Dotazník Základní údaje o činnosti pracoviště AV ČR v roce 2009 a
Transkript
Dotazník Základní údaje o činnosti pracoviště AV ČR v roce 2009 a
Dotazník Základní údaje o činnosti pracoviště AV ČR v roce 2009 a hlavní dosažené výsledky I. Textová část 1. Název pracoviště: Mikrobiologický ústav AVČR, v.v.i. Zkratka pracoviště: MBÚ AVČR, v.v.i. IČ: 61388971 2. Vědecká činnost pracoviště a uplatnění jejích výsledků 2a) stručná charakteristika vědecké činnosti pracoviště Česky: Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i., je jednou z hlavních vědeckých institucí v České republice, která se komplexně zabývá základním výzkumem v oboru mikrobiologie. Hlavní výzkumné oblasti jsou biochemie, fyziologie, molekulární genetika bakterií, kvasinek a vláknitých hub, mikroskopických řas a témata imunologická. V rámci těchto oblastí jsou podrobně studovány otázky produkce biologicky aktivních látek, enzymů, regulační mechanizmy v řízení diferenciace růstu mikroorganizmů, mechanizmy podílející se na přenosu a modifikaci DNA, degradační aktivity mikroorganizmů, fotosyntetický systém, vývojové aspekty imunity, patologie a léčba autoimunitních onemocnění a imunologie onemocnění nádorových. 1 Anglicky: Institute of Microbiology, Academy of Sciences of the Czech Republic, v.v.i., is one of the major scientific institutions in the country that systematically pursues basic research in microbiology. The main research areas are biochemistry, physiology and molecular genetics of bacteria, yeasts, filamentous fungi and microscopic algae, and immunological disciplines. Within the framework of these areas, detailed research is conducted into the problems of production of biologically active substances, enzymes, regulatory mechanisms controlling the differentiation and growth of microorganisms, photosynthetic machinery, evolutionary aspects of immunity, pathology and treatment of autoimmune diseases and modern methods for the therapy of tumors. 2b) 1 Pořadové číslo 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 výčet nejdůležitějších výsledků vědecké činnosti 2 Výsledek Oligomery bakteriálních toxinů tvoří v buněčné membráně póry (dr. Peter Šebo). Stresové granule u kvasinek (ing. Jiří Hašek) Antiradikálová aktivita flavonidu silybinu (prof. Vladimír Křen). Biodegradce endokrinně aktivních látek a potlačení estrogenní aktivity ligninolytickými houbami. (dr. Tomáš Cajthaml). Expanze aktivovaných naϊvních CD8+ T buněk a NK buněk komplexy IL-2 a anti-IL-2 monoklonálních protilátek je moderní přístup v nádorové imunoterapii (dr. Marek Kovář). Síra a dusík zčásti nahrazuje fosfor ve fosfolipidech fytoplanktonu (dr. Michal Koblížek). Nová mikroskopická technika využívající dvouelektronovou konfokální mikroskopii (dr. Libuše Váchová). Vliv mutace v Nod2 genu na patogenezi Crohnovy choroby (prof. Helena Tlaskalová). Mutasyntéza derivátů linkomycinu účinných proti rezistentním stafylokokům (ing. Jiří Janata). Příprava a imunologické testování dimerních disacharidů spojených linkerem definované délky (prof. Vladimír Křen, prof. Karel Bezouška) Klinické zkušenosti s polymerními konjugáty doxorubicinu a HPMA kopolymeru, který byl směrován lidským imunoglobulinem (prof. Blanka Říhová). Fytopatogenní houby působící novou chorobu ořešáku. (dr. Miroslav Kolařík). 2 3 Číslo citace výsledku 1 2 3-7 8 9 10 11 12 13 - 15 16 17 18 - 21 2c) anotace nejvýznamnějších výsledků z bodu 2b) Pořadové číslo anotace: 1 Název česky: Oligomery bakteriálních toxinů tvoří v buněčné membráně póry. Název anglicky: Oligomers of bacterial toxins are involved in pore formation. Popis výsledku česky: Byl proveden první přímý fyzikální důkaz, že bakteriální toxin z rodiny RTX proteinů tvoří v buněčné membráně oligomery. Bylo prokázáno, že oligomerizace je podmínkou tvorby pórů adenylát-cyklasového (AC) toxinu v buněčné membráně. Průnik enzymatické AC domény toxinu membránou buněk je pak zajištěn monomery toxinu, které do oligomerů nevstupují. Mechanismus působení toxinu na buněčné membráně tedy zahrnuje dvě paralelní a navzájem nezávislé aktivity, tvorbu pórů a dopravu AC enzymu přes buněčnou membránu. Tento prioritní výsledek je významný pro konstrukci nových typů nástrojů pro dopravu antigenů do buněk imunitního systému, pro účely navození ochranné imunity proti infekcím a pro vývoj nových postupů pro imunoterapii nádorů. Popis výsledku anglicky: For the first time, a direct physical evidence for oligomerization of an RTX family pore-forming toxin in the membrane of a target cells was obtained. It is shown that adenylate cyclase toxin (ACT) oligomerization is a prerequisite for formation of ACT pores, while translocation of the enzymatic adenylate cyclase domain of ACT across target cell membrane is associated with toxin monomers. These results show that toxin action on cell membrane involves two mutually excluding and independent mechanisms that operate in parallel. the translocation of the enzyme across cell membrane and the formation of cation-selective membrane pores. This priority results have important implications for construction of a novel generation of improved toxoid-derived tools for delivery of vaccinal antigens into dendritic cells, aiming for induction of specific cellular immune responses and development of novel immunotherapies of tumors. Citace výstupu: 1 - Vojtova-Vodolanova, J., Basler M., Osicka R., Knapp O., Maier E., Cerny J., Benada O., Benz R., Sebo P. (2009) Oligomerization is involved in pore formation by Bordetella adenylate cyclase toxin. FASEB J. 23, 2831-2843. Číslo ilustrace: 1 Spolupracující subjekt: Spolupráce s doc. J. Černým, PřF UK Praha a s prof. R. Benzem, University of Würzburg, SRN Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): doc. Peter Šebo, 296442141, [email protected] 3 Pořadové číslo anotace: 2 Název česky: Stresové granule u kvasinek. Název anglicky: Stress granules in yeasts. Popis výsledku česky: Stresem indukované akumulace esenciálních proteinů jsou důležitým diagnostickým znakem některých neurodegenerativních onemocnění. Mechanismy jejich vzniku nejsou známy, avšak jako možnou příčinou se jeví ztráta dynamického chování zúčastněných proteinů. Zejména se jedná o dynamiku stresových granulí tvořených komponentami translačního aparátu. V tomto směru jsme jako jedni z prvních prokázali, že stresové granule kvasinky Saccharomyces cerevisiae mohou také obsahovat translační iniciační faktor eIF3 a malou ribosomální podjednotku, podobně jako je tomu u savčích buněk. Tvorba kvasinkových stresových granulí je ovlivňována přítomností uvolněné mRNA a energie, a má význam pro obnovu buněčného růstu a dělení po stresu. Místa vzniku stresových granulí za teplotního stresu jsou u kvasinek určena markery P-bodies, ale tvorba těchto stresových granulí je nezávislá na přítomnosti hlavních strukturálních proteinů P-bodies. Naše výsledky naznačují, že i v kvasinkách, které jsou nejvhodnějším modelem eukaryotické buňky, vznikají stresové granule složením podobné stresovým granulím savčích buněk. Jejich tvorba však sleduje dosud ne zcela známé alternativní mechanismy. Význam práce byl zdůrazněn uvedením krátké předmluvy ke článku v kapitole „In this issue“ časopisu J. Cell Science. Popis výsledku anglicky: Stress-induced accumulation of essential regulatory proteins is an important marker of some neurodegenerative diseases, whose mechanisms are still unknown. It has been shown recently, that a possible role in a disease-induction might be ascribed to loss of regulatory protein dynamics. In this respect, the loss of dynamics of translational components in stress granules could be considered especially. In this paper we have described for the first time that also budding yeast Saccharomyces cerevisiae may form the stress granules which contain translation initiation factor eIF3 and 40S ribosomal subunits. Formation of these stress granules is energydependent and also depends on availability of cellular mRNA. Assembly of these granules was important for the regrowth of stressed cells during recovery. We also found that these stress granules are linked to P-bodies, but their assembly does not depend on structural proteins of P-bodies. Our data show that the best model system of eukaryotic cell, budding yeast S. cerevisiae, forms stress granules, which are similar in composition to stress granules of mammalian cells, however, the alternative routes for their assembly were suggested. The importance of this work was highlighted by acknowledgement in the chapter „In this issue“of the journal J. Cell Science. Citace výstupu: 2 - Groušl T., Ivanov P., Frýdlová I., Vašicová P., Janda F., Vojtová J., Malínská K., Malcová I., Nováková L., Janošková D., Valášek L., Hašek J. (2009) Robust heat shock induces eIF2α-phosphorylation-independent assembly of stress granules containing eIF3 and 40S ribosomal subunits in budding yeast S. cerevisiae. J. Cell Sci. 122, 2078-2088. Číslo ilustrace: 2 Spolupracující subjekt: Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): ing. Jiří Hašek, 