR Jiří Šantrůček a Jana Albrechtová, jednotlivé kroky jsou konzultovány s Výborem ČSEBR. Pro kandidaturu byla zvolena v poptávkovém řízení firma GUARANT INTERNATIONAL s.r.o. Kandidatura byla prezentována na Plant Biology Congress, 28.7.-3.8. 2012 ve Freiburgu. Kandidatura byla podpořena primátorem Hlavního města Prahy panem doc. Bohuslavem Svobodou, děkanem Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy v Praze prof. Bohuslavem Gašem, rektorem České zemědělské univerzity prof. Jiřím Balíkem, ředitelem botanického ústavu AVČR, v.v.i. Dr. Miroslavem Vosátkou, ředitelem Ústavu experimentální botaniky AVČR, v.v.i. Dr. Martinem Vágnerem a rektorem Jihočeské Univerzity prof. Liborem Grubhofferem. Zkrácená verze kandidatury je dostupná na: http://www.csebr.cz/aktuality/soubory/kandidatura.pdf. Více na str. 40. 3. ČSEBR přispěla k Odhalení pamětní desky profesoru Bohumilu Němcovi v rodné obci Prasek. Dne 16.6. 2012 byla v rodné obci Prasek odhalena pamětní deska profesoru Bohumilu Němcovi, nestoru české a slovenské anatomie a fyziologie rostlin. ČSEBR podpořila tuto aktivitu i drobným finančním přispěním. Zástupcem naší vědecké oborové komunity byl na slavnostním aktu Jan Krekule, poslední doktorand profesora Němce. Na slavnosti byl též přítomen další člen naší společnosti Jaromír Kutík v zastoupení Katedry experimentální biologie rostlin PřF UK, který přečetl slavnostní zdravici od Jany Albrechtové. 4. ČSEBR se jako asociovaná společnost EPSO zapojila významně do organizace Dne (týdne) fascinace rostlinami 18.5.2012 organizovaného celoevropsky EPSO. Více na webu ČSEBR http://www.csebr.cz/ a oficiálních stránkách EPSO http://www.plantday12.eu/. ČSEBR je jednou ze signatářských společností MoU http://www.epsoweb.org/partnerships/relations. Za ČSEBR byli hlavními koordinátory v České republice Jan Kolář a Jana Albrechtová – o průběhu akce více na str. 22. 5. ČSEBR připomíná 155. výročí habilitace Julia von Sachse na tehdejší KarloKarloFerdinandově univerzitě v Praze, světově první habilitace v oboru rostlinné fyziologie. V r. 2011 ČSEBR nabídla zhotovit pamětní artefakt věnovaný Juliu von Sachsovi v prostorách či exteriéru PřF Univerzity Karlovy v Praze. PřF UK projevila o tento artefakt zájem a v současnosti je třeba dojednat podobu a umístění díla. V nadcházejícím období ČSEBR ocení sponzorské dary na zhotovení díla – jeho odhalení bude předpokládaně realizováno v r. 2013 – více na http://www.csebr.cz/sachs/index.html. Hlavním organizátorem této aktivity je Jan Krekule s podporou Jany Albrechtové. ČSEBR připravila na akci Dne Fascinace rostlinami konané v Botanické zahradě PřF UK v Praze stanoviště věnované Juliu von Sachsovi „Výlet k počátkům fyziologie rostlin: 7 Aktuální zprávy ČSEBR Víte, kde vznikla rostlinná fyziologie? V Praze!“. Julius Sachs žil v Praze v letech 1851–1859 v rodině Jana Evangelisty Purkyně. Za akcí stojí mladí členové ČSEBR Zuzana Kubínová, Stanislav Vosolsobě a Jan Martinek z Katedry experimentální biologie rostlin (KEBR) PřF UK a „tradiční“ členové Jan Kolář a Jan Krekule. Jan Kolář ve spolupráci s Janem Krekulem připravil článek o Juliu von Sachsovi na web PřF UK (http://www.prirodovedci.cz/biolog/clanky/vedni-obor-ktery-vznikl-v-praze-pribeh-julia-von-sachse): "Vědní obor, který vznikl v Praze. Příběh Julia von Sachse“. 6. Lubomír Nátr obdržel dvě prestižní ocenění za knihu "Příroda, nebo člověk? Služby ekosystémů" nakladatelství Karolinum: Cenu Josefa Hlávky za nejlepší knihu v oblasti živých věd v r. 2011 a Cenu rektora Univerzity Karlovy v Praze za nejlepší vědeckou publikaci v r. 2011. Více na str. 27 a na webu http://www.natur.cuni.cz/fakulta/aktuality/dve-oceneni-pro-knihu-profesora-natra-o-sluzbachekosystemu (Zprávu napsal Jan Kolář). Laudatio knihy napsal prof. František Vyskočil. Více na str. 30. 7. Další celostátní seminář ve Viničné pořádaný ČSEBR a Katedrou experimentální biologie rostlin PřF UK se bude konat 8. ledna 2013. Seminář chceme věnovat tématu: „Na cestě buněčné biologie rostlin – 80 let od narození prof. Karla Beneše“. Detaily o semináři budou uveřejněny na odkazu http:// kfrserver.natur.cuni.cz/studium/anatomie.html. 8. V příštím roce 2013 se budou konat 11. Dny experimentální biologie rostlin (11. KEBR) na Univerzitě Pavla Jozefa Šafárika v Košicích na Slovensku. Konference bude probíhat v rámci série konferencí našeho oboru, které jsou organizovány v centrech rostlinné biologie v České republice a na Slovensku a kterých je ČSEBR spoluorganizátorem. Štafetu předáváme z Prahy, kde se konala konference 10. KEBR v září 2010 (http://www.csebr.cz/kebr/index.htm). Organizaci přislíbili kolegové z Košic pod vedením prof. Miroslava Repčáka. 9. Dny mladých studentů v oboru experimentální biologie rostlin v r. 2013 „The 11th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology“ budou organizovány jako doprovodná konference 11. KEBR v Košicích. Kromě košických organizátorů pod vedením Miroslava Repčáka přislíbili pomoci i bratislavští kolegové z Univerzity Komenského pod vedením Alexandra Luxe. Novinky na webových stránkách ČSEBR Na webových stránkách společnosti (http://www.csebr.cz/index.html) můžete nahlédnout do aktualizované databáze členů (http://www.csebr.cz/csebr/clenove.html). Naleznete tam také kalendář konferencí a dalších důležitých událostí a zajímavých akcí, předchozí čísla Bulletinu ČSEBR FS SBS a rovněž Newsletter ČSEBR. Jste zváni k přispívání na webové stránky naší společnosti. Aktuality a zprávy k uveřejnění posílejte na [email protected] – správcem webu je Lenka Dvořáková. Komunikace uvnitř ČSEBR: Oznámení všem členům ČSEBR (o seminářích, akcích, atd.) je možno psát na hromadnou e-mailovou adresu: [email protected]. Hromadná adresa pro výbor ČSEBR je: [email protected], pro komunikaci s ČSEBR je e-mail: [email protected] administrovaný Hanou Ševčíkovou a Zuzanou Kubínovou. Pro komunikaci se studenty, kteří jsou členy ČSEBR, můžete použít adresu [email protected]. Pro zasílání informací pro aktualizaci webu a příspěvků do „Newsletteru“ společnosti používejte adresu [email protected] - administruje Lenka Dvořáková. Členské příspěvky Pokud jste tak ještě neučinili, prosíme o zaplacení ročních členských příspěvků (500 Kč / 250 Kč - studenti). Informace o stavu plateb a podklady k platbě (číslo účtu, variabilní symbol) naleznete na stránkách ČSEBR: http://www.csebr.cz/csebr/clenstvi.html. Seznam je aktualizován vždy na začátku čtvrtletí. Pokud by vás zajímala aktuálnější informace, neváhejte se obrátit na email: [email protected] a my vám rádi zodpovíme všechny otázky. 8 Seminář J. Glosera Úvodem – několik souvislostí Podle mnoha ohlasů se výbor České společnosti experimentální biologie rostlin i vedení Katedry experimentální biologie rostlin Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy v Praze domnívají, že půldenní semináře věnované významným osobnostem našich vědních oborů nebo atraktivním aktuálním tématům jsou vítaným a jedinečným příspěvkem do bohatého programu seminářů a konferencí. Letošní květnový seminář spojoval jak jubileum nepominutelné osobnosti rostlinné fyziologie – sedmdesátiny profesora Jana Glosera – tak i atraktivní téma – rostliny v podmínkách chladu, sněhu a ledu v polárních oblastech. Jako organizátoři jsme však chtěli podpořit další záměr. Zdá se nám, že vědecká či myšlenková vzdálenost mezi Brnem a Prahou je velmi proměnlivá. Často jsou to vzdálenosti prakticky nerozlišitelné od nulové, ale někdy ještě jako by obě významná vědecká centra byla lokalizována na různých kontinentech. Proto jsme chtěli, aby většinově „brněnská“ odborná náplň podpořená početnou přítomností moravských kolegů v Praze zazněla nepřehlédnutelným způsobem. Předchozím odstavcem jsem rozhodně nechtěl naznačit, že v době, kdy celý svět je na dosah ruky, tedy letadla a internetu, tak brněnští a pražští experimentální biologové rostlin se setkávají jen při náhodných toulkách nevýraznými cestičkami. Pokud se však v tomto ohledu zásadně mýlím, webové stránky ČSEBR i příští číslo tohoto Bulletinu je k disposici pro Vaše názory. Vše ostatní o tomto semináři je na dalších stránkách. Nechť Vás zaujmou! Lubomír Nátr Jan Gloser 9 Seminář J. Glosera - Pozvánka 10 Seminář J. Glosera Cesty a křižovatky – stručný přehled odborné činnosti prof. Glosera Úvodní slovo na Semináři ČSEBR k životnímu jubileu prof. Glosera Miloš Barták Tento příspěvek je spíše než přehledem vědecké kariéry prof. Jana Glosera volně komentovaným příběhem tak, jak si jej pamatuji z vlastní zkušenosti a z vyprávění Jana a jeho kolegů. Po absolvování vysoké školy se Jan na půdě Akademie věd začal specializovat na problematiku měření produkčních procesů u různých typů přirozené vegetace. Tak začal Janův celoživotní odborný příběh, ve kterém studium fotosyntézy a vodního provozu rostlin vždy hrálo důležitou roli. V té době se bezpochyby počala formovat i jeho láska k přístrojové měřicí technice, která ho v následujících letech doprovázela v mnoha odborných projektech. Na půdě tehdejšího Ekologického oddělení se sešel vynikající kolektiv zapálených pracovníků, který se zapojil především do dlouhodobého komplexního programu IBP (International Biological Program). V tomto období se utvářel další významný aspekt Janovy profesní dráhy, tj. jeho zaměření na ekologickou fyziologii rostlin. Předmětem jeho odborného zájmu byla tehdy fotosyntéza a produkce lučních porostů a rákosin. Samostatnou kapitolou jsou Janovy dlouhodobé pracovní pobyty na Kubě, kam se opakovaně vracel, aby na půdě Botanického ústavu Kubánské akademie věd vedl komplexní ekologický výzkum vegetace savan. Při výzkumu se spolu s kubánskými spolupracovníky zaměřil na detailní terénní mikroklimatická měření společně s měřeními fyziologických procesů dominantních druhů rostlin. Zároveň se během těchto pobytů věnoval i průzkumu endemických druhů, které se vyskytují v odlehlých částech Kuby, v lidskou činností nepozměněných přirozených ekosystémech. Během těchto terénních prací se rozvinula Janova další láska, utvářená již od jeho studentských let, a to poznávání a pěstování epifytních druhů rostlin včetně endemických orchidejí a bromelií, které se mu stalo celoživotním koníčkem. Zaměření na ekofyziologický výzkumu rostlin pokračovalo i po Janově přechodu z Akademie věd ČR na půdu Masarykovy univerzity v Brně. Na půdě Katedry fyziologie a anatomie rostlin, jejímž vedoucím se záhy stal, se zaměřil na vliv přirozeně i antropogenně acidifikovaných horských stanovišť na růst a rozvoj travní vegetace a semenáčků lesních dřevin. Projekt byl řešen jak v terénu (Moravskoslezské Beskydy), tak v řadě laboratorních experimentů probíhajících v řízených podmínkách prostředí. Cílem bylo kvantifikovat rychlost příjmu živin, zejména nitrátového a amonného dusíku, v podmínkách silně kyselých půd. V širším kontextu projekt přispíval k odhalení příčin hynutí lesních porostů a změn druhového složení vegetačního krytu na odlesněných plochách. Janův ekofyziologický přístup se plně uplatnil i ve studiu dalších odborných problémů, například při výzkumu vlivu zvýšené koncentrace CO2 v ovzduší na fotosyntézu, růst a produkci zemědělských plodin i volně rostoucích druhů rostlin. Rovněž matematické modelování produkce rostlin patří mezi jednu z méně známých Janových odborných cest, při nichž aplikoval zásady ekofyziologického výzkumu. Důležitou křižovatkou a následným přesměrováním odborného zájmu byl pro Jana konec devadesátých let, kdy dostává nabídku účastnit se mnohaoborového projektu zaměřeného na ekologii pobřežních deglaciovaných oblastí Antarktidy. V rámci tohoto projektu formuloval základy dlouhodobých ekofyziologických měření antarktických mechů a lišejníků a od roku 1999 se účastnil expedic do různých oblastí Antarktidy (King George Island, Galindez Island, James Ross Island).) Během terénních pobytů v Antarktidě se zaměřil na druhovou diverzitu vegetace a studium limitních faktorů fyziologických procesů lišejníků a mechů. Lišejníkům se věnoval i na opačné straně zeměkoule během dvou expedic do lokality Petunia Bukta na souostroví Svalbard. Je mi ctí a potěšením uvést, že právě Janovým odborným aktivitám na poli ekologické fyziologie polárních rostlin je věnován dnešní seminář ČSEBR, pořádaný na půdě Katedry experimentální biologie rostlin PřF UK. 11 Seminář J. Glosera PŘÁNÍ PRO PROF. Dr. JANA GLOSERA K JEHO SEDMDESÁTINÁM 15. května 2012 Milý pane profesore, když jsme se setkali začátkem 60. let na brněnském oddělení Botanického ústavu ČSAV, začínal Mezinárodní biologický program, který vnesl podstatné oživení ekologie do přírodních věd. Pojem ekosystém se stal zaklínadlem pro všechny terénní výzkumy, kterých jsme se s požehnáním SPZV (Stát. plán základního výzkumu) zúčastnili. Protože model ekosystému se odvíjel od primárních producentů, dala se obec botaniků do zkoumání rostlinné produkce. Odběry biomasy nadzemní i podzemní, energetické kalkulace byly metodicky schůdné a běžně prováděné, chyběly ovšem definice procesů, které tyto stavové jednotky vytvářely. Zde se otevřelo hřiště pro Vaše ekofysiologické postřehy a analýzy klíčových druhů v ekosystémech. Od stepní vegetace jsme se přesunuli k žírným loukám jižní Moravy a potom k podhorským loukám u Kameniček. Ve všech těchto biotopech jste kladl diskrétní otázky dominantním travám a získával odpovědi o jejich ekologické stratégii, proč jsou úspěšné právě zde. Ke knižním syntézám našich projektů jste přispíval vždy kauzalitou vztahů mezi vnějšími faktory a vlastnostmi určujících dominant, což našim výzkumům dodávalo věrohodnosti. Při dnešním jubilejním semináři musím vzpomenout s díkem na Vaši vždy perfektní luční spolupráci, která sice předcházela Vaší sukulentní i antarktickou etapu, ale stala se podnes etalonem pro mnoho dalších ekosystémových studií. Ekologická fysiologie je totiž velmi vzácné koření a nauka o „whole plant physiology“ zmizela pod přílivem molekulárních metod dnes už téměř úplně. Snad se v budoucnu objeví ještě zájem o život rostlin v moderní podobě, jak jej kdysi hlásal Molisch (Pflanzenphysiologie als Grundlage der Gärtnerei), u nás Bohumil Němec a Vladimír Úlehla a přeji Vám kromě radosti z poznávání také radost z rozdávání naší milé nauky o životě rostlin, kterou nepochybně naše ekofysiologie rostlin je a bude. Toto povídání, spolu s přáním stále stimulačního domácího zázemí, Vám posílá k Vašemu životnímu jubileu Milena Rychnovská Jan Gloser 12 Přání Milý Honzo, blahopřejeme Ti k letošnímu životnímu jubileu také jménem členů České společnosti experimentální biologie rostlin. Dovolujeme si vyjádřit Ti uznání za obdivuhodný objem a kvalitu publikací, jichž jsi autorem. Chceme při této příležitosti připomenout Tvoje vynikající popularizující práce. Tvým houževnatým přičiněním se nejen odborná komunita ale i zvídavá veřejnost může dovídat o neznámých oblastech blízko pólů, ale zejména o tom, jak to tam kdesi v mrazu a sněhu ty rostliny zvládly, zvládají a zvládat nepochybně budou. Při příležitosti dnešního vědeckého semináře, který by prostě bez Tebe a Tvého díla nebyl, Ti přejeme zdraví, osobní pohodu a nikdy nekončící vědeckou tvůrčí zvídavost. Lubomír Nátr Jménem České společnosti experimentální biologie rostlin Vážený pane profesore, členové a studenti Katedry experimentální biologie rostlin Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy si Vám dovolují blahopřát k Vašemu významnému životnímu jubileu. Sedmdesátiny jsou více než dostatečným důvodem pro každého člověka, aby si je v pohodové atmosféře oslavil v kruhu své rodiny a se svými přáteli. Sedmdesátiny významného vědce jsou pak jedinečnou příležitostí, aby také jeho kolegyně a kolegové mu upřímně blahopřáli. V tomto případě to není jen blahopřání, ale také vyjádření poděkování a uznání k Vaší vědecké práci, která se věnovala převážně ekofyziologickému výzkumu. Vnímáme Vaši osobnost jako jednoho z významných představitelů sesterské katedry na Masarykově Univerzitě v Brně. Přejeme Vám dobré zdraví, radost i pohodu v osobním životě. Jana Albrechtová Jménem Katedry experimentální biologie rostlin PřF UK v Praze 13 Seminář J. Glosera Jak může fyziologie rostlin přispět k řešení ekologických problémů v polárních oblastech? Jan Gloser Polární oblasti, tedy rozsáhlá bezlesá území za polárním kruhem na severní i jižní polokouli, působí na první pohled velmi pustě a pro biologa vcelku nezajímavě. Přesto zájem o jejich výzkum má stále stoupající tendenci. Jsou zde totiž zachovalá původní společenstva vysoce odolných organismů v přehledně organizovaných ekosystémech, což usnadňuje jak poznávání základních ekologických vztahů, tak i indikaci možných globálních změn klimatu. Výzkum terestrických ekosystémů jižních polárních oblastí je omezen na plošně velmi úzké nezaledněné okraje antarktického kontinentu, které kromě extrémně malé druhové rozmanitosti jsou i velmi obtížně dostupné. Proto naprostá většina ekologických prací s polární tématikou byla a stále je soustředěna do severních oblastí, označovaných souhrnným názvem Arktida. Velká část Arktidy je sice také zaledněna, přesto na severních výběžcích přiléhajících kontinentů se nalézají velmi rozsáhlé plochy specifického biomu polární tundry. Tundrová společenstva rostlin i jiných organismů jsou přitom rozmanitější na severním okraji amerického kontinentu než na severu Eurasie, což je do značné míry podmíněno rozdílností orografickou a klimatickou. Systematický průzkum rostlinstva Arktidy probíhal již v 19. století. Na floristiku velmi záhy navazovaly studie fytogeografické, které postupně svým záběrem přesahovaly tradiční zjišťování areálů rozšíření jednotlivých druhů a vedly až k popisu gradientů druhové diversity a typů morfologických adaptačních znaků v závislosti na stoupající zeměpisné šířce a na lokálním (azonálním) typu prostředí. To už byl jen krůček ke skutečným ekologickým výzkumům, které lze datovat zhruba od počátku 20. století, při kterých byly již velmi podrobně zkoumány vazby mezi výskytem a prosperitou jednotlivých druhů, populací či společenstev polární tundry a faktory prostředí. Ekologický výzkum, a to nejen v polárních oblas- tech, měl zprvu čistě observační charakter. Avšak ani velké soubory terénních dat hodnocené sofistikovanou matematickou analýzou nedávaly spolehlivou odpověď na otázky týkající se příčinných souvislostí pozorovaných jevů, neboť chyběla znalost vnitřních, funkčních mechanismů reakce rostlin na působení vnějšího prostředí. K zapojení rostlinných fyziologů, kteří by mohli ekologům v tomto směru zásadně pomoci, docházelo však jen velmi zvolna. Vyplývalo to částečně z přesvědčení, že exaktní fyziologie může být rozvíjena jen jako laboratorní věda, ale hlavně chyběla vhodná měřící technika spolehlivě fungující i v terénních podmínkách. To však už dávno není pravda. Ekologická fyziologie je v současné době velmi rozvinutým a perspektivním vědním oborem disponující nejen bohatým arsenálem přesných kompaktních přístrojů, ale i rozmanitými možnostmi koncepčních přístupů, které jsou plně kompatibilní s potřebami ekologů. Stačí snad uvést pár příkladů: • máme velmi dokonalou a snadno dostupnou techniku pro dlouhodobé monitorování změn abiotických faktorů prostředí, • jsou vypracovány metody pro nedestruktivní měření významných fyziologických procesů na velkých pokusných plochách (aerodynamické měření výměny plynů, analýza spektrální reflektance…), • máme k dispozici metody umožňující integrovat průběh některých fyziologických procesů za delší časový interval (např. analýza izotopových poměrů), • jsme schopni realizovat terénní experimenty s reprezentativními vzorky vegetace, při kterých dlouhodobě měníme některý z faktorů prostředí (např. teplotu, množství dopadajícího UV záření, koncentraci CO2 ve vzduchu, obsah živin v půdě…) a sledovat dopad těchto změn na rostliny. • terénní měření se často provádějí paralelně s detailní analýzou podstaty adaptačních mecha14 Abstrakta vybraných příspěvků nismů v laboratorních podmínkách. V současné době probíhá v polárních oblastech více než sto různých výzkumných projektů s ekologickou tematikou, ať už na národní či mezinárodní úrovni. V mnoha z nich hraje studium ekofyziologických aspektů klíčovou roli. Nelze si však nepovšimnout dvou hlavních, poněkud se rozcházejících tendencí: • na organismové úrovni se provádí stále detailnější analýza mechanismů odolnosti ke stresovým faktorům u významných druhů polární tundry (mrazuvzdornost, tolerance hypoxie, dehydratace, fotodestrukce…), a to včetně využívání metod molekulární biologie. • na úrovni populací a porostů je hlavní zájem soustředěn na výzkum změn vegetace pod vlivem právě probíhajících či očekávaných změn prostředí, jako je zvyšování teploty (např. dlouhodobý projekt International Tundra Experiment), a na úlohu vegetace v řízení toků plynů (oxid uhličitý, metan, vodní pára …). Výzkumné aktivity v polárních oblastech jsou koordinované mezinárodními vědeckými výbory, jejichž členem je i naše republika (International Arctic Science Commitee, International Scientific Commitee on Antarctic Research). Předpokladem k provádění dlouhodobého výzkumu v polárních oblastech jsou dobře vybavené výzkumné stanice. V Antarktidě byla česká stanice vybudována na ostrově Jamese Rosse, v Arktidě se zřízení stanice teprve připravuje na souostroví Svalbard. Závěrem bych se rád zmínil o zvláště žádoucích, perspektivních oblastech uplatnění fyziologie rostlin v ekologickém výzkumu polárních oblastí. 1) Sotva lze pochybovat o potřebě dalšího detailního studia fyziologických procesů u plejády druhů dosud nedostatečně prozkoumaných. Při těchto výzkumech (na úrovni individua) by bylo velmi potřebné, kromě stále hlubší analýzy mechanismu adaptací ke stresovým faktorům a měření rychlosti metabolických procesů (fotosyntézy, respirace), věnovat zvýšenou pozornost také: - hospodaření s přijatými zdroji (uhlík, minerální živiny), - regulaci růstových a vývojových procesů, vedoucích k utváření fenotypu. 2) Hlavní zájem obecně ekologického výzkumu bude nepochybně i nadále směřovat k vysvětlování probíhajících změn rostlinné složky ekosystémů a k predikci možného dalšího vývoje. To ovšem předpokládá mít také komplexní znalosti o chování rostlin na úrovních vyšších než je organismová (populace, společenstva). Právě na těchto úrovních se totiž nejčastěji rozhoduje o zachování určitého druhu (ne tedy pomíjivého individua) na daném stanovišti. Populační dynamika má obvykle dlouhodobý průběh a je často závislá na mechanismech, které byly dosud při ekofyziologických výzkumech značně zanedbávány. Patří k nim např. reprodukční procesy (včetně regulace klíčivosti semen či tvorby odnoží) či schopnost vytvářet funkčně odlišné ekotypy. Zvláště málo prozkoumaná je pak celá složitá problematika biotických interakcí. Prof. RNDr. Jan Gloser, Gloser CSc. narozen 1. dubna 1942 v Příbrami na Moravě, ženatý, 2 děti, bydliště v Zastávce u Brna. Studium, zaměstnání: 1959-1964 studium biologie na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity v Brně 1964-1990 Botanický ústav ČSAV Brno (stipendista, aspirant, vědecký pracovník) 1991-1996 Masarykova univerzita (docent fyziologie rostlin) 1996 - dosud Masarykova univerzita (profesor fyziologie rostlin) Hlavní odborné zájmy: Ekofyziologické studium produkčních procesů (fotosyntéza, respirace) u různých typů vegetace (stepi, savany, louky, mokřady), matematické modelování produkčních procesů v porostech. Studium stresových reakcí lišejníků a rostlin v polárních oblastech s využitím nedestruktivních biofyzikálních metod (gazometrie, spektrální reflektance). Pedagogická aktivita v současné době (semestrální přednášky na PřF Masarykovy univerzity) Fyziologie rostlin, Biologie rostlin, Fyziologická ekologie rostlin. 15 Seminář J. Glosera Ekologická úloha sinic a řas v polárních ekosystémech Josef Elster Josef Elster1,2, Otakar Strunecký1,2, Jana Kvíderová1,2 Marie Šabacká1 a 3Lubomír Kováčik 1 Centrum polární ekologie, PřF JU, České Budějovice a Centrum pro algologie, Botanický ústav AV ČR Třeboň 3 Katedra botaniky, PřF Komenského univerzita, Bratislava 2 Úvod V pouštních či polopouštních ekosystémech Arktidy a Antarktidy, kde je voda v tekutém stavu dostupná jen po velmi krátké období polárního léta nebo je dostupná jen ve formě vzdušné vlhkosti, hrají bezcévné rostliny (sinice, řasy, mechorosty, lišejníky) prvořadou úlohu primárních producentů. Jejich podíl zabezpečující vstupy uhlíku, dusíku a energie do ekosystémů s růstem zeměpisné šířky se zvyšuje. Sinice a řasy jsou evolučně nejstarší rostlinné organismy, které byly schopny se přizpůsobit extrémním přírodním podmínkám Arktidy a Antarktidy, tj. nedostatku vody v tekutém stavu, nízkým teplotám, velkým teplotním a světelným sezónním změnám, krátkému vegetačnímu období, nedostatku minerálních živin atd. Algologové pracující v polárních oblastech si kladou celou řadu otázek, např.: 1. Uplatňují se v polárních oblastech endemické druhy, které přežily glaciální období, nebo se jedná o organismy, které do polárních oblastí v současnosti migrují? 2. Liší se polární druhy svými vlastnostmi od druhů mírné či tropické oblasti? Arktida a Antarktida Polární oblasti (Arktida a Antarktida) se tradičně považují za ekologicky podobné oblasti. Z bližšího ekologického pohledu však nacházíme výrazné rozdíly v historii vývoje těchto dvou chladných oblastí Země (Elster et Benson, 2000). Arktida je z hlediska zalednění mladá oblast, první ledovce se zde začaly utvářet přibližně před 3 mil. let. V současné době je velká část území Arktidy odledněná nebo se rychle odledňuje. Největší část Arktidy je tvořena Severním ledovým oceánem, který je propojen mořskými proudy s mírnou oblastí. Výměna energie pomocí termohalinního mořského výměníku výrazně ovlivňuje i proudění vzdušných mas. Tato oceánografická a geofyzikální charakteristika Arktidy předurčuje, že tato oblast je otevřená výměně energie a toku genomů mezi mírným a arktickým pásmem a současně předurčuje, že tato oblast je náchylná na změny včetně změn klimatu. Antarktida na druhé straně je zaledněna nejméně 35 mil. let. Ledový příkrov Antarktidy se začal utvářet zhruba v období, kdy se antarktický kontinent definitivně oddělil od svých kontinentálních sousedů (Austrálie a Jižní Ameriky). V tomto období se vytvořil kolem Antarktidy tzv. cirkumantarktický mořský proud, který přispěl k omezení přenosu energie mezi mírnou a antarktickou oblastí. Současný stav zalednění Antarktidy je výrazně odlišný od arktické oblasti, pouze nepatrné procento terestrické části je odledněné. Cirkum-antarktický mořský proud a na něj navazující proudění vzdušných mas významně přispívají k energetické a biologické izolovanosti Antarktidy. Izolovanost a větší extrémnost Antarktidy se projevují na všech úrovních včetně biologické diverzity a produktivity. Biogeografie sinic a řas Jednou z otázek, kterou si biologové kladou, je zda existují cirkum polární druhy, tj. mikrobiální druhy stejného nebo velmi blízkého genotypu, které se současně vyskytují v obou polárních oblastech. Jinými slovy, zda existují nějaké organismy, které jsou různými vektory pravidelně 16 Abstrakta vybraných příspěvků přenášeny mezi oběma polárními oblastmi. V naší prezentaci se zaměříme pouze na oxyfototrofní mikroorganismy, sinice a řasy. Provedli jsme polyfázickou studii vláknitých oscillatoriálních sinic Phormidium autumnale s.l., které jsme vyizolovali z různých arktických a antarktických lokalit. Provedli jsme analýzu 16S rDNA a současně morfologickou studii 26 kmenů. Analýzy jasně prokázaly, že izoláty z Arktidy a Antarktidy vytvářejí izolované skupiny mikroorganismů. Arktické genotypy jsou také rozšířeny do subarktické oblasti, dokonce i do alpínské oblasti střední Evropy (Strunecký et al. 2010). Dále jsme zjistili, že v rámci arktické oblasti (severoamerická a euroasijská) dochází k častému přenosu genotypů vláknité sinice Phormidium autumnale s.l., na němž se podílejí stěhovaví ptáci, driftující led či dřevo, lidé či vzdušné masy (Strunecký et al. 2012). V rámci skupiny Phormidium autumnale s.l. se vyskytuje několik ekologických forem, které jsou adaptované na konkrétní prostředí (sladkovodní, půdníaeroterestrické, glaciální atd.), (Strunecký et al. 2012a). Existence ekologických forem pro různé typy biotopů byla potvrzena i v Antarktidě. V Antarktidě za pomoci analýzy 16S rDNA, ITS a následné metody tzv. analýzy molekulárních hodin se nám podařilo objasnit, že některé genotypy rodu Phormidium autumnale s.l. pravděpodobně přežívají v Antarktidě od rozpadu prakontinentu Gondwana, a tak pravděpodobně přežívají glaciální období v některých ze specializovaných biotopů (Strunecký et al. 2012b). Teorie jedinečnosti populací arktických a antarktických genotypů sinic byla podpořena podobnou studií na souboru kokálních zelených řas (Chlorella like). Na souboru 22 izolátů z Arktidy a Antarktidy jsme prokázali, že se mezi tímto souborem nenacházel žádný genotyp shodný pro arktickou a antarktickou oblast. Studované kmeny následně testované na ekofyziologické vlastnosti prokázaly, že se jedná o psychrofilní či psychrotolerantní stínomilné organismy (Elster et al., in prep). cháním. Na konci arktického či antarktického léta můžeme ve vyschlých či vymrzlých mělkých mokřadech či na původně vlhké půdě nacházet zbytky kolonií sinic a řas. Již na první pohled je zřejmé, že kolonie prokaryontních sinic (připomínající navoskované kytičky) jsou pravděpodobně vytrvalé a přežívají zimní období ve vegetativních stádiích. Na druhé straně eukaryotní řasy po vyschnutí či vymrznutí rychle ztrácejí fotosyntetická barviva a na dně mělkých mokřadů je nacházíme ve formě žluté průsvitné, pravděpodobně mrtvé biomasy. Této biomase v Arktidě eskymáci říkají „Marťanský papír“ (Elster et Benson, 2000) V jihoseverním transektu kolem západního pobřeží Antarktického poloostrova od ostrova Adelaide (britská stanice Rothera) až po subantarktické ostrovy (Jižní Geogia) jsme na konci astrálního léta sbírali vymrzlý - vysušený povrch půdy. Ze vzorků jsme vyizolovali 15 kmenů sinic a 11 kmenů řas. Ty jsme podrobili experimentu, kdy jsme je zchlazovali na teploty -4 °C, -40 °C, -100 °C, - 196 °C a vysoušeli při teplotě 0 °C a +20 ° C. V následném růstovém testu jsme zjistili, že cca 93,5 % sinic a 50 % řas přežilo vymrzání a vysychání (Šabacká et Elster, 2006). Tolerance k vymrzání je více heterogenní mezi řasami než mezi sinicemi. Většina sinic přežívala vymrzání, u eukaryotických řas přežívaly vymrzání jen vybrané druhy. U stresu vysycháním byla situace odlišná, testované kmeny sinic reagovaly rozdílně na vysychání, některé přežívaly, jiné uhynuly. U řas bylo procento přežívání vyšší (Šabacká et Elster, 2006). Odolnost k vymrzání a vysychání jsme podobnou metodou také testovali u souboru jednoduchých vláknitých řas rodu Klebsormidium, které jsme vyizolovali z různých oblastí v Arktidě, v Antarktidě a z aeroterestrických biotopů na Slovensku. Překvapivě jsme nenašli statisticky významné rozdíly ve schopnosti přežívat vymrzání a vysychání mezi souborem těchto vláknitých řas (Elster et al. 2008). Literatura: Vymrzání a vysychání Sinice a řasy polárních oblastí jsou dobře adaptovány na stresy způsobené vymrzáním a vysy- Elster, J. and Benson E.E. 2004: Life in the Polar Terrestrial Environment a Focus on Algae and Cyanobacteria. In: B. Fuller, N. Lane and E.E. Benson, (eds.) Life In The Frozen State. Taylor and Francis, London, pp. 111- 149. 17 Seminář J. Glosera Elster, J., Degma, P., Kováčik, Ľ., Valentová, L., Šrámková, K., Pereira, A. B. 2008: Freezing and desiccation injury resistance in the filamentous green alga Klebsormidium from the Antarctic, Arctic and Slovakia. Biologia, 63/6: 839-847. DOI: 10.2478/s11756-008-0111-2. Elster, J., Shukla S.P., Lepka D., Hodač L., Kvíderová J., Adamec L., Fasshauer F., Friedl T. 2012: Phylogenetic and ecophysiological features of polar Chlorella-like species. FEMS Micriobial Ecology. In prep. Šabacká, M. & Elster, J. 2006: Response of cyanobacteria and algae from Antarctic wetland habitats to freezing and desiccation stress. Polar Biology 30 (1): 31-37. Strunecký, O., Elster, J. and Komárek, J. 2010: Relationship in geographically separate Phormidium like cyanobacteria: Is there a link between north and south Polar Regions? Polar Biology 33: 1419-1428, (DOI 10.1007/s00300-010/0834/8). Strunecký, O., Komárek, J., Elster, J. 2012a: Biogeography of Phormidium autumnale (Oscillatoriales, Cyanobacteria) at western and central Svalbard. Polish Polar Research (accepted). Strunecký, O., Elster, J., Komárek, J. 2012b: Molecular clock evidence for survival of Antarctic cyanobacteria 1 (Oscillatoriales, Phormidium autumnale) from Paleozoic times. FEMS Microbial Ekology, (accepted). Doc. Ing. Josef Elster, Ph.D. Narozen: Zaměstnán: Dačice, 14. února 1958 Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Přírodovědecká fakulta, Centrum polární ekologie a Botanický ústav AV ČR, Úsek ekologie rostlin, Centrum pro algologii, Třeboň, Tel. : (420) 384 721156-8, Fax: (420) 384 721136, E-mail: [email protected] CSc. (Ph. D.) (Botanika) Postdoktorský pobyt Docent (Habilitace v hydrobiologii) 1992 – Československá akademie věd, Botanický ústav (1991-1995) - University of Toronto, Erindale College, Mississauga, Ontario, Canada (2005) - Diverzita a četnost sinic a řas v různých biotopech polárních oblastí Masarykova univerzita v Brně Specializace v ekologii a ekofyziologii sinic a řas, především zaměřená na prostředí s nízkými teplotami a na polární ekosystémy. Účastník ve 23 polárních expedicích (Antarktida - Jižní Shetlandy, Antarktický poloostrov, ostrov James Ross, belgická stanice Princess Elisabeth v kontinentální Antarktidě, Arktida – ostrov Ellesmere, Svalbard, Abisko). Účast v 28 domácích a zahraničních projektech – v některých zodpovědný řešitel. Vedoucí 3 zahraniční postdoktorských pobytů. Vedoucí 5 Ph.D. studentů (dva ukončeny), 5 magisterských diplomových prací (všechny ukončeny) a 3 bakalářských prací (všechny ukončeny). Pravidelné přednášky na Jihočeské univerzitě v Českých Budějovicích, na Masarykově univerzitě v Brně a na Karlově univerzitě v Praze. 74 článků v impaktovaných časopisech nebo v mezinárodních knihách. Editor jedné knihy. Celkem cca 100 publikací. Počet citací na Web of Science – 368, H-index – 9, průměrná citovanost – 8,64. Řešitel projektu MŠMT LM2010009 – Projekt CzechPolar – České polární stanice" Stavba a operační náklady (velké infrastruktury). Člen redakční rady - ISRN Ecology, Hindawi Publishing Corporation a Czech Polar Reports ISSN: 1805-0689. Vybrané publikace: Kopalová, K., Veselá, J., Elster, J., Nedbalová, L., Komárek J., & Van de Vijver, B. 2012: Diatom communities in seepages and streams on James Ross Island (NW Weddell Sea, Antarctica). Plant Ecology and Evolution, 145 (2): 1-19. Shukla, S.P., Kvíderová, J., Elster, J. 2011: Nutrient requirements of polar Chlorella-like species. Czech Polar Reports, ISSN 18050689, 1: 1-10 Elster, J. and Kvíderová, J. 2011: Cyanobacteria. In. Encyclopedia of Astrobiology. M. Gargaud, R. Amils, J.C. Quintanilla, H. James, II. Cleaves, W.M. Irvine, D.L. Pinti and M. Viso (eds). Springer 394-397, DOI 10.1007/978-3-642-11274-4. Strunecký, O., Elster, J. & Komárek, J. 2011: Taxonomic revision of the fresh-water cyanobacterium „Phormidium“ murrayi = Wilmottia murrayi. Fottea 11(1): 57-71 (IF= 1.37). Kvíderová, J., Elster, J. & Šimek, M. 2011: In situ response of Nostoc commune s.l. colonies to desiccation, in Central Svalbard, Norwegian High Arctic. Fottea 11(1): 87-97, (IF= 1.37). Taton A., Wilmotte A., Šmarda J., Elster J. & Komárek J. 2011: Plectolyngbya hodgsonii – a remarkable filamentous cyanobacterium from Antarctic lakes; comparison with related cyanobacterial types. Polar Biology 34: 181-191, (DOI 10.1007/S00300-010-0868-y). 