Časopis - Beckman Coulter

Transkript

Časopis - Beckman Coulter
informační magazín číslo 15 - 2010
POKROK V DIAGNÓZE NÁDORU PROSTATY
SLAVNOSTNÍ PŘEDÁNÍ ROBOTICKÉHO SYSTÉMU
BIOMEK PRO FN MOTOL
MEMBRÁNOVÉ MOLEKULY V PATOGENEZI
A DIAGNOSTICE NĚKTERÝCH CHOROB
PSA a karcinom
prostaty
Tento článek je zamyšlením nad minulostí
i současností PSA v klinické praxi.
bjev nádorového markeru PSA vzbudil naději mnoha tisíců
lidí na celém světě – pacientů i lékařů. Navíc bylo jejich očekávání výrazně posíleno i první studií provedenou v Tyrolsku,
která ukazovala, že důsledkem populačního screeningu
bude nejen zlepšení diagnostiky, ale také pokles závažných
komplikací, především tolik obávané metastatické formy prostatického karcinomu. Na toto onemocnění zemřel např. francouzský prezident Francois Mitterand. Bohužel další výzkumy ukázaly, že to nebude tak jednoduché. PSA je sice poměrně výrazně tkáňově
specifickým nádorovým markerem a jen ojediněle jej nacházíme zvýšený
u nádorů plic či některých dalších maligních procesů, není však vůbec
nádorově specifický. Bylo prokázáno, že se jeho hladina výrazně mění
i u benigních onemocnění prostaty, především u benigní hypertrofie a při
zánětech prostaty (prostatitidě). To vedlo k tomu, že se kromě klasického
vyšetření per rektum začala sonograficky měřit velikost prostaty. Hodnota
PSA korelovaná se sonografií se označovala jako „prostatická denzita“. Pozdější studie prokázaly, že rychlost zvětšování se prostaty v závislosti na
čase je podstatně rozdílná u benigní hypertrofie prostaty a u maligního
nádoru. Objevil se nový pojem „prostatická velocita“. Ale ani tyto dvě nové
hodnoty neřešily tzv. šedou zónu celkového PSA, která se podle různých
autorů pohybovala v rozmezí od 2 event. 4 ng/mL až do 10 ng/mL. Další
snahou zlepšit senzitivitu nádorového markeru PSA bylo zavedení normálních hodnot korigovaných s věkem. Toto úsilí sice přineslo zlepšení sensitivity, ale problém spolehlivě prováděného screeningu neřešilo.
V letech 2001 – 2004, kdy všude ve světě prudce narůstal počet provedených
vyšetření PSA a s tím i počet diagnostikovaných karcinomů, vyvstala nová
otázka. Je opravdu nutné vědet o všech případech karcinomu prostaty? Jsou
všechny karcinomy stejně agresivní? Neprovádíme nadbytečnou diagnostiku?
V souvislosti s nadbytečnou diagnostikou se objevil, především v USA, další
problém – obrovský počet chirurgicky odstraňovaných nádorů prostaty (totální
prostatektomie) a s tím spojené závažné komplikace od impotence přes striktury močové trubice a záněty až po inkontinenci. Vynořila se tak nová otázka
– neléčíme zbytečně často? S tím vším jsou pak spojeny rovněž dopady na
psychiku nemocných. Nemocný, jenž má vysoké PSA a jehož biopsie prokáže (či
někdy neprokáže) nádor, žije ve strachu, často navštěvuje svého praktického
lékaře nebo urologa, naléhá na zkvalitnění diagnostiky, dožaduje se léčby a tím
se roztáčí kolotoč zvaný „overdiagnosis“ a „overtreatment“.
Na celém světě se vymýšlejí optimální schémata, jakým způsobem
provádět stanovení karcinomu
prostaty. Zdůrazňuji stanovení
karcinomu prostaty, i když není
splněna podmínka 95% senzitivity
při 97% specificitě tak, jak to má
být u screeningových metod.
2
informační magazín číslo 15 - 2010
PROF. MUDR. ONDŘEJ TOPOLČAN, CSC.
VEDOUCÍ ÚSEKU IMUNOANALÝZY
ODDĚLENÍ NUKLEÁRNÍ MEDICÍNY
FN PLZEŇ – PRACOVIŠTĚ BORY
Za této situace se začíná řešit v laboratořích
nový problém – jak zlepšit nejen senzitivu, ale
i specificitu. Zkoumají se metabolity PSA a na
světlo vyplouvají nové metody stanovení volného a komplexního PSA a od nich odvozené
poměry. Na celém světě se vymýšlejí optimální
schémata, jakým způsobem provádět stanovení
karcinomu prostaty. Zdůrazňuji stanovení karcinomu prostaty, i když není splněna podmínka
95% senzitivity při 97% specificitě tak, jak to
má být u screeningových metod. Zároveň není
splněna ani podmínka, že je pro vytipovanou
ohroženou skupinu populace k dispozici metoda, která se spolehlivostí blízkou 100 % prokazuje přítomnost či nepřítomnost karcinomu.
Biopsie má svá úskalí a navíc jde o invazivní,
pro pacienta nepříjemnou, metodu. V tomto
okamžiku se začíná diskutovat co dál. V letech
2004 – 2005 se ve světě rozeběhly obrovské
řízené randomizované studie.
V České republice se v letech 2001 – 2004 řešil
problém plošného stanovení PSA. V době, kdy
byla v celé zemi odstartována kampaň prováděná praktickými lékaři, urology, klinickými biochemiky a sekcí imunoanalýzy, si nikdo neuvědomil,
že tato akce předbíhá svoji dobu. V rámci kampaně se totiž přestalo hovořit o screeningu, ale
začala být propagována včasná diagnostika karcinomu prostaty u poučeného muže. Na tuto
definici naváži skokově. Přečtete-li si podrobně
doporučený postup americké urologické společ-
Obsah
Prostatický specifický antigen (PSA): 4,0 = 3,1
5
Karcinom prostaty nadále zůstává jednou z hlavních příčin úmrtí na nádorová
onemocnění a každoročně si v Evropě a Spojených státech vyžádá přibližně
85 000 obětí, 55 000 úmrtí v Evropě a 30 000 úmrtí ve Spojených státech.
p2PSA: pokrok v diagnóze nádoru prostaty
6
V současné době nabízí společnost Beckman Coulter tři parametry pro
diagnózu pravděpodobnosti výskytu nádoru prostaty. Jedná se o: PSA,
freePSA a p2PSA.
PSA izoformy, [-2]proPSA a Index zdravé prostaty (phi)
SPRIworks Fragment Library System
7
10
Plne automatizovaný systém pre prípravu sérií vzoriek fragmentov pre
sekvenátory druhej generácie, ako sú Roche GS FLX a Illumina Genome
Analyzer, umožňujúce masívne paralelné sekvenovanie.
Slavnostní předání robotického systému
Biomek pro FN Motol
11
V únoru tohoto roku byl na pracovišti Kliniky dětské hematologie a onkologie
2. LF UK a FN Motol nainstalován pipetovací robot pro monitorování virové
infekce BIOMEK NXp Span8.
Časopis vydává a distribuuje
Beckman Coulter Česká republika s.r.o.,
Radiová 1, 102 27 Praha 10, www.beckman.cz
Časopis připravují
Ing. Vanda Filová, PhD.
Ing. Kateřina Kožaná
Ing. Eva Králová
Ing. Hana Krátká
Mgr. Pavel Kružík
RNDr. Helena Kurzweilová, CSc.
Ing. Kateřina Lapišová, PhD.
Ing. Petr Suchan
Mgr. Patrik Šaf
RNDr. Jozef Smolka
Do časopisu přispěli
Prof. MUDr. Ondřej Topolčan, CSc. - FN Plzeň
Ing. Kateřina Lapišová, PhD.
Ing. Mgr. Ivana Mičíková
RNDr. Jozef Smolka
Ing. Jan Jedlička - NF Kapka naděje
Ing. Eva Králová
RNDr. Kristián Koubek, DrSc. - ÚHKT
Mgr. Pavel Kružík
Ing. Vanda Filová, PhD.
Ing. Kateřina Kožaná
Ing. Magda Karpetová
Ivan Šarkan - autor křížovky
Ing. Stanislav Čermák - autor tajenky
Graf ická podoba
Nina Nováková
Tiskárna
REPRO servis s. r. o.
Starochuchelská 15/195, 159 00 Praha 5
Náklad čísla
1800 výtisků
Life Science Research
12
Nový přehled produktů pro výzkumné, klinické a průmyslové laboratoře
Membránové molekuly v patogenezi
a diagnostice některých chorob
12
SOLASTRATM: nové reagencie
pro typizaci lymfomů a leukemií
26
Soupravy monoklonálních protilátek jsou určeny pro typizaci buněk
periferní krve a kostní dřeně vzorků lymfomů a leukemií. Kombinace 23
monoklonálních protilátek značených 5 různými fluorochromy je seskupena
v 7 lahvičkách. Osmou lahvičkou jsou negativní kontroly.
16. setkání distributorů manuálních
imunoanalytických souprav
27
Uživatelské setkání Beckman Coulter
28
XXXI. Imunoanalytické dny a X. Mezinárodní
konference CECHTUMA Mikulov
29
Finanční útvar
30
Křížovka o ceny
31
Kde se můžeme setkat (červen – září 2010)
32
informační magazín číslo 15 - 2010
3
nosti z roku 2010 (www.auanet.org/content/homepage/homepage.cfm),
jednou z jeho zásad je vytvoření úzké spolupráce mezi mužem – pacientem
a lékařem. Pro pacienta je nutností spolurozhodovat o tom, jak, kdy a proč
bude vyšetření PSA probíhat. Neboť hlavním cílem, který si v současnosti
klademe, není senzitivita a specificita screeningu, nýbrž odstranění overdiagnosis a overtreatment, tzn. rozhodnutí, kdy přistupovat k radikální léčbě
a kdy být v léčbě konzervativní. Jde tedy o určení stupně agresivity nádoru.
Druhým problémem je stále vysoké procento zbytečně prováděných biopsií,
tj. optimalizace specificity. Zde opět laboratoř přispěchala s pomocí. Existují metody molekulární biologie, které určují nádorové buňky v moči. Jde
o vysoce specifické metody s náročnou preanalytickou fází, neboť je nutné
provádět spolehlivou standardní masáž prostaty. Druhou cestou je řešení
společnosti Beckman Coulter. Ta se již řadu let zabývá studiem forem volného PSA a v letošním roce přichází na trh s nadějným novým stanovením
p2PSA – látky, jejíž koncentrace v séru se zvyšuje především u karcinomu
prostaty, kdežto u hypertrofie prostaty se vyskytuje pouze v nízké koncentraci. Z prvních publikovaných prací je zřejmé, že umožňuje jak zlepšení
odhadu agresivity nádoru, tak snížení počtu prováděných biopsií. Praxe
však ukáže, zda tomu tak skutečně je.
Závěrem bych chtěl zdůraznit, že se v České republice od počátku provádí pouze včasná diagnostika. Od začátku je také snaha o sladění diagnostického i terapeutického postupu s ohledem na kvalitu života nemocného
muže. Zajímavostí diagnostiky prostatického karcinomu je, že všechny
nové metody, indexy apod. většinou rozšiřují paletu a jen ojediněle vedou
k popření předcházejícího. Zvláštní kapitolou, která je mimo rámec tohoto
úvodníku, je monitoring konzervativní léčby a včasná diagnostika relapsu
onemocnění po provedené totální prostatektomii.
Jak již bylo zmíněno dříve, je možné provádět screening karcinomu prostaty za pomoci sledování koncentrace celkového PSA, nověji v kombinaci se
stanovením volného PSA (fPSA) nebo komplexního PSA (cPSA). Již na začátku
studií zaměřených na populační screening se objevily značné nejistoty, pokud
jde o skutečný přínos brzkého odhalení karcinomu prostaty. Zdá se, že pravidelné testování PSA může snížit pravděpodobnost úmrtí na rakovinu prostaty. Na druhou stranu je třeba zvážit všechna možná rizika, která vznikají
4
informační magazín číslo 15 - 2010
v důsledku včasného odhalení karcinomu prostaty
a následné léčby.
Literatura
1. Smith, R.A.; Cokkinides, V.; Brooks, D.; Saslow, D.;
Brawley, O.W. Cancer Screening In the United States, 2010: a review of current American Cancer
Society guidelines and issues in cancer screening.
CA Cancer J Clin. 2010; 60(2)99-119.
2. Wolf, A.M.; Wender, R.C.; Etzioni, R.B.; Thompson,
I.M.; D‘Amico, A.V.; Volk, R.J.; Brooks, D.D.; Dash, C.;
Guessous, I.; Andrews, K.; DeSantis, C.; Smith, R.A.
American Cancer Society Prostate Cancer Advisory
Committee. American Cancer Society guideline for
the early detection of prostate cancer: update
2010. CA Cancer J Clin. 2010; 60(2):70-98.
3. Smith, R.A.; Cokkinides, V.; Eyre, H.J. American
Cancer Society guidelines for the early detection of
cancer, 2003. CA Cancer J Clin. 2003 Jan-Feb;
53(1):27-43.
4. von Eschenbach, A.; Ho, R.; Murény, G.P.; Cunningham, M.; Lins, N. American Cancer Society guidelines
for the early detection of prostate cancer: update,
June 10,1997. Cancer 1997 Nov 1; 80(9):1805-7.
5. Miller, A.B. What is the role of early detection
and screening in cancer control? J Public Health
Policy. 1993; 14(4):403-12.
PROF. MUDR. ONDŘEJ TOPOLČAN, CSC.
ÚSEK IMUNOANALÝZY
ODDĚLENÍ NUKLEÁRNÍ MEDICÍNY
FN PLZEŇ – PRACOVIŠTĚ BORY
DR. E. BENEŠE 13, 305 99 PLZEŇ
E-MAIL: [email protected]
akovina prostaty je v České republice ročně odhalena u 5 000 mužů,
z nich asi třetina tomuto onemocnění podlehne. Nemocných nadále
přibývá. Za posledních 30 let se incidence zvýšila asi pětkrát, přičemž
mortalita je vysoká a stále roste.
V zemích západní Evropy začala v polovině 90. let
úmrtnost klesat. V České republice může tento
zlom nastat, jestliže se zlepší prevence.
Prostata je žláza o velikosti ořechu. Je umístěna
v přední části konečníku těsně pod močovým
měchýřem. U mužů je rakovina prostaty nejčastějším typem nádorového onemocnění. Rakovina
prostaty může mít pomalý vývoj. Mnoho starších
lidí s touto nemocí zemře z jiných příčin, aniž je
jejich nemoc objevena. Rakovina prostaty však
může mít také progresivní průběh, zejména
u nižších věkových skupin. Průběh onemocnění je
velmi individuální, proto je důležitá prevence
a včasná diagnóza.
Mezi nejčastější rizikové faktory tohoto onemocnění patří věk. Dvě třetiny všech nálezů rakoviny
prostaty jsou u mužů nad 65 let. Vliv může mít také
etnický původ, dieta a životní styl. Strava s vysokým obsahem červeného masa a mléčných výrobků
(například plnotučné mléko, sýry nebo zmrzlina)
zvyšuje riziko rakoviny prostaty. Větší pozornost by
měla být také věnována pacientům s předchozí
rodinnou anamnézou.
Již dnes mohou muži v České republice zažádat
o preventivní vyšetření. Provádí ho praktický lékař.
Preventivní vyšetření se skládá ze dvou částí – rozboru krve a pohmatového vyšetření prostaty.
Mezi základní imunochemické markery v diagnostice nádoru prostaty patří bezesporu stanove-
Prostatický specifický
antigen (PSA): 4,0 = 3,1
Karcinom prostaty nadále zůstává jednou
z hlavních příčin úmrtí na nádorová onemocnění
a každoročně si v Evropě a Spojených státech
vyžádá přibližně 85 000 obětí, 55 000 úmrtí
v Evropě a 30 000 úmrtí ve Spojených státech.
ní PSA a freePSA. Stanovení parametru PSA a freePSA může eliminovat počet
biopsií téměř o 20 %. Společnost Beckman Coulter má tyto parametry rovněž
ve své nabídce a poskytuje také výběr ze dvou kalibrací – tradiční Hybritech
kalibraci, která je považována za zlatý standard, a poměrně novou rekalibraci
dle požadavků Světové zdravotnické organizace (WHO), která má za cíl sjednotit mezi sebou jednotlivé výrobce diagnostických souprav. Je na uživatelích,
jaký typ kalibrace si zvolí. S tím však souvisí správná volba hodnoty cutoff
a následná interpretace výsledků.
Standard Hybritechu se datuje do roku 1986, kdy se stal izotopový test Hybridech TandemTM-R první esejí doporučenou k monitorování rakoviny prostaty. Na
základě dlouhodobé studie byly stanoveny rozhodovací limity, které jsou platné
dodnes. Hybritech® stanovil pro PSA cutoff hodnotu 4,0 ng/ml, která byla přijata
jako standard pro doporučení biopsie prostaty. Vzhledem k rostoucímu počtu
výrobců souprav pro stanovení PSA se začaly objevovat rozdíly mezi jednotlivými
stanoveními, a proto byla ustanovena globální standardizace dle WHO
– tzv. Standfordský standard, na který by měli navázat všichni výrobci souprav PSA.
Pro tento standard WHO byl společností Beckman Coulter stanoven nový cutoff,
který se pro automatizované soupravy Beckman Coulter liší o 22% bod od původního standardu, což posouvá tradiční cutoff pro PSA z 4,0 ng/ml na 3,1 ng/ml.
Obr. 1: Převodní diagram mezi Hybritech PSA a WHO PSA
Beckman Coulter vyhodnocoval vliv WHO kalibrace na dílčích klinických
studiích, kdy bylo vyšetřeno 6 630 mužů. Při použití cutoff 4,0 ng/ml bylo identifikováno 208 případů rakoviny prostaty. Jestliže byla použita kalibrace WHO, avšak
s cutoff 4,0 ng/ml, nebylo 38 případů (18 %) z předchozích 208 identifikovaných
zachyceno. Při použití cutoff 3,1 ng/ml byli identifikováni všichni pacienti.
Je proto zásadní používat pro obě metody stanovení, PSA a freePSA, stejný
typ kalibrace a k němu odpovídající hodnoty cutoff. V neposlední řadě se nesmí
zapomínat na kontrolní materiál a jeho vyhodnocení, popř. správné zařazení
účastníků do skupin v rámci externího hodnocení kvality.
Více na: www.beckmancoulter.com/PSAvalue.
KATEŘINA LAPIŠOVÁ, E-MAIL: [email protected]
IVANA MIČÍKOVÁ, E-MAIL: [email protected]
informační magazín číslo 15 - 2010
5
p2PSA: pokrok
v diagnóze nádoru prostaty
V současné době nabízí společnost Beckman Coulter tři
parametry pro diagnózu pravděpodobnosti výskytu
nádoru prostaty. Jedná se o: PSA, freePSA a p2PSA.
První dva parametry jsou již běžně rutinně používány, p2PSA
je však zcela novým parametrem v našem imunochemickém
menu a na trhu jej firma Beckman Coulter nabízí jako jediná.
Jedná se o stanovení izoformy [-2] proPSA, která je z jednotlivých izoforem proPSA nejstabilnější. O klinickém využití
uvedeného parametru se více dočtete v následujícím příspěvku tohoto časopisu: „PSA izoformy, [-2]proPSA a Index
zdravé prostaty (phi)“.
Metodu p2PSA lze stanovovat na systémech Access 2 a UniCel DxI. Jedná se o chemiluminiscenční stanovení s paramagnetickými částicemi
(vlastnosti soupravy shrnuje tabulka 1). V současné době probíhá první
PN
Název
A49752
