vyprac_test praktických znalosti_vse

C1. Karyotyp 47,XX,+8
Chromoz.nález-urči karyotyp, příp.název sy (já měla 3x8) a k tomu jakou pruhovací metodu
použili a v čem spočívá-př.Gpruh.-trypsin a geimsa.
Trizomie ch. 8 – nejčastěji spontánní potraty v 1.trimestru, v mozaice vzácně i postnatálně
G-pruhování = GTG, založeno na krátkodobém působení trypsinu – částečná degradace
proteinových složek chromozomového materiálu => barvení Giemsou => světlé/tmavé pruhy
různého rozsahu ( pruhy – charakteristické pro chromozom)
• lze rozlišit ch. do skupin i je přesně určit
• tmavé – vyšší kondenzace, pozdější replikace, převládá AT
• světlé – opak (transkripčně aktivnější), převládá GC
• pokud ztráta/nadbytečnost pruhu – strukturální změna
• lze přesně specifikovat přestavbu – základ pařížské nomenklatury (pruh určité
číslo,využití pro lokalizaci genů)
• např. CFTR – 7q31 (pruh 31, dlouhá raménka, ch. 7)
C2. Karyotyp 46,XX
určit karyotyp - mel jsem snad zdravou zenu, jestli opravdu jo, tak se nenechat oklamat
otázkami: o jaky syndrom se jedna? jaký je fenotyp jedince? pak tam byl určit typ barveni a
jeho podstatu - asi G-pruhováni, podstata
C3. Karyotyp t(14;21) - Downův syndrom
karyotyp přenašečky downova syndromu se slepenými chromozomy 14 a 21 v nějakém
pruhování ale netuším bohužel v jakém.
•
•
asi G-pruhování
45,XX, t(14;21) = balancovaná robertsonská translokace
C4. Karyotyp - obecné poznámky
hlavně Down, všecky translokace, pozor i normální karyotyp, tak tam nic nevymýšlejte! Dále
jak byly chromozomy barveny (G-pruhování) a jaká je podstata (natrávit trypsinem a obarvit
GR) a proč je to dobré (viz.dříve)
• 47,XY,+21
• Vzácně mozaika
• 46,XY, t(14;21)
• 46,XY, t(21;21)
C5. Vyšetření sex-chromatinu
vyšetření Barrova tělíska, ale pozor! v zadání bylo vyšetření sex-chromatinu, co to je a jak se
tomu jinak říká, tak se nenechte zmást. také popsat, jak Bar. těl. vzniká. já jsem měla dva
signály, popsat možné konstituce gonozomů a fenotypy (47,XXX = superfemale nebo
48,XXXY = Klinefelter).
• Sex chromatin= pohlavní chromatin (též Barrovo tělísko)
• Lze vizualizovat v interfázi (Feulgenova metoda)
• Tvořen inaktivovaným X (v interfázi zůstává spiralizován)
• Neaktivní kromě PAR
• Proces inaktivace = lyonizace
• 2 – 47,XXX / 48XXXY
•
3- 48,XXXX / 49XXXXY
formální genetika
F1. Rodokmen
rodokmen-konkr.máš konsanguinní pár, kde partnerův otec a partnerčina matka byli
sourozenci(nebo naopak?)a jejich otec, tj.děda těch 2.sezdanejch trpěl AR hluchotou, jinak
všichni zdraví-jaký má riziko potomstvo těch 2 pro onem.ARhluch.
F2. Vazba genů
priklad na vazbu genu, zadani myslim: krizime dva jedince "AbBa" (dvojnasobny
heterozygot) a "abab" (dvojnasobny recesivni homozygot). Dostaneme gamety v nasledujicim
zastoupeni: AB - 5, Ab - 45, aB - 45, ab - 5. Otazky pak jsou: jsou geny ve vazbe? v pripade
ze ano, v jake fazi? jake je jich vzdalenost???
•
•
•
•
•
•
Vazba neúplná
Asi se týká jen heterozygota
5:45:45:5
fáze trans
AB, ab – rekombinanty
Tedy 10.100/100 = 10cM
F3. Rodokmen - AD dedicnost
rodokmen s asi autozomalne dominantnim prenosem a napsat tam riziko pro potomky
postizene zeny se zdravym muze (tusim 50%) a este vypsat nejaku AD nemoc
•
•
50% postižení, 50%zdraví
Familiární hypercholesterolemie, Syndaktylie, polydaktylie, Huntingtnova
chorea, Osteogenesis imperfekta, myotonická dystrofie (to snad stačí)
F4. Cystická fibróza, hluchoněmost
Cystická fibroza, dokonce nějak různé typy mutace
hluchoněmost- každý partner jinak dědičnou, určit riziko pro děti
• Vrozená hluchota je heterogenně podmíněný znak, dědičnost
může být autosomálně recesivní, dominantní i gonosomálně
recesivní. Řada případů je i exogenních. Existuje více lokusů pro
AR hluchotu. (nevím, jak se to má počítat, zadaní nejasné)
•
CF - ᇫF508 (přímá diagnostika, něco v genu chybí), G551D (glycin zaměněn za
aspartát – místo, kde se váže ATP na Cl kanál, přímá, restrikční endonukleáza)
F5. Achondroplazie
celkem snadný, Achondroplázie, jak se dědí a jak se projevuje. dva postižení jedinci, jaké je
riziko pro potomstvo, resp. že se jim narodí životaschopné dítě = 2/3 = 66% (AA letální).
