veřejné výzkumné instituce v roce 2007 a hlavní dosažené

Transkript

Dotazník
Základní údaje o činnosti pracoviště AV ČR – veřejné výzkumné instituce v roce 2007 a hlavní dosažené
výsledky – I. Textová část
Název pracoviště: Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Zkratka pracoviště:
MBÚ AV ČR, v. v. i.
IČ: 61388971
1. Vědecká (hlavní) činnost pracoviště a uplatnění jejích výsledků
a)
stručná charakteristika vědecké (hlavní) činnosti pracoviště
Česky: Mikrobiologický ústav AV ČR je jednou z hlavních vědeckých institucí v České republice, která se komplexně zabývá základním
výzkumem v oboru mikrobiologie. Hlavní výzkumné oblasti jsou biochemie, fyziologie, molekulární genetika bakterií, kvasinek a
vláknitých hub, mikroskopických řas a témata imunologická. V rámci těchto oblastí jsou podrobně studovány otázky produkce biologicky
aktivních látek, enzymů, regulační mechanizmy v řízení diferenciace růstu mikroorganizmů, mechanizmy podílející se na přenosu a
modifikaci DNA, degradační aktivity mikroorganizmů, fotosyntetický systém, vývojové aspekty imunity, patologie a léčba autoimunitních
onemocnění a imunologie onemocnění nádorových.
1
Anglicky: Institute of Microbiology, Academy of Sciences of the Czech Republic, v.v.i., is one of the major scientific institutions in the
country that systematically pursues basic research in microbiology. The main research areas are biochemistry, physiology and molecular
genetics of bacteria, yeasts, filamentous fungi and microscopic algae, and immunological disciplines. Within the framework of these
areas, detailed research is conducted into the problems of production of biologically active substances, enzymes, regulatory
mechanisms controlling the differentiation and growth of microorganisms, photosynthetic machinery, evolutionary aspects of immunity,
pathology and treatment of autoimmune diseases and modern methods for the therapy of tumors.
b)
výčet několika nejdůležitějších výsledků vědecké (hlavní) činnosti a jejich aplikací
1
Pořadové číslo
2
Výsledek
3
Kategorie výstupu
1
Spektrum cytokinů v mléku a kolostru
badatelský
2
Velké propeptidy plísňových β-N-acetylhexosaminidas jsou
novými regulátory enzymů, které musí být intracelulárně
odštěpené aby mohly participovat na aktivaci, dimerizace a
sekreci mateřských enzymů
cílený
2
4
Citace výstupu
Kverka M., Burianová J.,
Lodinová-Žádníková R.,
Kocourková I., Cinová J.,
Tučková L., TlaskalováHogenová H. Cytokine profiling
in human colostrum and milk by
protein array. – Clin. Chem.
53, 955-62, 2007
Plíhal O., Sklenář J.,
Hofbauerová K., Novák P., Man
P., Pompach P., Kavan D.,
Ryšlavá H., Weignerová L.,
Charvátová-Pišvejcová A., Křen
V., Bezouška K.: Large
propeptides of fungal β-Nacetylhexosaminidases are
novel enzyme regulators that
must be processed
1
Pořadové číslo
3
2
Výsledek
3
Kategorie výstupu
Nový typ oxidasy u hub
c)
badatelský
anotace nejdůležitějších výsledků vědecké (hlavní) činnosti
3
4
Citace výstupu
intracellularly to control activity,
dimerization, and secretion into
the extracellular environment. –
Biochemistry 46, 2719-2734,
2007, Ettrich R., Kopecký V. Jr.,
Hofbauerová K., Baumruk V.,
Novák P., Pompach P., Man P.,
Plíhal O., Kutý M., Kulik N.,
Sklenář J., Ryšlavá H., Křen V.,
Bezouška K. Structure of the
dimeric N-glycosylated form of
fungal beta-Nacetylhexosaminidase revealed
by computer modeling,
vibrational spectroscopy, and
biochemical studies. – BMC
Structural Biology 7, 32, 2007
Daniel G., Volc J., Filonova L.,
Plíhal O., Kubátová E., Halada
P. : Characteristics of alcohol
oxidase from the fungus
Gloeophyllum trabeum, an
extracellular source of H2O2 in
brown rot decay of wood. –
Appl. Environ. Microbiol., 73
(19) 6241–6253, 2007
Pořadové číslo anotace: 1
Název česky: Spektrum cytokinů v mléku a kolostru
Název anglicky: Cytokine spectra in human milk and colostrum
Popis výsledku česky: Mateřské mléko a kolostrum obsahuje nejen řadu živin, ale i imunologicky aktivních faktorů, které hrají velkou roli
v rezistenci novorozence proti infekci a vývoji jeho imunitního systému. Snažili jsme se určit cytokinové spektrum mateřského mléka
pomocí moderní multiplexové proteinové metody – protilátkového mikročipu. Množství jednotlivých cytokinů a jejich spektrum
vykazovalo interindividuální variabilitu charakteristickou pro produkty sliznic a exokrinních žláz. Nalezli jsme 32 cytokinů, které
v mateřském mléku dosud nikdo nepopsal. Některé z těchto cytokinů by se mohly podílet na vyzrávání střevního imunitního systému,
(např. chemokiny PARC/CCL18, MIP-3alfa/CCL20, BLC/CXCL13), překvapující byl nález růstových faktorů, které ovlivňují vývoj
nervového systému (např. brain-derived neurotrophic factor, Neurotrophin-3 a 4).
Popis výsledku anglicky: Human colostrum and milk contains a number of components influencing the development of the child. We used
protein microarray to determine the cytokine profile of human milk and colostrum. There was considerable variability in cytokine
concentration and spectra among individual mothers typical for biologically active components of mucosal and exocrine gland secretions.
We found 32 cytokines that have not been described in human colostrum or milk before. Some of those cytokines might be important for
the intestinal immune system development (eg. PARC/CCL18, MIP-3alfa/CCL20, BLC/CXCL13). Interistingly we found several growth
factors known to influence the nervous system development (eg. brain-derived neurotrophic factor, Neurotrophin-3 and 4).
Kategorie výstupu: badatelský
Citace výstupu: Kverka M., Burianová J., Lodinová-Žádníková R., Kocourková I., Cinová J., Tučková L., Tlaskalová-Hogenová H.
Cytokine profiling in human colostrum and milk by protein array. – Clin. Chem. 53, 955-62, 2007
Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): Miloslav Kverka, 29644 2452, [email protected]
Název česky: Velké propeptidy plísňových β-N-acetylhexosaminidas jsou novými regulátory enzymů, které musí být intracelulárně
odštěpené aby mohly participovat na aktivaci, dimerizace a sekreci mateřských enzymů
Název anglicky: Large propeptides of fungal β-N-acetylhexosaminidases are novel enzyme regulators that must be intracellularly
processed to control activity, dimerization, and secretion into the extracellular environment
Popis výsledku česky: V laboratoři byla dokončena charakterizace unikátních propeptidů plísňových hexosaminidas. Propeptidy nejsou
v případě těchto enzymů degradovány, ale musí být odštěpeny v endoplasmatickém retikulu od svých mateřských molekul, aby mohly
regulovat enzymatickou aktivaci, dimerizaci katalytických podjednotek a sekreci dimerního enzymu do extracelulárního prostředí. Tento
mechanismus je aktivně využíván vláknitou houbou Aspergillus oryzae CCF1066 pro regulaci aktivity hexosaminidasy dle okamžité
4
potřeby. Výsledky byly publikované ve dvou významných článcích, z nichž jeden získal ocenění jako „Hot Article“ od American Chemical
Society (největší odborná profesní společnost na světě), druhý získal ocenění „Highly Accessed“.
Popis výsledku anglicky: We have finished the characterization of unique propeptides of fungal hexosaminidases. These are not
degraded but must be processed in the endoplasmic reticulum in order to be able to regulate the activity, dimerization, and secretion of
the parent enzyme. The mechanism is actively employed by the fungus Aspergillus oryzae CCF1066 for the regulation of the activity of
hexosaminidase depending on the individual stages of its life cycle. The results have been Publisher in two principal papers, one of which
has been selected as „Hot Article“(1) by the American Chemical Society, the second has been rated „Highly Accessed“ (2) by the
Internet Journal BMC Structural Biology.
Kategorie výstupu: cílený
Citace výstupu: Plíhal O., Sklenář J., Hofbauerová K., Novák P., Man P., Pompach P., Kavan D., Ryšlavá H., Weignerová L.,
Charvátová-Pišvejcová A., Křen V., Bezouška K.: Large propeptides of fungal β-N-acetylhexosaminidases are novel enzyme regulators
that must be processed intracellularly to control activity, dimerization, and secretion into the extracellular environment. Biochemistry 46,
2719-2734, 2007, Ettrich R., Kopecký V. Jr., Hofbauerová K., Baumruk V., Novák P., Pompach P., Man P., Plíhal O., Kutý M., Kulik N.,
Sklenář J., Ryšlavá H., Křen V., Bezouška K. Structure of the dimeric N-glycosylated form of fungal beta-N-acetylhexosaminidase
revealed by computer modeling, vibrational spectroscopy, and biochemical studies. – BMC Structural Biology 7, 32, 2007
Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): Karel Bezouška, 29644 2142, [email protected]
Název česky: Nový typ oxidasy u hub
Název anglicky: New type of oxidase in fungi
Popis výsledku česky: Bylo prokázáno, že v oxidativních enzymových mechanismech degradace dřeva houbou hnědé hniloby