18 Abstrakta vybraných příspěvků Klima Antarktidy - které faktory je formují? Proč je tak extrémní a současně časoprostorově stabilní? Jsou jeho změny zneužitelné? Pavel Prošek Antarktické klima je výsledkem působení stejných klimatotvorných faktorů (astronomických, cirkulačních, geografických a antropogenních), jako klima kterékoliv jiné oblasti na Zemi. Antarktidu však ovlivňují vzhledem k její poloze na jižním vrchlíku naší planety značně specificky. Jejich působením se zde vyvinulo nejextrémnější a mimořádně chladné klima, jež vedlo k jejímu silnému zalednění. Astronomické faktory, jimiž jsou především oběh Země kolem Slunce, její vlastní rotace, precesní a nutační pohyb její rotační osy, jsou v Antarktidě sice téměř identické s Arktidou a podmiňují specifický režim ozáření zemského povrchu Sluncem (polární den a polární noc, oddělené intervaly střídání dne a noci v periodě dne; délka všech tří period závisí na zeměpisné šířce). Významnou roli zde však hraje i malý úhel dopadu slunečních paprsků na povrch Země během polárního léta (zeslabuje insolaci, je však částečně eliminován prodlouženým trváním slunečního svitu během polárního dne) a z něj plynoucí dlouhá dráha pronikání paprsků přes atmosféru, díky níž se zde zvyšuje pohlcování záření. Radiační zisk je navíc významně zesilován silnou reflexí od sněhu (v průměru kolem 70 %) a velkou plochou mořského zámrzu na konci zimy. V období polární noci klesá zisk energie slunečního záření na nulu a jedinými zásadními toky energie jsou zde dlouhovlnné vyzařování zemského povrchu a zpětné (tedy k Zemi orientované) dlouhovlnné záření atmosféry. Současné cirkulační faktory jsou výsledkem driftu kontinentů v geologické minulosti, díky němuž se Antarktida postupně oddělila od Pangey a posunula se do své polární pozice. Velmi důležitým momentem driftu bylo paleocenní oddělení Antarktidy od Jižní Ameriky a eocenní oddělení od Austrálie. Vznikl tak dnešní Jižní oceán, propojující Atlantik, Pacifik a oceán Indický a izolující Antarktidu od teplejší mořské vody nižších šířek. Kolem Antarktidy v něm proudí po směru pohybu hodinových ručiček vody největšího světového mořského proudu – tzv. Západního příhonu. Motorem jeho pohybu je směrově identický globální pohyb atmosféry v tzv. cirkumpolární brázdě nízkého tlaku vzduchu kopírující svou polohou zhruba Antarktické pobřeží. Tento prstenec sníženého tlaku obklopuje kontinentální tlakovou výši. Je to velmi výrazná a nejstálejší anticyklóna na světě. Z její středové oblasti vytéká směrem k periferii kontinentu extrémně studený a suchý vzduch. Na jehož styku s vlhkým a teplejším mořským vzduchem cirkumpolární brázdy vznikají velmi hluboké a k východu rychle se pohybující cyklóny spojené do sérií, jejichž přechod je spojen s velmi intenzivními změnami tlaku a vysokými rychlostmi větru. K nejvýznamnějším geografickým faktorům patří přibližně kruhový tvar kontinentu, jehož jednoduchost je narušována pouze velkými zálivy Rossova a Weddellova moře a dlouhým výběžkem Antarktického poloostrova – součásti jižních And, s nimiž je propojen podmořským hřbetem Skotského oblouku. Významnou roli hraje i velká nadmořská výška kontinentu (v průměru 2 194 m bez šelfových ledovců), která souvisí s mohutným, v průměru 2,2 km mocným ledovcovým štítem o objemu téměř 30 mil. km² (je v něm koncentrováno 90 % zásob sladké vody světa). Tlakem jeho hmoty je významná část horninového podloží štítu stlačena hluboko pod úroveň mořské hladiny. V zalednění Antarktidy se rozlišují tři základní typy: ledovcové štíty (pokrývající centrální části pevniny), šelfové ledovce (vznikající roztékáním ledu ze štítů k okrajům pevniny a jeho nasouváním na mořskou hladinu) a mořský led (důsledek zámrzu mořské vody) pro který je typická výrazná změna plochy mezi zimním a letním obdobím. Na základě předchozích informací můžeme konstatovat, že Antarktida získává, a to jen v létě, pouze málo energie slunečního záření. Cirkulačně (ve vztahu k oceánické vodě i atmosféře) je neizolovanějším kontinentem Země, na němž se vyvinul velmi stálý a jednoduchý systém pohybu 19 Seminář J. Glosera vzduchu. Přímý vliv antropogenních klimatických faktorů v ní zatím nebyl prokázán. Předchozí informace umožní snadnější pochopení klimatu Antarktidy, v němž lze rozlišit dva základní typy: klima kontinentální a maritimní. Pro klima pevninské Antarktidy je charakteristický stálý systém větrů ze středu pevniny k jejím okrajům. Jejich příčinou je gravitační stékání extrémně studeného vzduchu z centrální tlakové výše k jejím okrajům, vyvolané poklesem tlaku a sklonem povrchu pevniny k pobřeží, případně usměrňované horskými překážkami (tzv. katabatické a orografické větry). V tlakové výši jsou potlačeny vzestupné pohyby vzduchu (a nejsou zde pro ně ani energetické podmínky). Spolu s nízkou vlhkostí vzduchu jsou příčinou jen velmi omezené tvorby oblaků s nízkým vodním obsahem. Řídká ledová oblaka tvořená velmi malými ledovými krystaly zde vznikají přímo desublimací vodní páry. Vypadává z nich proto jen velmi málo srážek – ročně jen kolem 50 mm. Teploty zde klesají hluboko pod bod mrazu. Nejnižší dosud změřená teplota (stanice Vostok) má hodnotu -89,2 ºC). Máme tedy plné právo označit střed Antarktidy jako mrazovou poušť. S kontinentálním klimatem kontrastuje klima antarktické periferie. Díky pohybům cyklón a jejich sérií se zde rychle střídají maritimní a kontinentální vlivy a počasí je proto typické prudkými změnami tlaku, silnými větry a velkou proměnlivostí teploty, jejíž minima zpravidla neklesají pod -40 ºC. V létě se mohou vyskytovat i teploty nad bodem mrazu, což umožňuje existenci skromné vegetace (převažují lišejníky a mechy). Globální klima Země ovlivňuje Antarktida již zmíněnou reflexivitou svého povrchu (zvyšuje albedo Země na hodnotu kolem 30 %) a svou nízkou teplotou. Ta zvětšuje teplotní kontrast mezi rovníkovými a vysokými šířkami jižní polokoule a v důsledku toho zesiluje meridionální cirkulaci vody i vzduchu. „Exportem“ studené vody do nižších zeměpisných šířek ovlivňuje Antarktida významně tzv. termohalinní cirkulací ve světovém oceánu. Vzhledem k velké hodnotě skupenského tepla tání ledu je ledovcový štít Antarktidy velmi stálý. K jeho rozpuštění by bylo třeba mimořádně velkého množství energie. Díky obrovské kumulaci ledu je proto Antarktida velmi významným stabilizátorem klimatu. Přes značnou resistenci vůči současnému globálnímu oteplování je však i Antarktida svou malou částí tímto procesem zasažena. Jde o polohově extrémní prostor Antarktického poloostrova, v němž došlo na úrovni průměrných ročních teplot během posledních 50 let k jednomu z největších oteplení na Zemi o 2,5 ºC. Jeho příčinou je zesílení cirkulace mořské vody a důsledkem pak destrukce šelfových ledovců, které se zde od 50. let minulého století zmenšily o 25 000 km². Již dnes lze konstatovat dopady tohoto procesu (i když zatím jen v pobřežních oblastech) např. ve zvýšení kapalných srážek v letním období, v rozšiřování areálů výskytu mechů a lišejníků nebo v rozšiřování hnízdišť tučňáků a letních shromáždišť ploutvonožců k jihu. Další oblastí u které lze při pokračujícím oteplování klimatu předpokládat významnější změny jsou ledovcové štíty Západní Antarktidy. Odhadovanými příčinami jejich menší odolnosti vůči klimatické změně je menší objem a větší hloubka kryptodepresí na jejich bázi. Pavel Prošek (1940) RNDr.: Přírodovědecká fakulta Univerzity J. E. Purkyně v Brně (1974) CSc.: Přírodovědecká fakulta Univerzity J. E. Purkyně v Brně (1977) docent: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta (1991) profesor: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta (1998) Pracoviště: Geografický ústav Přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity Odborná a výzkumná činnost Fyzická geografie – klimatologie (mikrometeorologie, mikroklimatologie, topoklimatologie, znečištění atmosféry, klima polárních oblastí), řešitel, resp. spoluředitel 15 výzkumných projektů. Významné zahraniční pobyty Geografické expedice na Svalbard (1985, 1988, 1990, 2011), celkem 10 měsíců Vědecké expedice do Antarktidy (1994/95, 1999, 2001, 2002, 2003, 2004, 2005, 2006, 2007, 2008), celkem 25 měsíců. Řešitel projektu Vybudování české vědecké stanice J. G. Mendela v Antarktidě Garant přijetí ČR do European Polar Board Člen delegace ČR na zasedáních Antarctic Treaty, resp. Committee for Environmental Protection in Antarctica. 20 Abstrakta vybraných příspěvků Co nejvíce omezuje antarktické rostliny? Chlad, mráz, nedostatek vody, živin či proměnlivé záření? Miloš Barták Rostliny se v Antarktidě trvale vyskytují pouze v jejích odledněných částech, a to v malých, často velmi ostře ohraničených územích, takzvaných vegetačních oázách. Nalezneme zde pouze dva druhy cévnatých rostlin, převahu vegetačního krytu však tvoří zejména mechy a lišejníky, často doprovázené nárostovými společenstvy řas a sinic. V současné době je předmětem odborného zájmu rostlinných fyziologů zejména stupeň adaptace těchto autotrofních organismů na drsné a často extrémní antarktické prostředí. Zároveň jsou studovány základy fyziologických procesů, které umožňují extremofilním organismům přežít a reprodukovat se v prostředí antarktických vegetačních oáz. Antarktické mechy a lišejníky využívají řadu biofyzikálních, biochemických i molekulárně biologických mechanismů, které jsou aktivovány během působení silného stresu chladem, mrazem, nedostatkem či přebytkem vody, množstvím a spektrálním složením dopadajícího záření. Přednáška zahrnuje informace o metodách měření a interpretaci výsledků získaných během antarktických expedic uskutečněných v posledních 10 letech v oblasti souostroví Jižní Shetlandy a ostrova Jamese Rosse (Antarktida). Týká se zejména fotosyntézy antarktických mechů a lišejníků v závislosti na teplotě, ozářenosti a stupni ovlhčení stélky, kryoresistence lišejníkových symbiotických řas, reakce antarktických mechů a lišejníků na uměle navozené oteplení růstového prostředí, mecha- nismů přežití extremofilních autotrofních organismů v podmínkách spolupůsobení několika stresových faktorů. Vybrané publikace se vztahem k tématu: Barták, M., Hájek, J., Vráblíková, H., Dubová, J. (2004): High -Light Stress and Photoprotection in Umbilicaria antarctica Monitored by Chlorophyll Fluorescence Imaging and Changes in Zeaxanthin and Glutathione. Plant Biology, 6, 333-341. Barták, M., Solhaug, K.-A., Vráblíková, H.,, H., Gauslaa, Y. (2006): Curling during desiccation protects the foliose lichen Lobaria pulmonaria against photoinhibition. Oecologia, 149, 553-560. Ilík, P., Schansker, G., Kotabová, E., Váczi, P., Strasser, R. J., Barták, M. (2006): A dip in the chlorophyll fluorescence induction at 0.22 s in Trebouxia-possessing lichens reflects a fast reoxidation of photosystem I. A comparison with higher plants. Biochimica et Biophysica Acta- Bioenergetics, 1757, 12-20. Roháček, K., Soukupová, J., Barták, M (2008): Chlorophyll fluorescence: A wonderful tool to study plant physiology and plant stress. In: Plant Cell Compartments - Selected Topics. Kerala - India : Research Signpost,. Schoefs (ed.), 1st edition, ISBN 978-81-308-0104-9, p. 41-104. Hajek J; Bartak M; Dubova J (2006): Inhibition of photosynthetic processes in foliose lichens induced by temperature and osmotic stress. Biologia Plantarum, 4: 624634. Hájek, J., Váczi, P., Barták, M. Jahnová, L. (2012): Interspecific differences in cryoresistance of lichen symbiotic algae of genus Trebouxia assessed by cell viability and chlorophyll fluorescence. Cryobiology: 64: 215-222 Miloš Barták Narozen v roce 1963 ve Varnsdorfu. Absolvent Vysoké školy zemědělské v Brně (nyní Mendelova zemědělská a lesnická univerzita) Profesionální kariéra: Doktorát získal v roce 1992 (Ústav systematické a ekologické biologie, Brno), habilitoval se v roce 1999, profesorem od roku 2006. Nyní pracuje jako vedoucí Oddělení fyziologie a anatomie rostlin ÚEB PřF MU. Specializace: Je odborně zaměřen na různé aspekty fotosyntézy vyšších rostlin. Hlavní oblastí odborného zájmu je studium fotosyntézy za použití fluorescence chlorofylu a gazometrických metod, zhodnocení vlivu stresových faktorů na fotosyntézu, ekofyziologie stromů, trav a lišejníků a extremofilních autotrofních organismů, počítačové modelování růstu rostlin. Zahraniční stáže: Při svých vědeckých stážích působil např. na University of Antwerp UIA, Department of Biology, NLH University of Aas, Norsko, Institute of Environmental Analysis & remote Sensing for Agriculture, Florence (Itálie). Zúčastnil se 10 antarktických expedic na ostrov Krále Jiřího, ostrov Galindez a ostrov Jamese Rosse. 21 Den fascinace rostlinami První ročník Dne fascinace rostlinami přilákal v ČR tisíce návštěvníků Evropská organizace rostlinné biologie (European Plant Science Organisation, EPSO) se rozhodla zvýšit povědomí veřejnosti o významu rostlin a rostlinné biologie pro lidstvo. Vyhlásila proto na 18. května 2012 mezinárodní Den fascinace rostlinami. Zapojilo se do něj nakonec 39 zemí: 29 z Evropy, 10 ze Severní a Jižní Ameriky, Asie, Austrálie a Afriky. Přes 450 institucí uspořádalo rozmanité akce, zaměřené na rostlinnou biologii, zemědělský výzkum, ochranu životního prostředí, biodiverzitu, vzdělávání či umění. Čeští biologové a popularizátoři vědy nezůstali pozadu. Ke Dni fascinace rostlinami se v ČR přihlásila téměř dvacítka pořadatelů: přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy, Univerzity Palackého a Jihočeské univerzity, výzkumné ústavy, botanické zahrady, neziskové organizace i soukromé firmy. Od 14. do 27. května se v České republice uskutečnilo 16 populárně-vědeckých akcí pro školy i veřejnost. Nabídka byla skutečně pestrá, takže si z ní mohli vybrat všichni milovníci rostlin. Na programu byly přednášky, diskuze, dny otevřených dveří na vědeckých pracovištích, botanické exkurze do přírody, výstavy, interaktivní expozice či prohlídky skleníků, parků a botanických zahrad s odbornými průvodci. Návštěvníci se mohli nechat fascinovat rostlinami v Praze, Brně, Olomouci, Českých Budějovicích, Hradci Králové, Průhonicích, Šumperku, Troubsku a Čelákovicích. O některé akce byl až překvapivě velký zájem. Například na dvoudenní program Kouzlo a moc světa rostlin v Botanické zahradě Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy přišly přes dva tisíce lidí. Velký dík patří všem pořadatelům ze zúčastněných institucí, kteří se zasloužili o úspěch českého Dne a o zviditelnění výzkumu rostlin. Na celostátní úrovni organizovaly Den fascinace rostlinami EPSO, Česká společnost experimentální biologie rostlin a Česká technologická platforma rostlinných biotechnologií „Rostliny pro budoucnost“. Koordinace aktivit se ujali doktor Jan Kolář (Ústav experimentální botaniky AV ČR), docentka Jana Albrechtová (Přírodovědecká fakulta Univerzity Karlovy a ČSEBR) a doktor Tomáš Vaněk (ÚEB AV ČR, Česká technologická platforma “Rostliny pro budoucnost” a zástupce ČR v EPSO). Den fascinace rostlinami se konal pod záštitou Ing. Petra Bendla, ministra zemědělství České republiky. Velký populárně-vědecký projekt zaměřený speciálně na rostliny u nás dosud chyběl. Proto doufám, že se Den fascinace rostlinami nekonal naposledy a že se v budoucnu stane stejně oblíbeným, jako jsou dnes Noc vědců nebo Muzejní noc. Podle mých informací zvažuje EPSO dvouletou periodicitu. Osobně bych se přimlouval dokonce za každoroční opakování. To sice znamená více práce pro organizátory, ovšem zvyšuje se šance, že veřejnost (a také novináři) si zvyknou akci pravidelně navštěvovat. Jan Kolář Ústav experimentální botaniky AV ČR a Přírodovědecká fakulta Univerzity Karlovy v Praze Poznámka: Informace o akcích pořádaných v České republice v rámci Dnes fascinace rostlinami v r. 2012 jsou na stránce: http://www.plantday12.eu/czech.htm. Souhrnné informace o Dnu fascinace rostlinami jsou na http://www.plantday12.eu/. 22 Den fascinace rostlinami „Kouzlo a moc světa rostlin“ – akce Dne fascinace rostlinami v Botanické zahradě PřF UK v Praze (18.(18.-19.5.2012) Přírodovědecká fakulta UK v Praze, ve spolupráci s Ústavem experimentální botaniky AV ČR, v. v. i. a Českou společností experimentální biologie rostlin uspořádala v rámci Dne fascinace rostlinami velkou dvoudenní akci v Botanické zahradě (BZ) PřF UK v Praze Na Slupi. Akce se zúčastnilo více než dva tisíce návštěvníků a byla to s velkou pravděpodobností nejvýraznější akce Dne fascinace rostlinami v ČR. U zrodu akce stál spolu se mnou proděkan Jan Černý, který se pak osobně zapojil i jako demonstrátor rostlinných struktur u fluorescenčního mikroskopu. Za Přírodovědeckou fakultu UK převzalo organizaci akce Oddělení vnějších vztahů pod taktovkou Alexandry Hroncové, která se toho podujala s velkým enthusiasmem a patří jí velký dík za zdar celé akce a její propagaci. Akci navštívil i děkan PřF UK, profesor Bohuslav Gaš (viz foto na další stránce). Po oba dva dny byla v Botanické zahradě lokalizována celá řada stanovišť, která umožňovala nahlédnout do tajů rostlinného světa, odhalit podstatu fyziologických procesů a prohlédnout si zblízka mikroskopický svět vnitřní struktury rostlin. Jedno ze stanovišť reprezentoval v barvách ÚEB AV ČR, v. v. i., Jan Kolář, který též akci významně podpořil i jako hlavní koordinátor Dne Fascinace rostlinami v ČR. Pro akci v BZ PřF UK připravil stanoviště „Rostlinné hrátky: Hravá interaktivní výstava o biologii rostlin. Odhalte například tajemství dědičnosti, růstu nebo rostlinných barev a vůní.“ Dotýkat se exponátů bylo vřele doporučeno! Navíc byl po dobu akce zdarma přístupný skleník BZ, probíhaly komentované procházky skleníkem a venkovními expozicemi Botanické zahrady zajištěné členy České botanické společnosti a katedry botaniky PřF UK. ČSEBR připravila na akci stanoviště věnované Juliu von Sachsovi u příležitosti 155. výročí jeho habilitace v oboru rostlinné fyziologie na tehdejší Karlo-Ferdinandově univerzitě v Praze roku 1857, která byla světově první a je považována za vznik nového oboru. Stanoviště mělo název „Výlet k počátkům fyziologie rostlin: Víte, kde vznikla rostlinná fyziologie? V Praze!“. Julius Sachs žil v Praze v letech 1851–1859 v rodině Jana Evangelisty Purkyně. Mladí biologové oživili atmosféru Sachsovy Prahy a předvedli některé jeho pokusy. Zde bych chtěla poděkovat především Zuzaně Kubínové, Ph.D. studentce Katedry experimentální biologie rostlin (KEBR) PřF UK, která celou prezentaci ČSEBR uvedla do pohybu a v život. Nemohu opomenout i další studenty KEBR, kteří za tímto počinem stojí – Stanislava Vosolsobě a Jana Martinka. Dík patří též Janu Kolářovi a Janu Krekulemu, kteří pomohli získat dobové archivní materiály. Na akci se nejvýznamněji podílela Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK, která připravila celou řadu stanovišť s atraktivními tématy experimentální biologie rostlin – vedení vody v rostlinách, mikroskopování rostlinných struktur i na vlastnoručně vyrobených preparátech, o pastech masožravých rostlin, rostlinách in vitro, orchidejích a dalších. Studenti a členové katedry neúnavně předváděli jednotlivé úlohy návštěvníkům po oba dny – celkem se akce zúčastnilo přes 30 členů a studentů katedry. Ráda bych zmínila alespoň ty kolegy, kteří věnovali akci více než jeden den (abecedně): Drahomíra Bartáková, Radek Bezvoda, Lucie Dlabalová, Tomáš Figura, Michal Hála, Hana Konrádová, Ivan Kulich, Zuzana Lhotáková, Petra Mašková, Markéta Pikorová, Peter Sabol, Aleš Soukup, Hana Ševčíková, Josef Šonka, Edita Tylová. Znovu děkuji Zuzaně Kubínové, která celé zapojení katedry koordinovala s nezměrným úsilím více než dva týdny. Děkuji i ostatním nejmenovaným, kteří přispěli svým dílem. Den fascinace rostlinami je významný počin EPSO pro propagaci biologie rostlin a jejího významu – těšíme se na další ročník. Doufám, že se podaří jej zorganizovat alespoň takto dobře opět v Botanické zahradě PřF UK a s ještě větším zapojením v celé České republice. Jana Albrechtová Poznámky: Video z akce „Kouzlo a moc světa rostlin“ na youtube zhotovené OVV PřF UK v Praze, Alexandra Hroncová: http:// www.youtube.com/watch?v=bL7L5o52ezA, program akce: http://www.prirodovedci.cz/kalendar-akci/mezinarodni-den-fascinacerostlinami. Webové stránky Fascination of Plants Day: http://www.plantday12.eu/. Další materiály z Dne Fascinace rostlinami 2012 na webu KEBR PřF UK: http://kfrserver.natur.cuni.cz/. 23 Den fascinace rostlinami Den fascinace rostlinami v Botanické zahradě PřF UK ČSEBR připravila stanoviště věnované Juliu von Sachsovi: „Výlet k počátkům fyziologie rostlin: Víte, kde vznikla rostlinná fyziologie? V Praze!“. Na přípravě se podíleli zejména studenti KEBR PřF UK Zuzana Kubínová, Stanislav Vosolsobě (na fotografii vpravo) a Jan Martinek. Akci navštívil i děkan PřF UK, profesor Bohuslav Gaš (na fotografii vlevo). Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK připravila celou řadu stanovišť. Na jednom z nich si mohli návštěvníci obarvit karafiát a na čerstvých řezech obarvenými stonky se podívat, kudy proudí voda v rostlinách. Vlevo Hana Konrádová z KEBR PřF UK. Autor fotografií: Jiří Mrhal 24 Fotogalerie Den fascinace rostlinami v Botanické zahradě PřF UK Petra Mašková (vpravo) z KEBR PřF UK seznamuje návštěvníky s prouděním vody v rostlinách. Další stánek, který připravil Miroslav Srba a Josef Šonka (na fotografii vpravo), zavedl návštěvníky do světa masožravých rostlin a jejich rafinovaných pastí. Autoři fotografií: Jiří Mrhal (1. a 4. snímek), Zuzana Kubínová (2. a 3. snímek) 25 Den fascinace rostlinami Den fascinace rostlinami na Katedře experimentální biologie rostlin PřF UK. V laboratořích Katedry experimentální biologie rostlin byla připravena expozice s názvem „Krása rostlinných struktur“. Návštěvníci si zde mohli prohlédnout nejrůznější rostlinné struktury pod mikroskopem a také si připravit vlastní preparát. Vzadu Markéta Pikorová z KEBR PřF UK. Zuzana Lhotáková z KEBR PřF UK (vpravo) učila neúnavně celý den návštěvníky Dne fascinace rostlinami pracovat s mikroskopem. Ivan Kulich z KEBR PřF UK (vlevo) seznamuje návštěvníky s modelovou rostlinou Arabidopsis thaliana. Autor fotografií: Jiří Mrhal 26 Oceněná kniha L. Nátra Dvě ceny Lubomíru Nátrovi za knihu „PŘÍRODA NEBO ČLOVĚK? SLUŽBY EKOSYSTÉMŮ" Nakladatelství Karolinum, 2011 Lubomír Nátr z Katedry experimentální biologie rostlin PřF UK publikoval loni v nakladatelství Karolinum vědeckou knihu o službách ekosystémů, které nám poskytuje příroda. O vysoké kvalitě knihy svědčí ceny, které jí byly uděleny - kniha získala hned dvě prestižní ocenění. Nadace Český literární fond udělila prof. Lubomíru Nátrovi Cenu Josefa Hlávky za nejlepší knihu v oblasti živých věd v r. 2011 a rektor Univerzity Karlovy v Praze mu za stejnou knihu udělil cenu za nejlepší vědeckou publikaci v přírodovědných a matematicko-fyzikálních vědách v r. 2011. Cenu rektora UK V Praze prof. Vladimíra Hampla obdržel Lubomír Nátr 31.5.2012, Cenu Josefa Hlávky pak převzal 18. června 2012 při slavnostním předávání cen Nadace Český literární fond a Nadace „Nadání Josefa, Marie a Zdeňky Hlávkových“ na zámečku v Lužanech. Z původních dvaasedmdesáti knižních publikací vybrala porota šestnáct finalistů pro ocenění ve třech kategoriích – v oblasti společenských věd, věd o živé přírodě a věd o neživé přírodě. Profesor Lubomír Nátr obdržel cenu za nejlepší vědeckou práci v kategorii živých věd. Laudatio knihy přednesl předseda devítičlenné hodnotící komise, prof. F. Vyskočil (viz další příspěvek). V knize autor píše: „…Snažil jsem se, aby i neodborník v oblasti biologie a ekologie rostlin mohl nahlédnout do příčinných vztahů i mnohých dosud nepoznaných mechanismů zajišťujících určité struktury a funkce ekosystémů. Jen tak lze posléze přijmout překvapivě vysoké hodnoty finančního vyjádření řady služeb ekosystémů, které v textu uvádím. A snad i toto poznání o tom, jak finančně drahé služby příroda zatím zdarma lidstvu poskytuje, umožní zásadní posun našeho vnímáni skutečných hodnot přírody. A ostatně i nás, lidí, samotných…(str. 15)“. „…Svým textem nechci přesvědčovat či na jeho základě vyzývat ke změně názorů. Mým přáním je srozumitelným způsobem poskytnout co nejvíce základních informací o rostlinách, ekosystémech a vůbec přírodě tak, jak je lze najít ve vědeckých pracích. A na základě těchto informací samozřejmě ponechávám na každém čtenáři, aby si vytvořil vlastní úsudek, vlastní názor. A následně je opět na jednom každém z nás, jak svoje znalosti i názory uplatňujeme v osobním i společenském životě...(str. 329)“. Velmi hezké rozjímání Lubomíra Nátra, jako čerstvého laureáta Ceny Josefa Hlávky je uveřejněno v internetovém časopisu Univerzity Karlovy i-Forum, v rubrice rozhovory a portréty z 20.6. 2012, názvem: „Třídění odpadu v domácnostech je jako úlitba starých Římanů svým bohům“ (http://iforum.cuni.cz/IFORUM-13161.html). Příspěvek je nejen o knize, za kterou ocenění získal, ale i o tom, proč je třeba popularizovat význam rostlin. Jak uvedl profesor Nátr v rozhovoru pro časopis i-Forum: „Finanční vyjádření alespoň ně- kterých služeb ekosystémů považuji za jednu z posledních nadějí na změnu vztahu lidských společností k přírodě. Slova o velkém významu rostlin, mořských ekosystémů, lesů či mokřadů jsou už tak běžná, že je patrně téměř nikdo nevnímá – stejně tak jako bezmyšlenkovitě opakovaná tvrzení o nezbytnosti trvale udržitelného rozvoje. Když se pak rozhoduje o dalším záboru orné půdy či kácení stromů, tak proti uvedeným obecným tvr27 Oceněná kniha L. Nátra zením stojí konkrétní čísla o zisku, nových pracovních místech či odvodů daní. Takže se úrodná půda obětuje stejně tak jako stromy či jiné přírodní lokality... Doufám, že doplněním oněch nezpochybnitelných tvrzení o významu přírody pro lidstvo konkrétními a ekonomickými metodami, přesně stanovenými hodnotami v korunách, dolarech či eurech, budeme moci opravdově pochopit naši závislost na službách ekosystémů, jimiž si nesmírně lukrativně a v podstatě zdarma zajišťujeme svůj životní standard.“ Ještě citace z knihy: „…Lidstvo si pro svou potřebu přivlastňuje asi třetinu veškeré primární produkce rostlin, která ovšem je „určena“ také pro miliony ostatních druhů organismů. Lidé změnili obrovské plochy pevnin. Naše aktivity narušují mnohé oblasti nedozírných vod oceánů. Produkce odpadů dosahuje nepředstavitelných rozměrů. A to všechno je naprosto logický důsledek zcela jedinečného růstu počtu lidí na planetě umocněného trvale podněcovanou snahou spotřebovat dnes víc než včera a zítra víc než dnes – tedy jakousi potřebou soustavného růstu. Není pochyb, že z hlediska materiálního blahobytu měřeného spotřebou a komfortem žije zatím každá generace lépe než ta předcházející. Kterýsi autor přirovnal naši situaci k eskalátoru, na jehož jednom stupni stojíme a který nás veze vzhůru. Snad jen naprosto nezkušené dítě se může oddat představě o setrvalém pohybu na eskalátoru, na němž jede stále výš. Překvapivě si ale totéž myslí naprostá většina současných necelých sedmi miliard lidí na Zemi. Naše planeta je konečná, ale všude se skloňuje smysluprázdné spojení slov „trvale udržitelný rozvoj….(str. 10)“. Při katedrální oslavě ocenění knihy koncem června padl nápad, že bychom měli zaslat po jednom výtisku každému jednomu poslanci Parlamentu České republiky, aby svá rozhodnutí napříště mohli opírat o vědecké argumenty a souvislosti, mající časový přesah mnohem delší než jejich funkční období, na které byli do funkce zvoleni. Nápad je to dobrý – zda bude realizován ještě ukáže budoucnost. Ona investice do pořízení výtisků knihy byla dokonce nabízena od členů katedry jako soukromých osob. (I to odráží jakousi míru kvalitu knihy). Otázkou pro smysluplnost realizace tohoto nápadu je, zda by kniha neskončila podobně jako řada jiných tiskovin a reklamních letáků zaslaných našim zákonodárcům, aniž by je četli. Budeme doufat, že kniha si najde své čtenáře skrze pozitivní recenze – tato by k nim ráda přispěla. Přeji Lubomírovi neutuchající nápady, inspiraci pro další, nejen publikační činnost a především hodně sil, pohody a co nejvíce zdraví! A jistě mohu říci alespoň jménem komunity rostlinných biologů - těšíme se na další publikaci. Jana Albrechtová Poznámky: Odkaz na zprávu o ocenění knihy na webu PřF UK – napsal J. Kolář: http://www.natur.cuni.cz/fakulta/ aktuality/dve-oceneni-pro-knihu-profesora-natra-o-sluzbach-ekosystemu. Odkaz na rozhovor s čerstvým laureátem Ceny Josefa Hlávky profesorem Lubomírem Nátrem v elektronickém časopisu UK i-Forum: http://iforum.cuni.cz/IFORUM-13161.html. Odkaz na osobní stránky Lubomíra Nátra: http://www.natr.cz/. 28 Oceněná kniha L. Nátra Prof. RNDr. Lubomír Nátr, DrSc. (*1934 v Jistebníku) je emeritní profesor na Přírodovědecké fakultě Univerzity Karlovy v Praze, působí na Katedře experimentální biologie rostlin. Po mnoho let působil jako vedoucí katedry, předseda české společnosti experimentální biologie rostlin, dosud je aktivním pedagogem – velkou popularitu mezi studenty získaly v posledních letech jeho přednášky v rámci předmětu „Globální změny, rostliny a trvalá udržitelnost“. Zajímá se o fyziologii rostlin, především o studium fotosyntézy, ale také o ekologii, trvale udržitelný rozvoj a klimatické změny. • • • • V 50. letech vystudoval biologii, specializace fyziologie rostlin na Přírodovědecké fakultě UJEP (nyní Masarykova Univerzita) Brno. V letech 1958 až 1976 působil ve Výzkumném ústavu obilnářském v Kroměříži. Od r. 1976 až dosud působí na Přírodovědecké fakultě Univerzity Karlovy v Praze, Katedra experimentální biologie rostlin (dříve Katedra fyziologie rostlin). V r. 1964 získal vědeckou hodnost CSc. (dnes ekvivalent Ph.D.), v r. 1970 byl habilitován docentem fyziologie rostlin, v r. 1985 získal vědeckou hodnost doktora biologických věd, DrSc., v r. 1986 byl jmenován profesorem fyziologie rostlin a v r. 2002 emeritním profesorem Univerzity Karlovy v Praze Dlouhodobé zahraniční pobyty: • • • • Francie: Univerzita v Grenoblu (Maître de Conférence Associé, 6 měsíců, 1967/1968): přednášky bakalářského a magisterského studia „Fotosyntéza“, „Minerální výživa“ a „Vodní provoz“. Velká Británie: Univerzita Aberdeen (Visiting Research Fellow, 11 měsíců, 1968/1969). Spolková republika Německo: Univerzita Hamburg (Stipendista, 3 měsíce, 1988). Velká Británie: Rothamsted Experimental Station, Harpenden (Stipendium EU, 3 měsíce, 1994). Redakční rady časopisů: • • • • • Photosynthetica (člen redakční rady, 1980 – dosud) Plant, Soil and Environment (místopředseda redakční rady, 1985 – dosud) Biologia Plantarum (člen redakční rady, 1975 – 1990) Scientia Agriculturae bohemica (člen redakční rady, 1980 – dosud) Biochemie und Physiologie der Pflanzen (člen redakční rady, 1975-1980) Mediale a ocenění: • • • • • • • • • • • 2012: Cena Literárního fondu Josefa Hlávky za nejlepší knihu v oblasti živých věd v r. 2011 2012: Cena rektora za nejlepší vědeckou publikaci UK v r. 2011 2009: Zlatá medaile Univerzity Komenského v Bratislave, Slovensko udělená rektorem UK v Bratislavě za významný príspevok k rozvoju vedného odboru fyziológia rastlín v Čechcách, na Slovensku a v celej Európe. 2009: Zlatou medaili České zemědělské univerzity v Praze udělenou na základě rozhodnutí vědecké rady ČZU 2009: Pamätnú medailu Slovenskej polnohospodárskej univerzity v Nitre, Slovensko udělená rektorem 2009: Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně Diplom od rektora a vědecké rady Mendelovy zemědělské a lesnické univerzity v Brně za zásluhy o rozvoj vědy a vzdělání (De scientia et cultura optime merito) 2007: Medaile za zásluhy Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy v Praze 2006: Zlatá medaile Přírodovědecké fakulty Univerzity Komenského v Bratislavě 2002: Diplom za rozvoj vědy Slovenské akademie polnohospodárských vied (2002) 1984: Zlatá medaile Matematickofyzikální fakulty Univerzity Karlovy v Praze Z vydaných knih a kapitol v knihách: • • • • • • • Nátr L. 1998: Rostliny, lidé a trvale udržitelný život člověka na Zemi. Nakl. Karolinum. Praha. Nátr L. 1999: Matematické modely fyziologie výživy rostlin. Skripta. Nakladatelství Karolinum. Praha. Nátr L. 2000: Koncentrace CO2 a rostliny. Nakladatelství ISV. Praha. Nátr L. 2002: Fotosyntetická produkce a výživa lidstva. Nakladatelství ISV. Praha. Nátr L., Lawlor D. W. 2005: Photosynthetic plant productivity. V: Pessarakli M. (ed.): Handbook of Photosynthesis. Taylor and Francis. Boca Raton. Str.: 501 – 524. Nátr L. 2005: Rozvoj trvale neudržitelný. Nakladatelství Karolinum. Praha. Nátr L. 2006: Země jako skleník: Proč se bát CO2? Nakladatelství Academia, Edice Průhledy. Osobní webové stránky: http://www.natr.cz/, http://kfrserver.natur.cuni.cz/lide/natr/. Jazykové znalosti: znalosti aktivně německy, francouzsky, rusky, anglicky. 29 Oceněná kniha L. Nátra Laudatio Lubomír Nátr: „Příroda, nebo člověk? Služby ekosystémů“ Nakladatelství Karolinum, 2011 František Vyskočil V knize jsou přístupnou formou vysvětleny typy a hlavní funkce ekosystémů, což jsou soustavy živých a neživých složek životního prostředí, navzájem spojených výměnou látek, tokem energie a předáváním informací. Měli by jí povinně studovat tisíce lidí ze všech oblastí veřejného života, především centrální i lokální politici, vodohospodáři, členové různých agrárních komor, komisí a pracovníci magistrátů. Ale i aktivisté, kteří sice za přírodu rádi bojují, ale neradi čtou a přemýšlejí a tak zpomalují nebo likvidují projekty, nutné pro přežití člověka ve jménu lokálního přežití některých často běžných biotopů a ekosystémů. Všichni tito lidé by se měli poučit o využití slunečního záření při fotosyntetické produkci biomasy v rostlinách, cyklu vody a rizika jejího nedostatku nejen pro sanitární a průmyslové potřeby, ale zejména pro zajištění dalšího nezbytného zvýšení produkce potravin, o příčinách a důsledcích zvyšování koncentrace skleníkových plynů se zákonitými dopady na klima i přírodu. To vše je v knize popsáno a podáno téměř decentní formou, bez halasu a příliš vztyčených ukazováčků. Čím je ale neobvyklá? Představte si, že ukradnou obraz Františka Kupky Tvar modré. Majitel zapláče a na mikrofon se vyjádří, že cena obrazu je nedozírná, neboli vlastně neznámá. Nedá se totiž znovu namalovat, neboť Kupka už nežije a kopie se nepočítají. Ale jakmile jde dílo do dražby, najednou poměrně přesně jeho cenu známe. Určí ji zájemci a tak se v dubnu v Praze vydražil tento obraz za rekordní cenu 55 miliónů korun. A jak je to s různými zákoutími naší planety, s ekosystémy, kde žijí v dynamické rovnováze rostliny a živočichové? Můžeme jejich hodnotu, která je podobně jako u uměleckých děl nedozírná a vlastně neocenitelná, přece jen nějak vyjádřit? Kupodivu kniha prof. Nátra z Katedry experi- mentální biologie rostlin Přírodovědecké fakulty UK v Praze se o to v souladu s celosvětovými trendy pokouší. Finanční ohodnocení toho, jak nám slouží různé ekosystémy může být jedním z účinných způsobů přesvědčování veřejnosti a postupně i politiků. A jak je to tedy s cenou za služby nějakého ekosystému? Lubomír Nátr cituje Gretchen Dailyovou která uvádí příklad nákladů za obyvatelnosti Měsíce. Lze vyčíslit, kolik by stál nákup a doprava všeho, co by lidé na Měsíci museli mít bezprostředně pro svou potřebu. Co si sebou vezmou a kolik to bude stát? Určitě nezbytné zdroje potravy. Asi by nešlo hned o kravičky a prasátka, i když to není vyloučeno, ale možná o mikroorganismy, řasy, houby a nějaké macaté hmyzí druhy jako zdroj živočišných bílkovin. A co vzít na Měsíc dál? Možná dřevo jako stavební materiál, další průmyslové suroviny a technologie na zpracování, komunikační prostředky atd. atd. Je toho hodně a všechno se to dá v podstatě finančně vyčíslit. Podobně jako Projekt Biosféra II. Pod velkou kupolí v arizonské poušti existuje na nevelké ploše už 21 let miniaturní soustava pěti ekosystémů. Stál 30 milionů dolarů a první poučení bylo, že v technologicky poměrně dobře zvládnutém umělém prostředí se tam žádné lidské společenství dlouho neudrželo, aniž by se několik skupinek badatelů nesepralo jako znepřátelené tlupy kočkodanů. Přemnožili se taky mravenci a švábi, a celý nákladný projekt od r. 1994 slouží pro sledování dopadů změn podnebí na jednotlivé složky mini biosféry. Nicméně je to dobře vyčíslitelný příklad služby pěti ekosystémů pro pár lidí. Ale jak vyčíslit služby ekosystémů, které jaksi bezplatně využíváme po celé planetě? Například les dokáže zadržovat vodu v krajině. Pokud ho vykácíme, budeme tuto jeho schopnost muset nahradit například stavbou přehrady. Ta už se finančně vyčíslit dá. Nevelký jez s elektrárnou v centru Hradce Králo30 Laudatio vé Hučák by dnes stál asi 150 mil. Kč. Největší vodní přehrada je v Itaipu na hraniční řece Paraná mezi Brazílií a Paraguají s hydroelektrárnou s zhruba šestkrát větším výkonem než Temelín. Náklady na výstavbu obřího vodního díla dosáhly 20 miliard amerických dolarů. Finanční vyjádření nepřeberných forem služeb lesů, mokřadů, mangrovů, deštných pralesů, mořských řas a dalších ekosystémů, na nichž bude existence lidstva i nadále záviset, může významným způsobem přispět k naprosté nezbytnosti jejich ochrany a neudržitelnosti stávajícího způsobu našeho života. Pardon, ne našeho, tento způsob života nám byl vnucen těmi „horními desetitisíci“, kteří na tomto duchovně prázdném způsobu života vydělávají. Takže poslouchejte: likvidací 1 ha zdravého smíšeného lesa na vilu, tenisové hřiště nebo betonové parkoviště přijdeme my všichni ročně o 37 mil. Kč, z toho 3,5 mil. Kč za produkci kyslíku (padesát haléřů za litr), 17 mil. Kč stojí klimatizační služba pomocí listů a kondensace vody a zbytek je za superčistou vodu produkovanou při transpiraci stromů. A nenarušený hektar říční krajiny, např. kolem Bečvy nebo Moravy, byl oceněn na téměř půl milionu ročně, což pro celou republiku činí 375 miliard ročně. A když připočteme škody za povodně, dostaneme se na hodnoty nejméně o polovinu vyšší. Na celé planetě se roční hodnota všech těchto služeb ekosystémů, toho, co nám poskytuje příroda zdarma, pohybuje v řádu trilionů dolarů, jak uvedl r. 1997 Robert Costanza z USA. Ke konci knížky prof. Nátr píše: „Pozorný čtenář nemůže sledovat text této publikace, aniž by alespoň sám pro sebe… nedomýšlel možné či nezbytné důsledky pro vlastní konání a rozhodovaní“. Má pravdu. Myslím, že je třeba nejen upravit (a neříkám jen snížit) vlastní spotřebu a produkci odpadu, ale uchopit i pomyslný klacek a vyhnat od rozhodovacích stolů finanční zájmové skupiny, jež nám nabízejí takovou úroveň života, jakou lze přirovnat k fastfoodům: je to drahé, ošizené o vitaminy, přetučnělé, dráždivé, plné bezcenných pochutin a hluchých kalorií, rozuměj bezcenných životních cílů a náhražek za kvalitu. Nátrova kniha ukazuje, že možná bude lepší nastoupit nikoliv cestu udržitelného rozvoje, ale spíš prosperujícího poklesu. Chcete-li vědět, co se míní tím prosperujícím poklesem, budete si muset jeho jedinečnou knihu koupit. Není drahá, její cena se rovná jen asi 800 litrům čistého kyslíku, a určitě to jsou to peníze účelně vynaložené ve prospěch zachování služeb našich ekosystémů. RNDr. František Vyskočil, DrSc., dr. h. c., Profesor fyziologie a farmakologie, DrSc. Člen České učené společnosti a Physiological Society Cambridge, Přírodovědecká fakulta UK a Fyziologický ústav AV ČR. 31 Vzpomínáme Dagmar Dykyjová (1914(1914-2011), její život a dílo Jan Květ 1,2 1 Jihočeská univerzita, Přírodovědecká fakulta, Branišovská 31, CZ-37005 České Budějovice 2 CzechGlobe - Centrum pro výzkum globální změny AV ČR, CZ-37005 České Budějovice Dagmar Dykyjová se narodila 12. dubna 1914 jako Dagmar Sajfertová. Rodištěm jí byla Česká Bělá, městys na Vysočině. Její otec byl majitelem statku a po jistou dobu též starostou České Bělé. Jeho dcera vyrůstala v láskyplném rodinném prostředí, jež obohacovaly časté návštěvy významných osobností té doby. Otec i matka pečovali o výchovu a vzdělání svých dětí, a tak vyslali dceru Dagmar a jejího bratra Miloše na střední školu do Prahy. Po maturitě D. Sajfertová pobývala po delší čas ve frankofonní části Švýcarska a ve Francii a dobře ovládla francouzský jazyk. Poté studovala botaniku se specializací na rostlinnou fyziologii na Přírodovědecké fakultě University Karlovy. Jejím nejvýznamnějším učitelem tam byl profesor Bohumil Němec, který zůstal jejím celoživotním vzorem. Titul RNDr. byl Dagmar Sajfertové udělen v r. 1938; pak se stala asistentkou v Ústavu pro fyziologii rostlin. Rok poté nacisté uzavřeli české vysoké školy a její asistentura tak skončila. Nové zaměstnání si našla v brněnské pobočce Výzkumného ústavu cukrovarnického. Tam pokusně sledovala různé fyziologické funkce rostlin cukrovky, např. vliv růstových látek na její růst a vývoj, a mimo jiné vypracovala pokyny k jejímu úspornému jednoklíčkovému pěstování. Většina jejích prací z tohoto období vyšla v časopisu „Listy cukrovarnické“. Během 2. světové války se provdala za chemika Jaroslava Dykyje a změnila si příjmení na Dykyj-Sajfertová (později pouze Dykyjová); v r. 1944 se jim narodila dcera Anna. Po válce přešla D. Dykyjová do výzkumného centra čs. chemického průmyslu v Ústí nad Labem, kde experimentálně zkoumala působení chemických hnojiv před jejich uvolněním k obecnému používání. Z Ústí často zajížděla do Prahy, kde externě vyučovala na Vysoké škole zemědělské a Universitě Karlově. V r. 1949 se Dykyjovým narodil syn Jan. V akademickém roce 1953/54, D. Dykyjová obdržela místo odborné asistentky na katedře fyziologie rostlin tehdejší Biologické fakulty University Karlovy. Pro mne a mé kolegy a kolegyně je dodnes velkou ctí počítat se mezi její žáky. Ihned si získala naše sympatie, i když nás dosti přísně vedla ke kázni a pořádku při práci. Obětavě pro nás pořádala zvláštní semináře a předzkouškové “nalejvárny”, i o prázdninách v České Bělé. Vzdělávala nás také ve studentském vědeckém kroužku rostlinné fyziologie, což byla zlegalizovaná neoficiální skupina MRF (Mladí rostlinní fyziologové), založená I. Šetlíkem v r. 1953 s cílem rozšiřovat naše odborné vědomosti. Je spoluautorkou instruktivních skript fyziologie rostlin. U některých „uvědomělých soudruhů” z řad pedagogů popularita D. Dykyjové mezi studenty vzbuzovala závist, jež nakonec vedla k jejímu víceméně nucenému odchodu z university v r. 1957. D. Dykyjová našla přátelské útočiště v tehdejší Encyklopedické kanceláři ČSAV. Tam dostala za úkol psát a redigovat biologická hesla pro novou Československou encyklopedii. Zbavena možnosti pracovat experimentálně, využila této příležitosti k rozšíření svých bio32 Dagmar Dykyjová logických vědomostí. To se obráží i ve 2. dílu tehdy moderní učebnice fyziologie rostlin pro zemědělské vysoké školy, který sepsala společně s profesorem R. Dostálem; vyšel v r. 1962. Velká změna nastala v životě D. Dykyjové, když ji v r. 1963. S. Hejný, ředitel Botanického ústavu ČSAV, pozval od 1.1.1964 do svého ústavu a dal jí na vybranou mezi ekofyziologickým studiem antropofyt (plevelů a ruderálních