Závěrečná zpráva o řešení výzkumného záměru

Transkript

Masarykova univerzita v Brně
Přírodovědecká fakulta
ZÁVĚREČNÁ
ZPRÁVA O ŘEŠENÍ VÝZKUMNÉHO ZÁMĚRU
„GENOMY A JEJICH FUNKCE“ MSM 143100008
za léta 1999 až 2004
řešitel: prof. RNDr. Jiřina Relichová, CSc.
2
Závěrečná zpráva o řešení výzkumného záměru
Identifikační kód
Název výzkumného záměru
Příjemce
Vykonavatel
Řešitel
Doba řešení
MSM 143100008
Genomy a jejich funkce
Masarykova univerzita v Brně
Přírodovědecká fakulta
Prof. RNDr. Jiřina Relichová, CSc.
1. 1. 1999 – 31. 12. 2004
1. Předpokládané cíle řešení výzkumného záměru
1.1. Cíle řešení výzkumného záměru v letech 1999-2003, strategie jejich dosažení a
předpokládané výsledky
Obecným cílem je studium struktury genomu ve vztahu k normální a patologické funkci genů a úloha
nekódujících oblastí genomu u zástupců hlavních skupin organizmů.
V části týkající se bakteriálního genomu budou studovány genomy patogenních druhů se záměrem praktického
využití jejich molekulární identifikace v diagnostice. U rostlin bude výzkum zaměřen na přiřazování biologické
funkce jednotlivým známým i nově izolovaným genům metodami funkční genomiky včetně reverzní genetiky u
modelové rostliny Arabidopsis thaliana. U živočichů a člověka jde o analýzu funkce cizích genů a jejich
regulačních mechanizmů v procesech maligního bujení na buněčné úrovni, dále o funkce cizích částí genomů na
organizmální úrovni po transgenozi u Drosophila melanogaster a detekci patologických stavů vlivem
chromozomových mutací u člověka. Výzkum nekódujících oblastí genomu bude zaměřen na molekulární analýzu
a význam důležité genomové domény eukaryotických chromozomů – telomer.
Konkretizace cílů:
Problematika 1. Garant: doc. RNDr. Jiří Doškař, CSc.
U bakterií bude výzkum orientován na zpřesnění identifikace patogenních a klinicky významných druhů
molekulární analýzou jejich DNA (především rod Staphylococcus a později i dalších bakteriálních druhů).
Výsledky tohoto studia budou využity při diagnostice patogenních druhů přípravou molekulárních sond. Výzkum
bude orientován zejména na rychlou a spolehlivou diagnostiku a typizaci klinicky významných druhů r.
Staphylococcus, zejména multirezistentních kmenů S. aureus, a dále na koaguláza-negativní stafylokoky, které se
vyskytují ve stále větší míře v humánním klinickém materiálu jako infekční agens. Výsledky analýzy budou
korelovány se standardními fenotypovými testy. Výsledky výzkumu mají přímé praktické využití, např.
identifikace původce stafylokokových nozokomiálních infekcí přispěje k jejich léčbě a prevenci, neboť zejména
mnohonásobně rezistentní kmeny podle stávajících prognóz představují a budou i nadáte představovat v
celosvětovém měřítku velmi závažný zdravotnický problém. Podobně budou identifikovány pomocí druhově
specifických primerů genomy patogenních spirochet u zástupců hematofágních členovců na území ČR, především
z čeledi Ixodidae, Simuliidae, Ceratopogonidae a Culicidae. Monitorování výskytu a molekulární charakteristika
této skupiny patogenů přispěje ke zdravotní ochraně obyvatelstva.
Při řešení VZ se počítá s úzkou spoluprací jak s tuzemskými tak i zahraničními pracovišti (Česká sbírka
mikroorganismů PřF MU v Brně, Národní Referenční laboratoř pro stafylokoky v Praze, Univerzita v Tübingenu,
Univerzita ve Vídni aj.).
Časový postup:
1999-2000: Shromáždění a otestování souboru terénních a sbírkových kmenů jednotlivých druhů r.
Staphylococcus, stanovení jejich fenotypových charakteristik (biotypizace, fagotypizace). Postupný odchyt
hematofágních členovců na jednotlivých lokalitách ČR, izolace spirochet z různých vektorů a srovnání jejich
genomu pomocí PCR, analýza spirochetálních proteinů pomocí metody PAGE.
2000-2001: Analýza genomu vybraných kmenů reprezentujících jednotlivé druhy pomocí kvantitativní restrikční
analýzy a PCR. Analýza obsahu plazmidů u kmenů rezistentních k antibiotikům. Výsledkem bude stanovení
genotypové variability kmenů jednotlivých druhů a charakterizace faktorů, které ji podmiňují.
Analýza genomu spirochet restrikční analýzou a stanovení jejich genetické příbuznosti, sledování odlišnosti
proteinů u jednotlivých pasáží izolovaných kmenů spirochet (studium antigenních změn).
2001-2002: Vyhledání sekvencí specifických pro jednotlivé druhy a jejich charakterizace. Příprava molekulárních
sond z těchto sekvencí a jejich využití k určení kmenů jednotlivých druhů. Identifikace jednotlivých Ag struktur
3
zodpovědných za patogenitu spirochet.
2002-2003: Vymezení a prověření metodických kriterií pro molekulární identifikaci klinicky významných druhů
bakterií (zejména stafylokoků). Určení jednotlivých druhů spirochet na základě detekce specifických genů.
Vypracování metodických pokynů pro aplikaci molekulárně-biologických postupů pro monitorování
bakteriálních původců nozokomiálních infekcí a alimentárních intoxikací.
Vypracování podkladů pro zlepšení vzdělávacího procesu a provádění proškolení externích pracovníků z
klinických zařízení a výzkumných ústavů. Předpokládá se, že pracoviště katedry by mohlo plnit funkci školícího
centra v tomto oboru.
Do konce roku 1999 se řešená problematika částečně překrývá s projektem GAČR 301/97/1192.
Problematika 2. Garant: RNDr. Břetislav Brzobohatý, CSc.
U rostlin bude funkční analýza genomu zaměřena na identifikaci genů účastnících se klíčových regulačních a
metabolických procesů růstu a diferenciace rostlin analýzou příslušných sekvencí genomu modelové rostliny
Arabidopsis thaliana. Dlouhodobým cílem této oblasti výzkumného záměru je přispět k porozumění molekulární
podstaty kontroly růstových a diferenciačních procesů u rostlin na komplexní úrovni propojující fyziologii a
genetiku rostlin. Dosažení vytyčeného cíle bude zahrnovat (i) vyhledávání genů kódujících proteiny se
strukturními charakteristikami typickými pro regulační proteiny a proteiny účastnící se klíčových metabolických
procesů systematickou analýzou příslušných sekvencí genomu Arabidopsis thaliana a dalších modelových
organizmů, (ii) následnou molekulární charakterizaci identifikovaných proteinů s cílem předpovědi jejich
biologických funkcí a (iii) průkaz předpovězených funkcí na organizmální úrovni přístupy reverzní i klasické
genetiky. Bude k tomu využito nejen kolekce mutantních genotypů získané v minulých letech na pracovišti
genetiky PřF klasickou mutagenezí, ale především bude využito možností, které se nabízejí u T-DNA inzerčních
mutantů, tj. lokalizace, izolace a charakterizace genů, zodpovědných za konkrétní funkce v rostlinách. Získané
poznatky budou sloužit jako základ pro experimentální vyhodnocení potenciálu kontrolované ektopické exprese
odpovídajících genů a jejich rekombinantních derivátů pro cílené modifikace vlastností a reakcí rostlin.
Etapy:
Průběžně. Postupné vyhledávání genů kódujících proteiny se strukturními charakteristikami typickými pro
regulační proteiny a proteiny účastnící se klíčových metabolických procesů. Průběh této etapy závisí na rychlosti
uvolňování sekvencí získaných sekvencováním genomu Arabidopsis thaliana a dalších organizmů do veřejně
přístupných databází. Studium vztahu mezi strukturou a funkcí vybraných klíčových proteinů metabolizmu a
signálních drah u rostlin. Řešení navazuje a částečně se překrývá s grantovými projekty ES, INCO-Copernicus,
No. PL966135 a v r. 1999 GAČR 204/97/0154. U ostatních řešených grantových projektů úkoly navazují na jejich
výsledky.
Do r. 2000. studium vlivu řízené ektopické exprese vybraných genů kódujících proteiny klíčového významu v
metabolizmu a regulačních procesech rostlin na vývoj a fyziologické charakteristiky rostlin. Lokalizace některých
těchto genů na chromozomy A. thaliana metodami klasické a molekulární rekombinační analýzy. Vytvoření
předpokladů pro aplikaci funkční genomiky pro jednoznačné přiřazování biologických funkcí vybraným
regulačním genům..
Do r. 2003. Jednoznačné určení biologické funkce vybraných genů metodami funkční genomiky. Studium
možností využití regulovatelné ektopické exprese vybraných regulačních genů k cíleným modifikacím vlastností
rostlin.