Gloeophyllum trabeum má významnou úlohu nový typ alkoholoxidasy sloužící jako hlavní extracelulární zdroj H2O2, komponenty
Fentonova reagens pro produkci vysoce destruktivních hydroxylových radikálů. Narozdíl od dosud známé lokalizace v peroxisomech
kvasinek je tento enzym sekretován do periplasmatického prostoru houbových hyf a imobilizován na extracelulárních membránových a
polysacharidových strukturách. Za jeho odlišnou translokaci je zřejmě odpovědna unikátní C-terminální signální sekvence. Substrátem
s nejvyšší kcat/Km je metanol, potenciálně dostupný z demetylace ligninové složky dřeva.
Popis výsledku anglicky: In oxidative enzyme mechanisms involved in wood brown rot by the fungus Gloeophyllum trabeum, an important
role was attributed to a novel alcohol oxidase serving as a major source of H2O2, a component of Fenton’s reagent for production of
highly destructive hydroxyl radicals. This enzyme is secreted into periplasmic space of fungal hyphae and imobilized on extracellular
membraneous and polysaccharide structures. The differences in the enzyme targeting compared to the known yeast peroxisomal
5
localization were traced to a unique C-terminal sequence of the oxidase, which is apparently responsible for the protein’s different
translocation. Methanol, potentially available from the demethylation of wood lignin, was estimated as a substrate with the highest kcat/Km
value.
Citace výstupu: Daniel G., Volc J., Filonova L., Plíhal O., Kubátová E., Halada P. : Characteristics of alcohol oxidase from the fungus
Gloeophyllum trabeum, an extracellular source of H2O2 in brown rot decay of wood. – Appl. Environ. Microbiol., 73 (19) 6241–6253, 2007
Kontaktní osoba (jméno, telefon, e-mail): Jindřich Volc, 29644 2298, [email protected]
d)
1
Číslo
1
2
3
4
5
6
7
nejvýznamnější popularizační aktivity pracoviště
2
Název akce
Profilový článek o
ústavu v
mezinárodním
časopise
Film
Nebezpečný virus,
Země bakterií,
Mrazivá naděje
(P. Šíma)
Celiakie (H.
Tlaskalová)
Článek (H.
Tlaskalová)
Na spolupráci stavím
celý náš výzkum (H.
Tlaskalová)
Křeslo pro Fausta“
(H. Tlaskalová)
3
Popis aktivity
5
Pořadatel
6
Datum a místo konání
Popis historie a současnosti ústavu včetně
nejdůležitějších výsledků
Scientific American
Červenec-srpen 2007,
str.54-55
Popularizační DVD o ústavu (v české i anglické
verzi)
překlady
Cittadella s.r.o.
2007
ČT
Celý rok
TV pořad
ČT 24
3.6.2007
Článek
časopis Generace
Článek
Zdravotnické noviny
5.11.2007
Vystoupení v pořadu „Křeslo pro Fausta“
1.LF UK
4.5.2007
6
1
Číslo
2
Název akce
3
Popis aktivity
5
Pořadatel
6
8
pravidelná
vystoupení (H.
Tlaskalová)
Pravidelná činnost pro Sdružení pacientů s celiakií: SPC
přednášky, pohovory s pacienty, testování sér
rodinných příslušníků
9
Vystoupení v pořadu
„Vstupte“ ( H.
Tlaskalová)
Vystoupení (I.
Trebichavský)
Přednáška (I.
Trebichavský)
Hostitel a mikroflóra“
(I. Šplíchal)
Praktika pro studenty
(I. Šplíchal)
Článek
(B. Říhová)
Sama doma (B.
Říhová)
Dobré časy (B.
Říhová)
Rozhovor
ČRo Leonardo
25.1.2007
Infekční imunita
ČRo Leonardo
opakovaně
Přednáška pro veřejnost
6.9.2007
Vývoj léku
galerie H, Kostelec
n.Č.l
Jiráskovo gymnázium
Náchod
Jiráskovo gymnázium
Náchod
Víkend, příloha
Magazinu novin
ČT 1
Rozhovor
radio Classic FM
7. 4. 2007
8. 4. 2007
11.4. 2007
Den imunologie (B.
Říhová)
Imunogenetika (B.
Říhová)
Třetí rozměrpovídání o vědě (B.
Vystoupení v pořadu Sama doma
ČT
29.4.2007
Vystoupení v pořadu Sama doma
ČT
23.4.2007
Rozhovor
ČRo Leonardo
15.6.2007
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
Přednáška pro studenty
Praktika pro studenty
Vývoj léku
7
Celý rok
4.6.2007
20.6.2007
22. 1. 2007
29. 1. 2007
1
Číslo
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
2
Název akce
Říhová)
Portréty (B. Říhová)
Všechnopárty (B.
Říhová)
Dobré časy (B.
Říhová)
Rozhovor
s Václavem
Moravcem (B.
Říhová)
Rozhovor
s Václavem
Moravcem (B.
Říhová)
Lidové novinyrubrika Siesta (B.
Říhová)
„Osudy“ (B. Říhová)
„Vakcina proti
karcinomu děložního
čípku“ (B. Říhová)
Dobré ráno s ČT (B.
Říhová)
Vývoj nového léčiva
(B. Říhová)
Podzimní škola
VŠCHT 2007 (B.
Říhová)
Literární pořad “333”
3
Popis aktivity
5
Pořadatel
6
Zahraniční vysílání českého rozhlasu
Vystoupení
ČRo 7
ČT 1
23. 6. 2007
26. 6. 2007
Rozhovor
Rádio Classic FM
21.6.2007
Rozhovor
Rádio Impuls
21.6.2007
Rozhovor
Rádio Impuls
27.6.2007
Článek
Lidové noviny
10.7.2007
3 půlhodinové relace
Edukační DVD
ČRo Vltava
GlaxoSmithKline
říjen 2007
září 2007
Komentář k oznámení o novém imunostimulačním
postupu, uveřejněném v časopise News Scientist
Dvousemestrální vzdělávací kurz ve farmaceutické
medicině 2007/2008
Článek: Polymerní protinádorová léčiva: struktura a
mechanismus působení
ČT
21.9.2007
UK
2007/2008
VŠCHT
23.10.2007
ČT
22.12.2007
Vystoupení
8
1
Číslo
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
2
Název akce
(B. Říhová)
Vývoj
protinádorového
léčiva (B. Říhová)
„Evropa loví mozky”
(M. Kovář)
“Otevřená věda”
V. Šašek, J. Brožek,
I. Prokopová, J.
Náhlík: Použití hub
a techniky
kompostování pro
zjišťování biologické
rozložitelnosti plastů
Den otevřených
dveří MBÚ
„Třetí dimenze“ (M.
Gryndler)
Popularizační
přednášky (P. Šebo,
L. Valášek)
Proč jsou rostliny
zelené? (O. Prášil)
Plankton – zbraň
proti oteplování? (O.
Prášil)
Hledání nových léků
z řas a sinic (J.
3
Popis aktivity
5
Pořadatel
6
Návštěvní den významných osobností
Gymnázium Arabská
Článek
Hospodářské noviny
Spolupráce se středoškolskými studenty
Popularizační publikace
MBÚ
Zahradnictví
2007
2007
Prezentace laboratoří pro návštěvníky
MBU
7.11.2007
Proč rostliny opustily poklidné vodní prostředí a
začaly kolonizovat souš?
6 popularizačních přednášek na VŠ
ČRo Leonardo
18.10.2007
UK
2007
Přednášky v rámci cyklu Týdne vědy a techniky 2007
19.11.2007
5.11., 8.11.2007
Článek
Lidové noviny
6.10.2007
Pořad Mozaika věda
ČRo Vltava
22.11.2007
9
1
Číslo
42
43
44
45
46
47
48
49
2
Název akce
Kopecký)
Rozvoj vědy a
výzkumu
v mikroregionu
Třeboňsko –
Novohradsko (J.
Masojídek)
“Genomika-věda 21.
století” (O. Benada,
J. Janata)
„Mykotoxiny“ (V.
Havlíček, M. Flieger)
Rezistence na
antibiotika trochu
jinak (J. Spížek)
Galapágy houbové
říše (M. Kolařík)
Mykologem proti své
vůli? (M. Kolařík, J.
Weiser)
Molekulární biologie
a mykologie (M.
Kolařík)
Novinky ze 7.
mezinárodního
mykologického
kongresu v Cairns
(M. Kolařík, O.
Koukol)
3
Popis aktivity
5
Pořadatel
6
Článek
měsíčník Třeboňský
svět
12/2007
Krátký film na DVD z cyklu Otevřená věda
2007
Natáčení pořadu ČT1 Planeta věda
Akademie věd ČR a
firma All in Agency,
spol.s.r.o.
ČT 1
12/2007
Článek
Vesmír
12/2007
Článek
Vesmír
2007
Článek
Mykologické listy
2007
Článek
Mykologické listy
2007
Článek
Mykologické listy
2007
10
1
Číslo
50
2
Název akce
Život v Jaderském
moři u ostrovů Badija
a Korčula (Z. Žižka)
Enzymový proces
jako ekologicky
šetrná alternativa
chemické syntézy
beta-laktamových
antibiotik (P. Kyslík)
Vedení biologického
kroužku (Z. Žižka)
51
52
e)
1
Číslo
3
Popis aktivity
5
Pořadatel
6
Článek
Akvárium - terárium
2007
Přednáška
ESF
2007
Teraristika
Dům dětí a mládeže
v Neratovicích
2007
domácí a zahraniční ocenění zaměstnanců pracoviště
2
Jméno oceněného
3
Druh a název ocenění
4
Oceněná činnost
1
2
Prof. RNDr. Blanka Říhová, DrSc.
MUDr.Pavel Rossmann, DrSc.
medaile
čestné členství
za zásluhy
3
RNDr. Petra Procházková, PhD.
cena
za nejlepší publikaci mladých
vědců
4
Prof. MUDr. Helena Tlaskalová, DrSc.
zahraniční člen
5
RNDr. Petr Šíma, CSc.
výroční cena 2007
6
RNDr. Ilja Trebichavský, CSc.
výroční cena 2007
11
za seriál článků „Horizontální
přenos genetické informace“
za seriál článků „Horizontální
přenos genetické informace“
5
Ocenění udělil
1.LF UK
Česká nefrologická
společnost
Česká imunologická
společnost
Royal Society of
Arts and Science in
Goteborg
časopis Živa
Časopis Živa
1
Číslo
2
Jméno oceněného
3
Druh a název ocenění
7
Plíhal O., Sklenář J., Hofbauerová K., Novák
P., Man P., Pompach P., Kavan D., Ryšlavá
H., Weignerová L., Charvátová-Pišvejcová A.,
Křen V., Bezouška K
Hot Article
8
Ettrich R., Kopecký V. Jr., Hofbauerová K.,
Baumruk V., Novák P., Pompach P., Man P.,
Plíhal O., Kutý M., Kulik N., Sklenář J.,
Ryšlavá H., Křen V., Bezouška K.
Highly Accessed
9
10
RNDr.Tomáš Cajthaml, PhD.
RNDr. Václav Šašek , CSc.
Prémie Otto Wichterle
Patočkova medaile
11
Mgr. Gabriela Novotná
cena
12
RNDr. Miroslav Šulc, PhD.
nejlepší poster na
konferenci 1st Central
and Eastern European
Proteomic Conference,
3rd Czech Proteomic
Conference
12
4
Oceněná činnost
5
Ocenění udělil
Large propeptides of fungal β-Nacetylhexosaminidases are
novel enzyme regulators that
must be processed intracellularly
to control activity, dimerization,
and secretion into the
extracellular environment.
Structure of the dimeric Nglycosylated form of fungal betaN-acetylhexosaminidase
revealed by computer modeling,
vibrational spectroscopy, and
biochemical studies
za zásluhy o mikrobiologii
Cena pro nelepšího českého a
slovenského mladého
mikrobiologa za rok 2006
Peslova K, Obsil T, Novak P,
Sulc M: Application of chemical