Access Hybritech p2PSA, 2x50 tests
A49753
Access Hybritech p2PSA calibartors (7 x 2,1 ml)
A56934
Access Hybritech p2PSA QC (3 hladiny, 1 x 5 ml)
Tabulka 1: Informace o soupravě pro stanovení p2PSA
Formát
1-krokový/sendvič
Objem vzorku
50 μl
Čas do prvního výsledku
20 min
Dynamický rozsah
0-5000 pg/ml
Stabilita otevřeného packu
28 dní
Stabilita kalibrační křivky
28 dní
Hladiny kalibrátorů pg/ml
0, 10, 20, 50, 100, 500, 5000
Kalibrátory
připraveny k použití
Hladiny kontrol pg/ml
~ 20, 175, 1000
Kontroly
připraveny k použití
klinické testování této soupravy v České republice. S výsledky studie vás seznámíme v příštím
čísle časopisu IVD.
V kombinaci se stanovením Access Hybritech
PSA a free PSA se p2PSA používá pro výpočet
Beckman Coulter phi (prostate health index) –
multivariačního indexu, který slouží jako pomůcka
ke stanovení rizika přítomnosti karcinomu prostaty
a odlišení karcinomu od benigních prostatických
stavů. Všechny tři parametry je zapotřebí stanovit
ze stejného vzorku séra, na stejném systému a za
použití stejného typu kalibrace (Hybritech nebo
WHO).
Výše stanovené koncentrace PSA a fPSA závisí na standardu použitém ke kalibraci stanovení. Hodnoty koncentrace PSA a fPSA založené
na kalibraci podle referenčního postupu přípravy WHO 96/670 (PSA) nebo WHO 96/668 (fPSA)
se budou lišit od koncentrací PSA a fPSA
založených na kalibraci podle originálních stanovení Hybritech Tandem™-R. Koncentrace nejsou vzájemně zaměnitelné a pro výpočet indexu phi nezaměňujte kalibraci Hybritech a WHO.
Pokud se typ kalibrace změní, přijatou laboratorní praxí je stanovit novou výchozí hodnotu
pro sledování pacienta.
KATEŘINA LAPIŠOVÁ
E-MAIL: [email protected]
IVANA MIČÍKOVÁ
E-MAIL: [email protected]
PSA izoformy, [-2]proPSA
a Index zdravé prostaty (phi)
érový PSA existuje primárně buď ve volné „nekomplexní“ formě
(fPSA) anebo jako PSA „komplexní“ (cPSA). Obvykle je 70 – 90 %
PSA v séru přítomno jako cPSA, zbytek tvoří fPSA. Bylo prokázáno,
že %fPSA (poměr fPSA vůči PSA) v séru významně zlepšuje rozlišení karcinomu prostaty od benigní hyperplasie prostaty (BPH),
a to zejména u pacientů s hladinami PSA v rozmezí >4 až <10
ng/ml. Vyšší %fPSA v séru koreluje s nižším rizikem karcinomu
prostaty, zatímco hodnoty %fPSA pod 10 % jsou mnohem více spojovány s karcinomem.
ProPSA a BPSA představují rozdílné formy fPSA, které prokazují lepší korelaci
s onemocněním než PSA, fPSA nebo cPSA samotné. Ukázalo se, že zkrácené
6
informační magazín číslo 15 - 2010
formy proPSA jsou zvýšené v periferní zóně tkáně
karcinomu v porovnání s tkáněmi BPH. ProPSA byl
nalezen ve zvýšené koncentraci ve tkáni tumoru
prostaty, zatímco BPSA byl zvýšený v nodulární
tkáni přechodové zóny BPH v porovnání s koncentrací ve tkáni periferní zóny.
ProPSA, jakožto nativní forma, obsahuje 7 aminokyselin pro vedoucí peptid ([-7proPSA]) společně
se zkrácenými formami obsahujícími menší počet
aminokyselin ([-5,-4,-2]proPSA). Nejvíce pozornosti se věnuje [-2]proPSA, protože jde o primární for-
mu nalezenou v extraktech z tumorů. Z identifikovaných forem proPSA je [-2]proPSA nejstabilnější.
Access Hybritech p2PSA vyvinula společnost
Beckman Coulter pro měření [-2]proPSA v séru. Při
studiích prováděných na mužích, u nichž biopsie
potvrdila karcinom prostaty, se ukázalo, že
[-2]proPSA v rozsahu PSA >2,0 až <10,0 ng/ml
zlepšovalo specificitu detekce karcinomu vůči %fPSA
samotnému. Užitečnost [-2]proPSA u mužů s PSA
pod 4,0 ng/ml je zvláště zajímavá, protože v tomto
rozpětí existuje mnoho karcinomů. Údaje z literatury
jsou ve shodě se zamýšleným použitím stanovení
Access Hybritech p2PSA, společně se stanoveními
Access Hybritech PSA a free PSA, pro výpočet
Beckman Coulter phi pro další hodnocení pacientů
s úrovněmi PSA v rozpětí >2,0 až <10,0 ng/ml, dle
vzorce: phi = (p2PSA/freePSA) * PSA^0.5.
Údaje z literatury podporují závěr, že prekurzorní formy PSA nastupují jakožto potenciální
důležité diagnostické sérové markery pro rozšíření
a zlepšení detekce karcinomu prostaty. Výsledky
multicentrického klinického hodnocení společnosti Beckman Coulter vedly k závěru, že hodnoty
Beckman Coulter phi významně zdokonalily klinickou specificitu relativně vůči PSA a %fPSA při
detekci karcinomu prostaty. Při 95% klinické citlivosti byla klinická specificita pro Beckman Coulter
phi 18,2 % v porovnání s 6,6 % pro %fPSA u PSA
v rozsahu od >2 ng/ml až <10 ng/ml. Zlepšení klinické specificity pro Beckman Coulter phi vůči
%fPSA představuje zásadní výhodu při testování
určeném jako pomůcka pro odlišení karcinomu
prostaty od benigních prostatických stavů u mužů
ve věku nad 50 let s celkovým PSA >2,0 až
<10,0 ng/ml a od nálezů digitálního rektálního
vyšetření, které nevzbuzují podezření na výskyt
karcinomu. Beckman Coulter phi lze rovněž použít
k hodnocení rizika, stanovení pravděpodobnosti
vzniku karcinomu u individuálního pacienta. Vyšší
hodnoty Beckman Coulter phi jsou spojeny s vyšším rizikem karcinomu.
Tento index může být vypočítán přímo v analyzátoru a může být použit pro individuální posouzení rizik karcinomu prostaty.
Výsledky stanovení Beckman Coulter phi by měly
být interpretovány ve světle celkového klinického
obrazu pacienta včetně příznaků, anamnézy a údajů z dalších testů a příslušných informací. Beckman
Coulter phi by neměl být pokládán za absolutní
důkaz o přítomnosti nebo nepřítomnosti karcinomu prostaty. Některé případy časného karcinomu
prostaty nebudou odhaleny testováním PSA, totéž
platí pro digitální rektální vyšetření. Biopsie prostaty je standardní metodou používanou pro potvrzení přítomnosti nebo nepřítomnosti karcinomu prostaty, i když ani toto vyšetření není, zejména
vzhledem k možným chybám při odběru vzorku,
100% důkazem přítomnosti či nepřítomnosti karcinomu prostaty.
Tabulka 1: PSA, fPSA, [-2]pro PSA, % fPSA a Beckman Coulter phi
Očekávané výsledky podle diagnózy (Kalibrace Hybritech
PSA a volného PSA)
Benigní
Maligní
Celkem
PSA (ng/ml)
Kalibrace
Hybritech
Medián
Průměr ±SD
Rozsah
5,09
5,29±1,95
1,99-10,04
5,28
5,35±1,87
2,02-9,68
5,15
5,31±1,91
1,99-10,04
fPSA (ng/ml)
Kalibrace
Hybritech
Medián
Průměr ±SD
Rozsah
0,98
1,04±0,51
0,26-4,34
0,80
0,92±0,55
0,18-3,91
0,90
0,99±0,53
0,18-4,34
[-2]pro PSA
(pg/ml)*
Medián
Průměr ±SD
Rozsah
12,44
13,84±6,79
2,86-43,54
13,41
16,08±10,30
3,98-90,78
12,94
14,85±8,61
2,86-90,78
% fPSA
Medián
Průměr ±SD
Rozsah
19,38
20,33±7,94
3,51-53,22
16,15
17,51±8,05
5,37-51,07
17,80
19,06±8,11
3,51-53,22
phi
Medián
Průměr ±SD
Rozsah
29,42
37,63
32,59
31,81±13,25 43,69±26,64 37,14±21,20
13,67-97,44 14,03-325,80 13,67-325,80
* Pro [-2]pro PSA není dostupný žádný standard WHO – pouze kalibrace Hybritech
Tabulka 2: PSA, fPSA, [-2]pro PSA, % fPSA a Beckman Coulter phi
Očekávané výsledky podle diagnózy (Kalibrace WHO PSA
a volného PSA)
Benigní
Maligní
Celkem
PSA (ng/ml)
Kalibrace
WHO
Medián
Průměr ±SD
Rozsah
3,99
4,19±1,52
1,57-7,94
4,20
4,24±1,45
1,60-7,63
4,09
4,21±1,49
1,57-7,94
fPSA (ng/ml)
Kalibrace
WHO
Medián
Průměr ±SD
Rozsah
0,77
0,82±0,40
0,20-3,51
0,63
0,73±0,44
0,14-3,15
0,70
0,78±0,42
0,14-3,51
[-2]pro PSA
(pg/ml)*
Medián
Průměr ±SD
Rozsah
12,44
13,84±6,79
2,86-43,54
13,41
16,08±10,30
3,98-90,78
12,94
14,85±8,61
2,86-90,78
% fPSA
Medián
Průměr ±SD
Rozsah
18,96
20,07±7,71
3,50-49,51
15,79
17,31±7,94
5,06-51,39
17,71
18,83±7,93
3,50-51,39
phi
Medián
33,18
42,76
37,27
Průměr ±SD 36,12±14,98 49,51±30,53 42,13±24,19
Rozsah
15,57-106,03 15,52-377,29 15,52-377,29
* Pro [-2]pro PSA není dostupný žádný standard WHO – pouze kalibrace Hybritech
Očekávané hodnoty
Multicentrické klinické hodnocení ze šesti pracovišť s kombinací prospektivních a retrospektivních subjektů bylo prováděno za účelem testování
účinnosti Beckman Coulter phi. Všechny zkoumané subjekty byly ve věku
od 50 do 84 let s hodnotami sérového PSA v rozsahu 2 až 10 ng/ml (kalibrace Hybritech) a nálezy digitálního rektálního vyšetření (DRE), u nichž
informační magazín číslo 15 - 2010
7
Tabulka 3: Klinická senzitivita a specificita karcinomu prostaty
Hodnoty cutoff pro Beckman Coulter phi u mužů bez
podezření z DRE (Kalibrace Hybritech PSA a volného PSA)
% klinická citlivost
Kalibrace Hybritech
phi cutoff
specificita
17,78
8,7
18,44
10,5
21,13
18,2
23,82
30,4
25
33,6
26,34
38,8
27,58
45,1
29,25
49,3
30,44
54,2
31,69
58
33,98
66,1
36,22
72,7
37,63
75,2
39,34
80,1
42,14
84,6
45,11
88,1
47,64
90,2
50,01
92
55,08
94,4
59,2
95,5
68
96,9
87,23
99,3
99
98
95
90
88
85
80
75
70
65
60
55
50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
8
informační magazín číslo 15 - 2010
nebylo podezření na karcinom. Tito muži představují „diagnostickou šedou zónu“ a spadají do
vysoce rizikové skupiny (25% míra karcinomu
u mužů nad 50 let věku), u níž by se však klinická
specificita mohla dále zlepšit. Pro rozsahy PSA
od 2 až 4 ng/ml a 4 až 10 ng/ml PSA bylo prokázáno srovnatelné riziko karcinomu prostaty, přibližně 25%.
Studie se účastnilo celkem 519 mužů (233 s karcinomem prostaty a 286 bez karcinomu prostaty).
Vyřazovací kritéria zahrnovala: předchozí karcinom prostaty v anamnéze, nedávnou prostatickou
manipulaci, která by mohla ovlivňovat hodnoty
PSA během třech měsíců předcházejících odběrům krve (včetně androgenní terapie), akutní prostatitidy, infekce močových test, předchozí transuretrální resekce prostaty (TURP), jednoznačné
výsledky biopsie, DRE s diskrétními moduly
s podezřením na karcinom a PSA <2,0 nebo
>10,0 ng/ml.
Medián věku pro pacienty s karcinomem byl
63 let a pro pacienty s benigním onemocněním
62 let. Tabulka 1 a tabulka 2 ukazují očekávané
hodnoty na základě kalibrací Hybritech a WHO pro
PSA (ng/ml), fPSA (ng/ml), [-2]proPSA (pg/ml),
%fPSA [(fPSA/PSA) x 100 %] a Beckman Coulter
phi pro tuto populaci mužů. Rozsah PSA >2 až
<10 ng/ml s kalibrací Hybritech odpovídá rozsahu
>1,6 až <7,8 ng/ml s kalibrací WHO.
Beckman Coulter phi je multifaktoriální matematickou kombinací koncentrací PSA, fPSA
a [-2] proPSA navržené pro optimalizaci klinické
citlivosti a specificity jakožto pomůcky při určování rizika karcinomu prostaty. Ukázalo se, že
Beckman Coulter phi významně zlepšil klinickou
specificitu napříč rozsahem klinické citlivosti
a detekci karcinomu relativně vůči PSA a %fPSA
v rozsahu PSA od 2 do 10 ng/ml u mužů ve věku
>50 let bez podezření z nálezu DRE. Výsledky
Beckman Coulter phi pro klinickou senzitivitu
a specificitu jsou shrnuty v tabulce 3 a tabulce 4.
Výběr vhodného skóre Beckman Coulter phi, které
slouží jako vodítko pro léčbu pacienta, uvažuje
procentuální podíl detekovaných karcinomů (klinická citlivost) a podíl mužů bez karcinomu,
u nichž je možné vyhnout se biopsii (klinická specificita). Například pomocí kalibrace Hybritech pro
PSA a volný PSA hodnota Beckman Coulter phi
25 odpovídá 88% klinické senzitivitě a 33,6% klinické specificitě. Proto se přibližně 1 ze 3 mužů
může vyhnout biopsii prostaty, zatímco se detekuje 88 % onemocnění, pokud je jejich hodnota
Beckman Coulter phi nižší než 25. U mužů s hodnotou Beckman Coulter phi nad 25 riziko karcinomu vzrůstá a může nepříznivě ovlivnit klinickou
léčbu každého pacienta. Nízká skóre Beckman
Coulter phi jsou spojena s nižším rizikem onemocnění karcinomem a vyšší skóre jsou spojena
se zvýšeným rizikem onemocnění karcinomem.
Volba vhodného skóre Beckman Coulter phi, které
bude použito jako vodítko při klinickém rozhodování, se může pro každého pacienta měnit a může
záviset částečně na jiných klinicky důležitých faktorech nebo na rodinné anamnéze onemocnění.
Tabulka 4: Klinická senzitivita a specificita karcinomu prostaty
Hodnoty cutoff pro Beckman Coulter phi u mužů bez
podezření z DRE (Kalibrace WHO PSA a volného PSA)
% klinická citlivost
Kalibrace WHO
phi cutoff
specificita
99
19,96
8,4
98
20,57
9,8
95
23,45
16,1
90
26,93
28,3
88
28,09
31,8
85
29,98
40,2
80
31,57
45,1
75
33,34
50,7
70
35,01
55,6
65
36,9
59,8
60
38,79
66,1
55
40,63
71,3
Individuální hodnocení
rizik pacienta
50
42,76
76,6
45
45,03
80,8
Beckman Coulter phi lze rovněž použít ke stanovení
relativního rizika (pravděpodobnosti) karcinomu prostaty u jednotlivých mužů. Rodinná a individuální
anamnéza pacienta může být použita v kombinaci
s výsledky Beckman Coulter phi pro stanovení nejlepších individualizovaných rozhodnutí o léčbě pacienta. Kromě citlivosti a specificity analýz údajů ze studie prováděné na více pracovištích odhadujeme
pravděpodobnost, že má jednotlivec detekovatelný
karcinom na základě hodnot Beckman Coulter phi.
V populaci mužů s PSA v rozsahu 2,0 až 10,0 ng/ml
a bez podezření z DRE byla již dříve hlášena 25%
pozitivní míra biopsie. Studie populace prováděné na
více pracovištích obsahovala přibližně 45 % (233/519)
pacientů s karcinomem a 55 % (286/519) pacientů
bez karcinomu. Pravděpodobnosti karcinomu založené na 45% poměru pacientů s karcinomem by zvýšily odhady rizika pro detekování karcinomu. Proto
byl poměr pacientů s karcinomem upraven na 25 %
před výpočtem pravděpodobností karcinomu pro
různá skóre Beckman Coulter phi. Tato úprava přináší přesné pravděpodobnosti pro skupinu mužů,
u nichž bude tento test používán.
Metoda zaváděcího programu byla použita pro
opakované vzorkování studie populace prováděné na více pracovištích. Každý vzorek obsahoval
286 (75 %) benigních subjektů a 95 (25 %) subjektů s karcinomem, celkem tedy 381 subjektů.
Tento proces náhodného vzorkování byl opakován 1000x. Vypočítali jsme průměrné pravděpodobnosti vzniku karcinomu (odhady rizika)
a neparametrické 95% intervaly spolehlivosti
(2,5. a 97,5. percentil). Tato metoda opakovaného
vzorkování zvyšuje spolehlivost odhadů rizika.
Tabulka 5 (na základě kalibrace Hybritech) a tabulka 6 (na základě kalibrace WHO) ukazuje pravděpodobnost detekce karcinomu prostaty při biopsii
na základě upraveného 25 % podílu subjektů
40
46,97
82,5
35
50,94
88,1
30
53,84
90,6
Testy kalibrace PSA
a volného PSA dle WHO
upravují skóre Beckman
Coulter phi
Rozsah PSA 2 až 10 ng/ml s kalibrací Hybritech
odpovídá rozsahu PSA 1,6 až 7,8 ng/ml s kalibrací
WHO. Skóre Beckman Coulter phi se bude rovněž
lišit, jestliže výsledky PSA a volného PSA použité
k odvození skóre Beckman Coulter phi byly kalibrovány dle WHO. Proto se může přibližně 1 ze 3 mužů
vyhnout biopsii, pokud mají skóre Beckman Coulter
phi 28,1 nebo nižší.
25
56,3
92
20
61,85
93,7
15
66,51
95,5
10
78,42
97,6
5
97,73
99
Tabulka 5: Pravděpodobnost (hodnocení rizika) karcinomu
prostaty. Pro Beckman Coulter phi pacientů s PSA
mezi 2 a 10 ng/ml (Kalibrace Hybritech PSA a volného PSA)
Rozsah phi
(Kalibrace Hybritech)
Pravděpodobnost
karcinomu
95% interval
spolehlivosti
0-21
8,4 %
1,9-16,1 %
21-40
21,0 %
17,3-24,6 %
40+
44,0 %
36,0-52,9 %
Tabulka 6: Pravděpodobnost (hodnocení rizika) karcinomu
prostaty Pro Beckman Coulter phi pacientů s PSA
mezi 1,6 a 7,8 ng/ml (Kalibrace WHO PSA a volného PSA)
Rozsah phi
(Kalibrace WHO)
Pravděpodobnost
karcinomu
95% interval
spolehlivosti
0-23
8,7 %
2,0-17,0 %
23-45
20,6 %
17,1-24,1 %
45+
43,8 %
35,8-52,2 %
s karcinomem. Silný vztah mezi Beckman Coulter phi a pravděpodobností
karcinomu prostaty lze pozorovat při vysokých hodnotách Beckman Coulter
phi spojovaných s vysokým rizikem karcinomu.
KATEŘINA LAPIŠOVÁ
E-MAIL: [email protected]
IVANA MIČÍKOVÁ
E-MAIL: [email protected]
informační magazín číslo 15 - 2010
9
SPRIworks Fragment
Library System
SPRIworks Fragment Library System je plne
automatizovaný systém pre prípravu sérií
vzoriek fragmentov pre sekvenátory druhej
generácie, ako sú Roche GS FLX a Illumina
Genome Analyzer*, umožňujúce masívne
paralelné sekvenovanie.
anuálna príprava takýchto sérií vzoriek je úzkym hrdlom celého laboratórneho procesu, je relatívne komplikovaná a predovšetkým časovo veľmi náročná. Aj skúsený laboratórny pracovník v priemere nie je schopný v priebehu jedného dňa
pripraviť viac ako 4 série vzoriek pre sekvenovanie.
Beckman Coulter ako prvý prichádza s riešením, ktoré zjednodušuje a hlavne automatizuje celý tento časovo zdĺhavý proces,
pričom využíva patentovanú technológiu SPRI (Solid Phase Reversible Immobilization) založenú na reverzibilnej väzbe nukleových kyselín na paramagnetické mikročastice, rovnako ako je to u kitov Agentcourt®.
SPRI Works Fragment Library System sa skladá z troch častí: SPRI-TE extraktora nukleových kyselín, karty metód, ktorá slúži ku kontrole správneho postu-