rostlin) v Průhonicích, a výzkumem mokřadních a vodních makrofy) na Třeboňsku, kde tyto rostliny se tehdy ještě vyskytovaly hojně i v rybnících a tekoucích vodách. Rozhodla se pro Třeboňsko, kde rychle uvedla v život náročný výzkumný program zaměřený především na produkční ekologii vegetace rybničních pobřeží, převážně porostlých rákosem a orobinci. V r. 1965 byl zahájen desetiletý Mezinárodní biologický program (IBP) pod heslem “Biologické základy produktivity a lidského blahobytu”. Studium fotosyntetické produkce rostlin bylo přirozeně významnou složkou IBP. Rod rákos (Phragmites), který je téměř kosmopolitní, byl navržen jako rostlina vhodná ke srovnávacímu výzkumu produktivity rostlin v rozdílných klimatických a půdních podmínkách. Českoslovenští vědci, jejichž specializace souvisela s náplní IBP, se ochotně zapojovali do IBP jako programu usnadňujícího tehdy dosti obtížnou komunikaci s jejich partnery ze zemí mimo „socialistický tábor“. D. Dykyjová se stala čs. koordinátorkou sekce IBP pro výzkum produktivity souše, který vždy propojovala s výzkumem produkčních procesů. Důležité byly například výzkumy její a jejích spolupracovníků hodnotící příjem a akumulaci minerálních živin mokřadními rostlinami, jak v terénu, tak v řízených kultivačních podmínkách. Totéž platí o stanoveních obsahu energie v sušině rákosu a dalších makrofyt, zhodnocených v jejím společném článku se S. Přibilem. Jedinečná jsou srovnání mezi primární produkcí rákosin na eutrofních stanovištích s produkcí jednobuněčných řas hromadně pěstovaných v optimálních podmínkách, jež podnikla společně s I. Šetlíkem. Rákos byl překvapivě poněkud produktivnější než řasy. Dala základ hodnocení radiačního režimu v rákosinách, které pomocí matematiky rozvinul J.P. Ondok. Produkčně ekologický výzkum rákosin postupně přešel do plnohodnotného ekosystémového výzkumu rybničního pobřežního ekotonu. V r. 1978 D. Dykyjová a autor tohoto článku jako editoři uveřejnili knihu shrnující hlavní výsledky tohoto výzkumu v národním měřítku. Mezinárodní spolupráci při studiu mokřadů koordinovala pracovní skupina IBP pro mokřady, jejíž byla D. Dykyjová v r. 1970 spoluzakladatelkou. Mnohé její výsledky se výrazně uplatnily v mezinárodní syntéze výzkumu mokřadů, uveřejněné až v r. 1998. Mezitím UNESCO vyhlásilo v r. 1971 program Člověk a biosféra (Man and the Biosphere, MaB). Ve své počáteční fázi byl program MaB zaměřen silně výzkumně, podobně jako byl IBP. D. Dykyjová se v tomto programu výrazně podílela na výzkumu ekosystémového provozu mokrých luk, jako marginálních mokřadů na vnějších okrajích pobřeží jak stojatých, tak tekoucích vod, ohrožených hlavně eutrofizací a odvodňováním. Její zájem a péče o úroveň a metodologii ekologického výzkumu vyústil v r. 1989 ve vydání obsáhlé a v té době ojedinělé příručky, pro niž obětavě a pečlivě redigovala příspěvky mnoha českých a slovenských specialistů. V r. 2001 ocenila zásluhy D. Dykyjové o vědecké poznání mokřadů mezinárodní společnost Society of Wetland Scientists (SWS) a udělila jí jednak celoživotní čestné členství, jednak uznání “International Fellowship Award”. Tím bylo na mezinárodní půdě doplněno národní uznání, jehož se jí dostalo od ČSAV udělením zlaté medaile J.G. Mendela v r. 1984. Celoživotní láskou D. Dykyjové bylo studium středoevropských vstavačovitých rostlin. Zabývala se nejen jejich biologií a ekologií, ale i fyziologií. Své nálezy orchidejí dokumentovala nedestruktivně, pomocí výborných fotografií. Hlavní výsledky tohoto svého výzkumu shrnula v knize uveřejněné v r. 2003, kdy jí bylo 89 let! D. Dykyjová nikdy neoddělovala od sebe základní a aplikovanou vědu. Z aplikací ekologických poznatků pro ni vždy byla důležitá ochrana přírody a životního prostředí. Asi nejvýznamnějším výsledkem jejího ochranářského snažení bylo vyhlášení biosférické rezervace Třeboňsko organizací UNESCO v r. 1977. Na národní úrovni to bylo vyhlášení CHKO Třeboňsko v r.1979. Společně s hrstkou svých kolegů a kolegyň pečlivě 33 Vzpomínáme pracovala na podkladových dokumentech pro tato rozhodnutí. Svůj všestranný pohled na veškeré hodnoty Třeboňska podává v knize pro širokou veřejnost, bohatě ilustrované (namnoze vlastními fotografiemi) a vydané v r. 2000. D. Dykyjová věnovala od počátku své vědecké dráhy čas a péči popularizaci vědeckých poznatků o životních funkcích rostlin, o racionálním využívání a ochraně přírody a krajiny jak obecně, tak v konkrétních případech. Její přečetné popularizační články v různých časopisech a novinách, rozhlasové a televizní relace, filmy, na nichž se podílela, a velké množství přednášek a besed pro veřejnost vyžadovaly nejen obsáhlé znalosti, ale mnohdy také podstatný kus občanské odvahy. Za tyto své zásluhy obdržela jednou cenu a jednou zvláštní uznání ministra pro životní prostředí ČR. Byla čestnou členkou této společnosti. D. Dykyjová si udržela téměř až do konce svého dlouhého života dobrou duševní pohodu a relativně dobré zdraví. Její život byl naplněn láskou jak k vědě, tak k rodině, vstřícností a pochopením pro spolupracovníky, studenty a poctivé lidi vůbec. Posledních několik let měla to štěstí, že mohla žít ve svém navráceném rodném domě v České Bělé a opírat se o pomoc svých dětí a jejich rodin. Opustila tento svět 22. prosince 2011 ve věku téměř 98 let. Jsme jí vděčni za vše, co nám dala, a musíme přijmout skutečnost, že již není mezi námi. Ale stale nás její příklad bude nabádat k činorodému a poctivému žití. Počet publikací D. Dykyjové, jak vědeckých, tak vědecko-popularizačních, je úctyhodný. Seznam jejích hlavních vědeckých prací brzo uveřejní časopis „Zprávy České botanické společnosti“. Doc. RNDr. Zdeňka Slavíková, CSc. V říjnu loňského roku zemřela doc. RNDr. Zdeňka Slavíková, pracovnice Katedry botaniky PřF UK. Doc. Slavíkovou spojovala s pracovníky Katedry experimentální biologie rostlin, tehdy ještě Katedry fyziologie rostlin, dlouhodobá spolupráce v rámci výuky předmětu Anatomie a morfologie rostlin, na jehož výuce se od nepaměti podílejí obě katedry. Když jsem převzala výuku tohoto předmětu, mile mě překvapil její přístup k naší spolupráci – byla v té době starší a hlavně mnohem zkušenější než já. Přesto se chovala velmi vstřícně a během těch mnoha let se náš vztah vyvinul v přátelství. Čeho jsem si na ní asi nejvíc cenila, byla její schopnost se dohodnout i o věcech sporných a vždycky jsme dohodu dokázaly najít. Asi i proto, že obě jsme chtěly studenty přesvědčit, že tyto dvě discipliny, anatomie a morfologie, jsou základem pro ostatní botanické discipliny a že pokud se chtějí jakémukoliv botanickému odvětví věnovat, neměli by tyto discipliny opomenout. Bylo pro mne velkou radostí, když mne navrhla jako oponentku svých skript „Morfologie rostlin“ a moc ráda jsem se této práce ujala a dodnes skripta využívám nejen já, ale i ostatní kolegové z katedry. Jsem velmi ráda, že jí v našem Bulletinu můžeme věnovat krátkou vzpomínku, kterou napsala její dlouholetá spolupracovnice a přítelkyně dr. Anna Skalická. Olga Votrubová 34 Zdeňka Slavíková 25. října 2011 jsme se naposledy rozloučili s doc. RNDr. Zdeňkou Slavíkovou, CSc., naší milou spolupracovnicí, kolegyní a přítelkyní. Nechce se uvěřit, že nás navždy opustila, v našich vzpomínkách je stále s námi. Zemřela ve věku 76 let po delších zdravotních potížích, které byly jistě i důsledkem tragických odchodů v její rodině: smrt dcery Renaty, vnučky Lucinky a manžela Bohumila. Odešla nejen hodná, přátelská a nezištná osoba, ale i významná pracovnice Katedry botaniky PřF UK, na které působila od roku 1962. Začínala zde jako odborná asistentka a od roku 1993, po předložení a obhájení habilitační práce „Květní morfologie vybraných taxonů krytosemenných rostlin“ jako docentka. Vždy se snažila dokázat, jak je důležitá znalost morfologie pro celou botaniku a že je tato disciplina základním stavebním kamenem ostatních botanických odvětví. Své znalosti předávala posluchačům na pečlivě připravených přednáškách, praktických cvičeních, četných exkursích a při vedení celé řady diplomových prací. Byla spoluautorkou skript „Praktická cvičení ze systematické botaniky“ a „Sběr, preparace a konservace rostlinného materiálu“. Samostatně napsala skripta „Morfologie rostlin“, která pro svůj význam vyšla již ve čtyřech vydáních. Významná je i její vědecko-výzkumná práce. Jejím základem byla práce v terénu, podklady pro svou práci získávala na četných exkursích (výjezdech) po celé republice, tehdy ještě včetně Slovenska. Spolupracovala s institucemi ochrany přírody, pravidelně se účastnila výjezdních seminářů ochrany přírody Středočeského kraje a v roce 1972 byla jmenována krajským konservátorem. Pro ochranu přírody prováděla se svými kolegy a se svým manželem několikaletý floristický výzkum v oblasti Orlíka před zatopením údolí při stavbě přehrady. Neobyčejně důležitým přínosem bylo sestavení morfologického slovníku pro 1. díl Květeny ČR (dosud vyšlo 8 dílů). Kromě tohoto slovníku revidovala rukopisy všech autorů dalších dílů. Samostatně zpracovala pro 6. díl rody Galeopsis (konopice) a Ladanella (konopička). Další oblastí zájmu Doc. Slavíkové byla květní biologie a morfologie květů. Podrobně studovala stavbu nektarií a průběh cévních svazků v korunních lístcích některých vybraných čeledí, což vyústilo v řadu publikací. Za dlouholetou pedagogickou a odbornou činnost jí byla udělena stříbrná a zlatá medaile Přírodovědecké fakulty UK. O výsledcích práce a působení doc. Slavíkové, lépe přítelkyně Zdeňky, by se mohlo napsat mnohem více. Ale těchto pár řádků je pouhou vzpomínkou, nikoli detailním výčtem jejích aktivit. Životopis a přehled publikovaných prací přináší článek J. Chrtka u příležitosti 60. narozenin Z. Slavíkové (Preslia 67/2: 185 – 189, 1995). Dr. Anna Skalická, CSc. 35 Disertační práce Strategies in aboveground space occupancy in herbs from disturbed habitats Alena Bartušková Faculty of Science, University of South Bohemia in České Budějovice; Institute of Botany of the ASCR, Třeboň; May 2012, Supervisor: Jitka Klimešová Disturbance is an important phenomenon affecting plant lives and shaping plant strategies in disturbed habitats. A variety of ecological concepts on individual plant response to injury has been proposed for specific natural ecosystems or growth forms. In Central Europe, man-made habitats are often cases of disturbed places, so the aim of the thesis was to apply four chosen concepts on them using manipulative experiments. We focused on three main plant parameters: fecundity, shoot biomass, shoot architecture and biomass partitioning among shoot organs (stem, leaf, flower). The thesis is composed of four original studies performed in two model ecosystems: a recurrently disturbed ruderal place inhabited by short-lived monocarpic plants and a regularly mown Central European meadow. The occupying of the aboveground space after a disturbance event was studied here either as renovation of biomass or plant architecture. Regenerative strategies in herbs occupying disturbed habitats were described and confronted with concepts proposed originally for ecosystems subjected to natural disturbance regimes. Case study 1 deals with comparison of the vegetative and generative regeneration following a severe disturbance in two short-lived herbs Rorippa palustris and Barbarea vulgaris. Case study 2 focuses on the compensatory growth after a hard damage and describes differences in the architecture of reiterated structures from the basal axillary buds and from the adventitious buds on roots in Rorippa palustris. Case study 3 describes the compensatory growth of 41 meadow plants after mowing and gives it in the relationship with the proportion of removed biomass and plant size. Another studied aspect is the effect of water availability on these features. Case study 4 follows the changes in biomass allocation pattern in 41 meadow plants after the cessation of regular mowing management, again on the example of two meadows differing in the water availability. 36 Disertační práce Phylogeny, Phytogeography, and Taxonomy of Polar Oscillatoriales O. Strunecký Ph.D. Thesis, Series No. 2. University of South Bohemia, Faculty of Science, School of Doctoral Studies in Biological Sciences, České Budějovice, Czech Republic, 104 pp. Supervisor: Josef Elster, scientific consultant: Jiří Komárek. Defended in 2012. Morphological and phylogenetic diversity of 143 strains belonging to Oscillatoriales with focus on traditional genera Phormidium sensu lato and Microcoleus were studied. The 88 strains of Ph. autumnale, Ph. setchelianum, Ph. subfuscum, Ph. favosum etc., and M. vaginatus confirmed the generic identity with typical Microcoleus Desmazières ex Gomont. The necessary nomenclatoric transfers were realized defining the revised genus Microcoleus. Based on phylogeny and morphology the taxonomic revision of the Antarctic species Ph. murrayi (Lyngbya murray West & West) was implemented and the genus Wilmottia was established. The phylogenetic evaluation of morpho-species included in Phormidium group I (Ph. lloydianum and Ph. acuminatum Gomont) preceded the definition of species Oxynema thaianum spec. nova. The biogeography of Antarctic and Arctic strains of M. vaginatus (Ph. autumnale) based on 16S rDNA and ITS sequences and strain's morphology was evaluated. The comparison of polar and non polar strains indicated that the Antarctic populations of M. vaginatus remained isolated from time of the isolation of the Antarctica from the Gondwana before ~31–45 Mya, whereas the transport of populations within Arctic is relatively frequent even at the present time. The thesis was based on the papers (listed chronologically): Strunecký, O., Elster, J. & Komárek, J. 2010. Phylogenetic relationships between geographically separate Phormidium cyanobacteria: is there a link between north and south polar regions? Polar Biology 33:1419-28 Strunecký, O., Elster, J. & Komárek, J. 2011. Taxonomic revision of the fresh–water cyanobacterium „Phormidium“ murrayi = Wilmottia murrayi. Fottea 11:57–71. Chatchawan, T., Komárek, J., Strunecký, O. & Šmarda, J. 2011. Phylogenetic position and ecology of the halophilic cyanobacterium Oxynema lloydianum (Gomont) comb. nova, separated from the traditional genus Phormidium. Cryptogamie Algologie (accepted). Strunecký, O., Komárek, J. & Elster, J. 2012. Biogeography of Phormidium autumnale (Oscillatoriales, Cyanobacteria) in western and central parts of Spitsbergen. Polish Polar Research accepted. Strunecký, O., Elster, J. & Komárek, J.. Molecular clock provided evidence for survival of cyanobacteria (Oscillatoriales, Phormidium autumnale) in Antarctica from Paleozoic times FEMS submited. Strunecký, O., Komárek, J., Johansen, J., Lukešová, A. & Elster, J. manuscript. Molecular and morphological criteria for revision of the genera Microcoleus Desmazières ex Gomont and Phormidium Kützing ex Gomont (Cyanobacteria), based on strains of Microcoleus vaginatus and Phormidum autumnale. Journal of Phycology. 37 Diplomová práce Molekulární farmářství a biofortifikované rostliny - aktualizace gymnaziálního studia biologie Kateřina Koblihová Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK v Praze, 2012 S růstem lidské populace roste poptávka po rostlinné a jiné produkci a zároveň klesá rozsah území, kde mohou být rostliny pěstovány. Lidem proto nestačí současná zemědělská výroba potravin, technických surovin či léčiv rostlinného původu ať už z tohoto důvodu, či kvůli snaze dosáhnout vyššího životního komfortu zejména v rozvinutých zemích. Snažíme se nalézt jednodušší, ekologičtější a levnější způsoby rostlinné produkce. Jednou z moderních možností jak dosáhnout tohoto cíle jsou genetické modifikace. Studenti se o nich dozvídají mnoho informací z nejrůznějších zdrojů, ale především jen z internetu a televize. Je vhodné, aby informace, které získávají z médií, porovnávali také se svými poznatky školními, protože jedině tak nepodlehnou tendenčním tlakům a manipulacím. 38 ENGLISH PART ANGLICKÁ ČÁST 39 Plant Biology Congress 2016 Candidacy to host the Plant Biology Congress in Prague in 2016 Part of materials submited to EPSO and FESPB representatives at the 18th Plant Biology Congress 2012 co-organized by FESPB and EPSO in Freiburg, Germany, from 29 of July to 3 of August 2012. INVITATION AND THE LETTER OF INTENT Dear EPSO and FESPB representatives, as the President of the Czech Society of Experimental Plant Biology (CSEPB), together with my colleague Jiří Šantrůček, who is a national representative of CSEPB in FESPB, I am very pleased to present this candidacy to host the Plant Biology Congress in Prague in 2016. The candidacy is fully supported by all major institutions located in Prague with focus on plant science – Charles University in Prague, Faculty of Science, Czech University of Life Sciences, Institute of Experimental Botany of Academy of Sciences of the Czech Republic, Institute of Botany of Academy of Sciences of the Czech Republic. In addition it is supported by the other of the foremost Czech universities - University of South Bohemia in České Budějovice. The Czech Society of Experimental Plant Biology (CSEPB) was established in the early 1990’s. It followed-up to an earlier long and succesfull activity of the Physiological Section of the Czech Botanical Society, which is celebrating 100 years from its establishment. CSEPB currently associates more than 120 plant biologists from the Czech Republic and some members from Slovakia. Close collaboration of CSEPB with Slovakian colleagues within the Physiological Section of Slovakian Botanical Society is given by historical reasons of long-term existence in one state of Czechoslovakia. CSEPB is a member of the Federation of European Societies of Plant Biology (FESPB). CSEPB contributes to accomplishment of the aims of FESPB to advance research and education in plant sciences, and the exchange of information amongst plant biologists within Europe and beyond. CSEPB regularly organizes or co-organizes plant science meetings on national and international level. The most important are international, mainly Czech-Slovakian Conferences on Experimental Plant Biology rotating in 3-year intervals in hosting institutions in centers of plant sciences around the Czech Republic and Slovakia. The last one - 12th KEBR 2010 with 280 participants - was organized in Prague by the team composed of many of the members of the Local Proposing Committee. In addition, the CSEPB organizes annual conferences of Ph.D. students of plant biology and symposia on methods in plant biology (Methodical Days). CSEPB is an Associate of EPSO being the sixth national society signing in 2009 the Memorandum of Understanding on science policy cooperation in the European plant 40 Invitation and the Letter of Intent sector and beyond towards creating the "Knowledge Based Bio-Economy". CSEPB is collaborating with EPSO to join forces on policy issues and public education. For example, this year we joined EPSO initiative of Fascination of Plants Day. Prague is a beautiful city offering both historical and modern conference venues, hotels, restaurants, infrastructure and places of interest. The conference delegates coming to Prague greatly enjoy the wide variety of suitable venues which provide a high standard of hospitality, with the overall costs being competitive compared to other European cities. What is also important is that Prague attracts a high number of congress participants thanks to its central European location. The city, lying in the heart of Europe, can be very easily reached from all over the world. We strongly believe that our capital Prague as well as our organization have all the infrastructure necessary for the a successful meeting. The best evidence of Prague being a successful congress venue is the fact that in 2014 the city hosts the 18th International Microscopy Congress (IMC) with as many as 3000 international delegates expected to attend. I am highly convinced that the Plant Biology Congress in Prague in 2016 will be a great success. Our capital is a charming place meeting all necessary requirements for this prestigious meeting. And last but not least, our local team supported by an experienced professional congress organizer is more than prepared to deliver its best to make the Congress a successful and memorable event. The members of the Local Proposing Comittee are plant scientists representing all hosting institutions of the proposed 2016 Congress, intending to participate in the 2016 meeting organization. I believe that Prague’s candidacy will be successful. Respectfully Yours, Jana Albrechtová Assoc. Prof. Jana Albrechtová, Ph.D. President of the Czech Society of Experimental Plant Biology Charles University in Prague, Faculty of Science Insitute of Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic 41 Plant Biology Congress 2016 LOCAL PROPOSING COMMITTEE REPRESENTATIVES OF NATIONAL SOCIETIES Assoc. Prof. Jana Albrechtová, Ph.D. President of the Czech Society of Experimental Plant Biology Head of the Department of Experimental Plant Biology, Charles University in Prague, Faculty of Science Institute of Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic Assoc. Prof. Jiří Šantrůček, Ph.D. National representative of the CSEBP in the FESPB Head of the Department of Experimental Plant Biology, Faculty of Science, University of South Bohemia in České Budějovice Institute of Plant Molecular Biology, Biology Centre of the Academy of Sciences of the Czech Republic in České Budějovice RNDr. Tomáš Vaněk, Ph.D. National representative of the Czech Republic in the EPSO Institute of Experimental Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic in Prague Prof. Lubomír Nátr, DrSc. Deputy President of the Czech Society of Experimental Plant Biology Department of Experimental Plant Biology, Charles University in Prague, Faculty of Science PROPOSED MEMBERS AT LARGE IN ALPHABET ORDER RNDr. Fatima Cvrčková, Dr. rer. nat. Department of Experimental Plant Biology, Charles University in Prague, Faculty of Science RNDr. Milan Durchan, Ph.D. Institute of Plant Molecular Biology, Biology Centre of the Academy of Sciences of the Czech Republic in České Budějovice 42 Local Proposing Committee RNDr. Tomáš Hájek, Ph.D. Institute of Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic, Division in Třeboň Assoc. Prof. Václav Hejnák, Ph.D. Vice Dean of the Faculty of Agrobiology, Food and Natural Resources of the Czech University of Life Sciences in Prague Head of the Department of Botany and Plant Physiology, Faculty of Agrobiology, Food and Natural Resources of the Czech University of Life Sciences in Prague RNDr. David Honys, Ph.D. Institute of Experimental Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic in Prague Department of Experimental Plant Biology, Charles University in Prague, Faculty of Science Ing. Václav Motyka, Ph.D. Institute of Experimental Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic in Prague RNDr. Jan Petrášek, Ph.D. Institute of Experimental Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic in Prague Department of Experimental Plant Biology, Charles University in Prague, Faculty of Science Prof. Ondřej Prášil, Ph.D. Head of the Department of the Phototophic Microorganisms, Institute of Microbiology, Academy of Sciences of the Czech Republic in Třeboň RNDr. Kateřina Schwarzerová, Ph.D. Department of Experimental Plant Biology, Charles University in Prague, Faculty of Science, 43 Plant Biology Congress 2016 RNDr. Martin Vágner, Ph.D. Director of the Institute of Experimental Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic in Prague RNDr. Radomíra Vaňková, Ph.D. Institute of Experimental Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic in Prague Mgr. Pavel Vítámvás, Ph.D. Department of Genetics and Plant Breeding Methods, Crop Research Institute in Prague RNDr. Miroslav Vosátka, Ph.D. Director of the Institute of Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic in Průhonice by Prague RNDr. Viktor Žárský, Ph.D. Department of Experimental Plant Biology, Charles University in Prague, Faculty of Science Institute of Experimental Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic in Prague 44 GUARANT International CSEBR partner for the Prague candidacy to host the Plant Biology Congress FESPB/EPSO 2016 GUARANT International – your conference partner • Professional congress organizer (PCO) • Operating within Central and Eastern Europe • Over 20 years of experience • 50 - 80 conference events annually • Team of 35 professionals • Turnkey solutions for your events • We organize 18th International Microscopy Congress 2014 in Prague GUARANT International spol. s r.o. Opletalova 22 110 00 Prague 1 Czech Republic Tel: +420 284 001 444 Fax: +420 284 001 448 E-mail: [email protected] Web: www.guarant.cz 45 46 The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology September 3-5, 2012, Brno Organizing institutions Institute of Biophysics of the Academy of Sciences of the Czech Republic Czech Society of Experimental Plant Biology Biomania 47 Welcome Letter Dear colleagues, This year the International Conference of PhD Students on Plant Experimental Biology will be held in Brno, in September 3-5, 2012. It is organised in the series as the 10th Student Conference by the Czech Society for Experimental Plant Biology, but this time the organization of this event is largely realised by the Institute of Biophysics of the Czech Academy of Sciences in Brno and by the Biomania, a society of students of the Faculty of Science, Masaryk University in Brno. Our conference is party organised in the Old Brno Monastery, the famous place where the founder of genetics – Gregor Mendel – lived and performed his famous experiments with pea plants. Based on the registration we expect about 120 participants from 12 counties. The scientific committee, which will be awarding the best presentations, possesses 11 experts from 4 countries. We have also invited four well recognised professors who will present overview lectures. The oral presentations of students are organised in 3 sections – molecular and cell biology (12 talks), biochemistry and physiology (12 talks), and systematics and evolution (4 talks). The scientific committee will award 3 best presentations regardless the sections. We expect totally 50 poster presentations: these will be evaluated by the participants themselves. We have tried to prepare comfortable conditions for the conference including receptions and social programme. They are partly covered by numerous sponsors who will also present 5 expert talks. We do hope you will enjoy the conference as well as your stay in Brno, Boris Vyskot Institute of Biophysics 48 49 Welcome Address from CSEPB Dear Colleagues, I have great pleasure to contribute to welcome address of the 10th Student Conference of Ph.D. students in the field of experimental plant biology held this time in Brno, in September 3-5, 2012. It has been organized regularly in the conference series of the Czech Society for Experimental Plant Biology in centers of plant biology around the Czech Republic and Slovakia. The aims of this conferences are to offer opportunity for students in the field of experimental plant biology to present their results in English what is an important skill particularly for non-native speakers. Furthermore, to prepare them for defense of their Ph.D. Theses and to try presentation in English at an international conference, yet in friendly environment of mainly same-age colleagues. Last but not least aim is networking among colleagues across national borders - the conference brings together students from different research, scientific and academic institutions of the field of experimental plant biology located not only in the Czech Republic and Slovakia but other EU countries also. Let me mention recent history of the conference series, which is held annually. In 2008, the 6th conference was held in Nové Hrady with the main organizer Jiří Šantrůček from the South Bohemian University in České Budějovice, in 2009 the 7th conference was hosted by Brno with the organizers from Mendel University - Vilém Reinöhl - and Masaryk University - Helena Vlašínová and Jaroslava Dubová. In 2010, the 8th student conference „Insight in Plant Affairs“ (http://www.vurv.cz/kebr/kdebr.htm) was a join event of the main, regular field Conference on Experimental Plant Biology „12th KEBR“ (http:// www.vurv.cz/kebr) organized by the CSEPB in 3-year intervals. The last year, the 9th conference was intedned being hosted by Slovakia though then norganized ad hoc also in Prague - that time it was hosted by the Department of Experimental Plant Biology, Faculty of Science, Charles University in Prague (http://www.csebr.cz/kdebr2011/). So it happened that I was in charge of the two last subsequent conferences in the series. Thus, I have a great pleasure that this year the organization of the event was taken over by Brno due to a generous offer of Boris Vyskot from the Institute of Biophysics of the Czech Academy of Sciences in Brno. He has got involved in organization the Biomania, a society of students of the Faculty of Science, Masaryk University in Brno. They made a great job together - amount of participants belongs to the highest number up to date in the conference series. I am pleased to state that the 2012 conference program is an exciting overview of very interesting topics from the field. These are great news for future of experimental plant biology, indeed! Conference is not intended only for young scientists, Ph.D. students but for anyone who is eager to get „fresh insights“, remains young in their mind and wants to find new prospective collaborators for their own research. So I extend a warm welcome to all our already „well-established in the field“ colleagues who came to support the conference, taking part in the evaluation committee and to meet coming generation of plant biologists. I hope that during the conference we will establish new friendships, relationships and professional contacts. Maybe we will find new collaborators for a project or to a team. I wish the conference to provide an excellent environment to exchange ideas and share joy from the beauty of experimental plant biology. Thanks to all organizing colleagues from Brno and most of all – thanks to you, Boris! Jana Albrechtová President of the Czech Society for Experimental Plant Biology 50 CSEPB - Presentation CZECH SOCIETY OF EXPERIMENTAL EXPERIMENTAL PLANT BIOLOGY The Czech Society of Experimental Plant Biology (CSEPB, http://www.csebr.cz/english/index.html) was established in the early 90s in the last century. It followed-up to an earlier long and successful of the Physiological Section of Czech Botanical Society, which is celebrating 100 years from its establishment this year. The research fields included in the focus of CSEPB are not restricted to the pure laboratory or theoretical ones, on the contrary, we welcome colleagues from applied science and field research. CSEPB currently associates more than 120 plant biologists from the Czech Republic and some members from Slovakia. Close collaboration of CSEPB with Slovakian colleagues within the Physiological Section of Slovakian Botanical Society is given by historical reasons of long-term existence in one state of Czechoslovakia - the CSEPB keeps tradition of collaboration in the field of experimental plant biology independently on legally determined borders. CSEPB regularly organizes or co-organizes plant science meetings on national and international level. The most important are international, mainly Czech-Slovak Conferences on Experimental Plant Biology rotating in 3-year intervals in hosting institutions in centers of plant sciences around the Czech Republic and Slovakia. In addition, the CSEPB organizes annual conferences of Ph.D. students of plant biology and symposia on methods in plant biology (Methodical Days). CSEPB publishes journal - Bulletin of CSEPB and the Physiological Section of the Slovakian Botanical Society – serving as a platform for field information, sharing experience, commemorating important events, personalities of the national plant scientists. In addition, proceedings of the conferences organized by CSEPB are published in the Bulletin CSEPB and PS SBS. CSEPB is a member of the Federation of European Societies of Plant Biology (FESPB). CSEPB is an Associate of EPSO being the sixth national society signing in 2009 the Memorandum of Understanding on science policy cooperation in the European plant sector and beyond towards creating the "Knowledge Based Bio-Economy". This year CSEPB joined EPSO initiative of Fascination of Plants Day on 18th May 2012. Nineteen Czech institutions joined FoPD with 16 events including various activities. One of the biggest events in CZ was „the Magic Power of Plants“ organized in the Botanical Garden of Charles University in Prague showing hands-on activities and demonstrations aimed on plant functioning with more than 2,000 visitors. The Czech programme was held under the auspices of Petr Bendl, Minister of Agriculture of the Czech Republic. CSEPB is a member of the Council of Scientific Societies of the Czech Republic by the Academy of Sciences (CSSCR), that includes more than 70 professional learned societies from all scientific fields. 51 Commitee Scientific Committee Dr. Ortrun Mittelsten Scheid Prof. Ingo Schubert (GMI Vienna) (IPK Gatersleben) Assoc. Prof. Jana Albrechtová Prof. Miloš Barták (Charles University, Prague) (Masaryk University, Brno) Prof. Ladislav Havel Assoc. Prof. Ruslan Kalendar (Mendel University, Brno) (University of Helsinki) Dr. Aleš Kovařík Dr. Pavel Lízal (Institute of Biophysics ASCR, Brno) (Masaryk University, Brno) Prof. Zdeněk Opatrný Assoc. Prof. Jana Řepková (Charles University, Prague) (Masaryk University, Brno) Assoc. Prof. Jiří Šantrůček Prof. Boris Vyskot (University of South Bohemia, České Budějovice) (Institute of Biophysics ASCR, Brno) Organizing Committee Pavlína Šteflová (Institute of Biophysics ASCR, Brno) Roman Hobza Eduard Kejnovský (Institute of Biophysics ASCR, Brno) (Institute of Biophysics ASCR, Brno) Magda Soukupová Boris Vyskot (Institute of Biophysics ASCR, Brno) (Institute of Biophysics ASCR, Brno) Jana Albrechtová Lenka Dvořáková (Charles University, Prague) (Charles University, Prague) Marian Hlavna Olga Krupková (Biomania) (Biomania) Pavel Reichmann Jan Škoda (Biomania) (Biomania) The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 52 Sponsors, Invited Talks Invited talks: Prof. Ortrun Mittelsten Scheid (Gregor Mendel Institute of Plant Molecular Biology, Vienna) Prof. Ingo Schubert (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research, Gatersleben) Prof. Ruslan Kalendar (University of Helsinki) Prof. Zdeněk Opatrný (Charles University, Prague) The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 53 Conference Venue 54 Programme Monday - September 3, 2012 - Mendel Museum 14:00 - 16:00 Registration (Mendel Museum) 14:00 - 22:00 Accommodation (Vinařská dormitory) 16:00 - 16:15 Opening words (Mendel Museum) 16:15 - 17:00 Invited talk - Prof. Ortrun Mittelsten Scheid (Gregor Mendel Institute of Plant Molecular Biology, Vienna): Epigenetics in plants 17:00 - 17:45 Invited talk - Prof. Ingo Schubert (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research, Gatersleben): Principles of karyotype evolution 17:45 - 18:00 Group photo in front of the Mendel Museum 18:00 - 21:00 Guided tour to the Mendel Museum and Monastery, Welcome reception Tuesday - September 4, 2012 - Vinařská dormitory 8:30 - 9:00 Mounting of posters 9:00 - 9:30 Invited talk - Prof. Ruslan Kalendar (University of Helsinki): What is the reality of a gene? 9:30 - 10:30 talk 11-3, Section 1 (Molecular & Cell Genetics) 9:30 - 9:50 Radka Uhlířová (GMI Vienna): Quantitative trait loci associated with Arabidopsis thaliana early root meristem 9:50 - 10:10 Veronika Zbránková (University of Ostrava): The complete mitochondrial genome sequence of the eustigmatophyte alga T. minutus 10:10 - 10:30 Sergey Mursalimov (Acad. Sci. Novosibirsk): Cytomixis and nuclear vacuoles in tobacco microsporogenesis 10:30 - 10:50 Coffee break 10:50 - 12:30 talk 44-8, Continuation of Section 1 10:50 - 11:10 Eva Majerová (Masaryk University, Brno): Epigenetic regulation of Nicotiana tabacum telomeres 11:10 - 11:30 Michael Watson (University of Leeds): Activity of mammalian DNA demethylation functions in Arabidopsis 11:30 - 11:50 František Zedek (Masaryk University, Brno): A mystery of the origin of holocentric chromosomes 11:50 - 12:10 Yuuta Imoto (University of Tokyo): Division behavior of mitochondrion and microbody in the red algae Cyanidioschyzon merolae 12:10 - 12:30 Lucie Najdekrová (Acad. Sci. Brno): The role of NBS1 in telomere maintenance of Arabidopsis thaliana 12:30 - 13:30 Lunch The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 55 Programme 13:30 - 14:50 talk 99-12, Section 2 (Developmental Biology) 13:30 - 13:50 Andreas Finke (IPK Gatersleben): Genetic analysis of RNA-directed transcriptional gene silencing in Arabidopsis thaliana 13:50 - 14:10 Jana Jarešová (Acad. Sci. Třeboň): The 17kDa protein is expressed in the course of chromatic adaptation of alga Chromera velia 14:10 - 14:30 Martin Janda (ICT Prague): Phospholipid signalling in SA pathway in Arabidopsis thaliana 14:30 - 14:50 Martina Kudělková (MENDELU Lednice): Comparison of test results of garlic plants for presence Carlaviruses by different methods 14:50 - 15:10 Coffee break 15:10 - 16:30 talk 1313-16, Continuation of the Section 2 15:10 - 15:30 Zuzana Vatehová (Acad. Sci. Bratislava): Cell wall modification of Zea mays L. plants treated with cadmium 15:30 - 15:50 Tomáš Zavřel (CzechGlobe Brno): Dynamics and constraints of batch culture growth of Synechocystis sp. PCC 6803 15:50 - 16:10 Wioletta Brankiewicz (University of Lublin): The influence of reactive oxygen species to the bioelectric signals of liverwort Conocephalum conicum 16:10 - 16:30 Eva Tomaštíková (Acad. Sci. Olomouc): Protein interactions of Arabidopsis RanBPM homologue reveal conservation of CTLH 16:30 - 18:30 Poster session 16:30 - 17:30 Odd numbers (1, 3, 5, …) 17:30 - 18:30 Even numbers (2, 4, 6, …) 19:00 - 23:00 Conference Party (Restaurant Železná růže) Wednesday, September 5, 2012, Vinařská dormitory 9:00 - 9:30 Invited talk - Prof. Zdeněk Opatrný (Charles University, Prague): Plant cell lines as experimental models of postgenomic biology: their privileges and limitations 9:30 - 10:30 talk 1717-19, Continuation of the Section 2 9:30 - 9:50 Danica Kučerová (Acad. Sci. Bratislava): Effect of galactoglucomannan oligosaccharides and cadmium on the growth and development of Arabidopsis thaliana primary root 9:50 - 10:10 Martin Rozmoš (Masaryk University, Brno): Do strigolactones really affect branching of arbuscular mycorrhizal mycelium? 10:10 - 10:30 Ladislav Šigut (University of Ostrava): Does long-term cultivation under elevated CO2 concentration influence acclimation of assimilatory processes to temperature? 