296442503, [email protected] 4 Pořadové číslo anotace: 3 Název česky: Antiradikálová aktivita flavonidu silybinu. Název anglicky: Antiradical activity of the flavonid sylibin. Popis výsledku česky: Byl detailně popsán molekulární mechanismus antiradikálové aktivity flavonoidu silybinu a jeho derivátů. Silybin je využíván rozsáhle jako nutraceutikum a v současnosti se studuje jeho použití při terapii nádorů prostaty (klinické zkoušky II) a dále jako účinné anti-angiogenní látky; v současné době je tato látka intenzivně studována (cca 200 publikací ročně). Při tom byly též vyvinuty dvě původní metody na diastereomerní diskriminaci silybinu, jedna pomocí glykosidas (viz. vyšlá publikace) a druhá pomocí lipas (publikace v recenzním řízení, podána patentová přihláška). Obě tyto metody umožní přípravu opticky aktivního silybinu v multigramových množstvím s možností scale-up i do provozních podmínek, což má zásadní význam pro rozvoj dalšího výzkumu a aplikace této látky. Popis výsledku anglicky: Molecular mechanism of the antiradical activity of the flavonoid silybin and its derivatives was described in detail. Silybin is extensively used as a nutraceutics and at present its application in prostatic cancer therapy is investigated (clinical tests II), as well as an effective anti-angiogenic substance. Two original methods for a chiral discrimination of silybin employing glycosidases and lipases were developed (paper + patent application). Both these methods enable preparation of multigram amounts of optically pure silybins with the scale-up option. This is a fundamental prerequisite for further research and application of this substance. Citace výstupu: 3 - R. Gažák, P. Sedmera, M. Vrbacký, J. Vostálová, Z. Drahota, P. Marhol, D. Walterová, V. Křen: Molecular mechanisms of silybin and 2,3-dehydrosilybin antiradical activity - role of individual hydroxyl groups. Free Rad. Biol. Med. 46, 745-758 (2009). 4 - Patrick Trouillas, Philippe Marsal, Alena Svobodová, Jitka Vostálová, Jan Hrbáč, Radek Gažák, Vladimír Křen, Roberto Lazzaroni, Jean-Luc Duroux, Petr Sedmera, Daniela Walterová: Mechanism of The Antioxidant Action of Silybin and 2,3-Dehydrosilybin Flavonolignans: A Joint Experimental and Theoretical Study. Journal of Physical Chemistry A. 112, 1054-1063 (2008). 5 - V. Křen, R. Gažák, K. Purchartová, P. Marhol, D. Biedermann, P. Sedmera: Chemoenzymatic preparative separation of silybin A and B. J.Mol. Catal. B: Enzymatic, 61, 247-251 (2009). 6 - D. Monti, R. Gažák, P. Marhol, D. Biedermann, K. Purchartová, M. Fedrigo, S. Riva, V. Křen, Enzymatic Kinetic Resolution of Silybin Diastereoisomers. J. Nat. Prod.. submitted 2009 7 - V. Křen, R. Gažák, P. Marhol, D. Monti, S. Riva: Způsob výroby opticky čistých stereomerů silybinu A a silybinu B. PV 2009-687, 21. 10. 2009 Číslo ilustrace: 3 Spolupracující subjekt: Univerzita Palackého, Olomouc, University of Limoges, (Francie), CNR, Milano, (Italie) Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): prof. Vladimír Křen, 296442510, [email protected] 5 Pořadové číslo anotace: 4 Název česky: Biodegradce endokrinně aktivních látek a potlačení estrogenní aktivity ligninolytickými houbami. Název anglicky: Biodegradation of endocrine-disrupting compounds and suppression of estrogenic activity by ligninolytic fungi Popis výsledku česky: Endokrinně aktivní látky (EDC) představují rozsáhlou skupinu zástupců přírodního a anthropogenního původu. Jsou velmi široce rozšířené v životním prostedí a představují vážné riziko pro vodní organismy a lidskou populace. V této studii byly degradovány 4-n-nonylphenol, technický 4-nonylphenol, bisphenol A, 17 alpha-ethinylestradiol a triclosan pomocí 8 druhů ligninolytických hub (Irpex lacteus 617/93, Bjerkandera adusta 606/93, Phanerochaete chrysosporium ME 446, Phanerochaete magnotiae CCBAS 134/1. Pleurotus ostreatus 3004 CCBAS 278, Trametes versicolor 167/93, Pycnoporus cinnobarinus CCBAS 595, Dichomitus squalens CCBAS 750). Výsledky ukazují že za použitých podmínek byly houby schopny rozložit EDC během 14-ti dnů kultivace a obecně se ukázalo, že estrogenní aktivity, měrené pomocí rekombinantního kvasinkového testu, klesaly s rozsahem degradace. Popis výsledku anglicky: Endocrine-disrupting compounds (EDCs) represent a large group of substances of natural and anthropogenic origin. They are widely distributed in the environment and can pose serious risks to aquatic organisms and to public health. In this study, 4-n-nonylphenol, technical 4-nonylphenol, bisphenol A, 17 alpha-ethinylestradiol, and triclosan were biodegraded by eight ligninolytic fungal strains (Irpex lacteus 617/93, Bjerkandera adusta 606/93, Phanerochaete chrysosporium ME 446, Phanerochaete magnotiae CCBAS 134/1. Pleurotus ostreatus 3004 CCBAS 278, Trametes versicolor 167/93, Pycnoporus cinnobarinus CCBAS 595, Dichomitus squalens CCBAS 750). The results show that under the used conditions the fungi were able to degrade the EDCs within 14 d of cultivation and in general, estrogenic activities assayed with a recombinant yeast test decreased with advanced degradation. Citace výstupu: 8 - Cajthaml T., Křesinová Z, Svobodová K., Möder M.: Biodegradation of endocrine disrupting compounds and suppression of estrogenic activity by ligninolytic fungi. Chemosphere 6 (2009) 745-750 Číslo ilustrace: Spolupracující subjekt: Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): dr. Tomáš Cajthaml, 296442498, [email protected] Pořadové číslo anotace: 5 Název česky: Expanze aktivovaných naϊvních CD8+ T buněk a NK buněk komplexy IL-2 a anti-IL-2 monoklonálních protilátek je moderní přístup v nádorové imunoterapii. Název anglicky: Expansion of Activated Naïve CD8+ T cells and NK Cells Driven by Complexes of IL-2 and Anti-IL-2 Monoclonal Antibody As Novel Approach of Cancer Immunotherapy. Popis výsledku česky: Práce prokazuje, že komplexy IL-2 a anti-IL-2 monoklonálních protilátek mají extremně vysokou schopnost expandovat in vivo aktivované naϊvní CD8+ T buňky. Po čtyřech dávkách se taková schopnost zvyšuje více než stonásobně, po šesti dávkách až tisícinásobně. Expandované naϊvní CD8+ T buňky tvoří robustní populaci funkčních paměťových buněk. IL-2/S4B6 6 imunokomplexy také navozují masivní expanzi NK buněk. U dvou různých nádorových modelů byla prokázána významná protinádorová aktivita. IL-2 imunokomplexy mají významně delší cirkulační dobu. Zatím co poločas volného IL-2 je kolem 15 minut, imunokomplexy IL2/anti IL-2 monoklonáoních protilátek (S4B6) mají poločas kolem tří hodin. Popis výsledku anglicky: In this study we show that although IL-2 immunocomplexes are less potent than free IL-2 in vitro, they possess extremely high stimulatory activity to expand activated naïve CD8+ T cells in vivo. IL-2 immunocomplexes expand activated naïve CD8+ T cells several hundred-fold times after 4 doses and more then thousand-fold times after 6 doses, while free IL-2 given at the same dosage shows negligible activity. IL2/S4B6 mAb immunocomplexes also induce massive expansion of NK cells. Importantly, activated naïve CD8+ T cells expanded by IL-2 immunocomplexes form robust population of functional memory cells. We also demonstrate in two distinct tumor models that IL-2/S4B6 mAb immunocomplexes possess considerable anti-tumor activity. Finally, by using radioactively labeled IL-2, we provide for first time direct evidence that IL-2 immunocomplexes have much longer half-life in circulation than free IL-2, being about 3 h versus < 15 min, respectively. Citace výstupu: 9 - Tomala, J., Chmelová, H., Mrkvan, T., Říhová, B., Kovář, M.: In Vivo Expansion of Activated Naïve CD8+ T cells and NK Cells Driven by Complexes of IL-2 and Anti-IL-2 Monoclonal Antibody As Novel Approach of Cancer Immunotherapy.J. Immunol., 183, 4904-4912 (2009). IF = 6.0 Číslo ilustrace: Spolupracující subjekt: Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): dr. Marek Kovář, 296442267, [email protected] Pořadové číslo anotace: 6 Název česky: Síra a dusík zčásti nahrazuje fosfor ve fosfolipidech fytoplanktonu. Název anglicky: Sulfur and nitrogen partly substitue phosphorus in phospholipides of phytoplankton. Popis výsledku česky: Zjistili jsme, že mořské jednobuněčné fotosyntetické mikroorganismy (fytoplankton) dokáží v případě limitace nedostatkem fosforu nahradit membránové fosfolipidy lipidy, které obsahují síru a dusík. Tuto schopnost ale nemají heterotrofní bakterie, které množství fosfolipidů nesníží ani v případě limitace fosforem. Tento poznatek vysvětluje, proč fytoplankton dokáže růst i v oblastech, ve kterých je fosforu nedostatek. Popis výsledku anglicky: We have found that eukaryotic phytoplankton and cyanobacteria have the ability to decrease their cellular phosphorus content when phosphorus in their environment is scarce by substituting non-phosphorus (containing sulphur or nitrogen) membrane lipids for phospholipids. In contrast, this ability has not been observed in marine heterotrophic bacteria which contained no substitute lipids. Our results suggest that phospholipid substitutions are fundamental biochemical mechanisms that allow phytoplankton to maintain growth in the face of phosphorus limitation. 