• autozomálně dominantní onemocnění pohybového aparátu, především receptorů
odpovídajících za vazbu růstového faktoru
fibroblastů
Projevuje se: malým vzrůstem a změnou tělesných
proporcí. Paže a nohy jsou obzvlášť krátké, kdežto hlava je
neúměrně velká. Disproporčnost je nápadná již u
novorozenců. Během celého dětství je pak zpomalen růst.
Proto dospělí dosahují výšky pouze kolem 115 - 135 cm (v
průměru 125 cm).
• Manželství obou postižených partnerů má pro každé
dítě 50% pravděpodobnost postižení
achondroplázií, 25% pravděpodobnost být
homozygotem pro achondroplázii, což je letální, a
25% pravděpodobnost být normálním nepostiženým
jedincem
Molekulární biologie
M1.InterpretaceFISH-Xcentromerická sonda
jsem měla interpretovat výsledek FISHe, což se mi absolutně nezdařilo a tak mi nedaly ani
bodiy ale byly tak Xcentromerický sondy a nějaký to bylo celýprapodivný...každopádně se
měl určit karyotyp(y)
M2.
Interpretace
FISH
malovaci
sonda
pro
chromozom
8
to byla FISH malovaci sonda pro 8.chr...jinak vsechny ostatni byly cerveny...netroufam si
moc tvrdit, co to presne melo rikat, ale nejspis tam byla nejaka reciproka translokace...dalsi
info k prikladu bylo, ze matka uz 2x potratila a tohle je jeji nalez...otazky pochopitelne: proc
matka potraci a jaky dalsi vysetreni byste provedli...No neni toho moc, ale aspon něco
•
Zřejmě podobný princip jako u malovací sondy 19 (asi bych použila dále M FISH)
M3. Interpretace FISH - asi CATCH22
FISH, poradne jsem to nepochopil, slo tam o vazbu sondy s nejakym genem na chromozomu
22 - dite se narodilo s postizenim aorty ci srdce, tak jej poslali na vysetreni. Asi se jednalo o
CATCH22 (?). Na kazdy dvacetdvojce jsou videt tri signaly - dva cervene a jeden zeleny.
Jedna barva hybridizuje asi s prislusnym genem a druha s subtelemerickymi oblastmi
chromozomu. Cilem je urcit syndrom, typ sondy, interpretovat vysledek testu
• Syndrom DiGeorge ( dalece 22q11.2, Projevy: konotrunkáln vada srdce, faciální
dysmorfie, mentální defekt, hypoplasie aplasie thymu)
• Mikrodelece prokázána, 50% riziko pro potomky
• Pokud byla na 22 duplikace – jedná se o Cat-Eye Syndrom….záleží, kolik signálů tam
bude
M4. Amesův test
vysledky Amesova testu napsat estli se da potvrdit mutagenita, proc sa dela pozitivni a
negativni kontrola a proc je pri vysoke koncentraci latky min reaktantu nez pri nizsi konc
latek.
• Laboratorní test genotoxicity na genové úrovni
• Studium reverzních mutací u histidin deficientních kmenů bakterie Salmonella
• Působením mutagenu dojde u některých buněk k reverzní mutaci,
která způsobí „opravu“ genu pro syntézu histidinu. Bakterie s touto
mutací tak znovu získají schopnost tvorby histidinu a přežívají i na médiu, které jej
neobsahuje
M5. Obecné poznámky
Baarova tělíska, locus-specifické sondy pro mikrodeleční syndromy (Angelman, WilliamBeurer), jak se ta metoda jmenuje, jestli by to šlo určit běžnou cytogenetickou metodou, určit
dle výsledku ten syndrom (čísla chromozomů jsou uvedena).