cross-linking and mass
spectrometry for the 14-3-3
dimer interactome elucidation
AVČR
Československá
mikrobiologická
společnost
Československá
společnosti
mikrobiologická
f)
další specifické informace o pracovišti
Za podpory programu příhraniční spolupráce INTERREG byly vybudovány nové laboratorní prostory v detašovaném pracovišti MBÚ
v Třeboni (Sektor autotrofních mikroorganismů).
2. Vědecká a pedagogická spolupráce pracoviště s vysokými školami
a)
1
Číslo
1
nejvýznamnější vědecké výsledky pracoviště vzniklé ve spolupráci s vysokými školami (kromě výsledků uvedených
v bodě 2 b)
2
Popis výsledku včetně uplatnění
Girardia intestinalis je prvok
způsobujícínejběžnější průjmové onemocnění
parazitárního původu na světě.
Nejzajímavějším rysem tohoto prvoka je
přítomnost dvou morfologicky podobných
jader, o kterých se předpokládalo že jsou
identická, přestože jejich karyotyp byl
neznámý. Prokázali jsme, že v rámci jediné
buňky se jádra odlišují v počtu i velikosti
chromozómů a že představitelé dvou hlavních
genetických skupin G. intestinalis obsahují
různé karyotypy. Lichý počet ukazuje na
aneuploidii jader Girardie a jejich stabilní
3
Forma spolupráce
Vícezdrojové financování
(GAAV, GAČR, MŠMT)
13
4
Spolupracující VŠ
1. LF UK Praha
5
Kategorie výstupu
badatelský
1
Číslo
2
3
Forma spolupráce
4
5
Kategorie výstupu
výskyt poukazuje na dlouhodobou asexualitu
polootevřeného typu při mitóze Girardií, která
vylučuje výměnu chromozómů mezi jádry.
Rozdíly v karyotypu a obsahu DNA a
asynchronicita buněčného cyklu prokazují
rozdíly mezi dvěma jádry Girardií.
2
3
Studovali jsme efekty probiotických bakterií
(GAAV, GAČR)
v experimentu i klinice. Zjistili jsme, že
probiotické kmeny E. coli (Nissle a E. coli O83)
a Lactobacillus casei snižují intenzitu střevního
zánětu vyvolaného experimentálně v Balb/c
myších (Kokešová a spol.). V klinické studii
jsme u dětí prokázali terapeutický efekt
Lactobacillus acidophilus a reuteri při průjmech
způsobených rotavirovou infekcí (Tláskal a
spol). Podíleli jsme se na studiu cytokinového
spektra u pacientu s diebetem 1. typu a jejich
příbuzných pomocí komerčně dostupného
protilátkového mikročipu. Nalezli jsme rozdíly
v cytokinovém spektru produkovaném krevními
monocyty zdravých lidí, pacientů s diabetem 1.
typu a jejich příbuzných. Tento typ
multiplexové analýzy může být použit ke
sledování stavu imunitního systému pacientů
s diabetem 1. typu na terapii a k určení
imunologicky riskantního spektra cytokinů u
jejich příbuzných. (Vrábelova a spol.)
In vitro působení glykokonjugátů na nádorové
14
2. LF UK Praha
badatelský
PřF UK Praha
badatelský
1
Číslo
2
3
Forma spolupráce
4
5
Kategorie výstupu
buněčné linie odvozené od chronické myeloidní (GAAV, GAČR, MŠMT)
leukémie a karcinomu tračníku se projevilo
významnou inhibicí mRNA exprese proliferačního
znaku Ki-67. V závislosti na typu linie použité
konjugáty regulovaly mRNA expresi
glykosyltransferáz GnT III a GnT V ve prospěch
snížení metastatického potenciálu nádorových
buněk.
LF UP Olomouc
4
Současný trend neurobiologického výzkumu
(GAČR, GAAV)
poruch chování je vázaný na abnormality v
přenosu signálu receptory vázanými na Gproteiny. In vitro sledování vlivu různých
antidepresiv na expresi alfa subjednotky Gproteinů a postsynaptické změny u C6 gliomové
linie a lidských NK buněk ukázalo na podobnosti
v jejich odpovědi na tyto léčiva. To znamená, že
reakce buněk nervového a imunitního systému
má jisté společné charakteristiky, které se mohou
podílet na rozvoji nemoci. Naše počáteční
výsledky sledování změn v distribuci
lymfocytárních subpopulací naznačují, že buňky
NK a exprese C-typu lektinových receptorů
(CD161, NKG2D) na jejich povrchu se
významnou měrou podílí na patogenezi
roztroušené sklerózy.
1.LF UK Praha
badatelský
5
Na myším experimentálním modelu B16F10
Katedra biofyziky, 3.LF UK,
badatelský
15
1
Číslo
6
2
3
Forma spolupráce
4
(GAČR, GAAV)
melanomu byly analyzovány účinky lokální
o
mikrovlnné hypertermie (LHT, 42 C) a zapojení
stresových proteinů (HSP72 a gp96). Fenotypová
a funkční charakteristika lymfocytů infiltrujících
nádor a jeho vaskularita byly studovány pomocí
konfokální mikroskopie. LHT vyvolává změny v
expresi HSP70, zvýšení senzitivity nádorových
buněk k NK buněčné cytotoxicitě a transport
aktivovaných monocytů (CD11b+CD69+) do
nádoru.
Praha; ČVUT, Praha; FgÚ
AVČR, Praha
Velké propeptidy plísňových β-Nacetylhexosaminidas jsou novými regulátory
enzymů, které musí být intracelulárně
odštěpené aby mohly participovat na aktivaci,
dimerizace a sekreci mateřských enzymů.
V laboratoři byla dokončena charakterizace
unikátních propeptidů plísňových
hexosaminidas. Propeptidy nejsou v případě
těchto enzymů degradovány, ale musí být
odštěpeny v endoplasmatickém retikulu od
svých mateřských molekul, aby mohly
regulovat enzymatickou aktivaci, dimerizaci
katalytických podjednotek, a sekreci dimerního
enzymu do extracelulárního prostředí. Tento
mechanismus je aktivně využíván vláknitou
houbou Aspergillus oryzae CCF1066 pro
regulaci aktivity hexosaminidasy dle okamžité
PřF UK Praha
(GAČR, GAAV)
16
5
Kategorie výstupu
badatelský
1
Číslo
2
3
Forma spolupráce
4
5
Kategorie výstupu
potřeby. Výsledky byly publikované ve dvou
významných článcích, z nichž jeden získal
ocenění jako „Hot Article“ od American
Chemical Society (největší odborná profesní
společnost na světě), druhý získal ocenění
„Highly Accessed“.
7
8
Substituované calix(4)areny jsou důležitými Vícezdrojové financování
stimulátory protinádorové imunitní odpovědi (GAČR, GAAV)
závislé na přirozených zabíječských buňkách.
V laboratoři byly ve spolupráci s Laboratoří
biotranformací a Laboratoří přirozené buněčné
imunity MBÚ AV ČR v.v.i. charakterizovány
cílové receptory a imunomodulační aktivity
calix(4)arenových derivátů. Calix(4)arenové
klece jsou zajímavé a široce využívané
nanostruktury, jejichž potenciál při cílené
dopravě léčiv je v posledních letech
předmětem aktivního výzkumu. V rámci tohoto
výzkumu byly připraveny sacharidové deriváty
calixarenů, a byla prokázána jejich vazba na
receptory přirozených zabíječských buněk, a
schopnost stimulovat aktivitu těchto buněk in
vitro a in vivo. Deriváty calixarenů obsahující
karboxylové skupiny jsou silnými antagonisty
receptoru CD69, a chrání tak CD69+ lymfocyty
před apoptosou.
Ve spolupráci s Laboratoří růstových
GAAV
17
PřF UK Praha
badatelský
PřF UP Olomouc
badatelský
1
Číslo
9
2
regulátorů Přírodovědecké fakulty UP
Olomouc jsme potvrdili, že látky typu
anticytokininů inhibují buněčný cyklus a
charakterizovali jsme také změny v buňkách
na úrovni mikrotubulárního cytoskeletu.
V olomoucké laboratoři bylo prokázáno, že
tento typ látek se neváže na cytokininové
receptory, jak se obecně usuzovalo, ale
inhibuje aktivitu cyklin dependetní kinázy.
Při použití variant proteinů fúzovaných se
zeleným fluoreskujícím proteinem (GFP) bylo
zjištěno, že proteiny Ato1p, Ato2p a Ato3p, o
nichž se předpokládá, že exportují amonné
ionty a že se účastní signalizace mezi
kvasinkovými koloniemi prostřednictvím
amoniaku, lokalizují do kompartmentů
plasmatické membrány kvasinek resistentních
k detergentům. Ato1p-GFP a Ato3p-GFP
vytvářejí v membráně shluky viditelné pod
fluorescenčním mikroskopem. Zatímco shluky
Ato3p-GFP jsou stabilní, přítomnost shluků
Ato1p-GFP je závislá na pH. Jsou přítomny
pouze v alkalické fázi vývoje kolonií nebo při
pH >5. Po působení nízkého pH 4-5 na buňky
(nebo v buňkách kolonií z 2. acidické fáze) je
fluorescenční signál Ato1p-GFP rovnoměrně
rozptýlen v plasmatické membráně. Tento jev
je reversibilní a je nezávislý na endocytose.
Předpokládáme, že změny pH mohou rychle
3
Forma spolupráce
(GAČR, MŠMT)
18
4
PřF UK Praha
5
Kategorie výstupu
badatelský
1
Číslo
10
11
2
3
Forma spolupráce
regulovat funkci Ato1p. Tyto výsledky byly
získány ve spolupráci se skupinou Doc. Z.
Palkové z Přírodovědecké fakulty UK.
Bylo zjištěno, že adenylát-cyklasový toxin z
patogenní bakterie Bordetella pertussis
(GAČR, GAAV, MŠMT)
zprostředkuje vstup vápenatých iontů do
myeloidních buněk zcela novým, unikátním
mechanismem, při kterém ionty vápníku
translokují z extracelulárního média do buněk
současně s translokací enzymatické adenylátcyklasové (AC) domény přes buněčnou
membránu. AC doména se přitom podílí na
tvorbě nového typu transientního vápníkového
kanálu a její struktura ovlivňuje kinetiku vstupu
iontů. Výsledek byl získán ve spolupráci se
skupinou Doc. I. Konopáska z Přírodovědecké
fakulty UK.
Denní změny množství bakteriochlorofylu byly AVČR
využity k výpočtu růstových rychlostí aerobních
anoxygenních bakterií v Atlantském oceánu.
Provedená měření naznačují, že aerobní
anoxygenní bakterie obsahující
bakteriochlorofyl mají v oligotrofních oblastech
Severního Atlantiku růstovou rychlost 0.911.08 za den a v Jižním Atlantiku rychlost 0.720.89 za den. Naopak v produktivních oblastech
severního Atlantiku vykazovaly fotosyntetické
