Mikrobiologie
Transkript
Mikrobiologie
Mikrobiologie – viry v potravinách – příklady z praxe Mgr. Petra Vašíčková, Ph.D. doc. MVDr. Renata Karpíšková, Ph.D. Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i. Standardy v rámci stravovacích služeb EU a CZ Praha, 16.3.2015 Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i., Brno 1. Virologie a diagnostika 2. Bakteriologie 3. Imunologie 4. Bezpečnost potravin a krmiv 5. Genetika a reprodukce 6. Chemie a toxikologie 7. Farmakologie a imunoterapie Oddělení bezpečnost potravin a krmiv 1.Mykobakteriální infekce (tuberkulóza, paratuberkulóza, mykobakteriózy zvířat) 2.Bakteriologie potravin 3.Virologie potravin 4.Průkaz falšování potravin 5.Výživa zvířat Mikrobiologie potravin • mikroorganismy v surovinách, polotovarech a potravinách, jejich výskyt a charakteristika • vliv technologií na mikroorganismy • studium metabolických pochodů mikroorganismů, které vedou ke kažení potravin • ochrana spotřebitelů před alimentárním onemocněním • studium preventivních opatření, která brání rozmnožování nežádoucích mikroorganismů v surovinách a potravinách. • využití mikroorganismů při výrobě různých druhů potravin v praxi Mikrobiologie potravin • mikroorganismy v surovinách, polotovarech a potravinách, jejich výskyt a charakteristika • vliv technologií na mikroorganismy • studium metabolických pochodů mikroorganismů, které vedou ke kažení potravin • ochrana spotřebitelů před alimentárním onemocněním • studium preventivních opatření, která brání rozmnožování nežádoucích mikroorganismů v surovinách a potravinách • využití mikroorganismů při výrobě různých druhů potravin v praxi Proč sledovat mikrobiální kontaminaci? • celosvětově pozorován zvýšený výskyt alimentárních onemocnění (epidemií, jednotlivé případy, hospitalizace i smrt) v souvislosti s potravinami • celosvětová distribuce potravin • vyšší spotřeba ovoce a zeleniny • zvýšený počet osob se s níženou imunitou Alimentární onemocnění • Z pohledu epidemiologie a infekčního lékařství se takto označuje každé onemocnění člověka a zvířat, kdy se jedinec nakazí pozřením kontaminované potravy či tekutiny. • Vstupní branou je trávicí trakt - přenos fekálně orální cestou Alimentární onemocnění • Nemocný člověk s klinickými příznaky, problém člověk nosič – bez klinických příznaků, ale virus (patogen) vylučuje • Zoonózy – zdroj zvíře • Problém import ze zemí s endemickým výskytem – turistika nebo zaměstnání v zahraničí, služební cesty • Preventivní opatření spočívají zejména v zabránění kontaminace potravin a vody; silně ovlivněno „lidským faktorem“ • Dovoz již kontaminovaných surovin/potravin Bakterie způsobující alimentární infekce Patogen Doba inkubace Symptomy Infekční dávka Listeria monocytogenes 1-5 dní (týdny) horečnatá gastroenteritida, aborty, septikemie a meningitidy 108 (102 – 103) Campylobacter spp. 3-5 dní zvracení, bolesti břicha, průjmy 103 Salmonella 6-48 hodin průjem, bolesti břicha, zvracení, horečka, bolest hlavy 104 – 108 E. coli (patogenní, O157) 3-8 dní