• Lokus specifické – hybridizují s jedinečnými sekvencemi, pro vyšetření mikrodelecí a
malignit, zjištění amplifikací onkogenů a některých translokací, možnost interfázní
FISH
•
•
•
Normálním vyšetřením se mikrodelece nezjistí
Williams-Beuren – mikrodelece 7q, skřítkovitý obličej (elfin face), irides stellatae,
abnormální dentice, cévní stenózy, hyperkalcémie, lehká až střední retardace,
přátelská povaha……
Angelman – mikrodelece15q,happy puppet, připomínají loutku, hyperaktivita,
epilepsie, těžká retardace, strnulá chůze, maternální delece ASCR(imprinting na
otcovském chromozomu – metylace), naopak oblast pro PWCR získaná od otce
metylovaná
M6. M-FISH
Já jsem měla myslím ženu s chronickou myeloidní leukémií, k tomu bylo vyšetření na MFISH, kde byly obarveny všechny chromozomy různou barvou, a chromozomy 9 a 22 měli
vyměněné mezi sebou malé části ramének. Otázky: Jaký je princip metody M-FISH a k čemu
se používá? jedná se o obarvení chromozomů pomocí flourescenčních barviv - pomocí pěti
barviv a jejich kombinacemi můžeme obarvit všech 24 lidských chrom., každý má pak jinou
barvu a použití je proto u celochromozomových přestaveb, translokací... Jaké další metody lze
použít? nevím jistě, snad lokus specif. sondu. Lze použít CGH? myslím, že ne (jen u
nebalancovaných přestaveb, kdy chybí nebo přebývá část DNA, balancované přestavby se
nepoznají
•
•
•
•
•
Tuto leukémii způsobuje derivovaný chromozom 22 (filadelfský ch.)
Získaná aberace, k níž dochází během života jedince
Reciproká translokace koncových úseků dlouhých ramének 9 a 22
Protoonkogen abl (oddělená část 9) je při translokaci na 22 fúzován s genem BCR
(silný promotor) --> abl aktivován na onkogen (jen pro úplnost viz.obrázek)
•
•
M FISH – potřeba metafázích jader, zejména k objasnění translokací zahrnujících
větší počet chromozomů
Lze použít CGH nelze použít u balancovaných přestaveb, snad by šlo využít malovací
sondy (nejsou ale vhodné pro složité translokace, lokus specifické se mi nezdají, o
deleci se zde nejedná…)
1.rodokmen GR, riziko pro potomky postizeneho muze se zdravou zenou, priklady GR chorob
•
•
•
•
•
Postiženi jsou (téměř výhradně) muži. Vloha se přenáší přes fenotypicky zdravou ženu
přenašečku (heterozygota).
Žena - přenašečka má 50% synů postižených, 50% dcer přenašeček.
Muž nikdy nepředává znak svým synům, všechny dcery postiženého muže jsou
přenašečky
Je li postižena žena, pak předpokládáme:
o X chromozomální aberaci
o Nerovnoměrnou lyonizaci
o Otec postižen,matka přenašečka-často příbuzenský sňatek rodičů
o Matka přenašečka, paternální X s čerstvou mutací
o Otec je postižen, maternální X s čerstvou mutací
Hemofilie A, Duchennova muskulární dystrofie, syndrom fragilního X,
Anhydrotická ektodermální dysplázie
2.karyotyp 46,XX,t(21,21) -fenotyp Downa, jake barveni (G-pruh) a zapsat princip metody
obarveni
•
G-pruhování viz dříve, fenotyp každý zná, ale jen pro úplnost:
3.Amesuv test-tabulka (latka tady zrovna nebyla mutagenni-jednoduse vyctes z hodnot v
tabulce) a otazky-co je poz/negativni kontrola, proc je delame?
46,X,del(Xp) nejpravdepodobnejsi ( nebo to mohla byt chyba tisku izochromozom, nebo
translokace X->X :o) proste jeden delsi, fenotyp? + barveni
izochromozom jsme dělali na praktiku……
Fenotyp jako pro Turnerův syndrom
Malá postava
Pterygium coli
Koarktace aorty
Štítovitý hrudník
Široce odstávající
prsní bradavky
Nedokonale
vyvinuté vaječníky
(často tvořené
pouze vazivem)
Četné pigmentové
skvrny na kůži
Často chybí
menstruace
Jen pro úplnost : Turnerův syndrom je způsoben:
a) Numerickými aberacemi (45,X nebo 45,X/46,XX)
b)Strukturnimi aberacemi - Izochromozom (46,X,iso(Xp) nebo 46,X,iso(Xq))
- Deleční formy (46,X,del(Xp) nebo 46,X,del(Xq))
- Kruhové chromozomy ( 46,X,r(X) )
Konsanguinni svazek - otec ženy a matka muže jsou sourozenci, jejich bratr (ie stryc muze a
zeny) ma AR hluchotu (mutace v Connexin 26) Riziko pro potomky?