7 Citace výstupu: 10 - Van Mooy, B.A.S., Fredericks, H.F., Pedler, B.E., Dyhrman, S.T., Karl, D.M., Koblížek, M., Lomas, M.W., Mincer, T.J., Moore, L.R., Moutin, T., Rappé, M.S., Webb, E.A.: Phytoplankton in the ocean use non-phosphorus lipids in response to phosphorus scarcity. – Nature 458, 69-72, 2009. Číslo ilustrace: 6 Spolupracující subjekt: Woods Hole Oceanographic Institution, USA, a 9 dalších institucí Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): dr. Michal Koblížek, 384340432, [email protected] Pořadové číslo anotace: 7 Název česky: Nová mikroskopická technika využívající dvou elektronovou konfokální mikroskopii Název anglicky: New microscopic approach using two-photon excitation confocal microscope Popis výsledku česky: Byla vyvinuta nová mikroskopická metoda využívající konfokální mikroskop s dvoufotonovou excitací, která umožňuje studium individuálních buněk přímo in situ v mikrokolonii kvasinek. Bylo zjištěno, že Ato1p-GFP protein je nejprve synchronně produkován buňkami v jasně ohraničené vrstvě po celém povrchu mikrokolonie. Vnější vrstva buněk o tloušťce 1-2 buněk pokrývající celou mikrokolonii chrání jako „kůžička“ populaci kolonie před vlivy prostředí. Je tvořena živými buňkami, které jsou těsně propojeny patrně povrchovými proteiny buněčné stěny. Popis výsledku anglicky: We developed new microscopic approach using two-photon excitation confocal microscope allowing the study of individual cells directly in situ within yeast microcolony. We found that production of Ato1p-GFP protein starts synchronously in surface layer of cells of uniform thickness over the whole microcolony surface (of about 50 µm in the 3-days old colonies). The outermost single cell layer covering the whole microcolony protects the colony population against environmental impacts like a “skin”. It is formed by living cells tightly joined via thick cell walls, probably by their surface proteins. Citace výstupu: 11 - Váchová L., Chernyavskiy O., Strachotová D., Bianchini P., Burdíková Z., Ferčíková I., Kubínová L., Palková Z. (2009) Architecture of developing multicellular yeast colony: spatio-temporal expression of Ato1p ammonium exporter. Environ Microbiol. 11, 1866-1877 Číslo ilustrace: 7 Spolupracující subjekt: Spolupráce s Laboratoří biologie kvasinkových kolonií, PřF UK v Praze a s Oddělením biomatematiky, Fyziologický ústav AV ČR Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): dr. Libuše Váchová, 296442376, [email protected] 8 Pořadové číslo anotace: 8 Název česky: Vliv mutace v Nod2 genu na patogenezi Crohnovy choroby. Název anglicky: Influence of Nod2 gene mutation to the pathogenesis of ileal Crohn's disease. Popis výsledku česky: Mutace v Nod2 genu patří mezi nejsilnější genetické rizikové faktory v patogeneze Crohnovy choroby. Na modelu Nod2 deficitních myších bylo prokázáno, že Nod2 hraje zásadní roli při regulaci komensální bakteriální flóry ve střevě. Exprese Nod2 je závislá na přítomnosti komensální mikrofóry; pokud byly imunokompetentní BALB/c myši chovány v bezmikrobním prostředí, byla prokázána nižší exprese Nod2 v terminálním ileu a po bakteriální kolonizaci došlo ke zvýšení exprese Nod2. Popis výsledku anglicky: Mutations in the Nod2 gene are among the strongest genetic risk factors in the pathogenesis of ileal Crohn's disease. Studies in a model of Nod2 deficient mice have proven that Nod2 plays an essential role in the regulation of gut commensal microbiota. The expression of Nod2 is dependent on the presence of commensal bacteria; we show that immunocompetent Balb/c mice maintained under germ-free conditions express significantly less Nod2 in their terminal ilea and that a colonization of germ-free mice with commensal bacteria increases Nod2 expression. Citace výstupu: 12 - Petnicki-Ocwieja T., Hrncir T., Liua Y.-J., Biswasa A., Hudcovic T., Tlaskalova-Hogenova H., Kobayashia K.S.: Nod2 is required for the regulation of commensal microbiota in the intestine. PNAS 106, 15813-1518 (2009). IF = 9. 038 Číslo ilustrace: Spolupracující subjekt: Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): Prof. Helena Tlaskalová, 296442363, [email protected] Pořadové číslo anotace: 9 Název česky: Mutasyntéza derivátů linkomycinu účinných proti rezistentním stafylokokům. Název anglicky: Mutasynthesis of lincomycin derivatives with activity against drug-resistant staphylococci. Popis výsledku česky: Cíleným zásahem do genomu producenta antibiotika linkomycinu Streptomyces lincolnensis ATCC 25466 byla zablokována produkce antibiotika. Přídavkem specifických prekurzorů do kultivačního media bylo dosaženo produkce derivátů linkomycinu 4'-butyl-4'-depropyllinkomycinu a 4'-pentyl-4'-depropyllinkomycinu bez kontaminace původně produkovaného antibiotika linkomycinu. Obě látky byly produkovány v koncentraci totožné s produkcí linkomycinu v původním divokém kmenu a nové látky mají vyšší účinnost proti klinickým izolátům stafylokoků včetně kmenů s některými typy rezistence vůči linkosamidovým antibiotikům. Výsledky byly dosaženy v projektu, na kterém náš ústav spolupracuje se společností Zentiva k.s., jsou předmětem dvou patentových přihlášek a publikace Popis výsledku anglicky: The directed genome manipulation of lincomycin producer S. lincolnensis ATCC 25466 was employed to block the antibiotic production. The specific precursors were added into cultivation media to obtain lincomycin derivatives 4'-butyl-4'depropyllincomycin and 4'-pentyl-4'-depropyllincomycin without any contamination of primarily produced antibiotic lincomycin. Both the 9 substances were produced in concentration identical with the wild type strain lincomycin production. The new derivatives exhibited higher efficiency against clinical isolates of Staphylococci including some strains resistant against lincosamide antibiotics. These results were achieved in collaboration with Zentiva k.s. and are subject of two patent applications and one publication in prestigeous journal Antimicrobial Agents and Chemotherapy. Citace výstupu: 13 - Janata J. a kol. (2009) Způsob biotechnologické přípravy derivátů linkomycinu a použití kmene, přihláška vynálezu PV 2009-277 (Z7605), 14 - Janata J. a kol. (2009) Sekvence genového shluku kódující biosyntézu celesticetinu a její použití, přihláška vynálezu PV 2009-278 (Z7607) 15 - Ulanová D., Novotná. J., Smutná Y., Kameník Z., Gažák R., Šulc M., Kadlčík S., Plháčková K. Janata J. (2010) Mutasynthesis of lincomycin derivatives with activity against drug-resistant staphylococci, Antimicrob Agents Chemother (v tisku; únor 2010) Číslo ilustrace:9 Spolupracující subjekt: Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): ing. Jiří Janata, 296442308, [email protected] Pořadové číslo anotace: 10 Název česky: Příprava a imunologické testování dimerních disacharidů spojených linkerem definované délky. Název anglicky: Construction and immunomodulation activity tests of new linked disaccharides Popis výsledku česky: Probíhala další optimalizace komplexních imunoaktivních oligosacharidů. Nejdůležitějším výsledkem na tomto poli byla identifikace dimerních sacharidů založených na di-N-acetyl-D-laktosaminových kostrách spojených pomocí thiomočovinové spojky jako velmi účinných aktivátorů NK buněk a látek aktivních při experimentálních nádorových terapiích. Tento unikátní účinek je založený na velmi účinné polymerizaci molekul receptoru, kdy dochází po vazbě prvého molekuly ligandu na dimerní NKR-P receptory ke konformační změně v receptorové molekule spojené s řádovým vzrůstem affinity vůči druhé molekule ligandu. Oproti obdobným derivátům obsahujícím pouze N-acetyl-D-glukosamin jsou nově popsané látky, zejména látka 6 (Obr. 2) mnohem účinnější při interakcích s cílovými receptory, též v nádorových experimentech in vivo, kdy bylo poprvé zaznamenáno účinné působení u vysoce metastazujících melanomů. Popis výsledku anglicky: Human placental β1,4-galactosyltransferase I (EC 2.4.1:38) transfers the galactosyl moiety from UDP-Gal to various GlcNAc and Glc acceptors in vivo. Here, we describe the construction of its Y284L mutant as His6propeptide-catβ4GalT1 construct, in which the Gal-transferase activity was totally abolished in favor of its GalNAc-transferase activity. Citace výstupu: 16 - Bojarová P., Křenek K., Wetjen K., Adamiak K., Pelantová H., Bezouška K., Elling L., Křen V. Synthesis of LacdiNAc-terminated glycoconjugates by mutant galactosyltransferase – A way to new glycodrugs and materials. Glycobiology 19, 509517 (2009). IF = 4.446 Číslo ilustrace: 10 10 Spolupracující subjekt: Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): prof. Vladimír Křen, 296442510, [email protected], prof. Karel Bezouška, 296442142, [email protected] Pořadové číslo anotace: 11 Název česky: Klinické zkušenosti s polymerními konjugáty doxorubicinu a HPMA kopolymeru, který byl směrován lidským imunoglobulinem. Název anglicky: Clinical