krvavé průjmy, postižení ledvin, 50 – 100 1-7 dní horečka, průjmy, bolestmi břicha enterokolitida, záněty kloubů a zvětšení mízních uzlin více než 109 Yersinia enterocolitica Parazité způsobující alimentární infekce Patogen Doba inkubace Symptomy Cryptosporidium parvum 2-10 dní průjem lidí i zvířat, zvracení, bolesti břicha, onemocnění trvá 1 - 2 týdny Giardia lamblia 1-3 týdny průjem, plynatost, hubnutí trvání nejméně 5 dní - většinou déle 10-100 max. 10 dní horečka, bolesti hlavy a očí, rozmazané vidění, zduření uzlin, bolesti svalstva, únava 10-100 Toxoplasma gondii Infekční dávka 1-100 (https://www.studyblue.com/notes/note/n/diarrhoea-/deck/938237) Viry způsobující alimentární infekce Patogen Doba inkubace Symptomy Norovirus 12 až 48 h křeče v břiše, průjem, zvracení, horečka 10-100 Rotavirus 1 – 3 dny horečka, mnohočetné průjmy, bolesti v nadbřišku 100-1000 Virus hepatitidy A 25 až 30 dní bolest břicha, nevolnost, horečka, žloutenka, tmavá moč 10-50 Virus hepatitidy E 40- 60 dní bolest břicha, nevolnost, horečka, žloutenka, tmavá moč 100 ? 7-30 dní příznaky lehké chřipky, vysoké horečky, prudké bolesti hlavy, nevolnost, zvracení, ztuhnutím svalů na šíji, svalovým třesem Virus klíšťově encefalitidy Infekční dávka ? Patogeny způsobující alimentární infekce Alimentární onemocnění • Nemocný člověk s klinickými příznaky, problém člověk nosič – bez klinických příznaků, ale virus (patogen) vylučuje • Zoonózy – zdroj zvíře • Problém dovoz ze zemí s endemickým výskytem – turistika nebo zaměstnání v zahraničí, služební cesty • Dovoz již kontaminovaných surovin/potravin • Preventivní opatření spočívají zejména v zabránění kontaminace potravin a vody; silně ovlivněno „lidským faktorem“ Výskyt hepatitidy A (https://www.nathnac.org/pro/factsheets/hep_a.htm) Alimentární onemocnění • Dovoz již kontaminovaných surovin/potravin • Dle legislativy povinnost vyšetření mražených jahod dovezených z Číny – virus hepatitidy A a Norovirus Kontaminace potravin - viry • V surovinách/potravinách se nemnoží • K vyvolání infekce stačí malé množství • Potraviny živočišného i rostlinného původu (hl. určené k přímé spotřebě) • Křížové kontaminace během zpracovatelských postupů (ruce, předměty, pitná voda) • Nejsou změněny senzorické vlastnosti potravin • Odolnost vůči vlivům vnějšího prostředí (acidorezistence, chlad) • Persistence dny, měsíce; zamražené roky Přenos virů způsobujících alimentární infekce Viry - rizikové potraviny EFSA (2014) Viry - epidemie • • 2015 – Austrálie, mražené drobné ovoce (Čína), hepatitida A • • • • • • • • • • • 2013 – Holandsko, mražené maliny z Polska, noroviry 2013 – 2014 Německo, Holandsko, Švédsko a Polsko, mražené bobulovité ovoce z Itálie, hepatitida A 2012 – 2013 – Skandinávie, mražené bobulovité ovoce , hepatitida A 2012 – Irsko, ústřice z Holandska, noroviry 2010 – Irsko, ústřice, noroviry 2009 – Dánsko, mražené maliny ze Srbska a Belgie, noroviry 2009 – Finsko, mražené maliny z Polska, noroviry (>100 ) 2009 – Švédsko, mražené maliny ze Srbska, 19 