Diagnostika LB

Transkript

Diagnostika LB
Průkaz specifickédeoxyribonukleovékyseliny v diagnosticelymeskéborreliózy
HulínskáD.,VotýpkaJ.,
Serologic\ý průkaz
Diagnostikapůvodcelymeskéboneliózy (LB)je od popsríní
tétonemocia identifikacejejího
původceBorrelia burgdorfer'(BB) postavenana prukazuspecifickýchprotilátekmetodou
(ELISA) a protilátekpomocíimunoblotu(Westernblot).obězmíněnémetody
jsou v naší
laboratořiakreditovríny.Serologické
metodyjsou velmi přesné,standardizovény,obecně
přijatéa nejčastějivyužívanépři
prukazuLB.Výhodou metodje vysoká specifičnost,a
možnostpoměrnéhokvantitativníhostanoveníproti|átek.Zezasí|aného
materiáluje pozitivita
na|ezenav 14-50 % u Elisy av 23-26 oÁu imunoblofu. Vlastní prťkazprotilátekvšaknení
průkazemakutníhoonemocnění,
velmi častopotvrzujekontakts původcemonemocnění
nebo
prodělanéonemocnění.Vtomtosměrub:fo'áu někteých metodproblémemna|éú.
zce|a
negativnívzorky. Yýznan serologickýchmetod m:ůže
byt ovlivněn i stále se více
vyskytujícímiimunodeťrcientní
stavyr,yšetřovaných
pacientůa měnícíse antigennískladbou
genomospeciés
BB.Popsáníjednotliých serotypů,vícei méněpatogenních,
vnášídalší
problémydo serologickédiagnostiky.Problémem
je i odlišnostantigenův jednotliqých
oblastecha odlišnost,,divokých..a sbírkových-kultivovaných
kmenůpoužívaných
pro
přípravuantigenůdiagnosticsýchsouprav.Zde můžedochézetkrozdílůmve qýsledcích
laboratoří,kterépoužívají
diagnostickésoupravyod ruznýchv1irobců.Výsledek
by měl být
vždydoprovénen
sdělením'kÍery,místrrí,
nebo sbírkoqikmen byl použiti kdy a kde byl
kmen izolován.Využitímonoklonálníchlátek vznášído diagnostikydalšíproměnné,
a nemůŽe
odráůetměnící
se antigennívybavení,kterázpůsobujev určitém
regiónu onemocnění.
Kultivace a mikroskopiclry průkaz.
Přímý prtkaz BB je možnýpomocíkultivacev BSK mediu' mikroskopiív zástinu a pomocí
imunofluorescence'
imunoelektronopticky.Kultivacepůvodcenemocije obtížnápřiizolacích
ztěIníchtekutin,úspěšnější
je ztkáni. Nejlepšímzdrojempro kultivaci borrelií(BB) jsou
infikovanáklíšťata,
která obsahujídesetitisícespirochét.
optická mikroskopiev zástinu,
případnědoplněnáimunofluorescencí,se uplatňujejen při vyšetřování
vzorkůs větší
koncentracíborrelií.Výěžnějšíje již kombinaceelektronové
mikroskopie s koncentrací
vzorkůpomocícentrifuagacea imunosorbcedoplněnénegativnímbarvením.Tato
dnes
akreditovanámetodadokaže
jižprukaz těl bonelií,určení
druhu,identifikacičástitěl borrelií
(flagella)nebo,,pobytové
stopy..přítomnostiborreliíve formě cyst.DlouhodobáqitěŽnost
metodyje od 2 do 7 Yoze zaslanéhomateriálu.
Průkaz deoxyribonukleovélryseliny Borrelia burgďorferi
Btzy po zavedenípolymeriízové
řetězovéreakce(PCR,1988)'ale i velmi záhypo popsrání
původcelymeskéborreliózy (1982)zkoušelanašelaboratořv retrospektivní
studii moŽnost
příméhoprůkazuDNA v tkaňoqýchtekutinácha ve tkríních.Pro
nedostupnost
komerčních
setůpro prtkaz borrelióvéDNA muselijsme vyzkoušetřadu metodiki materiálů.Dozačátku
roku 1996jsme lyzkoušeli postuppro izolaci DNA,vybrali setyprimeru_ specifických
sekvencíz DNA chromozómuBorrelia burgdorferi.Vyzkoušeli
variacetermálníchprogramů
pro cyklery, zaved|ikontrolucitlivosti reakce.odtéhoždatajsme zaved|iparalelní
vyšetření
materiáluzasílaného
na vyšetřeníserologickéa elektronoptické
s vpžitím evidencevzorkůa
pomocíprogramuEPI INFO. Časemjsme definovalipodmínkypro
ýsledků vyšetření
správnýodběri zacházenís lyšetřovanýmmateriálemi způsobhodnocenízískaných
výsledků.Potěšilo
nás,kdyžjsme později zjistí|i,že
tatonašezávěryjsou v souhlase
s publikovanými pracemipředníchza}trantčních
pracovišť
v problematicelaboratorní
diagnostikylymeskéborreliózy.od roku 1996jsme vyšetřilipomocíPCR 18690vzorků