Problematika 3. Garant: doc. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
U živočichů a člověka bude výzkum orientován na analýzu funkce cizorodých genů, jednak na buněčné, jednak
na organizmální úrovni a na detekci patologických stavů v genomu člověka. Smyslem výzkumu na buněčné
úrovni je získat původní poznatky o regulačních mechanizmech určujících proliferaci, diferenciaci a smrt
živočišných a lidských buněk. Exprese cizích genů na organizmální úrovni bude studována u modelového
organizmu Drosophila melanogaster po transgenozi. U člověka je hlavním záměrem rozvoj nových metod
detekce strukturních poruch genomu na úrovni sekvencí, genů a chromozomů. Bude studována korelace mezi
ztrátou, zmnožením a přemístěním genetického materiálu a variabilitou fenotypových projevů specifických
patologických stavů u člověka vedoucích ke vzniku vrozených vývojových vad a nádorových onemocnění
metodami molekulární cytogenetiky.
Tato část výzkumného záměru si klade za cíl prozkoumat funkci některých klíčových buněčných regulačních
proteinů v leukemických buněčných liniích a to především z hlediska jejich potenciálních protinádorových
účinků. Strategie je založena na přenosu relevantních genů (resp. cDNA) do vybraných leukemických linií, jejich
cílené expresi a analýze důsledků jejich přítomnosti na morfologii a další znaky buněk. Sledována bude
především proliferační aktivita, diferenciace a apoptóza. Mezi regulátory, které chceme tímto způsobem
prozkoumat patří např. regulační proteiny Fos, Jun, RAR, RXR, Myb, Bcl-2, CBP, atd. Většina těchto faktorů
realizuje svou funkci v buněčném jádře a jejich propojení s mimobuněčným prostorem je zajištěno důležitými
signálními kaskádami. V rámci tohoto záměru chceme výzkum orientovat k bližšímu poznání těchto signálních
4
drah. Konkrétně se budeme zabývat úlohou vysoce nenasycených mastných kyselin (zejména kyseliny
arachidonové a jejich metabolitů - eikosanoidů) v přenosu signálů cytokinů TNF- a TGF . Tato problematika
navazuje a dále rozvíjí grantové projekty GAČR, které v minulých letech byly a dosud jsou řešeny. Odlišuje se
od nich tím, že experimenty v rámci výzkumného záměru chceme realizovat na odlišném modelovém systému,
než který jsme používali dosud. Naším hlavním modelovým systémem se stanou lidské leukemické buňky,
především lidská leukemická linie HL-60. Naší snahou je dosáhnout takových výsledků, které by byly relevantní
pro lidskou medicínu. Zaměříme se též na použití metod molekulární cytogenetiky pro studium přímé korelace
mezi výskytem primárních chromozomálních změn a typem nádorového onemocnění, které slouží ke zpřesnění
diagnózy nádorového onemocnění, volbě způsobu léčby i kontrole její účinnosti. Ve spolupráci s Oddělením
lékařské genetiky FN v Brně se zaměříme na detekci genetických změn na úrovni chromozomů v interfázních
buňkách lidských solidních nádorů. Budou rozpracovány nové techniky FISH, které umožňují pomocí DNA
sond detekci buněčných klonů obsahujících amplifikované onkogeny (např. N myc onkogen u neuroblastomu),
aneuploidní sestavy chromozomů či specifické delece a translokace chromozomů.
V rámci tohoto záměru budeme také rozvíjet program založený na využití transgenních organizmů. V naší
laboratoři již využíváme kmeny transgenních Drosophila melanogaster nesoucích některé lidské geny pro
metabolizační enzymy, k testům genotoxicity čistých chemických látek i vzorků prostředí. Takovéto využití
transgenních drozofil se ukázalo jako velmi slibné, neboť se tím zvýšila výpovědní hodnota testování
genotoxicity vzhledem k člověku. Proto byly tyto testy navrženy do nově se formulující legislativy ČR v oblasti
ekotoxikologie. Záměrem návrhu je průběžná molekulárně genetická analýza lidských transgenů (CYP 2E1, CYP
2D6, glutathionS-transferáza) v hostitelském organizmu Drosophila melanogaster na úrovni DNA a RNA.
Výsledky posledních experimentů v naší laboratoři naznačují, že při využívání transgenních kmenů drozofil po
dobu přesahující pět roků došlo v některých ojedinělých případech ke spontánní změně původní sekvence
lidského genu. Vedle průběžného sledování úrovně, příčin a časových závislostí možné změny struktury
transgenu bude sledován také vliv testovaných substancí (mutagenů) na možnou indukci mutací přímo v
začleněném transgenu. Vzhledem k tomu, že test na somatické mutace a rekombinace, který v naší laboratoři
používáme, odpovídá spíše chronickému působení mutagenu (expozice asi 72 hodin) a může tudíž vyvolávat
změny na úrovni transgenu, bude jako praktický výstup této částí problematiky stanovena průměrná doba, po
kterou je možné test na transgenních kmenech využívat, aniž by byla ovlivněna aktivita enzymů exprimovaných
lidských transgenů.
1999-2000: Příprava expresních vektorů pro nadprodukci studovaných proteinů v transfekovaných leukemických
buňkách. Konkrétně budou cDNA kódující proteiny c-Fos, c-Jun, v-Fos, v-Jun, Bcl-2, RXR , CBP začleněny
pod kontrolu inducibilního promotoru odvozeného od lidského genu pro metallothionein v plazmidu pMT-IRESCD4 a to v orientaci "sense“ i "anti-sense“. Kontrola správnosti provedených genových manipulací restrikční
analýzou a testy inducibilní exprese daných genů v přechodně transfekovaných fibroblastech.
Analýza spontánních mutací lidských transgenů (CYP 2E1, CYP 2D6, glutathion S-transferáza) v hostitelském
organizmu Drosophila melanogaster na úrovni DNA.
Rozpracování nových postupů techniky FISH umožňujících detekci genetických změn na úrovni chromozomů
v interfázních buňkách lidských solidních nádorů v závislosti na typu nádoru a způsobu zpracování. Konkrétně
budou ověřovány postupy vykazující vysokou účinnost hybridizace na zamražených nádorech, formalínem
fixovaných nádorech a parafínových řezech.
Jedná se o úkoly, které se částečně překrývají s cíli projektu GAČR 312/98/0679.
2000-2002: Transfekce buněk lidské leukemické linie HL-60 výše uvedenými plazmidy elektroporací nebo
lipofekcí, identifikace a selekce stabilních transfektantů a jejich klonování. Testy exprese exogenních genů
imunoblotingem a western blotingem.
Molekulárně cytogenetická detekce specifických genetických změn v solidních nádorech vztahujících se
k patogenezi nádorového onemocnění (amplifikované onkogeny, aneuploidní sestavy chromozomů či specifické
delece a translokace chromozomů), vyvození závěrů o možnosti zpřesnění diagnózy, studium korelace mezi
cytogenetickými nálezy a stádiem choroby, kontrola účinnosti léčby.
Jedná se o původní problematiku, která se nepřekrývá se žádným z dosud řešených grantových projektů.
2002-2004: Charakterizace získaných stabilních transfektantů. Analýza důsledků nadprodukce proteinů v-Fos, cFos, v-Jun, c-Jun, Bcl-2, RXRα, CBP na diferenciaci, proliferaci a apoptózu buněk HL-60. Paralelně budou
studovány důsledky exprese obráceně orientovaných genů, které by tvorbou anti-sense RNA měly blokovat
tvorbu produktů endogenních genů fos, jun, bcl-2, RXRα, CBP. Ze srovnání fenotypových důsledků exprese
zmíněných genů budou vyvozeny závěry o jejich funkcích. U variant buněk HL-60 exprimujících v-fos, resp. cfos a v-jun, resp. c-jun budou vyvozeny závěry o funkčních odlišnostech virových a buněčných forem jejich
produktů. U všech získaných variant linie HL-60 bude studována úloha vysoce nenasycených mastných kyselin
(především kyseliny arachidonové a eikosanoidů) v přenosu signálů TNF- a TNF- . Ze srovnání informací
získaných na jednotlivých typech buněk budou vyvozeny závěry o způsobu propojení cytoplazmatických
signálních drah s jadernými.
5
Sledování indukovaných mutací transgenů při expozici jednotlivých genů drozofil testovaným substancím a
stanovení průměrné doby spolehlivého použití testu s ohledem na nestabiltu transgenů.
Získání nových typů DNA sond umožňujících detekci specifických genetických změn v nádorových buňkách,
detekce komplexních přestaveb chromozomů v nádorových buňkách, zavedení techniky vícebarevné FISH
(mFISH) s konkrétními dopady pro nádorovou cytogenetiku.
Jedná se o původní problematiku, která se nepřekrývá se žádným z dosud řešených grantových projektů.