10:30 - 10:50 Coffee break The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 56 Programme 10:50 - 12:30 talk 2020-24, Continuation of Section 2 10:50 - 11:10 Jana Klásková (Acad. Sci. Olomouc): New generation of potential inhibitors of cytokinin oxidase/dehydrogenase from Arabidopsis thaliana 11:10 - 11:30 Lucie Maršálová (ICT Prague): Plant Integral Membrane Proteins and Herbiced or what does not kill you makes you stronger 11:30 - 11:50 Kristina Felcmanová (Acad. Sci. Třeboň): Influence of enhanced CO2 concentration on regulation of photosynthesis in diazotrophic cyanobacteria 11:50 - 12:10 Eliška Ježilová (Acad. Sci. Olomouc): Stomatal opening under blue light and growth parameters of tomato mutant 7B-1 12:10 - 12:30 Halyna Korovetska (Masaryk University, Brno): How plants sense the reduced water availability? 12:30 - 13:30 Lunch 13:30 - 14:50 talk 2525-28, Section 3 (Systematics & Evolution) 13:30 - 13:50 Sonja Klemme (IPK Gatersleben): DNA composition and evolution of a selfish chromosome 13:50 - 14:10 Tereza Hasíková (University of Ostrava): The genus Tetracystis (Chlamydomonadales, Chlorophyceae): another highly polyphyletic taxon of coccoid green algae 14:10 - 14:30 Grzegorz Migdalek (Cracow University): The systematic position of violets from metal-polluted areas in light of embryological and molecular studies 14:30 - 14:50 Eva Žižková (Acad. Sci. Prague): Cytokinin metabolic pathways in evolutionary older non-vascular organisms 14:50 - 15:15 Coffee break 15:15 - 16:30 Sponsor Section 15:15 - 15:30 Jiří Brzobohatý (Sigma-Aldrich spol. s r. o.): Sigma-Aldrich - Your partner in plant research 15:30 - 15:45 Monika Džuganová (GATC Biotech): Multiplatform-based sequencing: combining libraries, sequencing technologies and software tools 15:45 - 16:00 Jan Zástěra (Genomac International, Ltd.): DNA sequencing and DNA sequencers, how to navigate in a dense jungle of technologies and devices 16:00 - 16:15 Lucie Nováková (M.G.P. spol. s r. o.): Introducing the Newest Member of the NanoDrop Family: NanoDrop™ Lite 16:15 - 16:30 Ludmila Lukeszová (Bio-Consult Laboratories s.r.o.): QIAGEN - revolutionary technologies and chemistry 16:30 Closing remarks, awards for the best lectures The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 57 Abstracts - Invited Talks Epigenetics in plants Ortrun Mittelsten Scheid Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology, Austrian Academy of Sciences, Vienna, Austria All major epigenetic mechanisms known to occur in eukaryotes are found in plants, often in diversity exceeding that of other organisms. Modifications of DNA and the associated histone molecules are installed, maintained or removed at specific sites by antagonistic or synergistic enzymes encoded by large gene families. RNA molecules initiate or maintain gene silencing and control development, transposon activity, or virus infections. In contrast to animals where germ line cells are laid aside early in development, plants have numerous possibilities to initiate new meristems from formerly differentiated tissues. Due to their sessile life style, plants are much more dependent on adaptation to their environmental conditions and have developed an amazing potential for phenotypic plasticity, including epigenetic responses. The study of plant epigenetics, applying molecular, cytological, genetic, genomic and bioinformatic tools, has produced substantial insight into epigenetic principles within and beyond the plant kingdom, and is likely to do so in future. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 58 Abstracts - Invited Talks Principles of karyotype evolution Ingo Schubert Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), D-06466 Gatersleben, Germany The chromosome complement of an organism is called karyotype. Karyotype evolution is based on prerequisites and is restricted by structural constraints that have to be considered to avoid wrong conclusions. Some of these prerequisites and constraints (many of them were detected by classical chromosome mutagenesis studies) will be out-lined and discussed. In brief: • Nuclear genomes are contained within chromosomes which coincide with genetic linkage groups. • Number, size and shape of chromosomes vary considerably between species (and sometimes even within a species). • Karyotype evolution is based on ploidy mutations, primary and secondary chromosome rearrangements. • Chromosome rearrangements result from (erroneous) recombination repair of DNA doublestrand breaks. • Often breakpoints of rearrangements involve repeats at chromosome ends and pericentromeres, providing ectopic homology for erroneous homologous recombination repair. • Upper and lower chromosome size limitations are constraints of karyotype evolution. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 59 Abstracts What is the reality of a gene? Ruslan Kalendar Institute of Biotechnology, University of Helsinki, Helsinki, 00014, Finland Biological systems are extremely complex and have emergent properties that cannot be explained, or even predicted, by studying their individual parts. The method of physics is simply one particular case of a general scientific way of investigation in which the nature of the pertinent objects and the region this science serves are taken into consideration. If this method is extended into the living, one obliterates the specific nature of life. The facts that the boundaries of transcriptional units are far from clear; in fact, whole chromosomes if not the whole genome seem to be continuums of genetic transcription, many examples of gene fusion are known, likewise many examples of so-called encrypted genes are known in the organelle genomes of microbial eukaryotes and in prokaryotes, and the structure of the gene, its functional status can also be inheritable, and, epigenetic extra-genomic modes of inheritance, called genetic restoration, seem to be a rather common phenomenon, meaning that organisms can sometimes rewrite their DNA on the basis of RNA messages inherited from generations past. The gene concepts require different prerequisites or complementation by different 'worlds'. The gene that is manipulated is dependent on living organisms that are competent to integrate it into their own genome. Life itself is a prerequisite for genetic manipulation and, as such, cannot be explained in molecular terms, it transcends molecular reductionism. Genes are not causes, but conditions for life processes. Genes provide the information for the primary structure of proteins. But their functions cannot be deduced from the latter; hence, there must be a 'world' of processes where proteins are at its disposal. The functions of gene products need to be integrated into the entirety of an organism, by the organism itself. Proteins allow for the expression of phenotypic characters, they are not their causes. Instead of investigating the living in accordance with its nature, one forces upon it a lawfulness alien to it. In this way, however, by denying life, one will never come to know it. Our thinking should not also be adequate to ask where an organ of a living being originates instead of what purpose it serves. Should be viewed the object as is never what purpose something serves but always how it develops. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 60 Invited Talks Plant cell lines as experimental models of postgenomic biology: their privileges and limitations Zdeněk Opatrný Department of Plant Experimental Biology, Faculty of Science, Charles University in Prague, Viničná 5, 128 44, Prague 2, Czech Republic Huge harvest of the plant genomic information can be effectively exploited only after their proper confrontation with adequate phenotypic markers they are coding for. Various large-scale procedures of plant phenomics have been developed recently, to be used for routine evaluation of either complete plant organisms and/or their organs. On the contrary, phenomenology of plant cell cultures as alternative experimental models mostly remains on rather primitive level. Why we have been using these cell models? What are their methodological privileges and limitations? To what extent the results gained through their application in the studies of plant growth, metabolism, differentiation, ontogenesis, stress responses can be taken as valid for the understanding of “native, complete” plants as well? The examples of the use of the various plant cell cultures in the investigation of plant hormonal machinery, cytoskeleton behaviour, programmed cell death responses will be presented and commented. In this connection some more general questions will be discussed: Would be reasonable to pay our attention and effort to the selection/construction of the broader spectrum of “plant HeLa” cells, similar in their parameters to the only till now universally used tobacco BY-2 cell line? What could be the obstacles limiting our success in the establishing of comparable cell lines of not only Arabidopsis but also maize, barley, tomato, or even Mendel´s pea? The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 61 Abstracts - Oral Presentations Quantitative trait loci associated with Arabidopsis thaliana early root development 1 Radka Uhlířová*, Bonnie Wohlrab and Wolfgang Busch Gregor Mendel Institute of Plant Molecular Biology, Dr. Bohr-Gasse 3, 1030 Vienna, Austria Plant development is a complex process in time and space. To understand its molecular basis, we can use model systems. One of these is Arabidopsis thaliana root. It is easy to grow, small, has simple structure and is amenable to microscopy and molecular genetics techniques, Thanks to its radial symmetry and largely invariant cell lineages, the spatiotemporal complexity of development can be reduced to just two dimensions. Tissues are specified along the radial axis and the developmental timeline can be tracked along the longitudinal axis. These features have been utilized to identify and analyse mutant phenotypes, and led to unravelling the role of many genes that are involved in root development. However, it appears that many processes are complex traits that are governed by many genes that function in robust regulatory networks. In such a scenario, the effect of mutated genes might be masked by network robustness. An alternative to laboratory-induced mutants is the extent of naturally present genetic variation among local wild type populations of Arabidopsis thaliana (called accessions). This enables exploration of the basis of complex biological processes using genome wide association (GWA) studies. In this study, we used 250 accessions that were already sequenced or genotyped at high density. The high-throughput phenotypization of these accessions was conducted by acquisition of root images at multiple days, using a semi-automatic image analyses computational pipeline. In total, we acquired 28200 images of single roots and quantified several traits from each image. The most informative trait, the growth rate of the root, was used for genome wide association mapping to identify genomic regions associated with the observed variation. Several highly significantly associated genomic loci could be identified. We found several genes in proximity of associated single nucleotide polymorphisms and filtered those using cell-type specific expression data of the root to identify high confidence candidate genes. According to their functional annotation and expression pattern, the most promising candidate genes are potentially involved in cell division or cell elongation. We are currently conducting in-depth characterization of the biological role of the genes. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 62 Abstracts - Oral Presentations The complete mitochondrial genome sequence of the eustigmatophyte alga Trachydiscus minutus 2 Veronika Zbránková*1, Jan Fousek2, Čestmír Vlček2, Marek Eliáš1 1 Department of Biology and Ecology, Faculty of Science, University of Ostrava, Chittussiho 10, 710 00 Ostrava, Czech Republic 2 Institute of Molecular Genetics, Academy of Sciences of the Czech Republic, Department of Genomics and Bioinformatics, 142 20 Prague, Czech Republic Eustigmatophytes are an interesting class of ochrophyte (stramenopile) algae with a high biotechnological potential yet with a poorly known biology and evolution. We sequenced and annotated the mitochondrial genome of Trachydiscus minutus representing a recently described early-branching group of eustigmatophytes, and annotated the mitochondrial genome of a distantly related eustigmatophyte Nannochloropsis oceanica sequenced but ignored by another team. A comparative analysis of the eustigmatophyte mitochondrial genomes revealed several notable features. First, they have kept a nearly identical gene arrangement, whereas the gene order in other ochrophyte classes appears less evolutionarily stable. Second, all genes, except tatC, are on the same strand, whereas all other stramenopiles exhibit several blocks of genes on both strands. Third, eustigmatophytes are the first ochrophyte class identified to have retained the apt1 gene in the mitochondrial genome. Fourth, a novel protein-coding gene lacking discernible homologs outside eustigmatophytes is conserved in their mitochondrial genomes. Fifth, uniquely among the taxa compared, the eustigmatophyte gene rps3 harbours a putative intron. Finally, eustigmatophytes exhibit a split form of the nad11 gene with the part encoding the C-terminal region of the Nad11 protein retained in the mitochondrial genome and the part encoding the N-terminal region apparently relocated to the nuclear genome. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 63 Abstracts Cytomixis and nuclear vacuoles in tobacco microsporogenesis 3 Sergey Mursalimov*, Elena Deineko Laboratory of plants bioengineering, Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Prospekt Lavrentyeva 10, 630090, Novosibirsk, Russia Tobacco microsporogenesis was studied by electron microscopy. The appearance of single-, double-, or multimembrane nuclear vacuoles in microspore mother cells and their further elimination from the nucleus are for the first time described for the genus Nicotiana as well as deviations from a normal course for this process. The migration of nuclei between cells (cytomixis) also was observed between tobacco microspore mother cells. Behavior of the nuclear vacuoles within the cytomictic nucleus was described for the first time. The maximal manifestation of cytomixis was observed in the pachytene. As a rule, several cells connected with one another by cytomictic channels wherein the nuclei migrated were observable at this stage. In the majority of cases, nuclei passed from cell to cell concurrently through several closely located cytomictic channels. During cytomixis chromatin migrate between cells within the nuclear envelope, and its disintegration was unobservable. The nucleus after passing through cytomictic channels into another cell can be divided into individual micronuclei or, in the case of a direct contact with another nucleus, can form a nuclear bridge. No signs of pyknosis were observable in the chromatin of the micronuclei formed after cytomixis, and the synaptonemal complex was distinctly seen. Using tobacco lines with different ploidy levels for light and electron microscopic analysis, we have obtained new data about this interesting phenomenon. We have shown that the frequency of cytomixis in tobacco microsporogenesis is directly proportional to ploidy level of plant. The results of our study allow cytomixis to be regarded as a normal process in the cell rather than pathology. The work was supported by “OPTEC” LLC The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 64 Oral Presentations Epigenetic regulation of Nicotiana tabacum telomeres 4 Eva Majerová*1, Miloslava Fojtová1, Iva Mozgová1, Miroslava Bittová2 and Jiří Fajkus1,3 1 Department of Functional Genomics and Proteomics, Faculty of Science and Central European Institute of Technology, Masaryk University, Kotlářská 2, CZ-61137 Brno, Czech Republic 2 Department of Chemistry, Faculty of Science, Masaryk University, Kotlářská 2, CZ-61137 Brno, Czech Republic 3 Institute of Biophysics, Academy of Sciences of the Czech Republic, v.v.i., Královopolská 135, CZ61265 Brno, Czech Republic Telomeres are nucleoprotein protective structures located at the ends of eukaryotic linear chromosomes. Their structural and functional regulation is essential for correct cell and whole organism development – non-functional, critically shortened telomeres may stop the cell cycle and lead to apoptosis and premature ageing of organism, while stably maintained telomeres are one of the crucial conditions for cellular immortality and possible cancer development. It was thought for a very long time that telomere DNA cannot be methylated for its specific repetitive sequence [CCCTAA(A)]n where no common methylation patterns as CpG or CpNpG motifs are found. Later on it was confirmed in plants that Arabidopsis telomeres are methylated via siRNA´s in CpNpN motifs and parallel research in mouse embryonic stem cells and MEF´s revealed that the length of telomeres is regulated by DNA and histonemethylation of telomeric and/or subtelomeric regions. Nevertheless, the DNA methylation of animal telomeres has never been proven. To describe epigenetic regulation of plant telomeres, we chose tobacco as the model organism because it has large heterochromatic genomic blocs and very long telomeres in comparison with Arabidopsis genome what makes it a very convenient organism for epigenetic studies. Here we focus on regulation of tobacco telomeres using drugs that inhibit DNA and histone methylation. First we confirmed that tobacco telomeres are methylated and we found that this methylation is a dynamic process that can be changed within specific conditions. In addition, the activity of telomerase is significantly increased when genomic DNA hypomethylation occurs and the transcription from telomeres (TERRA) changes dependently on the type of the drug used (DNA methylation inhibitor or whole mehtylation inhibitor). It is surprising that neither the length of telomeres, nor the telomere nucleosome folding was changed and those data contradict previous data in mouse stem cells. Furthermore we checked a detailed distribution of methylcytosines within proximal and distal telomere parts to find out whether a homogeneous character of chromatin exists throughout the long tobacco telomeres. These results will be discussed and compared with the data obtained in other model systems. This work was supported by the Czech Science Foundation (P501/11/0289, P501/11/0596) and the Czech Ministry of Education (MSM0021622415, LC06004 and LC 06035). The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 65 AO bsra trlaPcrtes sentations Activity of mammalian DNA demethylation functions in Arabidopsis 5 Michael Watson*, Aaron Berret and Peter Meyer Centre for Plant Sciences, University of Leeds, Leeds LS2 9JT, UK. DNA methylation is an epigenetic mark in plants found at 5’ positions of cytosines in CG, CNG and CNN sequence contexts. DNA methylation marks regulate gene expression and genome structure. Stability and dynamics of DNA methylation patterns are influenced by four major factors: de novo methylation, maintenance methylation, passive loss of methylation and active demethylation. Maintenance methylation functions are still well conserved among plants and animals, which separated more than 1.5 billion years ago. In contrast, demethylation mechanisms differ considerably among mammals and plants. The high tolerance of plants to changes in DNA methylation makes them an ideal experimental system to analyse DNA demethylation systems. We tested DNA demethylation activity of a mammalian dioxygenase in Arabidopsis and find that it can oxidise 5methyl cytosines at some genomic loci. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 66 AO bsratrlaPcrtessentations A mystery of the origin of holocentric chromosomes 6 František Zedek* and Petr Bureš Department of Botany and Zoology, Masaryk University, Kotlářská 2, 61137 Brno, Czech Republic In mitosis, holocentric chromosomes attach spindle microtubules to the kinetochores that cover almost the whole length of their poleward surfaces, which contrasts with the “normal type” of monocentric chromosomes, where spindle attachment is restricted to a single kinetochore. In meiosis, holocentric chromosomes attach microtubules either along their entire length (holokinetic meiosis) or to chromosomal ends (telokinetic meiosis). Telokinetic meiosis has been reported only in Nematoda so far, while holokinetic meiosis is present in all holocentric plants (e.g. families Cyperaceae and Juncaceae) and vast majority of holocentric animals (e.g. roundworms or many orders of insects). Thanks to their constitution, holocentric chromosomes are prone to chromosomal breakages and a high frequency of chromosomal fissions and fusions has implications for karyotype and genome evolution of holocentric organisms, especially those with holokinetic meiosis. Although holocentric chromosomes have been recognized almost eighty years ago, the mechanisms of their origin and their adaptive value remain unknown. A recent hypothesis suggests that they might have evolved as a defense against centromere drive. In monocentric organisms, under the model of centromere drive the expansion of centromeric satellite repeats could create a “stronger” centromere that recruits more kinetochore proteins and better attracts microtubules, which may confer an advantage in asymmetric (mostly female) meiosis, and the stronger centromere would likely sweep through the population. However, centromere drive might be associated with a number of negative effects such as skewed sex ratios in populations, male sterility or retention of deleterious mutations. The adaptive mutations of genes for kinetochore proteins that interact with centromeric DNA (CENH3 or CENP-C) may alter their binding affinity to satellite repeats and thus to bring back a balance and suppress centromere drive. In holocentric organisms with holokinetic meiosis, however, the expansion of satellite repeats should have no function because kinetochore is already formed along the entire length of chromosomes. If holocentrism has evolved to suppress centromere drive, holocentric organisms should exhibit nonadaptive evolution of kinetochore proteins. To address the hypothesis we have obtained the genes for kinetochore proteins from both telokinetic (Caenorhabditis) and holokinetic (Luzula) holocentric models. We have evaluated the selection regimes acting on analyzed genes and we found positive selection acting on kinetochore proteins in Caenorhabditis, while there were no signs of positive selection in Luzula. The absence of positive selection in Luzula supports the hypothesis that holocentrism might have evolved as a defence against centromere drive, at least in holocentrics with holokinetic meiosis. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 67 AO bsrtarlaPcrtsesentations Division behavior of mitochondrion and microbody in the red algae Cyanidioschyzon merolae 7 Yuuta Imoto* Imoto*1, 2, Mio Ohnuma2, Yamato Yoshida2, Haruko Kuroiwa2, Tsuneyoshi Kuroiwa2 and Shigeyuki Kawano1 1 Department of Integrated Biosciences, Graduate School of Frontier Sciences, the University of Tokyo, Kashiwa City Kashiwa-no-ha 5-1-5, Tokyo, Japan 2 Departments of Life Science, College of Science, Rikkyo University, Toshima-ku Nishi-ikebukuro 3-341, Tokyo, Japan Mitochondria and microbodies are ubiquitous subcellular organelles with different evolutionary origins. Both organelles fulfill essential roles in the cellular metabolism and proliferate by division. Considering that the cells of higher animals and plants contain many organelles which tend to behave somewhat randomly, there is little information concerning the division and inheritance of organelles during the cell cycle. Here, we show the current cytological and morphological knowledge of the division and inheritance of mitochondria and microbody studied with the primitive alga Cyanidioschyzon merolae that have a minimum set of organelles. The mitochondrial division is controlled by the MD (mitochondrial division) machinery composed of the outer machinery (outer MD ring, dynamin ring, Mda1 ring) and the inner machinery (inner MD ring, FtsZ ring). Our recent studies revealed that microbody is physically connected to mitochondria and MD-ring via electron-dense structure during mitochondrial division and induces the contraction of dynamin ring. For 2 h after the mitochondrial division, the dumbbell-shaped mother microbody divided and separated into spherical daughter microbodies by the activities of electron-dense patches (50 nm in diameter) at each side of the microbody, and microtubules of the mitochondrial spindle. Our results suggested that mitochondrial and microbody division is regulated by reciprocal relationship among these two organelles via MD machinery and the electron-dense structures. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 68 AO bsratrlaPcrtessentations The role of NBS1 in telomere maintenance of Arabidopsis thaliana 8 Lucie Najdekrová* and Jiří Široký Department of Plant Developmental Genetics, Institute of Biophysics ASCR, Kralovopolska 135, 61265 Brno, Czech Republic Many telomere-building protein complexes are associated with telomeres to ensure their proper capping function. It was found however, that many repair complexes also contribute to telomere stability. We focused on highly conserved DNA-repair complex Mre/Rad50/Nbs1 (MRN) and used Arabidopsis thaliana to study the possible functions of the DNA repair subunit Nijmegen breakage syndrome 1 (NBS1) in telomere homeostasis using knockout nbs1 mutants. Although NBS1-deficient plants were viable, without any visible signs of developmental defects and produced fertile seeds through many generations upon self fertilisation, plants lacking also the functional telomerase (double mutants) rapidly - within three generations - displayed severe developmental impairments leading to complete sterility in the 6th generation. Employing cytogenetic inspection of cycling somatic cells we observed very early onset of massive genome instability expressed by numerous anaphase bridges. These bridges are consequences of the fusions of de-protected termini of chromosomes which are treated as double strand breaks by non-homologous end joining mechanisms. Over increasing seed generations the percentage of bridged anaphases increased dramatically reaching almost 40% in 6th generation which was in striking contrast to plants deficient in telomerase gene alone (5%). This mutual interaction can be explained by a synergism between the two deficiencies. Consistent with this, we detected much faster telomere shortening in double homozygous mutants when compared to plants with knockout telomerase gene only. We did not directly approached the question whether the deficiency of NBS1 per se in telomerase negative plants was responsible for the observed phenotypes or whether there was some disturbance in the proper assembly of the MRN repair-complex with subsequent impact on the phenotypes. However, we provide indirect evidence of a novel role of NBS1 on plant telomere homeostasis. Acknowledgement: the Czech Science Foundation (204/09/H002 and P501/12/G090) The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 69 AO bsrtarlaPcrtsesentations Genetic analysis of RNARNA-directed transcriptional gene silencing in Arabidopsis thaliana 9 Andreas Finke*, Markus Kuhlmann and Michael Florian Mette Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Gatersleben, Germany In plants, a particular class of small non-coding RNAs, short interfering RNAs (siRNAs) can serve as a signal to induce cytosine methylation at homologous genomic regions. If the targeted DNA has promoter function, this RNA-directed DNA methylation (RdDM) can result in transcriptional gene silencing (TGS). RNA-directed transcriptional gene silencing (RdTGS) of transgenes provides a versatile system for the study of epigenetic gene regulation in plants. In our experimental setup in Arabidopsis thaliana, transcription of a nopaline synthase promoter (ProNOS)-inverted repeat provides a RNA signal that triggers de novo cytosine methylation and TGS of a homologous ProNOS copy in trans. Utilising a ProNOS-NPTII reporter gene particularly sensitive to silencing in this two component system, a forward genetic screen for EMS-induced “silencing abrogated” (slg) mutations was performed. Three of the obtained slg mutant lines were found to contain novel loss-of-function alleles of idn2, nrpd2a/ nrpe2a and drm2, respectively. IDN2 encodes a XH/XS domain containing protein that is able to bind double-stranded RNA with 5’-overhangs, while NRPD2a/NRPE2a encodes the common second-largest subunit of the plant-specific DNA-dependent RNA polymerases IV and V involved in silencing processes. Finally, DRM2 encodes the DNA methyltransferase responsible for de novo DNA methylation. The effects of idn2, nrpd2a/nrpe2a, drm2 and others on target gene expression, RdDM of transgenic as well as endogenous target regions and siRNA accumulation have been studied in detail. Based on the obtained results, a refined model for the positions of the affected factors in RdDM and RdTGS pathways will be proposed. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 70 AO bsratrlaPcrtessentations The 17kDa protein is expressed in the course of chromatic adaptation of alga Chromera velia 10 J. Jarešová* 1,2, R. Sobotka1,2, R. Kaňa1,2, E. Kotabová1,2, D. Bína2,3, P. Koník2 and O. Prášil1,2 1 Institute of Microbiology, Academy of Sciences of the Czech Republic, Department of phototrophic microorganisms, Opatovický mlýn, Třeboň, tel.+420384340412, email. [email protected] 2 University of South Bohemia, Faculty of Natural Sciences, Branišovská 31, České Budějovice, Czech Republic 3 Institute of Plant Molecular Biology, Academy of Sciences of the Czech Republic, Branišovská 31, České Budějovice, Czech Republic: tel. +420 387 772 244, fax: +420 385 310 366 Chromatic adaptation is a capacity of photosynthetic organisms to sense and respond to spectral composition of incident irradiance. In aquatic environment the spectral conditions can vary significantly within the water column. In general, red light is preferentially absorbed within the surface layer, then at moderate depths the green and blue parts of spectrum are dominant and only blue light penetrates to the very depths of euphotic (irradiated) zone of the water. We studied the adaptation on different spectral quality of photosynthetic apparatus of the recently discovered unicellular eukaryotic alga Chromera velia, the closest photosynthetic relative of apicomplexan parasites (malaria, toxoplasma etc.) We studied pigment-protein complexes of photosynthetic apparatus using the clear native electrophoresis (CN-PAGE), 2D electrophoresis, protein purification, emission spectra measurements and protein sequencing. Emission spectra of whole cells grown in red and blue lights showed differences in fluorescence emission maxima. The dominant maximum at 77K of red light-grown cells was shifted to 717 nm and one additional red-shifted fluorescence emission peak was also observed at 710 nm at room temperature. CN-PAGE of membrane proteins purified from red light grown cells revealed a small chlorophyll-binding protein complex that has never been present in samples grown at blue light. The room temperature emission of the band cut from the gel showed the shoulder at 710 nm. Using 2D electrophoresis we found a protein with mass about 17kDa to be the main component of the red-light specific pigment-protein complex. This protein was analyzed by mass-spectrometry sequencing and by BLAST and was identified as a member of the chlorophyll a, b bind superfamily. It is not clear whether it is functionally attached only to Photosystem II or also to Photosystem I. Currently we study its possible role in the dynamic re-arrangement of the thylakoid membrane as a response to red light. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 71 AO bsrtarlaPcrtsesentations Phospholipid signalling in SA pathway in Arabidopsis thaliana 11 Martin Janda*1, Vladimír Šašek2, Lenka Burketová2, Zuzana Novotná1 and Olga Valentová1 1 Department of Biochemistry and Microbiology, Institute of Chemical Technology Prague, Technická 5, 16628 Praha 6, Czech Republic 2 Institute of Experimental Botany AS CR, Rozvojová 263, 16502 Praha 6 - Lysolaje, Czech Republic Plant defence against biotic stress is like the performance of symphony orchestra. It contains many players and instruments and final result should be impressive. Plants have to survive many pitfalls, despite they don’t move so they can´t escape from the “battle”. During biotic stress a signal is transferred from the cell surface to the nucleus and this process is mediated by various signalling mechanisms. It has been shown that one of them is a phospholipid signalling system which involves phospholipases (enzymes hydrolysing phospholipids). Our subjects of interest are phospholipases D (PLD, EC 3.1.4.4), significant “family” of phospholipases comprising in Arabidopsis thaliana 12 isoforms differing in the structure and biochemical properties. PLD hydrolyses phospholipids to form a polar head and phosphatidic acid (PA), which is now considered as an important secondary messenger in plant signalling. Salicylic acid (SA) is one of the key components of plant defence response and has been intensively investigated during the last twenty years but still several crucial steps of SA pathway remain unresolved. We provide a strong evidence that either PLD or its product PA is involved in SA signalling. Co-treatment of Arabidopsis seedlings with SA and n-butanol, a compound known to modulate PLD activity, almost completely suppresses expression of SA-signalling marker gene PR-1 (pathogenesis-related 1). Microscopic observation showed that n-butanol hinders the nuclear accumulation of NPR1-GFP. NPR1 is a key transcriptional regulator of SA-responsive genes. Nuclear accumulation of NPR1 requires its monomerization. Treatment with n-butanol had no effect on the level of nuclear NPR1 in plants expressing constitutive monomeric form of NPR1. This indicates that n-butanol acts likely upstream of NPR1 monomerization rather than on its degradation by proteasome in nucleus. In order to identify PLD genes involved in SA signalling, we analysed expression of all isoforms after SA treatment. PLDγ1 and PLDγ3 were significantly induced by SA. In Arabidopsis genome, all three PLDγ genes are located at the same locus. We created an artificial microRNA construct which will silence all three PLDγ simultaneously. Transformed plants will be assessed for their responsiveness to SA. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 72 AO bsratrlaPcrtessentations Comparison of test results of garlic plants for presence Carlaviruses by different methods 12 Martina Kudělková*1, Jana Čechová1 and Hana Sasková2 1 Mendeleum - Institute of Genetics and Plant Breeding. FH MENDELU, Valtická 337, 69144 Lednice Department of Breeding and Propagation of Horticultural Plants, FH MENDELU, Valtická 337, 69144 Lednice 2 The experiment was focused on present Carlaviruses in garlic plants (Allium sativum L.). 100 plants of garlic grown in vitro were tested for the present of Garlic common latent virus (GCLV) and Shallot latent virus (SLV). ELISA (Bioreba) and Reverse transcription PCR were used for detection these viruses. The young leaves of garlic were used for testing. The results have proved a higher sensitivity of RT-PCR method for GCLV. This virus has been present in 29% plants. Only 12% positive plants have been detected by ELISA. Almost no difference has been between RT-PCR and ELISA in present of SLV. RTPCR has showed 23% of positive plants, ELISA 22%. The statistically significant difference has not been between these methods. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 73 AO bsra trlaPcrtes sentations Cell wall modification of Zea mays L. plants treated with cadmium 13 Kučerová čerová1,2and D. Lišková1 Zuzana Vatehová* Vatehová*1, A. Malovíková1, K. Kollárová1, D. Ku 1 Department of Glycobiotechnology Institute of Chemistry, Slovak Academy of Sciences, Dúbravská cesta 9, 845 38 Bratislava, Slovakia, [email protected] 2 Institute of Botany, Slovak Academy of Sciences, Dúbravská cesta 9, 845 23 Bratislava, Slovakia The plant cell wall, mainly composed of polysaccharides (cellulose, hemicelluloses and pectin), is known to participate in heavy metal detoxification. In addition to polysaccharides, also several classes of proteins and other components as lignin and phenolics are presented. The architecture and composition of cell walls change in association with developmental stage, biotic and abiotic factors, such as pathogens or osmotic stress. The aim of our work was to compare cell wall composition in roots of two Zea mays L. hybrids (sensitive and tolerant) after cadmium treatment. The seeds for our experiments were germinated in the dark. Uniform seedlings were selected and cultivated 10 days in solutions containing 10-5 and 5.10-5 M concentrations of Cd(NO3)2, at 25 °C, 70% humidity, in light condition (130-140 mmol m-2 s-1 PAR, 16-h photoperiod). Cell wall components were isolated according to Capek et al. (2000) and identified by FTIR. The Cd content was determined by AAS, Klason lignin by Košťálová et al. (2007), and cell wall-bond phenolics by Yu et al. (2002). Changes in chemical composition of cell walls were determined as a result of exposure to cadmium compared to untreated plants. Quantitative changes of cell wall polysaccharides, lignin and phenolics were ascertained. Results obtained in this study can contribute not only to plants protection against abiotic stress, but they can help to resolve some mechanisms of heavy metal action in plant cells. Capek P. et al. 2000. Carbohydr. Res. 329, 635–645. Košťálová Z. et al. 2007. Chemical Papers 63, 406-413. Yu L. et al. 2002. J. Agric. Food Chem. 50, 1619–1624. This study was supported by the Slovak Research and Development Agency, contract No. APVV-014010, and COST Action FA-0905. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 74 AO bsratrlaPcrtessentations Dynamics and constraints of batch culture growth of Synechocystis sp. PCC 6803 14 Tomas Zavrel *1, 2, Zaneta Pochylova 1, Jan Cerveny 1, Maria Sinetova 1, 3 and Ladislav Nedbal 1 1 2 3 Global Change Research Centre AS CR, v.v.i., Belidla 968/4a, 603 00, Brno, Czech Republic Masaryk University, Faculty of Science, Kotlářská 267/2, 611 37, Brno, Czech Republic Institute of Plant Physiology, RAS, Botanicheskaya Street 35, 127276, Moscow, Russian Federation Cyanobacteria, oxygenic photosynthetic microorganisms, have been documented to live in Earth surface habitats for more than 3.5 billion years. In recent decades cyanobacteria have gained increased attention because of their biotechnological potential and also due to the opportunities of studying broad range of fundamental biological phenomena. Unicellular cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 reached specific status across whole the Cyanoprokaryotes phylum; it has become essential model organism in cyanobacteria research and it also disposes great application potential. The biotechnological potential of cyanobacteria varies, among other, with the phase of the culture growth. In this talk will be presented results of experimental study of the batch culture growth dynamics of Synechocystis sp. PCC 6803. Experimental set was aiming on better understanding the physiological background of dynamics and constraints of the culture growth, discovering the limitations in the individual growth phases and also identifying potential for inducing or delaying transitions between the growth phases. Results will be compared with similar study of another unicellular cyanobacterium Cyanothece sp. ATCC 51142 and possible biotechnological potential of the work will be discussed. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 75 AO bsra trlaPcrtes sentations The influence of reactive oxygen species to the bioelectric signals of liverwort Conocephalum conicum 15 Wioletta Brankiewicz* Department of Biology and Biotechnology, Maria Curie - Skłodowska University in Lublin, Akademicka 19, 20-033 Lublin, Poland Reactive oxygen species (ROS) constitute a very important of the signal transductions in the living organisms. In the case of biotic and abiotic stress, the ROS level may greatly increase leading to damages in the cells’ structures. ROS mainly lead to far-going changes in cell membrane permeability which is confirmed in the surveys conducted on Conocephalum conicum thallus by using technique of measuring the bioelectrical potentials which the use of intercellular electrodes. They prove that the hydroxyl radical application which develops as the rent of ascorbic acid dilutions and CuCl2 (Cu/asc) reaction, created 10 minutes before the application, causes the bioelectric response in the sharp of action potentials (APs) with the 30.9 ± 0.4 mV amplitude. In turn, the application of 10 mM CuCl2 dilution didn’t give any response. With reference to estimated value AP amplitude, after adding 10 mM of Cu/asc and 10 mM of asc (26.5 ± 0.6 mV), there appeared the doubt whether the earlier creation of Cu/asc solution doesn’t lead to its deactivation. Therefore, there has been an experiment held with the incipient application of CuCl2 and the 10 mM of asc was added after 10 to 12 minutes and the effect of it was AP with the average amplitude of 85.2 ± 3.0 mV. In all those cases of the mentioned measurement, the long lasting chase of repolarization was visibly noticed without the possibility of returning to value of the rest potential. The parallel measurements were conducted for 4 mM condensation- average amplitude of 40.9 ± 0.4 mV, 3 mM – 33 ± 1.3 mV and 1 mM (no reaction). Additionally, there has been conducted the surveys with use of hydrogen peroxide. Application of H2O2 in the chosen concentrations 0.9 M (75.2 ± 0,6 mV) , 0.09 M (40,8 ± 0,6 mV) and 0.009 M (20.2 ± 0,75 mV) caused the effect in AP with a long- lasting depolarization. Therefore, it may be assumed that using ROS for Conocephalum conicum thallus causes the activation of the permeability canals for calcium employed in the first AP phase or / and in the inactivation of the potassium channels responsible for the stage of repolarization. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 76 AO bsratrlaPcrtessentations Protein interactions of Arabidopsis RanBPM homologue reveal conservation of CTLH complexes in eukaryotes 16 Eva Tomaštíková*1, Beáta Petrovská1, Lucie Kohoutová3, Věra Cenklová2, Petr Halada3 and Pavla Binarová3 1 Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research, Institute of Experimental Botany ASCR, v.v.i., Sokolovská 6, Olomouc 772 00, Czech Republic 2 Institute of Experimental Botany, ASCR, v.v.i., Sokolovská 6, 772 00, Olomouc, Czech Republic 3 Institute of Microbiology, ASCR, v.v.i., Vídeňská 1083, 142 20 Prague 4, Czech Republic RanBPM (Ran-binding protein in the microtubule-organizing centre) was originally reported as a centrosome-associated protein in human cells. However, RanBPM protein is currently considered as a scaffolding protein with multiple cellular functions. Based on sequence similarity, we identified a homologue of the human RanBPM in Arabidopsis thaliana (AtRanBPM, At1g35470). AtRanBPM protein has highly conserved SPRY, LisH, CTLH and CRA domains. We prepared GFP fusion and analysed the localization and distribution of the protein in Arabidopsis cultures and plants. Microscopic analysis of GFP-AtRanBPM in vivo and immunofluorescence localization of endogenous AtRanBPM showed mainly cytoplasmic and nuclear localization. Absence of colocalization with γ-tubulin was consistent with the biochemical data and suggests another than centrosomal role of the AtRanBPM protein. Cell fractionation showed that endogenous AtRanBPM or expressed GFP-AtRanBPM are mainly cytoplasmic proteins with only a minor portion detectable in microsomal fractions. AtRanBPM was identified predominantly in the form of soluble cytoplasmic complexes. Immunopurification of AtRanBPM followed by mass spectrometric analysis identified proteins containing LisH and CRA domains. Homologues of copurified proteins are known to be components of the C-terminal to the LisH motif (CTLH) complexes in humans and budding yeast. Taken together, our data indicate that as yet uncharacterized Arabidopsis RanBPM protein physically interacts with LisH-CTLH domain-containing proteins and forms high molecular weight cytoplasmic protein complexes homologous to similar complexes in human and budding yeast. Although the exact functions of the CTLH complexes in scaffolding of protein degradation in protein interactions and in signalling from the periphery to the cell centre are not yet fully understood, structural conservation of the complexes across eukaryotes suggests their important biological role. Supported by the European Regional Development Fund No. CZ.1.05/2.1.00/01.0007 for ET and BP, IGA UP PrF/2012/001 for ET, grants LC06034 and LC545 from MEYS of Czech Republic, 204/07/1169, 204/09/P155, and 204/09/H084 from the GACR, and grant IAA500200719 from GAAV. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 77 AO bsra trlaPcrtes sentations Effect of galactoglucomannan oligosaccharides and cadmium on the growth and development of Arabidopsis thaliana primary root 17 Danica Kučerová*1,2, Ivan Zelko2, Karin Kollárová2, Zuzana Vatehová2, Anna Kákošová2 and Desana Lišková2 1 Institute of Botany, Slovak Academy of Sciences, Dúbravská cesta 9, 845 23 Bratislava, Slovakia, [email protected] 2 Institute of Chemistry, Slovak Academy of Sciences, Dúbravská cesta 9, 845 38 Bratislava, Slovakia Galactoglucomannan oligosaccharides (GGMOs) belong to the group of biologically active oligosaccharides known as regulatory molecules influencing plant growth and development. Our recent study is focused on better understanding of GGMOs action during Arabidopsis primary root growth and their possible mediatory role in protecting plants, especially roots, from cadmium toxicity. In GGMOs grown plants primary roots were longer in comparison with the control. The presence of GGMOs diminished the negative effect of Cd on Arabidopsis root elongation and also changed root growth dynamics. In GGMO treated roots oligosaccharides stimulated cell division, elongation and differentiation. In these plants root meristem and elongation zone were longer and xylem maturation¸ hair root formation and lateral roots emergence were accelerated in comparison with the control. Cadmium has negative effect on all parameters followed, which was improved by GGMOs addition. In plants growing in the presence of GGMOs the suberin lamellae were developed more distant from the root apex. Faster solute and water transport when suberin lamellae were shifted farther from the root apex can possibly explain the faster growth of GGMOs grown plants. In Cd and GGMOs+Cd treated plants the formation of suberin lamellae was shifted closer to the root apex. This earlier suberin lamellae development confirms its protecting mechanism against heavy metal stress. We have followed cadmium distribution (using dithiozone) and its content in Cd and Cd+GGMOs grown plants for better understanding the GGMOs protective action. Cadmium distribution in plants depended on the duration of cadmium action. Cadmium, absorbed by the root cap and root hairs, on the beginning of incubation stored in the root and hypocotyl, was later transported by xylem up to the leaves and stored in trichomes. GGMOs didn’t unambiguously influence cadmium localization and its content in plants. Their action is focused mainly on growth and development promotion. This work was supported by the grants of Slovak Grant Agency for Science (VEGA No. 2/0046/10) and the COST Action FA-0905. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 78 AO bsratrlaPcrtessentations Do strigolactones really affect branching of arbuscular mycorrhizal mycelium? 18 Martin Rozmoš* Department of Experimental Biology, Faculty of Science, Masaryk University, Kamenice 753/5, 62500 Brno, Czech Republic Strigolactones, i.e. the terpenoid lactones decades ago recognized as the germination elicitors of parasitic plants from the genera Striga and Orobanche are recently acknowledged also as plant hormones and they play also a crucial role in establishing arbuscular mycorrhiza (AM). AM is of the most common symbiotic relationships of plants on the Earth, improving the uptake of nutrients by plant roots and in protecting them against root pathogens. We made a series of in vitro experiments aimed to assess effects of synthetic strigolactone analogue GR24 in concentrations 10-5 – 10-10 M and two plant extracts prepared from tomato fruit and carrot root on primary hyphae branching of two AM fungi, Gigaspora rosea and Glomus intraradices. Additionally, we studied the effects of these compounds on germination of Glomus mosseae spores and Striga hermonthica seeds. Neither hyphal branching nor spores germination were affected by any compound at any concentration used, including GR24 used as positive control. When treated with GR24 in concentration 10-5 M, 30– 60% of S. hermonthica seeds germinated. Tomato extract elicitated 22% and carot extract 58% germination, without induction no seeds germinated. None of our experiments showed significant effect of plant extracts and synthetic analogue GR24 on hyphal branching or germination of AM fungal spores. This contradicts with information available in the literature. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 79 AO bsra trlaPcrtes sentations Does longlong-term cultivation under elevated CO2 concentration influence acclimation of assimilatory processes to temperature? 19 Ladislav Šigut*1,2, Petra Holišová2, Karel Klem2, Otmar Urban2 and Vladimír Špunda1 1 Department of Physics, Faculty of Science, Ostrava University, 30. dubna 22, CZ-701 03 Ostrava 1, Czech Republic 2 CzechGlobe – Global Change Research Centre AS CR, v.v.i., Bělidla 986/4a CZ-603 00 Brno, Czech Republic In this study, we have tested the hypothesis that elevated CO2 concentration (EC) leads to a shift of the temperature optimum (Topt) of photosynthetic rate in long-aged tree species. Since the EC treatment usually leads to the significant decreases in stomatal conductance and consequently to decreases in transpiration (decline in output of latent heat) followed by increases in leaf temperature, we hypothesized that EC thus results in the acclimation of plants to higher temperature. We studied two most common economic species in Czech Republic – European beech (Fagus sylvatica L.) and Norway spruce (Picea abies [L.] Karst.). The eight-year-old trees were cultivated under ambient (AC; 380 µmol(CO2) mol-1) and elevated (EC; 700 µmol(CO2) mol-1) concentration of CO2 in glass domes at the experimental research site Bílý Kříž in the Beskydy Mts. The temperature response of basic photosynthetic characteristics was assessed in situ at leaf/needle temperature range 15–40 °C using gas exchange method (Li-6400/6400-40 LCF, Li-Cor, USA). Only sun exposed and fully developed leaves and shoots were measured during two campaigns (July 2010, August 2011). The suppression of light-saturated stomatal conductance, caused by EC conditions, was confirmed in beech during both campaigns and in spruce only during the second one. Thermal images taken by Fluke-Ti55FT (Fluke, USA) during second campaign directly showed that both EC variants had ~3 °C higher leaf temperature compared to their respective AC variants at 14:00 h during sunny day. Meticulous analysis of photosynthetic characteristics revealed that the shift of Topt to higher temperatures observed in EC variants during first campaign occurred particularly due to the instantaneous direct effect of EC. Measurement under growth CO2 concentration thus led to shift in limitation processes of photosynthesis with different temperature optima. However, we observed shifts in temperature optima of electron transport rate and Rubisco carboxylation capacity at light saturation. Our data thus do not support the initial hypothesis that longterm growth of plants under elevated CO2 concentration leads to the shift of Topt. However, other related processes acclimate to higher temperature. Acknowledgements: Financial support came from these projects and grants: LM2010007, CZ.1.05⁄ 1.1.00⁄02.0073, SGS17/PřF/2012. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 80 AO bsratrlaPcrtessentations New generation of potential inhibitors of cytokinin oxidase/dehydrogenase from Arabidopsis thaliana 20 Jana Klásková*1, Marek Zatloukal1,2, Lukáš Spíchal1,2 and Miroslav Strnad1,2 1 Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research, Šlechtitelů 11, 78371 Olomouc, Czech Republic 2 Laboratory of Growth Regulators, IEB AS CR & Palacký University Olomouc, Šlechtitelů 11, 78371 Olomouc, Czech Republic Cytokinin oxidase/dehydrogenase (CKX; EC 1.5.99.12) takes responsibility for an irreversible degradation of cytokinin hormones in plants. New group of CKX inhibitors with potential cytokinin-like activity were prepared. These compounds, LGR-2678, LGR-2679, were tested for their biological activity in various bioassays. Their biological activity was investigated in a receptor binding assay where an ability to activate the cytokinin receptors was assessed. Subsequently, binding of tested compounds to cytokinin receptors was determined by ARR5::GUS reporter gene assay. Their ability to inhibit the cytokinin oxidase/dehydrogenase from Arabidopsis thaliana (AtCKX2) was also studied. Finally, our in vivo experiments led to increased yield in Arabidopsis plants. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 81 AO bsratrlaPcrtessentations Plant Integral Membrane Proteins and Herbiced or what doesn't kill you makes you stronger 21 Lucie Maršálová*1, Iva Hlaváčková1, Vojtěch Jurga1, Radovan Hynek1 and Kateřina Schwarzerová2 1 2 Institute of Chemical Technology, Prague, Technická 3, 166 28, Praha 6-Dejvice Charles University in Prague, Viničná 5, 128 44, Praha 2 Plasma membrane separates two different enviroments. So, it is first cellular compartment that is exposed to the stressor effect. The proteomic apparatus is the most influenced by stressor and mediates defense reaction as well. Study of plasma membrane proteome, integral membrane proteins (IMPs) especially, is necessary for better understanding of plants reactions during stressful situation. Integral membrane proteins are analytical chalenge. Sample contains lot of hydrophilic impurities forming vesicles with IMPs after aqueous two-phase partitioning in the system of dextran and polyethylenglycol. So, IMPs are purified and fractionated by reversed-phase chromatography at the same time. Clasical proteomic method like two-dimensional electrophoresis cann't be often used because of IMPs extremly hydrophobic nature. This problem can be solved elegantly by using Mass Spectrometry after the specific digestion in solution. Moreover Mass Spectrometry provide the relative quantification using for example iTRAQ tags (isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation) too. This methodology was used in preliminary experiment to study influence of herbicide isoxaben to IMPs expression levels in cell culture of Arabidopsis thalina. Weight of cells in treated cell culture were higher than weight of cells in control cell culture. Size of cells was verified using microscopy. Plasma membranes were isolated and 103 proteins were identified, 34 of which were belonged to the IMPs. 42 proteins were quantified , 15 of which were belonged to the IMPs. Some isoforms of H(+)-ATPase and beta-1,3-glucosidase were exprimed the most. These proteins are closely related to synthesis of cell wall that is inhibited by isoxaben. Efficiency of quantification was verified by Western Blot with imunochemical detection with antibody againts H(+)-ATPase. Plasma membrane from Arabidopsis thaliana leaves will be isolated at different times of isoxaben effect in the another experiment. Financial support from specific university research (MSMT No 21/2012). The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 82 AO bsratrlaPcrtessentations Influence of enhanced CO2 concentration on regulation of photosynthesis in diazotrophic cyanobacteria 22 Kristina Felcmanova*1,2, Barbora Sediva1, Dana Luhanova2 and Ondrej Prasil1 1 Institute of Microbiology, Academy of Sciences of the Czech Republic, Laboratory of Photosynthesis, CZ-37981 Trebon, Czech Republic, [email protected] 2 University of South Bohemia, Faculty of Science, CZ-37005 Ceske Budejovice, Czech Republic Diazotrophic cyanobacteria are important contributors to ocean primary production and they are important providers of new nitrogen to the oligotrophic ocean areas. Increasing atmospheric concentration of CO2 has influence on the ocean carbonate chemistry, on its acidification and on phytoplankton physiology. Several reports have studied cyanobacterium Trichodesmium sp., which responds to elevated concentration of CO2 with increase of its growth rate. We therefore hypothesized that high pCO2 might be beneficial for all diazotrophs. We examined the physiological resp <onse, growth rate, carbon and nitrogen fixation activity of two diazotrophic cyanobacteria with different strategies of nitrogen fixation: unicellular Cyanothece sp. ATCC 51142 and filamentous heterocystforming Anabaena sp. PCC 7120 to current (390ppm) and future (900ppm) atmospheric CO2 concentration. Only few data are available reporting the response of diazotrophic cyanobacterium Anabaena sp. and so far no experiments have been done with cyanobacterium Cyanothece sp. and its response to the elevated CO2. High pCO2 increased the growth rate in Cyanothece sp. by 32%, however in cyanobacterium Anabaena sp., the growth rate was inhibited by 34%. Nitrogenase activity was stimulated under elevated CO2 in both species. The total nitrogen fixation derived from nitrogenase activity was under high pCO2 2-fold higher in cyanobacterium Cyanothece sp. and 1.5-fold higher in cyanobacterium Anabaena sp. in comparison with cultures cultivated at current pCO2. We also observed that cyanobacterium Cyanothece sp. fixes nitrogen at the end of light phase, although it has been assumed that nitrogen fixation in unicellular cyanobacteria is restricted only to the dark phase. In summary, our results do not confirm the initial hypothesis. Possible explanations for the contrasting response among Cyanothece and Anabaena may be found in different morphological and ecological strategies of diazotrophic cyanobacteria. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 83 AO bsratrlaPcrtessentations Stomatal opening under blue light and growth parameters of tomato mutant 7B 7B--1 23 E. Ježilová Ježilová* *1, V. Bergougnoux2,3, M. Fellner3 and M. Špundová1 1 Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research, Department of Biophysics, Faculty of Science, Palacký University, Šlechtitelů 11, Olomouc, CZ-78371, Czech Republic 2 Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research, Department of Molecular Biology, Faculty of Science, Palacký University, Šlechtitelů 11, Olomouc, CZ-78371, Czech Republic 3 Group of Molecular Physiology, Laboratory of Growth Regulators, Palacký University & Institute of Experimental Botany ASCR, v.v.i. Šlechtitelů 11, Olomouc, CZ-78371, Czech Republic Changes of photosynthesis under blue light and growth parameters were examined in the ABAoverproducing 7B-1 mutant in tomato. Net photosynthetic rate (PN), stomatal conductance (gs) and intrinsic water use efficiency (WUEi) under blue light in leaves of different insertion (1st, 4th and 9th ones) were measured in 5-, 7- and 9-week-old plants using an open gas exchange system. The stem growth was measured as an increase in length of stem between two nearby leaves during four weeks. With the aging of leaves, a blue-light-induced increase in PN and gs to steady-state was delayed and steady-state values of PN and gs were lower in 7B-1 plants compared with WT. Steady-state WUEi was increased in 4th and 9th leaves of 7B-1 plants compared with WT. In early ontogenetic stage 7B-1 showed faster stem growth than WT. However, the total increase in the length of internodes was greater in WT. The lower steady-state values of PN, gs in older leaves and higher steady-state WUEi values in 4th and 9th leaves together with faster growth of 7B-1 in early ontogenetic stage can be explained by the higher endogenous level of ABA in 7B-1 plants and their lower sensitivity to ABA in earlier growth stage. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 84 AO bsratrlaPcrtessentations How plants sense the reduced water availability? 24 Halyna Korovetska* and Vit Gloser Department of Experimental Biology, Faculty of Science, Masaryk University, Kamenice 5, 624 00 Brno, Czech Republic Roots respond sensitively to stress conditions in soil such as reduced soil water content (SWC). As distant sensors they help plant to adjust to variable environment by sending regulatory signals to the shoot. These signals serve to adjustments of stomatal opening that consequently limits both rates of water loss by transpiration and photosynthesis. Abscisic acid (ABA) is a key regulator of stomatal opening but recently has been shown that root-sourced ABA is not the main initial chemical signal from root to shoot in xylem when soil water content decreases. Many compounds may potentially act as root to shoot signals (e.g. pH, malate, nitrate, jasmonic acid) and act synergistically with ABA to facilitate stomatal closure under water stress. Obviously, some chemical signals transported from roots at the early stage of SWC decrease could modulate the effect of ABA in the leaf and also possibly stimulate the ABA synthesis in the leaves. The aim of our work was to investigate what chemical signals may be potentially involved in the leaf early signalling of soil water deficit. We explored the dynamics of changes in chemical composition of xylem sap in response to changes of SWC in Zea mays, Brassica napus, Helianthus annuus and Triticum aestivum. Xylem sap was extracted from leaves using pressure chamber. We measured sap pH by microelectrode and determined concentration of anions by capillary isotachophoresis. We found an increase of xylem sap pH when SWC decreased in all species. Soil drying also lead to an increase of the concentrations of sulphate and nitrate in the leaf xylem sap in all four species before sap pH was elevated. We hypothesize that, the inorganic ions could cause the pH alkalization and these may lead to enhancing of intensity of the ABA signal in the leaf. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 85 AO bsra trlaPcrtes sentations DNA composition and evolution of a selfish chromosome 25 Sonja Klemme*1, Mihaela Martis2, Ali Mohammad Banaei Moghaddam1, Klaus Meyer2, Thomas Wicker3, Jiri Macas5, Uwe Scholz1, Fabian Bull1, Thomas Schmutzer1, Hana Simkova4, Jaroslav Dolezel4, Nils Stein1, Jörg Fuchs1 and Andreas Houben1 1 2 3 4 5 Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Gatersleben, Germany German Research Center for Environmental Health, Neuherberg, Germany Institute of Plant Biology, University of Zurich, Switzerland Institute of Experimental Botany, Olomouc, Czech Republic Institute of Plant Mol Biology, Ceske Budejovice, Czech Republic B chromosomes (Bs) are non-obligatory chromosomes that exist in many species within plants, fungi and animals. They do not pair with the normal A chromosomes (As) and follow a non Mendelian inheritance pattern. In most cases they do not have beneficial genes but show selfish accumulation mechanisms. In the case of rye Bs this is achieved via non segregation of sister chromatids during first pollen mitosis. To determine the DNA composition and evolution of a selfish chromosome we flowsorted and pyrosequenced rye Bs (1C =~560 Mbp). In silico sequence analysis and subsequent fluorescence in situ hybridization (FISH) allowed us to compare rye As and Bs in depth. Based on identified gene reads we were able to trace the evolutionary origin of Bs. We found mobile elements which are differently distributed on As and Bs. Most of the newly identified B-specific high copy repeats clustered at the heterochromatic terminal part of the rye B. In addition, a B enriched pericentromeric sequence was found. To our great surprise we were able to show a high accumulation of chloroplast and mitochondrial DNA in the Bs compared to As. With the new data that we gathered, we propose a model for the formation and evolution of the rye B. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 86 AO bsratrlaPcrtessentations The genus Tetracystis (Chlamydomonadales, Chlorophyceae): another highly polyphyletic taxon of coccoid green algae 26 T. Hasíková*1, A. Lukešová2, E. Sýkorová3,4 and M. Eliáš1,5 1 Department of Biology and Ecology, Faculty of Science, University of Ostrava, Chittussiho 10, 71000, Ostrava, Czech Republic 2 Institute of Soil Biology, Biology Centre ASCR, Na Sádkách 7, 37005, České Budějovice, Czech Republic 3 Institute of Biophysics ASCR, Královopolská 135, 61200 Brno, Czech Republic 4 Faculty of Science, and CEITEC – Central European Institute of Technology, Masaryk University, Kamenice 5, 62500 Brno, Czech Republic 5 Charles University in Prague, Faculty of Science, Department of Botany, Benátská 2, 12801, Prague 2, Czech Republic Brown and Bold (1964) established a new genus Tetracystis to accommodate twelve species (nine newly described and three transferred from the genus Chloroccocum) of coccoid zoospore-producing algae. Nine species were subsequently added by various authors. So far, only the type species, Tetracystis aeria, has been studied by molecular taxonomy and shown to belong to the order Chlamydomonadales, leaving the phylogenetic position of the remaining species uncertain. We determined 18S rDNA sequences for 13 additional species and found that Tetracystis is a highly polyphyletic taxon represented by at least seven separate groups distributed in five major primary clades of Chlamydomonadales. However, the delimitation of the separate groups reflects the diversity of some delicate morphological and ultrastructural features that were thus previously not given the proper taxonomic significance. Strikingly, four species (T. excentrica, T. pulchra, T. texensis, and T. intermedia) turned out to be nested in a clade of fusiform flagellates recently described as the genus Gungnir. Despite their morphological disparity (coccoid versus flagellate vegetative stage), the relationship of Gungnir to these four Tetracystis species is corroborated by shared ultrastuctural features of the pyrenoid. Analyses of the ITS2 region are underway to aid further assessment of Tetracystis species. Financial support: GACR521/09/1912; GACRP506/10/0705 The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 87 AO bsratrl aPcrtessentations The systematic position of violets from metalmetal-polluted areas in light of embryological and molecular studies 27 Grzegorz Migdałek*1, Michał Combik2 and Elżbieta Kuta1 1 Department of Plant Cytology and Embryology, Jagiellonian University, Grodzka 52, 31-044 Cracow, Poland 2 Władysław Szafer Institute of Botany, Polish Academy of Sciences, Lubicz 46, 31-512 Cracow Poland Many species of the Violaceae family colonize soils polluted with heavy metals, forming metalliferous and non-metalliferous populations. Ore-bearing areas in Southern Poland in Chrzanów region are covered by forests with many plant species, including violets from Viola reichenbachiana-V. riviniana group. In field observation individuals growing in these areas were recognized by taxonomists as interspecific hybrids based on morphological intermediate features. The aim of the present studies was to confirm or reject the hypothesis of hybrid origin of violets growing on ore-bearing areas in the vicinity of Chrzanów (Chrzanów Borowiec, Chrzanów Warpie). The control represented Viola reichenbachiana, V. riviniana and hybrids between these species from non-polluted populations (Skała Kmity and Modlnica near Kraków). Studies included analysis of morphological traits, embryological development and chloroplast genome markers. Morphological analysis based on seven flower characters identified individuals from polluted populations as intermediate between V. reichenbachiana and V. riviniana, but more similar to V. riviniana. Pollen size and heteromorphism were informative in distinguishing two parental species from plants colonizing polluted areas. Pollen viability of plants from polluted areas was very high (over 96%). No disturbances were observed in female gametophyte development, embryo and endosperm formation and seed setting of plants from contaminated sites. Chloroplast genome markers rpoB , rpoC1 and trnH-psbA were used to discriminate V. reichenbachiana from V. riviniana and metalliferous populations. Analysis of chloroplast markers rpoB and rpoC1 showed no differences between two species. Non-coding marker trnh-psbA, howewer was more variable between species. V. reichenbachiana populations had high intraspecific variability, manifested as two genetic lineages. V. riviniana and metalliferous populations exhibited almost no variability of this particular marker, which suggested that those metallic forms within this sequence are more similar to V. riviniana, than to V. reichenbachiana. In conclusion: 1) No apparent negative influence by heavy metal pollution on plant vegetation and violets reproduction was detected; 2) No typical V. reichenbachiana and V. riviniana were found in orebearing sites. Morphologically, plants occurring in these areas were hybrids more similar to V. riviniana, fully fertile and can therefore be considered as stabilized introgressive forms or ecotypes of parental species modified by soil conditions. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 88 AO bsratrlaPcrtess-en OtraatlioPnre s sentations Cytokinin metabolic pathways in evolutionary older nonnon-vascular organisms 28 Eva Žižková*1, Martin Kubeš1, Lenka Záveská Drábková2, Petre Dobrev1, Klára Hoyerová1, Pavel Přibyl3, Miroslav Kamínek1 and Václav Motyka1 1 Institute of Experimental Botany AS CR, Rozvojová 263, 165 02 Prague, Czech Republic Institute of Botany AS CR, Zámek 1, 252 43 Průhonice, Czech Republic 3 Institute of Botany AS CR, Dukelská 135, 379 82 Třeboň, Czech Republic 2 Cytokinins (CKs) are plant hormones controlling at low concentration many physiological and developmental processes such as cell division, morphogenesis, senescence, apical dominance, seed germination and dormancy. Based on their chemical structure, natural CKs are adenine derivatives substituted in the N6 position with isoprenoid or aromatic side chain. The most abundant isoprenoid CKs in plant tissues are N6-(2-isopentenyl)adenine (iP), zeatin occurring in trans or cis configuration (transzeatin, tZ; cis-zeatin, cZ), dihydrozeatin (DHZ) and their individual derivatives. Mechanism of CK homeostasis including biosynthesis, inactivation and degradation is well characterized mainly in higher plants, however, data concerning CK metabolic pathways in evolutionary older non-vascular organisms are rare. Our screening of endogenous CK profiles in several cyanobacteria and algae species originating from various nature biotops revealed a wide spectrum of isoprenoid CK derivatives. The most prevailing CKs detected were free bases of iP, cZ and tZ. On the contrary, very low or no detectable levels of CK storage and deactivation forms (CK-O- and CK-N-glucosides) were reported. Interestingly, the 2methylthio-derivatives of iP were detected as predominant metabolites in a few species of cyanobacteria and algae, which suggests a potential involvement of 2-methylthiolation in CK deactivation machinery in some evolutionary older non-vascular organisms. High concentrations of cZ (in most tested cyanobacteria and algae exceeding those of tZ) indicate that deactivation role of CK-N-glucosides in these organisms might be substituted, at least partly, by cZ. With the aim to characterize the downregulatory pathway(s) of bioactive CK pool in cyanobacteria and algae, radiolabelled [3H]tZ was used in our experiments as an essential marker in CK metabolism. The obtained data will be presented and discussed at the conference. This work is supported by the Czech Science Foundation (project P506/11/0774). The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 89 Abstracts - Sponsor Talks SigmaSigma-Aldrich - Your partner in plant research Jiří Brzobohatý, Sigma-Aldrich spol. s r. o. Sigma-Aldrich is a leading Life Science and High Technology company. Its biochemical and chemical products and kits are used in scientific research, including genomic and proteomic research, oncology research, biotechnology, pharmaceutical development and as key components in pharmaceutical, diagnostic and other high technology manufacturing. For example, Sigma Life Science has developed a CompoZrŸ Zinc Finger Nuclease (ZFN) technology which has been repeatedly used to make highly targeted and permanent mutations in eukaryotic genome. Sigma also offers other useful tools for plant research such as Extract-N-Amp? Plant and Seed kit, Anti-RuBisCO Spin and LC-2 columns and Diffinity RapidTip. MultiplatformMultiplatform-based sequencing: combining libraries, sequencing technologies and software tools Monika Dzuganova, GATC Biotech Highest quality sequencing results can be achieved by combining leading sequencing technologies on the market as ABI 3730xl (Sanger sequencing), Illumina HiSeq 2000 and Roche Diagnostics GS FLX System (Next Gen sequencing), as well as Pacific Biosciences PacBio RS (Third Gen Generation sequencing) with different library preparation methods and made-to-measure bioinformatic analyses. The new Pacific Biosciences PacBio RS uses a novel technology that enables single molecule, real-time, or SMRTEUR, detection of biological processes. This feature allows the system to observe certain variation not accessible with other technologies. The Illumina HiSeq 2000 provides the industryEURs highest sequencing output and quality at fastest data generation rate and hence can be optimally used to obtain best sequencing results in resequencing projects. DNA sequencing and DNA sequencers, how how to navigate in a dense jungle of technologies and devices Jan Zástěra, Genomac International, Ltd. DNA sequencing has been for a long time an integral part of the methodological spectrum of molecular genetic laboratories. Although the beginnings of DNA sequencing date back to the 80s of the last century, the importance of this methodology still remains unequaled. It also proves the fact that although the essence of the method remains the same, its development is still primarily to increase its speed and reduce its difficulty and complexity. Currently, DNA sequencing is the exclusive domain of all automated DNA analyzers. The work of the current generation of these devices is still based on capillary electrophoresis, whereas the upcoming generation will use other approaches, such as pyrosequencing, ligation, and others. Future generation of DNA sequencers can expect different technologies such as SMRT technology or nanopore technologies. In order to be more efficient, faster and less expensive they will offer new approaches of reading DNA however despite offering a wider range of sequences the capillary electrophoresis remains today, the gold standard for DNA sequencing. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 90 Abstracts - Sponsor Talks Introducing the Newest Member of the NanoDrop Family: NanoDrop™ Lite Lucie Nováková, M.G.P. spol. s r.o. As the industry leader in micro-sample quantitation, Thermo Scientific NanoDrop Products meet the needs of today's laboratory scientist with instruments that are smart, simple and robust. We combine our extensive expertise in micro-sample analysis with an in-depth understanding of real-life applications to deliver the latest in UV-Vis and Fluorescence instrumentation. Basic Microvolume UV-Vis Spectrophotometer NanoDrop™ Lite is designed for simple sample analysis delivered in compact footprint. NanoDrop™ Lite measures nucleic acid concentration at 260 nm, purity using the 260/280 ratio and purified protein concentration at 280 nm. It delivers the accuracy and reproducibility expected from NanoDrop instruments. With its compact design, built-in controls and software, the NanoDrop Lite is small enough to fit on any benchtop, but powerful enough to provide routine measurements for life science workflows. QIAGEN - revolutionary technologies and chemistry Ludmila Lukeszová, Bio-Consult Laboratories s.r.o. QIAGEN is the leading global provider of sample and assay technologies. Sample technologies are used to isolate and process DNA, RNA, and proteins from biological samples such as blood or tissue. Assay technologies are used to make such isolated biomolecules, such as the DNA of a specific virus, visible for subsequent analysis. The company provides these products to molecular diagnostics laboratories, academic researchers, pharmaceutical and biotechnology companies, and applied testing customers for purposes such as forensics, animal or food testing and pharmaceutical process control. QIAGEN brings the quality and complete solution with revolutionary technologies like automation of manual columns sample preps with QIAcube, HRM technology with RotorGene Q and Pyrosequencing with Pyromark. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 91 Abstracts - Posters Enhancing photosynthesis when stomata are closed 1 Daniel Hisem*1, Daniel Vrábl1,2and Jiří Šantrůček1,3 1 The University of South Bohemia, Faculty of Science, Department of Experimental Plant Biology, Branišovská 1716/31c, České Budějovice 370 05 2 The University of Ostrava, Faculty of Science, 30. dubna 22, Ostrava 701 03 3 Institute of Plant Molecular Biology, Branišovská 1160/31, 370 05 České Budějovice Mesophyll conductance (gm) represents crucial diffusional limitation of photosynthesis since it restricts CO2 flux from intercellular spaces to the sites of carboxylation inside the chloroplasts stroma. gm was found to respond to different environmental factors simultaneously with stomatal conductance (gs) in some studies, but not in others. Supplying plants with abscisic acid (ABA), we triggered stomatal closure and estimated fast responses of gs and gm to different CO2 concentrations as well as relationship between gs and gm under low ABA-concentration treatment simulating moderate water restriction. Plants treated by low concentration of ABA simultaneously decreased stomatal conductance and enhanced mesophyll conductance to CO2 transport to balance CO2 flux and to keep its concentration in chloroplasts (Cc) and photosynthetic rate as high as possible. This process finally enhanced water use efficiency. The study was supported by the Grant Agency of the Czech Republic (GACR), grant no. P501/12/1261, and by the Grant Agency of the University of South Bohemia (GAJU), grant no. 134/2010/P. Micropropagation protocol of Viola uliginosa, species threatened with extinction and cyclotide content in plants from natural sites and in material from in vitro culture 2 Błażej Ślązak*1, Justyna Bujak1, Ulf Göransson2and Elżbieta Kuta1 1 Jagiellonian University, Institute of Botany, Department of Plant Cytology and Embryology, 52 Grodzka st., 31-044 Cracow 2 Division of Pharmacognosy, Department of Medicinal Chemistry, Uppsala University, Biomedical Centre, Box 574, SE-751 23 Uppsala, Sweden Viola uliginosa Besser is European species occurring mainly in the Baltic Sea region. In some regions of its distribution, including Poland, is considered as endangered or even threatened with extinction. In vitro technique is one of the methods of ex-situ conservation and preservation of rare and endangered species. In relatively short time, in controlled conditions, multiplication of maternal plant(s) is achieved and regenerated plantlets are a source of material for reintroduction. Plant tissue cultures have also great potential in the industrial production of bioactive plant metabolites from rare, medicinal plants. Species of Violaceae from different genera and sections produce cyclic polypeptides (cyclotides). These proteins are of much interest due to their medicinal properties (ureotonic, hemolytic, anti-cancer and cytotoxic, antimicrobial, insecticidal, HIV-inhibitory, trypsin inhibitory) and specific chemical structure (cyclic amino acid backbone of about 30 amino acid residues, stabilized by three disulfide bridges). A micropropagation protocol of V. uliginosa was developed and cyclotide content both from plants from natural sites and in the material obtained in culture was investigated. Fresh leaf and petiole fragments were cultured on Murashige and Skoog (1962) medium solidified with agar and supplemented with different concentrations of plant growth regulators - TDZ, KIN, 2,4-D. Direct and indirect (via callus) organogenesis were induced on MS + 0.5 mg l-1 TDZ and MS + 1 mg l-1 TDZ or 2 mg l-1 KIN + 2mg l-1 2,4-D (followed by callus transfer on 1mg l-1 TDZ), respectively and confirmed by observations in SEM and by histological analysis in light microscope. Regenerated shoots were rooted on MS with 2% sucrose and 0.5 mg l-1 IBA. Plantlets were acclimatized. Presence of different types of cyclotides in plants from natural sites and in material from culture was confirmed by LC-MS analysis. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 92 Abstracts - Posters Brassinosteroids as regulators of changes in the response of two genotypes of Zea mays L. to water deficit 3 Lenka Fridrichová*, Nina Trubanová, Dana Holá, Marie Kočová, Olga Rothová, Iva Jelénková and Daniel Panchártek Charles University in Prague, of Science, Department of Genetics and Microbiology, Viničná 5, 128 43 Prague 2, Czech Republic Brassinosteroids (BRs) are phytohormones essential for plant growth and development. Exogenously applied BRs have long been known to increase growth and yield in many economically useful plant species. Many researchers have also investigated the ameliorative effects of BRs on stressed plants; however, the knowledge on the role of BRs as regulators of plant response to water deficit (both at the cellular and whole organism level) is still incomplete. Our experiments were focused on the effects BRs have on selected photosynthetic, protective, developmental, growth and morphological parameters of drought-stressed plants. Two inbred lines of maize (Zea mays L.) – 2023, CE704 - from the Czech Republic were used for the experiments. Plants were grown in pots with garden soil in a glasshouse, one plant per pot. Twenty days after the date of sowing (V2 or V3 developmental stage) they were leaf-sprayed with 10-8 M aqueous solutions of 24-epibrassinolide (24-EBL) and then these plants (as well as control plants treated with tap water + Tween 20) were exposed to a 10-day period of water deficit. During this period, various photosynthetic and growth/morphological parameters were monitored and samples for the determination of the content/activity of various antioxidants/osmoprotectants (proline, malondialdehyde, catalase, ascorbate peroxidase) were taken. The experiments resulted in finding the differences in the response of drought-tolerant (CE704) and –sensitive (2023) genotypes to exogenously applied BRs. More affected by drought stress were parameters observed in 2023 than in genotype CE704. The biggest differences between the stressed and control plants were found in morphological and developmental parameters. Acknowledgement: This work was supported by the research projects SVV-2012-265202 of the Grant Agency of Charles University and 612612 of the Grant Agency of Charles University, 501/11/1650 of the Grant Agency of the Czech Republic and No. MSM 0021620858 of the Ministry of Education, Youth, and Sports of the Czech Republic. Comparative transcriptomics reveals candidate genes for copper tolerance in Silene dioica 4 Vojtěch Hudzieczek*, Eva Nevrtalová, Radim Čegan, Jiří Baloun and Roman Hobza Department of Plant Developmental Genetics, Institute of Biophysics, ASCR, Brno Silene dioica is the first plant species reported to sustain enormous concentration of copper in soil. Although heavy metal tolerance is rare in plant kingdom, little is known about this ability on molecular level. In Silene dioica, copper tolerance shows population-specific pattern, therefore we took an advantage of comparison between plants from tolerant and non-tolerant populations in distinct metal treatment. In order to find out candidate genes responsible for copper tolerance, we combined two different approaches for genome-wide expression analysis - cDNA-AFLP and RNA-seq. Firstly, we sequenced outlier bands found in comparative cDNA-AFLP analysis and identified 18 candidate genes with differential expression pattern according to degree of tolerance. Subsequent RNA-seq analysis confirmed regulation changes of these candidates, and underlined overall trends of transcriptional changes under copper stress. Our study gives first insight into phenomenon of heavy metal tolerance in plant species Silene dioica on molecular level. Acknowledgement: This work was supported by Czech Science Foundation (P501/12/2220, 522/09/0083, 204/09/ H002). The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 93 Abstracts Comparison of the plant responses of two soybean varieties to cadmium ions 5 Terézia Dobroviczká*1, Beáta Piršelová1, Peter Boleček1 and Ildikó Matušíková2 1 Department of Botany and Genetics, Constantine the Philosopher University in Nitra, Nábrežie mládeže 91, 94974 Nitra, Slovak Republic 2 Institute of Plant Genetics and Biotechnology SAS, Akademická 2, P.O. Box 39A, 95007 Nitra, Slovak Republic Heavy metals belong to significant pollutants of the environment since they accumulate in organisms and are not degradable. Heavy metals have influence on the plants as abiotic stress factor causing changes at different levels. Plants of the family Fabaceae are considered as relatively sensitive to the effects of the heavy metals. The goal of our experiments was to assess the impact of applied dose of cadmium (50 mg.kg-1 of soil in the form of Cd(NO3) 2 .4H2 O) on the morphological and physiological parameters of two soybean varieties (Glycine max (L.) Merr. cvs. Bólyi 44 and Cordoba). Already after 96 hours of the experiment a significant decrease of fresh and dry weight of primary roots was scored. The results of our experiments confirm the negative effect of cadmium on the tested morphological and physiological parameters of soybean. However, the plants of the two varieties responded to the cadmium differently. In the case of the variety Bólyi 44 we scored reduced length, fresh and dry weight of roots, as well as dry weight of shoots. In the contrary in the case of the variety Cordoba we recorded increased length of roots, shoots as well as fresh weight of roots. Exposure to cadmium, however, resulted in significantly elevated amounts content of metal in the shoots of both the varieties. In the leaves of the variety Bólyi 44 cadmium did not cause significant changes in the content of photosynthetic pigments in contrast to the leaves of the variety Cordoba. The results of our experiments further confirm the negative effect of cadmium on the morphological and physiological parameters of the leaf epidermis of both varieties; the number and size of stomata as well as the number of epidermal cells were affected. All together, the variety Cordoba was identified as a relatively more tolerant to the applied dose of metal. The high flexibility of the stomatal responses appears to be an important component of a complex defense mechanism in soybean plants under growth in metal-polluted environment. This work was supported by KEGA 044UKF-4/2012, VEGA 2/0062/11, VEGA 1/0509/12 and UGA VII/11/2012. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 94 Posters Glutathione and other antioxidative substances as bioindicators of shortshortand longlong-term responses of in vitro cultivated orchids to high radiation stress 6 D. Chmelík*, M. Barták, J. Dubová and J. Rotkovská Section of Plant Physiology and Anatomy, Department of Experimental Biology, Faculty of Science, Masaryk University, Kotlářská 2, 611 37 Brno, Czech Republic Using micropropagation for proliferation of plants in vitro is fast and effective way to obtain new plant material. It is well estableshed that numerous in vitro-cultivated plants show low resistance to high radiation and increased sensitivity to photoinhibition of photosynthesis. In our study, we focus on plants of orchids Potinara hyb. and Cymbidium sp. cultivated in vitro, particularly their sensitivity to short- and long-term radiation stress. The plant explants were cultivated in temporary immersion system (TIS) RITA®. To supply the explants by nutrients from growing solution (MS medium), they were immersed regularly, i.e. 7 times during 24 hours. Immersion time lasted for 5 minutes. This study investigated the short- and long-term effects of different radiation intensities of photosynthetic active radiation (PAR) on (1) synthesis of the antioxidative substrate glutathione, (2) interconversion of xanthophyll cycle pigments (de-epoxidation state, DEPS), and (3) nonphotochemical quenching of absorbed excess energy in chloroplastic photosynthetic apparatus (NPQ) as a marker of stress in photosystem II. We hypothesised that there will be interspecific differences in their sensitivity to high radiation stress. Before experiments, the plants were cultivated under radiation intensity of 15 µmol.m-2.s-1 (PAR) for 3 weeks. In short-term treatment, the plants were exposed to 800 / 1200 µmol.m-2.s-1 of PAR for 60 min. During the exposition, plants were sampled regularly in 10 min step for further HPLC analysis of glutatione and DEPS. In long-term treatment, the plants were exposed to 40 and 150 µmol.m-2.s-1 of PAR for 21 days to artifical low radiation (LR) and high radiation (HR) growing conditions. Then, samples were collected for subsequent analysis of glutatione and DEPS. Increased radiation intensity caused expected increase of both monitored components of antioxidative protection, which directly related to protection against photoinhibition. In short-term HR treatment, glutathion responded in a complex manner. Generally, total glutathione (GSHTOTAL) decreased with time of exposition. Ratio of oxidized to total glutatione (GSSH/GSHTOTAL) increased showing, however, large sample-related variation. These changes, as well as differences found in the values and time courses of DEPS and NPQ, respectively, are indicative of radiation stress in photosynthetic apparatus of Potinara hyb., Cymbidium sp. The two investigated species showed different sensitivity to both short- and long-term high radiation treatment. These finding will be utilized in further in vitro cultivation of the two orchid species and estimation of optimum radiation pretreatments before in vitro to ex vitro transfer. TryptophanTryptophan-derived metabolites in the immunity of model Brassicaceae species. 7 Karolina Kułak* and Paweł Bednarek Institute of Bioorganic Chemistry, Polish Academy of Sciences, Z.Noskowskiego 12/14, 61-704 Poznań, Poland Secondary metabolites are highly diversified group of compounds, which are not involved in normal growth of flowering plants. However some of them can be biosynthesized and secreted upon pathogen attack. Model plant Arabidopsis thaliana synthesizes and accumulates constitutively aliphatic- (methionine–derived) and indole-type (tryptophan-derived) secondary metabolites named glucosinolates. Recent studies revealed a pathway for metabolism of indole glucosinolates (IGs) that is triggered by a number of fungal and oomycete pathogens, and is essential in pre-invasive defence of A. thaliana. In addition infection of this model species lead to biosynthesis of other Trp-derived secondary metabolites with function in immunity. In our study we analyzed conservation and differentiation of Trp-metabolism of A.thaliana and its close relatives by LC/UV/MS metabolic profiling. We also made a bioinformatic analysis of accessible genomes of A.thaliana relatives which included identification of possible ortholog genes encoding enzymes involved in Trp and IG metabolism. Our studies indicated IG biosynthesis and metabolism conservation in A.thaliana and its tested close relatives which suggests an ancient and important role of this pathogen-triggered metabolic pathway in pre-invasive defence responses. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 95 Abstracts 8 Bud outgrowth in pea can be based on the competitive canalization of auxin Zuzana Medveďová*1, Jozef Balla1,2, Vilém Reinöhl1 and Stanislav Procházka1 1 CEITEC - Central European Institute of Technology, Mendel University in Brno, Zemědělská 1, 613 00 Brno, Czech Republic, 2 Department of Plant Biology, Mendel University in Brno, Zemědělská 1, 613 00 Brno, Czech Republic Polar auxin transport in stem is necessary for the control of bud outgrowth by a dominant apex. Following decapitation in pea (Pisum sativum L.) the axillary buds establish directional auxin export by subcellular polarization of PIN1 auxin transporters. Application of auxin efflux inhibitor (NPA, TIBA) or protein synthesis inhibitor cycloheximide to the second axillary bud of decapitated plants reduces or completely prevents bud outgrowth. Inhibition of outgrowth of the second axillary bud in these plants caused outgrowth of the first bud, which is associated with changes in expression profiles of PIN1 and DRM1 genes. These results support the competitive canalization theory, by which canalization of auxin from the lateral auxin source is possible only if the primary source is removed or weakened. Length of the decapitated stem stump may affect timing of changes in expression of PIN1 and DRM1 genes and hence the timing of initiation bud outgrowth after removal of the dominant apex. The signal for axillary bud outgrowth therefore could be the auxin decrease or depletion in the stem. This work was supported by Technology" (CZ.1.05/1.1.00/02.0068). the project "CEITEC - Central Temperature dependence of photosynthesis in recombinant tobacco (Nicotiana tabacum L. cv. Samsun) European Institute of 9 Peter Paseka*1, David Kaftan1 and Jindřich Bříza1,2 1 Faculty of Science, University of South Bohemia in České Budějovice, Branišovská 31a, 370 05 České Budějovice, Czech Republic 2 Institute of Plant Molecular Biology, Biology Centre of the Academy of Sciences of the Czech Republic, v.v.i., Branišovská 31/1160, 370 05 České Budějovice, Czech Republic This research follows the previous findings that double mutation in D1 protein of the photosystem II reaction centers and elevated CO2 grant thermotolerance to mesophilic cyanobacterium. The double mutant of the higher plant Nicotiana tabacum L. cv. Samsun was prepared using biolistic transformation technique. We created stable recombinant of tobacco replacing two conserved residues in the D helix of the D1 protein by the analogue residues present in the thermophilic Thermosynechococcus elongatus. The main aim of our work is study of temperature acclimation of thermotolerant tobacco by means of metabolomic profiling and physiological characterization that is vital to our understanding of the acclimation process and has a considerable impact in basic and applied sciences. To this end, we used CO2 gas exchange and oxygen evolution measurements for determination of photosynthetic capacity of intact plants and leaf discs respectively and kinetic chlorophyll fluorescence measurements for the assessment of the electron transfer rate in photosystem II. Lipid and fatty acid analysis was also carried out to evaluate the role of lipids in thermal acclimation of the plants. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 96 Posters Plant Aurora kinases are required for maintaining the level of endoreduplication 10 Hana Jeřábková*1, Beáta Petrovská1, Věra Cenklová2, Pavla Suchánková1 and Pavla Binarová3 1 Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research, Institute of Experimental Botany ASCR, v.v.i., Sokolovská 6, Olomouc 772 00, Czech Republic 2 Institute of Experimental Botany, ASCR, v.v.i., Sokolovská 6, 772 00, Olomouc, Czech Republic 3 Institute of Microbiology, ASCR, v.v.i., Vídeňská 1083, 142 20 Prague 4, Czech Republic Aurora kinases, a group of conserved serine/threonine kinases, play important role in mitosis and subsequent cytokinesis. In metazoans Aurora kinases A, B, and C are important oncogens overexpressed in many types of cancer cells. Three types of Aurora kinases – AtAurora 1, 2 and 3 have been identified in Arabidopsis genome. In our work we down-regulated Arabidopsis Aurora kinases using RNA interference (RNAi) method and carried out detailed phenotypic analysis of Aurora RNAi plants. RNAi silenced plants showed strong developmental defects. Arrested primary meristems, ectopic meristem formation, trichoms with supernumery branches, cells with large nuclei or cells with several nuclei of irregular shape in roots as well as in aboveground part were often observed. DNA content measurement of seedlings with down-regulated Aurora kinases using flow cytometry analysis (FCM) showed a high proportion of cells with 8C and 16C DNA, while 2C and 4C cells remained similar to the controls. Subsequent chromocentres counting confirmed that the increased amount of DNA content was caused by extra replication cycles (endoreduplication). Our results revealed an essential role of plant Aurora kinases in the control of cell division and their requirement for maintaining of meristematic activity and for the switch from meristematic cell proliferation to the differentiation and endoreduplication. Acknowledgement: This work was supported by grants 204 ⁄ 07 ⁄ 1169, 204 ⁄ 09 ⁄ P155 and GD 204 ⁄ 09 ⁄H084 from the Grant Agency of the Czech Republic, grants LC06034 and LC545 from the Ministry of Education, Youth and Sports of the Czech Republic, grant IAA500200719 from the Grant Agency of the Czech Academy of the Sciences, IGA UP PrF/2012/001 for H.J., grant No. CZ.1.05 ⁄ 2.1.00 ⁄ 01.0007 to H.J., B.P., and P.S. from the Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research. Light harvesting complexes of Chromera velia, the photosynthetic relative of apicomplexan parasites 11 Josef Tichy* Tichy*1,2, Zdenko Gardian1,2, David Bina1,2, Miroslava Herbstova1,2, Radek Litvin1,2 and Frantisek Vacha1,2 1 2 Faculty of Science, University of South Bohemia, Branisovska 31, 37005 Ceske Budejovice, Czech Republic Institute of Plant Molecular Biology, Biology Centre of the ASCR, v. v. i. Branisovska 31, 370 05 Ceské Budejovice Chromera velia (Chromerida; Alveolata; Eukaryota) is a photosynthetic unicellular alga that was isolated as supposed symbiont of coral Plesiastrea versipora from the eastern coast of Australia (Moore et al. 2008). Major interest is due to its close phylogenetic affinities with apicomplexa. Apicomplexa are strict heterotrophs or parasites, whose well-known representatives, Plasmodium and Toxoplasma, are the cause of malaria and toxoplasmosis, respectively. These parasites contain an unpigmented chloroplast remnant called apicoplast, which lost all properties necessary for photosynthesis. According to the Chromalveolate hypothesis, apicomplexans together with heterokonts, haptophytes, cryptophytes and dinoflagellates, have acquired their chloroplast through secondary endosymbiosis of a free-living photosynthetic red alga (Green 2011). C. velia with its recently described relative Vitrella brassicaformis are known as the solely photosynthetic close relatives to apicomplexans (Moore et al. 2008; Obornik et al. 2012). Spectroscopy, pigment and protein analysis and electron microscopy revealed two different types of antennae systems in Chromera velia. One is closely related to FCP (Fucoxanthin Chlorophyll Protein) complexes from diatoms and the other as the Photosystem I bound Light Harvesting Complexe I (PSI-LHCI) frequently found in higher plants and algae. Chromera therefore possesses light harvesting antennae typically found in two different, evolutionary distant, groups of photosynthetic organisms. Green BR (2011) After the primary endosymbiosis: an update on the chromalveolate hypothesis and the origins of algae with Chl c. Phosynth Res 107:103-115. Obornik M, Modrý D, Lukeš M, Černotíková-Stříbrná E, Cihlář J, Tesařová M, Kotabova E, Vancova M, Prášil O and Lukeš J (2012) Morphology, ultrastructure and life cycle of Vitrella brassicaformis n. sp., n. gen., a novel Chromerid from the Great barrier reef. Protist 163:306–323. Moore RB et al. (2008) A photosynthetic alveolate closely related to apicomplexan parasites. Nature 451:959-963. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 97 Abstracts Altered glutathione pool in response to shortshort -term high light stress: Is there any interspecific difference in extremophilic lichens? 12 Kateřina Balarinová*, Miloš Barták and Jana Hazdrová Department of the Experimental Biology of Faculty of Science, Masaryk University in Brno, Kamenice 5, 625 00 Brno, Czech Republic Glutathione is a natural tripeptide with several functions in the plants. Among them, the ability to protect plant cells against various abiotic and biotic stresses is of most importance. In our laboratory, glutathione and its response to high light stress has been studied for a several years. It is generally known that short-term exposure to high light stress decreases glutathione pool (GSH) and increases oxidized form (GSSG). In this study, we focused on glutathione redox state in extremophilic lichen species (e.g. Usnea antartica, Usnea aurantiaco-atra, Pseudocyphellaria endochrysa) exposed to 800 mmol.m-2.s-1 (HL, high light). Glutathione was extracted in HCl and determined by labeling by thiol-binding fluorescence pigment monobromobimane in samples taken before light treatment and after the exposure lasting 10, 20, 30, 40, 50, 60 min., and during dark (11 mmol.m-2.s-1) recovery. HPLC evaluation of glutathione redox state was made on HPLC (Waters, USA). In spite of several interspecific differences, there was a general response of gluathione pool to short-term high light stress. After first 10 min. of exposure to HL, GSH increased by 40% due to light-dependent synthesis of glutathione. Further HL exposure led to a gradual decrease with maximum at the end of HL treatment (85% of untreated control). Within this period, the rate of degradation of glutathione was faster than its resythesis. After the HL treatment, i.e. during dark recovery, GSH increased gradually to maximum. In all lichen species, HL treatment led to a change in redox state of glutathione. HL treatment caused an increase in oxidized-to-total glutathione ratio (GSH/GSSG) throughout the whole period of thalli exposition to HL. After the treatment, GSH/GSSG decreased rapidly indicating high capacity of lichens to cope with short-term high light stress. There were species-specific differences in the sensitivity of Usnea antartica, U. aurantiaco-atra, and Pseudocyphellaria endochrysa, their glutathione pool responses to HL in particular. The results support the idea of resistance of Antarctic lichens to high light. Acknowledgements: The authors would like to express their thanks to the infrastructure of J. G. Mendel Antarctic station for providing facilities of CzechPolar during Czech Antarctic expedition activities (lichen thalli collection, handling, storage). The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 98 Posters Hardening effect of salicylic acid - role of glutathione transferases in the improved stress tolerance. 13 Edit Horváth*, Zsolt Váry, Szilvia Brunner, Ágnes Gallé, Katalin Gémes, Irma Tari and Jolán Csiszár Department of Plant Biology, University of Szeged, Közép fasor 52., 6726 Szeged, Hungary Glutathione transferases (GSTs) are a diverse group of multifunctional enzymes that catalyze the conjugation of glutathione and play important roles in detoxification. Some GST isoforms have glutathione peroxidase (GPOX) activity and they are important in hormone metabolism. GSTs can be induced by auxin, ethylene and salicylic acid (SA). SA is a signal molecule, which can generate the pre-adaptation responses in tomato plants under salt stress. We investigated the role of GSTs in the improved acclimation to salt stress of SA pre-treated plants. Solanum lycopersicum L. cvar. Rio Fuego, tomato plants growing in hydroponic culture were pre-treated with 10 -4 M and 10 -7 M SA from the 3 rd until the 6th week, on which 100 mM NaCl were added to induce salt stress. This experimental system was transferred also on Arabidopsis thaliana L. (Col-0) plants, which were grown in Hoagland solution for 5 weeks and after that 10-5-10 -9 M SA were applied as pre-treatment. Salt stress was induced after 2 weeks of SA pre-treatment. The measurements were done after one week of 100 mM NaCl treatment in both experiments. Fluorescent dye 2',7'-dichlorodihydrofluorescein diacetate was used for investigation of reactive oxygen species (ROS). The detection of fluorescence was performed with Zeiss Axiowert 200M-type fluorescence microscope. Hydrogene peroxide content, GST and GPOX activities were measured spectrophotometrically. Our results indicate that treatment of seedlings with sublethal concentrations of SA may improve the stress tolerance of plants to the subsequent salt stress. The enhanced ROS production may play an important role in this effect. The GST and GPOX activities were enhanced by SA, suggesting the role of these enzymes in elevated stress tolerance of SA pre-treated plants under the subsequent NaCl stress. Several GST coding sequences were selected for further analysis after constructing a family tree from the tomato GST-coding TCs found in The Gene Index Project DFCI database using the known Arabidopsis gene sequences. SA affected them differently and in a tissue specific manner during the hardening period. Our results indicated that GSTs belonging to different GST classes are involved in the hardening effect of SA. This work was supported by the Hungarian National Scientific Research Foundation (OTKA K101243). The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 99 Abstracts Spatial orientation of Norway spruce needles on a shoot may result in differences of structural parameters corresponding to sun and shade leaf characteristics 14 Zuzana Kubínová*1, Zuzana Lhotáková1, Barbora Radochová2, Lucie Kubínová2, Jiří Janáček2 and Jana Albrechtová1 1 Charles University in Prague , Faculty of Science, Department of Experimental Plant Biology, Viničná 5, 128 44 Prague 2, Czech Republic 2 Institute of Physiology, AS CR, v.v.i., Vídeňská 1083, 142 20 Prague 4, Czech Republic Irradiance and atmospheric concentration of carbon dioxide belong to envinronmental factors, which remarkably influence anatomical parameters of plant leaves. The spatial orientation of needles on the shoot can also play an important role. It seems that microclimatic conditions, such as local needle shading, could affect needle differentiation into sun and shade leaf ecotypes. Sun and shade needles of Norway spruce (Picea abies L. Karst.) were collected from upper (sun) and lower (shade) shoots of crowns of trees treated by ambient or elevated CO2 concentration. The trees were planted in special glass domes on an experimental site of the Global Change Research Centre, AS CR at Bílý Kříž in Moravskoslezské Beskydy mountains. Needles were stored frozen until processing. Cross-sections were cut off by a hand microtome in a systematic uniform randomly chosen positions along the needle. Images were captured by a Leica SP2 AOBS confocal laser scanning microscope and analysed using Ellipse software (ViDiTo, Košice, SR). The structural parameters (needle length, volume and shape, number of mesophyll cells per volume and number of chloroplasts per cell) were compared between sun and shade needles grown under ambient and elevated CO2 concentrations. Anatomical parameters of needles varied between sun and shade needles under ambient CO2 concentration. Some structural parameters of sun needles were influenced by the spatial orientation of the needle on the shoot, indicating response to supposed different irradiance conditions within the shoot. This effect was more pronounced in needles grown in ambient CO2 concentration in comparison to elevated CO2. Moreover, we have noticed a trend of a different ultrastructure of chloroplasts within the same sun needle, implying that sun needles may have sun and shade side. The results of our study are useful particularly for needle sampling in anatomical studies: Sampling without respect to the spatial-determined structural differences may be biased. Supported by the Grant Agency CR (P501/10/0340), Academy of Sciences CR (AV0Z50110509), Financing of the Institute of Physiology AS CR (RVO:67985823), Charles University in Prague (SVV 265203/2012). The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 100 Posters Salt induced changes in the accumulation of reactive oxygene species and in ethylene production 15 Judit Kovács*, Péter Poór, Ágnes Szepesi and Irma Tari Department of Plant Biology University of Szeged, Közép fasor 52, H-6726 Szeged, Hungary Programmed cell death (PCD) plays a critical role in response to changing environments and it is induced by various abiotic stressors such as high salinity. To investigate the role of salt stress we treated the tomato plants with 100mM and 250mM NaCl in the nutrient solution for 24h. In some cases generation of ethylene, reactive oxygen species (ROS), and NO is one of the earliest responses of plant cells under abiotic stresses. In the leaves ethylene production increased quickly at 30 min after 100 mM NaCl treatment and exhibited a second smaller peak at 3h which coincided with the maximum of ROS and NO. After the same treatment the ethylene production was much higher in the roots than in the leaves and showed two maxima at 30min and at 6h. The increases in ROS followed the maximum of ethylene emanation, and NO accumulation occured later at 3h after salt treatment. The other treatment, the lethal NaCl concentration induced stress ethylene production only in the leaves. ROS production showed two maxima at 1h and 6 h but NO does not increased in leaves. In contrast ethylene decreased in the roots but the ROS production exhibited only one maximum after 1h and NO level showed two maxima at 1 h and at 6h after the 250mM NaCl treatment. It is concluded that the salt stress-induced PCD is associated with rapid increase in ethylene production in the leaves which is accompanied with high ROS level. In roots ROS production significantly increased without an enhanced ethylene release and was accompanied with NO accumulation after the lethal NaCl treatment. If the plant survived the increased ethylene production was accompanied with ROS and NO accumulation. This work was supported by OTKA K101243. Study of connection between carbohydrate partitioning and tuber induction in potato 16 Hana Ševčíková*, Hana Konrádová, Petra Mašková and Helena Lipavská Department of Experimental Plant Biology of Faculty of Science, Charles University in Prague, Viničná 5, 12844 Praha 2, Czech Republic Potato (Solanum tuberosum) tuberization is an important process and its products (potato tubers) are widely used all around the world, yet mechanisms of tuber formation are still inadequately explored. The onset of tuberization is controlled by complex network of external (such as photoperiod, temperature or nitrogen supply) and internal factors. Key internal regulators of tuberization seem to be phytohormones (mainly gibberellin and cytokinin) and sugar metabolism. Standard cultivation protocol for in vitro microtuber formation involves high medium concentration of sucrose (8%). In this study we use potato (cv. Lada) mutants that spontaneously tuberize (ST plants) under low carbohydrate availability (3% sucrose). ST plants were transformed with a gene-trap construct for random gene activation but detail molecular characterization showed that the insertion is in non-coding area and the only difference found was lack of manganese stabilizing protein of photosystem II (Fischer et al. 2008). ST plants have significantly higher amount of soluble sugars in shoot than WT plants so there is a possibility of distinct changes in sugar allocation and metabolism. We closely observed distribution of soluble sugars in potato shoots and roots using HPLC. Carbohydrate metabolism enzymes regulate sugar distribution by determining sink strength or directly donating sugar transport (phloem loading). Therefore, we histochemically localized activities of key sugar metabolism enzymes - sucrose synthase, invertase and phosphoglucomutase. This work was supported by the Ministry of Education, Youth and Sports of the Czech Republic (grant number MSM 0021620858), by the Charles University Grant Agency (grant number GAUK 387011) and by Charles University in Prague, SVV 265203 / 2012. Fischer, L., Lipavska, H., Hausman, J.F., Opatrny, Z.: Morphological and molecular characterization of a spontaneously tuberizing potato mutant: an insight into the regulatory mechanisms of tuber induction. BMC Plant Biology 8: 117, 2008 The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 101 Abstracts Orchids can utilize trehalose as carbon and energy sources by action of trehalase. 17 Jan Ponert*1,2 and Helena Lipavská2 1 Department of Experimental Plant Biology, Faculty of Science, Charles University in Prague, Viničná 5, 128 44 Praha 2, Czech Republic 2 Prague Botanical Garden, Nádvorní 134, 171 00 Praha 7 – Troja, Czech Republic During early stages of development, orchid nutrition depends exclusively on mycorrhiza. The question remains, however, which compounds are transferred in mycorrhizas and what are their roles. Saccharides are supposed to be an important part of material provided by fungi for orchid nutrition serving primarily as energy and carbon sources. In plants generally, carbohydrates fulfil multiple roles including, beside others, signalling roles, with trehalose as a prominent member of signalling compound spectrum. We have tested ability of different saccharides to be utilized by protocorms of selected orchid species (Cypripedium reginae, Dactylorhiza majalis, Himantoglossum robertianum, Ophrys lojaconoi). The results confirmed sucrose, fructose, glucose, maltose, raffinose and trehalose to be suitable for the support of protocorm growth under in vitro conditions. Lactose and mannitol are utilized only to a low degree and galactose applied as the only carbohydrate source is not metabolised at all. Most plants are able to synthesise trehalose, but they contain very low amounts of this sugar and reserve it only for signalling purposes. The levels of trehalose and their derivatives are controlled, besides other enzymes, also by trehalase, splitting it into two molecules of glucose. Trehalase activity can be blocked by a specific inhibitor- validamycin A. In our experiments, the application of validamycin A to trehalose-supported cultures led to nearly total inhibition of protocorm growth which indicates trehalase activity being responsible for trehalose utilization by young orchid cultures. This work was supported by the Ministry of Education, Youth and Sports of the Czech Republic (grant number MSM 0021620858) and grant SVV 265203 / 2012, Charles University in Prague. Influence of mutation in At1g67580 Arabidopsis thaliana gene on in vitro plant regeneration 18 Piotr Żabicki*1, Elżbieta Kuta1 and Przemysław Malec2 1 Department of Plant Cytology and Embryology, Jagiellonian University, Grodzka 52, 31-044 Cracow, Poland, 2 Department of Plant Physiology and Biochemistry, Jagiellonian University, Gronostajowa 7, 30-387 Cracow, Poland The Arabidopsis At1g67580 gene encodes a Ser/Thr protein kinase expressing a significant similarity to animal and human cyclin-dependent (PITSLRE) kinases and taking part in controlling of cell division. At1g67580 mutant, one of homozygotic Arabidopsis knock-out lines, was created by insertion of T-DNA in the first exon of At1g67580. Previous studies indicated that the mutation affected developmental processes of A. thaliana (Kuta et al., 2008). The aim of this study was to investigate the influence of mutation in At1g67580 A. thaliana gene on explant reaction and in vitro plant regeneration. The control was tissues isolated from wild A. thaliana genotype Columbia. 