C - Základy biochemie
Transkript
Základy biochemie KBC / BCH Metabolismus lipidů Inovace studia biochemie prostřednictvím e-learningu CZ.04.1.03/3.2.15.3/0407 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. Lipidy a buněčné membrány • LIPIDY – jsou ve vodě nerozpustné biomolekuly, dobře rozpustné v organických rozpouštědlech (např. chloroform). • Buňky jsou ohraničeny biologickými membránami, které oddělují obsah buněk od vnějšího okolí. • Biologické membrány se vyznačují polopropustností (semipermeabilita). Na membránách se uskutečňují transportní pochody. • Membrány jsou dynamické struktury ve kterých se pohybují proteiny v moři lipidů. • U eukaryot existují vnější (plasmatické) a vnitřní buněčné membrány, které tvoří hranice organel jako jsou mitochondrie, chloroplasty, peroxisomy a lysosomy. • Dalšími funkcemi biologických membrán nutnými pro život jsou skladování energie a přenos informací. Vlastnosti biologických membrán • 1. Membrány tvoří vrstvené struktury o síle dvou molekul. Tloušťka membrán je mezi 6 nm až 10 nm. • 2. Membrány obsahují hlavně lipidy a proteiny v poměru od 1 : 4 až 4 : 1. • 3. Membránové lipidy jsou malé molekuly s částmi hydrofilními a hydrofobními. Vytváří lipidové dvojvrstvy. • 4. Specifické proteiny zprostředkovávají různé funkce membrán. Proteiny slouží jako pumpy, kanály, receptory, přenašeče energie a enzymy. • 5. Membrány jsou nekovalentní seskupení. • 6. Membrány jsou asymetrické. Dvě strany biologické membrány se od sebe liší. • 7. Membrány vytváří fluidní mozaiku. • 8. Většina membrán je elektricky polarizována. Řez plasmatickou membránou erythrocytu Mastné kyseliny – nositelky hydrofobních vlastností O C Palmitát O - - (ionizovaná forma kyseliny palmitové) O C Oleát (ionizovaná forma kyseliny olejové) O - - Názvosloví mastných kyselin • Nasycená mastná kyselina s 18 atomy C (C18) se nazývá oktadekanová (podle uhlovodíku oktadekanu), s dvojnou vazbou pak oktadekenová a se dvěma dvojnými vazbami oktadekadienová kyselina. • Záznam 18 : 0 značí mastnou kyselinu C18 bez dvojné vazby. Záznam 18 : 2 znamená, že kyselina obsahuje dvě dvojné vazby. • Uhlíky mastné kyseliny se číslují od karboxylu, atomy 2 a 3 se také označují α a β. Koncový methyl se označuje ω-uhlíkový atom. • Poloha dvojné vazby se označuje symbolem Δ a číslem v exponentu. Tak např. cis- Δ9 značí polohu dvojné vazby mezi uhlíky 9 a 10. • Dvojné vazby je také možné označovat od ω-uhlíkového atomu (má číslo 1). Např. ω- 3 mastná kyselina má dvojnou vazbu na třetím uhlíku od konce. Značení uhlíkových atomů mastných kyselin O β H3C ω H2 C 3 C H2 n 2 C H2 α C 1 - O - Některé přírodní živočišné mastné kyseliny Počet C Počet dvojných vazeb Název • • • • • • • • • • • • Laurová Myristová Palmitová Stearová Arachidová Behenová Lignocerová Palmitolejová Olejová Linoleová Linolenová Arachidonová 12 14 16 18 20 22 24 16 18 18 18 20 0 0 0 0 0 0 0 1 1 2 3 4 Systematický názeb n-dodekanová n-tetradekanová n-hexadekanová n-oktadekanová n-eikosanová n-dokosanová n-tetrakosanová cis-Δ9-hexadecenová cis-Δ9- oktadecenová cis, cis-Δ9, Δ12-oktadekadienová all-cis-Δ9, Δ12, Δ15-oktadekatrienová all-cis-Δ5, Δ8, Δ11, Δ14-eikosatetraenová Tři typy membránových lipidů: • Fosfolipidy • Glykolipidy • Cholesterol • Fosfolipidy sestávají ze čtyř složek: mastné kyseliny, glycerol – základ na který se váží mastné kyseliny, fosfát a na něj vázaný alkohol. Kromě glycerolu se jako základ může uplatňovat alkohol sfingosin. • Fosfolipidy odvozené od glycerolu se nazývají fosfoglyceridy. • Fosfoglyceridy obsahují glycerol na který jsou vázány dvě mastné kyseliny a fosforylovaný alkohol. Fosfatidová kyselina R1 Acylové skupiny mastných kyselin R2 O 1 CH2 C O O C O Fosfatidát 2 C H 3 H2C (diacylglycerol-3-fosfát) O 2- P O + O O Schematická struktura fosfolipidu Mastná kyselina Mastná kyselina G l y c e r o l Fosfát Alkohol