tělníchtekutina tkríní.(Viztabulkač.1)
Tabulka č'1:Počty lyšetřenóho materiálu v letech 1996.2003
Rok
vyšetření
1996
Počet
vyšetřených
Vzorků PCR
r43
r997
r998
1592
2446
2000
2001
2002
2003
2839
2548
2581
3186
18690
1999
Celkem
33s5
o vyšetření
metodouPCR zájem narůstaltak,žeod roku 2000 bylo nutnékaždýrok
omezovatpoěetvyšetření.Vedli
nás k tomujak pohnutkyekonomickéi technickói qfzkumný
zám&.omezili jsme především
počtyvyšetřené
k'rve.Zájemnásvedl k přednostnímu
vyšetření
mozkomíšního
moku,výpotkůa tkání.VýběrsekvenceDNA Z genomubakteriemá
rozhodujícíýznampro specifičnost
a citlivost reakcePCR Při srovniíní
primeru jsme měli
možnostvyzkoušetprimery odvozenéz genůgenomovéi plasmidovéDNA. Kriteriem pro
ýběr byla genetickástabilitavybranésekvence,specifiěnosta dostateěnácitlivost i při
jednokrokovéPCR. ffiz tabulkaě.2)
Tabulka č.2:Zkoušenéprimery pro průkaz DNA Borrelia burgdorferis.lato
označení primeru
Druh PCR
Autor a rok publikace
bb
Jednokrokové,i
nested
Jednokrokové i
nested
Nested
Rosa,P.A.,1991
Jednokrokové,
a sonda
Marconi,R.T.,1992
Jednokrokové'
a sonda
Marconi"R.T..1992
cc
bb-cc
LD
BB
Rosa.P.A..1991
Melchers.W..l99I
Z čehoje primer
odvozen
Klonovany fragment
genomu
Klonovaný fragment
genomu
Klonovaný fragment
genomu
165 rRNA
genom
165 rRNA
genom
BG
VS
WK1.WK2
F7,F2
P41
Jednokrokové'
a sonda
Marconi.R.T."1992
Jednokrokové,
a sonda
Marconi,R.T.,1992
Jednokrokové,
a sonda
Jednokrokové,
a sonda
Jednokrokové,
a sonda
Jednokrokové.
a sonda
Kruooger,W.H.,1991
165rRNA
genom
165rRNA
genom
Flagellin gen
Lebech.A.M..1991
Flagellin gen
Luft.B.J."1992
Jednokrokové,
a sonda
Luft.8.J.,1992
Gen P41 antigenu
flagellin
Gen P41 antigenu
flagellin
Gen 165rRNA
Adam,T.,1992
Gen 165 rRNA
OSPA
Jednokrokové,
a sonda
Nested
Luft.B.J.1995
OSPA L5,R5
Jednokroková,
a sonda
Manak,M.M.,1997
PlasmidováDNA
OSPA gen
OSPB
16S
BBUTP-BBURT
Luft,B.LI992
Plasmidová DNA,
OSPA sen
Specifičnost
primeru pouŽívaných
pro identifikacipůvodcelymeskéborreliózy nemusíbý
vždyjednoznačnájakjsme si ověřili testovánímpoužívaných
primeru s DNA z narostlé
kultury sbírkoqýchkmenůrťuných bakterií.(viz tabu|ka3)
Tabulka 3.: Specifita primerů používanýchpro identifikaci DNA Borrelia burgďorferi
sensu lato .Srovnání s DNA některých sbírkoých mikroorganismů.
IZo-LovANÁ
Sbírkový
mikrooragnismus
Bacillus cereus
DNA
Označení
kmene )*
Bc 8/78
C orynebacterium murium Cor 35170
Enterobacter aerogens
Ae I/43
Escherichia coli
EcKI4Il59
Klebsiella ozaenae
Klo 1/35
Micrococcus luteus
M 8/58
Proteus hauseri
PrK4157
Proteus morpanii
Prm ll37
Proteus mirabilis
Pnni26177
P seudomonas aerupinosa Ps 3 7 1 65
Serratia marcescens
Sr 20161
Staphylococcus aureus
Mau ll45
Pozitivita primerů při uvedenéteplotě
anilingu )**
LD LD OSPA VS BG
bb.cc
47 57 57
47 47
37t55
T
+
+
+
-J-
+
+
-r
+
t
Ť
T
Yersinia enterocolitica
Candida albicans
Borrelia burgdorferis.s.
Borrelia garinii
Borrelia afzelii
Y 1164
55/79
B31 )x
M 1 9 2) x
Kc90 )x
++
++
-t--t-
++
++
-r-T-
-r-r
++
++
++
!
++
TT
)*
CNCTC {zechoslovak National Collection of Type Cultures,SZÚ Praha
)x
Nrírodníreferenční
laboratořpro lymeskouborreliózu 'CEM,SZÚ Praha
)**
Uveden nánevprimerua teplotaannealing,druhého
kroku po|ymerénové
řetězové
reakce
Ze získanýchvýsledkůje zřejmé,Že k identifikacije nutnépoužítvždy
několik primerus
odlišnýmisekvencemi.Dáleje nutnédůsledněpoužívatupozitivníchvzorkůdalšíidentiťrkaci
produktu pomocídruhověspecifickéhybridizační
sondy,případně
restrikčníana|ýzunebo
sekvenciproduktu.Vtabulcenejsouuvedenyvšechnyzkoušené
organismyjejichžDNA byla
vyšetřenaspeciťrckými
primery pto Borrelia burgdorferi.Jednáseo následující
druhy:
Legionellapneumophila,Anaplasmaphagocytophilum,Human