Problematika 4. Garant: RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Samostatnou část tvoří výzkum nekódujících oblastí genomů. Tyto sekvence tvoří zpravidla většinu celkové
délky eukaryotických genomů. Fakt, že nekódují sekvenci proteinů nebo RNA, přitom zdaleka neznamená, že jde
o oblasti málo významné z hlediska funkce genomu. Např. všechny tři základní známé funkční elementy
eukaryotických chromozomů - centromery, počátky replikace a telomery – jsou tvořeny nukleoproteinovými
komplexy, jejichž složkou DNA není kódující sekvence. Posledně jmenovaná genomová doména, telomera a její
metabolizmus, je dominantním objektem práce na této části záměru. Bude provedena charakterizace
nukleotidových sekvencí tvořících ve spojení se specifickými proteiny telomery a subtelomery eukaryotických
chromozomů a bude analyzována mikrostruktura konců rostlinných telomer. Dále bude provedena charkterizace
vlastností rostlinné telomerázy, zjištěna její tkáňová specifita a závislost na diferenciačním stavu buňky.
Předmětem zájmu bude také podjednotkové složení komplexu telomerázy - nukleotidová sekvence RNA složky,
charakterizace proteinových podjednotek telomerázy a jejich interakce.
1999-2001. Charakterizace podjednotkového složení nukleoproteinového komplexu rostlinné telomerázy:
izolace RNA složky a stanovení její nukleotidové sekvence, izolace proteinové podjednotky s aktivitou reverzní
transkriptázy a příprava klonování její cDNA.
Jde o úkoly částečně se překrývající s cíli projektu MŠMT VS97032, v případě proteinové podjednotky
telomerázy se jedná o rozšíření původních cílů.
1999-2000. Stanovení mikrostruktury konců rostlinných chromozómů: určení délky a kvantitativního zastoupení
jednovláknových přesahů telomerové DNA, sekvenční charakterizace dalších spojovníků mezi telomerou a
centromerou (potenciální chromozom-specifické sondy).
Jedná se o cíle stanovené v rámci projektu MŠMT VS97032 specificky rozšířené o podrobnou analýzu
jednovláknových přesahů.
2000-2003. Izolace a charakterizace proteinů s vazebnou afinitou k telomerám v jejich specifických strukturních
stavech (jednovláknový G-řetězec a C-řetězec, dvojvláknová DNA, tetraplexní forma G-řetězce). Lokalizace
nalezených proteinů in situ.
Původní cíl projektu VS97032 je v tomto bodě rozšířen o bližší charakterizaci vazebných proteinů, přípravu
specifických protilátek a jejich využití k imunocytochemické lokalizaci.
2001-2003. Exprese rekombinantní katalytické podjednotky telomerázy a její charakterizace. Charakterizace
expresního profilu této podjednotky a RNA podjednotky u modelové rostliny.
Není překryv s VS97032, pouze návaznost na dosažené výsledky.
Perspektivní získání knockout mutantů ve vztahu k telomerázovým podjednotkám a vazebným proteinům,
konstrukce transgenních rostlin exprimujících mutantní formy rekombinantních komponent telomerázy, event.
vazebných proteinů pro studium jejich funkce in vivo.
Úkol bude řešen ve spolupráci s LMFR od r. 2002, ale do r. 2003 zřejmě nebude ukončen, a proto tento úkol
není v pravém slova smyslu kontrolovanou etapou předkládaného záměru, ale spíše naznačuje jeho další
směřování.
Předpokládané výsledky a způsob jejich prezentace
Výsledky výzkumu celého VZ budou každoročně prezentovány obhájenými diplomovými pracemi, úspěšně
zakončeným rigorózním řízením studentů PGS, publikovány v podobě původních vědeckých prací v
mezinárodních vědeckých časopisech a na konferencích.
U problematiky 1 bude zpřesněna diagnostika a typizace bakteriálních patogenů a budou připraveny molekulární
sondy a specifické primery pro identifikaci bakteriálních patogenů (zejména stafylokoků a borelií). Výsledky
významně přispějí k účinné léčbě a k prevenci bakteriálních infekcí, které představují a podle stávajících
prognóz budou nadále představovat v celosvětovém měřítku velmi závažný zdravotnický problém.
U problematiky 2 získané výsledky přispějí k porozumění vztahu mezi metabolizmem a účinkem fytohormonu
cytokininu, k porozumění jeho signálních drah a jeho role na faktory vnějšího prostředí. Lokalizace některých
genů na chromozom přispěje k saturaci genové mapy Arabidopsis.
U problematiky 3 budou učiněny závěry o významu proteinů Fos, Jun, Bcl-2, RXRα a CBP v protinádorových
procesech a způsobu jejich funkčního propojení s cytoplazmatickými signálními drahami řízenými metabolity
kyseliny arachidonové a eikosanoidy. Navíc budou učiněny závěry o odlišnostech účinků onkoproteinů v-Fos a
v-Jun od jejich buněčných prekurzorů c-Fos a c-Jun.
U problematiky 4 budou získané klony v expresních vektorech použity k získání informací o mechanismech
6
regulace exprese telomerázy v procesech ontogeneze a při navození senescence nebo buněčné nesmrtelnosti. Pro
tento typ studia představují rostlinné buňky jedinečný model a výsledky na něm získané mohou napomoci
objasnění těchto mechanismů i v případě lidských buněk.
1.2. Cíle řešení výzkumného záměru v roce 2004 a předpokládané výsledky
Genom bakterií
•
•
•
Bude dokončena příprava souboru molekulárních sond pro detekci specifických genů a genomových
sekvencí, využitelných pro molekulární diagnostiku patogenních stafylokoků a jejich virů. Přednostně
budou tyto sondy odvozeny z genů a sekvencí zodpovědných za virulenci kmenů, tvorbu toxinů a rezistenci
k antibiotikům. Předpokládáme, že s využitím sady připravených sond (resp. PCR primerů) bude možné
provést jak druhovou identifikaci, tak i diferenciaci přirozeně se vyskytujících kmenů. Výstupem řešení této
problematiky by mělo být zavedení nové genotypizační metody do klinické praxe, kde by měla najít
uplatnění zejména při epidemiologických studiích patogenních stafylokoků. Studium rezidentních fágů
významně přispěje k objasnění jejich vlivu na genetické vlastnosti a virulenci toxinogenních kmenů S.
aureus.
Hlavním cílem studia genomu polyvalentních fágů bude objasnit, do jaké míry je jejich lytická aktivita a
rozmezí hostitele ovlivňováno genetickou konstitucí lytických genů. V řešení této problematiky bude
využito srovnání příslušných genů jednotlivých fágových kmenů v korelaci s analýzou jejich proteomu
včetně přímé detekce enzymových aktivit v expresních systémech in vitro. Splnění těchto cílů by mělo
podstatnou měrou přispět k objasnění molekulárního základu polyvalence těchto fágů, který je zatím
neznámý, a tím k racionalizaci fágové terapie jako perspektivní metody léčby stafylokokových infekcí.
Výsledkem studia genomu spirochet bude dosažení možnosti geneticky charakterizovat kmeny borrelií
získaných z různých zdrojů (živočichů) na území ČR a porovnání těchto výsledků s údaji o kmenech
vyskytujících se v Evropě a ve světě, hlavně v USA. Práce tohoto rozsahu je v rámci celé ČR dosud
ojedinělá. Očekává se též alespoň částečné určení antigenních složek zodpovědných za vyvolání reakce
imunitního systému, jež by mohla vést ke vzniku komplikací doprovázejích onemocnění Lymeská
borrelióza.
Genom rostlin
• Bude dokončena první etapa studia funkční architektury aktivního centra β-glukozidázy Zm-p60.1 v oblasti
analýzy molekulární determinace substrátové specificity.
• Bude dokončen vývoj a základní charakterizace pOp/LhGR systému indukovatelné exprese transgenu ipt u
Arabidopsis thaliana a Nicotiana tabacum.
• Bude dokončena analýza fenotypových projevů inzerčních mutací v genech ARR4 a ARR21 u Arabidopsis
thaliana.
• Metody analýzy proteomu Arabidopsis thaliana budou využívány pro studium role cytokininů v regulaci
vývoje rostlin. Bude dokončena první databáze zachycující změny proteomu Arabidopsis thaliana
v odpovědi na změny hladin cytokininů.
• S perspektivním cílem sekvenční analýzy studovaných genů budou identifikovány nové DNA markery
v těsné vazbě.
• Bude dokončena identifikace modifikátorových genů pozdního kvetení u pozdně kvetoucích mutantů A.
thaliana. U přírodních pozdních populací bude cílem nalézt a charakterizovat konkrétní gen pozdnosti.
Nadále bude rozvíjena činnost Centrální laboratoře speciálních technik molekulární biologie MU, která přispěje
k realizaci řady projektů MU a jiných subjektů v oblasti genomiky a proteomiky.
Pracoviště se bude podílet na činnosti proteomické laboratoře MU na PřF MU.