Alkoholy, které se váží esterovou vazbou na fosfatidát: - OOC HO C H2 H C HO + NH3 Serin C H2 H2 C HO + NH3 C H2 Ethanolamin HO C H2 H C C H2 Glycerol OH H H OH H H Inositol + CH3 H OH OH HO HO N Cholin H HO H2 C OH CH3 CH3 Fosfatidylserin – příklad fosfolipidu R1 R2 O C O C O O CH2 O C H H2C O P - COO H O + - O Fosfatidylserin CH2 C NH3 + Struktura sfingosinu a sfingomyelinu. H3N + C C HO Sfingosin H H O C R1 NH H CH3(H2C)12 C C HO H C H2 O P O + O -O Sfingomyelin C H2 H2 C N + CH3 CH3 CH3 C H2 OH Glykolipidy - sacharidy obsahující lipidy • Glykolipidy jsou odvozeny od sfingosinu, jehož aminoskupina je acylována jako ve sfingomyelinu mastnou kyselinou. Na rozdíl od sfingomyelinu je na hydroxylu sfingosinu vázán sacharid. O Mastná kyselina Cukerná jednotka C R1 NH H CH3(H2C)12 O HO H Cerebrosid (glykolipid) Glukosa nebo galaktosa Cholesterol • Cholesterol je lipid na bázi steroidního skeletu – steranu. • V membránách je cholesterol orientován rovnoběžně se řetězci mastných kyselin. Je až 25 % součástí membránových lipidů nervových buněk, ale je nepřítomen v intracelulárních membránách. Cholesterol neobsahují prokaryotní membrány. H3C CH3 CH3 CH3 CH3 HO Cholesterol Metabolismus mastných kyselin • Úloha mastných kyselin: • 1. Součást biologických membrán – fosfolipidy a glykolipidy. • 2. Mnohé proteiny jsou modifikovány kovalentní vazbou s mastnými kyselinami a tímto způsobem jsou lokalizovány v membránách. • 3. Mastné kyseliny jsou zásobárnou energie. Obvykle jsou skladovány jako triacylglyceroly (nebo také neutrální mastné kyseliny, triglyceridy). Triacylglyceroly • Triacylglyceroly skladují velké množství metabolické energie, protože jsou bezvodé a redukované. • Kompletní oxidací jednoho gramu mastné kyseliny se získá 38 kJ energie, zatím co z 1 g sacharidů nebo proteinů pouze 17 kJ. • Triacylglyceroly jsou výhodně skladovatelnou energií. Jeden gram tuku skladuje 6 x více energie než 1 g hydratovaného glykogenu. • Typický 70 kg vážící muž má energetickou rezervu 420 000 kJ ve formě triacylglycerolu, 10 000 kJ v proteinech (svaly), 2 500 kJ v glykogenu a 170 kJ v glukose. • Celková hmotnost triacylglycerolů je 11 kg. Pokud by se takové množství energie skladovalo v glykogenu, byla by tělesná hmotnost 55 x vyšší. • Zásoby glykogenu a glukosy vystačí zásobovat organismus energií jeden den. Triacylglyceroly týdny. • U savců je hlavním místem akumulace triacylglycerolů cytoplasma adiposních buněk (tukových buněk). Triacylglyceroly z potravy. • Triacylglyceroly ze střevní sliznice jsou z důvodu nerozpustnosti převáděny na micely za účasti žlučových kyselin. Žlučové kyseliny jsou amfipatické (obsahují polární i nepolární části), jsou syntetizovány v játrech a uvolňovány ze žlučníku. • Žlučové kyseliny obalí triacylglyceroly a usnadní tak funkci hydrolytickým lipasam. Např. glykocholát. O OH H H CH3 H CH3 HO H3C H OH Glykocholát N H COO - Hydrolytické štěpení triacylglycerolu pankreatickými lipasami O R2 H2C O O O Triacylglycerol O Lipasa O O C H H2C R1 R3 R2 - O O C H CH2OH O H2O H2C O R3 Diacylglycerol R1 O O Lipasa R2 - O O C H CH2OH O H2O CH2OH R1 Monoacylglycerol Resyntéza triacylglycerolů ve sliznici střeva • • • • • • Resyntetizované triacylglyceroly jsou sbaleny do lipoproteinových transportních částic – chylomikronů, které přes lymfu vstupují do krve. Chylomikrony se váží na na membránách (přednostně adiposní tkáně a svalstva) vázané lipoproteinové lipasy, kde jsou triacylglyceroly opět hydrolyzovány na mastné kyseliny a monoacylglycerol, aby je bylo možné transportovat do tkání. Periferní tkáně využívají energii lipidů skladovaných v adiposní tkáni ve třech stupních: 1. Mobilizace lipidů – hydrolýza na mastné kyseliny a glycerol, které jsou transportovány do potřebných tkání. 2. Aktivace mastných kyselin a jejich transport do matrix mitochondrií. 