experience with anthracycline antibiotics-HPMA copolymer-human immunoglobulin conjugates. Popis výsledku česky: Byly získány první klinické výsledky s antracyklinovým antibiotikem (epirubicin, doxorubicin) navázaným na polymerní nosič na bázi N-(2-hydroxypropyl)methakrylamidu na který byl navázán take autologní nebo komerční lidský immunoglobulin. Testováno bylo celkem osm pacientů ve věkovém rozmezí 28 – 55 let. U všech byl diagnostikován generalizovaný karcinom (většinou se jednalo o nádor prsu) rezistentní na registrovanou terapii. Účinnost terapie a celkový stav pacienta byl monitorován pomocí vice než 100 biochemických, hematologických a imunologických parametrů, včetně devíti nádorových znaků (CA). Krevní vzorky byly odebírány za 24 hodin po první a až 10 měsíců po poslední léčbě. Intravenozní podání bylo prováděno ambulantně a neprovázely ho žádné vážnější nežádoucí jevy. U šesti z osmi testovaných pacientů bylo dosaženo stabilizace choroby (ultrazvuk a CT) s velmi dobrou kvalitou života, která trvala až 18 měsíců. Pozitivní odpověď na léčbu potvrdilo i snížení řady CA včetně CA 15-3 a CEA. Ojedinělou t.j. duální cytotoxickou a imunomodulační aktivitu pozorovanou na experimentálních zvířatech potvrdila u pacientů aktivace NK a LAK buněk a stabilizovaná hladina retikulocytů. Popis výsledku anglicky: First clinical experience with anthracycline (epirubicin; Epi or doxorubicin; Dox) containing an N-(2hydroyxypropyl)methacrylamide copolymer carrier targeted with autologous or commercial human immunoglobulin were obtained in eight patients aged 28–55 suffering from therapy-resistant metastatic cancer. More than 100 biochemical, hematological and immunological parameters, including nine tumor markers, were tested in blood samples taken 24 h after the first and up to 10 months after the last application. The intravenous application proceeded without serious adverse or side effects and did not require hospitalization. Six of eight monitored patients attained stabilization of disease (liver ultrasound scan and bone computer tomography) with a very good quality of life lasting from seven up to 18 months. Positive response to the treatment was, among others, evaluated as decreased CA 15-3 and CEA tumor markers. A stable or elevated number of peripheral blood reticulocytes together with activation of natural killer (NK) cells and lymphokine-activated killer (LAK) cells supports the data previously obtained in experimental animals pointing to a dual role, i.e. the cytotoxic and immunomobilizing character of doxorubicin–HPMA conjugates. Citace výstupu: 17 - Rihova, B.: Clinical experience with anthracycline antibiotics-HPMA copolymer-human immunoglobulin conjugates. Adv Drug Del Rev 61,1149 – 1158 (2009) IF = 8. 224 Číslo ilustrace: 11 Spolupracující subjekt: ÚMCH AVČR, v.v.i., Praha Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): prof. Blanka Říhová, 296442345, [email protected] Pořadové číslo anotace: 12 Název česky: Fytopatogenní houby působící chorobu ořešáku. Název anglicky: Newly emerging disease of walnuts cuased by phytopathogenic fungi. Popis výsledku česky: Ve spolupráci s fytopatologickými pracovišti v Kalifornii a Koloradu byla studovaná nová choroba ořešáku. Jako příčina hynutí byla určena houba rodu Geosmithia (Freeland, Kolarik et al. 2009), jejíž výzkum biologie a taxonomie bude pokračovat v dalších letech. Bylo dokončeno studium výskytu nebezpečné patogenní houby Histoplasma capsulatum v jeskyních střední Evropy. Bylo ověřeno, že v našem prostředí tato houba chybí a je zde nahrazena příbuzným, velmi podobným a nepatogenním druhem, který byl nově popsán jako Chrysosporium speluncarum. Další tři nové druhy hub byly popsány z prostředí ambrosiových kůrovců (Kolařík and Hulcr 2009). Řada dosud nepopsaných nebo málo známých hub byla objevena v prostředí požerků kůrovců na jedli a v extrémně kyselých a zasolených půdách (Jankowiak and Kolařík 2009, Hujslová, Kubátová et al. 2009) Popis výsledku anglicky: Newly emerging disease of walnuts occurring in the western states of USA was studied in the collaboration with US phytopathological laboratories. A new species of the filamentous fungus from the genus Geosmithia vectoring by a walnut twig beetle was determined as a causal agent and its host range at the same area was studied (Freeland, Kolarik et al. 2009). Results showed that this fungus has narrow host range limited to bark beetles infesting walnuts, what is important in the design of the proper quarantine precautions. The occurrence of the dangerous human pathogenic fungus Histoplasma capsulatum in the Central European caves was studied. The occurence of this pest was not confirmed and is replaced here by highly similar, but non-harmful fungus newly described as Chrysosporium speluncarum (Nováková and Kolařík 2009). The description of three novel taxa from the ambrosia beetle found in Costa Rica was published. This finding dramatically enlarge the knowledge about bark-beetle associated ophiostomatoid fungi, which belonged to well known forest pests (Kolařík and Hulcr 2009). Citace výstupu: 18 - Hujslová, M., A. Kubátová, et al. (2009). "Diversity of fungal communities in saline and acidic soils in the Soos National Natural Reserve, Czech Republic." Mycological Progress in press, 19 - Freeland, E., M. Kolarik, et al. (2009). "The Geosmithia causing thousand cankers disease of walnut is a new species." Phytopathology 99(6): S37-S37. 20 - Kolařík, M. and J. Hulcr (2009). "Mycobiota associated with the ambrosia beetle Scolytodes unipunctatus (Coleoptera: Curculionidae, Scolytinae)." Mycological Research 113(1): 44-60 21 - Jankowiak, R. and M. Kolařík (2009). "Fungi associated with the fir bark beetle Cryphalus piceae in Poland." Forest Pathology: in press Číslo ilustrace: 12 Spolupracující subjekt: Přírodovědecká fakulta UK Praha Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): dr. Miroslav Kolařík, 296442332, [email protected] 12 2d) domácí a zahraniční ocenění zaměstnanců pracoviště 1 Číslo 2 Jméno oceněného 3 Druh a název ocenění 1 2 3 Petr Man Michael Volný Ondřej Prášil, Michal Koblížek, Radek Kaňa, Michal Mašín Prémie O. Wichterleho Prémie O. Wichterleho Cena AV ČR 4 Jana Kamanová 5 Tomáš Hrnčíř 6 Marek Kovář 7 Helena Tlaskalová Cena České imunologické společnosti Cena Milana Pospíšila a České imunologické společnosti Cena České imunologické Patočkova medaile 8 Martin Schwarzer Cena za nejlepší poster a přednášku 9 Karel Lemr Členství v European Academy of Sciences and Arts 13 4 Oceněná činnost 5 Ocenění udělil Za vynikající výsledky v oboru Za vynikající výsledky v oboru Řešení projektu "Nové optické metody studia fytoplanktonu" v rámci podpory projektů cíleného výzkumu za práci Kamanova J., et al. J. Immunol 181: 5587-5597 (2008). Původní vědecká práce. AV ČR AV ČR AV ČR Původní vědecká práce. ČIS Přínos pro imunologii a mikrobiologii a za zásluhy o Československou společnost mikrobiologickou Nejlepší poster a přednáška ČSSM ČIS ČIS XXVIII Congress of European Academy of Allergy and Clinical Immunology European Academy of Sciences and Arts 2e) další specifické informace o pracovišti Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i., se zapojil do projektu Orlice, stal se řešitelem technologické části projektu „Rozvoj Jihočeského vědeckotechnického parku - Etapa IIA, IIB“ a účastní se též projektu BIOCEV. 3. Vzdělávací činnost 3a) účast pracoviště na terciárním vzdělávání (uskutečňování bakalářských, magisterských a doktorských studijních programů) 1 Číslo 2 Bakalářský program 3 Název VŠ 4 Přednášky 5 Cvičení 6 Vedení prací 7 Učební texty 1 2 3 4 5 6 Mikrobiologie Imunologie Biofyzika Analytická chemie Biochemie Klinická a toxikologická analýza UK, VŠCHT, JčU UK JčU PřF UK PřF UK PřF UK ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ne ano ano ano ano ano ano 1 Číslo 2 Magisterský program 3 Název VŠ 4 Přednášky 5 Cvičení 6 Vedení prací 7 Učební texty 1 2 3 4 5 Mikrobiololgie Imunologie Analytická chemie Biochemie Mikrobiologie PřF UK PřF UK PřF UK PřF UK PřF JčU Č. Budějovice ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ne ne ano 14 8 Jiné 8 Jiné 1 Číslo 2 Magisterský program 3 Název VŠ 4 Přednášky 5 Cvičení 6 Vedení prací 7 Učební texty 6 7 1 2 3 4 5 6 Biologie Biologie Biologie Biologie Botanika Imunologie Imunologie Biologie PřF UJEP Ústí n/L LF UP Olomouc PřF MU Brno PřF OU Ostrava PřF UK 1. LF UK Vysoká škola v Plzni, o.p.s. ČZU Praha ano ano ano ano ano ano ano ano ne ne ne ne ano ne ne ne ne ne ne ne ne ne ne ne ne ne ne ano ne ne ne 1 Číslo 2 Doktorský program 3 Název VŠ 4 Přednášky 5 Cvičení 6 Vedení prací 7 Učební texty 1 2 3 Mikrobiologie Imunologie Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie Chemie Biochemie a biotechnologie Fyzika PřF UK PřF UK PřF UK ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano VŠCHT VŠCHT MFF UK, JčU ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano ano 4 5 6 3b) 1 Číslo 1 účast pracoviště na sekundárním vzdělávání (středoškolská výuka) 2 Akce Praxe v