Genom živočichů
V roce 2004 plánujeme pokračovat v řešení jednotlivých částí projektu zaměřených na výzkum genomu
živočichů a člověka takto:
•
Budeme studovat význam nádorového supresoru p53 pro modifikaci funkce onkoproteinu v-Myb
v leukemických buňkách se zaměřením na celkové změny proteomu vyvolané přítomností p53 a dalších
7
transgenů v monoblastech transformovaných onkogenem v-myb. Práce by měla přispět jednak k objasnění
molekulárního mechanismu funkční interakce v-Myb-p53 a jednak k pochopení podstaty anti-leukemického
působení některých transgenů, které jsme popsali v předchozích letech řešení projektu.
•
Máme v úmyslu použít techniky PCR, SSCP, TGGE a sekvencování DNA, které jsme zvládli na
modelovém systému D. melanogaster, pro detekci mutací v lidském genomu. Konkrétně se v roce 2004
zaměříme na sledováním změn v genech SCN5A, KCNE2 a KCNJ2, spojených se syndromem
prodlouženého QT intervalu (LQTS). Molekulárně genetická analýza mutací v těchto genech je důležitým
nástrojem diagnostiky tohoto onemocnění.
•
V návaznosti na výsledky dosažené v předchozím období bude další výzkum zaměřen na charakterizaci
prognosticky významných genetických změn u kultivovaných solidních nádorů, u nichž jsou genetické
odchylky v porovnání s hematologickými malignitami málo známé. Tato etapa bude dále směrována k
rozpracování technologie DNA-mikročipů, pomocí nichž by bylo možno studovat přestavby genů a změny
genové exprese typické pro jednotlivé nádory.
Nekódující oblasti genomu
• Telomer-vazebné proteiny
Na základě výsledků analýzy telomer-vazebných proteinů (výstupem za rok 2003 by měla být parciální
sekvence proteinů získaná pomocí MS) bude hledána kompletní kódující sekvence a ta bude následně
klonována do expresního vektoru pro analýzu vazebných vlastností a účinku na aktivitu telomerázy in vitro
pomocí retardace v gelu nebo plazmonové rezonance.
•
Výzkum alternativních telomer
Sekvence DNA, které budou identifikovány jako funkční alternativní telomery budou analyzovány po
stránce chromatinové struktury. Dále budou vyhledávány proteiny specificky se vážící k těmto sekvencím a
tyto proteiny analyzovány s cílem zjistit, zda se jedná o varianty původních telomer-vazebných proteinů
(před ztrátou typických telomer), nebo o jiné proteiny, které zřejmě získaly novou funkci. Tento výzkum by
měl testovat hypotézu, podle níž mezi telomerovou DNA a jejími vazebnými proteiny dochází během
evoluce k procesu rychlé adaptace pod silným selekčním tlakem, který představuje požadavek na funkčnost
telomer. Bylo totiž ukázáno, že evoluce centromerové DNA a jejích specifických vazebných proteinů zřejmě
tímto způsobem probíhá.
•
Proteiny interagující s telomerázou
Výstupy ze sekvenční analýzy klonů, které vzešly z dvojhybridního screenu na proteiny interagující
s telomerázou (v rámci kompletní cDNA knihovny Arabidopsis thaliana) budou analyzovány in silico a
následně vytipované geny budou klonovány do expresních vektorů pro analýzu vazebných vlastností a
možného regulačního vlivu na aktivitu telomerázy in vitro.
• Vývoj diagnostických technik
Budou testovány a zaváděny další diagnostické techniky pro onkologii a pediatrii, založené na dostupných
metodických přístupech a jejich vhodné kombinaci (PFGE, RQ-RT-PCR, fibre-FISH DNA, MALDI-TOF).
8
2. Dosažené cíle a uplatněné výsledky
2.1. Splnění cílů řešení
Genom bakterií (garant: prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc.)
A. Identifikace patogenních a klinicky významných druhů stafylokoků a příbuzných
druhů molekulární analýzou jejich DNA
1. Příprava molekulární sondy a zavedení metody PCR pro identifikaci kmenů druhu
Staphylococcus aureus
Většina genotypových metod používaných v současné době k diagnostice patogenních
stafylokoků je vhodná pro typizaci kmenů daného druhu, ne však pro identifikaci jednotlivých
druhů. Z tohoto důvodu byla pozornost zaměřena na přípravu molekulární sondy specifické
pro S. aureus jako nejvýznamnějšího patogenního druhu stafylokoků. Makrorestrikční
srovnávací analýzou genomu reprezentativního souboru sbírkových a klinických kmenů S.
aureus byly identifikovány dosud nepopsané sekvence DNA charakteristické pro tento druh,
které se staly základem pro přípravu specifické hybridizační molekulární sondy pro
identifikaci kmenů druhu S. aureus. Jako specifická pro S. aureus se ukázala 2 kb sonda
odvozená z 44 kb SmaI restrikčního fragmentu genomové DNA, což se ověřilo hybridizací
s DNA 43 dostupných druhů a poddruhů rodu Staphylococcus. Následně byly z nukleotidové
sekvence sondy navrženy primery pro rychlou detekci druhu S. aureus pomocí PCR, jejíž
specifita pro tento druh byla ověřena na obsáhlém souboru sbírkových a terénních kmenů.
Pozitivní výsledek byl oběma metodami získán na všech 216 testovaných kmenech S. aureus
a negativní výsledek u všech z 81 testovaných stafylokokových druhů jiných než S. aureus.
Zavedení metody PCR významně urychluje a usnadňuje identifikaci kmenů druhu S. aureus a
současně i jejich odlišení od jiných druhů stafylokoků v klinickém materiálu.
Publikace ve vědeckých časopisech:
Štěpán, J., Pantůček, R., Růžičková, V., Rosypal, S., Hájek, V., Doškař, J.: Identification of Staphylococcus
aureus based on PCR amplification of species specific genomic 826 bp sequence derived from a
common 44-kb SmaI restriction fragment. Mol Cell Probes. 15(5):249-257,2001. IF 1,744
Abstrakta z konferencí:
Hradecká, H., Michalová, E., Růžičková, V.: Metoda přímé detekce specifických genů v koloniích bakterií. In:
Tomáškovy dny 2003. Vyd. LF MU Brno: Mikrobiologický ústav LF MU a FN v Brně, str. 8, 2003.
Rosypal, S., Štěpán, J., Pantůček, R., Růžičková, V., Hájek, V., Doškař, J.: Identification of Staphylococcus
aureus based on PCR amplification of species specific genomic 826 bp sequence derived from 44 kb
SmaI-restriction fragment. In 9th International Symposium on Staphylococci and Staphylococcal
Infections. Kolding : JDS, s. 105-105, 2000.
Štěpán, J., Pantůček, R., Růžičková, V., Rosypal, S., Doškař, J.: Příprava DNA hybridizační sondy pro
identifikaci kmenů druhu Staphylococcus aureus. "3. pracovní setkání biochemiků a molekulárních
biologů", Přírodovědecká fakulta MU v Brně, s.29, 1999.
Štěpán, J., Pantůček, R., Růžičková, V., Rosypal, S., Doškař, J.: Preparation of a species specific molecular
probe for identification of Staphylococcus aureus. Scripta Medica, Brno: Lékařská fakulta Masarykovy
univerzity, 72, 8, s. 380-380, 2000.
9
Diplomové práce:
Hradecká Helena: Detekce a charakterizace termonukleázového genu u vybraných druhů stafylokoků. 2003.
Školitel: V. Růžičková.
Dizertační práce:
Štěpán Jiří.: Příprava molekulární sondy a PCR-primerů pro identifikaci kmenů S. aureus. 2001. Školitel: J.
Doškař.
2. Příprava molekulárních sond a zavedení PCR pro detekci profágů v kmenech S.
aureus a jejich využití pro genovou typizaci těchto kmenů
V epidemiologii nozokomiálních infekcí je jedním z nejdůležitějších kroků jednoznačná
identifikace kmene patogenního druhu, který tuto infekci vyvolal, jeho odlišení od ostatních
kmenů tohoto druhu a vyhledání zdroje nákazy a způsobu jejího šíření. Pro odlišování kmenů
(tzv. typizaci) je používána řada metod, žádná z nich však zatím neumožňuje odlišit kmeny se
stoprocentní účinností. Jelikož téměř všechny klinické izoláty S. aureus jsou lyzogenní (tj.
obsahují jednoho nebo více různých profágů), zaměřili jsme se na vypracování typizační
metody založené na rozdílném obsahu profágů v jejich genomech. V genomech fágů S.
aureus mezinárodní řady byly vyhledány sekvence specifické pro fágové druhy séroskupin A
(fág 3A, 5 003 bp), B (fág 53, 3 926 bp), F (fág 77, 3 398 bp) a L (fág 187, 1 927 bp), z nichž
byly připraveny hybridizační sondy pro detekci profágů příslušných fágových druhů
v lyzogenních kmenech S. aureus. Pomocí této metody lze do výše zmíněných druhů
klasifikovat také všechny další stafylokokové fágy a profágy, u kterých byly již popsány
genomy.
K usnadnění a urychlení detekce profágů byly ze sekvencí sond navrženy PCR-primery,
umožňující získat pro každý fágový druh amplifikační produkt charakteristické velikosti.
