zde - AUC
Transkript
zde - AUC
Malé studentské projekty Rozptyl primárních elektronů na atomech zalévacího media biologického materiálu u nízkonapěťového transmisního elektronového mikroskopu LV EM 5 Vedoucí projektu: Autor projektu: Mgr. David Kaftan, Ph.D. Mgr. Tomáš Bílý Cíl projektu Zjistit jakou vlastní strukturu vykazují jednotlivá zalévací media v LV TEM (LV EM 5) LV EM 5 vs rutinní standardní TEM: Nominální urychlovací napětí 5 kV Tloušťka řezu do 20 nm Max zvětšení 145.000× (360× a 400×) Rozlišovací schopnost 2,5 nm Není potřeba kontrastovacích činidel - dostatečný kontrast C pro C, N, O - závislost σ, ρ, t N0 σ T t A n I n e C 1 kde n0 n0 I 0 Malé rozměry, jednoduchý provoz Cíl projektu Zjistit jakou vlastní strukturu vykazují jednotlivá zalévací media v LV TEM (LV EM 5) Příprava biologického materiálu: Fixace – zastavení degradace Dehydratace – vakuum Prosycení zalévacím mediem EPON 812 (SPI), Spurr 4 složkové, epoxidové Krájení – LEICA Ultracut UCT Diamantové nože 35º s vibracemi a bez vibrací 45º Kontrast ~ Δt - změna povrchové morfologie LV EM, AFM Měřící přístroje: LV EM – Delong Instrument LV EM 5 – analogie zvětšeného stínu – 2,5 nm v X, Y AFM – Molecular Imaging Pico SPM – povrchová morfologie (přesné měření v ose XYZ) – poklepový mód (tapping) – 0,5 nm v ose X,Y a 0,05 v ose Z EPON a Spurr krájený 45º, 35º, 35º s vibr. Statistika z 12 snímků 1. Zobrazení povrchové morfologie v AFM Postup měření povrch. morfologie: Řezy na slídě – muskovit drsnost pod 0,1 nm Označení řezů lihovým fixem – Olympus CX41 Prohlížení AFM Poloha – Zeiss Jena, objektiv 10×, USB mikroskop Ednet 10× – 50× Poklepový mód, raménka E – 38 kHz a F – 125 kHz Rychlost skenování 91.553 nms-1 (3,1 řádků za sekundu) Plocha 3.072 × 3.072 nm na 1024 × 1024 px (1 px = 3 nm) 8 bit 1. Zobrazení povrchové morfologie v AFM Reprezentativní snímky: 35º bez vibrací EPON Spurr 35º s vibracemi 45º 1. Zobrazení povrchové morfologie v AFM Postup statistické analýzy obrazu (ImageJ a Matlab): 1. Odstranění šumu (despecle) – medián matice 3×3 (pepř a sůl) 2. Průměrování – matice 5×5 (eliminace vyšších frekvencí jasu) 3. Rotace obrazu 4. Výřez 900 × 500 px (1px = 3nm) 5. Analýza Matlabem (skript) – výšky a šířky výběžků ▪ průměr celého obrazu ▪ nalezení max. a min. 1. Zobrazení povrchové morfologie v AFM - Statistika 100 100 50 0 1. čtvrt. 4. čtvrt. Východ Západ Sever 50 0 1. čtvrt. 4. čtvrt. Východ Západ Sever Závislosti: Výška výběžků se zmenšuje s menším úhel břitu Šířka výběžků se zvětšuje s menším úhlem břitu Zkouška mikrotvrdosti dle Vickerse (vtlačování diamantového jehlanu) Zatěžovací síla F = 0,4905 N, rychlost zatěžování v = 50 µms-1 Epon MHv= 124,83 ± 1,6 MPa, Spurr MHv= 110,90 ± 1,3 MPa Tvrdší materiál, větší závislost výšky výběžků na úhlu břitu 2. Ultrastrukturální vzhled v LV TEM Postup analýzy obrazu (ImageJ a Matlab): 1. Odstranění šumu (despecle) – výstup hodnota pozadí (Lmin) 2. Odstranění pozadí – metoda „rolujícího míče“ 250 px 3. Průměrování – matice 5×5 4. Rotace obrazu 5. Inverze barev – stín 4. Výřez 700 × 500 px (1px = 3nm) 5. Analýza Matlabem (skript) – šířky výběžků 6. Výpočet kontrastu podle Michelsona L Lmin s časem není expozice konstantní K max Lmax Lmin největší odchylka 0,021 (2,1 %) Závislost kontrastu na expozičním čase a celkovém emisním proudu katody Kontrast K 0,14 0,12 0,10 0,08 0,06 0,04 0,02 0,00 0 20uA 23uA 26uA 29uA 31uA y = 0,0161Ln(x) - 0,0188 32uA 34uA 36uA 1000 2000 3000 Expoziční čas [m s] 4000 Aproximace 2. Ultrastrukturální vzhled v LV TEM Reprezentativní snímky: V klasickém TEM (> 100 kV) nelze zobrazit 35º bez vibrací EPON Spurr 35º s vibracemi 45º 3. Zhodnocení vlivu strukt. zalévacích medií na kontrast v LV TEM Graf šířek – koreluje s AFM – hodnoty jsou menší (úpravy obrazu, odchylka, skládání výš.) Graf kontrastu – nejednoznačná závislost (proměnné, celková šířka řezu) Celý 62,2 %, A 42,8 %, 11,0 % (Spurr) Graf šířek Graf kontrastu nm 1200 K [%] 20,0 18,0 1000 800 Šířka Min. Šířka Prům. 600 Šířka Med. 400 Šířka Max. 200 16,0 14,0 Kontrast Min. 12,0 10,0 8,0 Kontrast Prům. 6,0 4,0 Kontrast Max. Kontrast Med. 2,0 0,0 0 E 35° E 35° Vibr. E 45° S 35° Zalévací m edium S 35° Vibr. S 45° E 35° E 35° Vibr. E 45° S 35° Zalévací m edium S 35° Vibr. S 45° Děkuji za pozornost