bakterie růstové rychlosti až 2.13 za den. Tyto
vysoké rychlosti jsou v příkrém rozporu s
19
4
5
Kategorie výstupu
PřF UK Praha
badatelskÝ
BF JčU České Budějovice
cílený
1
Číslo
2
3
Forma spolupráce
4
5
Kategorie výstupu
poměrně pomalými rychlostmi, které běžně
vykazují mořské bakterie. Z toho usuzujeme,
že navzdory svým relativně menším počtům
představují aerobní fotosyntetické bakterie
značně dynamickou část mořských
bakteriálních populací, která se výrazně podílí
na mořském koloběhu uhlíku.
12
13
14
MŠMT, GAČR
Antropogenní zvýšení atmosférického CO2
může ovlivnit i mořské diazotrofní sinice, které
fixují atmosferický uhlík. Ukázali jsme, že
zvýšení CO2 má pozitivní vliv na rychlost růstu
a fixace dusíku u sinice Trichodesmium.
Pravděpodobným mechanismem je alokace
energie a reduktantů od mechanismů
koncentrace uhlíku v buňkách k mechanismům
fixace dusíku
GAČR
Role proteinu PsbI v skládání a opravě
fotosystému v sinici Synechocystis PCC
6803. Účast proteinu PsbI v skládání a opravě
fotosystému II byla studována v kmenech
sinice Synechocystis PCC 6803. Celkové
výsledky ukázaly, že PsbI je časným
vazebným partnerem proteinu D1 a hraje
dùležitou úlohu při vazbě proteinu CP43 v
komplexu PSII.
Z mykangií samic pilořitky Tremex fuscicornis
byly získány izoláty symbiotické houby ze
MŠMT
20
badatelský
badatelský
ČZU, fakulta lesnická a
dřevařská
badatelský
1
Číslo
2
3
Forma spolupráce
4
5
Kategorie výstupu
skupiny Basidiomycota, které se shodovaly
morfologicky i v analýze RAPD. Houba byla
určena na základě sekvence rDNA (oblasti
ITS1, 5.8S, ITS2 a úsek D1D2 z 28S) jako
Cerrena unicolor (Basidiomycota:
Polyporales). (Pažoutová S, Šrůtka P, 2007. A
record of symbiotic relationship between
Cerrena unicolor and a horntail Tremex
fuscicornis in the Czech Republic. - Czech
Mycology 59, 83-90).
15
Vhodné morfologické charakteristiky pro
identifikaci řas Zygnematales byly stanoveny
při použití kombinace klasické optické
mikroskopie (LM), fluorescenční mikroskopie
(při modré a zelené excitaci), rastrovací
mikroskopie (SEM) a speciálních kultivačních
metod. Detailní LM a SEM pozorování
zygospor všech Zygnema druhů by tak mohla
poskytnout základní údaje pro přípravu atlasu
a klíče k identifikaci jednotlivých druhů, které
po doplnění molekulárními metodami objasní
genetické vztahy mezi těmito morfologickými
druhy. (Políčková A., Žižka Z., Hašler P.,
Benada O. 2007: Zygnematalean zygospores:
Morphological features and use in species
identification. - Folia Microbiol. 52: 135 – 145).
16
Imobilizace
biokalyzátorů
GAČR
(nitrilhydratasy, Vícezdrojové financování
21
PřF UP Olomouc
badatelský
FPBT VŠCHT Praha
badatelský
1
Číslo
2
3
Forma spolupráce
4
5
Kategorie výstupu
nitrilasy) technologií LentiKats. Byly připraveny (GAAV, GAČR, MŠMT)
imobilizované preparáty nitrilhydratasy z
baktérie Rhodococcus a nitrilasy z Fusarium
solani. Tento způsob imobilizace se jeví jako
vhodný pro imobilizace labilních enzymů
tohoto typu, jejichž aktivita zůstává zachována
a zvyšuje se jejich stabilita.
17
Nemodifikovaný doxorubicin a doxorubicin AVČR
navázaný na polymerní nosič na bázi HPMA
buď enzymaticky (PK1) nebo hydrolyticky
(HYD) štěpitelnou vazbou se liší jak
v antiproliferativních vlastnostech tak i v
signálech
vedoucích
k buněčné
smrti.
Doxorubicin a HYD mají podobné mechanismy
působení, zatím co PK1 se chová zcela
odlišně. Kovář, L., Strohalm, J., Chytil, P.,
Mrkvan, T., Kovář, M., Hovorka, O., Ulbrich,
K., Říhová, B.: The same drug but a different
mechanism of action: comparison of free
doxorubicin
with
two
different
N-(2hydroxypropyl)methacrylamide
copolymerbound doxorubicin conjugates in EL-4 cancer
cell line. - Bioconj. Chem. 18, 894-902, 2007
PřF UK, 1. LF UK, LF UP,
VŠCHT
badatelský
18
Kalretikulin je evolučně konzervovaný protein MŠMT NPV2
vázající vápník, který je zapojen do mnoha
buněčných procesů. Kromě celé řady dalších
funkcí se účastní regulace homeostázy
1. LF UK
badatelský
22
1
Číslo
2
3
Forma spolupráce
4
5
Kategorie výstupu
vápenatých iontů a funguje jako molekulární
chaperon. V naší práci jsme popsali a
charakterizovali sekvenci cDNA pro kalretikulin
u žížal Eisenia fetida. Fylogenetická analýza
ukázala podobnost kalretikulinu u E. fetida
s molekulami kalretikulinu u měkkýšů. Dále
jsme pomocí in situ hybridizace a real-time
PCR prokázali zvýšenou expresi kalretikulinu
v nervových a spermatických buňkách a v
buňkách svaloviny tělní stěny. Šilerová M.,
Kauschke E., Procházková P., Josková R.,
Tučková L., Bilej M.: Characterization,
molecular cloning and localization of
calreticulin in Eisenia fetida earthworms. Gene 397: 169-177 (2007).
b)
nejvýznamnější výsledky činnosti výzkumných center a dalších společných pracovišť AV ČR s vysokými školami
Pořadové číslo: 1
Název společného pracoviště česky: Centrum funkční organizace buňky
Název společného pracoviště anglicky: Functional cell organization centre
Kategorie společného pracoviště: LC
Dosažený výsledek: U kvasinky Saccharomyces cerevisiae jsme objevili, že membránový potenciál má důležitou roli v organizaci
plazmatické membrány. Zjistili jsme, že v plazmatické membráně existují tři nepřekrývající se kompartmenty. V jednom, který je
reprezentován síťovitou strukturou, se nachází protonová ATPasa Pma1 a ve druhém, tvořícím 300 nm shluky, jsou obsaženy protonové
symportery (Can1, Fur4, Tat2 a HUP1) a protein Sur7, který je komponentou eisosomů. Třetí kompartment obsazují proteiny, které jsou v
membráně rozmístěny rovnoměrně (např glukosový přenášeč HXT1). Zatímco rozmístění některých membránových proteinů lze
ovlivňovat např. lipidním složením membrány či její deenergizací, rozmístění jiných je neobyčejně stabilní.
23
Citace výstupu, příp. jiné uplatnění: Grossmann, G., Opekarová, M., Malinský,J., Weig-Meckl, I., Tanner, W. (2007) Membrane potential
governs lateral segregation of plasma membrane proteins and lipids in yeast.- EMBO J. 26, 1-8.
Název společného pracoviště česky: Centrum molekulární biologie a fyziologie společenstev kvasinek
Název společného pracoviště anglicky: Center for molecular biology and physiology of yeast colonies
Dosažený výsledek: Sumarizovali jsme současné znalosti o účasti metakaspasy Mca1p v procesu podobném apoptose u kvasinek a o
jejích předpokládaných rolích v tomto procesu. Experimentálně jsme se zaměřili na možnosti detekce aktivity Mca1p a dalších proteas
podobných kaspasám u Saccharomyces cerevisiae. Porovnali jsme techniky použití inhibitorů FLICA a fluorescenčního substrátu D2R.
Ukázali jsme, že použití D2R je pro detekci proteas podobných kaspasám u kvasinek mnohem vhodnější. Nové výsledky o roli
enzymatických systémů obrany proti stresu v dlouhodobém přežívání kolonií kvasinek naznačují, že mnohem důležitější než tato obrana
jsou metabolické změny v buňkách kolonií.
Citace výstupu, příp. jiné uplatnění: Váchová L., Palková, Z. (2007) Caspases in yeast apoptosis-like death: Facts and artefacts.- FEMS
Yeast Res. 7:12-21
Název společného pracoviště česky: Studium vlivu obsahových látek na vitalitu kvasinek během pivovarského procesu
Název společného pracoviště anglicky: Study of natural compounds effect on viability of yeast during brewing process.
Kategorie společného pracoviště: 1M
Dosažený výsledek: Bylo zjištěno, že metabolické inhibitory a chmelové látky snižují vitalitu kvasinek měřenou jako acidifikační síla (AP),
lysosomotropní látky působí depolarizaci membrány, inhibici MDR pump a permeabilizaci. Zvýšený osmotický tlak (kvašení vysoce
koncentrovaných mladin) neovlivní vitalitu buněk. Poškozené buňky uvolňují do prostředí invertasu, jejíž hladina v pivu je podobná při
použití technologie CKT a u klasické technologie a zvyšuje se s opakovaným nasazováním kvasnic. U kvasinek se sníženou aktivitou
superoxiddismutasy (SOD) bylo sledováno působení antioxidantů. Cytosolická SOD, chrání bu?ky proti oxidativnímu stresu,
24
mitochondriální MnSOD chrání buňky také proti osmotickému a teplotnímu stresu, a stresu způsobeného metaloidy. Stres působí u
kvasinek mj. také zrychlené replikativní stárnutí. Mladé dceřiné buňky onkogenního mutanta RAS2val19 se rodí „staré“.
Citace výstupu, příp. jiné uplatnění: Krasowska A. Piasecki A., Murzyn A., Sigler K. (2007) Assaying the antioxidant and radical
scavenging properties of aliphatic mono- and di-N-oxides in a test with SOD-deficient yeast and by a chemiluminescence test. - Folia
Microbiol. 52, 45-51., Dziadkowiec D., Krasowska A., Liebner A., Sigler K. (2007) Protective role of mitochondrial superoxide dismutase
against high osmolarity, heat and metalloid stress in S. cerevisiae.- Folia Microbiol. 52, 120-126.
Název společného pracoviště česky: Centrum molekulárních metod monitorování difúzního znečištění životního prostředí
Název společného pracoviště anglicky:
Kategorie společného pracoviště: 1M
Dosažený výsledek: Dvě laboratoře sektoru biogeneze a biotechnologie přírodních látek (laboratoř biologiesekundárního metabolismu a