infikovaných noroviry 2006 – Holandsko, mražené maliny z Chile, 45 infikovaných noroviry 2006 – Finsko, zeleninový salát, noroviry (cca 400) 2005 – Dánsko, mražené maliny z Polska, noroviry (>350 ) 2005 – Rusko, pivo (voda užitá při přípravě), hepatitida A (> 500 ) Vliv technologií na přežívání virů v potravinách a pitné vodě Virologie potravin - ČR • • Sledování potravinových řetězců v ČR, lokální produkty Drobné ovoce (jahody, maliny, ostružiny, borůvky) Zelenina (listový salát, mrkev, okurky, rajčata ...) Vepřové masné produkty a zvěřina Snaha o dosledování zdroje kontaminace Prostředí (stěry, voda) Genotypizace původce (HEV, HAV, NoV) Metodika • • Ovoce, zelenina, stěry Dle ISO/TS 15216 Akreditace Vepřové masné produkty, zvěřina • Akreditace Voda (pitná i užitková), „plody moře“ Příprava akreditace – tento rok Výskyt virových střevních onemocnění, hepatitidy A a E v ČR (EPIDAT) Výskyt hepatitidy A a hepatitidy E v ČR (EPIDAT) Alimentární patogeny na úrovni farem výsledky Farma Bakterie LM LM Salmone YE qPCR lla Viry HAV CS CS qPCR - F1 (H) - F2 (V) - F3 (P) - F4 (L) 0/15 0/10 1/5 0/5 0/15 0/10 0/5 0/5 0/15 0/10 0/5 0/5 0/0 0/0 0/0 0/0 1/15 1/10 0/5 0/5 Celkem 1/35 0/35 0/35 0/35 2/35 NoV Parazité CP GL Indikátor EC EC qPCR 1/15 0/10 0/5 0/5 0/15 0/10 0/5 0/5 0/15 0/10 0/5 0/5 0/15 0/10 0/5 0/5 0/15 0/10 0/5 0/5 0/15 0/10 0/5 0/5 9/15 7/10 1/5 5/5 1/35 0/35 0/35 0/35 0 /35 0/35 21/35 Mikrobiální kontaminace jahod nízká Alimentární patogeny na úrovni farem výsledky Bakterie LM LM YE qPCR CS CS qPCR Stěry - F1 (H) - F2 (V) - F3 (P) - F4 (L) 0/36 0/22 0/11 0/6 0/36 0/22 0/11 0/6 0/36 0/22 0/11 0/6 0/36 1/22 0/11 0/6 Voda - F1 (H) - F2 (V) - F3 (P) - F4 (L) 0/3 0/2 0/1 0/6 0/3 0/2 0/1 0/6 0/3 0/2 0/1 0/6 0/3 0/2 0/1 0/6 Farma Viry HAV NoV Parazité CP GL Indikátor EC EC multi EC qPCR 2/36 0/22 0/11 0/6 0/36 0/22 0/11 0/6 0/36 0/22 0/11 1/6 nd nd nd nd nd nd nd nd 0/36 0/22 0/11 0/6 2/36 0/22 0/11 0/6 8/36 1/22 0/11 3/6 0/3 0/2 0/1 0/6 0/3 0/2 0/1 0/6 0/3 0/2 0/1 0/6 nd nd nd nd nd nd nd nd 0/3 0/2 0/1 0/6 0/3 2/2 1/1 1/6 0/3 2/2 nd nd Noroviry - jeden vzorek stěrů toalet E. coli - 6 vzorků (ruce, toaleta, závlahová voda) Alimentární patogeny na úrovni tržní sítě výsledky Vzorek Bakterie LM LM Salmone YE qPCR lla CS CS qPCR Viry HAV NoV Parazité CP GL Indikátor EC EC qPCR Jahody 0/20 Ostatní 0/9 Mražené 0/8 0/20 0/9 0/8 0/20 0/9 0/8 0/20 0/20 0/9 0/9 0/8 0/8 3/20 0/9 3/8 0/20 0/9 0/8 0/20 0/9 0/8 1/20 0/9 0/8 0/20 0/9 0/8 0/20 2/9 0/8 11/20 6/9 7/8 Celkem 0/37 0/37 0/37 6/37 0/37 0/37 1/37 0/37 2/37 24/37 0/37 0/37 Mikrobiální kontaminace drobného ovoce nízká • Cryptosporidium parvum – jeden vzorek jahod • E. coli – 2 vzorky • nebyl pozorován významný rozdíl mezi ovocem z ČR a zahraničí Zelenina – ČR Vzorek Noroviry HAV Zelenina čerstvá - farmy 1/200 0/318 Zelenina čerstvá - obchod 4/345 0/20 Zelenina mražená 0/40 0/20 Voda 2/20 0/36 Stěry prostředí 0/64 0/64 Průkaz rodu Norovirus v dovezené zelenině (3 vzorky) Masné výrobky – ČR (prodejny, výrobní závody Vzorek