Počet sérií vzoriek za deň
Graf 1: Porovnanie množstva pripravených vzoriek – manuálne
a pomocou SPRI works Fragment Library System
22
20
18
16
14
12
10
8
6
4
2
0
SPRIworks System
automatizovaný
proces
Manuálna príprava
sérií vzoriek
pu pipetovania, a z cartridge, ktorá obsahuje všetky
reagencie potrebné pre prípravu série vzoriek. Všetky reagencie, špičky a skúmavky potrebné pre prípravu série vzoriek sú zahrnuté v kite SPRIworks
Fragment Library Kit. Úžívateľ potrebuje len adaptéry pre príslušný typ sekvenátora a skúmanú vzorku. Následne tieto komponenty vkladá do analyzátora. SPRIworks je stolový typ prístroja, ktorý je
v priebehu 5 hodín schopný pripraviť paralelne až
10 sérií vzoriek pre sekvenátory druhej generácie,
pričom manuálna príprava pred samotným spustením tvorby sérií vzoriek zaberie menej ako
5 minút.
SPRI chémia je optimalizovaná na vyčistenie
fragmentovanej DNA a zároveň umožňuje výber
veľkosti fragmentov pre pripravovaný súbor vzoriek. K dispozícii sú dva rozsahy dĺžky fragmentov
ako aj možnosť prípravy vzoriek bez výberu veľkosti fragmentov určená predovšetkým pri spracovaní
amplikónov. Táto vlastnosť nahrádza potrebu
použitia gélov a kolóniek pre vyčistenie. Práve kroky spojené s výberom veľkosti fragmentov a vyčistenia sú vykonané pomocou chémie SPRI.
Krátke fragmenty 200 – 400 bp
Dlhé fragmenty 300 – 600 bp
Bez určenej veľkosti
SPRI Works Fragment Library System teda zjednodušuje a výrazne urýchľuje proces sekvenovania pre sekvenátory druhej generácie. Svojim
výkonom 10 sérií vzoriek za 5 hodín (približne 20
sérií za deň) redukuje TAT na minimálnu možnú
mieru a zároveň zvyšuje kapacitu celého procesu
sekvenovania.
Jednoduchý postup:
1. Vloženie reagenčných cartridge
2. Transfer vzorky
3. Vloženie labware
4. Vloženie karty metódy, spustenie
Kľúčové vlastnosti:
Jednoduchý stolový systém
Reagencie pripravené priamo na použitie
Automatická purifikácia fragmentovanej DNA
Optimalizovaná chémia pre výber veľkosti fragmentov – bez gélov
Paralelne spracovanie 10 sérií vzoriek v čase
kratšom ako 5 hodín
Skrátený sekvenačný TAT
Rozmery Š x H x V: 500 mm x 612 mm x 645 mm
Hmotnosť: 56 kg
* Ochranné známky sú vlastníctvom príslušných
vlastníkov.
JOZEF SMOLKA
E-MAIL: [email protected]
10
informační magazín číslo 15 - 2010
ento robot s unikátní konfigurací je prvním zařízením v Evropě, které díky speciálně
vyvinutému softwaru ACP (Antibody Coctail
Preparation) umožňuje přípravu vzorků pro
vícebarevné cytometrické vyšetření.
Konfigurace Biomeku byla navržena v úzké
spolupráci s MUDr. Tomášem Kalinou, PhD., a to
přesně podle požadavků a potřeb laboratoře.
„BIOMEK je robotický systém, který umí přesně
a rychle nahradit práci člověka při přípravě vzorku krevních buněk. Pracuje na principu osmi
nezávisle se pohybujících pipetovacích hlav. Tyto
hlavy přenášejí přesně daná množství kapaliny
mezi zkumavkami s reagenciemi a vzorky s buňkami pacientů. Umí také udržovat buňky při
tělesné teplotě a přitom přidávat určené reagencie. Dokáže pracovat s připravenými programy
i mimo běžnou pracovní dobu, což umožňuje
zahrnout do diagnostické praxe i výzkumné
metody, jejichž provedení přesahuje 12 hodin.
Využit bude pro monitorování rozvoje imunitní
odpovědi buněk pacientů po transplantaci kmenových buněk krvetvorby proti život ohrožujícím
virům (především proti Cytomegaloviru).“, vysvětlil MUDr. Kalina (čerpáno z tiskové zprávy NF Kapka naděje).
Díky práci Dr. Lucie Šrámkové, která se zúčastnila
se svým článkem (Detectable Minimal Residual
Disease Before Allogeneic Hematopoietic Stem Cell
Transplantation Predicts Extremely Poor Prognosis
in Children With Acute Lymphoblastic Leukemia)
druhého ročníku soutěže vědeckých prací – Ceny
Arnolda Beckmana, pořádanou naší společností
ve spolupráci s Českou společností pro biochemi
Slavnostní předání
robotického systému
Biomek pro FN Motol
V únoru tohoto roku byl na pracovišti Kliniky
dětské hematologie a onkologie 2. LF UK
a FN Motol nainstalován pipetovací robot pro
monitorování virové infekce BIOMEK NXp Span8.
a molekulární biologii, získali pracovníci Kliniky dětské hematologie a onkologie od společnosti Beckman Coulter 50% slevu na nákup tohoto přístroje.
Pipetovací robot Biomek NXp Span8 byl zakoupen Nadačním fondem
Kapka naděje a FN Motol byl slavnostně předán dne 25. února 2010 ve
14.00 hod. Toto unikátní zařízení, které zpracovává biologický materiál a připravuje ho pro finální analýzu, byl věnován Klinice dětské hematologie
a onkologie za přítomnosti Františka Wagnera a Vladimíra Mikela, jednatelů
společnosti ROSSMANN, spol. s r.o., a prezidentky NF Kapka naděje Venduly
Auš Svobodové.
Finanční podpora na nákup robota pochází z výtěžku akce „5.000.0000 Kč
pro dětský úsměv“. Tu v srpnu 2009 uspořádala společnost ROSSMANN
a oslavila tak 15 let na českém trhu. Výrobky, které se do projektu zapojily, byly
označeny speciálním logem a výtěžek z jejich prodeje dosáhl úctyhodných
5 610 028 Kč. Část tohoto výtěžku věnovala společnost ROSSMANN NF Kapka
naděje právě na nákup tohoto potřebného robota.
„Považuji za svou osobní i firemní povinnost se o náš úspěch podělit se společností, která nám za těch uplynulých 15 let umožnila růst a prosperitu. Je
nám ctí, že jsme měli možnost spolupodílet se na práci Nadačního fondu Kapka naděje a věnovat peníze na boj s leukémií.“, řekl jednatel společnosti ROSSMANN František Wagner. (čerpáno z tiskové zprávy NF Kapka naděje).
ING. JAN JEDLIČKA, NF KAPKA NADĚJE
EVA KRÁLOVÁ, E-MAIL: [email protected]
informační magazín číslo 15 - 2010
11
Laboratorní
automatizace
Agencourt – izolace a purifikace nukleových kyselin
Agencourt SPRI ® (Solid Phase Reversible
Immobilization) je patentovaná technologie
izolace a purifikace nukleových kyselin založená
na reverzibilní vazbě nukleových kyselin na
paramagnetické mikropartikule.
Princip metody Agencourt SPRI®
Krok 1: Imobilizace nukleové kyseliny
SPRI® partikule jsou přidány přímo do
vzorku. Nukleové kyseliny se selektivně
imobilizují, naváží na SPRI® partikule,
ostatní kontaminace zůstanou nenavázány v roztoku.
Princip metody spočívá v navázání paramagnetických
partikulí na nukleovou kyselinu v roztoku a jejich
následné fixaci pomocí magnetického separátoru.
Ostatní složky roztoku mohou pak být odsátím
odstraněny ze směsi. Tento postup je společný pro
všechny druhy reagencií Agencourt®, ať už určených
pro izolaci geonomové či plazmidové DNA, izolaci
RNA z tkání či buněk, nebo purifikaci sekvenační
PCR reakce či PCR clean-up. Veškeré postupy jsou
realizované bez použití filtrace nebo centrifugace
a jsou tak přímo předurčeny pro případnou
automatizaci těchto metod na automatizovaných
stanicích Biomek®.
Pipetovací stanice
Biomek®
Magnet
Biomek®
Automatizované pipetovací stanice Biomek® představují komplexní řešení pro laboratoře, které potřebují pipetovat ve formátu zkumavek nebo destiček.
Biomek® umožňuje provádění veškerých manipulací
s kapalinami od prostého rozpipetování, ředění
a distribuce vzorků, až po speciální manipulace jako
je izolace a purifikace DNA/RNA (např. pomocí kitů
Agencourt® SPRI®), PCR set-up nebo přípravu vzorků
pro další analýzy.
V nabídce jsou jak purifikační tak izolační kity např.:
■ odstranění dye terminatorů Agencourt CleanSEQ
■ purifikace PCR produktů Agencourt AMPure XP
■ purifikace plasmidů
Magnet
■ izolace DNA z krve a séra
■ izolace RNA z buněk a tkání
■ izolace RNA z krve a séra
■ izolace DNA z bukálních stěrů
■ izolace DNA z parafínových
bločků
■ a další
Systém Biomek® umožňuje provedení testů na jedné
platformě (pracovní ploše pipetovací stanice) včetně
pipetování reagencií, inkubace, promývání, odsávání,
měření produktů v readeru a samozřejmě vedení a zpracování dat o vzorku.
Přístroj umožňuje integrovat do prostoru pracovní plochy
readery pro destičky (luminometr, absorbanční reader,
fluorometr), PCR cycler, inkubátory buněk a další zařízení. Biomek lze také doplnit o čtečky čárových kódů jak
pro destičky tak pro zkumavky.
Krok 2: Odstranění kontaminací
Magnetické partikule s navázanými nukleovými kyselinami jsou díky magnetu přidrženy na
stěnách zkumavky nebo jamky, ostatní kontaminace tak mohou být ode dna odsáty. Mikropartikule jsou pak důkladně několikrát promyty pro
dosažení vysoké čistoty nukleových kyselin.
Krok 3: Eluce nukleových kyselin
Vazba již přečištěné nukleové kyseliny
a magnetických partikulí je následně
rozvolněna vodným roztokem, což
umožňuje maximální flexibilitu pro
následné aplikace.
SPRIworks Fragment
Library System I
SPRI Fragment Library System I představuje plně
automatizovaný systém určený k přípravě vzorků pro
sekvenátory druhé generace - Illumina Genome Analyzer* umožňující masivní paralelní sekvenování.
Náš zcela nový přístroj zjednodušuje a automatizuje
jinak velice zdlouhavý proces manuální přípravy série
fragmentů. Využívá patentované technologie Solid
Phase Reversible Immobilisation (SPRI) založené na
reversibilní vazbě nukleových kyselin na paramagnetické mikročástice stejně jako kity Agencourt®.
Veškeré operace jsou řízeny prostřednictvím řídícího
počítače pipetoru Biomek®. Pokročilejší a komplexnější
pipetování lze jednoduše nastavit a kontrolovat pomocí
software SAMI EX.
V nabídce jsou tři základní modely:
Biomek® 3000
Biomek® NXP
Biomek® FXP
* Ochranné známky jsou vlastnictvím příslušných vlastníků
Life Science Research
Nový přehled produktů pro výzkumné,
klinické a průmyslové laboratoře
ři vyslovení názvu společnosti Beckman Coulter si asi většina
našich zákazníků z výzkumných a vědeckých laboratoří představí ultracentrifugy nebo vysokokapacitní centrifugy, jejichž
historie se datuje již od roku 1947, kdy byla na trhu představena
první komerční ultracentrifuga. Naše společnost tak stojí v popředí
vývoje centrifug již více než 60 let.
Beckman Coulter však neprodává pouze centrifugy. Spojením společnosti Beckman a společnosti Coulter v říjnu 1997 vznikla organizace disponující jedním z nejucelenějších produktových portfolií, které pokrývá celou
oblast biomedicíny od „life science“ přes klinickou diagnostiku až po buněčnou analýzu.
A právě pro výzkumné, klinické a průmyslové laboratoře jsme připravili
nový katalog produktů pro oblast Life Science Research. Obsahuje stručný
přehled produktů s jejich krátkou charakteristikou. Kromě centrifug, které
naleznete na prvních stranách katalogu, jsou zde obsaženy informace
Life Science
RESEARCH
Přehled produktů pro výzkumné, klinické a průmyslové laboratoře
o produktech pro laboratorní automatizaci
(pipetovací stanice Biomek), o genetických analyzátorech, spektrofotometrech a mikrodestičkových readerech, kapilárních elektroforézách
a rovněž průtokových cytometrech, a to od těch
nejjednodušších až po cytometry nejvyšší kategorie – se sorterem. Na konci pak uvádíme přehled analyzátorů buněk a částic, včetně vyloženě
průmyslových přístrojů pro stanovení porozity
materiálu nebo přístrojů pro stanovení Zeta
potenciálu.
V případě zájmu vám katalog velice rádi na
vyžádání zašleme nebo osobně doručíme.
EVA KRÁLOVÁ
E-MAIL: [email protected]
Membránové molekuly v patogenezi
a diagnostice některých chorob
Úvod
Do patogeneze a patofyziologie jednotlivých chorob se promítají různé
molekuly, které mohou dávat informaci o příčině odlišného stavu organismu.
Tyto molekuly se nachází na povrchu buňky jako extracelulární anebo uvnitř
buňky jako intracelulární. Navíc jsou některé molekuly součástí tělních tekutin či intracelulárních prostor. V tomto článku se zaměříme na extracelulární
molekuly, které výrazným způsobem napomáhají v diferenciální diagnostice
některých chorob a patologických stavů.
Odkrývání extracelulárních molekul prošlo již v minulém století velkým
vývojem, kdy byly na povrchu lidské buňky nejprve identifikovány molekuly MHC I. a II. třídy a membránové imunoglobuliny. S vývojem nových
metod se postupně začaly odkrývat na různých buňkách další molekuly
(antigeny, markery, receptory), které byly zkoumány zejména z hlediska
jejich chemické struktury, genetické determinace, exprese a funkce. Běžně
se stávalo, že byly některé antigeny popisovány různými, zcela odlišnými
názvy, což vytvářelo poměrně nepřehlednou situaci. To byl také hlavní
důvod k zavedení tzv. CD klasifikačního systému, ve kterém jsou velmi
12
informační magazín číslo 15 - 2010
dobře definovaným membránovým molekulám
přiřazována jednotlivá CD čísla.
Tento systém, neboli nomenklatura, se vytvořil
na základě pracovních HLDA zasedání (workshopů) a konferencí. Zásadní roli přitom hrály monoklonální protilátky. HLDA je původně pojmenováním pro „human leucocyte differentiation
antigens“, ale také se tak označovaly nomenklaturní vědecká zasedání, kterých bylo již uspořádáno celkem 8. První setkání se uskutečnilo v roce
l982 v Paříži, kde byl založen CD klasifikační systém. Poté následovala pracovní setkání v Bostonu
(1984), Oxfordu (1986), Vídni (1989), opět v Bostonu (1994), Kobe (l996), Harrogate (2000)
a naposledy v Aldelaide (2004). V Paříži dostaly
antigeny definované monoklonálními protilátkami označení tvořené písmeny CD („Cluster of
Differentiation“) s příslušným číslem. V tomto
systému se i nadále pokračuje. Pokud je v CD
„názvu“ obsaženo písmeno w, znamená to, že
antigen ještě není jednoznačně definován, ale
jeho zařazení do posloupnosti CD molekul je
nepochybné.
Na prahu dalšího tisíciletí je CD systém dále
rozšiřován. Po konferenci v Aldelaide (Austrálie)
zatím končí číslem CD350. Je třeba říci, že CD
membránových molekul je o něco více, protože
jsou v tabulce znaků zahrnuty jednak skupiny příbuzných molekul a jednak jejich různé glykozylované formy. V nomenklatuře CD „leukocytárních“
znaků jsou šířeji zahrnuty i některé molekuly, které se nacházejí na dendritických a endoteliálních
buňkách, erytrocytech a krevních destičkách, proto není jejich zařazení do „čistě“ leukocytárních
antigenů zcela přesné. U skupiny antigenů velmi
blízce příbuzných molekul je jejich rozlišení ještě
vystiženo písmeny (např. CD85a, CD85b, CD85c
atd.). U některých znaků jsou různé glykozylované
(sialyzované) formy vyjádřené písmenem „s“
(např. CD15s, CD65s), několik antigenů také nese
označení „R“ (např. CD2R, CD44R, CD99R, CD162R,
CD236R), což je zkratka pro „restricted“.
Inventarizace (přiřazování) membránových
molekul do CD systému nemá logiku, v podstatě
se jednotlivým znakům přiřazují CD čísla nahodile.
Snad jen pro lepší zapamatování lze v CD systému
najít některé logické snahy, mající charakter spíše
pomůcek. Např. Fc gama receptory (III, II, I) jsou
v CD tabulce uvedeny pod násobkem čísla 16,
tj. CD16, CD32 a CD64. Receptory pro interleukiny (IL1, IL2, IL3, IL4, IL5, IL6, IL7 a IL8) jsou uvedeny posloupností čísel CD121 až CD128 a dále
receptory pro IL10 až IL19 mají vymezeno postupné označení CD210 až CD219, přičemž zatím pouze několik z nich je zahrnuto do CD tabulky
(CDw210/IL10R, CD212/IL12R, CD213a1/IL13Rα1,
CD213a2/IL13Rα2, CDw217/IL17R, CDw218A/
IL18Ralfa a CDw218B/IL18Rbeta).
Po 8. HLDA konferenci se do CD tabulky promítly některé změny, které dosavadní nomenklaturu velmi rozšiřují či doplňují. Do CD tabulky
bylo vloženo zhruba 99 znaků, z toho 83 znaků
je zcela nových a 13 znaků nese označení jako
CDw. Do nové CD tabulky byly začleněny některé
velmi podstatné molekuly, jako jsou např. TRAIL
receptory, TOLL-„like“ receptory, receptory programované buněčné smrti (B7DC, B7H1, PD1)
a celá řada dalších molekul, které mohou mít
významné uplatnění i v klinickém a diagnostickém terénu. Samozřejmě nelze říci, že je některý
receptor zajímavější či důležitější, spíše se z hlediska našich znalostí může jeho funkce jevit pro
některé buňky významnější a pro jiné méně
zásadní.
Konference v Adelaide přinesla i některé změny
z hlediska strategie zařazování lidských membrá-
nových antigenů. Označení HLDA („Human Leukocyte Differentiation Antigens“) bylo pozměněno na HCDM („Human Cell Differentiation Molecules“)
a také zařazování nových znaků bude prováděno jiným způsobem, a to
s ohledem na nomenklaturu genů podle „Human Genome Organization
(HUGO), Gene Nomenclature Committee.
Tabulka 1 podává základní informace z hlediska formování CD
nomenklatury. Rozpracovávání inventarizace leukocytárních antigenů
naráží i na řadu problémů. Jedním z nich je, jaké spektrum molekul má být do