laboratoř genetiky , fyziologie a bioinženýrství hub) se podílejí na projektu Centrum molekulárních metod monitorování difúzního
znečištění životního prostředí (Výzkumná centra 1M; MŠMT). Účelem projektu je multidisciplinární výzkum nových systémů pro
monitorování difúzního znečištění (DZ) životního prostředí. DZ se rozumí dlouhodobá kontaminace prostředí velmi nízkými
koncentracemi polutantů, rezidui rozmanitých antropogenních činností, s prokazatelně negativním vlivem na živé organismy i jejich
reprodukci. V České republice dosud naprosto chybí monitorovací systém těchto nebezpečných látek v životním prostředí. Cílem
projektu je proto navrhnout a ověřit ucelený systém pro hodnocení DZ povrchových i podzemních vod a sedimentů s využitím
molekulárních diagnostických metod. Diagnostika bude založena na připraveném panelu specifických monoklonálních protilátek proti
vybraným polutantům spolu s komplexním molekulárně-genetickým popisem struktury a změn bakteriálních konsorcií a jejich genové
výbavy. Naše skupiny se v projektu podílí na vypracování metodik pro monitorování antibiotik významných pro DZ a genů souvisejících
s antibiotickou biosyntézou a rezistencí. Konkrétně byly vypracovány analytické metody pro stanovení vybraných antibiotik a jejich
intermediátů (1,2) , byly vypracovány DNA metodiky pro charakterizaci prosperování dynamiky bakteriálních konsorcií, jsou monitorovány
geny pro antibiotickou rezistenci v půdě a sedimentech i klinických izolátech (3).
Citace výstupu, příp. jiné uplatnění: 1. Jana Olšovská, Jitka Novotná, Miroslav Flieger, and Jaroslav Spížek (2007) Assay of tyrosine
hydroxylase based on high-performance liquid chromatography separation and quantification of L-dopa and L-tyrosine. - Biomedical
Chromatography 21, 1252-1258., 2. Olšovská, J., Jelínková, M., Man, P., Koběrská, M., Janata, J., Flieger, M. (2007). High-throughput
25
quantification of lincomycin traces in fermentation broth of genetically modified Streptomyces spp.Comparison of ultra-performance liquid
chromatography and high-performance liquid chromatography with UV detection. - J.Chromatogr. A 1139: 214-220. , 3. Novotná, G.,
Spížek, J. , Janata, J. - (2007) In Vitro Activity of Telithromycin and Quinupristin/dalfopristin against Methicillin-Resistant CoagulaseNegative Staphylococci with Defined Resistance Genotypes - Folia Microbiol. 52 (6): 000-000
Název společného pracoviště česky: Centrum nádorové proteomiky a Centrum funkční charakterizace buňky
Název společného pracoviště anglicky:
Dosažený výsledek: Zde je hlavním výsledkem obecný vývoj metod chemického zesíťování jako nástroje pro určování třírozměrné
struktury bílkovin.
Citace výstupu, příp. jiné uplatnění: : Novák P. and Giannakopulos A.G., Chemical crosslinking and mass spectrometry as a structure
determination tool, Eur. Mass Spectrom. 2007; 13, 105-113. Novak P., Havlicek V, Derrick PJ, Beran K, Bashir S and Giannakopulos AE,
Monitoring conformational changes in protein complexes using chemical cross-linking and Fourier transform ion cyclotron resonance
mass spectrometry: the effect of calcium binding on the calmodulin - melittin complex. - European Mass Spectrometry 2007; 13, 281-290.
Název společného pracoviště česky: Centrum biokatalýzy a biotransformací
Název společného pracoviště anglicky: Center of Biocatalysis and Biotransformation
Dosažený výsledek: Na pracovišti (MBÚ): Byla objevena a popsána nová beta-galaktosidasa z Talaromyces flavus, u které byla zjištěna
zcela neobyklá substrátová specifita – toleruje objemné, stericky bráněné aglykony (např. terc-butanol), které nejsou akceptovány
prakticky žádnou známou glykosidasou. Tento enzym je indukován výlučně quinovosou, což je dosud nepopsaný induktor galaktosidas.
Bylo dokončeno strukturální studium beta -N-acetylhexosaminidasy z A. oryzae a byl nalezen a detailně analyzován dosud nepopsaný
regulační mechanismus její exprese a posttranslačního zpracování, především role části propeptidu, který působí jako esenciální
chaperon. β-N-Acetylhexosaminidasa z T. flavus byla purifikována a kompletně biochemicky charakterizována a dále podrobena
26
proteomické analýze. Enzym byl testován na aktivitu s modifikovanými substráty (6-aldehyd a 6-sulfát) pro využití v syntéze
imunoaktivních glykomimetik a bylo zjištěno že tato hexosaminidasa je schopna tyto substráty štěpit s velmi dobrou aktivitou. Toho je
v současnosti využito pro syntetické aplikace v přípravě nových imunoaktivních glykomimetik. Nové látky, a to jak v oligosacharidické
formě tak i ve formě polyvaletních mimetik vázaných na calixarenový nosič byly otestovány s velmi dobrými výsledky na aktivaci NK
buněk a v současnosti probíhaji testy in vivo.
Citace výstupu, příp. jiné uplatnění: Vejvoda V., Šveda O., Kaplan O., Přikrylová V., Elišáková V., Himl M., Kubáč D., Pelantová H.,
Kuzma M., Martínková L.: Biotransformation of heterocyclic dinitriles by Rhodococcus erythropolis A4 and fungal nitrilases. Biotechnol.
Lett. 29, 1119-1124. (2007) IF = 1,134, Kubáč D., Kaplan O., Elišáková V., Pátek M., Vejvoda V., Slámová K., Tóthová A., Lemaire M.,
Gallienne E., Lutz-Wahl S., Fischer L., Kuzma M., Pelantová H., van Pelt S., Bolte J., Křen V., Martínková L. (2007) Biotransformation of
nitriles to amides using soluble and immobilized nitrile hydratase from Rhodococcus erythropolis A4. - J. Mol. Catal. B: Enzymatic, 50,
107-113 (2008). IF = 2,149, Vejvoda V., Kaplan O., Bezouška K., Pompach P., Šulc M., Cantarella M., Benada O., Uhnáková B.,
Rinágelová A., Lutz-Wahl S., Fischer L., Křen V., Martínková L. (2007) Purification and characterization of a nitrilase from Fusarium
solani O1. J. Mol. Catal. B: Enzymatic, 50, 99-106 (2008). IF = 2,149, Martínková L., Vejvoda V., Křen V. Selection and screening for
enzymes of nitrile metabolism (a review). J. Biotechnol., po revizi. IF = 2,600, P. Simerská, D. Monti, I. Čechová, H. Pelantová, M.
Macková, K. Bezouška, S. Riva, V. Křen: Induction and characterization of an unusual beta -D-galactosidase from Talaromyces flavus. J.
Biotechnol. 128 (1), 61-71 (2007). IF = 2,600, Ettrich R, Kopecky V, Hofbauerova K, Baumruk, V., Novak, P., Pompach, P., Man, P.,
Plihal, O., Kuty, M., Kulik, N., Sklenar, J., Ryslava, H., Kren, V., Bezouska, K.: Structure of the dimeric N-glycosylated form of fungal
beta-N-acetylhexosaminidase revealed by computer modeling, vibrational spectroscopy, and biochemical studies. BMC Structural
Biology 7 (2007): Art. No. 32 IF = 1,980, O. Plíhal, J. Sklenář, K. Hofbauerová, P. Novák, P. Man, P. Pompach, H. Ryšlavá, A
Charvátová-Pišvejcová, V. Křen, K. Bezouška: Large propeptides of fungal beta -N-acetylhexosaminidases are novel enzyme regulators
that must be processed intracellularly to control activity, dimerization, and secretion into the extracellular environment. Biochemistry 46,
2719 – 2734 (2007). IF = _3,633, R. Gažák, D. Walterová, V. Křen: Silybin and silymarin – new and emerging applications in medicine.
Curr. Med. Chem. 14 (3), 315-338 (2007). IF = 5,207, K. Křenek, M. Kuldová, K. Hulíková, I. Stibor, P. Lhoták, M. Dudič, J. Budka,
H. Pelantová, K. Bezouška, A. Fišerová and V. Křen: N-Acetyl-D-glucosamine substituted calix[4]arenes as stimulators of NK cellmediated antitumor immune response. Carbohydr. Res. 342, 1781-1792 (2007). IF = _1,703,R. Gažák, P. Sedmera, M. Marzorati, S.
Riva, V. Křen: Laccase-mediated dimerization of the flavonolignan silybin. J. Mol. Catal./B Enzymatic 50, 87-92 (2008). IF = 2,149, P.
Bojarová, K. Křenek, M. Kuzma, L. Petrásková, K. Bezouška, D.-J. Namdjou, L. Elling, V. Křen: N-Acetylhexosamine triad in one
molecule: Chemoenzymatic introduction of 2-acetamido-2-deoxy- beta -D-galactopyranosyluronic acid residue into a complex
oligosaccharide. J. Mol. Catal./B Enzymatic. 50, 69-73 (2008). IF = 2,149, B. Sauerzapfe, D.-J. Namdjou, T. Schumacher, N. Linden, K.
27
Křenek, V. Křen, L. Elling: Characterization of recombinant fusion constructs of human beta-1,4-galactosyltransferase 1 and the lipase
pre-propeptide from Staphylococcus hyicus. J. Mol. Catal./B Enzymatic. 50, 128-140 (2008). IF = 2,149
c)
spolupráce s vysokými školami na uskutečňování bakalářských, magisterských a doktorských studijních programů a
vzdělávání středoškoláků
1
Číslo
2
Bakalářský program
3
4
Přednášky
5
Cvičení
6
Vedení
prací
7
Příprava
textů
1
2
3
4
5
6
Mikrobiologie
Imunologie
Biofyzika
Analytická chemie
Biochemie
Klinická a toxikologická analýza
UK, VŠCHT, JčU
UK
JčU
PřF UK
PřF UK
PřF UK
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ne
ano
ano
ano
ano
ano
ano
1
Číslo
2
Magisterský program
3
4
Přednášky
5
Cvičení
6
Vedení
prací
7
Příprava
textů
1
2
3
4
5
6
7
8
Mikrobiologie
Imunologie
Biofyzika
Analytická chemie
Biochemie
Klinická a toxikologická analýza
Biotechnologie
Fyziologie rostlin
UK, VŠCHT, JčU
UK
JčU
PřF UK
PřF UK
PřF UK
JčU
PřF UP, JčU
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ne