Optimalizací sady primerů byla zavedena multiplex PCR pro přímý důkaz přítomnosti
profágů jednotlivých druhů v jediné PCR-reakci. Metoda detekce profágů byla ověřena jak na
experimentálně lyzogenizovaných kmenech připravených na našem pracovišti, tak na
kmenech z klinického materiálu, kde byly zjištěny významné rozdíly v obsahu profágů.
Jelikož se obsahem profágů liší i velmi blízce příbuzné stafylokokové kmeny, lze „profágový
profil“ kmenů využít též jako novou genotypizační metodu k jejich odlišení a k velmi
spolehlivé identifikaci, např. při epidemiologických studiích, kde vykazuje stejnou nebo vyšší
diskriminační schopnost ve srovnání s dalšími genotypizačními metodami (např. PFGE a
ribotypizace). Na rozdíl od klasické fagotypizace má uvedený postup výhodu především
v tom, že je nezávislý na citlivosti testovaných kmenů k fágům. Identifikace profágů pomocí
multiplex PCR je snazší než pomocí konvenčních metod jako indukce UV-světlem nebo
mitomycinem C; navíc je specifická a umožňuje současně provést jejich zařazení do fágových
druhů.
Sondy byly využity též k detekci profágů u kmenů vyznačujících se specifickými
fenotypovými vlastnostmi, zejména u toxinogenních a multirezistentních kmenů. V genomu
25-ti TSST-1 pozitivních kmenů S. aureus byla při simultánní hybridizaci k HindIII
restrikčním spektrům zjištěna přítomnost specifických sekvencí alespoň pro jeden serotyp
profágů. Nejčastěji byl zastoupen serotyp F (asi z 84%), což znamená, že u TSST-1
pozitivních kmenů lze předpokládat výskyt profága sérologické skupiny F. Ze zjištěných
skutečností vyplývá, že u toxinogenních stafylokoků může existovat určitá souvislost mezi
výskytem profágů sérologické skupiny F v jejich genomu bakterií a schopností tvořit TSST-1.
Fágové sondy a PCR primery byly aplikovány též při identifikaci profágů u souboru 62
multirezistentních a oxacilin rezistentních kmenů pocházejících z popáleninového centra FN
v Bohunicích izolovaných v letech 1996-2002. Na základě této analýzy lze izoláty rozdělit do
10
dvou klonálních typů, z nichž jeden je přítomen v nemocnici již od roku 1996 a výskyt
druhého byl poprvé zaznamenán v roce 2001. Další skupinou kmenů, u které byla provedena
detekce profágů, byly kmeny S. aureus produkující exfoliatin A a B.
V oblasti studia problematiky vztahu fágů ke kmenům rodu Staphylococcus byla pozornost
věnována též polyvalentním bakteriofágům, které se vyznačují širokým rozmezím hostitelů a
mají proto perspektivní využití v terapii stafylokokových infekcí. Byla provedena analýza
genomu polyvalentního bakteriofága φ812, jeho mutant a příbuzných fágů 131, 113, U16 a
Twort, jejímž cílem bylo objasnit molekulárně biologický základ mutací, které se týkají změn
v jejich rozmezí hostitele. Studium bylo zaměřeno na identifikaci a bližší charakterizaci
genomových sekvencí a genů, které mají vztah k širokému rozmezí hostitele polyvalentních
fágů, mezi něž patří zejména geny, jejichž produkty se vyznačují lytickými vlastnostmi. Byly
klonovány a sekvencovány putativní geny pro endolyzin a holin, které umožňují uvolnění
virionů z hostitelské buňky. Srovnáním stanovených sekvencí bylo zjištěno, že oba geny
vykazují vysoký stupeň homologie s příslušnými geny jiných bakteriofágů. Významné je
zjištění, že gen pro endolyzin je přerušen intronem kódujícím putativní endonukleázu.
Metodou RT-PCR byla v infikovaných stafylokokových buňkách prokázána přitomnost
mRNA pro endolyzin s vystřiženým intronem. Intron v genu pro endolyzin teoreticky
umožňuje expresi samostatné N-terminální domény, což může přispívat k širokému rozmezí
hostitele fága 812. Pozornost byla soustředěna na analýzu oblastí fágové genomové DNA,
v níž dochází k zásadnějším genomovým přestavbám (inzerce, delece, inverze). Byly
stanoveny rozdíly v nukleotidových sekvencích genů kódujících hlavní strukturní proteiny
těchto fágů. Vedle genů pro lytické enzymy byla pozornost věnována též genům, jejichž
produkty jsou složkou bakteriofágových kapsidů. Byl identifikován gen pro hlavní kapsidový
protein a stanovena jeho lokalizace na genetické mapě fága 812.
Vedle studia fágového genomu bylo započato s analýzou fágového proteomu zaměřenou na
srovnání fága standardního typu, jeho mutant v rozmezí hostitele a příbuzných fágů. Po
purifikaci fágových virionů v grandientech CsCl bylo SDS-PAGE elektroforézou stanoveno
spektrum základních fágových proteinů a u vybraných typů určena pomocí hmotové
spektroskopie jejich aminokyselinová sekvence. Rozpracování tohoto nového přístupu
umožňuje nalézt korelaci mezi genomovými mutacemi a změnou proteinových struktur, které
se podílejí na lytických vlastnostech fágů. Výsledky tohoto studia mají zásadní význam pro
racionalizaci fágové terapie, která představuje perspektivní alternativu léčby závažných
stafylokokových infekcí antibiotiky, která je vzhledem k rezistenci většiny kmenů již často
neúčinná.
Doškař, J., Pallová, P., Pantůček, R., Rosypal, S., Růžičková, V., Pantůčková, P., Kailerová, J., Klepárník, K.,
Malá, Z., Boček, P.: Genomic relatedness of Staphylococcus aureus phages of the International Typing
Set and detection of serogroup A, B, and F prophages in lysogenic strains. Canadian Journal of
Microbiology, 2000; 46(11): 1066-1076. ISSN 0008-4166. IF 1,105.
Pantůček, R., Doškař, J., Růžičková, V., Kašpárek, P., Oráčová, E., Kvardová, V., Rosypal, S.: Identification of
bacteriophage types and their carriage in Staphylococcus aureus. Archives of Virology 149(9): 1689–
1703, 2004. IF 1,876.
Abstrakta z konferencí
Doškař, J., Pantůček, R., Růžičková, V., Kašpárek, P., Eyer, L., Konečná, H., Zdráhal, Z., Preisler, J.: Genomic
and proteomic characterization of the polyvalent staphylophage 812. 11th International Symposium on
Staphylococci & Staphylococcal Infections. Plenary Summaries & Poster Abstracts, p. 201. Charleston,
SC, USA. October 24 - 27, 2004.
Doškař, J., Pallová, P., Pantůček, R., Rosypal, S., Růžičková, V., Pantůčková, P., Kailerová, J.: Preparation of
specific probes detecting prophages of serogroups A, B and F in lysogenic strains of Staphylococcus
11
aureus. In 9th International Symposium on Staphylococci and Staphylococcal Infections. Kolding :
JDS, s. 102-102, 2000.
Doškař, J., Pallová, P., Pantůček, R., Rosypal, S., Růžičková, V., Pantůčková, P., Kailerová, J., Klepárník, K.,
Malá, Z., Boček, P.: Příprava specifických sond pro detekci profágů seroskupin A, B a F v lyzogenních
kmenech Staphylococcus aureus. In 4th Workshop of Biochemists and Molecular Biologists.
Biochemistry and molecular biology on the threshold of a new century. 1. vydání, 2000. Brno:
Masarykova univerzita, s. 47-48, 2000.
Eyer, L., Konečná, H., Zdráhal, Z., Preisler, J., Pantůček, R., Doškař, J.: Analýza proteomu polyvalentního
bakteriofága 812. In VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova
univerzita, 3.–4. února 2004. Sborník příspěvků s. 45-46, 2004.
Kašpárek P., Doškař J., Pantůček R.: Analýza genomu stafylokokového bakteriofága 812. Abstrakt z Konference
mladých mikrobiologů X. Tomáškovy dny. Scripta Medica (Brno) –75 (1, February 2002):39, 2002.
Kašpárek P., Pantůček R., Doškař J.: Genome analysis of staphylococcal bacteriophage 812. VI. Pracovní
setkání biochemiků a molekulárních biologů, 7.2.2002. Masarykova univerzita v Brně. Sborník
příspěvků p. 66, 2002.
Kašpárek, P., Doškař, J., Pantůček, R.: Analýza genomu stafylokokového bakteriofága 812. In Konference
mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2001 - Sborník souhrnů přednášek. Brno, Mikrobiologický
ústav LF MU a FN u sv. Anny v Brně, s. 15, 2001.
Kašpárek, P., Doškař, J., Pantůček, R.: Molecular basis of the host-range mutations in polyvalent staphylococcal
phage 812. V. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Masarykova univerzita v Brně,
14. února 2001. Sborník příspěvků s. 41-42, 2001.