této nomenklatury zahrnuto. Má se jednat hlavně o buněčné znaky čistě leukocytární, popř. rozšířené o molekuly exprimované na krevních elementech
(destičkách, erytrocytech), nebo se má systém rozšířit např. o skupinu úzce
příbuzných molekul, vyskytujících se na různých somatických buňkách
(hepatocyty, keratinocyty, mozkové buňky apod.)? Do jednotlivých workshopů byly zahrnuty sekce týkající se karbohydrátových (lektinových) struktur,
erytrocytárních buněk, dendritických buněk, kmenových/progenitorových
buněk a také sekce zabývající se možností zavedení určitých korelací s buňkami některých živočišných druhů. Je to dáno tím, že některé epitopy nejsou
pouze specifické pro lidský systém, ale jsou vytvořeny i na buňkách jiných
živočišných druhů.
Vyvstávají i další otázky – mají být např. karbohydrátové epitopy či antigeny některých vzácných krevních skupin také zahrnuty do této nomenklatury, jestliže se tyto epitopy vyskytují převážně na patologických buňkách?
Tím se vlastně původní záměr sestavit systém membránových molekul
hematopoetického původu na normálních buňkách posouvá do oblasti
neoplasií. To již vyplynulo ze zavedení původních lymfocytárních antigenů
(např. CD3, CD4, CD5, CD8, CD10, CD20 atd.), které se staly užitečným
diagnostickým vodítkem pro leukémie dětského i dospělého věku. Mimo to,
oblast transmembránových antigenů s intracelulárními epitopy a intracelulárními molekulami může poukazovat pouze na mnohofunkčnost daných
extracelulárních antigenů, které jsou navíc zahrnuty do různých signalizačních drah.
informační magazín číslo 15 - 2010
13
Tabulka 1: Základní informace o mezinárodních setkáních
z hlediska vytvoření CD nomenklatury
Počet MP
Definované
Citace
prokazujících
CD znaky* monografie
CD znaky
Pracovní
setkání
Místo
konání
Rok
1
Paříž
1982
102
CD1 –
CDw15
I
2
Boston
1984
126
CD16 – CD26
II
3
Oxford
1986
236
CD27 – CD45
III
IV
4
Vídeň
1989
425
CD46 –
CDw78
5
Boston
1993
662
CD79 –
CD130
V
6
Kobe
1996
444
CD131. –
CD166
VI
7
Harrogate
2000
273
CD167 –
CD247
VII
8
Adelaide
2004
CD247 –
CD350
VIII
9
Barcelona
2010
v přípravě
* V CD systému jsou zahrnuta i některá CD označení rezervována pro další znaky, které
budou postupně doplňovány.
CD nomenklatura je mezinárodně akceptovaná WHO a IUIS, a tak ji
bude zřejmě nezbytné určitým způsobem dotvořit či uzavřít. I když nemá
nomenklatura zcela jasné logické uspořádání a i když se původní předpoklad „inventarizovat všechny membránové molekuly lidských leukocytů“
poněkud zkomplikoval, přesto se v biologii leukocytů jeví tato nomenklatura jako velmi užitečná. Některé názvy molekul (např. CD3, CD4, CD8,
CD34) se dokonale vžily, takže jsou běžně mezinárodně používané. Názvy
některých adhezivních a destičkových molekul se vyskytují v obojí podobě, tj. původní název i CD označení. Se zahrnutím membránových imunoglobulinů (mIg), TC receptorů (TCR α/β, TCR γ/δ), MHC molekul (I. a II.
třídy) se do CD nomenklatury již nepočítá, protože označení pro tyto znaky jsou tak zažitá, že měnit je by zřejmě nemělo smysl. V inventuře leukocytárních antigenů jsou tak zahrnuty i tyto výjimky, které pramení z dřívějšího poznání.
Výčet membránových znaků lidských leukocytů není ještě zdaleka
vyčerpán. Popsaných antigenů (nebo skupin antigenů), které mají CD
označení, je v současné době zhruba 350. Mimo to na leukocytech existují další molekuly, které jsou již popsané, ale doposud nemají CD označení, a také molekuly, které zatím nejsou objevené, proto se dá předpokládat, že se současný stav poznání membránových struktur leukocytů
pohybuje kolem 50 – 60 %. Tento odhad vychází i z našich dřívějších
nálezů při rozlišování membránových proteinů lidských leukocytů. Využitím dvourozměrné elektroforézy lze nalézt až kolem 1 000 skvrn příslušných molekul pro směs leukocytárních buněk. Jednotlivé typy buněk
vyjadřují charakteristické spektrum membránových struktur, které mohou
mít různé zastoupení (počet kopií) na buňce. Např. na erytrocytech může
být exprimováno celkem 100 – 200 různých molekul, na lymfocytech 200
– 300 a na monocytech snad ještě o něco více, což znamená, že celkové
množství není na všech buňkách konstantní. Je to dáno tím, že se buňky
nacházejí v různých fázích svého cyklu a mají různou funkci, která je pro
ně zásadní. Také počet kopií jedné molekuly na buňce může být různý,
např. na erytrocytárním povrchu je CD99 (12E7 protein, E2) vyjádřen asi
tisícem kopií oproti znaku GLUT1, který je zastoupen v rozmezí 200 000
– 700 000 kopií. Z kvalitativního a kvantitativního zastoupení lze učinit
odhad, že na buněčné membráně plně funkční leukocytární buňky o veli-
14
informační magazín číslo 15 - 2010
kosti 14 μ může být vyjádřeno až 9,4 milionů
všech molekul. Spektrum jednotlivých molekul
vtiskuje buňce její funkce, které podmiňují její
komplexnost a také její plastičnost.
Membránové antigeny nejen napomáhají charakterizovat jednotlivá diferenciační a proliferační
stádia lidských normálních leukocytárních buněk,
ale mají také zásadní dopad na patogenezi a patofyziologii celé řady chorob. V současné době některé diagnosticky významné molekuly výraznou
měrou napomáhají v klasifikaci leukemií a lymfomů, což se odrazilo do jejich diferenciální imunodiagnostiky.
Kvalitativní i kvantitativní zastoupení jednotlivých molekul je relativně konstantní pro jednotlivé typy buněk, což značí, že je celá architektura buněčné membrány pod genetickou
kontrolou. Fenotypové kopie (počet molekul na
buňku) jsou konstantně přepisovány a organizovány do daných stechiometrických poměrů,
které byly ve fylogenezi zřejmě utvářeny podle
určitých funkčních hledisek. U patologických
buněk (leukemických/lymfomových) může být
exprese membránových molekul pozměněna,
ale přesto zůstává otázka, ke kterému typu normálních buněk je tato exprese vztažena. V CD
nomenklatuře jsou zahrnuty i některé erytrocytární molekuly vytvářející krevní skupiny (S/s =
CD235b, Gerbich = CD236R, Kell = CD238,
Band3/Diego = CD233, Rh30CE = CD240CE,
Rh30D = CD240D, Rh30D/CE = CD240DCE,
Landsteiner-Wiener (LW) krevní skupina =
CD242), což jenom poukazuje na heterogenitu
leukocytární a erytrocytární buněčné membrány a na diferenciační začlenění erytrocytu do
leukocytární kaskády.
Jednotlivé membránové molekuly lokalizované
na buněčném povrchu mají celou řadu funkcí,
pomocí nichž se buňka orientuje v daném mikroprostředí a zprostředkovává svoji odezvu. Tímto
způsobem buňka vlastně jednak reaguje na prostředí a jednak vyjadřuje svoji funkční individualitu. Buňka má tedy ve svém vybavení velkou škálu
receptorů, pomocí nichž má možnost zprostředkovávat celou řadu interakcí. Zjednodušeně by se
dalo říci, že různé funkce, jako diferenciace, proliferace, aktivace, migrace, polarizace, apoptóza,
„homing“ a některé další, jsou vytvářeny pomocí
membránově vázaných molekul, které jsou propojeny různými mechanismy s celou řadou dalších
systémů.
Za expresi membránových molekul jsou odpovědné příslušné geny nacházející se na jednotlivých chromozomech. Tabulka 1 dokumentuje
základní genetické údaje o všech antigenech
zahrnutých do CD nomenklatury. Poslední CD
znak končí číslem CD350. Některá čísla jsou však
pro CD znaky v tabulce pouze rezervována. Jedná
se zhruba o 19 znaků, kde je snaha dát těmto
zarezervovaným molekulám určitou posloupnost
s ohledem na jejich zařazení.
Obrázek 1 podává základní charakteristiky
lidského genomu. Uvádí se, že lidská buňka
o velikosti 15 nm obsahuje zhruba 108 molekul,
z nichž 9 000 je lokalizováno uvnitř buňky a až
1 000 molekul na povrchu buňky. Genetická informace je obsažena v jádře a v mitochondriích. Lidský genom obsahuje 4,5 miliardy bází, které jsou
soustředěny do 23 párů chromozomů. V nich je
23 000 genů. Dezoxyribonukleová kyselina (DNA)
má průměr 2 nm o celkové délce 2,1 m. Toto vlákno se pro mitotické účely postupně smotává,
takže je chromozom v metafázi veliký v průměru
1 400 nm. Vztah mezi genotypem a fenotypem
v utváření CD membránových molekul podává
obrázek
CD molekuly v patologii
a patogenezi různých chorob
Již v minulém století byla velká snaha objevit
molekuly (antigeny), o které by se opírala diagnostika ve smyslu odlišení normální buňky od
nádorové. Bylo publikováno velké množství
prací, které se pokoušely tento nádorový antigen prokázat. Postupem času se při detailnějším testování ukázalo, že to není tak jednoduché, a tak byla celá řada prací zpochybněna.
Co k tomu přis pělo? Odhlédneme-li od počátečního entusiasmu začínajících badatelů
nalézt specifickou molekulu pro příslušný typ
nádorů, ukázalo se postupem času, že existence této kýžené molekuly se specificitou pro
nádorovou buňku je více než svízelná. V tom
i autor nabyl určité zkušenosti, když se pokoušel připravovat antiséra proti lidským leukemickým buňkám. Záměr těchto experimentů byl
logický – imunizovat zvířata nádorovými buňkami, poté tato antiséra opakovaně vysycovat
celou plejádou normálních buněk, testovat
příslušná antiséra na nádorové buňky a v případě, že by reagovala (či nereagovala) s normálními buňkami, byl by problém vyřešen.
Samozřejmě že byla tato technologie velmi
pracná, proto se někdo, kdo daroval 0,1 ml
antiséra k detekci leukemického procesu,
považoval za prioritního badatele. Autor si
vzpomíná, jak dostal od jednoho londýnského
pracovníka darem k detekci T-ALL antisérum,
aby si mohl porovnat svá osobně vyvinutá
antiséra. V tomto duchu se před vyvinutím
biotechnologie přípravy monoklonálních protilátek pracovalo a mnoho pracovníků se také
snažilo své objevy rychle publikovat. Později se
ukázalo, že je tento nádorově specifický antigen přítomný rovněž na mikropopulacích normálních buněk, které tehdy příslušné detekční
metody nebyly schopné odhalit. Bylo to dáno
tím, že nebyla k dispozici průtoková cytomet-
rie, a tak byly tyto buněčné mikropopulace považovány za artefakty
v mezích kontroly. Snad nejtypičtějším příkladem je odkrytí CALLA antigenu, který byl popisován jako leukemický specifický antigen pro
nemocné s akutní lymfoblastickou leukemií. Později byla exprese této
molekuly na leukemických buňkách výrazným způsobem zpochybněna,
protože se ukázalo, že je přítomná na normálních prekurzorech lymfatických hematopoetických buněk. K tomu také přispěly buňky stabilizovaných lidských buněčných linií známých vlastností.
Nástupem biotechnologie přípravy monoklonálních protilátek bylo mnoho
problémů a nejasností odstraněno, neboť mohly být tyto protilátky důkladně
protestovány s celou řadou normálních i nádorových buněk. Mimo to
posloužily tyto protilátky jako vhodné referenční standardy nejen pro celý CD
leukocytární systém, ale také pro analýzu patologických stavů různých tkání
a orgánů. Tak se vlastně tyto CD leukocytární molekuly dají odkrývat na nejrůznějších nádorových buňkách a mohou napomáhat analyzovat tzv. nádorový fenotyp. Díky tomu byl i CALLA antigen zařazen do leukocytárního systému coby CD10 znak. Zcela opačná situace nastala u antigenu, který je
označován jako CD297. Původně byl tento antigen objeven na erytrocytech
a označen jako Dombrock krevní skupina (DO, DOK1, AKT4). Později se ukázalo, že je tento antigen přítomný na buňkách gynekologických nádorů, ale
není přítomen na odpovídajících buňkách normálních tkání. Zde by se dalo
říci, že kdyby nebyl tento antigen objeven na erytrocytech, mohl být veden
jako specifický antigen pro některé gynekologické nádory, avšak časem by byl
také zpochybněn.
Má tedy ještě pro analýzu nádorového fenotypu význam hledat nádorové antigeny, jestliže jsou přítomné také na normálních buňkách lidských tkání? Na to dává odpověď genetika. Zjistilo se, že mutace výrazným způsobem zasahují do utváření extracelulárních molekul. To
znamená, že vícenásobné mutační změny v utváření těchto molekul
zásadním způsobem ovlivňují jejich funkční projevy a to někdy i zcela
zásadním způsobem. V tomto smyslu již nehraje označení nádorový antigen žádný význam, když se vlastně jedná o mutovaný normální antigen,
který pozbyl svoji funkci.
RNDR. KRISTIÁN KOUBEK, DRSC.
KLINICKÝ ÚSEK, ÚSTAV HEMATOLOGIE A KREVNÍ TRANSFÚZE,
U NEMOCNICE 2, 128 20 PRAHA 2
E-MAIL: [email protected]
informační magazín číslo 15 - 2010
15
Tabulka 2: Chromozomální lokalizace, genové vlastnosti, hmotnost CD znaků
CD znaky
Chromozomální Jméno
lokalizace
genu
Entrez
(genu)
Molekulová
hmotnost*
Dg význam průkazu molekuly
CD1a
1q22-23
CD1a
909
49
stanovení některých T forem leukemií tymového původu, základní
znak, klasifikace některých T lymfomů
CD1b
1q22-23
CD1b
910
45
stanovení některých T forem leukemií tymového původu, základní
znak, klasifikace některých T lymfomů
CD1c
1q22-23
CD1c
911
43
stanovení některých T forem leukemií tymového původu, základní
znak, klasifikace některých T lymfomů
CD1d
1q22-23
CD1d
912
38
stanovení některých T forem leukemií tymového původu, základní znak
CD1e
1q22-23
CD1e
913
36
stanovení některých T forem leukemií tymového původu, základní znak
CD2
1p13
CD2
914
50/50
výskyt u některých T forem leukemií a lymfomů, (MF, LL, PTL, SS, LBL)
CD3g
11q23
CD3D
915
25
CD3e
11q23
CD3E
916
20
CD3d
11q23
CD3G
917
CD3x
11q23
16
CD3h
11q23
32
CD4
12pter-p12
CD4
920
55
klasifikace T forem leukemií a lymfomů, imunodeficitní stavy, povaha
AIDS
CD5
11q13
CD5
921
58/67
klasifikace T forem leukemií a lymfomů, analýza T lymfocytárních
a tymocytárních populací, CCL B typu
CD6
11q13
CD6
923
105 a 130
klasifikace T forem leukemií a lymfomů, analýza T lymfocytárních
a tymocytárních populací
CD7
17q25.2-q25.3
CD7
924
40
stanovení některých forem T leukemií a lymfomů, přídatný znak
20
CD8a
2p12
CD8A
925
68/32-34
klasifikace T forem leukemií a lymfomů, analýza lymfocytárních
a tymocytárních populací
CD8b
2p;12
CD8B1
926
68/30-32
klasifikace T forem leukemií a lymfomů, analýza lymfocytárních
a tymocytárních populací
CD9
12p13
CD9
928
24/24-26
imunofenotypizace leukemií, minimální zbytková choroba s CD34
(koexprese)
CD10
3q21-q27
MME
4311
100/100
klasifikace leukemií a lymfomů, vymezení kompletní remise, stanovení
lymfoidních progenitorových buněk
CD11a
16p11.2
ITGAL
3683
170/180
stanovení imunodeficitů, klasifikace leukemií AML a lymfomů
CD11b
16p11-11.2
ITGAM
3684
165/170
charakterizace leukemií a lymfomů (např. ANL, HCL) z hlediska adhezivních vlastností
CD11c
16p11-11.2
ITGAX
3687
145/150
charakterizace leukemií a lymfomů (např. ANL, HCL) z hlediska adhezivních vlastností
23444
150-160/120
nápomocný znak v klasifikaci leukemií AML, AMoL, CML
charakterizace leukemií a lymfomů převážně myeloidní povahy
CDw12
CD13
15q25-q26
ANPEP
290
150
CD14
5q31.1
CD14
929
53/55
klasifikace leukemií převážně myelomonocytární formy (AMoL, CML)
CD15
variabilní
klasifikace leukemií a lymfomů, výskyt na nádorech plic, tlustého
střeva a mamy, krevní skupinový antigen
CD15s
variabilní
klasifikace leukemií a lymfomů, výskyt na nádorech plic, tlustého
střeva a mamy, sializovaná forma
klasifikace leukemií a lymfomů, výskyt na nádorech plic, tlustého
střeva a mamy
CD15u
CD16a
1q23
FCGR3A
2214
50-65
CD16b
1q23
FCGR3B
2215
/48
zahnutí v klasifikaci některých leukemií NK forem, průkaz granulocytů
a makrofágů ve vztahu k funkci
zahrnutí v charakterizaci některých leukemií myeloidního charakteru
objasňování patogenéze a patofyziologie u některých metabolických
chorob
CD17
CD18
21q22.3
ITGB2
3689
90/95
LAD „disease“, chromosomální translokace u CML, u LAD bakteriální
a houbové
CD19
16p11.2
CD19
930
120/95
klasifikace B forem leukemií a B lymfomů, B buněčné prekurzory a progenitory
CD20
11q12-q13.1
MS4A1
931
37/35
klasifikace B forem leukemií a B lymfomů (folikulárních a difuzních)
CD21
1q32
CR2
1380
145/110
klasifikace B forem leukemií a B lymfomů (některých folikulárních
a difuzních)
CD22
19q13.1
CD22
933
140/130
význam i při objasňování některých forem lymfoidních malignit B
typu, klasifikace leukemií a lymfomů
CD23
19p13.3
FCER2
2208
45/45
detailní charakterizace lymfoidních malignit B typu, rozpustný antigen, prognostický znak u CLL
16
informační magazín číslo 15 - 2010
CD znaky
Chromozomální Jméno
lokalizace
genu
Entrez
(genu)
Molekulová
hmotnost*
Dg význam průkazu molekuly
CD24
6q21
CD24
934
35-45
klasifikace leukemií, nádory neuroektodermálního původu
CD25
10p15-p14
IL2RA
3559
55/55
asociovaná s CD122 a CD123, regulace hematopoézy a jejich poruch