•
•
Nepostižený sourozenec postiženého – ze 2/3 přenašeč (takže otec i matka 2/3)
Tedy 1/3 x 1/3 x 1/4 = 1/36 (prosím zkontrolovat) ( musí to být dobře, i mně to tak
vyšlo ☺)
Lokus specificka pro 21 - v obrazku 3x , ie DOWN, proc jsme nepouzili centromerickou pro
21 + co je nuchalni translucence a jake jine veci se vysetruji (hCG, uE3, AFP, PAPP-A)
•
•
•
Centromerická sonda pro 21 hybridizuje také s 13 – bylo by tedy 5 signálů
Nuchální translucence je měření tloušťky kožní řasy na šíji plodu. Pokud má plod
větší než normální tloušťku kožní řasy, existuje vysoká pravděpodobnost, že dítě bude
trpět Downovým syndromem
Biochemický test - odběrem krve mezi 16. - 17. týdnem těhotenství, při kterém
zjišťujeme hladiny tří hormonů (alfafetoprotein, hCG a estriol - proto název triple test)
a přepočítáváme na věk ženy
Bio: 1-poznat chrom. aberaci filadelfský chromozom, jak se podili na rozvoji
chron.myeloid.leuk – translokace 9 a 22 viz výše
2-hemofil. A - typ prenosu, projevy, pricina – GR, mutace v genu po faktor VIII, nepřímá
diagnostika
3-neprima diag. CF pomoci polymorf., ktery je s ni ve vazbe. – viz skripta Goetz II
Jeste poznamka k te hemofilii: mel jsem rodokmen - otec hemofilik, matka zdrava, pak nejaci
sourozenci (jak na tom byli, nevim) a riziko pro plod –všechny dcery budou přenašečky,
synové zdraví. U neprime diag. uvest infomativnost rodiny(ja mel neinformativni) a
navrhnout dalsi postup vysetreni – použít jiný polymorfismus a opakovat nepřímou
diagnostiku
1)karyotyp superfemale, zapsat, fenotyp.projevy + barvení – 47,XXX
Duševní vývoj je opožděný až k slabomyslnosti. Plodnost u skoro poloviny je
snížena či chybí. Pacientky bývají častější v psychiatrických léčebnách a zvláštních
školách. Podle některých autorů mají postižené sklon k schizofrenii. Některé ženy
mají amenoreu, jiné jsou plně fertilní a rodí většinou chromosomálně zdravé děti. Věk
matek postižených dcer je proti normální populaci vyšší.
fenotypicky žena, nevýrazné sekundární znaky, opožděný tělesný i duševní vývoj,
drobné vrozené vady (není pravidlem)
z 50% neplodné, nejsou dobré matk
2)přímá diagnostika cystické fibrózy,analýza výsledků vyšetření -informativita
rodiny,spolehlivost výsledků, doporučení dalšího vyšetření v případě neinformativity
3)rodokmen- GR choroba u otce probanda, proband zdravý, jaké riziko, že jí proband předá
potomkům, když jeho manželka zcela zdravá a tato nemoc se v její rodině nikdy nevyskytla žádné. + napsat nějaké GR choroby
•
•
Muž nikdy nepředává znak svým synům – tedy syn zdravý
Riziko populační
nepřímá diagnostika CF, říct jestli je to přímá nebo nepřímá, podle fotky PCR říct, jestli je
rodokmen informativní a jak, navrhnout přesnější diagnostiku
2. populačka: zdravý rodiče mají zdravou dceru, zdravého syna a dva postižené syny (dle
popisu syndrom fra.X) - jak se přenáší, jestli bude mít dcera zdravé děti
•
GR, žena přenašečka 50%postižených synů, 50% dcer přenašeček
3. obecná bio: buňky kostní dřeně => nakreslenej graf s dvouma peakama - závislost množství
DNA na množství buněk. Řešení- takovýto kolečko v kočárkovejch skriptech - nejvíc buněk
(peak A) s málo DNA atd. prostě to vyplývá s toho jak jdou ty fáze v interfázi.
Z biologie jsem si vytáhla FISH na které je centromerickou sondou zvýrazněný chromozom
13 a 21. Není to moc dobře znát, ale jsou tam 3x21. Další otázka k tomu byla co je nuchální
transcudance, jaké jsou biochemické markery a jaké jsou další možné sondy na značení
chromozomů 21a 13 - malovací dvě barvy
Otázka 2 - zdraví manželé se ptají jaké je riziko pro jejich dítě, když manželčin bratr zemřel
na CF (jejich rodiče jsou zdraví), jak se to dědí, jaké jsou příznaky CF
•
•
•
•
•
•
AR
Tedy rodiče ženy přenašeči Aa, bratr aa
Aa x Aa AA(1):Aa(2):aa(1)
Žena ze 2/3 přenašečka
Muž zdravý, tedy zdravé děti
Pokud jsou oba přenašeči (v populaci častí) – z 25% postižené děti
•
Není zadána frekvence přenašečů v populaci