3. Odbourávání mastných kyselin na acetyl CoA, který vstupuje do cyklu trikarboxylových kyselin. Tvorba chylomikronů LUMEN SVALOVÁ BUŇKA Triacylglyceroly Další lipidy a proteiny H2O Lipasy Chylomikrony Mastné kyseliny + Monoacylglyceroly Triacylglyceroly Do lymfatického systému Hormonální regulace hydrolýzy triacylglycerolů Lipasy adiposních buněk jsou aktivovány adrenalinem, (nor…), glukagonem a ACTH. Insulin inhibuje. Hormon + Adenylátcyklasa GT P Volné mastné kyseliny 7TM receptor Glycerol ATP cAMP Proteinkinasa Další lipasy Proteinkinasa Diacylglycerol Triacylglycerollipasa Triacylglycerollipasa P Triacylglycerol Lipolýzou uvolněné mastné kyseliny se váží na sérový albumin, který slouží jako jejich nosič do tkání. Glycerol se absorbuje v játrech. O - O R2 H2C O O O O C H H2C O Triacylglycerol O R1 Lipasa R3 3 H2O 3 H+ R1 CH2OH HO C H CH2OH O + - O R2 O Glycerol - O R3 Mastné kyseliny Glycerol se přeměňuje na meziprodukty glykolýzy CH2OH HO C H CH2OH Glycerol Glycerolkinasa ATP ADP CH2OH HO C Glycerol-3-fosfátdehydrogenasa H 2- CH2O PO3 L-Glycerol-3-fosfát NAD+ NADH + H+ H CH2OH O Triosafosfátisomerasa C 2- CH2O PO3 Dihydroxyacetonfosfát H C C O OH 2- CH2O PO3 D-Glyceraldehyd-3-fosfát Aktivace mastných kyselin. Na vnější membráně mitochondrie jsou mastné kyseliny aktivovány za katalýzy acyl CoAsynthetasy (také thiokinasa mastných kyselin): O O - + ATP O R CoA + Acyladenylát O O + R PPi AMP R Mastná kyselina + AMP Acyladenylát HS CoA R S Acyl-CoA AMP Vstup mastných kyselin do matrix. Tvorba acylkarnitinu – karnitinacyltransferasa I. Na vnitřní straně mitochondriální membrány se za katalýzy karnitinacyltransferasy II přenáší acyl na CoA SH. R O H3C O R S CoA Acyl-CoA + H3C N HO + H O H3C - O H3C Karnitin H3C N O + H O - O H3C Karnitin + HS CoA Aktivovaná mastná kyselina je přenášena do matrix vázána na karnitin přes translokasu. Acyl-CoA CoA Karnitin Acylkarnitin Cytosol Translokasa Matrix Karnitin Acyl-CoA Acylkarnitin CoA Odbourávání nasycených acyl CoA – β – oxidace. 1. Acyl CoAdehydrogenasa (FAD) – tvorba trans-Δ2-enoyl CoA. R C H2 H2 C O C H2 C S CoA Acyl-CoA FAD OXIDACE FADH2 R C H2 H C O C H C S Trans-Δ2-Enoyl-CoA CoA 2. Enoyl CoAhydratasa R C H2 O H C C C H S CoA Trans-Δ2-Enoyl-CoA H2O HO R C H2 HYDRATACE O H C C C H S H L-3-Hydroxyacyl-CoA CoA 3. L-3-Hydroxyacyl CoAdehydrogenasa HO R C H2 O H C C C S CoA H H L-3-Hydroxyacyl-CoA NAD+ OXIDACE H+ + NADH R C H2 O O C C C H S H 3-Ketoacyl-CoA CoA 4. β-Ketothiolasa R C H2 O O C C C H H 3-Ketoacyl-CoA CoA HS S CoA THIOLÝZA O O R C H2 C S CoA + Acyl-CoA (zkrácený o 2 uhlíkové atomy) H C C H S H Acetyl-CoA CoA Výtěžek kompletní oxidace palmitátu: • Palmitoyl CoA + 7 FAD + 7 NAD+ + 7 CoA + 7 H2O → → 8 acetyl CoA + 7 FADH + 7 NADH + 7 H+ 2 V dýchacím řetězci se získá z jednoho NADH asi 2, 5 ATP a z jednoho FADH2 asi 1, 5 ATP. Sečteno: 7 x FADH2 = 10, 5 ATP 7 x NADH = 17, 5 ATP Oxidace 8 acetyl CoA v citrátovém cyklu = 80 ATP Součet : 108 ATP Spotřeba na aktivaci mastné kyseliny: 2 ATP Konečný součet : 106 ATP Odbourávání nenasycených mastných kyselin. Cis izomer je převeden na trans isomerasou. H H H3C C (CH2)4 C H H C H2 O C C C H2 C S CoA Cis-Δ3-Enoyl-CoA-isomerasa H3C (CH2)4 C H H2 C C H O H C H2 C C H C S CoA Další dvojná vazba mezi uhlíky 4 a 5 je odstraněna redukcí: O H H3C (CH2)4 C C C H H 5 4 C C S CoA H 3 2 1 2,4-Dienoyl-CoA H+ + NADPH 2,4-Dienoyl-CoA-reduktasa NADP+ H3C (CH2)4 H2 C 5 O H C H 4 C 3 C H2 2 C 1 Trans-Δ3-Enoyl-CoA S CoA Odbourávání mastných kyselin s lichým počtem uhlíků vede k sukcinyl CoA. Převedení L-methylmalonyl CoA na sukcinyl CoA probíhá za účasti enzymu mathylmalonyl CoA mutasy jehož koenzymem je derivát vitaminu B12 – kobalamin. O H3C C H2 C S Propionyl-CoA - CoA ATP + HCO3- O ADP + Pi O O C C H3C C O O S CoA H D-Methylmalonyl-CoA - O C H3C C C S CoA H L-Methylmalonyl-CoA O - C O H2 C O C H2 C Sukcinyl-CoA S CoA Odbourávání mastných kyselin na