ve smyslu defektů při přenosu signálu
CD26
2q24.3
DPPA
1803
120/110
znak autoimunitních chorob, význam defektu v patogenezi HIV
CD27
12p13
TNFRSF7
939
110-120/55
význam v předání signálu pro aktivaci T buněk a její patogeneze,
změny u alergických stavů
CD28
2q33
CD28
940
90/44
význam v sledování T buněčných efektorových funkcí a jejich patogeneze, význam pro vznik myelomu
CD29
10p11.2
ITGB1
3688
110/130
molekula asociovaná s progresí nádorů a jejich metastází, patologie
zánětů
CD30
1p36
TNFRSF8
943
120/105
znak pro R5 nádorové buňky u Hodkinových lymfomů, K1 lymfomy,
vztah k některým virům (KS)
CD31
17q23
PECAM1
5175
~135/135
význam při sledování adheze buněk a jejich migrace, popřípadě jejich
patologických projevů
CD32
1q23
FCGR2A
2212
40/42
analýza patogeneze B buněčných funkcí a imunitních komplexů,
tkánové poškození
CD33
19q13.3
CD33
945
150/67
klasifikace a diagnóza akutních myeloidních leukemií, některých jejich
nezralých forem
CD34
1q32
CD34
947
~ 105-120
klasifikace a diagnóza akutních myeloidních leukemií, zásadní znak pro
transplantaci kmenových buněk
CD35
1q32
CR1
1378
160-250
asociace u hemolytické anemii, diabetes mellitus, AIDS a některých
maligních nádorů, imunitní komplexy
CD36
7q11.2
CD36
948
90/85
patogeneze, adheze, agregace a cytoadherence Plasmodium falciparum, erytropoeza a její poruchy
CD37
19p13 - q13.4
CD37
951
40-52/40-52
patologie přenosu signálu (signální transdukce) a imunofenotypizace
některých lymfomů B typu
CD38
4p15
CD38
952
45/45
patogeneze regulace buněčné aktivace a proliferace, charakterizace
některých lymfomů (LBL)
CD39
10q - 24
ENTPD1
953
80/80
patologie některých adhezivních mechanizmů u aktivovaných buněk
(dendritické buňky)
CD40
20q12 - q13.2
TNFRSF5
958
48-85
poruchy u patogeneze B buněčného růstu a diferenciace, význam
u lymfomů B typu, reumatoidní artritida
CD41
17q21.32
ITGA2B
3674
135/120/23
patofysiologie aktivace destiček a jejich agregace, v komplexu CD41/
CD61
CD42a
3q21
GP9
2815
22/17 - 22
analýza vWF a trombínu v patogenezi destiček, Bernard-Soulier syndrom
CD42b
17pter - p12
GP1BA
2811
160/145
analýza vWF a trombínu v patogenezi destiček, Bernard-Soulier syndrom
CD42c
22q11.21
GP1BB
2812
160/24
analýza vWF a trombínu v patogenezi destiček, Bernard-Soulier syndrom
CD42d
3
GP5
2814
82/82
analýza vWF a trombínu v patogenezi destiček, Bernard-Soulier syndrom
CD43
16p11.2
SPN
6693
95-135/95135
patogeneze regulace hematopoézy se zaměřením na adhezi i antiadhezi, WAS
CD44
11p13
CD44
960
90
molekula zahrnuta v imunitní stimulaci a signalizaci mezi buňkami,
marker malignity a metastází
CD45
1q31-q32
PTPRC
5788
180-220/
analýza poruch TCR pro BCR zprostředkované aktivace
CD46
1q32
MCP
4179
CD47
3q13.1-q13.2
CD48
1q213-q 22
CD48
962
52-58/62-68
objasňování faktorů u proteolitického štěpení C3b, C4b
45-60/50-55
patogeneze trombospondinového receptoru
45/45
analýza poruch adhezivní molekuly pro utváření T buněk
CD49a
5
ITGA1
3672
200/200
detailní analýza poruch adhezivní molekuly¸ význam při zánětlivých
chorobách střeva
CD49b
5q23-31
ITGA2
3673
150/160
detailní analýza poruch adhezivní molekuly
CD49c
17q21-31
ITGA3
3675
150/125, 30
detailní analýza poruch adhezivní molekuly
CD49d
2q31-q32
ITGA4
3676
145/150
detailní analýza poruch adhezivní molekuly, která je významná
u metastází a progresi nádorů
CD49e
12q11-q13
ITGA5
3678
160/135,25
detailní analýza poruch adhezivní molekuly, význam molekuly v regulaci přežívání buněk a apoptózy
CD49f
2p14-q14.3
ITGA6
3655
150/125
detailní analýza poruch adhezivní molekuly,
CD50
19p13.3-13.2
ICAM3
3385
110-140/
patogeneze kostimulační molekuly v regulaci adhezivních funkcí
150/124,24
význam u kostního metabolismu, apoptózy, adhezi, signální transdukci
a infekci
CD51
2q31-q32
ITGAV
3685
informační magazín číslo 15 - 2010
17
CD znaky
Chromozomální Jméno
lokalizace
genu
Entrez
(genu)
Molekulová
hmotnost*
Dg význam průkazu molekuly
CD52
1p36
CDW52
1043
25-29/25-29
zjišťování poruch komplementárních funkcí ADCC
CD53
1p31-p12
CD53
963
32-42/
analýza poruch aktivace B buněk i z hlediska signální transdukce
CD54
19p13.3-13.2
ICAM1
3383
90/95
detekce Rinovirů u RBC infikovaných parazitem malárie, význam
u zánětů
CD55
1q32
DAF
1604
55-70/80
význam při paroxyzmální noční hemoglobinurii, mutace způsobuje
defekt v biosyntéze GPI-CD 55 kotvy
CD56
11q23-q24
CD57
CD58
CD59
1p13.1
11p13
NCAM1
4684
140
detalnější analýza homofilní a heterofilní adheze
CD57
964
110-115/
detalnější analýza adheze buňka-buňka
CD58
965
/55-70
význam při adhezi buněk a jejich aktivaci (NK)
18-25/18-25
význam při paroxyzmální hemoglobinurii, mutace způsobuje defekt
v biosyntéze GPI-CD55 kotvy
120/
znak pro maligní melanomy
CD59
966
CD60
CD61
17q21.32
ITGB3
3690
90/110
detailnější analýza poruch kontaktu krevních elementů, Glanzmanova
trombasthenie
CD62E
1q22-q25
SELE
6401
115/97
poruchy adheze během metastáz, role u angiogenéze a zánětů, LADII
syndrom
CD62L
1q23-q25
SELL
6402
65/74-95
poruchy rolování leukocytů, význam u koronární arteriální stenózy
CD62P
1q22-q25
SELP
6403
120/140
poruchy destiček u různých onemocnění (infarkt myokardu), význam
u koronární arteriální stenózy
CD63
12q13
CD63
967
40-60/
analýza melanomových buněk a CD gen 63 má roli v supresi nádorů,
znak pro melanomy
CD64
1q21.2-q 21.3
FCGRIA
2209
-/72
klasifikace leukemii FAB M4 a M3, ADCC
CD65
klasifikace leukemií FAB MO, marker pro extravaskulární infiltraci AML
CD65s
klasifikace myeloidních leukemií, očištění kostní dřeně pro autologní
transplataci dřeně kostní
CD66a
19q13.1-2
CEACA
634
/140-180
znak maligních buněk kde exprese molekuly je snížena
CD66b
19q13.2
CEACA
1088
/95-100
upřesnění některých plicních karcinomu a melanomu
CD66c
19q13.2
CEACA
4680
/90
poruchy adheze u granulocytů
CD66d
19q13.2
CEACA
1083
/35
poruchy adheze u granulocytů
CD66e
19q13.2q13.2
CEACA
1048
/180-200
poruchy adheze u granulocytů
poruchy adheze u granulocytů, nezbytná pro průběh normálního
těhotenství
CD66f
19q13.2
PSG1
5669
/54-72
CD68
17p13
CD68
968
110/
při patologii funkce makrofágů, význam u arteriosklerózy
CD69
12p13- p12
CD69
969
60/28-32
časný aktivační antigen, jehož testování může vypovídat o rekonstrukci hematopoézy u transplantací
CD70
19p13
TNFSF7
970
55-170
imunofenotypizace lymfomů, patologie aktivace lymfocytů a jejich
projevů
CD71
3q26.2-qter
TFRC
7037
190/95
klasifikace leukemií a lymfomů ve smyslu aktivace, může přispět ve
stanovení cirkulujících buněk B
CD72
9p
CD72
971
80-86/43
typizace B lymfoproliferativních stavů, význam regulace u autoimunitních chorob
CD73
6q14-q21
NTSE
4907
69-72/
uplatnění v imunodiagnostice leukemií a lymfomů, imunoproliferativních stavů
CD74
5q32
CD74
972
41/
diagnostika B-lymfoproliferativních stavů, analýza buněk B řady
Různá
defekt v sialotransferáze, přínos v typizaci u B malignit, (germinální
centra)
CD75
typizace některých leukemií a lymfomů, význam u syndromu IA
(CD65IA), zahrnutá v infekci lymfotropních virů
CD75s
CD77
CD79a
1kD
19q13.2
CD79A
973
typizace lymfomů, Burkittův lymfom, Fábriho choroba
/40-45
stanovení buněk B řady a jejich patologických forem
CD79b
17q23
CD79B
974
/37
stanovení buněk B řady a jejich patologických forem, autoimunitní
choroby
CD80
3q13.3-q21
CD80
941
60/
význam při prevenci reakce štěpu proti příjemci, analýza imunitního
stavu po transplantaci
CD81
11p 15
CD81
975
26/
poruchy přenosu signálu (signální transdukce)
CD82
11p11.2
KAI1
3732
45-90/
význam znaku při metastázích nádorových buněk (prostata)
CD83
6p23
CD83
9308
/43
patofyziologie prezentace antigenů, výskyt na mozkových buňkách
CD84
1q24
CD84
8832
68-80/72-86
při imunodeficiencích a jejich patologických projevů
CD85a-m
19q13.4
LILRB(x)
11025
~ 60-110
imunofenotypizace, znak pro ALL, B-NHL, HCL a pro některé
18
informační magazín číslo 15 - 2010
CD znaky
Chromozomální Jméno
lokalizace
genu
Entrez
(genu)
Molekulová
hmotnost*
Dg význam průkazu molekuly
CD86
3q21
CD86
942
/80
význam při prevenci reakce štěpu proti hostiteli, analýza nádorových
buněk
CD87
19q13
PLAUR
5329
35-68/32-66
stanovení některých nádorových buněk zahrnutých do pericelulární
proteolýzy, vymezení AML-M5
CD88
19q13.3-q13.4
C5R1
728
43/
cytoskeletární obnova a odpověď na zánětlivé stavy, analýza poruch
chemotaxe a adheze
CD89
19q13.2-q13.4
FCAR
2204
45-100/
protilátková cytotoxicita, fagocytoza a některé střevní defekty, podílí
se na likvidaci mikrobů
CD90
11q 22.3q23
THY1
7070
25-35/25-35
význam při sledování některých defektů při mozkových funkcí a apoptózy, likvidace nádorových buněk
CD91
12 q 13-q 14
LRP1
4035
600/
stanovení neuronů a astrocytů v centrálním nervovém systému, gastrointestinální trakt
CD92
SLC44A1
23446
70/70
význam při klasifikaci myeloidních leukemií
CD93
CD93
22018
110/126
význam při imunofenotypizaci myeloidních leukemií
CD94
12q13
KLRD1
3824
70/30
role v regulaci HLA-A,B,C, molekul, NK buněk a některých cytotoxických T buněk
CD95
10q24.1
TNFRSF6
355
90, 200/45
autoimunitní onemocnění asociované s mutací v CD95, patofyziologie
apoptózy
CD96
10225
160/
analýza poruch aktivace buněk T
CD96
CD97
19p13.2-p13.1
CD97
976
75-85/75-85
exprese na maligních buňkách u adenokarcinomu, revmatoidní artritida
CD98
11q13
SLC3A2
6520
125/80, 45
hraje významnou roli v normálním vývoji plodu, interfáze mezi matkou
a plodem, zánětlivé léze
CD99
Xp22.3,Yp11.3
CD99
4267
32/32
antigen je asociován s genem pro ichthyosis, očním albinismem a retinoschisis, imunofenotypizace T-ALL
CD100
9q22-q31
SEMA4D
10507
300/150
význam u kongenitální a megakaryocytární trombocytopenie
CD101
1p13
IGSF2
9398
240/120
patofysiologie signální transdukce
CD102
17q23-q25
ICAM2
3384
55-65/
patofyziologie adhezivní molekuly, patogeneze, angiogeneze, lymfoidní malignity
CD103
17p13
ITGAE
3682
175/150, 25
výskyt na nádorových buňkách, vaječník, prostata, změny u alergických
stavů, adheze navozená CCR9 faktorem
CD104
17q11-qter
ITGB4
3691
205/220
význam v metastázování nádorů, exprese na nádorových buňkách
etiopatogenéze adhezivní molekuly na endotheliálních buňkách,
význam u HHT
CD105
9q33-34.1
ENG
2022
180/90
CD106
1p32-p31
VCAM1
7412
110/110
patologie angiogenní kaskády
CD107a
13q34
LAMP1
3916
100-120/
význam při stanovení nádorových buněk u metastáz, patologie svalu,
(LAMP-1 molekula)
CD107b
Xq24
LAMP2
3920
100-120/
význam při stanovení nádorových buněk u metastáz, patologie svalu,
(LAMP-1 molekula)
CD108
15q22.3-q23
CD109
SEMA7A
8482
76/80
patogeneze JMH krevních skupin, asociace s formou CDA
CD109
135228
170/170
patofysiologie přenosu signálu, význam ANT u transfuzní purpury
CD110
1p34
MPL
4352
82-92/
význam znaku v patologii destičkové řady, význam u trombocytopenie
CD111
11q23–q24
PVRL1
5818
/75
analýza receptoru pro pan-alpha herpes virus (poliovirus)
CD112
19q13.2–13.4
PVRL2
5819
64-72/64-72
interakce polioviru se svým receptorem na buňkách, receptor pro
a herpes virus (HSV-1) a pseudorabies virus (PRV)
PVRL3
25945
/130
CD113
CD114
1p35–p34.3
CSF3
1441
130-150
analýza patologie myeloidních buněk, mutace u CD114 způsobují
kongenitální neutropenie
CD115
5q 33.2-33.3
CSF1R
1436
150/
choriokarcinom, klasifikace AML, výskyt na buňkách některých gynekologických nádorů
CD116
Xp21 a Yp11.2
CSF2RA
1438
80
klasifikace AML, patologie a mutace receptoru pro GM-CSF
CD117
4q11-q12
KIT
3815
145/145
mutace v receptoru způsobuje autosomálně dominantní porucha
pigmentace (piebaldismus), klasifikace AML
LIFR
3977
190/
CD118
CD119
6q23-q24
IFNGRI
3459
80-95/
porucha v etiologii interferonu defekt v CD119 podmiňuje případy
roztroušené atypické mykobakteriální infekce
CD120a
12p13.2
TNFRSF1A
7132
55/
analýza stavů zahrnujících nekrózu nádoru, anorexii, revmatioidní
artritidu, defekt u CD120a je syndrom TRAPS
CD120b
1p36.3-p36.2
TNFRSF1B
7133
75/
analýza různých stavů zahrnujících nekrózu nádoru, anorexii,
revmatioidní artritida
CD121a
2q12
IL1R1
3554
75-85/75-85
etiopatogenese působení IL1
informační magazín číslo 15 - 2010
19
CD znaky
Chromozomální Jméno
lokalizace
genu
Entrez
(genu)
Molekulová
hmotnost*
CD121b
2q12-q22
7850
60-68/60-68
etiopatogenese působení IL1
IL1R2
Dg význam průkazu molekuly
CD122
22q11.1-q12
IL2RB
3560
70-75/
etiopatogenese působení IL2, autoimunitní stavy, MP anti CD122 lze
použít u granulární lymfocytické leukemie
CD123
Xp22.3,Yp11.3
IL3RA
3563
70/
etiopatogenese působení IL3, autoimunitní stavy, marker pro AML
a pro B lymfoproliferatívní poruchy
CD124
16p11.2-12.1
IL4R
3566
140/
etiopatogenese působení IL4, IL13,
CD125
3p26-p24
IL5RA
3568
60/
etiopatogenese působení IL5, klasifikace AML, zánětlivé stavy u bronchiálního astma
CD126
1q21
ILR6
3570
80/80
etiopatogenese působení IL6, klasifikace plasmatických buněk, u myelomu a plazmocytomu
CD127
5p13
IL7R
3575
65-90/90
etiopatogenese působení IL7,
CD128A
2q35
IL8RA
3577
44-59/67-70
patologie angiogenese, odlišení myeloidních typů od lymfoidních typů
lidské leukemie
CD128B
2q35
ILRB
3579
44-59/67-70
zvýšené hladiny u zánětlivých stavů, odlišení myeloidních typů od
lymfoidních typů lidské leukemie
CD129
IL9R
3581
receptor hraje úlohu při vzniku nádorů
CD130
IL6ST
3572
etiopatogenese působení IL6, funkční defekty u placenty, charakterizace mnohočetného myelomu
CD131
22q13.1
CSF2RB
1439
120-140/
klasifikace časných B forem leukemií („alveolar protein osis“)
CD132
Xq13.1
IL2RG
3581
65-70/
mutace odpovědná za XSCID (kombinovaná imunodeficience), onemocnění založené na ztrátě buněk T a NK
CD133
4p16.2
PROM1
8842
120/120
marker hematopoetických kmenových buněk pro transplantační studie, mutace zodpovědná za retinální degeneraci
CD134
1p36
TNFRSF4
7293
48-50/
poruchy adhezivní funkce, význam u mnohočetné sklerózy a psoriázy
130/155-160
klasifikace leukemií z časných hematopoetických progenitorů, AML,
CML, B-CLL, ALL
CD135
13q12
FLT3
CD136
13p21.3
MST1R
4486
180/150, 40
poruchy v MSP
CD137
1p36
TNFRSF9
3604
85/39
poruchy v aktivaci T lymfocytů
CD138
2p24.1
SDC1
6382
/80-150
patogeneze funkce plazmatických buněk
CD139
2322
CD139
23448
/209-238
subklasifikace CLL, pacienri CD139+ mají nejpříznivější vývoj choroby
CD140a
4q11-q13
PDGFRA
5156
160,180/
interakce nádorových bunek při metastázování, defekty kináz (FAK)
CD140b
5q31-q32
PDGFRB
5159
160-180/
interakce nádorových bunek při metastázování, defekty kináz (FAK)
CD141
20p12- cen
THBD
7056
160-180/
význam v patogenezi metastáz, metastatická kaskáda, vzácně mutace
v genu způsobuje hyperkoagulační poruchy
CD142
1p22-p21
F3
2152
45-47
patogeneze hemostázy, trombolytické stavy
ACE
1636
170-180/170- význam znaků v parogenezi vzniku spermií a kardiovaskulárních
180
komplikací
CDH5
1003
135/130
CD143
17q2
CD144
redukovaná exprese u angiosarkomu
25,90, 110/25,
stanovení nádorových buněk u močového měchýře
90,
CDw145
CD146
11q23.3
MCAM
4162
118/130
CD147
19p13.3
BSG
682
50-60/55-65
melanom, definování melanomu a jejich forem
patogeneze revmatoidní artritidy
význam u karcinomu prsu a některých dalších karcinomů a jejich
subklasifikace
CD148
11p11.2
PTPRJ
5795
240260/240-260
CD150
1q22-q23
SLAMF1
6504
65-85/75-95
stanovení lymfoproliferací X-vázaných NHL, imunodeficience
CD151
11p15.5
CD151
977
32/
AML, srdeční sval, zřejmě rozdíl v množství epitopů mezi normálními
a maligními buňkami
CD152
2q33,
CTLA4
1493
50/33
význam u autoimunitních poruch
CD153
9q33
TNFSF8
944
70-75/38-40
AML (30%), B-ALL, HCL, high-grade NHL
CD154
Xq26
TNFSF5
959
33/33,30,28
iminodeficience (X-vázaná imunodeficientní porucha, hyperimunoglobulin, HIGM syndrom), regulátor M1
CD155
19q13.2
PVR
5817
80-90/
etiologie polioviru (PVR)
CD156a
10q26.3
ADAM8
101
/69
buněčné adhezi, signální transdukci
CD156b
2p25
ADAM17
6868
/100-120
role u zánětlivých stavů, defekty antigenů i u fetálních tkání
CD156c
ADAM10
102
65/79
znak (Adam 10) se uplatňuje v degradaci myelinu u sclerosis multiplex
CD157
BST1
683
42-45/42-45
význam v patogenezi revmatoidní artritidy, sérový výskyt
CD158a-k,z 19q13.4
KIR
>3800
58-70/50140
uplatnění znaku při NK zprostředkované rejekci alogenní kostní dřeně,
melanomy, regulace melanomových buněk
CD159a
KLRC1
3821
43
význam CD94/CD159 a znaku u NK buněk a gama/delty lymfocytů
12p12.3-p13.1
20
informační magazín číslo 15 - 2010
CD znaky
Chromozomální Jméno
lokalizace
genu
CD159c
Entrez
(genu)
Molekulová
hmotnost*
Dg význam průkazu molekuly
KLRC2
3822
36
předpokládá se asociace s revmatoidní artritidou