ne
ne
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
28
8
Jiné
8
Jiné
1
Číslo
2
Doktorský program
3
4
Přednášky
5
Cvičení
6
Vedení
prací
7
Příprava
textů
1
2
3
Mikrobiologie
Imunologie
Molekulární a buněčná biologie,
genetika a virologie
Chemie
Biochemie a biotechnologie
Fyzika
PřF UK
PřF UK
PřF UK
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
VŠCHT
VŠCHT
MFF UK, JčU
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
ano
4
5
6
d)
8
Jiné
vzdělávání středoškolské mládeže
1
Číslo
2
Aktivita
3
Pořadatel/škola
4
Popis
1
2
Otevřená věda
Konference
3
4
dobrovolná
Vedení
herpetologickomikrobiologického
kroužku
exkurse
Předmaturitní praxe
AVČR
Československá společnost
mikrobiologická
MBÚ AVČR
Gymnázium Všetaty
6 studentů pracovalo v laboratořích MBÚ
10 studentů libereckých gymnázií se účastnilo 24. Kongresu ČSSM
v Liberci
2 studenti docházeli do laboratoří MBÚ po celý rok
Každých 14 dní
MBÚ / pro různé SŠ
MSPŠCH
Prohlídky laboratoří dle zájmu pedagogů
Umožnění 14-denních praxí
5
6
3. Spolupráce pracoviště s dalšími institucemi a s podnikatelskou sférou
a)
společné projekty výzkumu a vývoje podpořené z veřejných prostředků
29
Název projektu /programu v češtině:
Název projektu/programu v angličtině:
Poskytovatel: GAČR, MŠMT
Partnerská organizace: ÚMCH AV ČR, v.v.i.
Dosažený výsledek: Polymerní konjugát na bázi HPMA, který obsahuje cytotoxické léčivo (doxorubicin) a lidský intravenózní
imunoglobulin, má významnou protinádorovou účinnost u myší C57BL/6 se syngenním lymfomem EL-4. Léčba nepoškozuje imunitní
systém hostitele a indukuje specifickou, dlouhodobě přetrvávající imunitu proti nádoru. Tu lze prokázat u vyléčených myší transplantací
téhož nádoru podruhé – u resistentních jedinců se nádory nevyvinou, a přenést slezinnými buňkami vyléčených myší nebo izolovanými
CD8+ buňkami na čisté příjemce (naive) tzv. Winnovým testem
Uplatnění/Citace výstupu: Šírová M, Strohalm J., Šubr V., Plocová D., Rossmann P., Mrkvan T., Ulbrich K., Říhová B.: Treatment with
HPMA copolymer-based doxorubicin conjugate containing human immunoglobulin induces long-lasting anti-tumour immunity in mice. Cancer Immunol Immunother. 56: 35-47, 2007
Poskytovatel: GAČR, MŠMT
Partnerská organizace: ÚMCH AV ČR, v.v.i.
Dosažený výsledek: V této studii jsme srovnali antiproliferativní signály a signály kontrolující přežití a smrt buněk, které se zapojují u
nádorových buněk EL-4 vystavených působení volného, nebo na HPMA navázaného doxorubicinu a to buď enzymaticky (PK1) nebo
hydrolyticky (HYD) degradovatelnou vazbou. Prokázali jsme různé aktivace a role MAPK signalizačních drah kontrolujících buněčnou
proliferaci a smrt, podobně aktivaci kaspázy 3 a vazebnou aktivitu p50 podjednotky NFkappaB u buněk vystavených volnému
doxorubicinu a HPMA konjugátům. Následnou analýzou exprese genů zapojených v apoptóze a regulaci buněčného cyklu jsme
prokázali, že volný doxorubicin a HYD mají podobné mechanizmy účinku, zatímco PK1 vykazuje velmi rozdílný mechanizmus účinku.
Uplatnění/Citace výstupu: Lubomír Kovář, Jiří Strohalm, Petr Chytil, Tomáš Mrkvan, Marek Kovář, Ondřej Hovorka, Karel Ulbrich, Blanka
Říhová.: The same drug but a different mechanism of action: comparison of free doxorubicin with two different N-(2hydroxypropyl)methacrylamide copolymer-bound doxorubicin conjugates in EL-4 cancer cell line.- Bioconjug Chem. May-Jun;18(3):894902, 2007
30
Poskytovatel: MŠMT, GAČR
Partnerská organizace: VÚFB, s.r.o.
Dosažený výsledek: Ve spolupráci s REaD VÚFB, s.r.o. jsme testovali protizánětlivou účinnost nově syntetizovaných derivátů kyseliny
aryloctové v experimentálním modelu ulcerosní kolitidy. Pět z těchto derivátů má shodný či větší protizánětlivý účinnek než běžně
používaný sulfasalazin. Tato studie by mohla být podkladem pro vývoj nových a účinnějších protizánětlivých léků.
Uplatnění/Citace výstupu: Junek R, Brůnová B, Kverka M, Panajotová V, Jandera A, Kuchar M. Antileukotrienic N-arylethyl-2arylacetamides in the treatment of ulcerative colitis. - Eur J Med Chem. 2007,42,1084-94
Poskytovatel: GAČR, GAAV, MŠMT
Partnerská organizace: ÚŽFG AV ČR, v.v.i.
Dosažený výsledek: Ve spolupráci s Ústavem živočišné fyziologie a genetiky jsme stanovili cytokinový profil in vivo a in vitro
sarkomovými buňkami R5-28 potkanů kmene Lewis. V pokusech byly identifikovány tři cytokiny (MCP-1, TIMP-1 a VEGF) produkované
R5-28 buňkami in vitro. Další tři cytokiny (TNF-α, β-NGF and LIX) stanovené in vivo v krevním séru a lyzátu nádoru jsou pravděpodobně
produkovány imunitními a stromálními buňkami během růstu nádoru.
Uplatnění/Citace výstupu: Strnádel J., Kverka M., Horák V., Vannucci L., Usvald D., Hlučilová J., Plánská D., Váňa P., Reisnerová H.,
Jílek K. Multiplex analysis of cytokines involved in tumour growth and a spontaneous regression in a rat sarcoma model. - Folia Biol.
2007, 53, 216-219
31
Poskytovatel: IGA MZ ČR, GAČR
Partnerská organizace: Revmatologický ústav, Praha a ÚMG AV ČR, v.v.i.
Dosažený výsledek: Mnohobarevná FACS analýza prokázala u pacientů s autoimunitními nemocemi (revmatoidní artritídou – RA a
polymyositidou/dermatomyositidou – PM/DM) zvýšenou expresi CD161 antigenu na granulárních buňkách periferní krve. Poměr
CD8high/CD8low je 2-3 násobně zvýšen oproti kontrole. Podobně, zvýšení ko-exprese NKG2D a CD161 na NKT buňkách a diferenciace
APC buněk (CD86high) u RA pacientů se jeví jako perspektivní diagnostické znaky.
Uplatnění/Citace výstupu:
Poskytovatel: IGA MZ ČR, GAČR
Partnerská organizace: Gynekologicko-porodnická klinika LF UK a FN Plzeň a s Ústavem pro péči o matku a dítě, Praha
Dosažený výsledek: Leukemický infibiční faktor (LIF) má klíčovou úlohu v preimplantačním vývoji embrya a mutace tohoto genu, jak bylo
ukázáno v našich výsledcích, se podílí na poruchách implantece a následné neplodnosti. Naše zjištění prokázaly také další rizikové
faktory, jako je exprese CD69 a CD161 znaků na NK buňkách a zvýšení jejich funkční aktivity. Interakce IL-12/IL-15/IL-18 cytokinového
systému s endometriálními leukocyty (NK buňkami) ovlivňuje angiogenezi přestavbu tkání.
Uplatnění/Citace výstupu: Králíčková M, Šíma R, Martínek P, Vaněček T, Ulčová-Gallová Z, Šíma P, Křižan J, Kalis V, Štěpán Jr, Štěpán
J, Rokyta Z, Uher P, Hes O.: [The leukemia inhibitory factor gene mutations in the population of infertile women: the heterozygote
transition G to A on the position 3400 does not affect the outcome of the infertility treatment] Ceska Gynekol. 2007 Aug;72(4):293-8,
Králíčková M., Šíma R., Vaněček T., Šíma P., Rokyta Z., Ulčová-Gallová Z., Suchá R., Uher P., Hes O.: Leukemia inhibitory factor gene
mutations in the population of infertile women are not restricted to nulligravid patients. - Eur J Obstet Gynecol Reprod Biol. 127(2), 231235, Epub 2006 Mar 20. (2006).
Název projektu /programu v češtině: Informační a vzdělávací program pro využití biotechnologií v oblasti životního prostředí a
udržitelného rozvoje.
32
Název projektu/programu v angličtině: Information and education programs in biotechnology and environment
Poskytovatel: ESF
Partnerská organizace: VŠCHT, Envisan GEM, a.s.
Dosažený výsledek: V rámci programu na pracovišti MBÚ AV ČR mj. proběhly 4 turnusy dvoutýdenních laboratoří s celkem více než 40
absolventy. Studenti si prakticky osvojili pokročilé genetické techniky, jako např. inaktivace genů; cílenou metagenezi proteinů a přípravu
rekombinantních proteinů v bakteriální buňce.
Uplatnění/Citace výstupu:
Název projektu /programu v češtině: Tandem
Název projektu/programu v angličtině: Tandem
Poskytovatel: MPO
Partnerská organizace: Bioveta, a.s.
Dosažený výsledek: Je vyvíjen nový typ vakcíny submersní způsobem proti nejzávažnějšímu onemocnění prasat - aktinobacilové
pleuropneumoniae, založené na bázi Apx toxinů mající prokazatelně protektivní účinky. V roce 2007: Základní kultivační testy ve
třepaných baňkách ověřující expresi a kvalitativní produkci APX toxinů I, II a III byly provedeny na komplexním médiu obsahujícím
kvasničný extrakt a pro zajištění selektivity na plasmid nesoucí kmen též antibiotikum kanamycin. Pokusy prokázaly dobré expresní
vlastnosti i stabilitu plasmidu za podmínek bohatého média, limitace kyslíkem, nízkého nárůstu biomasy a stabilní kultivační teploty.
Uplatnění/Citace výstupu: Prell A., Sadílková L., Osička R., Kujan P., Nepeřený J., Vrzal V., Šafář H.: Production of recombinant proteins
to immunize livestock to infectious disorders. 34nd International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské
Matliare 2007, Slovakia, Proc. pg. 219, Lecture No. Th-1, 022s. Prell A., Sadílková L., Osička R., Kujan P., Nepeřený J., Vrzal V.,
Sobotka M.: Development of a new recombinant subunit vaccine against porcine pleuropneumonia. 13th European Congress on
Biotechnology, Barcelona 2007, Spain, Poster No. 189.
33
b)
1
Číslo
výsledky výzkumu a vývoje pro ekonomickou sféru (případně dosažené ve spolupráci s touto sférou) na základě