peroxisomech • Peroxisomy obsahují velké množství enzymu katalasy, který katalyzuje dismutaci peroxidu vodíku na vodu a kyslík !!! • Na peroxisomech se mastné kyseliny jen zkracují na délku oktanoyl CoA, který je posléze snadněji odbouráván v matrix mitochondrií β-oxidací. V prvním stupni peroxisomální oxidace mastných kyselin katalyzuje flavoproteinová dehydrogenasa, která přenáší elektrony na kyslík za tvorby peroxidu vodíku (Rozdíl od β-oxidace). H3C C H2 H2 C O C H2 C S CoA H3C C H2 H C O C H C S Acyl-CoA-dehydrogenasa Acyl-CoA-dehydrogenasa (ox, FAD) (red, FADH2) O2 H2O2 Katalasa H2O + 1/2 O2 CoA Další oxidace Tvorba a funkce ketolátek • Vstup acetyl CoA do citrátového cyklu závisí na dostupnosti oxaloacetátu. Při nedostatku sacharidů se hladina oxaloacetátu snižuje a tím zpomaluje citrátový cyklus. Oxaloacetát se získává karboxylací pyruvátu. • Známá biochemický bonmot: TUKY HOŘÍ V OHNI SACHARIDů. • Při hladovění nebo diabetu je oxaloacetát spotřebováván na tvorbu glukosy. • Za této situace se dva acetyl CoA kondenzují za tvorby acetoacetyl CoA. Ten reaguje s dalším acetyl CoA za tvorby 3hydroxy-3-methylglutaryl CoA (HMG – CoA) a CoA. HMG-CoA se posléze štěpí na acetyl CoA a acetoacetát. • Hlavním místem tvorby ketolátek jsou jaterní mitochondrie. Role acetoacetátu • Srdeční sval a kůra ledvin preferují acetoacetát před glukosou. • Taktéž mozek se za hladovění adaptuje na acetoacetát. Při dlouhodobém hladovění je až 75 % energie mozku z acetoacetátu !!! • Acetoacetát má regulační roli. Vysoká hladina acetoacetátu v krvi je signálem přítomnosti vysokého množství acetyl CoA což vede k poklesu lipolýzy v adiposních tkáních. • Ketolátky jsou ve vodě rozpustnou transportní formou acetylů. 3-Ketothiolasa – tvorba acetoacetyl CoA O H3C C O S Acetyl-CoA CoA + H3C C S Acetyl-CoA CoA 1 H3C CoA O O C C C H2 S Acetoacetyl-CoA CoA Hydroxymethylglutaryl CoAsynthasa H3C O O C C C H2 O S Acetoacetyl-CoA CoA + H3C C S Acetyl-CoA O 2 CoA - O H2O CoA C HO C H2 CH3 C C H2 O C S CoA 3-Hydroxy-3-methylglutaryl-CoA Hydroxymethylglutaryl CoA štěpící enzym O - O C HO C H2 CH3 C C H2 O C S 3 CoA - O O 3-Hydroxy-3-methylglutaryl-CoA H3C C O O C C C H2 Acetoacetát S CoA CH3 D-3-Hydroxybutyrátdehydrogenasa. Acetoacetát spontánně dekarboxyluje na aceton. O - O C O C H2 C Acetoacetát O 4 - CH3 O H+ + NADH NAD+ C H C H2 OH C CH3 D-3-Hydroxybutyrát O H3C CO2 C Aceton CH3 Acetoacetát je aktivován přenosem CoA ze sukcinyl CoA a posléze štěpen specifickou thiolasou na dva acetyl CoA. V játrech transferasa není ! Acetoacetát Sukcinyl-CoA CoA-transferasa Sukcinát Acetoacetyl-CoA CoA Thiolasa 2 Acetyl-CoA Živočichové nedokáží převést mastné kyseliny na glukosu !!! • Proč ? • Acetyl-CoA nemůže být převeden na pyruvát nebo oxaloacetát, neboť vstupuje do citrátového cyklu a oba uhlíky se v jeho průběhu odštěpí jako CO2. • Rostliny mají další dva enzymy v tzv. glyoxylátovém cyklu a jsou schopné převést acetyl CoA na oxaloacetát. Rozdíly mezi odbouráváním a syntézou mastných kyselin. • 1. Syntéza mastných kyselin probíhá v cytoplasmě, odbourávání v matrix mitochondrií. • 2. Meziprodukty syntézy mastných kyselin jsou kovalentně vázány na sulfhydrylové skupiny ACP (acyl carrier protein), kdežto meziprodukty degradace jsou vázány na SH skupinu CoA. • 3. Enzymy syntézy mastných kyselin vyšších organismů jsou spojeny do polypeptidového řetězce zvaného synthasa mastných kyselin. Enzymy degradace jsou v matrix volně. • 4. Řetězec mastných kyselin se prodlužuje o dva uhlíky z acetyl CoA. Aktivovaným donorem dvou uhlíků je malonyl CoA a prodlužování řetězce je poháněno odštěpováním CO2. • 5. Redukčním činidlem při syntéze je NADPH, oxidačními činidly při degradaci jsou FAD a NAD+. • 6. Prodlužování řetězce na synthase mastných kyselin končí tvorbou palmitátu (C16). Další prodlužování řetězce a tvorba nenasycených kyselin probíhá na jiných