CD160
1q 42.3
CD160
11126
80/27
patogenese paroxymální noční hemoglobinurie
CD161
12p13.3-p13.1
KLRB1
3820
80/40
poruchy funkcí buněk NK
CD162
12q24
SELPLG
6404
220-240/110patofysiologie ve funkci neutrofilů, analýza poruch rolování leukocytů
140
CD163
CD163
9332
110
molekula se může uplatňovat při protizánětlivé odpovědi monocytů
CD164
CD164
8763
160/80
subklasifikace a zjišťování patologie adheze hematopoetických buněk
CD165
CD165
23449
37/42
subklasifikace T forem u akutních ALL
CD166
3q13.1-q13.21
ALCAM
214
100/105/100patogeneze neurodegenerativních onemocnění, roztroušená skleróza
105
CD167a
6p21.3
DDR1
780
125
význam znaku u progrese nádoru, malformace prsní žlázy
DDR2
4921
130
aktivace znaku indukuje expresi metaloproteáz (kolagenázy a gelatinázy), které ovlivňují kolagen
CD167b
CD168
5q 33.2
HMMR
3161
/56-58
charakterizace maligních B-buněk (myelom, B-CLL), role při
onkogenezi
CD169
20p13
SN
6614
180/200
analýza u role makrofágu nádorově buněčné interakce u karcinomu
mléčné žlázy a chronické záněty
CD170
19q13.3
SIGLEC5
8778
140
patologie funkce dendritických buněk a monocytů
CD171
Xq28
L1CAM
3897
200-230
patogeneze CRASH syndromu, (X-vázaná recesivní neurologická
porucha)
CD172a
20p13
PTPNS1
140885
85-90
patologie neuronů hypokampu Purkyňových buněk a buněk retiny,
antigen váže CD47
CD172b
SIRB1
10326
110-120
signální regulační protein β1 nalézá uplatnění v patologii myelodních
buněk
CD172g
SIRPB2
55423
55
marker hematopoetických kmenových buněk, antigen přítomný
u karcinomu
CD173
CD174
FUT3
marker hematopoetických progenitorových buněk, význam při
apoptóze
2525
CD175
nádorově specifický antigen vyjádřený u různých nádorů
CD175s
nádorově specifický antigen vyjádřený u různých nádorů
CD176
CD177
120-198
antigen nádorových buněk PaN-karcinoma antigen, metastáze nádorových buněk
PRV1
57126
49-55/56-64
význam znaku při autoimunitních neutropeniích a neonatálních
neutropeniích, PH
patogeneze autoimunitních chorob, ALPS, HT, diabetes mellitus, SLE,
roztroušená skleroza
CD178
1q23
TNFSF6
356
/30-40
CD179a
22q11.22
VPREB1
7441
/16-18
klasifikace pre-B-ALL a X-vázaných agamaglobulinemií
CD179b
22q11.23
IGLL1
3543
/22
klasifikaxce pre-B-ALL, mutace agamaglobulinemie, mutace CD179
genu podmiňuje agamaglobulinemiig
CD180
5q12
LY64
4064
95-105/95105
znak zvyšuje náchylnost k BCR indukované buněčné smrti, rodina
receptorů pro patogeny, klasifikace buněk B
CD181
IL8RA
3577
uplatnění molekuly v rozlišování myeloidních typů krevních malignit
od lymfoidních typů malignit
CD182
IL8RB
3579
význam molekuly při rozlišování myeloidních typů krevních malignit
od lymfoidních typů malignit
CD183
8p12p11,Xq13
CXCR3
2833
/40-41
znak asociovaný s chemotaxí buněk T při zánětech, roztroušená
skleróza, hepatitida, sarkoidóza, revmatoidní artritida
CD184
2q21
CXCR4
7852
46/46
znak zahrnutý v patologii HIV1 infekce nádorů (ALL, AML, GH,
osteosarkom), mnohočetný myelom
BLR1
643
CD185
CD186
CXCR6
10663
39
CD191
CCR1
1230
41
CD192
CCR2
1231
42
CD193
CCR3
1232
41
CD194
CCR4
1233
41,4
CD195
CCR5
1234
37/40,6
význam znaku při zánětech, neutralizuje HIV infekci, migrace Th1
lymfocytů
CD196
CCR6
1235
42
molekula se selektivně nachází na některých typech non Hodglinských
lymfomů
informační magazín číslo 15 - 2010
21
CD znaky
Chromozomální Jméno
lokalizace
genu
CD197
9p13
Entrez
(genu)
Molekulová
hmotnost*
Dg význam průkazu molekuly
CCR7
1236
90
fenotypizace různých nádorů (ALL, BL, EBV, GH, kožní lymfom)
CDw198
CCR8
1237
41
CD198molekula je koreceptorem s CD4 znakem pro HIV-1
CDw199
CCR9
10803
42
uplatnění při chemotaktické odpovědi na SCYA25/TECK
znak ve vztahu k prodloužení přežití transplantátu
CD200
CD200
4345
40-45
CD201
20q11.2
PROCR
10544
49/25
EPC receptor má význam při koagulopatii
CD202b
9p21
TEK
7010
140/140
patologie TEK receptoru
CD203c
6q22
ENPP3
5169
270/130-150
význam při detekci buněk prostaty a epityddimis, význam u gliomových buněk prostaty a uteru
CD204
MSR1
4481
220
význam znaků při odstraňování patogenních mikroorganismů
(fagocytóza)
CD205
LY75
4065
205/
patologie dendritických buněk a monocytů
MRC1
4360
162-175/
antigen navozuje internalizaci ologosacharidových domén u gram+
a gram-
CD206
10p13
CD207
2p13
CD207
50489
40/40
analýza funkce nezralých Langerhansových buněk
CD208
3q26.3-q27
LAMP3
27074
70-90
patologie interdigitujících DB, význam při karcinomu prsu
CD209
19p13
CD209
30835
/44
patogeneze HIV1, funkce dendritických buněk
cytomegalovirus (CMV) a virus Epstein Barrové se váže na CDw210
(receptor pro IL10)
CDw210a
11q23.3
IL10RA
3587
90
CDw210b
21q 22.11
IL10RB
3588
90
CD212
19p13.1
IL12RB1
3594
110
CD213α 1
X13
IL13RA1
3597
patogeneze Crohnova onemocnění, revmatoidní artritida, Th1 typ, CD34
IL13RA2
3598
analýza poruch imunitních stavů
2p31
IL17R
23765
význam při zánětlivých stavech, osteogenezi a poruch granulopoezy
CD213α 2
CD217
receptor hraje roli u u chronické zánětlivé choroby („Crohn’s disease“)
CD218a
15q25-26
IL18R1
8809
62
znak nalézá uplatnění u imunitního systému při působení IL18 a IL12
ke vztahu TH1 a TH2 imunitní odpovědi
CD218b
15q25-26
IL18RAP
8807
68
selektívní distribuce na buňkách podmiňuje vazbu IL18 pro indukci
interferonu γ
CD220
INSR
3643
400
patologie interakce inzulinu se svým receptorem, výskyt na buňkách
různých nádorů
CD221
IGF1R
3480
135+90
CD221 je asociována s Beckwith-Wiedemann syndromem, prognostický indikátor některých nádorů (prsu, střev)
CD222
IGF2
3482
250/300
významný u některých nádorů (karcinom jater), zřejmě mutovaná forma
LAG3
3902
70/70
CD223 váže MHC antigeny druhé třídy a reguluje homeostatickou
expanzi T buněk
CD224
GGT1
2678
55+25/100
imunofenotypizace lymfoidních populací T a B
CD225
IFTTM1
8519
17
imunofenotypizace lymfoidních maligních forem (CLL, HCL, PLL)
CD223
12p13
CD226
18q22.3
CD226
10666
/65
exprese antigenu je zvýšena u nemoných s autoimunitními chorobami,
virové infekce
CD227
1q21
MUC1
4582
220-700
patologie adheze na aktivovaných buňkách, role u zánětlivých
epiteliárních chorob
MF12
4241
80-90
melanom, analýza asociovaných proteinů u melanomu, Alzheimerova
choroba
LY9
4063
120
význam při stanovení imunodeficientů, X-vázaný lymfoproliferativní
syndrom, XLP gen
PRSP
5621
30-40
význam receptoru pro prionový protein při patologických stavech
CD228
CD229
1q21.3-q22
CD230
CD231
Xq11
CD232
TM4SF2
7102
30-45
znak pro neuroblastomové buňky a některé formy T leukemií (T-ALL),
patologie mozkových tkání, X- váz. ment. ret.
PLXNC1
10154
200
patologie dendritických buněk a neutrofilů z hlediska VESP receptor
patologie Diego krevní skupiny na erytrocytech a utváření jejich
morfologie, patologie erytrocytu
DARC patologie Duffy antigenu na erytrocytech, analýza zánětlivých
onemocnění
CD233
17q12-q21
SLC4A1
6521
95-105/95105
CD234
1q22-23
DARC
2532
35-43/36
CD235a
4q28-q31
GYPA
2993
30m, 65d
CD235b
4q28-q31
GYPB
2994
CD236
2q14-q21
GYPC
2995
CD236R
2q14-q21
CD238
7q33
CD239
KEL
19q13.2
LU
22
3792
4059
patologie krevní skupiny na erytrocytech
patologie krevní skupiny na erytrocytech
30-40
klinický význam a patologie antigenů nejsou zcela objasněny
40
patologie Gerlich antigenu, populace kmenových buněk a jejich vymezení
115-200/93
patologie Kell antigenu v erytropoeze
78-85
Lutheran patologie krevní skupiny, analogie jako CD146, CD166,
erytroidní diferenciace
informační magazín číslo 15 - 2010
CD znaky
Chromozomální Jméno
lokalizace
genu
Entrez
(genu)
Molekulová
hmotnost*
Dg význam průkazu molekuly
CD240CE
1p36,13-p34.3
RHCE
6006
30
shoda ve znacích při transplantacích mezi dárcem a příjemcem, patologie Rh systému
CD240D
1p36,13-p34.3
RHD
6007
30
shoda ve znacích při transplantacích mezi dárcem a příjemcem, patologie Rh systému
CD240DCE
1p36,13-p34.3
CD240D
30
shoda ve znacích při transplantacích mezi dárcem a příjemcem, patologie Rh systému
CD241
6p11-p21.1
RHAG
6005
50
patologie Rh antigenu na erytrocytech
CD242
19p13.3
ICAM4
3386
42
poruchy při angiogeneze, CD242 je nizká během těhotenství a u některých maligních buněk
ABCB1
5243
170-180/170klasifikace leukemií z kmenových buněk, sledování rezistence na léky
180
CD244
51744
70/70
CD243
CD244
1q22
CD245
17q21-q22
mutace navozuje X lymfoproliferativní syndrom, imunodeficience
220-250
definování patologických lymfocytárních klonů
CD246
2p23
ALK
238
200
klasifikace subtypu T buněčných lymfomů, vymezení tzv. alkomy,
význam u neuroblastomů, RB
CD247
1q22.q23
CD3Z
919
16
patogeneze aktivačního receptoru, význam u nádorů k jejich špatné
prognóze a přežívání
CD248
11q13
CD248
57124
175
význam molekuly při agresivním proliferačním utváření některých
nádorových buněk
CD249
4q25
ENPEP
2028
160
analýza molekuly v prevenci angiogenezi nádorů, význam v léčbě
hypertenze
CD252
1q25
TNFSF4
7292
34
vztah molekuly k psoriáze a astmatu, TRAIL molekula má několik
závažných dopadů u nádorových procesů
CD253
3q26
TNFSF10
8743
32,5
TRAIL molekula má několik závažných dopadů u nádorových procesů
CD254
13q14
TNFSF11
8600
34,5
u antigenu se předpokládá potenciální diagnostický a terapeutický
význam
TNFSF12
9742
CD255
CD255 molekula indukuje NFκB aktivaci a proliferaci endotelových
buněk a neovaskularizaci nádorů
CD256
27,5
význam znaku při kontrole nádorového růstu, uplatnění při formování
nervového systému
CD257
31
analýza B buněk při objasňování aktivace, přežívání apoptózy za patologických stavů (CLL, myelom)
CD258
19p13.3
TNFSF14
8740
29
CD258 molekula má význam při aktivaci a při přežívání B buněk
v nádorovém procesu
CD261
8p21
TNFRSF10A
8797
50
polymorfismus CD261 antigenu je ve vztahu k riziku nádoru močového
měchýře
CD262
8p22-p21
TNFRSR10B 8795
48
antigen CD258 se může uplatňovat při různých funkcích buněčné
signalizace, sekreci cytokinů, aktivaci a apoptóze
CD263
8p22-P21
TNFRSF10C
8794
65
význam antigenu u maligních tkání není zcela objasněn
CD264
8p21
TNFRSF10D
8793
35
molekula je zahrnuta v kontrole TRAILem zprostředkované buněčné
smrti u některých nádorů
CD265
12q22.1
TNFRSF11A
8792
97
stanovení antigenu je přínosem pro poruchy vzniku kostí
(osteogenezi), (FEO, PDB2)
CD266
16p13.3
TNFRSF12A
51330
14
význam antigenu při analýze mozkových a pankreatických nádorů
CD267
17p11.2
TNFRSF13B
23495
32
CD267 na povrchu CD27+ vymezují paměťové B buňky, CD267 má
diagnostický význam u B malignit a autoimunitních stavů
CD268
22q13.1-q13.3
TNFRSF13C
115650
CD269
16p13.1
TNFRSF17
608
27
využití CD269 antigenu pro selektívní eliminaci plazmatických buněk
TNFRRSF14
8764
30
Interakce CD270/CD258 je zahrnuta do artherosklerotických lezí
antigen má význam při migraci buněk do vaskulární systém, při afinitě
TrK receptorů proneurotrofiny a u nádorů mamy
CD270
význam antigenu u B malignit a také MP může se uplatňovat v terapii
autoimunitních chorob
CD271
17q21-q22
NGFR
4804
75
CD272
3q13.2
BTLA
151888
33
CD273
9p24.2
PDCD1LG2
80380
25
znak pro rozlišení primárního mediastinálního B buněčného lymfomu
od difuzního velkého B buněčného lymfomu
CD274
9p24
CD274
29126
40
melanomy, karcinomy, glyoblastomy a T buněčné lymfomy exprimují
CD274 antigen, nástroj pro imunoterapii nádorů
CD275
21q22.3
ICOSLG
23308
CD276
15q23-q24
CD276
80381
110 a 40-45
molekula může mít uplatnění při stanovení některých neuroblastomů
CD277
6p22.1
BTN3A1
11119
56
antigen se manifestuje na buňkách nádorově specifických linií
antigen nabývá na významu pro patologii odmítnutí šzěpu a také při
alergii
informační magazín číslo 15 - 2010
23
CD znaky
Chromozomální Jméno
lokalizace
genu
Entrez
(genu)
Molekulová
hmotnost*
Dg význam průkazu molekuly
CD278
2q33
ICOS
29851
55-60d
glykoprotein se uplatňuje při alergických nemocech a zánětlivých
stavech
CD279
2q37.3
PDCD1
5133
55
antigen je užitečný pro stanovení prognózy náchylnosti k autoimunitním chorobám
CD280
17q23.2
MRC2
9902
180
antigen má potencionální terapeutický význam v léčbě a progresi nádorů
CD281
4p14
TLR1
7096
90
molekula je zahrnuty do vrozených stavů imunity na různé patogeny
(např. Borrelia burgdorferi)
CD282
4p32
TLR2
7097
85
CD282 molekula je receptor pro rozpoznání celé řady patogenů (plísní,
Gram negatívních bakterií)
CD283
4p35
TLR3
7098
100
CD283 antigen má roli při odpovědi na virové infekce
CD284
9q32-q33
CD285
CD286
4p14
CD287
TLR4
7099
85
antigen se uplatňuje při infekčních a zánětlivých stavech, rozpoznává
patogeny Aspergillus fumigatus a Candida al.
TLR5
7100
120
molekula je ve vztahu k plicním patogenům Legionella pneumophila
a Pseudomonas aeruginosa
TLR6
10333
85
antigen má roli u vrozených poruch imunity, při kterých uplatňují
specifické patogenní molekuly (PAMPs)
TLR7
51284
význam stanovení CD287 antigenu při diferenciaci B buněk, DC
(myeloidní) a jejich patologických forem
CD288
Xp22
TLR8
513111
83
molekula označená jako „Toll –like receptor“ se uplatňuje při vrozených
obraných stavech virové iínfekce
CD289
3p21.3
TLR9
54106
115-120
CD289 hraje roli u vrozených stavů imunitní odpovědi během
bakteriálních a virových infekcí
CD290
4p14
TLR10
81793
91-100
antigen vykazuje určitý polymorfismus a může uplatňovat u astma
a v patologii plicní tkáně
TLR11
442887
97
antigen má vztah k myeloidní diferenciaci a k jejím poruchám
CD291
CD292
10q22.3
CD293
CD294
11q13-q13.3
BMPR1A
657
50-58
znak reguluje (podobně jako CDw293) chondrogenézi a vývoj kostí
a mutace je asociována s Cowdenovou chorobou
BMPR1B
658
50-58
protein má významnou roli v navození buněčné proliferace a diferenciace a mutace způsobuje brachydaktilii typu A2
GPR44
11251
43
antigen je znak pro TH2 buňky a je také zahrnut u alergických chorob
CD295
1p31
LEPR
3953
130-150
receptor pro leptin má celou řadu funkcí, které mají dopad pro metabolismus lipidů, angiogenézi, fertilitu a obezitu
CD296
11p15
ART1
417
37
CD296 je asociován s diferenciací myocytů, s zánětlivou odpovědí
a inhibicí proliferace cytotoxických T buněk
CD297
12p13-p12
DO
420
38
CD297 je užitečný znak pro gynekologické nádory, protože není přítomen na odpovídajících buňkách normálních tkání
CD298
3q23
ATP1B3
483
32
analýza poruch Na/K ATPásy při transportu
CD299
19p13
CLEC4M
10332
40,1
význam antigenu při analýze virů (HIV type 1, Ebola virus), cytomegalovirus, Hepatitis C, SARC coronaviru
CD300a
17q25.1
11314
60
cytoplazmatická část molekuly obsahuje inhibiční motify pro fosforylaci tyrozinu, na které se podílí tyrozín fosfatáza
10871
23
antigen je široce zastoupen na buňkách hematopoetického systému
CD300c
antigen je vyjádřen na na monocytech, makrofázích a dendritických
buňkách a může napomoc k jejich fenotypizaci
CD300e
CD301
17p13.1
CLECSF14
10462
38
CD301 je znak pro nezralé dendritické buňky a pro makrofágy
CD302
2q24.2
CD302
9936
30
Reed-Stermberg buňky Hodgkinských lymfomů vyjadřují molekulu,
která je fůzní mezi CD205 a CD302
CD303
12p13.2-p12.3
CLECSF7
170482
38
marker pro plazmocytární dendritické buňky a pro jejich patologické
rozložení
CD304
10p12
NRP1
8829
140
molekula je znak pro plasmocytoidní dendritické buňky a koreluje se
špatnou prognózou nádoru prostaty
CD305
19q13.4
LAIR1
3903
31
antigen obsahuje intracelulární ITIM motify a je předmětem dalších
analýz
CD306
19q13.4
LAIR2
3904
16
znak může být užitečný v patologii funkce monocytů
CD307
1q21
CD308
CD309
4q11-q12
CD310
24
FCRL5
83416
100
CD307 antigen má uplatnění ve fenotypizaci B buněčných malignit
(non-Hodginských lymfomů a vlasaté leukemie)
FLT1
2321
152
molekula je významná pro atherosklerotických stavů a pro potenciální
léčbu zánětlivých projevů
KDR
3791
230
znak je zahrnut do regulace angiogeneze u některých nádorů a do
diabetické retinopatie
FLT4
2324
146
exprese u adenokarcinomu žaludku, který koreluje se špatnou
prognózou
informační magazín číslo 15 - 2010
CD znaky
Chromozomální Jméno
lokalizace
genu
CD311
CD312
19p13.1
CD313
Entrez
(genu)
Molekulová
hmotnost*
Dg význam průkazu molekuly
EMR1
2015
98
specifický marker pro makrofágy v terminální diferenciaci, jehož
uplatnění může být v poruchách buněčné adheze
EMR2
30817
90
vyšší exprese u synoviálních tkání revmatioidních nemocných
EMR3
84658
poruchy funkčních aktivit monocytárního-makrofágového systému
CD314
12p13.2-p12.3
KLRK1
29914
42
význam CD314 molekuly může být v rozpoznávání virem transformovaných nebo infikovaných buněk
CD315
1p13.1
PTGFRN
5738
135
molekulu vyjadřují buňky buněčných linií odvozených z fibrosarkomů
CD316
1q23.1
IGSF8
93185
63