Kašpárek, P., Pantůček, R., Loessner, M.J., Zimmer, M., Doškař, J.: Identifikace genu pro endolyzin
polyvalentního stafylokokového bakteriofága 812. VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních
biologů. Brno, Masarykova univerzita, str. 43, 2003.
Kašpárek, P., Pantůček, R., Rosypal, S., Doškař, J.: Analýza mutací stafylokokového bakteriofága 812
vedoucích ke změně rozmezí hostitele. 22. Kongres Čs. spol. mikrobiol. Košice, 5.-9.9.2001. Sborník
abstraktů, p.197, 2001.
Hrstka, R., Růžičková, V., Pantůček, R., Petráš, P., Doškař, J.: Detection of prophages in TSST-1-positive
Staphylococcus aureus strains by means of specific probes. Scripta Medica. vol. 74, no. 4, s. 279-280,
2001.
Oráčová E., Kvartová, V., Pantůček, R., Doškař, J.: Detekce profágů v kmenech Staphylococcus aureus pomocí
multiplex PCR. Genetická konference Perspektivy genetiky – genomy a genová exprese, Brno 5.-6. 2.
2002. Informační listy Genetické společnosti Gregora Mendela 24:37, 2002.
Pantůček, R., Oráčová, E., Kvartová, V., Růžičková, V., Petráš, P., Doškař, J.: Multiplex PCR for detection of
Staphylococcus aureus prophages. In 10th International Symposium on Staphylococci and
Staphylococcal Infections. Tsukuba, Japan October 16-19, 2002. Poster 147-02 Abstract Book p. 66,
2002.
Pantůček, R., Doškař, J., Růžičková, V.: Comparative phage genomics of family Siphoviridae in Staphylococcus
aureus. 11th International Symposium on Staphylococci & Staphylococcal Infections. Plenary
Summaries & Poster Abstracts, p. 203. Charleston, SC, USA. October 24 - 27, 2004.
Pantůček, R., Doškař, J., Růžičková, V.: Bakteriofágy a lyzogenie u Staphylococcus aureus. Abstrakt
z přednášky na Konzultačním dnu NRL pro stafylokoky SZÚ CEM 6. 11. 2002. Zprávy CEM (SZÚ,
Praha) 12(1): 37, 2003.
Pilousová, L. Pantůček, R., Doškař, J.: Příprava univerzální sondy pro detekci profágů v kmenech
Staphylococcus aureus. VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno : Masarykova
univerzita, s. 65-66, 2003.
Preisler, J., Zdráhal, Z., Klepárník, K., Foret, F., Vrábel, P., Malá, Z., Doškař, J., Pantůček, R., Růžičková, V.,
Konečná, H., Krásenský, P.: Proteomic analysis of therapeutically important bacteriophage 812 by
combination of electrophoresis and mass spectrometry. 51st Annual Conference on Mass Spectrometry
and Allied Topics. Montreal, Canada, June 8 - 12, 2003. Poster No. 451, Abstract book, p. 1152, 2003.
Zdráhal, Z., Konečná, H., Eyer, L., Pantůček, R., Doškař, J., Preisler, J.: Analysis of the polyvalent
bacteriophage 812 proteome. 22nd Informal Meeting on Mass Spectrometry, section Focus on
Biomedical Applications and proteomics. Mass Spectrometry Department of the Chemical Research
Center, Hungarian Academy of Sciences. 2 - 6 May, 2004 Tokaj, Hungary. Poster No. MoPo06, Book
of Abstracts p.47, 2004.
12
Diplomové práce:
Eyer Luděk: Analýza proteomu polyvalentního bakteriofága. 2004. Školitel: J. Doškař.
Kvardová Veronika: Charakterizace genomu stafylokokového bakteriofága 187 a příprava specifické sondy pro
detekci profágů serologické skupiny L v kmenech S. aureus. 2002. Školitel: J. Doškař.
Oráčová Eva: Identifikace profágů v genomu Staphylococcus aureus pomocí multiplex-PCR. 2002. Školitel: R.
Pantůček.
Pilousová Lenka: Příprava univerzální sondy pro detekci profágů v kmenech Staphylococcus aureus. 2003.
Školitel: J. Doškař.
Eyer Luděk: Analýza proteomů polyvalentních stafylofágů. Školitel: J. Doškař.
Kašpárek Petr: Molekulární základ mutací polyvalentního fága týkající se jeho rozmezí hostitele. Školitel: J.
Doškař.
Pallová Petra.: Molekulární charakterizace genomu fága 53. 2000. Školitel J. Doškař.
3. Srovnání fenotypizačních a genotypizačních metod pro diagnostiku stafylokoků
Na základě fenotypových znaků (biotypizace, fagotypizace, rezistence k antibiotikům)
byly shromážděny a charakterizovány skupiny kmenů izolované z klinického materiálu
nemocnic v ČR: 87 kmenů S. aureus MRSA, 42 kmenů S. epidermidis, 23 kmenů S.
haemolyticus, 10 kmenů S. hominis subsp. hominis a 70 kmenů S. hominis subsp.
novobiosepticus (rezistentních k oxacilinu). U těchto kmenů byly aplikovány genotypizační
metody za účelem jejich typizace a identifikace s ohledem k jejich klíčovým fenotypovým
vlastnostem, jakými jsou rezistence k antibiotikům (zejména MRSA, oxacilin rezistentní
koaguláza negativní stafylokoky a multirezistentní kmeny) a produkce extracelulárních
faktorů vztahujícím se k patogenitě a virulenci. Byla provedena SmaI-makrorestrikční analýza
genomových DNA, analýza obsahu plazmidů, RS-PCR (amplifikace přepisovaných
ribozomálních mezerníků) a RAPD PCR.
U meticilin rezistentních S. aureus byla druhově specifickou 2 kb hybridizační sondou
zpřesněna jejich identifikace. Specifické sondy, připravené z DNA fágových druhů 3A, 53 a
77 prokázaly, že kmeny MRSA jsou polylyzogenní a obsahují ve svém genomu profágy
seroskupin A, B a F. Výsledky prokázaly, že profágová typizace je velmi vhodnou typizační
metodou doplňující PFGE a metody PCR. Polymorfizmus genomu kmenů byl stanoven taktéž
metodou PCR-RFLP (gen pro koagulázu). Byl určen typ stafylokokové chromozomové
kazety mec (SCCmec), což je mobilní genetický element obsahující zejména geny
podmiňující různé typy rezistence. V testované skupině izolátů MRSA z FN Brno byly
nejčastější zcela identické podskupiny kmenů označené podle typu makrorestrikčního spektra
a typu SCCmec jako 1a/IIIA (6 izolátů shodně z popáleninového centra z let 1999 a
2000), 2e/IV (2 izoláty z různých oddělení z let 2001 a 2002) a 2e/III vykazující odlišnosti
v obsahu profágů (9 izolátů). Zbylé kmeny měly jedinečný genotyp. Na základě
epidemiologických šetření lze vyslovit hypotézu, že zdrojem kmenů může být centrum pro
popálené a nejčastější cestou přenosu ruce ošetřujícího personálu.
Na základě aplikace molekulárně-biologických metod orientovaných na analýzu genomu byla
zpřesněna diagnostika nejčastěji se vyskytujících koaguláza-negativních druhů stafylokoků (S.
epidermidis, S. haemolyticus a S. hominis). Byla stanovena genetická variabilita meticilin
rezistentních kmenů koaguláza-negativních stafylokoků izolovaných z klinického materiálu a
výsledky analýzy byly korelovány se standardními fenotypovými testy. Získané výsledky
umožnily definovat celkovou variabilitu genomu a výskyt jednotlivých genotypů uvedených
druhů a budou sloužit jako základ pro zavedení genotypizačních metod do praxe. Podstatným
přínosem této části je popis variability genomu těchto kmenů v ČR a výběr vhodných metod
pro studium jejich molekulární epidemiologie. Spolu se studiem variability genomu byly
testovány metody pro stanovení rezistence k oxacilinu (meticilinu) u koaguláza-negativních
13
stafylokoků a srovnávány s metodami pro druh S. aureus. Byly testovány různé metody pro
stanovení rezistence. Vedle stanovení rezistence diskovou metodou a metodou minimální
inhibiční koncentrace (MIC) byl použit latex-aglutinační test pro důkaz tvorby PBP2a
proteinu a PCR amplifikace genu mecA a regulačního genu femA. Na základě výsledků bylo
doporučeno modifikovat stávající fenotypizační testy pro posuzování rezistence kmenů
v klinických laboratořích, což přispěje k racionalizaci antibiotikové léčby u pacientů se
stafylokokovými infekcemi.
Celkově výsledky této části řešení VZ přispěly k charakterizaci stafylokokových kmenů
způsobujících nozokomiální infekce v ČR a budou využity k jejich identifikaci a typizaci. Za
tímto účelem byly současné možnosti aplikace molekulárně genetických metod pro
diagnostiku klinicky významných stafylokoků shrnuty v obsáhlém přehledovém článku,
v němž jsou též zdůrazněny přednosti genotypizace oproti klasickým fenotypizačním
metodám.