laboratořích 3 Pořadatel/škola Střední škola 4 Činnost Laboratorní praktické ukázky a úlohy 15 8 Jiné 8 Jiné 1 Číslo 2 Akce 2 3 Otevřená věda “Zajímavá biomedicína" 4 Cena za 2. místo v celoevropské soutěži středoškoláků v oboru biochemie 3c) 1 Číslo 3 Pořadatel/škola obchodu, služeb a podnikání v Českých Budějovicích MSŠCH Jiráskovo gymnázium v Náchodě FEBS 4 Činnost Praktická činnost v laboratořích Přednášky a praktická činnost v laboratořích J. Nepožitek, práce byla prezentována formou posteru (a obsadila 2. místo) na celoevropské soutěži středoškoláků v oboru biochemie u příležitosti 34. kongresu FEBS v Praze dne 4.7.2009 vzdělávání veřejnosti 2 Akce 3 Pořadatel 4 Činnost 1 Přednáška na tiskové konferenci o probioticich Firma Danone H. Tlaskalová - Přednáška na tiskové konferenci o probioticich (březen 2009) 2 Přednášky, pohovory s pacienty, testování sér rodinných příslušníků, vedení panelové diskuse s pacienty při setkáních Sdružení pacientů s celiakií H. Tlaskalová-Hogenová, L. Tučková a spolupracovníci - pravidelná činnost pro Sdružení pacientů s celiakií: přednášky, pohovory s pacienty, testování sér rodinných příslušníků, vedení panelové diskuse s pacienty při setkání, květen 2009, Praha 3 přednáška v Městské knihovně Praha l, 4.11.2009 Městská knihovna Praha l B. Říhová: „Moderní léčba nádorů pomocí směrovaných nanoterapeutik“, Týden vědy a techniky 2009, přednáška v Městské knihovně Praha l, 4.11.2009 16 1 Číslo 2 Akce 3 Pořadatel 4 Činnost Popularizační video o kultivaci řas 4 3d) J. Masojídek: Microalgal Symphony, YouTube, http://www.youtube.com/watch?v=fyEH2cEf7jo seznam titulů vydaných na pracovišti Folia Microbiologica (impaktovaný mezinárodní vědecký časopis, 6 čísel ročně, ISSN 0015-5632) 4. Činnost pro praxi 4a–1) výsledky spolupráce s podnikatelskou sférou a dalšími organizacemi získané řešením projektů Pořadové číslo: 1 Dosažený výsledek: Vývoj technologie výroby viru vztekliny v průmyslovém měřítku prostřednictvím submerzní kultivace buněčné kultury BHK-21, Uplatnění/Citace výstupu: Vývoj vakcíny proti vzteklině Název projektu /programu v češtině: TIP / FR-TI1/157 , (2009 – 2011) Název projektu/programu v angličtině: TIP / FR-TI1/157 , (2009 – 2011) Poskytovatel: Ministerstvo průmyslu a obchodu Partnerská organizace: Bioveta Ivanovice na Hané, spol. s.r.o., Pořadové číslo: 2 Dosažený výsledek: „Bioremediace a biotransformace difúzního znečištění perzistentními organickými polutanty v zemědělských půdách in situ a pevných odpadech Uplatnění/Citace výstupu: Kultivace mikroorganismů vhodných pro in-situ bioremediace znečištěných půd. Název projektu /programu v češtině: TANDEM / FT.TA 4/101, 2007 - 2010 17 Název projektu/programu v angličtině: TANDEM / FT.TA 4/101, 2007 - 2010 Poskytovatel: Ministerstvo průmyslu a obchodu Partnerská organizace: GEO Group a.s,. Vodní zdroje GLS Praha a.s., Vysoká Škola chemicko-technologická v Praze, Fakulta potravinářské a biochemické technologie 4a–2) 1 Číslo 1 2 3 výsledky spolupráce s podnikatelskou sférou a dalšími organizacemi získané na základě hospodářských smluv 2 3 Zadavatel Výsledek (anotace) BioGeoEko Kultivace vhodných mikroorganismů spol.s.r.o., Envisan GEM a.s., BV Plast s.r.o. Pharmaceutical Kultivace mikroorganismů Biotechnology s.r.o., EUCODIS Produkce beta-laktamas Bioscience GmbH, Austria, 4 Uplatnění Dekontaminační projekty Příprava potravinářských biodoplňků Vývoj a výroba nových antibiotik 4 AnalytiCon Discovery GmbH, Germany, Technologie růstu Streptomyces violaceoruber Biotechnologie 5 IEP GmbH, Germany, Optimalizace produkce oxidoreduktas Biotechnologie 6 BIOAXXESS, UK Optimalizace růstu E.coli pro potřeby imunobiologických testů Biotechnologie a imunologie 18 1 Číslo 7 2 Zadavatel Zentiva, k.s., 3 Výsledek (anotace) V rámci spolupráce je vyvíjen další z preparátů s protinádorovou aktivitou. V tomto projektu jde o kombinaci amidicky a hydrazonově vázaného doxorubicinu na N-(2hydroxypropyl)methakrylamidové (HPMA) kopolymery/onkopolymery. Výsledky in vivo testů jasně ukazují aditivní efekt u léčiva/doxorubicinu navázaného dvěma druhy kovalentní vazby. Biodistribuce, ale zejména intracelulární osud a intracelulární cíle léčiva navázaného různou kovalentní vazbou jsou různé a tím si lze vysvětlit vyšší účinek mix-onkopolymerů ve srovnání s mono-onkopolymery. Výsledky uvádí detailně „Výzkumná zpráva“, vydaná v Edici MACRO T-738 a předaná v polovině prosince 2009 objednavateli. 8 ProtEra s.r.l. – Siesto Fiorentino, Italie V rámci HS ProtEra, byly testovány možné protinádorové účinky Protinádorová terapie nových inhibitorů nebo antagonistů metaloproteináz na myších in vivo modelech kolorektálního karcinomu a melanomu. 9 ÚOCHB AV ČR, v.v.i. Na zvířecích experimentálních modelech roztroušené sklerózy na morčatech a indukované erythroleukémie virem Friendové na myších) byly ověřeny adjuvantní účinky nových derivátů muramylových glykopeptidů, které by do budoucna měli sloužit jako součást antivirových a protinádorových vakcín. Celkový počet získaných výsledků 9 19 4 Uplatnění Protinádorová terapie Protinádorová terapie 4a–3) nové firmy, které vznikly na základě výsledků činnosti pracoviště v oblasti aplikovaného výzkumu 1 Číslo 2 Název firmy 3 Důvod založení 4 Kategorie firmy 5 Činnost firmy nevznikly 4b) významné patenty, užitné vzory, vynálezy, licenční smlouvy, ochranné známky Pořadové číslo: 1 Název česky: Sekvence nukleotidů o velikosti 2646 bp, kódující penicilinacylázu, nové konstrukty rekombinantní nukleové kyseliny a rekombinantní mirkoorganismy nesoucí tuto sekvenci Název anglicky: Nucleotide sequence in length of 2646 bp encoding penicillin acylase, novel constructs of a recombinant nucleic acid and recombinant microorganisms carrying such sequence. Kategorie: prodej licence Zapsán pod číslem: 300467 Popis česky:.Konstrukt produkující penicilinacylázu ve velkém množství. Popis anglicky: Strain (construct) able to produce penicilinacylase in large scale. Využití: Uvedení na trh katalyzátoru Fermase PA 150 a zahájení realizace výsledků CZ patentu č. 300467 a PCT přihlášky WO 2009/016642 spolupracující farmaceutickou firmou Fermenta Biotech Ltd., Indie Datla A., Rajasekar V.W., Kyslik P., Bečka S., Krishnakant A.T., Yogesh Z.S., Nikunj K.: Process for the preparation of immobilized recombinant penicillin acylase catalyst from Achromobacter sp. CCM4824 expressed in E. coli BL21 CCM7394 and its use for the synthesi sof beta-lactam antibiotik. WO 2009/016642, 2 Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): dr. Pavel Kyslík, 296442777, [email protected] Pořadové číslo: 2 Název česky: Způsob výroby quercetin-3-β-D-glukopyranosidu za vzniku L-rhamnosy Název anglicky:Method of production of isoquercetin-3-β-D-glukopyranoside connected with L-rhamnose formation Kategorie: Přihláška vynálezu Zapsán pod číslem: PV 2009-720 20 Popis česky: Byla vyvinuta enzymová příprava nutraceutika isoquercitrinu byla optimalizována a rozpracována ve čtvrtprovozním měřítku (30 l). Pro tyto objemy vyvinuty fermentační procedury přípravy enzymu a též separační a purifikační procedury a byla podána patentová přihláška. Popis anglicky: Enzymatic method of isoquercetin-based nutraceutics was developed and optimized as well as cultivation procedure (30 l scale) and purification methods were described. Využití: L. Weignerová, V. Křen: Enzymatic processing of bioactive glycosides from natural sources. Topics Curr. Chem. in press (2010) Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): prof. Vladimír Křen, 296442510, [email protected] Pořadové číslo: 3 Název česky: Polymerní přípravek se synergickým účinkem při léčbě nádorových onemocnění. (Etrych, T., Ulbrich, K., Hovorka, O., Říhová, B.) Název anglicky: A synergically acting polymeric composition for treatment of cancer. Kategorie: český patent, podává Zentiva, a.s. Zapsán pod číslem: 301288 Popis česky: Vodorozpustný polymerní konjugát s navázaným kancerostatikem. Popis anglicky: Water-soluble polymeric conjugate containing cancerostatic. Využití: Léčba nádorových chorob Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): prof. Blanka Říhová, 296442345, [email protected] Pořadové číslo: 4 Název česky: Polymerní konjugáty paclitaxelu a docetaxelu s pH řízeným uvolňováním kancerostatika. Název anglicky: Polymeric conjugates of paclitaxel and docetaxel with pH-controlled release of cancerostatic. Kategorie: Přihláška vynálezu Zapsán pod číslem: PV 2009-85, zároveň je podána žádost o zahraniční patent Popis česky: Polymerní konjugáty taxolů se zvýšeným protinádorovým účinkem. Popis anglicky: Pomymeric taxol conjugates with enhanced antitumour effects. Využití: Léčba nádorových chorob. Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): prof. Blanka Říhová, 296442345, [email protected] Pořadové číslo: 5 Název česky: Průmyslový kmen Scenedesmus quadricauda SeIV+ VI zelené chlorokokální řasy Scenedesmus quadricauda (Turp.)Bréb. 21 Název anglicky: Industrial strain of Scenedesmus quadricauda SeIV+ VI of the chlorococcal alga Scenedesmus quadricauda (Turp.)Bréb. Kategorie: český patent Zapsán pod číslem: 300808 Popis česky: Kmen, který je schopen růstu ve vysokých koncentracích selenu v různých formách sloučenin. Kromě autotrofního růstu může růst i v bioreaktorech. Popis anglicky: Strain of alga Scenedesmus quadricauda capable of growth in the presence of elevated selenium concentrations. Cultivable under both autotrophic and heterotrofphic conditions. Využití: Například při výrobě selenem obohacené biomasy pro použití v humánní i veterinární medicíně. Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): dr. Vilém Zachleder, 384340480, [email protected] Pořadové číslo: 6 Název česky: Průmyslový kmen SeIV zelené chlorokokální řasy Scenedesmus quadricauda (Turp.) Bréb. Název anglicky: Industrial strain SeIV of chorococcal alga Scenedesmus quadricauda (Turp.) Bréb. Kategorie: český patent Zapsán pod číslem: 300861 Popis česky: Kmen, který je schopen růstu ve vysokých koncentracích selenu v různých formách sloučenin. Kromě autotrofního růstu může růst i v bioreaktorech. Popis anglicky: Strain of alga Scenedesmus quadricauda capable of growth in the presence of elevated selenium concentrations. Cultivable under both autotrophic and heterotrofphic conditions. Využití: Například při výrobě selenem obohacené biomasy pro použití v humánní i veterinární medicíně. Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): dr. Vilém Zachleder, 384340480, [email protected] Pořadové číslo: 7 Název česky: Průmyslový kmen Scenedesmus quadricauda SeVI zelené chlorokokální řasy Scenedesmus quadricauda (Turp.)Bréb Název anglicky: Industrial strain SeVI of of chorococcal alga Scenedesmus quadricauda (Turp.) Bréb. Kategorie: český patent Zapsán pod číslem: 300809 Popis česky: Kmen, který je schopen růstu ve vysokých koncentracích selenu v různých formách sloučenin. Kromě autotrofního růstu může růst i v bioreaktorech. Popis anglicky: Strain of alga Scenedesmus quadricauda capable of growth in the presence of elevated selenium concentrations. Cultivable under both autotrophic and heterotrofphic conditions. 22 Využití: Například při výrobě selenem obohacené biomasy pro použití v humánní i veterinární medicíně. Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): dr. Vilém Zachleder, 384340480, [email protected] Pořadové číslo: 8 Název česky: Submerzní kmeny Geosmithia spMK 583B, směs antrachinonových barviv jimi produkovaná Název anglicky: Submerged strain of Geosmithia spMK 583B and produced mixture of antraquinone dyes Kategorie: český patent Zapsán pod číslem: 300810 Popis česky: Způsob fermentace kmene a purifikace a isolace antrachinonových sloučenin. Popis anglicky: Method of strain fermentation and purification and isolation of antraquinone-based compounds. Využití: Barviva v potravinářském, kosmetickém a textilním průmyslu a v zemědělství. Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): dr. Miroslav Flieger, 296442319, [email protected] Pořadové číslo: 9 Název česky: Pseudacyclin a způsob indikace houby Pseudallescheria boydii Název anglicky: Pseudacycline and method of Pseudallescheria boydii fungus identification Kategorie: český patent Zapsán pod číslem: 300904 Popis česky: Identifikace houby na bázi produkovaných sekundárních metabolitů Popis anglicky: Identification of the fungus based on their secondary metabolites Využití: V medicíně jako standard pro diagnostiku způsobené choroby Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): Doc. Vladimír Havlíček, 296442749, [email protected] 4c) výsledky spolupráce se státní a veřejnou správou Pořadové číslo: Dosažený výsledek: Oblast uplatnění výsledku: Uživatel/Zadavatel: 23 4d) odborné expertizy zpracované v písemné formě pro státní orgány, instituce a podnikatelské subjekty 1 Číslo 2 Název 3 Příjemce/Zadavatel 4 Popis výsledku Nebyly Celkový počet zpracovaných expertiz 4e) 0 zapojení do monitorovacích sítí Pořadové číslo: 1 Objekt sledování česky: Česká technologická platforma pro užití biosložek v dopravě a chemickém průmyslu (J.Masojídek, zástupce MBU) Objekt sledování anglicky: Název sítě česky: Název sítě anglicky: Provozovatel: Důvody zapojení do monitoringu: Program: 24 5. Mezinárodní vědecká spolupráce pracoviště 5a) přehled mezinárodních projektů, které pracoviště řeší v rámci mezinárodních vědeckých programů Číslo 3 2 Název Název zastřešující programu organizace česky/anglicky (zkratka) 1. MŠMT KONTAKT 2. MŠMT KONTAKT 3. MŠMT KONTAKT 4. MŠMT KONTAKT 5. MŠMT KONTAKT 1 4 5 Název projektu česky/anglicky Koordinátor/řešitel česky/anglicky Indukce antimikrobiálních peptidů při salmonellové gastroenteritidě v závislosti na typu lipopolysacharidu / Induction of antimicrobial peptides in Salmonella-caused gastroenteritis in dependence on type of lipopolysacharide Kvasinky jako modelový organismus procesu stárnutí a apoptosy / Yeast: model organism of aging and apoptosis Tvorba stresových granulí na kvasinkvých mitochondriích / Stress granules assembly on yeast mitochondria Modifikace aminokyselin a jejich vliv ma stabilitu enzymových biokatalyzátorů / Amino acid modification and their influence on biocatalyst stability Úloha fototrofních bakterií v horských jezerech / Role of phototrophic bacteria in mountain 25 6 Spoluřešitel /počet 7 8 Stát(y) Aktivita Ing. Igor Šplíchal, CSc. ČR vědecká Doc. Ing. Alena Pichová, CSc. ČR vědecká Ing. Jiří Hašek, CSc. ČR vědecká Ing. Petr Halada, Ph.D. ČR vědecká Mgr. Michal Koblížek, Ph.D. ČR vědecká 1 Číslo 3 2 Název Název zastřešující programu organizace česky/anglicky (zkratka) 6. MŠMT KONTAKT 7. MŠMT KONTAKT 8. MŠMT KONTAKT 9. MŠMT COST 10. MŠMT COST 11. MŠMT COST 4 5 Název projektu česky/anglicky Koordinátor/řešitel česky/anglicky lakes Inovační postupy přípravy biosorbentů / Innovative methods in biososbent development Vzájemné vztahy mezi funkcí mitochondrií a stárnutím u kvasinek z pohledu molekulární a buněčné biologie / Interplay between mitochondrial function and aging in yeast: molecular and cell-biological approach Charakterizace T a B lymfocytů v Peyerských placích kyčelníku u prasete / Characterization of T and B lymphocytes in Ileal Peyers Patches of swine Kombinovaná chemická a enzymová syntéza komplexních multivalentních glykokonjugátů – cesty k novým materiálům a glykoterapeutikům / Combined chemical and enzymatic synthesis of complex multivalent Půdní houby jako zdroj enzymů pro funkcionalizaci polymerů / Soil fungi as a source of enzyme for the functionalization of polymers Silybin a jeho deriváty jako účinné anti angiogenní a chemoprotektivní 26 6 Spoluřešitel /počet 7 8 Stát(y) Aktivita RNDr. Jiří Gabriel, DrSc. ČR vědecká doc. Ing. Alena Pichová, CSc. ČR vědecká RNDr. Marek Šinkora, Ph.D. ČR vědecká Prof. Ing. Vladimír Křen, DrSc. ČR vědecká RNDr. Petr Baldrian, Ph.D. ČR vědecká Prof. Ing. Vladimír Křen, DrSc. ČR vědecká 1 Číslo 3 2 Název Název zastřešující programu organizace česky/anglicky (zkratka) 12. MŠMT COST 13. MŠMT COST 14. MŠMT COST 15. MŠMT EUREKA 16. MŠMT EUREKA 4 5 Název projektu česky/anglicky Koordinátor/řešitel česky/anglicky látky / Inhibitors of Angiogenesis: Design, Synthesis and Biological Exploitation Enzymy saprotrofních hub, využitelné pro zpracování lignocelulózy v biorafineriích / Enzymes for lignocellulose biorefineries from saprotrophic fungi Selektivní enzymové oxidace a deracemizace přírodních látek a biomolekul / Selective enzymatic oxidations and deracemizations of natural products and biomolecules Kaskádové chemoenzymatické reakce nitrilů / Cascade chemoenzymatic reactions of nitriles Využití spalinového oxidu uhličitého v produkčních kulturách řas / Use of carbon dioxide from flue gas for production of microalgae Výroba biopaliv z řas s vysokým obsahem škrobu a lipidů při využití spalinového oxidu uhličitého jako zdroje uhlíku / Production of biofuels from microalgae with a high content of starch and lipids 27 6 Spoluřešitel /počet 7 8 Stát(y) Aktivita RNDr. Petr Baldrian, Ph.D. ČR vědecká Prof. Ing. Vladimír Křen, DrSc. ČR vědecká Ing. Ludmila Martínková, CSc. ČR vědecká Ing. Petr Novák (Termizo) RNDr. Vilém ČR, GER Zachleder, CSc. / 3 vědecká Ing. Petr Novák (Termizo) RNDr. Vilém ČR, GER Zachleder, CSc. / 3 vědecká 5b) 1 Číslo 1 akce s mezinárodní účastí, které pracoviště organizovalo nebo v nich vystupovalo jako spolupořadatel 2 Název akce v češtině 3 Název akce v angličtině 4 Hlavní pořadatel akce česky/anglicky 2 Kaskádové reakce nitrilové skupiny 11. kongres ISDCI Cascade reactions on the nitrile group 11th Congress of the International Society of Developmental and Comparative Immunology, June 28-July 4, 2009, Prague 3 34. Kongres FEBS 34th FEBS Congress, 4.-9. červenec 2009 4 Kongres Mezinárodní společnosti pro oční záněty International Ocular Inflammatory Society (IOIS) Congress 2009, (Tlaskalová) MBÚ AV ČR ISDCI – International 391 / 371 Society of Developmental and Comparative Immunology Federation of European Biochemical Societies 28 5 Počet účastníků celkem/z toho z ciziny 26 / 9 6 Významná prezentace M. Bilej – předseda organizačního výboru, členové – H. Tlaskalová, M. Šinkora, P. Procházková Workshop WS 1: Nanotherapeutics (Říhová) Sympozium 1: Turnover an recognition of carbohydrates (Bezouška) Workshop WS 2 : Glycomic technologies (Bezouška) 1 Číslo 2 Název akce v češtině 5 Třetí Středo a východoevropská proteomická konference 6 Inhibitory angiogenese 7 3 Název akce v angličtině 4 Hlavní pořadatel akce česky/anglicky 30.5.