enzymech. Klíčovým krokem syntézy mastných kyselin je tvorba malonyl CoA. Acetyl CoA + ATP + HCO3- → malonyl CoA + ADP + Pi + H+ • Katalyzuje acetyl CoA karboxylasa (obsahuje biotin). • Reakce probíhá ve dvou stupních: Biotin–enzym + ATP + HCO3- → CO2-biotin-enzym +ADP + Pi CO2-biotin-enzym + acetyl CoA → malonyl CoA + biotin-enzym • Acetyl CoA karboxylasa je regulačním enzymem metabolismu mastných kyselin. ACP – fosfopanteteinové raménko, na kterém jsou vázány meziprodukty syntézy mastných kyselin. Fosfopantetheinové raménko ACP (proteinový nosič) Koenzym A Jednotlivé kroky syntézy mastných kyselin. • 1. Syntéza malonyl CoA: acetyl CoAkarboxylasa • 2. Navázání acetyl CoA na ACP: acetyltransacylasa • 3. Navázání malonyl CoA na ACP: malonyltransacylasa • 4. Kondenzační reakce: acylmalonyl ACP kondenzační enzym Acetyl ACP + malonyl ACP → acetoacetyl ACP + ACP + CO2 • 5. První redukce: β-ketoacyl ACP reduktasa Acetoacetyl ACP + NADPH + H+ → D-3-hydroxybutyryl ACP + NADP+ • 6. Dehydratace: 3-hydroxyacyldehydratasa D-3-Hydroxybutyryl ACP → krotonyl ACP + H2O • 7. Druhá redukce: enoyl ACP reduktasa Krotonyl ACP + NADPH + H+ → butyryl ACP + NADP+ Kondenzace - zjednodušeně O H3C C S Acetyl-ACP ACP + - O O O C C C H2 KONDENZACE S Malonyl-ACP ACP H3C ACP + CO2 O O C C C H2 S Acetoacetyl-ACP ACP Elongace řetězce je zahájena spojením acetylu za účasti kondenzačního enzymu CE. O H3C C S Acetyl-CE CE + - O O O C C C H2 KONDENZACE S Malonyl-ACP ACP H3C CE + CO2 O O C C C H2 S Acetoacetyl-ACP ACP První redukce H3C O O C C C H2 S Acetoacetyl-ACP ACP REDUKCE H+ + NADPH HO H3C NADP+ O H C C H2 C S ACP D-3-Hydroxybutyryl-ACP Dehydratace HO H3C O H C C H2 C DEHYDRATACE S ACP D-3-Hydroxybutyryl-ACP H3C H2O O H C C C S H Krotonyl-ACP ACP Druhá redukce O H H3C C C C S H Krotonyl-ACP ACP REDUKCE H+ + NADPH H3C NADP+ H2 C O C H2 C S Butyryl-ACP ACP Další postup syntézy mastných kyselin • V dalším kole syntézy se kondenzuje malonyl – ACP s butyryl ACP za tvorby C6-β-ketoacyl ACP. Poté následuje první redukce, dehydratace a druhá redukce za tvorby C6 – acyl ACP. • Prodlužování řetězce se opakuje až do délky C16 – palmitát. • Thioesterasa je enzym, který odštěpuje palmitát z ACP a tak je syntéza ukončena. Savčí synthasa mastných kyselin. • Savčí synthasa mastných kyselin se liší od synthasy z E. coli. Savčí je homodimer 260 kDa podjednotek. • Každá z podjednotek má tři domény spojené pohyblivými regiony. • Doména 1 – vstup substrátu a kondenzační jednotka obsahuje obě transferasy a β-ketoacylsynthasu (kondenzační enzym). • Doména 2 – redukční jednotka – obsahuje β-ketoacylreduktasu, dehydratasu a enoylreduktasu. • Doména 3 – obsahuje thioesterasu odštěpující palmitát. ACP, Savčí synthasa mastných kyselin Doména 1 (modrá) AT-acetyltransferasa, MT-malonyltransferasa, CEkondenzační enzym. Doména 2 (žlutá) ACP, β-ketoacylreduktasa (KR), dehydratasa (DH), enoylreduktasa (ER). Doména 3 (červená) thioesterasa (TE). Flexibilní raménka (zelená). AT MT DH ER KR ACP TE CE Cys SH SH TRANSLOKACE HS SH Cys REDUKCE TE ACP KR ER KONDENZACE DH MT Uvolnění palmitátu CE Vstup substrátu AT Synthasa mastných kyselin funguje jako dimer. Ke kondenzaci dochází mezi malonylem zavěšeným na jedné podjednotce ACP a acetylem na SH kondenzačního enzymu druhé podjednotky. CE ACP CE SH S C ACP SH HS O O H3C H2C S ACP C C O CH3 KONDENZACE - O SH CE H2C CO2 S ACP C C O O SH CE Obě redukce a dehydratace na fosfopantheteinovém raménku ACP. CE ACP CE SH HS CH3 H2C S ACP C C O ACP SH HS CH3 REDUKCE H2C O SH CE S ACP C CH2 O SH CE Translokací se přenese řetězec z ACP na SH skupinu kondenzačního enzymu stejné podjednotky. CE ACP CE SH HS CH3 H2C S ACP C SH HS CH3 TRANSLOKACE H2C CH2 O SH CE ACP SH ACP O CH2 C S CE Další malonyl se naváže na raménko ACP druhé podjednotky. Probíhá druhá kondenzace na protilehlou podjednotku dimeru. CE ACP CE SH HS S HS SH ACP