Publikace ve vědeckých časopisech
Hájek V., Pantůček R., Kolář M., Doškař J., Rosypal S.: Comparison of MRSA-screen latex agglutination,
conventional phenotypic methods and mecA gene detection for identification of oxacilin resistance in
staphylococci. Biologia. Section Cellular and Molecular Biology, 57(6): 729–738, 2002. IF 0,208.
Štěpán, J., Pantůček, R., Doškař, J.: Molecular diagnostics of clinically important staphylococci. Folia
Microbiol. (Praha), 49: 353-86, 2004. IF 0,857.
Hobza, R., Doškař, J., Pantůček, R.: Stanovení polymorfizmu genů pro tvorbu koagulázy, rezistenci k meticilinu
a 16S-23S mezerníkových oblastí rDNA genů u Staphylococcus aureus metodou PCR. In 4th Workshop
of Biochemists and Molecular Biologists. Biochemistry and molecular biology on the threshold of a
new century. 1. vydání, 2000. Brno: Masarykova univerzita, s. 49-50, 2000.
Petráš, P., Růžičková, V.: Zjištění kompletní sekvence genomu methicilin-rezistentního a vankomycinrezistentního kmene S. aureus. Zprávy CEM (SZÚ, Praha). ISSN 1211-7358, 10: 180-181, 2001.
Kašpárek, P., Hobza, R., Kizek, R., Pantůček, R., Růžičková, V., Hájek, V., Rosypal, S., Doškař, J.: Genotypová
variabilita kmenů Staphylococcus aureus rezistentních k oxacilinu. "3. pracovní setkání biochemiků a
molekulárních biologů", Přírodovědecká fakulta MU v Brně, 3. února 1999 Brno, s. 17, 1999.
Kašpárek, P., Doškař, J., Pantůček, R., Hájek, V., Rosypal, S.: Analýza plazmidů kmenů druhu Staphylococcus
aureus lišících se rezistencí k antibiotikům. In 4th Workshop of Biochemists and Molecular Biologists.
Biochemistry and molecular biology on the threshold of a new century. 1. vydání, Brno: Masarykova
univerzita, s. 50-50, 2000.
Pantůček, R., Hájek, V., Sedláček, I., Petráš, P., Švec, P., Růžičková, V., Rosypal, S., Kailerová, J., Faitová J.,
Zahradníčková, E., Rybář, R., Doškař, J.: Characterization of oxacillin–resistant coagulase–negative
staphylococcal strains isolated in the Czech Republic. In 9th International Symposium on Staphylococci
and Staphylococcal Infections. Kolding, Denmark: JDS, June, 14th–17th, Abstract book p. 104, 2000.
Pantůček, R., Rybář, R., Petráš, P., Sedláček, I., Růžičková, V., Doškař, J.: Characterization of genomic
variability of new multiresistant subspecies Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus in Czech
Republic. V. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Masarykova univerzita v Brně, 14.
února 2001. Sborník příspěvků s. 40, 2001.
Petráš P., Pantůček R., Doškař J.: Genomic and phenotypic variability of multiresistant strains Staphylococcus
hominis subsp.novobiosepticus. In 10th International Symposium on Staphylococci and Staphylococcal
Infections. Tsukuba, Japan October 16-19, 2002. Poster 147-01 Abstract Book p. 65, 2002.
Diplomové práce:
Hobza Roman: Studium polymorfismu genomu kmenů S. aureus pomocí PCR. 2000. Školitel: J. Doškař.
Kašpárek Petr: Chrarakterizace plazmidů kmenů druhu Staphylococcus aureus rezistentních k antibiotikům.
2000. Školitel: J. Doškař.
14
Rybář Roman: Genomová variabilita a typizace kmenů Staphylococcus hominis izolovaných z klinického
materiálu v České republice. 2001. Školitel: R. Pantůček.
Jedličková Dagmar: Molekulární typizace patogenních stafylokoků. Školitel: J. Doškař.
4. Genotypová analýza klinicky významných kmenů enterokoků rezistentních k
antibiotikům
Ve spolupráci s LF UP v Olomouci byl analyzován soubor kmenů Staphylococcus sp. a
Enterococcus sp. Cílem této části práce bylo stanovení příbuznosti vankomycin-rezistentních
enterokoků (VRE) na střední Moravě v období 1997–2003, vyskytujících se jak v komunitním
a veterinárním, tak nemocničním prostředí. V současné době dochází k vzestupu jejich
významu jako důležitých původců nozokomiálních infekcí močového a respiračního traktu,
chirurgických ran a infekcí krevního řečiště. Byla zavedena PCR-metoda pro detekci
rezistence k vankomycinu typu VanA a VanB a pro diferenciaci druhů Enterocococus
faecium a E. faecalis. V případě Enterococcus faecium typu VanA byla provedena analýza
genomové DNA, pomocí níž se podařilo kmeny rozdělit na základě SmaI-makrorestrikční
analýzy podle podobnosti spekter fragmentů DNA do skupin, u nichž lze předpokládat
klonální původ. Výsledky tohoto studia se staly podkladem pro širší epidemiologickou studii.
Důležitou otázkou je primární zdroj VRE. Jako rezervoár mohou mít velký význam zvířata, u
nichž enterokoky tvoří přirozenou součást mikroflóry střevního traktu. VRE byly izolovány
nejen z humánního materiálu, ale rovněž ze slepičích chovů umístěných ve studovaném
regionu. Na základě získaných výsledků studia nemocničních izolátů lze potvrdit možnost
přežívání kmenů E. faecium VanA v prostředí nemocničního oddělení a následný přenos na
hospitalizované pacienty. Současně je však nutné připustit i endogenní původ těchto kmenů a
následnou selekci vlivem širokospektré antibiotické léčby.
Jedním ze způsobů přenosu VRE je kontaminace potravinového řetězce, která způsobí
kolonizaci střevního traktu a umožní následující interhumánní přenos. Jedná se v podstatě o
jakousi modifikaci „alimentární infekce“. Zdrojem mohou být hospodářská zvířata
produkující maso, mléko a mléčné výrobky.
V rámci spolupráce s Ústavem bunkovej biológie PrF UK v Bratislavě, probíhala analýza
genomu kmenů r. Enterococcus, které jsou využívány při přípravě potravinářských výrobků
(např. brynzy) a jako probiotické preparáty. Cílem řešení této problematiky byla genotypová
charakterizace těchto kmenů a jejich odlišení od potenciálně patogenních druhů rodu
Enterococcus (a příbuzných druhů), které jsou kontaminantami z přírodních zdrojů a mohou
být zdrojem genů rezistence k antibiotikům. Byla provedena molekulárně-biologická a
mikrobiologická analýza izolátů z brynzy za účelem identifikace druhu Enterococcus faecium,
příp. Enterococcus faecalis a jejich odlišení od jiných zástupců Enterococcus sp. přítomných
v brynze. Studium genotypové variability bylo provedeno pomocí pulzní gelové elektroforézy
a multiplex PCR pro amplifikaci genů ddl, vanA a vanB, které jsou zodpovědné za rezistenci
k vankomycinu. Výsledky těchto analýz umožňují vyhledávání možných environmentálních
zdrojů vankomycin-rezistentních kmenů enterokoků, z nichž může docházet k přenosu
determinant rezistence k antibiotikům na klinicky významné kmeny r. Enterocococus a
Staphylococcus.
Kolář M., Pantůček R., Bardoň J., Vágnerová I., Typovská H., Válka I., Doškař J.: Occurrence of antibioticresistant bacterial strains isolated in poultry. Veterinary Medicine – Czech 47(2 –3):52 –59, 2002. IF
0,348.
15
Jurkovič, D., Krajčovič, J., Dušinský, R., Pantůček, R., Doškař, J.: PCR identifikácia enterokokov izolovaných z
bryndze. Tomáškovy dny 2003 - sborník abstraktů. Brno, Mikrobiologický ústav LF MU a FN u svaté
Anny, str. 27, 2003.
Kesselová, M., Pantůček, R., Vágnerová, I., Kolář, M., Sauer, P.: Význam molekulárno-biologických metód v
problematike vankomycín-rezistentných enterokokov. Študentská vedecká konferencia organizovaná pri
príležitosti 50. výročia Slovenskej akadémie vied. Bratislava, Prírodovedecká fakulta Univerzity
Komenskeho, Bratislava, 2003.
Kesselová, M., Pantůček, R., Vágnerová, I., Kolář, M., Sauer, P.: Molekulárno-biologická analýza vankomycin
rezistentných enterokokov. Tomáškovy dny 2003 - sborník abstraktů. Brno, Mikrobiologický ústav LF
MU a FN u svaté Anny, s. 31-32, 2003.
Kolář, M., Pantůček, R., Vágnerová, I., Kesselová, M., Sauers, P., Matoušková, I., Doškař, J.: Molecular-biology
analysis of Enterococcus faecium VanA strains in haemato-oncological patients. In 5th European
Congress of Chemotherapy and Infection. Greece: Federation of the European Societies for
Chemotherapy and for Infection, s. 106, 2003.