-3.6.09, Praha 3rd Central and Eastern European Proteomic Conference, Budapest, 6.9.10.2009 Inhibitors of angiogenesis MBÚ AV ČR 5 Počet účastníků celkem/z toho z ciziny 6 Významná prezentace 31 / 12 Annual meeting IPODD Intestinal Proteases: Opportunities for Drug Discovery 15.7. – 18.7. Praha (Tlaskalová) 5c) výčet jmen nejvýznamnějších zahraničních vědců, kteří navštívili pracoviště AV ČR 1 Čísl o 1 Prof. V.J. Smith 2 Prof. K. Söderhäll 2 Jméno vědce 3 Význačnost vědce a jeho obor President, International Society of Developmental and Comparative Immunology“ Past-President „International Society of Developmental and Comparative Immunology“ 29 4 Mateřská instituce 5 Stát University of St. Andrews, Scotland UK Uppsala Universty Švédsko 1 Čísl o 3 4 2 Jméno vědce 3 Význačnost vědce a jeho obor 4 Mateřská instituce Indie Italie 15 13 17 Directory General, CSIR Vláda Indické republiky Přední odborník v oblasti průmyslové Università degli Studi della Tuscia mikrobiologie Viterbo Prof. Ivan Lefkovits Člen Dozorčí rady MBÚ AV ČR, v.v.i. Basel University Dr. Gary Kruppa vicepresident of Bruker Daltonics Bruker Daltonics Dr. Robert Norris R&D director Fonterra corporation Dalších 42 významných učenců, vesměs špiček v oboru mikrobiologie a imunologie Prof.Govindjee University Illinois Prof. K. Kuwano Nagasaki University Prof. G.Papageorgiu Inst.Demokritos Prof.W.Vredenberg, Univ.Wageningen Prof.I.Berman-Frank Bar Ilan University Dr. Christian Jeanthon CNRS Roscoff Dr.Josep Gasol Institut de Ciències del Mar, CMIMA, CSIC, Barcelona Dr. Sylwia Lew Univerzita Olsztyn Dr. Jean-Luc Pernodet Universita Paříž XI Prof. Michael Breitenbach University of Salzburg 18 19 Dr. Campbell W. Gourlay Prof. Anil Kumar Tripathi UK Indie 20 21 22 Prof. S. Michal Jazwinski, Prof. Mathias Sipicky Prof. Andreas Baumler 23 Mgr. Alessia Pepori 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 Prof. Samir K. Brahmachari Prof. Federico Federici 5 Stát University of Kent Banaras Hindu University, Varanasi Tulane University, New Orleans University of Debrecen University of California. Los Angeles Instituto per la Protezione delle Piante, Sesto fiorentino 30 Švýcarsko USA Nový Zéland USA Japonsko Řecko Nizozemí Israel Francie Španělsko Polsko Francie Rakousko USA Maďarsko USA Italy 1 Čísl o 24 Dr. Nicola D´Antona 25 26 Prof. Laura Cantarella Prof. Maria Cantarella 27 Dr. Linda G. Otten 28 Dr. Margit Winkler 29 30 31 32 Prof. Peter J. Derrick Dr. Gill Norris Prof. Andreas Rizzi Hirohide Uenishi 33 34 Hiroki Shinkai Yoshihiro Muneta 35 Bohuslav Dvořák 36 David Francis 37 David Zeman 2 Jméno vědce 3 Význačnost vědce a jeho obor 4 Mateřská instituce Institute of Biomolecular Chemistry, C.N.R., Catania University of Cassino, Cassino University of L´Aquila, Monteluco di Roio Biocatalysis & Organic Chemistry, Delft University of Technology, Delft Research Centre Applied Biocatalysis GmbH; Graz University of Technology, Graz Massey University Massey University University of Vienna National Institute of Agrobiological Science, Tsukuba STAFF Institute, Tsukuba National Institute of Animal Health, Tsukuba Department of Pediatrics, University of Arizona, Tucson, Arizona Department of Veterinary Science, South Dakota State University, Brookings, SD Department of Veterinary Science, South Dakota State University, Brookings, SD 31 5 Stát Itálie Italie Itálie Nizozemí Rakousko Nový Zéland Nový Zéland Rakousko Japonsko Japonsko Japonsko USA USA USA 1 Čísl o 38 Chris Chase 39 Feng li 40 Karl Klisch 41 Yori Gidron 42 Pramod Srivastava 43 Demetrios Spandidos 44 Antonio Gomez-Munoz 45 46 Antonio Sica William Paul 47 48 49 Ch. Galanos M. Freudenberg J. Mestecky 2 Jméno vědce 3 Význačnost vědce a jeho obor 4 Mateřská instituce Department of Veterinary Science, South Dakota State University, Brookings, SD Department of Veterinary Science, South Dakota State University, Brookings, SD Veterinary Faculty, University of Nottingham Research, Brunel University, Southall Center for Immunotherapy of Cancer and Infectious Diseases, University Cancer University of Crete and University Hospital, Heraklion Faculty of Science and Technology, University of the Basque Country, Bilbao Instituto Clinico Humanitas, Milan National Institute of Health, Bethesda Max Planck Institute Freiburg Max Planck Institute Freiburg Alabama University at Birmingham, Birmingham 32 5 Stát USA USA UK UK USA Řecko Španělsko Itálie USA Německo Německo USA 5d) 1 Číslo aktuální meziústavní dvoustranné dohody 2 Spolupracující instituce 3 Stát 4 Oblast (téma) spolupráce nejsou 6. Seznam citací k oddílu 2b), 2c), ev. 4a) 1 - Vojtova-Vodolanova, J., Basler M., Osicka R., Knapp O., Maier E., Cerny J., Benada O., Benz R., Sebo P. (2009) Oligomerization is involved in pore formation by Bordetella adenylate cyclase toxin. FASEB J. 23, 2831-2843. 2 - Groušl T., Ivanov P., Frýdlová I., Vašicová P., Janda F., Vojtová J., Malínská K., Malcová I., Nováková L., Janošková D., Valášek L., Hašek J. (2009) Robust heat shock induces eIF2α-phosphorylation-independent assembly of stress granules containing eIF3 and 40S ribosomal subunits in budding yeast S. cerevisiae. J. Cell Sci. 122, 2078-2088. 3 - R. Gažák, P. Sedmera, M. Vrbacký, J. Vostálová, Z. Drahota, P. Marhol, D. Walterová, V. Křen: Molecular mechanisms of silybin and 2,3-dehydrosilybin antiradical activity - role of individual hydroxyl groups. Free Rad. Biol. Med. 46, 745-758 (2009). 4 - Patrick Trouillas, Philippe Marsal, Alena Svobodová, Jitka Vostálová, Jan Hrbáč, Radek Gažák, Vladimír Křen, Roberto Lazzaroni, Jean-Luc Duroux, Petr Sedmera, Daniela Walterová: Mechanism of The Antioxidant Action of Silybin and 2,3-Dehydrosilybin Flavonolignans: A Joint Experimental and Theoretical Study. Journal of Physical Chemistry A. 112, 1054-1063 (2008). 5 - V. Křen, R. Gažák, K. Purchartová, P. Marhol, D. Biedermann, P. Sedmera: Chemoenzymatic preparative separation of silybin A and B. J.Mol. Catal. B: Enzymatic, 61, 247-251 (2009). 6 - D. Monti, R. Gažák, P. Marhol, D. Biedermann, K. Purchartová, M. Fedrigo, S. Riva, V. Křen, Enzymatic Kinetic Resolution of Silybin Diastereoisomers. J. Nat. Prod.. submitted 2009 7 - V. Křen, R. Gažák, P. Marhol, D. Monti, S. Riva: Způsob výroby opticky čistých stereomerů silybinu A a silybinu B. PV 2009-687, 21. 10. 2009 8 - Cajthaml T., Křesinová Z, Svobodová K., Möder M.: Biodegradation of endocrine disrupting compounds and suppression of estrogenic activity by ligninolytic fungi. Chemosphere 6 (2009) 745-750 9 - Tomala, J., Chmelová, H., Mrkvan, T., Říhová, B., Kovář, M.: In Vivo Expansion of Activated Naïve CD8+ T cells and NK Cells Driven by Complexes of IL-2 and Anti-IL-2 Monoclonal Antibody As Novel Approach of Cancer Immunotherapy.J. Immunol., 183, 4904-4912 (2009) 33 10 - Van Mooy, B.A.S., Fredericks, H.F., Pedler, B.E., Dyhrman, S.T., Karl, D.M., Koblížek, M., Lomas, M.W., Mincer, T.J., Moore, L.R., Moutin, T., Rappé, M.S., Webb, E.A.: Phytoplankton in the ocean use non-phosphorus lipids in response to phosphorus scarcity. – Nature 458, 69-72, 2009. 111 - Váchová L., Chernyavskiy O., Strachotová D., Bianchini P., Burdíková Z., Ferčíková I., Kubínová L., Palková Z. (2009) Architecture of developing multicellular yeast colony: spatio-temporal expression of Ato1p ammonium exporter. Environ Microbiol. 11, 1866-1877 12 - Petnicki-Ocwieja T., Hrncir T., Liua Y.-J., Biswasa A., Hudcovic T., Tlaskalova-Hogenova H., Kobayashia K.S.: Nod2 is required for the regulation of commensal microbiota in the intestine. PNAS 106, 15813-1518 (2009). 13 - Janata J. a kol. (2009) Způsob biotechnologické přípravy derivátů linkomycinu a použití kmene, přihláška vynálezu PV 2009-277 (Z7605), 14 - Janata J. a kol. (2009) Sekvence genového shluku kódující biosyntézu celesticetinu a její použití, přihláška vynálezu PV 2009-278 (Z7607) 15 - Ulanová D., Novotná. J., Smutná Y., Kameník Z., Gažák R., Šulc M., Kadlčík S., Plháčková K. Janata J. (2010) Mutasynthesis of lincomycin derivatives with activity against drug-resistant staphylococci, Antimicrob Agents Chemother (v tisku; únor 2010) 16 - Bojarová P., Křenek K., Wetjen K., Adamiak K., Pelantová H., Bezouška K., Elling L., Křen V. Synthesis of LacdiNAc-terminated glycoconjugates by mutant galactosyltransferase – A way to new glycodrugs and materials. Glycobiology 19, 509-517 (2009) 17 - Rihova, B.: Clinical experience with anthracycline antibiotics-HPMA copolymer-human immunoglobulin conjugates. Adv Drug Del Rev 61,1149 – 1158 (2009) 18 - Hujslová, M., A. Kubátová, et al. (2009). "Diversity of fungal communities in saline and acidic soils in the Soos National Natural Reserve, Czech Republic." Mycological Progress in press, 19 - Freeland, E., M. Kolarik, et al. (2009). "The Geosmithia causing thousand cankers disease of walnut is a new species." Phytopathology 99(6): S37-S37. 