O C O CH3 H2C ACP CH3 H2C CH2 C Malonyl-CoA S CE CoA SH ACP O CH2 O CH2 C - S CE C O Stechiometrie syntézy palmitátu • Stechiometrie syntézy palmitátu: Acetyl CoA + 7 malonyl CoA + 14 NADPH + 20 H+ → → palmitát + 7 CO2 + 14 NADP+ + 8 CoA + 6 H2O • Stechiometrie syntézy malonyl CoA: 7 Acetyl CoA + 7 CO2 + 7 ATP → 7 malonyl CoA + 7 ADP + 7 Pi + 14 H+ • Celkově: 8 Acetyl CoA + 7 ATP + 14 NADPH + 6 H+ → → palmitát + 14 NADP+ + 8 CoA + 6 H2O + 7 ADP + 7 Pi Citrát jako nositel acetylů z matrix mitochondrie do cytosolu • K syntéze palmitátu je třeba: 8 acetyl CoA, 14 NADPH a 7 ATP (8 NADPH se získá transportem citrátu do cytoplasmy a zbylých 6 v pentosafosfátové dráze). • Acetyl CoA je v matrix a vnitřní mitochondrální membrána acetyl CoA nepropouští !! • Při vysokých hladinách citrátu je transportován do cytosolu, kde je štěpen ATP citrátlyasou. Citrát + ATP + CoA + H2O → acetyl CoA + ADP + Pi + oxaloacetát • Do cytosolu tak vstupuje spolu s acetyl CoA oxaloacetát. Transfer acetylCoA do cytosolu: MITOCHONDRIE Acetyl-CoA Citrát CYTOSOL Citrát Acetyl-CoA Oxaloacetát NADH Oxaloacetát Malát Pyruvát Pyruvát NADPH Zdroje NADPH pro syntézu mastných kyselin • • Oxaloacetát vytvořený při transportu citrátu do cytosolu by se měl vrátit do matrix. Vnitřní mitochondriální membrána je pro oxaloacetát nepropustná. Oxaloacetát je redukován za účasti NADH na malát cytosolovou malátdehydrogenasou: Oxaloacetát + NADH + H+ → malát + NAD+ • Malát je oxidačně dekarboxylován NADP+-malátovým enzymem (také jablečný enzym): Malát + NADP+ → pyruvát + CO2 + NADPH • Konečně pyruvát vstupuje do mitochondrie, kde je karboxylován pyruvátkarboxylasou: Pyruvát + CO2 + ATP + H2O → oxaloacetát + ADP + Pi + 2 H+ • Sumární rovnice: NADP+ + NADH + ATP + H2O → NADPH + NAD+ + ADP + Pi + H+ Regulace metabolismu mastných kyselin • Syntéza mastných kyselin probíhá za situace, kdy je dostatek sacharidů a energie a nedostatek mastných kyselin. • Ústřední klíčovou roli hraje acetyl CoA karboxylasa. • Karboxylasa je pod kontrolou adrenalinu, glukagonu a insulinu. • Insulin stimuluje syntézu mastných kyselin aktivací karboxylasy, glukagon a adrenalin mají opačný účinek. • Citrát, znak dostatku stavebních jednotek a energie, aktivuje karboxylasu. • Palmitoyl CoA a AMP, naopak, inhibují karboxylasu. Prodlužování řetězce a tvorba nenasycených mastných kyselin probíhá na cytosolární straně membrány endoplasmatického retikula. • Tvorba oleoyl CoA (cis Δ9-dvojná vazba) ze stearoyl CoA: Stearoyl CoA + NADH + H+ + O2 → oleoyl CoA + NAD+ + 2 H2O • Katalyzují tři membránové enzymy. • Savci nemají enzymy katalyzující vstup dvojné vazby za uhlík C-9 řetězce mastných kyselin. • Savci nemohou syntetizovat linoleát (18 : 2 cis Δ9, Δ12) a linolenát (18 : 3 cis Δ9, Δ12, Δ15). • Obě mastné kyseliny jsou pro savce esenciální – musí být dodány s potravou. Biosyntéza cholesterolu • Cholesterol má 27 uhlíkových atomů a všechny mají původ v acetyl CoA. • Syntéza cholesterolu se uskutečňuje ve třech stupních: • A) Syntéza isopentenyldifosfátu, jako aktivní isoprenové jednotky. • B) Kondenzace šesti molekul isopentenyldifosfátu za tvorby skvalenu. • C) Cyklizace skvalenu řadou reakcí na tetracyklický produkt, který je bezprostředně převeden na cholesterol. • Cholesterol: Modulátor fluidity živočišných membrán Prekurzor steroidních hormonů Prekurzor žlučových kyselin Prekurzor vitaminu D Značení uhlíkových atomů cholesterolu v návaznosti na značení acetylu. H3C C HO C C C CH3 C C C C C C C C C CH3 C C C C C C CH3 C CH3 C C C H3C C Číslování uhlíků cholesterolu a steroidů 21 H3C 20 18 CH3 19 CH3 2 3 HO 1 A 4 10 5 11 9 B 6 12 C 13 14 8 7 17 D 16 15 22 23 24 25 27 CH3 CH3 26 Syntéza isopentenyldifosfátu v cytosolu • Meziprodukty jsou 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA (HMG-CoA) a mevalonát. • HMG-CoA se v mitochondriích převádí na acetyl CoA a