Noroviry HAV HEV Masné výrobky nd nd 0/89 Mleté maso 4/100 0/100 1/100 Stěry prostředí 6/160 0/160 0/100 Průkaz rodu Norovirus ve stěrech z prostředí obchodů - prodej uzenin Virus hepatitidy E - prasata domácí (jatečná) Typ chovu Játra Žluč Trus Ekologický 2/113 (1,8 %) 8/112 2/113 Konvenční 4/150 (2,6 %) 5/150 0/150 Nizozemsko (6,5 %), Německo (4 %;), Itálie (6 %), Španělsko (3 %) (Di Bartolo et al., 2012; Wenzel et al., 2011; Bouwknegt et al., 2007) Virus hepatitidy E - zvěř volně žijící x obory Prase divoké Jelen lesní Daněk evropský Srnec obecný Muflon obecný 1 16/62 2/145 0/19 0/23 0/0 0/0 2 4/22 0/4 0/1 1/4 0/0 0/0 3 8/17 0/10 0/0 0/0 0/0 0/0 4 0/26 0/0 0/0 0/2 0/1 0/0 5 2/26 0/5 0/0 0/0 1/1 0/0 6 5/37 0/5 0/0 0/1 0/0 0/18 35/190 2/169 0/20 1/30 1/2 0/18 Jelen sika Volnost Celkem Obory A 14/63 0/0 0/36 0/0 2/15 0/0 B 39/91 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 C 0/0 0/0 0/0 0/0 2/22 0/0 D 8/106 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 Celkem 61/260 0/0 0/36 0/0 4/37 0/0 Jak předejít infekci viry z potravin? Zdravá a nekontaminovaná surovina (kontaminované suroviny nezměněné senzorické vlastnosti, infikovaná zvířata – nerozpoznatelná) Vaření (teplota v jádře potraviny) 100 oC / 5 min Omývání ovoce a zeleniny pitnou vodou (prověřený zdroj) Dodržování čistoty v kuchyních, aby nedošlo ke kontaminaci potravin, mléka, zeleniny při zpracování, skladování a distribuci potravin Zabránění manipulace s potravinami infikovaným osobám (nosič bez příznaků) Dodržování správné hygienické praxe při výrobě potravin (i osoby bez příznaků onemocnění mohou kontaminovat potraviny) Mražení viry nelikviduje, chlazení prodlužuje jejich přežívání, okyselení, tepelné opracování při mírných teplotách vede k malému snížení počtu virů !!! Farmy a zpracovatelé • Základ zdravá a nekontaminovaná surovina • Dodržování správné hygienické praxe při produkci a zpracování surovin/potravin sklizeň, zpracovávání, balení mytí a dezinfekce rukou, rukavice • Zabránění manipulace s potravinami infikovaným osobám • Použití prověřených zdrojů pitné vody závlaha, oplachy, zpracování možný problém voda „z vlastních zdrojů“ určená k oplachům – pravidelná kontrola • Zabránění vstupu divoké zvěře a domácích zvířat • Hnojení – vyzrálý hnůj Děkuji za pozornost Práce byla provedena s podporou grantů MZ (NT13884-4/2012), MZe (QJ a MV ČR (VG20102015011). Co nabízíme: • • • Konzultace Vyšetření vzorků (akreditované metody) Ovoce Zelenina Masné výrobky Vzorky od zvířat (sérum, trus játra, maso) Lidské vzorky (stolice a sérum) Voda Patogeny Virus hepatitidy A Virus hepatitidy E Noroviry Po domluvě i jiné viry Kontaktní údaje: Mgr. Petra Vašíčková, Ph.D. Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i. Oddělení Bezpečnost potravin a krmiv Pracovní skupina Virologie potravin Hudcova 70 Brno 621 00 -------------------------------------------------Tel.: +420 777 786 756 Fax: +420 541 211 229 -------------------------------------------------E-mail: [email protected] www.vri.cz