rodokmen- GR choroba u otce probanda, proband zdravý, jaké riziko, že jí proband předá
potomkům, když jeho manželka zcela zdravá a tato nemoc se v její rodině nikdy nevyskytla žádné. + napsat nějaké GR choroby
•
Otec X synům nepředává
1.rodokmen GR, riziko pro potomky postizeneho muze se zdravou zenou, priklady GR chorob
•
Všechny dcery přenašečky, synové zdraví
1. Klinefelter - 47,XXY (nazov, zapis, fenotyp, barveni)
•
•
Malá varlata, zvětšené prsní žlázy, většinou sterilní, jeden Y a dva X (může být i více),
vysoká postava, omezený rozvoj sekundárních pohlavních znaků, klinický obraz se
vyvíjí až v pubertě
1/700 chlapců
2. Rodokmen - zena postihnuta so zdravym manzelom dve postihnute dcery a jednu zdravu
dceru, jedna z chorych dcer so zdravym manzelom postihnutu dceru a ta zas so zdravym
manzelom postihnuteho syna (mozno aj nieco naviac, ale v principe tak nejak). Urcit
najpravdepodobnejsie typy dedicnosti a priklady choroby - AD urcite a teraz mi dochadza ze
moze byt aj GD (asi)
•
•
AD – postižení Aa (vertikální typ přenosu, riziko pro děti postiženého i jeho
sourozence, pokud je kdo z rodičů přenašečem 50%)
GD – postižená žena se zdravým manželem 50%nemocných dcer i synů (přenos bývá
3 generace v přímé linii)
3.ZADANE: CF- analyza mutace delF508 v gene CTFR. Ak alela mutovana, vzikne kratsi
fragment(95kb). Ak nemutovana - dlhsi fragment. NA OBRAZKU: matka heterozygotka
prenasacka- dva pruzky(kratky aj dlhy), otec heterozygot prenasac - jeden pruzok (dlhy),
narodene chore dieta - dva pruzky (kratky aj dlhy). Plod - dva pruzky (kratky a dlhy)
URCIT: o aky typ diagnostiky sa jedna, ci je spolahlivejsia priama alebo nepriama, ci je
rodina inforamtivna alebo zpoloviny informativna + preco, ci je mozne uzavriet diagnozu
plodu, ake dalsie vysetrenie.
•Co som dala ja k 3 : Ide o priamu diagnostiku. Kedze choroba moze byt sposobena roznymi
mutaciami v gene CTFR- u otca aj ked rovnako prenasaca ide o inu mutaciu, tak je tato
metoda v tomto pripade nespolahliva. Rodina je zpoloviny informativna zo strany matky matka nesie mutaciu delF508, otec inu mutaciu. Diagnozu nemozno uzavriet, plod bud
postihnuty alebo prenasac. Dalsie vysetrenie - nepriama diagnostika¨
1.karyotyp XXX,jaky je fenotyp,jaka metoda pruhovani byla pouzita.
2.FISH 3 signaly-2 zelene,1 cerveny,delece 15.chromozomu q12,jaky je to syndrom/zadano
bylo devce 7 let a mentalni retardaci a neurologickymi poruchy/,jake sondy byly pouzity,lze
tento pripad vysetrit zakladni cytogenetikou.
•
Běžnou cytogenetikou nelze – mikrodelece, použity lokus specifické sondy a dvě
kontrolní telomerické – Angelman (podle popisu spíš) nebo PW
3.otec ma sklerozu a leci se cyklofosfamidem/mutagenni ucinky/,matka zdrava a ma bratra
postizeneho Duchennovou muskulárni dystrofii/ojedinely pripad/ a matciny rodice jsou
zdraví.Jaké je riziko pro jejich potomky a jaka pripadna vysetreni byste navrhovali
•
•
DMD- GR ALE:
pozn.k zadání-bratr umřel ve29, jinak rodina ženy ok, ženě je 35, muži40,ten lék má
mutagenní účinky;řešení:vzhledem k tomu, že v rodině ženy jeK.O.bratr ojedinělý
případDMD,pojednala jsem o mutaci de novo a tudíž ženu z přenašečctví nepodezírám
a DMD dále neřeším, ALE!co se jejího věku týče-už jí táhne přes35,tzn.předpoklad
zvýšeného rizika nondisjunkcí-a to v1./2.meiot.děl.,potažmo aneuploidií no a co se
bud.tatínka týče, ten má riziko nondisj.taky vyšší a to pro mutagenní účinek
těchléků.závěrem chci tedy říci, že pro DMD riziko není zvýšeno,ale indikovala bych
prenat.vyš.pro zvýšené riziko nondisj.ze strany matky i otce...a když to tam takhle
nějak napíšeš... ...měla jsem plnej počet a málem hvězdičku, tak by to mělo být
ověřený...
zdrava matka, zdravy otec maji zdravou dceru, 1 zdr. syna a 2 postizene syny, kteri maji velke
usi, protahly oblicej a velka testes. Otazka: jaky typ dedicnosti, pravdepodobna diagnoza ( sy
frag. X), jake je riziko pro deti te dcery a jake vysetreni byste navrhovali.