acetoacetát (ketolátky) !!!! • Syntéza mevalonátu je klíčovým stupněm syntézy cholesterolu. Redukce HMG-CoA enzymem HMG-CoA reduktasou je ireversibilním stupněm, kontrolním bodem syntézy. Reduktasa je integrální součástí membránových proteinů v endoplasmatickém retikulu. HMG-CoA + 2 NADPH + 2 H+ → mevalonát + 2 NADP+ + CoA Přeměny 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA v cytosolu a mitochondrii CYTOSOL H3C O O C C C H2 + S 2 H + 2 NADPH CoA O Acetoacetyl-CoA - + O O H3C C S CoA H2O CoA C H3C C H2 OH C C H2 CoA + 2 NADP+ O - O H3C C C H2 C C H2 CH2 Mevalonát O C OH OH S CoA O 3-Hydroxy-3-methylglutaryl-CoA (HMG-CoA) C H3C Acetyl-CoA CoA S Acetyl-CoA O - O MITOCHONDRIE C + C H2 CH3 C Acetoacetát O Syntéza isopentenyldifosfátu COO - COO CH3 OH CH2 OH - COO CH3 ATP ADP Mevalonát ATP P O COO CH3 OH CH2 O - O + O 5-Fosfomevalonát 2- ADP ATP P O H2C CH3 OH CH2 O - - O + O ADP P O + O 5-Difosfomevalonát O 2- CH3 2- O PO 3 CH2 O P O - CO2 + Pi O + O P O O + O 2- CH2 O P O - O + O P O + O 3-Isopentenyldifosfát O 2- Izomerizace isopentenyldifosfát – dimethylallyldifosfát H2C H3C CH3 CH3 3- CH2O PO2PO3 3-Isopentenyldifosfát 3- CH2O PO2PO3 Dimethylallyldifosfát Mechanismus kondenzace allylového substrátu (dimethylallyldifosfát) s 3-isopentenyldifosfátem. Kondenzace hlava – ocas. 3-Isopentenyldifosfát CH3 3- PO2PO3 CH3 CH3 R H Allylový substrát PPi CH2O H2C + CH2O R 3PO2PO3 - CH2 H Allylový karbanion Geranyldifosfát CH3 3- H3C OPO 2PO 3 Dimethylallyldifosfát CH3 3- H2C OPO 2PO3 3-Isopentenyldifosfát PPi CH3 3- OPO 2PO3 CH3 H3C Geranyldifosfát Geranyl = dimethylallyldifosfát + isopentenyldifosfát; Farnesyl = geranyl + isopentenyldifosfát. 3- PO2PO 3 CH3 + H2C CH3 CH2 R C H2 CH3 CH2O H CH2O H2C CH3 + H 3- PO2PO3 CH2 R H H Geranyl-(farnesyl)-difosfát Skvalen = 2 x farnesyldifosfát + NADPH Kondenzace hlava – ocas. CH3 3- OPO2PO3 CH3 CH3 H3C Farnesyldifosfát Farnesyldifosfát + NADPH PPi + NADP+ + H+ CH3 CH3 CH3 CH3 CH3 H3C CH3 Skvalen CH3 Cyklisace skvalenu na lanosterol přes skvalen epoxid a protosterolový kationt. O2 + NADPH + H+ H2O + NADP+ O Skvalen Skvalen epoxid H+ H H3C + CH3 H CH3 H H3C H CH3 CH3 H H+ HO H3C H CH3 Lanosterol HO CH3 CH3 H Protosterolový kation Lanosterol přechází řadou reakcí na cholesterol. Odstranění tří methylů, redukce jedné dvojné vazby NADPH a přesun druhé dvojné vazby. H3C CH3 H3C CH3 CH3 H3C CH3 H3C 19 KROKŮ CH3 CH3 HO CH3 HCOOH + 2 CO2 HO H3C CH3 Lanosterol Cholesterol Regulace syntézy cholesterolu. • Dospělý člověk syntetizuje denně 800 mg cholesterolu (játra, střevo). • Syntéza cholesterolu je regulována jeho buněčnou hladinou zpětnovazebně přes aktivitu a množství HMG-CoA reduktasy !! • 1. Rychlost syntézy reduktasové mRNA je kontrolována zvláštním proteinem (regulatory element binding protein SREBP) – transkripční faktor. Nízká hladina cholesterolu aktivuje SREBP, vysoká inhibuje. • 2. Rychlost translace reduktasové mRNA je inhibována nesteroidními metabolity odvozenými od mevalonátu a cholesterolem z potravy. • 3. Odbourávání reduktasy – proteolýza je spuštěna při vysokých koncentracích cholesterolu. • 4. Fosforylace snižuje aktivitu reduktasy. AMP aktivovaná proteinkinasa vypíná syntézu cholesterolu. Syntéza se zastavuje při nízkých hladinách ATP. Inhibitory syntézy cholesterolu. • Syntéza cholesterolu může být efektivně blokována třídou sloučenin zvaných statiny (např. lovastatin také s názvem mevacor). Jedná se o silné inhibitory (Ki = 1 nM) HMG-CoA reduktasy. • Obvykle se podávají s inhibitory reabsorpce žlučových kyselin. • Atherosklerosa !! HO COO - OH H3C O H O Lovastatin CH3 H3C CH3 Syntéza žlučových kyselin. Polární deriváty cholesterolu – vysoce efektivní detergenty. Cholesterol O OH H3C COO - OH CH3 H3C SCoA CH3 H3C CH3 CH3 HO CH3 OH HO Trihydroxykoprostanoát OH CH3 Cholyl-CoA Taurin Glycin O OH H3C CH3 O NH COO CH3 HO CH3 OH - H3C CH3 CH3 OH Glykocholát