herpesI simplexvirus,Human
herpes2 simplexvirus a Human herpes4 lymphocryptovirus,
Human herpes5
cytomegalovirusaDNA 30 izolátů blíženeidentifikovanýchbakterií,kterékontaminovaly
vzorky při kultivaci boneliív BSK mediu z lidskych i zvířecíchvzorků.Vyšetření
výše
uvedenýchdruhůDNA bylo při použitípollžívartých
primeru k prukazu agenslymeské
bonelliózy negativní.MnoŽství
primerupoužívaných
k identifikaciDNA Borrelia burgdorferi
sensulatoje od počátkupoužívéní
tétometodyvelkémnožství.
JednokrokováPCR
umožňujespolehlivěidentifikovat40-400fentogramů
DNA Borrelia burgdorferisensulato
v 1 mililitru tělnítekutinynebove vyšetřované
tkani. Při obsahu20 fentogramů
chromozomové
DNA v jednéburíceBB, můžeme
při ideálníchpodmínkáchptokazat2-21
spirochét.CitlivějšínestedPCR _ prokažei menšímnožství
DNA v materiálu.Zvyšovéni
citlivosti přinášívzrtsta1ící
riziko kontaminace.U nestedPCR dochazík manipulaci
s namnoŽeným
produktemanziko kontaminaceje již reálnéatatometodase neupouživápři
vyšetřovrání
většíhomnoŽstvívzorků.JednokrokováPCR bezpečně
odhalípatogenní
spirochetémie,
navícje možné
u nípoužívat
účinnou
ochranupřed kontaminací- systému
cÍlÍTy-over
prevence.Pro zqýšeníspecifityje možnLedále
použíthorky start.Přesto,Žepoěet
je úlymeskéborrelióry v těle velmi nízkýv porovnánís jinými bakteriálnímii
organismů
virovými původcionemocněnístačí
jednokrokováPCR prokrízatpůvodceBB v materiálu.
Yiztabulka 4.
Tabulka 4: Množstvíspirochétve vyšetřovaném
materiálu nemocného
jedince a
nejnižší
početpro úspěšnou
izolaci DNA(podle B.L.Schmidta (1))
Druh materiálu
Infikovanéklíště
Krevníplasma
Krevní plasma u pacientůs erythema
migrarrÁ
Moč
Výpotek kloubní
Mozkomíšnímok
Plná krev
Krevní sérum
Početspirochét
v materiálu
vml
4 500-55000/iedinci
Pod 50
Nejnižšípočet
spirochét
pro izolaci DNA v ml
4000
10
t0
Pod 50
50
5000-10000
r-20
Pod 50
Pod 50
?(10)
10
10
100
50
Výs1edky
Vybraný panel vyšetření
Výsledkempokusůa srovnánís dostatečným
počtemvyšetření
bylqýběr postupupři
vyšetření
vzorkůna přítomnostDNA původcelymeskéborreliózy.Byl tak vytvořenpanelpro
vyšetření,který
byl z většíčástipřevzatdo akreditované
metody.DNA se získáváz citrátové
krevníplasmy(krvinkyv EDTě rychle hemolysují),nativníhomozkomíšního
moku'nativďho
qipotku aztkání ve fuziologickémroiloku.Yzorky se nesmízmrazovatmimoumístění
tkáně
v tekutémdusíku.Seruma močse k vyšetření
nepoužívá.Tekutiny
se koncentrujícentrifugací
do 6000 g.K přípravěse používákomečních
kitůpro izolaci geonomové
DNA.Komerčně
vyraběný mix pro amplifikaci v systému horký start obsahuje l0 Yoternp|átllizo|ovaného
ze
vzotku,vyvéženémnožstvídvou páru primeru Jedna sada primeru je
odvozena z l6SrRNA
genu geonomovéDNA a druhá sadaz OSPA genu plastidovéDNA
Bonelia
burgdorferz.Rozpustidlemje qýhradně sterilní destilovaná voda pro parenterální
použítí,bez
pyrogenů.Reakční
směs o objemu nejméně25 mikrolitru je amplifiko vána v35 cyklech
programu v teplotnímprofilu pro multiplex PCR. 10 % produktu je použito
pro elektro forézu
v T,5 %oagarczovém ge|u zapřítomnosti velikostního DNA markeru.Po obarveníje
produkt
odečítanproti pozitivním a negativníkontrole,velikostnímu markeru . Pozitivní
vzorky jsou
verifikovríny hybridizací nebo sekvenací.
Yýsledky vyšetření materiálu podle druhu
Během retrospektivnístudie jsme měli možnost zptacovávatmateriál zasí|anýzoddělení
infekčních,neurologických, revmatologických a dermatologických, menšíčástvzorků i
z jinýchpracovišť.Většinazaslanýchvzorků byla od pacientůs chronickou LB.Akutní
případy jsme měli většinouz vlastních odběru, zřadpracovníků Státníhozdravotrrího
ústavu
velmi častos prokazatelným erythema migrans. Pruměrnéročníprocento pozitivity krevní