•
•
•
Sydrom frag.X – GR, Žena - přenašečka má 50% synů postižených, 50% dcer
přenašeček, rozsah postižení se odvíjí od počtu repetic tripletových sekvencí
Riziko dcery se odvíjí od toho, jestli je nebo není přenašečka
Vyšetření – molekulárně biologické metody – amplifikace – PCR (Diagnostika je
založena na předpokladu, že premutované a plně mutované alely se díky expandované
CGG repetici nemohou amplifikovat. PCR reakce nám pomáhá vytřídit FRAXA negativní
vzorky nesoucí normální alely ještě před Southern blottingem. Jsou to muži s jedním PCR
produktem a ženy se dvěma PCR produkty (dvě různě dlouhé normální alely). Zbylé
FRAXA suspektní vzorky, kterými jsou muži bez amplifikačního produktu a ženy s pouze
jedním amplifikačním produktem, postupují do další analýzy metodou Southern
blottingem.) – to jsem moc nepochopila….
Dale tam pry nekdo mel comet assay - interpretovat vysledek vysetreni. ¨ - stanovení malých
fragmentů DNA v jádrech buněk vlivem mutagenů, buňky se převedou do gelu a případné
fragmenty se uvolní při elektroforéze, pak se jádra obarví fluoreskující látkou a pod
mikroskopem vidíme ohon komety
matka po dvou potratech porodila downa, její sestra měla mongoloidní, záhy zemřivší dítě,
neokaryotypizováno. O co se pravděpodobně jedná? Jaká vyšetření provést? jaké jsou závěry
a pravděpodobnosti, co se narodí z dalších těhotenství
•
•
Tohle vypadá, že matka je přenašečkou balancované translokace 45,XX,t(21;21)
Buď se narodí Down nebo potrat
•
Riziko 100%
2.rodokmen-podle mě AD, vypsat nemoci a určit riziko pro děti ženy, která je postižená a
vezme si zdravého muže
•
•
•
•
Aa:aa – Aa:aa 50:50
HD, achondroplazie, polycystóza ledvin, brachydaktilie, Crouzonova choroba
Tady ještě pojmy variabilní expresivita - tentýž (parciální) genotyp se u různých
jedinců žijících v různých prostředích může do fenotypu promítnout různě silně
Neúplná penetrance - Stav, kdy ne u všech nositelů disponujících alel dojde k
manifestaci daného onemocnění, ať už proto, že je genetická dispozice "titrována"
ochranně působícími alelami dalších genů a interakcí, případně příznivým vlivem
složky prostředí (např. životní styl)
3.Comet assay test-vysvětlete princip testu, jaký jiný test můžeme použít u lidí k zjištění
genotoxicity a interpretujte výsledek testu-to tam byly 4 obrázky, který podle mě měly
všechny vidět "kometu"...přesněji ale nebylo řečeno jak interpretovat, tak nevim jestli jim
stačí říct, že ano, fragmenty tam sou, člověk byl vystaven genotoxicitě ...
•
•
Tak další testy (pokud měl na mysli chromozomovou úroveň): napsala bych asi
studium výměn sesterských chromatid, stanovení aberací u pracovníků/obyvatel
rizikových oblastí (nad 4%b genotoxicita prokázána) a micronucleus test(hodnocení
výskytu acentrických fragmentů po mitóze)
Hodně jsme řešili Amesův test, ale ten je na genové úrovni….
1) karyotyp: 45,XX,der(14;21)(q10;q10) - určit fenotyp: přenašečka nebalancované
translokace, Down. sy nepostižená + barvení: zase G pruhování
Tady jenom doufám, že stačí základní zápis
2) rodokmen, tuším AD, protože byl postižen vždy alespon 1 člen v každé generace a byl tam
přenos z muže na muže, probandka postižená, určit riziko pro děti, když si vezme
nepostiženého muže + napsat př. takto děděných chorob
•
Pokud ona Aa, muž aa – 50% dětí postižených
3) Amesův test - tabulka: 1. sloupec koncentr. benz(o)pyrenu - hodnoty myslím 0, 50, 100,
200, 300? a 2. sloupec počet revertantů: 15(spontánní), 37, 147?, 370 a 362 no a mělo se zas
určit, jestli je benz(o)pyren mutagen, potom, proč u poslední koncentr. začíná klesat počet
revertantů a vysvětlit zas negativní a pozitivní kontrolu
•
Genotoxicita prokázána – pak to klesá kvůli toxicitě mutagenu
1).Opete u nas v kruhu byla prutokova cytometrie+ k cemu se pouziva
•
Průtoková cytometrie -použití přístroje FACS Fluorescence Activated Cell Sorter –
měří koncentraci DNA v každé buňce podle intenzity fluorescence (buňky jsou
obarveny fluorescenčním barvivem, které váže DNA), další použití k měření
koncentrace DNA v buňkách pacientů s hematologickými malignitami
2)Rodokmen, u ktereho se mel urcit typ dedicnosti a riziko pro deti probanda(ja mela
konkretne gonozomalne recesivni dedicnost a ptali se na potomky postizeneho muze a zdrave
zeny
•
•
XaY: XAXA
Otec nepředá znak synům, dcery přenašečky
3) hodne lidi od nas melo primou ci neprimou diagnostiku CF,riziko pro plod , navrzeni
lepsiho diagnostickeho postupu atd.