HO CH3 OH Taurocholát - NH SO 3 Steroidní hormony. • Cholesterol je prekurzorem pěti hlavních tříd steroidních hormonů: • Progestageny, glukokortikoidy, mineralokortikoidy, androgeny a estrogeny. • Regulace genové exprese. • Biosyntetická cesta tříd steroidních hormonů. Cholesterol (C27) Pregnenolon (C21) Progestageny (C21) Glukokortikoidy (C21) Androgeny (C19) Mineralokortikoidy (C21) Estrogeny (C18) Funkce a místo syntézy steroidních hormonů • Progestagen progesteron – připravuje dělohu pro přijetí vajíčka. • Androgeny (jako testosteron) – vývoj sekundárních pohlavních znaků mužů. • Estrogeny (jako estron) – vývoj sekundárních pohlavních znaků žen, ovariální cyklus. • Glukokortikoidy (jako kortisol) – propagace glukoneogeneze s tvorby glykogenu, inhibice zánětů. • Mineralokortikoidy (aldosteron) – zvýšení reabsorbce Na+ a vylučování K+ a H+ což vede ke zvýšení objemu a tlaku krve. • Hlavními místy syntézy steroidních hormonů jsou: • Žluté tělísko (Corpus luteum) pro progestageny. Vaječníky pro estrogeny. Varlata pro androgeny. Kůra nadledvinek pro glukokortikoidy a mineralokortikoidy. Vitaminy D – kontrola hladiny Ca2+ a fosfátů. Aktivním hormonem je kalcitriol. Nejedná se o pravý steroid, ale funkčně působí podobně tím, že se váže na strukturně podobný receptor za tvorby komplexního faktoru regulujícího genovou expresi. H3C CH3 H3C CH3 CH3 H3C CH3 H3C CH3 Ultrafialové záření HO HO 7-Dehydroxycholesterol Provitamin D3 H3C CH3 H3C CH3 OH CH3 H3C OH Kalcitriol (1,25-Dihydroxycholekalciferol) CH3 H3C CH2 HO CH3 CH2 HO Vitamin D3 (Cholekalciferol) Isopentenyldifosfát je prekurzorem terpenů, řetězců ubichinonu, chlorofylu, karotenoidů a vitaminu K. Myrcen (bobkový list) Limonen (citronová silice) Zingiberen (zázvor) Vitamin K2 a ubichinon O O Isoprenová jednotka ( O Vitamin K2 ) 6 CH3 H MeO Isoprenová jednotka ( MeO O Ubichinon (Koenzym Q10) ) H 10 CH3 Fytol a karotenoidy • Fytol-vedlejší řetězec chlorofylu je složen ze čtyř isoprenových jednotek. • Karotenoidy – barviva rajčat a mrkve. Absorbují světlo, protože obsahují konjugované dvojné vazby (mezi 400 až 500 nm). • Jejich C40 uhlíkatý řetězec je skládán z C5 jednotek až po geranylgeranyldifosfát C20, jehož dvě molekuly kondenzují způsobem hlava-ocas za tvorby fytoenu C40. • Fytoen přejde po dehydrogenaci na lykopen. Cyklizací obou konců lykopenu získáme β-karoten – prekurzor retinalu. Karotenoidy Lykopen β-Karoten Fotoreceptorová molekula rhodopsin sestává z proteinu opsin a 11-cis – retinalu jako prosthetické skupiny. Absorpční maximum rhodopsinu je 500 nm. H3C CH3 CH3 CH3 H3C H 11-cis-Retinal O
Podobné dokumenty
Biochemie 10 lipidy biosyntesa
sulfhydrylové skupiny ACP (acyl carrier protein), kdežto meziprodukty degradace jsou vázány na SH skupinu CoA.
VíceMetabolismus lipidů - Ústav lékařské biochemie
– β-oxidace části nenasycených MK – odbourávání neobvyklých MK • např. kys. eruková - 22:1(13) – degradace je velmi pomalá, a proto se ukládá ve formě TG v myokardu
VíceCyklus glykolýza Krebs Fotorespirace dýchání
3. Enzymy syntézy polypeptidový řetězec (synthasa mastných kyselin). Enzymy degradace volně v matrix. 4. Řetězec mastných kyselin se prodlužuje o dva uhlíky z acetyl CoA. Aktivovaným donorem dvou u...
VíceSelekční znak - farmaceuticka
geny z Arabidopsis thaliana kódující enzymy účastnící se metabolismu lipidů a sacharidů někdy geny z Brassica napus a Saccharomyces cerevisiae
VíceCitrátový cyklus
• Citrátový cyklus je amfibolický. V cyklu dochází ke katabolické reakci (odbourávání acetyl CoA na CO2). Meziprodukty cyklu se využívají k syntézám dalších látek – anabolické reakce.
Vícebi opr spect - Biotechnologická společnost
KgaA (www.wiley-vch.de). Kniha je rozdělena do tří částí. První se podrobně zabývá historií biotechnologií, druhá část nazvaná „The New Paradigm Based on Molecular Biology and Genetics“ se v zásadě...
Více