molekula se uplatňuje při metastázi nádorových buněk a patogenezi
HCV
CD317
19p13.2
BST2
684
29-33
marker pozdního stádia maturace B buněk , což napomáhá při stanovení mnohočetného myelomu a makroglobulinemie
CD318
3p21.31
CDCP1
64866
140
marker pro diagnózu myeloidní leukemie
CD319
1q23.1-q24.1
SLAMF7
57823
66
analýza poruchy imunitních funkcí lymfocytů, Nk buněk a dendritických buněk
uplatnění při léčbě lymfomů
CD320
19p13.3-p13.2
CD320
51293
29
CD321
1q21.2-q21.3
F11R
50848
32-35
antigen sehrává roli u zánětlivých procesů a imunitě
CD322
21q21.2
JAM2
58494
45
role antigenu v buněčné polaritě
JAM-3
83700
43
význam molekuly v patologii zánětlivých vaskulárních chorob
CD323
CD324
16q22.1
CDH1
999
120
znak koreluje s rychlým postupem růst nádoru a také s jeho špatnou
prognózou
CD325
18q11.2
CDH2
1000
140
podíl na osidlování maligních buněk T původu na metastázích a i vnikání do zánětlivých ložisek
CD326
2p21
TACSTD1
4072
40
znak k odlišení nádorů epitelového původu od nádorů neepitelového
původu, znak pro léčbu rektálních nádorů
CD327
19q13.3
SIGLEC6
946
49
antigen se uplatňuje při embryogenezi
CD328
19q13.3
SIGLEC7
27036
75
CD328 inhibuje proliferaci leukemických buněk in vitro
CD329
19q13.41
SIGLEC9
27180
50,1
vazba ligandu na CD329 vyvolává aktivaci signalizační cesty vyvolávajicí apoptózu u neutrofilů
SIGLEC10
89790
90-120
molekula zřejmě ovlivňuje aktivitu eosinofilů během alergické reakce
CD330
CD331
8p11.2-p11.1
FGFR1
2260
130
mutace v molekule způsobují celou řadu syndromů (např. Pfeiffer,
Kallmann syndromu, 8p11 myeloprol. syndromu)
CD332
10q26
FGFR2
2363
115-135
bodové mutace způsobují defekty (např. Pfeiffer, Crouzen, Apert,
Lackson-Wess, Saethre-Chotzen syndromy)
CD333
4p16.3
FGFR3
2261
115-135
abnormální exprese CD333 (FGFR3) je ve vztahu k různým nádorům
(gresivní formy karcinomu močového měchýře)
CD334
5q35.1-qter
FGFR4
2264
110
exprese molekuly je prognostický indikátor u různých nádorů
(nádory prsu, tlustého střeva, prostaty, plic)
CD335
13q13.42
NCR1
9437
46
CD335 zprostředkovaná cytotoxicita nádorových buněk je pro NK
buňky ve vztahu k navození apoptózy 3 a CD337
CD336
6p21.1
NCR2
9436
44
CD336 zprostředkovaná cytotoxicita nádorových buněk je pro NK
buňky ve vztahu k navození apoptózy 3 a CD337
CD337
6p21.3
NCR3
259197
30
CD337 zprostředkovaná cytotoxicita nádorových buněk je pro NK
buňky ve vztahu k navození apoptózy 3 a CD337
CD338
4q22
ABCG2
9429
72
znak je zahrnut v rezistenci při chemoterapii na daunorubicin, doxorubicin, mitoxantron u leukemických pacientů
CD339
20p12.1-p11.2
JAG1
182
150
mutace u CD339 je u Alagilo syndromu a znak se podílí na defektech
kardiovaskulárního syndromu
CD340
17q11.2-q12
ERBB2
2064
185
význam při stanovení B-ALL, některých nádorů (neuroblastomů, karcinomů) s agresívní povahou a špatnou prognózou
CD344
11q14.2
FZD4
8322
59,8
CD344 hraje roli v angiogenezi retiny a jeho mutace se podílí na
vitreoretinopatii
CD349
7q11-23
FZD9
8326
64,5
analýza buněk některých fetálních (ledviny, mozek, svaly, oči)
a mezenchymálních kmenových buněk
CD350
12q24-33
FZD10
11211
65,3
analýza buněk některých fetálních (ledviny, mozek, žaludek)
a nádorových tkání a buněk nádorových linií
Poznámka: význam v regulaci tkání a buněčné polarity, regulaci proliferace, embryogenezi, vývoji dospělého organismu
informační magazín číslo 15 - 2010
25
SOLASTRATM: nové
reagencie pro typizaci
lymfomů a leukemií
Soupravy monoklonálních protilátek jsou určeny pro typizaci buněk periferní krve a kostní
dřeně vzorků lymfomů a leukemií. Kombinace
23 monoklonálních protilátek značených 5 různými fluorochromy je seskupena v 7 lahvičkách.
Osmou lahvičkou jsou negativní kontroly.
eagencie jsou určeny pro cytometr Cytomics FC500 a použití in
vitro. V dalším kroku budou validovány také pro Navios.
Cytometr Navios nabízí možnost rozšířit testy až do desetibarevného stanovení. Uživatelsky nejjednodušší je přidat další monoklonální protilátky značené APC, APC-Alexa Fluor®* 700 a Pacific Blue.
Pokročilejší uživatelé pak mohou využít další kombinace s APC-Alexa
Fluor®* 750 a PacificOrange*.
Souprava
B lineage
T lineage
Myelomonocytic Lineage
Negative
Control
FITC
PE
ECD
PC5.5
PC7
BL1
kappa
lambda
CD19
CD5
CD45
BL1
CD20
CD10
CD19
CD38
CD45
TL1
CD2
CD56
CD7
CD5
CD45
TL2
CD8
CD4
-
CD3
CD45
ML1
CD15
CD11b
CD16
CD14
CD45
ML2
HLA DR
CD56
CD34
CD117
CD45
ML3
CD7
CD13
CD34
CD33
CD45
Neg.
CTRL
IgG
IgG
IgG
IgG
CD45
26
Výběr protilátek a jejich kombinace vychází
z doporučení WHO a specializovaných konferencí (2006 Bethesda International Consensus, WHO
Classification of Tumors of Hematopoietic and
Lymphoid Tissues, 2008 revised).
Objednací čísla
A66286
B Lineage Kit, 25 testů
Solastra BL1 Kappa-FITC/Lambda-PE/CD19-ECD/
CD5-PC5.5/CD45-PC7
Solastra BL2 CD20-FITC/CD10-PE/CD19-ECD/
CD38-PC5.5/CD45-PC7
A66287
T Lineage Kit, 25 testů
Solastra TL1 CD2-FITC/CD56-PE/CD7-ECD/CD5PC5.5/CD45-PC7
Solastra TL2 CD8-FITC/CD4-PE/CD3-PC5.5/CD45PC7
A66288
Myelomonocytic Lineage Kit, 25 testů
Solastra ML1 CD15-FITC/CD11b-PE/CD16-ECD/
CD14-PC5.5/CD45-PC7
Solastra ML2 HLA-DR-FITC/CD56-PE/CD34-ECD/
CD117-PC5.5/CD45-PC7
Solastra ML3 CD7-FITC/CD13-PE/CD34-ECD/CD33PC5.5/CD45-PC7
A66256
Neg. Control Vial, 25 testů
*Obchodní známky jsou vlastnictvím příslušných
vlastníků.
PAVEL KRUŽÍK
E-MAIL: [email protected]
informační magazín číslo 15 - 2010
16. setkání distributorů manuálních
imunoanalytických souprav
Praha, 10. – 14. května 2010
zahraničí neprodáváme soupravy
přímo konečným zákazníkům, ale spolupracujeme vždy s našimi partnery –
distributory. Se zástupci jednotlivých distributorů se pak každoročně setkáváme.
Umožňuje nám to přímo řešit složitější otázky
a předávat si nové informace s bezprostřední
možností diskuze a zároveň poskytuje prostor pro
vzájemnou výměnu zkušeností mezi samotnými
distributory.
Letošní setkání bylo věnováno tématu reprodukce. V jeho rámci proběhlo školení o 13 nových
Jedním z odvětví, kterými se společnosti Immunotech a Beckman Coulter zabývají, je výroba manuálních imunodiagnostických souprav a jejich prodej
a podpora nejen v České republice a na Slovensku,
ale i ve zhruba 90 zemích celého světa.
imunodiagnostických soupravách, jejichž výroba byla v loňském roce převedena z pobočky společnosti Beckman Coulter DSL v USA do Prahy. Následovala živá až bouřlivá diskuze o změnách v logistice a dodávkách zboží,
které byly způsobeny jak tímto převodem, tak přechodem na nový softwarový systém, a které se dotkly také vás – našich zákazníků v České republice
a na Slovensku.
Značná část setkání byla věnována i společnému workshopu na téma „Stanovení AMH (Anti-Mülleriální hormon), jeho klinický význam a zkušenosti
v různých zemích“. Součástí semináře byla rovněž vynikající přednáška Sherry
Ann Faye z Velké Británie, která se zmiňovala mimo jiné o výsledcích nejnovějších klinických studií týkajících se možností využití AMH jak v reprodukční
medicíně, tak v pediatrii.
Společenský program se již tradičně konal ve městě s bohatou historií a nádherným okolím – letos padla volba na Telč. Zámek, renesanční náměstí i 20 km
vzdálený lázeňský komplex Sv. Kateřina vzbudily zaslouženou pozornost našich
kolegů z celého světa a poskytly jim možnost odpočinout si po dlouhé cestě
(leckdy přes polovinu zeměkoule – Argentina, Mauricius, Japonsko…) a po
náročném programu jednání, školení a workshopů.
A co letos nejvíce oslovilo mě? Byla to chvíle, kdy si v rámci vzájemného se
představování zástupce Íránu vylosoval do společné dvojice reprezentanta
z Izraele. Bylo vidět, že si absurditu situace oba uvědomují, ale zvládli ji s úsměvem a nadhledem a konstatovali, jaké je štěstí, že politika nedokáže postavit
bariéry všude a že vždy záleží na jednotlivcích.
VANDA FILOVÁ, E-MAIL: [email protected]
informační magazín číslo 15 - 2010
27
Uživatelské setkání
Beckman Coulter, Třeboň 2010
Letos poprvé se ve dnech 13. – 15.5.2010 uskutečnilo
samostatné české setkání uživatelů systémů AU, Access,
UniCel DxC, UniCel DxI, UniCel DxCi a Immage (na Slovensku
naši kolegové připravili podobnou akci na konci února
letošního roku v Šachtičkách). Volba místa konání tentokrát
padla na krásné jihočeské lázeňské město Třeboň.
elé setkání bylo tématicky zaměřeno na problematiku diagnostiky
karcinomu prostaty a varia, ale vyskytly se zde pochopitelně
i přednášky zabývající se jinými aktuálními tématy. Abychom účastníkům odbornou část programu zatraktivnili, umístili jsme ji do Schwarzenberského sálu na Státním zámku Třeboň. Zde proběhlo slavnostní
přivítání účastníků a první blok přenášek.
Úvodní den byl zakončen společnou prohlídkou třeboňského zámku,
která se uskutečnila v podvečerních hodinách. Návštěvníci tak mohli obdivovat
nejen krásy zámeckých komnat a sálů, ale spatřit z oken zámku i celou pouze
pouličními lampami osvětlenou jihočeskou Třeboň. Vzhledem k nepřízni počasí
bohužel neproběhla také plánovaná procházka po zámecké zahradě. Své dojmy
z prvního dne konání akce si zákazníci mohli předat při společném rautu připraveného v zámecké konírně.
Odpoledne druhého dne, po skončení dopoledního přednáškového bloku, bylo
věnováno nejprve společné prohlídce třeboňského pivovaru Bohemia Regent
s degustací několika druhů piv a poté volnočasovým aktivitám. Účastníci si mohli vybrat mezi relaxací v hotelovém wellness centru (sauna, masáže) a otestováním si hráčských dovedností při bowlingu. Protože jsme počítali s tím, že v polo-
vině května by nám již mohlo přát počasí, měli jsme
do programu zařazeny zejména venkovní aktivity –
prohlídku historického jádra města Třeboň, návštěvu
Schwarzenberské hrobky a pro sportovní nadšence
možnost projížďky na kole po místním okolí. I přesto,
že nám matka příroda v tomto ohledu připravila
značné zklamání, nenechala se většina zákazníků
odradit a připravené akce absolvovala. Zejména si
pak zaslouží obdiv ti, kteří i v dešti vyrazili na svůj
plánovaný cyklovýlet.
Večer se pak naštěstí všichni mohli zahřát u staročeského rautu, který se konal tentokrát v pivovarské
sladovně, a při tanci na hudbu všech možných stylů.
Doufáme, že naše úsilí při přípravě letošního
setkání nevyšlo vniveč a že byli zúčastnění zákazníci s průběhem akce spokojení, a zároveň bychom
chtěli poděkovat všem přednášejícím.
KATEŘINA KOŽANÁ
E-MAIL: [email protected]
28
informační magazín číslo 15 - 2010
XXXI. Imunoanalytické dny
a X. Mezinárodní konference
CECHTUMA Mikulov, 16. – 18. května 2010
ísto konání již XXXI. Imunoanalytických dnů (IAD) připadlo
letos na jihomoravské město
Mikulov. Tato konference byla
opět odborně a organizačně
zastřešena Fakultní nemocnicí
Plzeň – pracoviště Bory pod vedením pana Prof. Topolčana ve spolupráci s agenturou Booster Event s.r.o. a sponzorskými firmami,
mezi nimiž tradičně nechyběla ani naše společnost. O populárnosti akce svědčí také velký počet
účastníků, který letos přesáhl množství 200 osob.
IAD 2010 byly výjimečné i tím, že probíhaly paralelně s X. Mezinárodní konferencí o nádorových
markerech – CECHTUMA. Na stránkách www.imunodny.cz se můžete zpětně dozvědět více informací, popř. sledovat další aktivity a plány, které
tuto akci doprovází.
Konference byla rozdělena do tématických celků.
Velká část programu byla věnována preventivní
medicíně a stále aktuálnímu tématu diagnostiky
onemocnění štítné žlázy. Nechybělo téma screening vrozených vývojových vad a blok zaměřený na
kontrolu kvality. Zajímavostí a novinkou letošní
akce byly snídaně v diskusních kroužcích, na něž se
mohli zájemci registrovat dle vybraných témat
a kde měli možnost aktivně diskutovat s předními
odborníky jednotlivých problematik. Součástí konference byla také posterová sekce.
Kromě návštěvníků z řad zástupců laboratoří
a odborných společností byly přítomny také firmy, které se zde mohly prezentovat formou
stánku a odborných přednášek. Společnost Beckman Coulter zastupoval
náš kolega z Francie Jean Sebastien Blanchet, který měl příspěvek v sekci
CECHTUMA, a to k tématu karcinomu prostaty a zcela novému a unikátního parametru proPSA.
Cílem konference byla především edukace a propojení laboratorní praxe s klinickou disciplínou. Přestože byl odborný program obsáhlý, našel se rovněž prostor pro odpočinek a poznání malebného historického centra Mikulova a místního zámku. Oba večery probíhaly ve společenském duchu. V neděli se
uskutečnil zahajovací večírek, v pondělí pak raut s cimbálovou muzikou
a degustací lokálních vín, přímo z výrobny hotelu Galant, který poskytoval po
celou dobu příjemné zázemí. Dá se říci, že k naprosté spokojenosti účastníků
chybělo pouze vlídnější počasí.
KATEŘINA LAPIŠOVÁ, E-MAIL: [email protected]
informační magazín číslo 15 - 2010
29
Pipetovací
stanice
Biomek®...
...řešení na míru
vaší laboratoře
Finanční útvar
polečnost Immunotech a.s. v roce 2009 dosáhla díky důvěře
zákazníků velmi solidních finančních výsledků. Úspěšně provedla
akvizici diagnostické divize společnosti Olympus a tím posílila
svou vlastní pozici na trhu.
V roce 2010 pak došlo ke změně struktury v rámci skupiny
Beckman Coulter. Vznikla nová společnost Beckman Coulter
Česká republika s.r.o. coby čistě obchodní divize. Výrobní divize
dále pokračuje ve své činnosti pod hlavičkou společnosti Immunotech a.s.
Cílem této změny je další zlepšení firemních procesů a nastartování kontinuálního zvyšování kvality služeb zákazníkům.
Finanční útvar je zodpovědný za hladkou realizaci výše uvedených změn
z finančního hlediska. S touto reorganizací je spojena i centralizace finančního útvaru všech 3 společností koncernu Beckman Coulter pohybujících
se na českém a slovenském trhu – Immunotech a.s., Beckman Coulter Česká
republika s.r.o. a Beckman Coulter Slovenská republika s.r.o. Dojde tím ke
zjednodušení komunikace sdílených dodavatelů s pracovníky našeho oddělení a můžeme okamžitě řešit veškeré dotazy či problémy. Správu pohledávek má pro české zákazníky na starosti Ing. Martina Boušková, pro slovenské pak paní Adriana Kovačičová. Naším cílem je zlepšit komunikaci se
zákazníky, co se týče pohledávek, a spolupracovat s nimi při řešení jejich
potřeb.
V posledních měsících zároveň proběhla ve společnostech BC ČR a BC SR
implementace nového ERP systému. Pro finanční útvar to byla příležitost
seznámit se s moderním systémem a využít jeho předností ke zvýšení efektivity práce.
Jsem ráda, že se nám podařilo zvládnout hlavní část výše uvedených
změn, a naším úkolem je nyní již jen finální doladění nově nastavených
procesů.
Biomek® 3000
Biomek® NX
MAGDA KARPETOVÁ
E-MAIL: MKARPETOVÁ@BECKMAN.COM
30
informační magazín číslo 15 - 2010
Biomek® FX
Česká křížovka
Vybráno z konferenčního příspěvku zástupce jedné firmy dodávající diagnostické prostředky:
„Přesnost této metody je neuvěřitelná: ve sto případech ze sta je stanovení diagnózy naprosto přesné. A navíc, pokud …(Tajenka.) potřebných
k testům, dozví se výsledek během taktéž neuvěřitelných patnácti vteřin.“
Slovenská křížovka
Křížovka o ceny
Vybraté z konferenčného príspevku zástupcu jednej firmy dodávajúcej diagnostické prostriedky:
„Presnosť tejto metódy je neuveriteľná: v sto prípadoch zo sto je stanovenie diagnózy úplne presné. A naviac, pokiaľ …(Tajnička.)
potrebných na testy, dozvie sa výsledok počas tiež neuveriteľných pätnásť sekúnd.“
Pro 3 vylosované úspěšné luštitele jsou připraveny zajímavé ceny! Tajenky zasílejte e-mailem na adresu: [email protected] do
15.8.2010. Do předmětu uveďte „TAJENKA“. Nezapomeňte také, prosím, uvést své kontaktní údaje a název pracoviště.
TAJENKA Z MINULÉHO ČÍSLA: PŘÍPADŮ FALEŠNOU POZITIVITU. Výherci: Jan Balla, Hana Hanáková, kolektiv SLH IKEM.
informační magazín číslo 15 - 2010
31
Kde se můžeme setkat
(ČERVEN – ZÁŘÍ 2010)
30. 5. – 1. 6. 2010
8. – 11. 9. 2010
45. sjezd biochemických laborantů BIOLAB 2010
(Hradec Králové)
XXII. Biochemický sjezd
(Martin)
7. – 8. 6. 2010
9. 9. 2010
Mezikrajské pracovní dny Moravskoslezského kraje
(Žermanice)
Celostátní pracovní konference zdravotních
laborantů FN Motol
(Praha)
10. – 12. 6. 2010
33. kongres České nefrologické společnosti
(Praha)
20. – 21. 9. 2010
Symposium FONS 2010
(Pardubice)
10. – 12. 6. 2010
Laboratórna diagnostika v medicíne 2010
(Levoča)
24. – 26. 6. 2010
XXIV. Olomoucké hematologické dny
(Olomouc)
24. – 25. 9. 2010
XVIII. Severočeská imunologická konference
(Ústí nad Labem)