20 - Kolařík, M. and J. Hulcr (2009). "Mycobiota associated with the ambrosia beetle Scolytodes unipunctatus (Coleoptera: Curculionidae, Scolytinae)." Mycological Research 113(1): 44-60 21 - Jankowiak, R. and M. Kolařík (2009). "Fungi associated with the fir bark beetle Cryphalus piceae in Poland." Forest Pathology: in press 7. Popularizační a propagační činnost 7. Popularizační a propagační činnost 34 1 Číslo 2 Název akce 3 Popis aktivity 1 2 Týden vědy Exkurze do laboratoří Den otevřených dveří MBÚ Exkurze pro středoškoláky konané v průběhu roku, zejména v jarních měsících, cca dvojnásobná až trojnásobná účast ve srovnání s DOD 3 Popularizační článek Článek Baldrian P. (2009) Houby v lesní půdě a jejich ekologický význam. Živa 95: 150-152. 4 Popularizační článek 5 6 7 Popularizační článek Popularizační článek Popularizační článek 8 Televizní pořad 9 Rozhlasový pořad 10 Popularizační článek 11 Televizní pořad 12 Popularizační článek 13 Popularizační článek 14 Popularizační článek K.Bišová: „Řasa Chlamydomonas reinhardtii – novodobá chiméra“ Vesmír 12/2009 M.Koblížek - Ekonom, Český vědec v Sargasovém moři M.Koblížek - Lidové noviny, Co drží na uzdě plankton M.Koblížek - Technický týdeník, Naši vědci se účastní výzkumu oceánu M.Koblížek - ČT 1, Studio 6, Výzkum jednobuněčných řas a sinic J. Kopecký: Biodiesel z řas. Český rozhlas–Leonardo, pořad Mozaika věda, 2009. J. Kopecký: “Projekty Mikrobiologického ústavu AV ČR, v.v.i. ve spolupráci s Rakouskem“, popularizační článek v měsíčníku Třeboňský svět 11/2009 J.Masojídek, Budou se vyrábět biopaliva z řas? Milénium futurologický magazín České televize J.Masojídek, „Zelenivka“, popularizační článek v měsíčníku Třeboňský svět Hrubý, M., Chytil, P., Ulbrich, K., Koňák, Č., Filippov, S., Větvička, D., Říhová, B., Kučka, J.: Polymerní micely – perspektivní nosiče léčiv, Zdravotnické noviny Šíma, P.: Příroda nevytváří dokonalost. Zdravotnické noviny 4, 35 5 Spolupořadat el Střední školy ze Středočeskéh o kraje Živa 6 Datum a místo konání průběžně Vesmír Ekonom Lidové noviny Technický týdeník Česká televize 26.3.2009 5.3.2009 10.3.2209 11.3.2009 Český rozhlas Třeboňský svět 11/2009 Česká televize duben 2009 Třeboňský svět Zdravotnické noviny 09/2009 Zdravotnické 1 Číslo 2 Název akce 3 Popis aktivity 26-28, 2009 Šíma, P.: Civilizační nemoci aneb nemoci západního životního stylu. Lékařské listy 16, 3-5, 2009 B. Říhová: Optimismus mám v pracovní náplni, The BEST WOMAN 1/9-10:12-17, 2009 B. Říhová: Článek v Lidových novinách v příloze Věda a výzkum: B. Říhová „Myši měly klimatizaci dřív než já“, Fatrcová-Šramková, K., Máriássyová, M., Nůžková, J., Kropková, Z., Šíma, P.: Antiradikálová aktivita a flavonoidy vo vybraných druhoch včelieho pelu. Potravinárstvo 3,2009 B. Říhová: Chřipka očkovat nebo neočkovat? Doktoři ve zpovědnici: Nechali jste se očkovat proti chřipce? Magazín dnes 5 Spolupořadat el noviny Lékařské listy 15 Popularizační článek 16 Popularizační článek 17 Popularizační článek 18 Popularizační článek 19 Popularizační článek 20 Výstava české vědecké fotografie Mikrosvět - výstava autorů z různých vědeckých a Akademie věd pedagogických institucí ČR představuje převážně náměty z mikroskopických studií. Nabízí dokumentární i umělecké fotografie. Výstavu sestavila galeristka Bohumila Maříková a Petr Znachor a František Weyda z Biologického centra Akademie věd a Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity. 21 Rozhlasový pořad 22 Rozhlasový pořad 23 Televizní pořad M Gryndler se spoluautory: Seriál o houbách. Radio Leonardo (T. Urválková Celkem rozhovory s 13 pracovníky z oboru mykologie, biotechnologie nebo mikrobiologie B. Říhová: Český rozhlas 2, Meteor, “ Směrovaná léčiva“, redaktorka Jana Olivová. Dále bude tento pořad v rozšířené podobě vysílán na stanici Vltava. B. Říhová: ČT 1“Sama doma“, Jak ovlivňuje genetika náš život? 36 The Best Woman Lidové noviny 6 Datum a místo konání 8.9.2009 Potravinárstvo Magazín dnes 3.12.2009 Brusel, Národní divadlo v Praze Rádio Leonardo Český rozhlas 4.4.2009 Česká televize 25.3.2009 1 Číslo 2 Název akce 3 Popis aktivity 5 6 Spolupořadat Datum a místo el konání Česká televize 8.7.2009 24 Televizní pořad B. Říhová: Informace o 34. FEBS kongresu, ČT 24 25 Televizní pořad B. Říhová: ČT24 EKONOMIKA + (rubrika Století žen), pátek v pořadu „Před polednem“ (9.45), „ Studio ČT 24 (17.20)“ a „ Ekonomika 24 (21.50)“ Česká televize 30.10.2009 26 Televizní pořad Česká televize 26.10.2009 27 Popularizační článek Reflex 9.4.2009 28 Přednáška UJEP 29 Diskusní pořad 6.11.2009, Ústí nad Labem 19.11.2009, Brno 30 Křtiny B. Říhová: ČR1 „Sama doma“, pořad k novým způsobům léčby rakoviny, B. Říhová: Anketa: Osobnost – věda, RX č. 15/2009, (Holý, Bártek, Jirsák, Zahradník, Bičák, Bureš, Michl, Říhová,Wicherle). B. Říhová: Konference „Žena – tvůrčí osobnost 21. století“, přednáška v sekci „žena ve světě vědy“ B. Říhová: Kabinet HAVEL a „Česká vize“, diskuzní pořad, Divadlo Husa na provázku B. Říhová: Role kmotry knihy „Albína Dratvová-Deník 19211961, Scientific Diary“, Nakladatelství Academia, literární kavárna knihkupectví Academia. Divadlo Husa na provázku Academia 6.5.2009, Praha 8. Seznam ilustrací Oddíl: 2c / anotace 1 Název česky: Název anglicky: Popis česky:. Tvorba membránových membránových výběžků na erytrocytech, vyvolaná působením membránových pórů vytvářených adenylát cyklázovým toxinem. Obrázek z rastrovacího elektronového mikroskopu (zvětšeno 10 000 krát) 37 Popis anglicky: Scanning electron microscopy of erythrocyte swelling and formation of membrane projections induced by the poreforming activity of adenylate cyclase toxin Označení ilustrace: MBU_1 Oddíl: 2c / anotace 2 Název česky: Granule v kvasinkách vzniklé tepelným šokem. Název anglicky: Granules in yeast induced by heat-shock. Popis česky: Kvasinka Saccharomyces cerevisiae se používá nejenom v různých technologiích, ale také jako nejlepší modelový systém pro studium reakcí probíhajících v lidských buňkách. Při různých stresových situacích jsou klíčové bílkoviny v buňkách chráněny shlukováním do stresových granulí. Na obrázku pořízeném fluorescenčním mikroskopem je zobrazen vznik těchto granulí v kvasinkách působením teplotního stresu (zeleně svítí fúzní protein Pab1-GFP a červeně svítí fúzní protein eIF3a/Rpg1-RFP). Popis anglicky:Yeast microorganism Saccharomyces cerevisiae is frequently used not only in biotechnologies, but also in human medical research. The most important proteins aggregate under the stress conditions in the cell. The picture shows formation of the granules induced by heat-shock. Označení ilustrace:MBU_2 Oddíl: 2c / anotace 3 Název česky: Ostropestřec mariánský Název anglicky: Sylibium marianum Popis česky: Zdroj sylibinu a sylimarinu, látek užívaných v léčbě jaterních chorob Popis anglicky:The source of sylibin and sylimarin, compounds used in therapy of liver diseases Označení ilustrace: MBU_3 Oddíl: 2c / anotace 6 Název česky: Dr. Michal Koblížek diskutuje detaily experimentu. Název anglicky: Dr. Michal Koblížek in discussion on experimental approach details. Popis česky: 38 Popis anglicky: Označení ilustrace: MBU_6 Oddíl: 2c / anotace 7 Název česky: Kolonie kvasinek. Název anglicky: Yeast colony. Popis česky: Skupina kolonií kvasinky Saccharomyces cerevisiae. Pohled do kolonie zdola prostřednictvím konfokálního mikroskopu s 2-fotonovou excitací. Zelené oblasti kolonie jsou tvořeny buňkami, které obsahují jeden transportní protein (Ato1p) zbarvený jeho fúzí se zeleným fluorescenčním proteinem. Buňky ve středové černé části kolonie tento protein neobsahují Popis anglicky: The colony of S. cerevisiae yeast. Green parts of colonies are formed by cells containing Ato1p transport protein. Označení ilustrace: MBU_7 Oddíl: 2c / anotace 9 Název česky:. Název anglicky: Popis česky: Výzkumných prací se účastní i mladí doktorandi. Popis anglicky:.PhD students take part in the research projects. Označení ilustrace: MBU_19 Oddíl: 2c / anotace 10 Název česky: Syntéza látek 5 a 6. Název anglicky: Synthesis of compounds 5 and 6 Popis česky: UDP-GlcNAc byl nejprve epimerizován enzymově na UDP-GalNAc, a poté přenášen za katalýzy mutantní galaktosyltransferasou na cílový acceptor. Popis anglicky:. UPD-GlcNAc was first epimerized enzymatically to UDP-GalNAc, from which the GalNAc residue was transferred to the acceptor consisting of GlcNAc dimerized through a thiourea joining group to the flexible alkyl linker. Označení ilustrace: MBU_10 39 Oddíl: 2c / anotace 12 Název česky: Ořešák se symptomy choroby působené houbou Geosmithia. Název anglicky: Decaying Hinds' Black Walnut (Juglans hindsii) with symptoms of thousand cancer diseases, caused by Geosmithia sp. Popis česky: Popis anglicky: Označení ilustrace: MBU_12 Vyplnil dne: Jméno: 17. ledna 2010 dr. Jiří Gabriel tel.: 296442231 e-mail: [email protected] 40