hospodářských smluv
2
Zadavatel
3
Výsledek (anotace)
4
Uplatnění
1
ICSE Milano, Italie
2
SVUS, NATIM,
CR, Abiogen
Pharma a
PROTERA srl,
Sesto Fiorentino,
Itálie
3
Imunotech, a.s.
Uvedení na trh nového katalyzátoru Fermase NA 150 s
aktivitou nové penicilin G-acylasy vyvinutého pro
enzymovou syntézu beta-laktamových antibiotik společně
s farmaceutickou firmou Fermenta Biotech Ltd., Indie.
Vyvinutý bioproces nahrazuje chemickou výrobu
zatěžující výrazně životní prostředí.
Předmětem studia bylo vyhodnocení účinků (1-->3)-betaD-Glukanů, vysoce konzervativních struktur buněčných
stěn kvasinek, hub a mořských řas. Podání glukanu
phycarinu (odvozeného od mořských řas) vyvolalo
stimulaci fagocytární aktivity i tvorbu protilátek imunitními
buňkami, potencovalo účinky chemotherapie Lewisova
plicního karcinomu cyklofosfamidem a zkrátilo období
leukopenie jak po chemoterapii, tak po ozáření. Redukce
růstu melanomů a stimulace NK buněčné cytotoxicity u
myší byla zaznamenána také při použití glukanů
izolovaných z hub (hlíva ústřičná).
Ve spolupráci s firmou Imunotech (Beckman Coulter, Inc)
jsme připravili myší monoklonálních protilátky proti
gliadinu a určili jejich specificitu metodou pepscan
s dekapeptidy α- a β-gliadinu a ω-sekalinu. Tento
metodický přístup umožil konstrukci vysoce citlivého a
reproducibilního ELISA testu detekujícího gliadin
v potravinách určených pro bezlepkovou dietu. Výstupem
naší studie také publikace: Specificity analysis of antigliadin mouse monoclonal antibodies used for detection of
34
Větvička V., Dvořák B., Větvičková J., Richter J.,
Křižan J., Šíma P., Yvin J.C.: Orally
administered marine (1-->3)-beta-D-glucan
Phycarine stimulates both humoral and cellular
immunity. - Int J Biol Macromol. 2007 Mar
10;40(4):291-8
Sánchez D, Tučková L, Burkhard M, Plicka J,
Mothes T, Hoffmanová I, Tlaskalová-Hogenová
H. - J Agric Food Chem, 2007, 4, 55, 2627-32.
1
Číslo
2
Zadavatel
3
Výsledek (anotace)
4
Uplatnění
gliadin in food for gluten-free diet.
Celkový počet získaných výsledků
c)
1
Číslo
1
nové firmy, které vznikly na základě výsledků činnosti ústavu v oblasti aplikovaného výzkumu
2
Název firmy
3
Důvod zřízení
4
Kategorie firmy
5
Činnost firmy
Nevznikla žádná firma
d)
1
Číslo
1
3
odborné expertizy zpracované v písemné formě pro státní orgány a instituce
2
Název
3
Příjemce/zadavatel
4
Popis výsledku
Nebyla zpracována žádná expertíza pro SO a I
Celkový počet zpracovaných expertiz
6 posudků pro veřejnost (mikrobiologické a mykologické rozbory)
35
4. Mezinárodní vědecká spolupráce pracoviště
a)
1
přehled mezinárodních projektů, které pracoviště řeší v rámci mezinárodních vědeckých programů
Číslo
2
Název
zastřešující
organizace
(zkratka)
3
4
5
6
7
8
Název programu
česky/anglicky
Název projektu
česky/anglicky
Koordinátor/řešitel
česky/anglicky
Spoluřešitel
(počet
spoluřešitelů)
Stát(y)
Aktivita
1
EU
6. RP/ FP 6
2
EU
6. RP/ FP 6
3
EU
6. RP/ FP 6
4
EU
6. RP/ FP 6
5
EU
6. RP/ FP 6
Mucosal vaccines for
poverty related
diseases
Optimised delivery
systems for vaccines
targeted to dendritic
cells
Integrating
genomics-based
applications to exploit
actinomycetes as a
ressource for new
antibiotics
Biological procedures
for diagnosing the
status and predicting
evolution of polluted
environment
European virtual
institute for functional
genomics of bacterial
pathogens
Chiron SpA,
Itálie/Chiron SpA,
Italy
Institut Pasteur,
Francie/ Institut
Pasteur, France
21
vědecká
6
vědecká
University of
Wales,
VB/University of
Wales, UK
17
vědecká
GBF,
Německo
8
vědecká
Bayerische JuliusMaxmilians
Universitaet,
Německo/Bayerisc
he JuliusMaxmilians
Universitaet,
36
vědecká
36
1
Číslo
2
Název
zastřešující
organizace
(zkratka)
3
4
5
6
7
8
Název programu
česky/anglicky
Název projektu
česky/anglicky
Koordinátor/řešitel
česky/anglicky
Spoluřešitel
(počet
spoluřešitelů)
Stát(y)
Aktivita
Germany
Mikrobiologický
ústav AV ČR, v. .v
i. / Institute of
Microbiology
ASCR, v. v. i.
University of
Portsmouth, UK
6
EU
Marie Curie/Marie
Curie
Ion Cyclotron
Resonance Fourier
Transform Mass
Spectromentry
0
vědecká
7
EU
6. RP/ FP 6
vědecká
8
EU
6. RP/ FP 6
A biological
7
nanoactuator as a
molecular switch for
biosensing
Biocompatible nonGhent University,
8
viral polymeric gene Belgie/Ghent
delivery systems for University, Belgium
the ex vivo treatment
of ocular and
cardiovascular
diseases with high
unmet medical need
b)
vědecká
nejvýznamnější vědecké výsledky pracoviště dosažené v rámci mezinárodní spolupráce
Název programu:
Název projektu: Houby v lesní půdě
Koordinátor/řešitel (česky): Petr Baldrian, MBÚ AVČR, spolupráce s International Graduate School, Zittau, Germany
Koordinátor/řešitel (anglicky):
37
Význačný výsledek: Bylo zjištěno, že saprotrofní basidiomycety výrazně přispívají k přeměně organické hmoty v půdě, zejména díky
produkci enzymů. V průběhu 12-týdenní inkubace rozložila H. fasciculare 23%, R. butyracea 32% a Gymnopus sp. 38% suché
hmotnosti substrátu. Všechny houby produkovaly lakázu, Mn-peroxidázu, endoštěpící hydrolázy polysacharidů, celobiohydrolázu a řadu
glykosidáz. Všechny houby snižovaly poměr C/N v opadu a Gymnopus sp. také významně snižoval obsah ligninu. Ve srovnání s
rozkladem působeným basidiomycety docházelo v opadu in situ k relativnímu vzestupu obsahue ligninu. Nejpravděpodobnějším
vysvětlením je participace mikromycet a bakterií v průběhu přirozeného rozkladu opadu.
Uplatnění/Citace: Valášková, V., Šnajdr, J., Bittner, B., Cajthaml, T., Merhautová, V., Hofrichter, M., Baldrian, P. (2007) Production of
lignocellulose-degrading enzymes and degradation of leaf litter by saprotrophic basidiomycetes isolated from a Quercus petraea forest. Soil Biology and Biochemistry 39: 2651-2660.
Název programu: EUREKA
Název projektu: BIOFIX: Využití spalinového oxidu uhličitého v produkčních kulturách řas
Koordinátor/řešitel (česky): Spalovna komunálního odpadu TERMIZO a.s., Liberec, Ústav pro výzkum a využití paliv, a.s., PrahaBěchovice, Institut főr Getreideverarbeitung, GmbH., Abteilung der Algenbiotechnologie, Bergholz-Rehbrőcke, Německo
Význačný výsledek: V průběhu screeningu prováděném v jižním Řecku (Peloponéz) jsme vyizolovali a klonováním izolátu získali nový
produkční kmen řas rodu Chlorella, který se vyznačuje vysokou růstovou rychlostí (µmax=0,25 h-1), tolerancí vůči vysokým teplotám a
vysoké koncentraci CO2. Kmen bude přihlášen k patentové ochraně. Tento kmen jsme použili pro fotoautotrofní produkci řasové
biomasy s využitím oxidu uhličitého ze spalných plynů ve spalovně municipálních odpadů TERMIZO a.s. Liberec. Zjistili jsme, že růstová
rychlost řas, pěstovaných na odpadním CO2 je stejná jako u kontrolních kultur. Navržený způsob aplikace spalinového CO2 v
produkčních bioreaktorech umožňuje levnou (cena potravinového CO2 tvoří přibližně 50 % ceny všech živin) produkci kvalitní řasové
biomasy, která splňuje všechny požadavky legislativy EU pro potraviny dané kategorie. Kromě toho přispívá ke snižování ekologicky
nežádoucího vysokého obsahu CO2 ve spalných plynech. Způsob aplikace spalinového CO2 v produkčních bioreaktorech bude
přihlášen k patentové ochraně.
Uplatnění/Citace:
38
Název programu:
Název projektu: QLGI-1999-00050
Koordinátor/řešitel (česky): Helena Tlaskalová, MBÚ AVČR
Význačný výsledek: Studovali jsme účast komensálních bakterií při vzniku experimentálního střevního zánětu vyvolaného u
imunodeficitních SCID myší přenosem patogenních CD45RBhigh CD4+ T buněk izolovaných ze slezin konvenčních Balb/c myší. Zjistili
jsme, že pokud se patogenní T buňky přenesou do SCID myší žijících v bezmikrobním prostředí, střevní zánět nevznikne. Bezmikrobní
myši osazené různými kmeny komensálních bakterií (Enterococcus faecalis a další) také zánět nevyvinuly. Po osazení bezmikrobních
myší směsí SPF bakterií vznikne zánět jenom tehdy, pokud jsou přítomny nekultivovatelné Segmentované Filamentozní Bakterie (SFB)
Dále jsme studovali vliv kolonizace střevního traktu komensálními bakteriemi na vývoj repertoáru T buněčného receptoru. Byla sledována
diverzita T buněčného receptoru ve střevě bezmikrobních a SPF mikroflorou osazených Balb/c myší. Bylo zjištěno, že ve střevě
bezmikrobních myší T buněčný repertoár je oligoklonálního charakteru, zatímco v SPF podmínkách střevo vykazuje diverzifikovanou T
buněčnou populací, která mění svůj charakter v době odstavu
Uplatnění/Citace: Probert Ch.S.J., Williams A.M., Stepankova R., Tlaskalova-Hogenova H., Phillips A., Bland P.. The effect of weaning
on the clonality of αβ T-cell receptor T cells in the intestine of GF and SPF mice. - Dev. Comp. Immunol. 31, 606-17, 2007
Název programu: Spolupráce s University of Alabama
Název projektu:
Koordinátor/řešitel (česky): Ludmila Tučková, MBÚ AVČR
Význačný výsledek: Ve spolupráci s Prof. L. Smythies a Prof. P. Smihem z University of Alabama, Birmingham jsme studovali úlohu
buněk přirozené imunity při vzniku celiakálního onemocnění. Ukázali jsme, že peptické fragmenty gliadinu zvyšují expresi kostimulačních