620 hypocotyls and 660 cotyledons of 3-day-old seedlings of both genotypes were cultured on MS (Murashige and Skoog 1962) medium solidified with agar and supplemented with 2,4-D to induce callus proliferation. Organogenesis was achieved after callus transfer on MS + TDZ. The initiation time of callus induction, intensity of callus proliferation on hypocotyls and cotyledons of 3-day-old seedlings was genotype dependent. Evident delayed in shoot regeneration after callus transfer on MS + 0.5 mg l-1 TDZ was observed in mutant (42 days versus 7 days in wild Columbia genotype). Regenerated shoots of both genotypes were rooting on MS + IBA and 1/2 MS + 2% sucrose media but roots were formed exclusively in shoots of wild genotype. Regenerated plantlets of Columbia genotype developed flowers and produced seeds after self-fertilization whereas mutant regenerants were dwarf and produced inflorescences with small bud-like flowers with reduced corolla and generative organs. In conclusion: Mutation of At1g67580 gene evidently influenced reaction of mutant explants on culture conditions. Organogenesis on regenerated media was delayed as compared to shoot formation in Columbia genotype and no roots were formed on rooting media. Due to lack of roots, regenerated shoots development was disturbed and rootless plantlets although produced inflorescence not set seeds. Kuta E, Malec P, Pilarska M, Słomka A, Rataj K, Ilnicki T. 2008. Developmental biology of Arabidopsis thaliana At1g67580 mutant. Abstracts of the XXVIII Conference on Embryology: Plants, Animals, Humans, Wisła, May 14-17, 2008. Acta Biologica Cracoviensia Series Botanica 50 suppl. 1: 51. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 102 Posters Morphological traits of wheat/barley ‘Mv9 kr’1/’Igri’ addition lines under greenhouse conditions 19 Nikolett Réka Aranyi1, Éva Éva Szakács2, Márta MolnárMolnár-Láng2 and Borbála Hoffmann1 1 2 Department of Plant Sciences and Biotechnology, Georgikon Faculty, University of Pannonia Agricultural Institutes, Centre for Agricultural Research, Hungarian Academy of Sciences Hybridization between related species makes it possible to transfer useful traits such as tress tolerance, earliness, or various desirable traits from one species into another. The 2H, 3H, 4H, 6HS and 7H addition lines of winter wheat ‘Martonvásári 9 kr1’/winter barley ‘Igri’ produced in Agricultural Institutes, Centre for Agricultural Research of the HAS in Martonvásár were investigated to determine how the added barley chromosome influences the development of wheat plants and the agronomic traits. The addition and parent lines were grown in 1,5 l pots in greenhouse in Martonvásár. All the pots received weight irrigation until 60% field water capacity. Fresh and dry weight of root and shoot samples from each line were taken four times during plant development. Data were obtained for anthesis- and maturity dates, plant height, ear length, thousand grain weight, number of kernels, and grain yield. The highest root-shoot ratio was measured in case of 4H. The introgression lines exhibited marked difference in anthesis - and maturity dates, two weeks difference was observed between 7H and 4H addition lines. The 3H addition line was the shortest and the 2H line the tallest among the lines. The spike-length of these lines was proportional to plant height. The thousand grain weight of 7H addition line was the greatest, but this line had a poorer grain number per spike and low grain yield per pot. We measured a scale of variation in all examined traits. The introgression lines originating from wheat-barley hybrids can broaden the genetic bases of the wheat breeding programs with valuable traits. Expression of floral organ identity genes in allotetraploid Nicotiana tabacum 20 Jaroslav Fulneček1, Elizabeth W. McCarthy2,3,4+, Eva Kabáthová*1, Roman Matyášek1 and Aleš Kovařík1 1 Institute of Biophysics, Academy of Sciences of the Czech Republic, v.v.i., Královopolská 135, CZ-612 65 Brno, Czech Republic; 2 School of Biological and Chemical Sciences, Queen Mary University of London, Mile End Road, London, E1 4NS, UK; 3 Natural History Museum, London, SW7 5BD, UK; 4 Jodrell Laboratory, Royal Botanic Gardens, Kew, Richmond, Surrey, TW9 3DS, UK; + Current address: The New York Botanical Garden, 2900 Southern Blvd., Bronx, NY 10458, USA A eudicot flower is composed of four floral organs (sepals, petals, stamens, and carpels), which are organized in four concentric whorls. Floral organ identity specification is regulated by floral organ identity genes which are classified according their spatially specific expression; the finding which led to description of flower development by an elegant ABCE model. Except individual floral organs, the floral genes are practically silenced in other tissues. Germination of Nicotiana tabacum (tobacco) seeds in 1 - 500 µM solutions of 9-(S)-(2,3-dihydroxypropyl)-adenine (DHPA), an inhibitor of SAH-hydrolase for 6 days led to 1) dosage-dependent global DNA hypomethylation mitotically transmitted to adult plants; 2) pleiotropic developmental defects including decreased apical dominance, altered leaf and flower symmetry, flower whorl malformations and reduced fertility; 3) dramatic upregulation of floral organ identity genes DEFICIENS, GLOBOSA and AGAMOUS in leaves. The results indicate that DNA methylation plays an important role in developmental regulation of the genes. Since tobacco is an allotetraploid plant, we were also interested in inheritance and expression of progenitor copies of the genes. Both progenitor copies of DEFICIENS, GLOBOSA and AGAMOUS genes are maintained in tobacco genome and are additively and equally transcribed in tobacco flower buds. We did not find any evidence of subor neofunctionalization of the homoeologs probably due to relatively recent origin of tobacco. Additive transcription correlates with geometric morphometric analysis of floral limb shape, which revealed that tobacco flower morphology is intermediate or within the range of progenitors in several tobacco varieties. Possibly, additive transcription contributes to tobacco flower morphology. Substantial ectopic transcription of both progenitor copies in tobacco leaves after DNA hypomethylation suggests that developmental regulation connected with DNA methylation is probably similar for both progenitor copies. We have found progenitor specific differences in minute transcript levels in leaves. The origin of these differences is in progenitor species, indicating that some features of orthologous genes might not be identical. Such differences between homoeologs may open the field for evolution of new functions in polyploids. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 103 Abstracts Characterization of major groups of repetitive DNA in dioecious plant Rumex acetosa 21 Pavlína Šteflová*1, Viktor Tokan1, Ivan Vogel1, Matěj Lexa2, Boris Vyskot1 and Eduard Kejnovský1 1 2 Department of Plant Developmental Genetics, Institute of Biophysics, ASCR, Brno, Czech Republic Faculty of Informatics, Masaryk University, Brno, Czech Republic Rumex acetosa (sorrel) is a dioecious plant with XY1Y2 sex chromosomes system. Both Y chromosomes are thought to be degenerated because they ceased recombination with X chromosome and, as a consequence, accumulated large amount of specific tandem repeats. We performed low-pass 454 sequencing and similarity-based clustering of 454 reads in order to identify and characterize major groups of R. acetosa repetitive DNA. We found main groups of tandem repeats, microsatellites and transposable element (TE) families. Here, we present their structure, copy number in R. acetosa genome (with focus to differences between male and female), chromosomal localization and expression. We found previously described RAYSI, RAYSII, RAYSIII, RAE180 and RAE730 tandem repeats. Fluorescent in situ hybridization (FISH) showed that RAYSI-III were specifically localized on both Y chromosomes, RAE180 was found on the Y1, Y2 and one autosomal pair, and RAE730 was specific for one autosomal pair. FISH results were consistent with 454 sequencing data. We also found that most abundant microsatellites in R. acetosa genome are CA and CAA motifs. We identified the most abundant groups of transposable elements among which LTR retrotransposons Copia and Gypsy dominated. Various TE families showed contrasting FISH patterns - majority of TEs were ubiquitous but absented on both Y chromosomes, other TEs were, in contrast, accumulated on both Y chromosomes, some TEs were specifically localized in centromeres, and some TEs were depleted on X chromosome. Expression analysis of TEs show differences between TE families compared to their genomic proportions and differences between plant tissues. Acknowledgement: the Czech Science Foundation (P501/12/G090, 204/09/H002) Copper tolerance mechanism in Silene 22 Jiri Baloun1, Vojtech Hudzieczek1, Eva Nevrtalova1,2 and Roman Hobza1 1 Department of Plant Developmental Genetics, Institute of Biophysics, ASCR, Kralovopolska 135, 61200 Brno, Czech Republic 2 Mendel University in Brno, Zemedelska 1/1665, 61300 Brno, Czech Republic Copper is included in group of heavy metals necessary for all plants. It plays crucial role in redox reactions in cell. It is a cofactor of proteins and enzymes. On the other hand the copper excess is very dangerous. It can produce free radicals that may damage cell biomolecules (proteins, DNA) or structures (membranes). The affected plant has smaller root and shoot system and its leaves exhibit necrosis spots. In plant kingdom exist a few plants endure the high amount of toxic and essential heavy metals in environment. Silene ssp. can survive easily in these toxic conditions, resp. in copper pollution. We found Silene dioica and Silene vulgaris growing on heaps of copper spoil in ´Smolnik´ and ´Lubietova´ in Slovakia. These plants tolerate more than 60 times higher copper concentration in soil. For this reason genus Silene is a good model for studying the copper tolerance mechanism in plants. To identify the copper tolerance mechanism we searched for genes involved in copper translocation in plants from literature. We found a candidate protein family connected with transport of heavy metal via membranes called Heavy Metal ATPase (HMA). We marked only on HMA7 that is very important for copper translocation in cell. HMA7 transfers copper from cytosol into Golgi vesicles where copper takes part in ethylene triple response and protein post-translate modification. We found and characterized SvHMA7 and confirmed its function as important player in copper tolerance. This work was supported by Czech Science Foundation (P501/12/2220, 204/09/H002 and 522/09/0083) The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 104 Posters Sequencing of genes correlated with the exit of apricot flower buds from endogenous dormancy. 23 Jana Čechová*1, Miroslav Baránek1, Boris Krška2 and Miroslav Pidra1 1 Mendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Faculty of Horticulture in Lednice, The Mendeleum Institute of Genetics and Plant Breeding, Valticka 334, 691 44 Lednice, Czech Republic 2 Mendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Faculty of Horticulture in Lednice, Department of Fruit Growing, Valticka 337, 691 44 Lednice, Czech Republic Too short endogenous dormancy period of apricot flower buds can results in their lower frost resistance, and it can be one of the causes of lower fruit yields in certain years. The aim of the project was the analysis of the gene expression profiles in flower buds of four apricot varieties (‘Sundrop’, ‘Stark Early Orange’, ‘Vestar’ and ‘Betinka’) differing in it’s dormancy duration. The investigation was carried out in the dates covering the period of exit from endogenous dormancy of the apricot flower buds. The analysed traskriptomes were obtained by the molecular cDNA-AFLP method. Fragments showing a large change in expression profile, which could be linked to or even direct the exit of apricot flower buds from endogenous dormancy, were chosen from the expression profiles. The selected fragments were cut out from the polyacrylamide gel, re-amplified and prepared for cycle sequencing reaction. The samples were then purified in preparation for analysis using the ABI PRISM 310 genetic analyser. The nucleotide sequences obtained were compared with nucleotide sequences recorded in the NCBI (National Center for Biotechnology Information) database. The comparisons of these sequences with databases usually show similarity to some already described genes (aquaporines, S6 ribosomal protein, 40S ribosomal protein S12, DAP carboxylase, sodium and lithium-tolerant 1 protein) and other interesting nucleotide sequences (Full-length cDNA Complete sequence from clone GSLTFB68ZF04 of Flowers and buds of strain col-0 of Arabidopsis thaliana; water channel (GAMMA-TIP) mRNA (Tonoplast intrinsic protein (TIP) gamma)). As visible, some of these genes would be really involved in processes potentially influenting the exit from endogenous dormancy. Genetic variability of puroindoline genes in European bread wheat cultivars 24 Milan Pouch*1, Katerina Vaculova2 and Jarmila Milotova2 1 Research Group Plant Cytogenomics, Central European Institute of Technology, Kamenice 5, 62500 BrnoBohunice, Czech Republic 2 Department of Genetics and Breeding, Agrotest fyto, Ltd., Havlickova 2787, 76701 Kromeriz, Czech Republic Kernel hardness is a very important and highly heritable trait determining the technological and processing quality of bread wheat (Triticum aestivum L.). Puroindoline a (Pina-D1) and puroindoline b (Pinb-D1) are genetic factors predominantly controlIing wheat grain hardness. Mutations in either one or both puroindoline proteins result in hard grains. In this study, we analyzed sequence variability of Pin genes and kernel hardness of 239 European wheat cultivars. Standard alleles in both Pin genes (Pina-D1a/Pinb-D1a) were identified in 61 (25,5 %) cultivars. The frequencies of Pina-D1b, Pinb-D1b, Pinb-D1c, and Pinb-D1d alleles among 162 hard wheats were 2, 77, 14, and 7 %, respectively. Sixteen cultivars were determined as heterogenous, i.e., two alleles were simultaneously detected in one of the puroindoline genes. The cultivars were classified into three classes according to the results of SKCS (Single Kernel Characterization System) analysis. The frequencies of soft, mixed and hard genotypes were 25, 19, and 56 %, respectively. The results of molecular and SKCS analyses are in a good correlation, hence a combination of both approaches can be applied to study diversity of wheat genetic resources. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 105 Abstracts Relations between wheat genotypes with colored caryopsis 25 Milena Musilová*, Václav Trojan, Tomáš Vyhnánek and Ladislav Havel Department of Plant Biology, Faculty of Agronomy, Mendel University in Brno, Zemědělská 1, 613 00 Brno, Czech Republic Red colour is most frequent pigmentation of caryopses of cultivated common wheat (Triticum aestivum L.). Red pigments are caused by polyphenols. Genotypes with caryopses of different colour (blue, purple, yellow and white) also exist. These caryopsis colours are caused by anthocyanins (purple, blue) and/or carotenoids (yellow). Pigment formation and their localisation are controlled by genes. Blue pigments can be found in aleurone layer, purple pigments in pericarp and in testa and yellow ones in endosperm. Strong antioxidant activity is one of the anthocyanin characteristics. The use of such caryopses could lead to the functional food production. Unfortunately the most of genotypes that are available have lower yield than generally cultivated cultivars. More breeding is needed for stabilisation of new characteristics. The first step of the breeding process is to describe and understand available genotypes. In our work we confirmed localisation of blue and purple pigments in caryopsis during the filling and ripening of the caryopsis of selected genotypes at first. Then the collection of 24 genotypes of common wheat (Triticum aestivum L., 2n = 6x = 42, BBAADD) with red purple, blue, yellow and white caryopses and one genotype Thinopyrum ponticum (Podp.) Barkworth & D. R. Dewey (2n = 10x = 70, JJJJJJJsJsJsJs), which is supposed to be a donor of genes for blue pigments production, was studied using the SSR method. The SSR markers localized on chromosomes of A (2; 5 and 7) and B (5; 4 and 7) genome were chosen for the analysis because it is known that genes responsible for mentioned pigments are localised on these chromosomes. Based on 44 SSR markers a dendrogram was calculated. There is evident the wild genotype Th. ponticum stands out of the whole wheat collection. That means the genome of Th. ponticum does not share significant similarity with the wheat genome. Nevertheless when we compared the wild type with only blue colored wheat in another dendrogram, the genotypes layout shows a significant relationship with blue colored genotypes. Genotypes with red caryopses are gathered close together including genotype with white caryopses which is supposed to be recessive homozygote of the red ones. Genotypes with purple and blue caryopses showed high variability. Genotypes with yellow caryopses are also close together in the dendrogram. The obtained results can be used to improve the breeding programs in wheat to get high productive genotypes with anthocyanins in caryopses. Acknowledgment: GACR No. 204/09/H002. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 106 Posters Luzula elegans – a holocentric species with an inverted sequence of meiotic events? 26 Maja Jankowska, Stefan Heckmann and Andreas Houben Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK), Corrensstraße 3, OT Gatersleben, D-06466 Stadt Seeland Accurate partitioning of the genetic material during meiosis is essential for all species with sexual reproduction to propagate. The centromere ensures proper chromosomal segregation and transmission. Based on the function and localization of the centromere, eukaryotic chromosomes can be classified into two distinct types: monocentric and holocentric. In mitosis monocentric chromosomes form the kinetochore at a clearly defined region of single primary constriction. In contrast, holocentric chromosomes have spindle microtubules that are attached to nearly whole length of the chromatid. We have first indication that in the holocentric species Luzula elegans the sequence of meiotic events is inverted it means that chromosomes segregate equationally during the first meiotic division and reductionally during the second one. Our goal is to decipher the mechanism that allows holocentric chromosomes the correct course of meiotic events. To understand this process L. elegans genes encoding proteins involved in recombination, crossover formation and sister chromatid cohesion/separation during first and second meiosis will be identified. First, after characterization of the anther transcriptome by RNAseq and in silico analysis it is intended to express recombinant proteins encoded by selected meiotic genes. Next, polyclonal antibodies will be generated, which will be used for indirect immunofluorescence to visualize the position and dynamics of selected proteins during meiosis by high-resolution microscopy. Fluorescence in situ hybridization (FISH) with chromosome-specific probes will be performed to analyze the movements of chromosomes undergoing inverted meiosis. The physical map of wheat chromosome arm 3DS 27 Jan Bartoš1, Kateřina Cviková*1, Jan Šafář1, Hana Šimková1, Delphine Fleury2, Hélène Bergès 3, Klaus Mayer4, Jan Dvořák5,Nils Stein6, Federica Cattonaro7 and Jaroslav Doležel1 1 Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research, Institute of Experimental Botany, Sokolovská 6, 772 00 Olomouc, Czech Republic 2 Australian Centre for Plant Functional Genomics (ACPFG), University of Adelaide, PMB1, Glen Osmond, SA 5064, Australia 3 INRA, National Resources Centre for Plant Genomics, F-31326 Castanet Tolosan Cedex, France 4 Institute for Bioinformatics and Systems Biology (MIPS), Helmholtz Center f. Health and Environment, Ingolstadter Landstr. 1, D-85764 Neuherberg, Germany 5 Department of Plant Sciences, One Shields Avenue, 1210 Plant and Environmental Sciences Bldg Davis, CA 956168780 6 Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK) Gatersleben, Corrensstrasse 3, 06466 Gatersleben, Germany 7 Instituto di Genomica Applicata, Via J. Linussio 51, 33100 Udine, Italy Bread wheat is one of the most important crop in the World. Sequencing its genome can provide valuable information leading to its improvement. The wheat chromosome arm 3DS was sorted using flow cytometry and 3DS specific BAC library was constructed. This library was used to build the physical map using HIFC technique using Fingerprinted Contigs software. At the end of automated phase of contig building, Minimum Tilling Path (MTP) was selected. Three-dimensional pooling strategy was used to anchor markers to contigs. The sequences from 3D-pools of MTP were generated with Illumina technology. Pool's sequences were aligned with reference data sets of GenomeZipper, SNPs of Aegilops tauschii and sequences obtained after flow sorting of chromosome 3DS. 40% of new sequence markers were in silico anchored to the physical map. Contigs were ordered on the basis of comparison to genomes of Brachypodium, Rice and Aegilops tauschii. At the end of manual phase of contig bulding the physical map consisted of 945 contigs and over 20,000 markers. This work was supported by European Seventh Framework Project FP7-212019, IGA PrF/2012/001 and grant No. ED0007/01/01 Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 107 Abstracts Determination of polymorphisms of the partial sequences chalcone isomerase and dihydroflavanol reductase in wheat 28 J. Ondroušková*1, T. Vyhnánek1, 2, P. Hanáček1, 2 and P. Martinek3 1 2 3 Department of Plant Biology, Mendel University in Brno, Zemědělská 1, 61300 Brno, Czech Republic CEITEC MENDELU, Mendel University in Brno, Zemědělská 1, 61300 Brno, Czech Republic Agrotest fyto, s.r.o. Kroměříž, Havlíčkova 2787, 76701 Kroměříž, Czech Republic Anthocyans are plant pigments which are responsible for the red, purple and blue color of flowers, fruits and other plant parts. They are responsible for different caryopsis colour of common wheat (Triticum aestivum L.). These coloured grain wheats were obtained through wide hybridization among common wheat and other related genotypes, such as Agropyron elongatum, purple-grained tetraploid wheats from Ethiopia etc. The common grown wheat has red coloured grain. The aim this work is identification of genes from the anthocyanins biosynthetic pathway that are responsible for grain colour and compare their sequences. As a material we used ripened caryopsis of spring wheat with different coloration of the aleurone and pericarp layers. Genotypes UC66049 and Tchermaks Blaukörniger Sommerweizen have blue aleuron. Genotypes Abissinskaja arrasajta a ANK-28B have purple pericarp. Genotype Novosibirskaya 67 was used as standard. It has a white caryopsis as well as a genotype Heroldo (a form of winter wheat). RNA from caryopsis was reverse transcribed into cDNA transcription. For designing primers we used sequences cDNA for CHI and DFR obtained from the database NCBI. PCR reactions were amplified segments of sequences for CHI and DFR, which were used for direct sequencing of PCR product. The obtained candidate sequences were compared with sequences in the NCBI database and it was evaluated their polymorphism. We obtained a partial sequence for genes chalcone isomerase and dihydroflavanol reductase. By comparing sequences for each gene was found homology between the range 95 to 100%. We have identified single nucleotide polymorphisms and indel in sequences that disrupt the reading frame and can have a significant impact on the functionality of the transcript. Downstream step in this work is to get the whole sequence of the transcribed genes by 3'RACE and 5'RACE PCR reactions. Furthermore, the complete cDNA sequence compared with genomic DNA sequences to determine the presence of introns in genes. Finally, the data will be used for the design of qPCR for the study of genes expresion during caryopsis maturation. This study was supported by project GACR No. 204/09/H002. Physical mapping of barley BACs using fluorescent in situ hybridization 29 Lala Aliyeva*, Lu Ma, Thomas Schmutzer, Frank Blattner, Nils Stein and Andreas Houben Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), 06466 Gatersleben, Germany Physical mapping of genetically predefined sequences is important for comparative genomics as well as for the sequence characterization of large genome species like barley (Hordeum vulgare). We are interested in using FISH for resolving the order of BAC contigs that were genetically assigned to a 10 cM bin around the centromere of 3H of Hordeum vulgare. Generally, centromeres are poor in meiotic recombination and therefore often the positions of physically and genetically mapped sequences differ (Tanksley, Ganal et al. 1992). The second aim of the project will be to compare the order of predefined BACs between H. vulgare and related wild Hordeum species as such as H. bulbosum, H. marinum and others. This comparison will enable us to study the evolution of Hordeum species at the chromosomal level. Repeat-free sequences suitable for FISH of preselected BACs will be identified first by in silico Mathematically Defined Repeat (MDR) analysis. Next, identified sequences will be PCR-amplified and used as FISH probes according to Ma et al., (2010). In addition to mitotic metaphase chromosomes we intend to employ pachytene chromosomes for physical mapping. Chromosomes at the pachytene phase are less condensed than mitotic chromosomes and therefore a higher resolution of physically mapped sequences can be achieved. Ma L, Vu GTH, Schubert V, Watanabe K, Stein N, Houben A, Schubert I. 2010. Synteny between Brachypodium distachyon and Hordeum vulgare as revealed by FISH. Chromosome Research 18(7):841-850. Tanksley, S. D., M. W. Ganal, et al. (1992). "High-Density Molecular Linkage Maps of the Tomato and Potato Genomes." Genetics 132(4): 1141-1160. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 108 Posters Mapping of non/recombining regions of barley chromosome 7H using multicolor FISH 30 Miroslava Havránková*1, Jan Bartoš1, David Kopecký1, Nils Stein2, Kazuriho Sato3 and Jaroslav Doležel1 1 Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research, Institute of Experimental Botany, Sokolovská 6, 772 00 Olomouc, Czech Republic 2 Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), 06466 Gatersleben, Germany 3 Barley Germplasm Center, Research Institute for Bioresources, Okayama University, Kurashiki, 710-0046, Japan In this study, we confirmed the key importance of cytogenetic techniques for physical mapping. We selected 15 cDNAs of variable length (2,3-3,5kb) originating from centromeric and pericentromeric regions of barley chromosome 7, which were anchored in identical genetic position. The probes were prepared with nick translation and mapped using fluorescence in situ hybridization. Five clones were localized on the short arm and ten clones on the long arm of chromosome 7H. Surprisingly, 9 cDNA clones also provided a specific signal on chromosome 5H. This finding is consistent with a hypothesis of ancient duplication between these two chromosomes. We localized selected cDNAs on the particular chromosome arms and furthermore we determined the mutual position of 13 of the selected clones. According to the FISH results, non-recombinig region spanning the centromere represents about 30 % of the chromosome 7H. Besides BAC-FISH, this approach provides alternative method for overcoming the common problem of mapping in non-recombing regions. This work was supported by the Ministry of Education, Youth and Sports of the Czech Republic, the European Regional Development Fund (Operational Programme Research and Development for Innovations No. CZ.1.05/2.1.00/01.0007) and IGA UP PrF/2012/001. Computational analysis of LTR retrotransposons using NGS Data 31 Ivan Vogel*1, Matej Lexa2, Roman Hobza3, Boris Vyskot3 and Eduard Kejnovsky3 1 2 3 Faculty of Information Technology, Brno University of Technology Faculty of Informatics, Masaryk University, Brno Department of Plant Developmental Genetics, Institute of Biophysics, ASCR, Brno Next-generation sequencing (NGS) technology offers a great opportunity to analyze a large amount of biological data in a cost-efficient manner and provides a solution for problems that, due to their complexity, could not be formerly addressed. We studied the expression of transposable elements (TEs) in two dioecious plant species with sex chromosomes - Silene latifolia and Rumex acetosa - using NGS. One of the big computational tasks is the efficient mapping of sequence reads onto a reference sequence. We mapped cDNA reads corresponding to Gypsy and Copia families of LTR retrotransposons to genomic reads which significantly improved genomic sequence coverage compared to mapping of reads only to available reference sequences of TEs. The workflow consisted of data preprocessing (filtering artefact reads, removing redundancy and low quality reads, trimming reads based on quality) and final mapping of the reads to the reference sequence or genomic reads, normalizing and parsing the results. We obtained several plots showing levels of expression for specific TE families relative to each other and to their genomic proportions. In order to identify and classify certain families of TEs, we performed a phylogenetic analysis where we combined our new elements with the database of already classified TEs. We have also built a database of LTR retrotransposons that were mined from BAC clones using several prediction tools and annotated them (protein domains, PBS and PPT tracks). Additionally, we also studied microRNAs derived from transposable elements. We analyzed the abundance and positions of microRNA sequences inside the LTR retrotransposons which enabled us to speculate about their regulatory roles. Acknowledgement: the Czech Science Foundation (204/09/H002 and P501/12/G090) The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 109 Abstracts Mapping of agronomicaly important traits in Triticum monococcum L. 32 Barbora Klocová*1, Tibor Sedláček2, Hana Vanžurová1, Lucia Gallová1, Miroslav Valárik1 and Jaroslav Doležel1 1 Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research, Institute of Experimental Botany, Sokolovská 6, Olomouc, CZ-77200, Czech Republic 2 SELTON Research Centre. Ltd., Stupice 24, Sibřina CZ-250 84, Czech Republic Einkorn wheat T. monococcum is a diploid wheat species closely related to the A genome of bread wheat. The diploid genome and availability of wild and domesticated cultivars makes T. monococcum a rich source of genetic variation useful in wheat improvement. It is also an ideal target for QTL mapping and positional cloning. Here we report on mapping of a set of agronomically important traits affecting yield, plant height, pubescence, plant shape, flowering time, nitrogen content and brittle rachis. A mapping population that was derived from a cross of cultivated T. monococcum ssp. monococcum cv. Dv92 and wild T. monococcum ssp. aegilopoides cv. G3116 was used to construct QTL and high density linkage map. The linkage map was constructed using 471 markers comprising 368 DArTs, 43 STS, 40 SSR ad six previously cloned wheat genes. The QTL mapping of the agronomical traits was done during three seasons at two locations with two treatments. A total of 12 QTL were identified, seven for yield, one for plant height, flowering time and brittle rachis, two for plant shape. No significant QTL was found on chromosomes 6 and 7. Genetic map of the identified loci will be saturated with additional molecular markers and ultimately used to clone genes affecting the traits. This work was supported by the Ministry of Education, Youth and Sports of the Czech Republic and the European Regional Development Fund (Operational Programme Research and Development for Innovations No. CZ.1.05/2.1.00/01.0007) and Internal Grant Agency PrF-2012-001. Screening of expression levels of host mRNAs in PSTVdPSTVd-infected tomato plants revealed misregulation of genes involved in plant development 33 Martin Selinger*1, Ganesh S. Duraisamy2, Zoltán Füssy1,2, Gerhard Steger3 and Jaroslav Matoušek1,2 1 Faculty of Science, University of South Bohemia, Branišovská 31, 37005 České Budějovice, Czech Republic Institute of Plant Molecular Biology, Biology Centre of the ASCR, v.v.i., Branišovská 31, 37005 České Budějovice, Czech Republic 3 Institute of Physical Biology, Heinrich Heine University Düsseldorf, 40204 Düsseldorf, Germany 2 Viroids are the smallest known infectious agens of higher plants. They are characterized as unencapsidated singlestranded circular RNAs ranging in size from 250 to 400 nucleotides. Viroid RNA lacks translational activity and is autonomously replicated via rolling-circle mechanism either in nucleus (Pospiviroidae) or in chloroplast (Avsunviroidae) of host plant cell. The process of plant pathogenesis caused by viroids remains still a riddle. Recent hypotheses suggest the involvement of viroid-derived small RNAs (vsRNA) in misregulation of host´s gene expression via transcriptional or post-transcriptional gene silencing. We therefore accomplished Illumina sequencing of four small RNA libraries derived from healthy and viroid-infected tomato (Solanum lycopersicon L. cv. Heinz) plants using three strains of PSTVd (Potato spindle tuber viroid) - two severe (AS1 and C3) and one mild (QFA). To identify potential viroid targets in PSTVdinfected tomato, we searched vsRNA libraries for complementarity to mRNA sequences. The obtained list of possible mRNA targets consisted of 1633 loci that have fragments in at least one of Illumina libraries. We selected 47 possible gene targets mainly involved in RNA-metabolism or signaling pathways of plant development, metabolism and cell cycle. The chosen potential target genes were analyzed for changes in expression levels in symptomatic AS1-infected tomato plants in comparison with healthy plants by using quantitative reverse-transcription PCR (qRT-PCR). The analysis revealed 12 genes with significant changes in mRNA levels. From twelve of such genes eight were downregulated in AS1-infected plants including auxin and ethylene response regulators (ERF4, NPH3), kinases involved in plant defense (PP2A , SERK1) and a leaf development transcription factor (TCP3). Up-regulation was observed in the four remaining genes, particularly in H/ACA complex subunit 1 which is responsible for ribosome biogenesis. Further analyses of the twelve misregulated genes are in progress to determine the possible target(s) of viroid pathogenesis network. Acknowledgments: This work was supported by the Czech Science Foundation (GACR P501/10/J018) and by the Grant Agency of the University of South Bohemia (GAJU 134/2010/P). The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 110 Posters Dynamics of TBN1 wt biogenesis upon coco-infiltration with gene silencing suppressors and WD40 transcription factor 34 Anna Týcová*1,2 and Jaroslav Matoušek1,2 1 Faculty of Science, University of South Bohemia, Branišovská 31, 370 05 České Budějovice, Czech Republic Biology Centre of the ASCR, v. v. i., Institute of Plant Molecular Biology, Branišovská 31, 370 05 České Budějovice, Czech Republic 2 Tomato bifunctional nuclease 1 (TBN1) has antitumor activity and therefore, it is studied extensively to improve its molecular farming. We are focusing on TBN1 biogenesis in its natural environment – in infiltrated leaves upon coexpression with gene silencing suppressors p38 and p19, and WD40 transcription factor AtTTG1, because AtTTG1 makes plants more viable. Leaves of Nicotiana benthamiana plants were infiltrated with the mixture of Agrobacterium tumefaciens strains bearing the nuclease plant expression vector and co-infiltrated with the vectors bearing silencing suppressors or transcription factor. RNA and protein extracts were prepared from infiltrated leaves on the 3rd, 5th and 7th day post infiltration (p.i.) and analysed for level of nuclease mRNA by qPCR, for nuclease accumulation using Western blots and for ssDNase activity. The nuclease accumulation and activity was the highest on the 7th day p.i. and reached higher values in samples co-expressing the nuclease with p38 or p19 than in samples with TBN1 alone. The activity further increased when the nuclease was simultaneously expressed with suppressors and transcription factor AtTTG1. Real-time PCR analysis showed that TBN1 mRNA content culminated on the 3rd day p.i. and that the mRNA level was higher in the presence of p38 in comparison to TBN1 controls. This suggests efficient stabilization of TBN1 mRNA by this silencing suppressor. Moreover, the highest content of TBN1 mRNA was observed in the samples co-expressing the nuclease and both p38 and AtTGG1. Grant support: GAČR 521/09/1214 and GAJU 134/2010/P. On the measurement of infectivity of Wheat dwarf virus infectious clones using differential realreal-time PCR 35 Pavel Cejnar*1,2, Kumar Kundu Jiban1 and Pavel Rysanek2 1 Department of Virology, Crop Research Institute, Drnovská 507, 16106 Prague, Czech Republic Department of Crop Protection, Faculty of Agrobiology, Food and Natural Resources, Czech University of Life Sciences Prague, Kamýcká 129, 165 21 Prague 6, Czech Republic 2 Wheat dwarf virus (WDV) is a single-stranded circular DNA virus, which belongs to the genus Mastrevirus of the Geminiviridae family. WDV is one of the most important virus pathogens of cereal crops and grasses in the Czech Republic. The virus is transmitted only by leafhopper Psammotettix alienus. The testing of resistance is dependent on large scale field trials. We have developed infectious clone of Czech isolate of WDV to support functional genomics study of the virus and to enhance resistance testing of cereals. A differential real-time qPCR was developed for the quantification of DNA molecules of WDV. New viral DNA molecules together with the infectious clone molecules were quantified by the primers and probes for WDV using TaqMan assay. A specific TaqMan assay for the quantification of solely infectious clone DNA molecules was also designed, based on DNA sequence specific to bacterial plasmids. The feasibility of the method was tested on diluted standards with the PCR product of the virus genome mixed with DNA of infectious clones at different concentrations. The TaqMan assay was used to evaluate the amount of new virus molecules after mechanical inoculation of the suitable host (Triticum aestivum). However, infectivity of the WDV infectious clone has not yet been proved through mechanical inoculation to the wheat plants. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 111 Abstracts Cytological Characterization of Two Genlisea Species with a TwentyTwenty-fold Genome Size Difference 36 Trung D Tran*1, Gabriele Jovtchev1, 2, Pavel Neumann3, Jiri Macas3, Giang TH Vu4, Joerg Fuchs1 and Ingo Schubert1 1 Department of Cytogenetics and Genome Analysis, Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Gatersleben, Germany 2 Present address: Department of Bio-Indication & Environmental Assessments, Environmental Mutagenesis, Central Laboratory of General Ecology, Sofia, Bulgaria 3 Laboratory of Molecular Cytogenetics, Institute of Plant Molecular Biology, Biology Center ASCR, Ceske Budejovice, Czech Republic 4 Department of Plant Breeding and Genetics, Max-Planck-Institute for Plant Breeding Research, Cologne, Germany The cosmopolitan Lentibulariaceae family is characterized by extreme plasticity of genome size, variable chromosome numbers, high base substitution rates and unique trapping mechanism for carnivory. Species of the monophyletic genus Genlisea attract, trap and digest mainly protozoan in “lobster pot” traps of their corkscrew-like bundles of root-like subterraneous leaves. The genus comprises at least 27 species with genome sizes ranging from 64 Mbp (G.aurea) to 1550 Mbp (G. hispidula). This feature makes Genlisea species interesting subjects to study mechanisms of genome and karyotype evolution. However, cytogenetic data were largely lacking so far. For G. pygmaea (86 Mbp) with one of the smallest plant genomes and G. hispidula with twenty-fold larger genome we were determining the chromosome numbers and investigated the chromosomal constitution regarding heterochromatin, telomere and rDNA as well as the sub-nuclear distribution of epigenetic marks. Furthermore we were analysing the chromosomal distribution of diverse retrotransposon and newly identified tandem repeats including a putative centromeric sequence for G. pygmaea. These fundamental cytological data constitute basic information for future elucidation of karyotype evolution by chromosome painting within the Lentibulariaceae family. Study of determinants of cytokinin receptor ligand specificity 37 Lucia Gallová*1, Karel Berka2, Pavel Mazura3 and Lukáš Spíchal 1,4 1 Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research, Faculty of Science, Palacký University, Šlechtitelů 11, 783 71 Olomouc, Czech Republic 2 Department of Physical Chemistry, Faculty of Science, Palacky University, 17. listopadu 12, 771 46 Olomouc, Czech Republic 3 Department of Molecular Biology and Radiobiology FA, Zemědělská 1, 61300 Brno, Czech Republic 4 Laboratory of Growth Regulators, Faculty of Science, Palacký University & Institute of Experimental Botany AS CR, Šlechtitelů 11, 783 71 Olomouc, Czech Republic Plant hormones cytokinins activate histidine kinase receptors to initiate a signalling pathway. Three receptors, CRE1/AHK4, AHK3 and AHK2, are known in Arabidopsis thaliana. These receptors differ in sensing of different cytokinins. Extracellular ligand-binding domains of all three receptors contain so-called CHASE domain. Although sequences of CHASE domains of all the receptors are highly conserved, CRE1/AHK4 and AHK3 have contrasting ligand specificities. The molecular basis of the ligand recognition has been unravelled only recently thanks to crystallisation of CRE1/AHK4 sensor domain. Based on this we selected amino acids that can be responsible for the differences in the ligand specificity and used site directed mutagenesis to manipulate CRE1/AHK4 sensitivity towards AHK3-preffered ligands. Functional assays proved such changes in CRE1/AHK4 specificity. This knowledge might provide better understanding of interactions of cytokinin receptors and their ligands in plants. Supported by grant No. ED0007/01/01 Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 112 Posters Cytogenetic analysis of Miscanthus x giganteus and its parent forms 38 Andrzej ChramiecChramiec-Głąbik* Department of Plant Cytology and Embryology, Institute of Botany, Jagiellonian University, Grodzka 52, 31-044 Cracow, Poland The research aimed at comparative karyotype analysis and measurement of the nuclear DNA amount in giant miscanthus - Miscanthus x giganteus and its hypothetical ancestors: eulalia grass - M. sacchariflorus and porcupine grass - M. sinensis. The triploid chromosome number 2n=57 in M. x giganteus and the diploid chromosome number 2n=38 in the other species was confirmed. In the karyotype of giant miscanthus three SAT chromosomes were observed, whereas in M. sinensis there were two and in M. sacchariflorus probably four satellited chromosomes. In the first species 1 to 4 B-chromosomes were evidenced. The highest proportion of the C-banding/DAPI positive heterochromatin was found in M. sinensis cv. Gracillimus and the least - in M. sinensis M07 genome. The banding patterns observed in giant miscanthus resembled those observed in M. sacchariflorus. The 2C nuclear DNA content in M. x giganteus was 7.47 pg and in M. sacchariflorus it was 5.14 pg; two analysed lines of M. sinensis differed in 2C DNA value (5.18 pg and 5.49 pg). Characterization of DNA repetitive sequences (RAYSI and RAYSII) derived from Y chromosomes of Rumex acetosa, R. arifolius and R. thyrsiflorus. 39 Patryk Mizia*, Dagmara Kwolek and Andrzej J. Joachimiak Department of Plant Cytology and Embryology, Institute of Botany, Jagiellonian University, Grodzka 52, 31-044 Kraków, Poland Dioecius species are uncommon among flowering plants and only few of them developed well-determined sex chromosome system. Sorrel species (Rumex) represent a broad spectrum of different sex determining mechanisms starting from hermaphroditic, polygamous, gynodioecious monoecious and dioecious species (witch different sexdetermining mechanisms and sex-chromosomes systems). One of the representatives of this interesting genus is R. acetosa, one of the best studied dioecious plant. In our study we analysed two Y-chromosome linked, AT-rich satellite sequences (RAYSI and RAYSII) in R. acetosa, R. arifolius and R. thyrsiflorus from Poland. All species possess the same multiple sex chromosome system (XX/XY1Y2). PCR method based on RAYSI and RAYSII primers were commonly used on those species for sexing seeds as well as adult plants. PCR products based on RAYSI (R. acetosa and R. thyrsiflorus) sequence produced only one band witch similar weight among R. acetosa and R. thyrsiflorus species (~900 bp). In addition presence of low luminous band in some female samples of both species were detected. PCR products based on RAYSII (R. acetosa, R. arifolius and R. thyrsiflorus) sequence produced only one band (~700 bp) in R. acetosa and R. arifolius and two in R. thyrsiflorus (~600 and ~700 bp). All obtained PCR products were cloned and sequenced (including RAYSI female product), and variability among clones from same plants, within species and between species were detected. Quantitative data analysis showed separate clustering of ~600 bp and ~700 bp RAYSII sequences and surprisingly large nucleotide variation of RAYSI obtained from different plants. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 113 Abstracts Cytokinin metabolism and signal transduction in cold and heat stress responses of Arabidopsis 40 Eva Ge*, Jana Dobra, Petre Dobrev, Helena Storchova and Radomira Vankova Institute of Experimental Botany AS CR, Czech Republic Heat stress represents abiotic stress, which may cause very fast damage to all cell structures, thus, the initial stress response includes transient stimulation of transpiration, which delays the rise of leaf temperature until other defence mechanisms can be stimulated. On the contrary, cold stress is associated with slowing down of metabolic processes. The early responses to both stresses include down-regulation of the growth rate. Plant hormone cytokinins (CKs) have been recognized to play an important role in both responses. Heat (40 °C) and cold (5 °C) stresses were applied to shoots of Arabidopsis thaliana grown in hydropony. Upon heat stress, expression of genes for biosynthetic enzymes (isopentenyltransferases, especially IPT3) as well as for degrading enzymes (cytokinin oxidases/dehydrogenases, e.g.CKX1) was down-regulated in apices and leaves, while up-regulated in non-stressed roots. Enhanced CK transport from the roots enabled to maintain active CK levels (necessary for stomata opening) in leaves for ca 45 min (period of stimulated transpiration). Cold stress was also associated with down-regulation of IPT3, which, however, returned to control level after 6 h. CKX genes (especially CKX1 and CKX6) exhibited transient peak after 30 min of cold stress, which coincided well with down-regulation of active CK levels in leaves. The expression of CK receptors exhibited (with a 15-min delay) transient down-regulation upon heat stress, reaching back the control levels after 2 h. Similar expression profile was determined for positive type-B response regulators (e.g. ARR12). Expression of negative type-A response regulators was down-regulated immediately upon heat stress. On the contrary, upon cold stress, fast transient stimulation of type-A response regulators was found. The expression data are in good accordance with hormone levels as well as with physiological performance of stressed plants. This work was supported by GA CR projects no. 522/09/2058 and 206/09/2062. Role of horizontal transfered mis gene in genus Nicotiana and genus Linaria 41 Viera Kováčová* and Bohuslav Janoušek Department of Plant Developmental Genetics, Institute of Biophysics, ASCR, Kralovopolska 135, 612 00, Brno, Czech Republic The gene for mikimopine synthase was originally found in T-DNA that is being transferred by Agrobacterium rhizogenes during its infection of the roots of host plant. Later was the occurence of this gene also reported in nontransformed plants of several species of the genus Nicotiana (Solanaceae). Recently, was the presence of this gene also reported in the species Linaria vulgaris (Plantaginaceae). We decided to test the similarity in the evolution of the mis gene evolution in the genus Nicotiana and Linaria. We have tested presence of mis gene in several species of genus Linaria: L. vulgaris, L. genistifolia, L. genistifolia susp. dalmatica, L. triornithophora, L. alpina, L. repens, L. purpurea, L. aeruginosa, L. bipartita, L. maroccana. The mis gene was found in species: Linaria vulgaris, L. genistifolia subsp. dalmatica, L. genistifolia. We have sequences several samples from each species. Simultaneously, we have sequenced mis gene from several species of the genus Nicotiana (several lines from each species): N. tabacum, N. tomentosiformis and N. glauca. Analysis of the sequences for the synonymous and non-synonymous substitutions showed that the horizontally transferred sequences in Nicotiana and Linaria evolved in different manner. The role of mis gene in these organisms is unkown. We have also tried to establish the function of mis gene by using bioinformatics tools (String 9.0, SupFam, KEGG, Phyre2). Acknowledgement: the Czech Science Foundation (204/09/H002 and P501/12/G090) The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 114 Posters Evolution of sex chromosome in Silene genus 42 Veronika Slancarova1*, Radim Cegan1, Jitka Zluvova1, Jana Zdanska1, Alex Widmer2, Christian Zschach1 and Bohuslav Janousek1 1 Department of Plant Developmental Genetics, Institute of Biophysics AV CR, Kralovopolska 135, 61200, Brno, Czech Republic 2 Plant Ecological Genetics, Institute of Integrative Biology, ETH Zurich, Universitatstr. 16, 8092 Zurich, Switzerland Genus Silene has a great potencial for sex chromosome evolution studies. It is a species-rich genus and it also includes species with various reproductive strategies: hermaphroditic, dioecious, gynodiecious etc. Dioecious plants from this genus are important for sex chromosomes evolutionary studies because their sex chromosomes are evolutionarily young, much younger than e.g. mammalian sex chromosomes. Genus Silene includes 2 subgenera: subgenus Behenantha and subgenus Silene and dioecious species are included in both of them. In Silene genus, dioecy evolved in at least two independent events, as was shown by a previous study comparing sex-linked markers from Silene latifolia and Silene colpophylla. In our work, we focuse especially on Silene otites possesing sex chromosomes which seem to be very interesting for this type of study. We are looking for sex-linked STS markers, to test whether sex chromosomes of Silene otites evolved from the same pair of autosomes as some other dioecious species of genus Silene expecially its phylogenetically closely related species Silene colpophylla. Acknowledgement: GA CR 204/09/H002 & P501/12/G090 Chromosome numbers in flowering plants from Poland 43 Paulina Gacek*, Grzegorz Goralski and Andrzej Joachimiak Department of Plant Cytology and Embryology, Institute of Botany, Jagiellonian University, Kraków, Poland To determine the degree of knowledge of chromosome numbers and polyploidy in flowering plants from Poland we used information collected in Chromosome Number Database of Polish Angiosperms (http:// www.binoz.uj.edu.pl:8080/chromosomes/). This database comprises 3387 records on chromosome numbers of 1498 species which represent 40.28% of the total Angiosperms (3,719) occurring in Poland. In our investigation we focused especially on native species, anthropophytes and different growth habits in plants: trees, shrubs and subshrubs, perennials plants and annual and biennial plants. Chromosome numbers were reported for 1,205 native species (53.4%), 194 anthropophytes (56%), 49 trees (37.12%), 150 shrubs and subshrubs (44.64%), 959 perennials plants (43.14%), 326 annual and biennial plants (32.37%). According to generic basal chromosome numbers, 46.44% of Polish angiosperms were inferred to be polyploid. By basal chromosome numbers, 49.07% native species, 32.99% anthropophytes, 26.53% trees, 70% shrubs and subshrubs, 48.05% perennials plants and 33.33% annual and biennial plants were polyploids. Using three different threshold methods, proposed by Goldblatt, Grant and Wood, we calculated the proportion of polyploids for native plants (67.58%, 53.46%, 47.22%), anthropophytes (48.45%, 37.63%, 25.77%), trees (97.96%, 75.51%, 10.20%), shrubs and subshrubs (80%, 73.33%, 59.33%), perennials plants (65.80%, 50.43%,45.89%) and annual and biennial plants (49.09%, 37.88%, 31.21%). It's worth to underline connection between percentage of polyploids (obtained by two thresholds methods developed by Goldblatt and Grant) and different growth habits in plants. Proportion of polyploids rises from annual and biennial plants through perennials plants, shrubs and subshrubs to trees. However, percentage of polyploids among trees differ significantly regardless of the estimation method. It was shown that frequency of polyploids is higher in native species than in anthropophytes, and that the ploidy distribution among plants from Tatras does not differ significantly from that observed in the rest of native plants. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 115 Abstracts Phenotypic and genotypic identification and phylogenetic characterisation of Taphrina fungi on poplar species in Slovakia. (Taphrina johanosnii and Taphrina rhizophora are two different species). 44 Jana Petrýdesová*1, Pavol Sulo2 and Kamila Bacigálová1 1 Department of Non-Vascular Plants, Institute of Botany SAS, Dúbravská cesta 9, 845 23, Bratislava 4, Slovak Republic 2 Department of Biochemistry, Faculty of Natural Sciences, Comenius University in Bratislava, Mlynská Dolina, Bratislava 842 15, Slovak Republic The ascomycetous genus Taphrina Fr. is remarkable group of more than 90 the phytopathogenic microscopic yeastlike fungi, with characteristic dimorphism. Mycelial state is strictly phytoparasitic, while the second state of their life cycle is saprobic since they are able to grow as yeasts on artificial media. Taphrina species are mainly identified according their host species and morphological, physiological or molecular traits. The rule of thumb is that one species parasites on one host plant. However taxonomic classification of few exceptions from this rule has not been clarified yet. Therefore the aim of this study was to inspect taxonomic classification of two species Taphrina johanosnii and Taphrina rhizophora, parasitizing on two different poplar species and considered as conspecific. Due to undistinguishable phenotypic traits we determined and compared their nucleotide sequences of the regions from 26S rRNA gene (D1/D2 domains) and mitochondrial gene (rns gene). The rate of divergence and sequence comparison revealed that these yeasts are not conspecific as they have been recently classified, but should be assigned to two different species. Identity of selected Vězda's specimens of Solenopsora (lichenized fungi) 45 Katarína Piknová*, Anna Guttová, Judita Zozomová and Anna Lackovičová Institute of Botany, Slovak Academy of Sciences, Dúbravská cesta 9, 845 23 Solenopsora A. Massal. is a small lichen genus including ca 20 taxa worldwide, with uncertain position within Lecanoromycetidae (Rhizocarpomycetidae – Catillariaceae). The members of the genus are mostly confined to calcareaous substrates. Its diversity center is the Mediterranean and the Black sea region. Occurrence of species is local. W. Nylander described taxon Lecanora liparina in 1876 from serpentine rocks in France, based on Lamy´s collection from Haute Vienne. A. Zahlbruckner transfered it to the genus Solenopsora in 1919. A. Vězda collected some specimens of S. liparina in France and Romania from calcareous and serpentine rocks. Moreover he collected S. carpatica from Czech Republic (Jeseníky Mts.) which grew also on serpentine rocks. Vězda's collection of specimens were assessed on the basis of sequences of ITS region, ketosynthase domain of PKS gene and mcm7 gene. The analysis comprised also furhter Solenopsora specimens with placodioid thallus collected in the South pre-Alps, along the Adriatic coast, Macedonia and the Western Carpathians. Preliminary molecular analyses show that Vězda's specimens of S. liparina from France and S. carpatica from the Jeseníky Mts. are genetically different from the specimens of placodioid Solenopsora from the sampled region. Further sampling is crucial to disclose, whether we deal with the vicariant taxon confined to different type of substrate (serpentine rock), or with cryptic taxon. Chemical analysis (TLC) shows that Vězda's specimens of S. liparina from France and Romania are markedly different from the rest of the placodioid taxa which were studied. These contain pannarin and zeorin, while Vězda's specimens contain undefined substances. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 116 Posters Identification of linuron resistance in the common ragweed (Ambrosia artemisiifolia L.) and a multiplex PCR technique for the easy detection of it 46 Kinga Klára Mátyás*1, Péter Poczai 2, István Cernák3, Diane Lyse Benoit4 and János Taller1 1 Biotechnology Group, Department of Plant Science and Biotechnology, Georgikon Faculty, University of Pannonia, Festetics u. 7, Keszthely 8360, Hungary 2 Plant Biology (Biocenter 3), University of Helsinki, PO Box 65, 00014 Helsinki, Finland 3 Potato Research Centre, Centre of Agricultural Sciences, University of Pannonia, Festetics u. 7, Keszthely 8360, Hungary 4 Horticultural Research and Development Centre, Agriculture and Agri-Food Canada, 430 Gouin blvd., Saint-Jeansur-Richelieu (Québec) J3B 3E6, Canada The common ragweed, ( Ambrosia artemisiifolia L.) is an annual, noxious, invasive weed in North America, Europe and Asia. It belongs to the family Asteraceae. The rapid spread of this weed causes economic damages in agriculture and the pollen of ragweed may induce allergy in humans. Herbicides play an important role in ragweed control. Linuron, a member of urea-group herbicides inhibits the photosynthesis at photosystem II by blocking the electron transfer activity of the D1 protein. The target gene of it is the psb A gene which is located in the chloroplast genome. Since linuron acts in a single-site mode, resistance may develop by point mutation. In common ragweed linuron resistant biotypes were detected and collected on field borders in Ste-Clotilde-Legault (Canada). We isolated the psb A gene from the linuron resistant biotypes and compared it to the wild type. The molecular genetic basis of linuron resistance seems to be the same as it was observed in atrazine-resistant ragweed, i.e.: an A/G point mutation at the 790. nucleotide position of the gene is causing an amino acid change from serine to glycine. Further, the heteroplasmic state of resistant and wild type cpDNA could also be proved in linuron resistant biotypes. We tested our Bi-PASA method that was developed to detect the atrazine-resistance causing mutation in common ragweed, and in can be concluded that it is applicable in the same way for the detection of linuron resistance, too. When applied in monitoring for linuron resistance our results may contribute to the success of precise weed regulation. Natural variation of Arabidopsis thaliana genes involved in postpost-transcriptional transgene silencing 47 Thanh Loan Le* and Renate Schmidt Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK) T-DNA lines that carried defined numbers of a GFP (green fluorescent protein) reporter gene under the control of a strong promoter conferring high constitutive expression were established in the accession Col-0 to study transgene expression and silencing in Arabidopsis thaliana. These transgenes were inserted at many different positions in the genome. Below a certain number of identical transgenes each gene copy contributes equally to gene expression. This expression is high, stable throughout plant development and in all analysed generations. It is also comparable between independent lines carrying the same transgene copy number. The high expression level mediated by multiple copies of a particular reporter gene triggers gene silencing. Methylation and siRNAs specific for the transcribed regions, systemic spread of silencing during development, and meiotic reversibility of the process have been documented for the transgenes and all these features support a posttranscriptional mechanism of gene silencing. The onset and/or the spread of silencing can be reliably monitored in populations of transgenic lines carrying GFP transgenes. Recently, the study of mutants with impaired post-transcriptional gene silencing (PTGS) led to the discovery of many genes that play important roles in this process. We have selected 19 genetically diverse accessions in order to analyse copy number and sequence variation of genes involved in PTGS. Based on the results of the comparative sequence analysis we will select on the one hand sequence variants of particular genes and on the other hand accessions for functional tests. In order to study the functional relevance of sequence variants or particular genetic backgrounds we are setting up introgression lines. The onset and spread of silencing of GFP transgenes will be assessed in all different introgression lines and compared to the pattern in the Columbia-0 background. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 117 Abstracts Model of mitochondrial and chloroplast DNA integration into nuclear genome in completely sequenced plant species 48 Monika Michalovova1,2, Boris Vyskot1 and Eduard Kejnovsky1,2 1 2 Laboratory of Plant Developmental Genetics, Institute of Biophysics ASCR, Brno, Czech Republic; Laboratory of Genome Dynamics, CEITEC, Masaryk University, Brno, Czech Republic Plant cells contain beside nuclear genome also genomes of chloroplast and mitochondria. According to endosymbiotic theory, organelles originated as free-living bacteria (proteobacteria in case of mitochondrion and cyanobacteria in case of chloroplasts). DNA is still migrating between cellular genomes, with dominant flux from organelles to nucleus. Chloroplast and mitochondrial DNA sequences in nuclear genome (called NUPTs and NUMTs, respectively) can be determined based on similarity with organellar genome and are also known as „promiscuous DNA“. In this study, we analyzed NUPTs and NUMTs in selected completely sequenced plants genomes with focus on their chromosomal localization, size and estimated date of insertion. We found that long insertions were identical to chloroplast or mitochondrial sequences, what suggests their recent origin, and were localized close to centromeres. Shorter sequences with lower identity were distributed along all chromosomes. Based on these data we have proposed a model of turnover of promiscuous DNA where new organellar DNA sequences are inserted into centromeric or pericentromeric region, subsequently fragmented (e.g. by transposable elements insertions), reshuffled away from centromeres or removed by recombination. The mode and tempo of this turnover is speciesspecific – higher in larger genomes and lower in smaller genomes - what explains distribution patterns of NUPTs and NUMTs in studied species. Acknowledgement: the Czech Science Foundation (204/09/H002) Differences in structure of plant sex chromosomes 49 Tereza Králová*, Radim Čegan, Roman Hobza and Boris Vyskot Department of Plant Developmental Genetics, Institute of Biophysics ASCR, v.v.i., Kralovopolska 135, 61200, Brno, Czech Republic Evolution of separated sexes and differentiated sex chromosomes is one of the biggest mysteries in biology. Plant sex chromosomes were first observed in Rumex acetosa (Kihara et Ono, 1923) and Silene latifolia (Blackburn, 1923). Although these plants have large, distinguishable sex chromosomes, each model represents different type of sex determination and level of sex chromosome evolution. Silene latifolia has sex determination system based on the dominant role of Y chromosome (mammalian type), while Rumex acetosa sex is determined by the ratio between the X chromosome(s) and sets of autosomes (Drosophila type). No sex-linked genes have been identified yet in Rumex acetosa. Our aim was to find and characterize them. In order to isolate sequences accumulated on one of the sex chromosomes BAC library of Rumex acetosa has been constructed. BAC library was hybridized with two types of radioactive probes. First type of probes was derived from repetitive sequences abundant on Y chromosomes, namely RaysI, RaysII, RaysIII and microsatellite (CAA)10. Given that the satellites occur mainly on the Y chromosomes, we expected to find sex-linked sequences in their proximity. In this case, we used clones giving the strongest hybridization signals. In the second approach we hybridized BAC library using probe derived from male genomic DNA. To find low-copy sequences (hypothetical genes) we chose the weakest hybridization signals. Afterwards fluorescence in situ hybridization (FISH) was used to determine whether sequences are localized on sex chromosomes. We isolated BAC clones providing discrete FISH signals on the sex chromosomes. BAC 43H11 seems to represent pseudoautosomal region of X and Y1 . BAC 7P2 is a unique X-specific sequence, what indicate possibility to find Xlinked genes or/and sex-linked markers. BAC 60K24 shows repetitive sequnces occuring throughout genome except Y chromosomes. Isolated sequences help us to study the differences in the evolution of X and Y chromosomes. This work was supported by Czech Science Foundation (P501/12/2220, 204/09/H002 and 522/09/0083) The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 118 Posters Novel regulators in intracellular trafficking of auxin transporters identified by forward genetics screen in Arabidopsis 50 Mike Karampelias*, Lukasz Langowski and Jiri Friml Plant Systems Biology – VIB, Gent University, Belgium The plant hormone auxin contributes to coordination of tissue and organ development including tissue and cell polarization. Local auxin maxima are achieved by directional auxin flow through tissues that is mediated by efflux and influx carriers polarly localized on the plasma membrane of transporting cells. Dynamic cellular polarity of PIN auxin efflux carriers determines directionality of auxin transport and thus is of great developmental importance. Subcellular polar delivery of PINs is assured by constitutive endocytic recycling from and to the plasma membrane. Treatments with the trafficking inhibitor Brefeldin A (BFA) block the endosomal recycling to the plasma membrane and in a short time, leads to the formation of intracellular membrane structures, called “BFA bodies”. In order to identify novel components of the mechanism involved in subcellular trafficking and asymmetric distribution of PIN proteins, we performed forward genetic screen on EMS mutagenised PIN1-GFP population of Arabidopsis. By differential time and dose treatments with BFA, we identified mutants exhibiting alternative response to BFA in terms of endocytosis or exocytosis of PIN1 as well as its trafficking between other cellular compartments. Here we present partial characterization of selected mutants affected in BFA-sensitive PIN trafficking. The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 119 List of Participants Aliyeva Lala Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research, Gatersleben [email protected] Poster No. 29 Aranyi Nikolett University of Pannonia, Keszthely, Hungary [email protected] Poster No. 19 Balarinová Kateřina Masaryk University, Brno KBalarinova@seznam Poster No. 12 Baloun Jiří Masaryk University, Brno [email protected] Poster No. 22 Brankiewicz Wioletta Maria Curie - Skłodowska University, Lublin [email protected] Talk No. 15 Brzobohatý Jiří Sigma Aldrich, spol. s r. o. [email protected] Sponsor talk Cejnar Pavel Crop Research Institute, Czech University of Life Sciences, Prague [email protected] Poster No. 35 Cviková Kateřina Institute of Experimental Botany, ASCR, Olomouc [email protected] Poster No. 27 Čechová Jana Faculty of Horticulture, Mendel University in Brno [email protected] Poster No. 23 Dobroviczká Terézia Constantine the Philosopher University in Nitra [email protected] Poster No. 5 Dzuganova Monika GATC Biotech [email protected] Sponsor talk Felcmanová Kristina University of South Bohemia, České Budějovice [email protected] Talk No. 22 Finke Andreas Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research, Gatersleben [email protected] Talk No. 9 Fridrichová Lenka Charles University in Prague [email protected] Poster No. 3 Gacek Paulina Jagiellonian University, Cracow [email protected] Poster No. 43 Gallova Lucia Palacký University, Olomouc [email protected] Poster No. 37 Ge Eva Institute of Experimental Botany AS CR, Prague [email protected] Poster No. 40 Hasíková Tereza University of Ostrava [email protected] Talk No. 26 Havránková Miroslava Institut of Experimental Botany AS CR, Olomouc [email protected] Poster No. 30 Hisem Daniel University of South Bohemia, České Budějovice [email protected] Poster No. 1 Horváth Edit University of Szeged [email protected] Poster No. 13 Hudzieczek Vojtěch Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Poster No. 4 Chmelík Dominik Masaryk University, Brno [email protected] Poster No. 6 Chramiec-Głąbik Andrzej Jagiellonian University, Cracow [email protected] Poster No. 38 Imoto Yuuta University of Tokyo [email protected] Talk No. 7 Janda Martin Institute of Chemical Technology, Prague [email protected] Talk No. 11 Jankowska Maja Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research, Gatersleben [email protected] Poster No. 26 Jarešová Jana Institut of Microbiology, Třeboň [email protected] Talk No. 10 Jeřábková Hana Institute of Experimental Botany, ASCR, Olomouc [email protected] Poster No. 10 Ježilová Eliška Palacký University, Olomouc [email protected] Talk No. 23 Kabáthová Eva Masaryk University, Brno [email protected] Poster No. 20 Kalendar Ruslan University of Helsinki [email protected] Invited talk Karampelias Mike PSB, VIB - University Gent [email protected] Poster No. 50 Klásková Jana Institut of Experimental Botany AS CR, Olomouc [email protected] Talk No. 20 Klemme Sonja Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research, Gatersleben [email protected] Talk No. 25 The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 120 Active Participants Klocová Barbora Institute of Experimental Botany, ASCR, Olomouc [email protected] Poster No. 32 Korovetska Halyna Masaryk University, Brno [email protected] Talk No. 24 Kovács Judit Dept. of Plant Biology, University of Szeged [email protected] Poster No. 15 Kováčová Viera Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Poster No. 41 Králová Tereza Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Poster No. 49 Kubínová Zuzana Charles University in Prague [email protected] Poster No. 14 Kučerová Danica Institute of Chemistry, Slovak Academy of Sciences, Bratislava [email protected] Talk No. 17 Kudělková Martina Mendel University in Brno martina.kudelkova @mendelu.cz Talk No. 12 Kułak Karolina Institute of Bioorganic Chemistry, Polish Academy of Sciences, Poznań [email protected] Poster No. 7 Le Thanh Loan Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research, Gatersleben [email protected] Poster No. 47 Lukeszová Ludmila Bio-Consult Laboratories, spol. s r. o. [email protected] Sponsor talk Majerová Eva Masaryk University, Brno [email protected] Talk No. 4 Maršálová Lucie Institute of Chemical Technology, Prague [email protected] Talk No. 21 Mátyás Kinga Klára University of Pannonia, Keszthely, Hungary [email protected] Poster No. 46 Medveďová Zuzana CEITEC - Central European Institute of Technology, Brno [email protected] Poster No. 8 Migdałek Grzegorz Jagiellonian University, Cracow [email protected] Talk No. 27 Michalovová Monika Faculty of Informatics Masaryk University, Brno michalovova.monika @gmail.com Poster No. 48 Mittelsten Scheid Ortrun Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology, Vienna ortrun.mittelsten_scheid@gmi. Invited talk oeaw.ac.at Mizia Patryk Jagiellonian University, Cracow [email protected] Poster No. 39 Mursalimov Sergey Institute of cytology and genetics, RAS, Novosibirsk [email protected] Talk No. 3 Musilová Milena Mendel University in Brno [email protected] Poster No. 25 Najdekrová Lucie Masaryk University, Brno [email protected] Talk No. 8 Nováková Lucie M.G.P. spol. s r.o. [email protected] Sponsor talk Ondroušková Jana Mendel University in Brno [email protected] Poster No. 28 Opatrný Zdeněk Charles University in Prague [email protected] Invited talk Paseka Peter University of South Bohemia, České Budějovice [email protected] Poster No. 9 Petrýdesová Jana Botanický ústav SAV, Bratislava [email protected] Poster No. 44 Piknová Katarína Comenius University in Bratislava [email protected] Poster No. 45 Ponert Jan Charles University in Prague [email protected] Poster No. 17 Pouch Milan CEITEC - Central European Institute of Technology, Brno [email protected] Poster No. 24 Rozmoš Martin Masaryk University, Brno [email protected] Talk No. 18 Selinger Martin Faculty of Science, University of South Bohemia, České Budějovice [email protected] Poster No. 33 Schubert Ingo Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research, Gatersleben [email protected] Invited talk The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 121 List of Participants - Active Participants Ślązak Błażej Jagiellonian University, Cracow [email protected] Poster No. 2 Ševčíková Hana Charles University in Prague [email protected] Poster No. 16 Šigut Ladislav Global Change Research Centre ASCR, Brno [email protected] Talk No. 19 Šlancarová Veronika Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Poster No. 42 Šteflová Pavlína Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Poster No. 21 Tichý Josef University of South Bohemia, České Budějovice [email protected] Poster No. 11 Tomaštíková Eva Institute of Experimental Botany, ASCR, Olomouc [email protected] Talk No. 16 Tran Trung Duc Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research, Gatersleben [email protected] Poster No. 36 Trojan Václav Mendel University in Brno [email protected] Poster No. 25 Týcová Anna Biology Centre of the ASCR, České Budějovice [email protected] Poster No. 34 Uhlířová Radka Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology, Vienna radka.uhlirova @gmi.oeaw.ac.at Talk No. 1 Vatehová Zuzana Institute of Chemistry, Slovak Academy of Sciences, Bratislava [email protected] Talk No. 13 Vogel Ivan Faculty of Information Technology, University of Technology, Brno [email protected] Poster No. 31 Watson Michael The University of Leeds [email protected] Talk No. 5 Żabicki Piotr Jagiellonian University, Cracow [email protected] Poster No. 18 Zástěra Jan Genomac International, Ltd. [email protected] Sponsor talk Zavřel Tomáš Global Change Research Centre ASCR, Brno [email protected] Talk No. 14 Zbránková Veronika University of Ostrava [email protected] Talk No. 2 Zedek František Masaryk University, Brno [email protected] Talk No. 6 Žižková Eva Institute of Experimental Botany ASCR, Prague [email protected] Talk No. 28 The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 122 List of Participants - Passive participants Albrechtová Jana Charles University in Prague [email protected] Barták Miloš Masaryk University, Brno [email protected] Bartoš Michael University of South Bohemia, České Budějovice [email protected] Blavet Nicolas Institute of Experimental Botany, ASCR, Olomouc [email protected] Burger Anna University of Vienna [email protected] Čegan Radim Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Dębski Paweł Maria Curie - Skłodowska University, Lublin [email protected] Fulneček Jaroslav Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Havel Ladislav Mendel University in Brno [email protected] Hobza Roman Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Ištvánek Jan Masaryk University, Brno [email protected] Kejnovský Eduard Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Kovařík Aleš Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Kubát Zdeněk Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Lízal Pavel Masaryk University, Brno [email protected] Nedbalová Ivana Photon Systems Instruments, spol. s r.o. [email protected] Nevrtalová Eva Mendel University in Brno [email protected] Ortmannová Jitka Charles University in Prague [email protected] Pidra Miroslav Mendel University in Brno [email protected] Růžičková Martina Charles University in Prague [email protected] Řepková Jana Masaryk University, Brno [email protected] Sabol Peter Charles University in Prague [email protected] Sekereš Juraj Charles University in Prague [email protected] Soukupová Magda Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Sýkorová Eva Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Šantrůček Jiří University of South Bohemia, České Budějovice [email protected] Široký Jiří Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Vukašinović Nemanja Charles University in Prague [email protected] Vyskot Boris Institute of Biophysics, ASCR, Brno [email protected] Zrůstová Jana EPPENDORF Czech & Slovakia s.r.o. [email protected] The 10th International Ph.D. Student Conference on Experimental Plant Biology 123 124 125 126 127 128 129 Notes 130 Notes 131 Notes 132