plasmy bylo 9,8 oÁ (8,9-12,ÍYov posledníchtřech letech).U mozkomíšníhomoku
bylo
průměrné procento 8,0 "Á (s rozptylem 4,4-12 % v jednotliqych letech).Nejvyššíprocento
pozitivních vzorků z pruměru posledních tří let bylo zjištěno u kloubních výpotků23,l%o(od'
I4,| do 36 Yo rcčníchpruměru).Poměrná pozitivita u jednotliých druhůodpovídá
qýsledkům jiných laboratoří používajících
diagnostiku PCR pro identifikaci DNA Borrelia
burgdorfer'.Nižšíprocento pozitivních vysledků u mozkomíšďho moku je dáno tím,že
zptacovávámepÍevážněvzorky z chronických, častojiž \éčenýchpřípadů.Vesledovaném
období jsme neměli možnostvyšetřit biopsie kůžezakutních případůs prťrkaznýmerythema
migrans, kde bywá pozitivitanejvyšší' nad 50 %.(2).
vyvoj procenta pozitivity během posledníchčtyřlet
o roku 1998jsme zjistili kolísrín
počtupozitivníchqfsledkův jednotlivýchletech.Počtyjsme
v^áhli k pocT vyšetřenýchvzorkůa dostalitak ročníprocentopozitivity vyšetření
v naší
laboratoři.od roku 1998narůstalo
procentopozitivity z IO na 17 Yov roce 2000.od tohoto
vrcholu docházíkminimu v roce 2003(7 %),letosji žv pwétřetinězaznamenáváme
mírný
niírustpočtupozitir,níchvzorků.(Viz graf č.1)
Graf č.1
Ročníprůměrpozltiviý PcR LB v procent.ech
18
--
16
\
./
14
\.
\
12
10
I
6
4
2
0
rok 1998
rok í999
rok2000
rok2001
rok2}O2
rok2003
rok2oo4
Při porormánípoměrného
počtuvyšetřenýchdruhůklinickéhomateriálu v posledníchletech
zjišt'ujemežepoětypozitivníchvzorků v krvi ztlstávajípraktickystejné,počty
pozitivních
kloubníchvýpotkuse rychle zvyšují.Naopakpočtypozitivďch mozkomíšních
mokůse
dlouhodoběsniŽují.Tomůžesouvisetse změnoupočtujednotliqich genospeciésBB ve
zkoumanýchoblastech. Niz grafč.2)
Graf č.2
Graf č.2
40
35
30
25
20
15
10
5
0
rok rok rok rok
2001 2002 2003 2A04
Při měsíčnímrozboru počtupozitivních vzorků během roku jsme pravidelně zjišťovalidvě
ročnímaxima. Jedno bylo na jďe,většinou v březnu aŽ květnu a pak na podzim v záňíaž
ffjnu. Několikrát nás překvapil vysoký početpozitivních vzorků v lednu někteých
roků.Situacese opakovala a tak jsme tomuto zjištěnívěnovali většípozornost.V jednotliých
letech od roku l998 jsme stanovili ročnípruměr pozitivity a ten porovnali s počtypozitivních
v měsíci lednu všech sledovaných let od roku 1998 do roku 2004.v letech 2OO0,200I a2OO3
jsme zjistili procento pozitivity v lednu vyššínežje pruměr pro celý rok. Přitom v letech 2001
a2003 byla tato odchylka velmi vyrazná.Yiz gtaf ě.3
Graf č.3
Lednové hodnoty pozitiviý v oÁa ročniprůměry
25
20
15
10
5
0
ffiffi %leden
.p*.p"1p".p.1.*"tpŤ
Zajíma|onás co ovlivnilo lednovó narusty pozitivity.Hledali jsme spojitost s oslabením
organismuběhemprobíhající
epidemie,nebo souvislosts wý,raznýmpodchlazením
organismu
a vývořenímpodmínekpro množení
bonelíí(rustovéoptimumje u BB 32-33C)v akrálních
částechtě14nebov podchlazenýchkloubech. Dalšípodezřeníbylo na užívání|éku
snižujících
obranyschopnost
organismu(krtikoidy q) aumožňující
vycestováníspirochétdo
tělníchtekutin.Sledovalijsme i moŽnost,Že
borrelieperzistující
v organismučlověka
prodělávajísvůjŽivotnícyklus a v určitýchobdobíse v organismupomnožíapŤipravítak
podmínkypro následnoumoŽnostopuštění
hostitelského
organismuv rrámcidalšíhoživotního
cyklu.
Lednovéodchylky pozitivníchýs|edků proti ročnímuprůměru
14
12
10
8
6
4
2
0
€
4
rok
í998
rok
't999
rok
2000
rok
2002
rok
2003
rok
2004
Citace:
1. Schmidt,B.L.,PCR in LaboratoryDiagnosisof HumanBorrelia burgdorferi
Infections,Clinical Mikrobiology Reviews,Ian.I 997,p.I 85-201
2. lnformacez EUCALB 1997-2004EuropeanUnion ConcertedAction on Lyme
Borreliosis
http:i/vie.dis.strath.ac.ulďvie/LymeEU/diagnosis_clinical-features-pcr.html