Podobné dokumenty

Časopis - Beckman Coulter

Časopis  - Beckman Coulter RNDr. Štěpán Tintěra Ing. Věra Vejvodová Ing. Lukáš Palivec, PhD. RNDr. Kristián Koubek, DrSc. - ÚHKT Mgr. Pavel Kružík Ing. Eva Králová Mgr. Hana Coufalová, MUDr. Josef Kopáč Lékařská laboratoř RN...

Více

Časopis - Beckman Coulter

Časopis  - Beckman Coulter Beckman Coulter Česká republika s.r.o., Radiová 1, 102 27 Praha 10, www.beckman.cz Časopis připravují Ing. Kateřina Kožaná Ing. Eva Králová Ing. Hana Krátká Mgr. Pavel Kružík Ing. Kateřina Sikorová...

Více

Časopis - Beckman Coulter

Časopis  - Beckman Coulter postgraduální studenti, dvě studentky letos obhájily na toto téma svoje PhD. Aplikace nádorových vakcín pacientům podléhá zákonu o léčivech, proto bylo zapotřebí vybudovat superčisté prostory,

Více

Směřování české psychiatrie na přelomu století

Směřování české psychiatrie na přelomu století ústavní péče ve velkých venkovských nemocnicích k léčbě v nemocnicích všeobecných. Léčba nabyla více medicínského a biologicky orientovaného charakteru. Od r. 1932, kdy vzniklo první neuropsychiatr...

Více

Časopis - Beckman Coulter

Časopis  - Beckman Coulter prostaty (phi) na systémech Beckman Coulter Karcinom prostaty je jednou z hlavních příčin úmrtí na nádorová onemocnění. Co je PSA a jak nám znalost jeho struktury může v prevenci tohoto zpočátku ča...

Více

zde.

zde. Pneumonie u imunokompromitovaných nemocných se vyznačují odlišným mikrobiálním spektrem. U této skupiny nemocných se vedle běžných patogenů uplatňují i oportunní mikroorganismy. Jako oportunní je o...

Více

NÁDOROVÉ MARKERY

NÁDOROVÉ MARKERY Viry: játra, děložní čípek

Více

Časopis - Beckman Coulter

Časopis  - Beckman Coulter či škol, v nichž badatel pracuje, a také se spolupodílí na jejich renomé. V podstatě se jedná o velmi aktuální otázky: kde, kdo, co a jak by se mělo řešit a navíc v tom pro řešení nalézt ta nejlepš...

Více