•
•
Přímá – pokud jeden z přenašečů nese jinou mutaci, než sledujeme, použijeme
nepřímou diagnostiku
Neinformativita - můžeme použít jiný polymorfismus (marker) a doplnit informativitu
Nekdo mel v otazce na FISH sondu, ktera hybridizuje s genem "HIRA"(je to v pracovnim
sesite ke Kocarkovym skriptum na str. 44)
Di George (CATCH22)
c) matka prokázaná aA pro AR; postižené aa dítě z 1. manželství, nyní ve druhém manželství
s otcem A? - výskyt ar choroby v populaci=1/10000. Jaké jsou vyhlídky? (nadějné, jak by řekl
Dickens). q=1/100, frekvence heterozygotů 1/50 -> pravděpodobnost, že muž je Aa jsou 2
procenta. Tzn. 1% budou přenašeči, 0,5% nemocní a 0,5% zcela zdraví. pravděpodobnost, že
manžel je AA je 98% -> tzn. 49% Aa děti, 49% AA, celkem tedy je 0,5% šance postiženého
dítěte, 50% šance dítě přenašeč a 49,5 zcela zdravé dítě.
•
aa …….f= 1/10000 ….tedy f recesivní a alely = 1/100
•
•
•
•
A = 1 (1/100 +A=1)
F přenašečů = 2.1/100= 1/50
Riziko pro potomka 1 (matka přenašečka) x 1/50 (f v populaci) x 1/4 (postižené dítě)
= 1/200
Tedy riziko narození postiženého dítěte je 0,5 %
metodou FISH máme označené 22. chromozomy...červená sonda na lokusu q11, zelená sonda
je kontrolní (na jiné pozici, je jedno kde). Na obrázku je vidět červený signál pouze na
jednom chrom. 22. Urči výsledek vyšetření, jakou chrom. vadu jsme vyšetřovali, jak se
jmenuje syndrom (=mikrodeleční sy 22q11 –CATCH 22), jako sondu jsme použili (=lokus
specifickou) a jestli se dá tento sy vyšetřit normální cytogen. metodou (nedá, je to
submikroskop. Delece)
!!!!! ještě jsme dnes mluvili s p.Tůmovou a ta řikala, že když tam někdo má karyotyp 46,XX
(XY) a ptají se ho na fenotyp, že tam všichni píšou, že je vyšetřovaný zdravý, ale že si na to
máme dát pozor, protože u toho karyotypu, jsme sice vyloučili numerické aberace a asi i
nějaké větší strukturní, ale neznamená to, že je pacient zdravý (třeba může mít mikrodeleci,...)
sice nevim, jestli za to strhávají bod, ale tak na to asi dejte pozor
Krevni skupiny - matky AB,M, dite B,M. Genotyp matky a ditete a potencialniho otce? Jaky
typ dědičnosti
•
•
Intermediární dědičnost – kodominancí monogení dědičost
Otec – určitě M,N může být AB, B, O, A
Pacient - muž, 18 let - gynekomastie, azospermie - genotyp 46,XX. Jak je to mozne? Jaka
dalsi vysetreni
•
•
Došlo k translokaci genu SRY na chromozom X (nerovnoměrný crossing over), dále
bych použila lokus specifickou sondu (ověření SRY na X) + X centromerickou sondu
(2 signály)
Muž neplodný, protože geny ovlivňující spermatogenezi leží na Yq (u něj Y chybí)
1) karyotyp triploidie - napsat o co se jedná, zápis, jaký fenotyp a název sy, jaké pruhování a
princip
69,XXX
2) AR rodokmen - napsat nemoci a postižení pro probandku, když matka postižená a otec ne.
(zase aa :AA – 100% přenašečka)
3) reciproká translokace 9;22 - napsat o jakou chromozomovou aberaci se jedná, proč to
způsobuje rakovinné bujení, a jakou molekul. biologickou metodu použít (M FISH, viz
filadelfský syndrom)
mela jsem FISH delanou pro podezreni na Wiliams-Beurena, podle sond byl ale zdravy, jinak
do pouziti sond je dobre napsat, ze pouzivame satelitni centromerickou sondu (zelena) pro
kontrolu, zda jsou ve vzorku oba chromosomy 7 (pri zpracovani se obcas neco ztrati) a lokus
specifickou sondu hybridizujici s kritickym regionem (cervena) pro vylouceni ci potvrzeni
mikrodelece.
Priklad na rodokmeny byl> hluchy muz ma zdravou sestru i rodice chce mit dite s hluchou
zenou, jejiz syn z prvniho manzelstvi (se zdravym muzem) je zdravy, ona sama ma vsak
postizenou sestru a matku, vypoctete rizika...
spravna odpoved> u zeny se pravdepodobne jedna o AD (ale muze byt i AR), u muze jde bud
o cerstvou mutaci AD, nebo jeho hluchota neni geneticky urcena (mohl uzivat ototoxicke leky
nebo prodelal infekci...atd.), takze pak napisete rizika pro vsechny mozny kombinace. Melo
by to byt dobre,mam plny pocet.