molekul CD80 a CD86, dendritického znaku CD83 a aktivačního znaku CD83 na monocytech pacientů s aktivní formou onemocnění. U
těchto buněk indukovaly rovněž tvorbu chemokinů a prozánětlivých cytokinů. Mechanismus indukce zahrnoval zvýšenou DNA vazebnou
aktivitu podjednotek p50 a p65 NF-kappaB a NF-kappaB inhibitory snižovaly jak DNA vazbu tak produkci cytokinů.
39
Uplatnění/Citace: Cinová J., Palová-Jelínková L., Smythies L.E., Černá M., Pecharová B., Dvořák M., Fruhauf P., Tlaskalová-Hogenová
H., Smith P.D., Tučková L. Gliadin peptide activate blood monocytes from patients with celiac disease. - J. Clin. Immunol. 27, 201-209,
2007
c)
1
Číslo
akce s mezinárodní účastí, které pracoviště organizovalo nebo v nich vystupovalo jako spolupořadatel
2
Název akce
v češtině
3
Název akce
v angličtině
1
Mezinárodní symposium
polymerických léčení
2
5. mezinárodní workshop
dodacího systému léčiv
3
BIT 5. ročník kongresu
BIT´s 5th Anniversary
mezinárodní vědy pro
Congress of International
objevení léčiv a technologie Drug Discovery Science
and Technology (IDDST
24. Kongres ČSSM
24 Congress CSSM
4
4
Hlavní pořadatel akce
česky/anglicky
5
Počet účastníků
celkem/z toho
z ciziny
6
Významná prezentace
International Symposium on Institute of
Polymer Therapeutics
Chemistry and
Biochemistry Freie
Universität Berlin
th
5 International Workshop Veterinary Research
on Drug Delivery Systems
Institute, Brno
5
35. kongres mezinárodní
společnosti pro ??? biologii
a medicínu
The 35th Congress of the
International Society for
Oncodevelopmental Biology
and Medicine
6
24. ročník setkání ESHO evropská společnost pro
24th Annual Meeting of the
ESHO - European Society
BITeomics, China
Jiří Gabriel, CSSM
The International
Society for
Oncodevelopmental
Biology and
Medicine
40
400/200
Plenární přednáška prof. J.
Spížka
1
Číslo
7
8
9
10
11
2
Název akce
v češtině
3
Název akce
v angličtině
4
česky/anglicky
hypertermickou onkologii
PIERS2007 Symposium
vývoje v
elektromagnetickém
výzkumu
1. Středoevropská
proteomická conference a
3. Česká proteomická
konference
1st Central and Eastern
European Proteomic
Conference and 3rd Czech
Proteomic Conference
2. studentská konference
sítě excelence
‘Europathogenomics’
Pokročilý kurz buněčné
biologie 2007. Apoptotické
procesy v kvasinkách a v
savčích buňkách - obecné a
jedinečné rysy
1. Středo- a
2nd Student's Meeting of
the Network of Excellence
‘Europathogenomics’
Advanced Course in Cell
FEMS
Biology 2007. Apoptotic
processes in yeast and
mammalian cells - common
and unique features
1. Central and Eastern
5
celkem/z toho
z ciziny
6
for Hyperthermic Oncology
PIERS2007 Progress In
Electromagnetics Research
Symposium
Proteomická sekce
CSBMB, ÚŽFG AV
ČR,v.v.i.,
Mikrobiologický
ústav AV ČR, v.v.i.
Proteomic Section
of CSBMB, Institute
of Animal
Physiology and
Genetics, AS CR,
v.v.i. and Instituite of
Microbiology, AS
CR, v.v.i.
P. Šebo
41
78 účastníků, z
toho 14
zahraničních
Pichová - místopředsedkyně
organizačního výboru
J. Weiser - člen
1
Číslo
2
Název akce
v češtině
3
Název akce
v angličtině
European Proteomic
Conference and 3. Czech
Proteomic Conference
13
východoevropská
proteomická konference a
3. Česká proteomická
konference
35. výroční konference o
kvasinkách
nebyl
14
Cukrblik07
Zuckerblick07
12
d)
1
Číslo
1
35th Annual Conference on
Yeast.
AquaFluo 2007 Chlorophyll Fluorescence in
Aquatic Sciences
4
česky/anglicky
5
celkem/z toho
z ciziny
6
organizačního výboru
A. Pichová - členka
programového výboru
MBÜ AVČR
104/53
Mikrobiologický
ústav AV ČR , Ústav
fyzikální biologie JU
a Ústav systémové
biologie AV ČR
Česká chemická
společnost + MBÚ
AV ČR, v.v.i. V.
Křen
120 účastníků z 24
zemí světa.
78/30 (hlavně
Slovensko).
výčet jmen nejvýznamnějších zahraničních vědců, kteří navštívili pracoviště AV ČR
2
Jméno vědce
Msc. Robert Jankowiak, Ph. D.
3
Význačnost vědce a jeho obor
autor mnoha vědeckých článků v
prestižních mykologických a
fytopatologických časopisech
Oddělení lesnické fytopatologie
42
4
Mateřská instituce
Zemědělská univerzita Krakow
5
Stát
Polsko
1
Číslo
2
Jméno vědce
3
2
3
4
Dr. Gary Kruppa
Prof. Tek Chand Bhalla PhD.
Prof. J. Kopeček
5
Prof. Ines Swoboda
6
Prof. J. Mestecky
7
Prof. B. Dvorak
8
Prof. R. Apte
vicepresident
Professor in Biotechnology
vedoucí oddělení Department of
Pharmaceutics and Pharmaceutical
Chemistry, Center for Controlled
Chemical Delivery (CCCD),
špičkový odborník studia pylových a
potravinových alergenů,
vedoucí laboratoře Department of
Pathophysiology, Pathophysiology
vedoucí oddělení, špičkový oborník
ve slizniční imunitě
vedoucí oddělení Department of
Pediatrics
cytokiny a nádorová imunologie
9
Dr. John Larsen
vedoucí vědecký pracovník
10
Michael Dunn
11
Doc. Bozena Cukrowska
editor Proteomics, Klinická
proteomika
vedoucí laboratoře Department of
Pathology
12
13
14
Daniella Lavatore
Giada de Palma
Prof. Geoffrey Daniel
15
Dr. Jean-Luc Pernodet
profesor, šéf Wood Ultrastructure
Center
vedoucí Laboratoře molekulární
43
4
5
Stát
Bruker Daltonics
University of Himachal Pradesh
The University of Utah
USA
Indie
USA
Pathophysiology, Medical
University of Vienna
Rakousko
University of Alabama,
Birmingham
University of Arizona
USA
Ben-Gurion University, BeerSheva
Research Institute Flakkebjerg,
Slagelse
University College Dublin
USA
Izrael
Dánsko
Irsko
The Children’s Memorial Health
Institute
Polsko
Swedish University of Agricultural
Sciences Upsalla andUniversity of
Umea
Ústav genetiky a mikrobiologie,
Švédsko
Francie
1
Číslo
2
Jméno vědce
3
mikrobiologie aktinomycet
16
17
Dr. Marko Kaksonen
Dr. Elena Nadezdhina, A.N.
18
Prof. Ze'ev Barak
19
Dr. Boris Negrutski
20
Prof. Maija Ruklisha,
21
Prof. Ashwani Kumar
ředitel
22
Prof. Claude Leclerc
23
Prof. Ingo Just
ředitelka jednotky buněčné
imunologie
ředitel ústavu toxikologie
24
25
26
27
Prof. S. M. Jazwinski
Prof. F. Madeo
Prof. Hannelore Koller
Prof.Paul Falkowski
28
29
Prof.Govindjee
Dr. Giuseppe Torzillo
Department of Life Science, head
člen mj. prestižní National Academy
of Sciences, USA, vedoucí postava
v oboru ekofyziologie fytoplanktonu
přední odborník v oblasti fotosyntézy
44
4
Universita Paris-Sud, Orsay
EMBL Heidelberg
Belozersky Institute of PhysicoChemical Biology Moskva
Ben-Gurion University, BeerSheva
Institute of Molecular Biology and
Genetics, National Academy of
Sciences of Ukraine, Kiev
Institute of Microbiology &
Biotechnology, University of
Latvia, Riga
Industrial Toxicology Research
Centre, Lucknow
INSERM, Institut Pasteur, Paris
Medizinische Hochschule
Hannover
Tulane University, New Orleans
Karl-Franzens University, Graz
University of Salzburg
Rutgers University, New Jersey
University of Illinois
Istituto per lo Studio degli
Ecosistemi, CNR
Polo Scientifico
5
Stát
Německo
Rusko
Izrael
Ukrajina
Lotyšsko
Indie
Francie
Německo
USA
Rakousko
Rakousko
USA
USA
Itálie
e)
aktuální meziústavní dvoustranné dohody
1
Číslo
1
2
Spolupracující instituce
3
Stát
4
Oblast (téma) spolupráce
Žádné nemáme
5. Seznam ilustrací
1
Oddíl
1b
2
Číslo
řádku
2
3
Název (česky)
Molekulární modely β-Nacetylhexosaminidasy z
Aspergillus oryzae
4
Název (anglicky)
5
Popis (česky)
Molecular models of β-Nacetylhexosaminidase
from Aspergillus oryzae
45
Modely ukazují tvar
katalytické podjednotky
v pohledu z boku (A) a
shora (B) s aktivním
místem na C-konci a
uspořádání těchto
podjednotek v plně Nglykosylovaném dimeru
(C). Velká flexibilní
smyčka (D – pohled
z boku a E – pohled
shora, označeno žlutě)
zeleného monomeru je
přibližně 1 nm nad
aktivním místem
(označeno šedě)
červeného monomeru.
6
Popis (anglicky)
7
Označení
ilustrace
The models show the
obr_MBU
shape of the catalytic
_1b_2
subunit from a side view
(A) and a top view (B)
with the active site at
the C-terminus, and the
arrangement of these
subunits in the fully Nglycosylated dimer (C).
The large flexible loop
(D: side view, E: top
view, shown in yellow)
of the green monomer is
just about 1 nm above
the active site residues
(shown in grey) of the
red monomer.
1
Oddíl
2
Číslo
řádku
3
Název (česky)
4
Název (anglicky)
5
Popis (česky)
6
Popis (anglicky)
7
Označení
ilustrace
6. Seznam titulů vydaných na pracovišti
Folia Microbiologica, mezinárodní vědecký časopis s IF, vydávaný spolu s Československou společností mikrobiologickou. V roce 2007
byla zahájena jednání o připojení časopisu do konsorcia Springer.
Vyplnil dne:
Jméno:
21.1.2008
Jiří Gabriel
tel.:
296442231 e-mail: [email protected]
46

veřejné výzkumné instituce v roce 2007 a hlavní dosažené

Transkript

Podobné dokumenty

VZ o činnosti za rok 2006 - Přírodovědecká fakulta UJEP

program

Biodegradace - isb

Postup plnění úkolů k 31. srpnu 2008

2009 - Fyziologický ústav AV ČR

Genetické varianty určující resistenci k AIDS u osob

Urbanway 10,5 m – Cursor 8 CNG EURO VI

Výroční zpráva o činnosti a hospodaření za rok 2007

Kdo pije víno, má na víno

Prednaska 1_2015 - Katedra organické chemie