Podobné dokumenty

Plechový proletář Fiat 126/127

Plechový proletář Fiat 126/127 Simku Présidentie||e obdivovat na montja|inském zámku (Cháteaude Montja|in)'kde stojíved|eda|Ších speciálůdíve pouŽívanýchÍrancouzsktýmiprezidený.

Více

1972.

1972. 4sek uspĚŠně absolvo v8li. Úspésné-9konči1i přes nepřízeň poěasí zin&í prústup tradov]i;fií dolinkalri kteřý byl uskutečněn v polovině května. ' Jsltc uspořádalj. zájezd aa !4r.yho chatu. opšt ná5 ...

Více

CHORUS Legionella pneumophila IgG

CHORUS Legionella pneumophila IgG  Použití silně hemolytických vzorků nebo vzorků s mikrobiální kontaminací může vést k nereprodukovatelným výsledkům.  Než vložíte jednorázový test do přístroje, zkontrolujte, že reakční jamka neo...

Více

ODBĚRY VZORKŮ

ODBĚRY VZORKŮ odebírá cca 500 µl tekuté nebo polotuhé stolice nebo cca 1g (tj. asi velikost lískového oříšku) tuhé stolice. Nevhodně odebrané vzorky: Vodnatá, průjmová stolice, stolice v transportním mediu, odbě...

Více

Rozbory pitné vody v obcích Lhota a Vlasenice ze - Lhota

Rozbory pitné vody v obcích Lhota a Vlasenice ze - Lhota < - y^ledek pod mez detekce, > - rist€dekj€ ryJSi nez uvedend hodnota Vysledky se rykaji pouze zkousentch vzorki Bez pisemndho souhlasu laboratoie se desmi protokol reprodukovatjinak nez ce1i. uved...

Více