•
•
•
•
Pokud AD a otec negenetická hluchota – riziko pro děti ze strany ženy 50%
Pokud žena Aa a i u otce AD de novo – 75% postižení (liší se nějak projevy AA od
Aa?????)
Pokud žena AR aa a muž de novo negeneticky – všichni přenašeči
Pokud žena aa AR a muž Aa AD – 50 % postižení (dostanou od otce A) nebo
přenašeči (od matky a)
1. křížení AaBb s aabb, štěpné poměry byly AB=26, Ab=24, aB=27, ab=23 (nebo tak nějak,
nevím přesně), mělo se určit, zda jsou nějaké geny ve vazbě, pokud ano, určit fázi a
vzdálenost v centimorganech
jen dodávám, že čísla u toho příkladu na vazbu byla taková, že geny vůbec ve vazbě nebyly,
tzn. pravděpodobně jsou i na jiných chromozomech... take se nic nepočítá, i když k tomu
naváděj ( souhlasím s komentářem poměr 26:24:27:23 je zhruba 1:1:1:1 pak vazba je volná a
nic bych nepočítal)
2)dva achodropasiky co chtej dite (ona ma postizenou matku jinak vsichni zdravi)nakreslit
rodokmen a s jakou pravdepodobnosti budou mit nemocny dite +fenotyp a
•
•
1/4 zdraví, 1/2 nemocní, 1/4 letální
Tedy cca 67% riziko narození postiž. dítěte
1.cytogenetika: mela jsem NESERAZENY karyotyp..a k tomu pak otazky na typy
chromozomu,pruhovani...
!!!!!Kočárek mezi řečí zmiňoval, že se v testech vyskytuje také rodokmen s holoandrickou
dědičností (Y-vázaná dědičnost). Prý na něj dosud nikdo nepřišel.
tak dneska na bio jsem mela mozaiku 47,XY +21 / 46,XY a urcit co zpusobuje aberaci a
fenotyp..
•
Somatický mozaicismus, lehčí projevy, ale záleží na tom, jak časně nondisjunkce
proběhla
urcit nejvyssi a nejnizsi riziko potomku u techto moznosti
a)rodice s dcerou s pylorostenozou – multifaktoriální choroba, Pylorostenóza se 5 x častěji
vyskytuje u novorozenců mužského pohlaví. V rodině je postižena dcera. – riziko opakování
je tedy větší pro bratry a riziko se celkově zvýšilo (je nemocná dcera, tedy méně rizikové
pohlaví)
b)rodice se synem s pylorostenozou - menší riziko než v a) pro obě pohlaví
c) par,zeny otec je hemofilik jinak vsichni zdravi – žena je přenašečka, riziko pro 50% synů a
50% dcer přenašečky (tedy vyšší riziko pro muže než a,b) u dcer asi menší, když jsou jen
přenašečky…????nechápu, jak mám tohle porovnávat…)
d)pribuzensky vztah - jejich rodice byli sourozenci a jejich tatine(dedecek) mel Huntingtnovu
choreu.. (,,Pak jsem měla ten nesmysl s pylorostenozou, huntingtonem ( tam bylo zadáno, že
rodiče toho páru jsou 70letí a zdraví, tudíž se dá čekat, že nemají tu mutovanou alelu ) a
hemofilií“)
- AD, tady by riziko bylo největší, ale jestli je rodičům 70, tak alelu nezdědili
MG: FISH, lokus specifická sonda na 22q11 (zelená) + kontrolní na 22 jinde (červená - nebo
možná barvy opačně). Co jsme vyšetřovali, jaká je podstata aberace, co je to za syndrom. Co
z toho vyšetření vyplývá - byly 4 signály zel., 4 čer., takže ten syndrom neměl. V jaké fázi
cyklu je buňka - G2 (po S), protože je jasné, že na každém chr. 22 jsou 2 signály = 2
chromatidy.
já jsem měla karyotyp 47,XY,+21(65)/46,XY(35). Napsat, co je to za syndrom a jeho fenotyp,
jestli se tenhle pacient bude lišit od 47,XY,+21 ( myslím, že tenhle bude mít mírnější formu) a
jak tohle vzniká ( asi nadbytečný 21 vymizí v některých buňkách v časných postzygotických
děleních ), jo a popsat, co vlsatně ten zápis znamená.
•
•
Pacient je mozaikou vznikající nondisjunkcí ( při mitóze blastomer v zygotě)
Zápis znamená poměr vyšetřovaných buněk s trizomíí a bez ní
Nepřímá diagnostika pro ten polymorfismus, co je v jejich skriptech za tím, co jsme dělali.
matka měla jeden dlouhý fragment a 2 krátký, otec totéž, postižené dítě mělo 2 krátké a plod
jeden dlouhý. Z toho jsem vyvodila, že je rodina plně informativní a plod bude zdravý
homozygot.