Kolář, M., Vágnerová, I., Pantůček, R., Čermák, P.: Impact of rational antibiotic usage on occurrence of
vancomycin-resistant enterococci in hematological patients. 11th European Congress of Clinical
Microbiology and Infectious Diseases, Istanbul 1-4 April 2001. Clinical Microbiology and Infection
2001; 7(Suppl. 1), p. 91. IF 1,198.
5. Identifikace a popis nových druhů stafylokoků a příbuzných druhů bakterií na
základě jejich genotypové analýzy
V posledních letech bylo popsáno několik nových druhů rodu Staphylococcus, jejichž studium
je významné jak z hlediska patogeneze, tak evoluce. V této souvislosti jsme se zaměřili na
druhy Staphylococcus carnosus a blízce příbuzný Staphylococcus piscifermentans. S.
carnosus je používán v potravinářském průmyslu, kde je vzhledem ke způsobu jeho aplikace
důležitá jeho identifikace. Na základě podrobné numerické analýzy 100 fenotypových znaků
byly studované kmeny druhů S. carnosus a S. piscifermentans rozděleny do vzájemně
odlišných klastrů, které korespondovaly s výsledky analýzy genomu při kterých byly použity
DNA typizační metody. V této studii bylo modelově na příkladě dvou druhů stafylokoků
prokázáno, že DNA typizační techniky ve spojení s numerickou analýzou podstatně upřesňují
klasifikaci blízce příbuzných druhů, jelikož umožňují rozlišit např. fenotypově konvergentní
kmeny na základě jejich genomových profilů. Výsledky této práce podpořily popis dvou
nových taxonů v rámci rodu Staphylococcus, a to nový druh Staphylococcus condimenti a
nový poddruh Staphylococcus carnosus subsp. utilis.
S využitím metod PFGE, ribotypizace, RAPD a analýzy sekvencí genů pro tRNA bylo
upřesněno taxonomické postavení dalších vybraných druhů gram-pozitivních koků r.
Enterococcus izolovaných z povrchových vod a popsány dva nové druhy (Enterococcus
haemoperoxidus a E. moraviensis).
Studium grampozitivních potenciálně patogenních koků bylo doplněno charakterizací dosud
neklasifikovaných druhů izolovaných ze zvířat. Výsledky molekulární analýzy jejich genomů
naznačuje, že se jedná o dosud nepopsané druhy. Byly charakterizovány nové druhy
makrokoků izolované z kůže a sliznic velbloudovitých. Analýza obsahu GC, DNA-DNA
hybridizace, a sekvenční analýza 16S-rRNA potvrdila taxonomické zařazení těchto kmenů do
rodu Macrococcus. Následnou ribotypizací bylo prokázáno, že tyto kmeny jsou vzájemně
geneticky odlišné a představují tři nové druhy, Macrococcus hajekii, M. brunensis a M.
lamae. Výsledky této studie ukazují na nutnost použití genotypizačních metod pro přesnou a
spolehlivou charakterizaci izolátů příbuzných stafylokokům představujících potenciálně
patogenní druhy grampozitivních koků. V roce 2004 byl na základě sekvenční analýzy genů
pro 16S rRNA a protein Hsp60, DNA-DNA hybridizace a biochemických znaků
16
identifikován nový koaguláza-negativní druh Staphylococcus
z gastrointestinálního traktu primátů, blízce příbuzný S. aureus.
saimirii
izolovaný
Pantůček, R., Sedláček, I., Doškař, J., Rosypal, S.: Complex genomic and phenotypic characterization of the
related species Staphylococcus carnosus and Staphylococcus piscifermentans. Int. J. Syst. Bacteriol. 49:
941-951, 1999. IF = 3,724.
Švec, P., Sedláček, I., Pantůček, R., Devriese, L.A., Doškař, J.: Evaluation of ribotyping for characterization and
identification of Enterococcus haemoperoxidus and Enterococcus moraviensis strains. FEMS Microbiol
Lett. Sep 11; 203(1):23-27, 2001. IF 1,615.
Mannerová, S., Pantůček, R., Doškař, J., Švec, P., Snauwaert, C., Vancanneyet, M., Swings, J., Sedláček, I.:
Macrococcus brunensis sp. nov., Macrococcus hajekii sp. nov. and Macrococcus lamae sp. nov., from
the skin of llamas. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 53(5): 16471654, 2003. IF=3,187.
Publikace ve vědeckých časopisech odeslané do tisku:
Pantůček, R., Sedláček, I., Petráš, P., Koukalová, D., Švec, P., Štětina, V., Vancanneyt, M., Chrastinová, L.,
Vokurková, J., Růžičková, V., Doškař, J., Swings, J., Hájek, V.: Staphylococcus saimirii sp. nov.,
isolated from South American squirrel monkeys. International Journal of Systematic and Evolutionary
Microbiology, 2004: (submitted IJSEM paper no. 63590). IF=3,187.
Doškařová, S., Sedláček, I., Pantůček, R.: Biochemical and molecular taxonomy of gram-positive cocci isolated
from skin of llamas. Abstrakt z Konference mladých mikrobiologů X. Tomáškovy dny. Scripta Medica
(Brno); 75 (1):42-43, 2002.
Doškařová, S., Sedláček, I., Pantůček, R.: Biochemická a molekulární taxonomie grampozitivních koků
izolovaných z kůže lam. In Konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2001 - Sborník souhrnů
přednášek. Brno, Mikrobiologický ústav LF MU a FN u sv. Anny v Brně, s. 19, 2001.
Doškařová-Mannerová Sylva: Molekulární taxonomie grampozitivních koků izolovaných ze zvířat. 2004.
Školitel-specialista: R. Pantůček.
Švec Pavel: Molekulární taxonomie grampozitivních koků. 2001. Školitel: J. Doškař.
6. Molekulární charakterizace a typizace toxinogenních kmenů Staphylococcus aureus
V rámci bakteriálního druhu S. aureus jako univerzálního patogena pro člověka a pro
ostatní teplokrevné živočichy jsou obzvláště nebezpečné jeho toxinogenní kmeny způsobující
závažné toxikózy. Mezi nejznámější patří otravy z potravin, syndrom toxického šoku (TSS) a
kožní epidermolýzy.
Exfoliatin-pozitivní (ET) kmeny S. aureus, izolované v letech 1998 - 2004 v porodnicích
v ČR, v nichž došlo k hromadným puchýřnatým onemocněním byly diferencovány metodami
PFGE, interrepetitivní PCR (ERIC2-PCR), PCR-ribotypizací a profágovou typizací.
Stanovením genetické příbuznosti těchto kmenů byly vytypovány potencionální zdroje
nových infekcí na území ČR. K přesné identifikaci ET-pozitivních kmenů byla genotypizace
rozšířena o multiplex PCR pro detekci čtyř genů kódujících toxiny. Gen eta byl lokalizován
na chromozomu a gen etb na plazmidu. Bylo zjištěno, že gen eta je nesen fágy serologické
skupiny A a B.
Na základě SmaI-makrorestrikční analýzy genomové DNA byla stanovena příbuznost 45
TSST-1-pozitivních kmenů izolovaných v 19 městech ČR v období 1986 - 2004. Třicet
kmenů bylo TSS, z nich 10 kmenů způsobilo menstruální formy TSS a 20 kmenů
nemenstruální TSS. Genotypová analýza byla zpřesněna použitím PCR metod a profágové
17
typizace, podobně jako u ET-pozitivních kmenů a hybridizací byl lokalizován gen tst v
genomové DNA.
Enterotoxinogenní kmeny S. aureus jsou po salmonelách nejčastějšími původci
gastrointestinálních nemocí, proto neustává snaha zdokonalovat identifikační metody, které
by umožnily spolehlivě diagnostikovat toto rizikové agens ať již v klinickém materiálu nebo
v podezřelé potravině. Byla zavedena genotypizace enterotoxinogenních kmenů metodou
PCR. Pomocí specifických sond byly lokalizovány geny pro enterotoxiny A, B, C1, C2,3, a
termonukleázový gen nuc v restrikčních fragmentech SmaI genomové DNA. Pro rychlou
diagnostiku toxinogenních kmenů byla zavedena hybridizační metoda detekce genů přímo v
koloniích stafylokoků.
Významným je zjištění, že se gen eta (pro exfoliatin A) vyskytuje nejčastěji v genomu fága
serologické skupiny B, avšak tento gen byl identifikován též u fága serologické skupiny A.
Na základě restrikční analýzy genomu byly rozlišeny tři B-fágy a pět A-fágů. Experimentálně
byl uskutečněn přenos genu eta do recipientního kmene S. aureus. Tento kmen po fágové
konverzi B-fágem získal schopnost produkovat exfoliatin A. Tyto výsledky umožňují objasnit
molekulární podstatu vzniku virulentních kmenů v populaci druhu S. aureus, který je
v přirozených podmínkách nejpravděpodobněji výsledkem horizontálního přenosu genů
virulence prostřednictvím bakteriofágů.
Růžičková, V., Pantůček, R., Petráš, P., Doškař, J., Sedláček, I., Rosypal, S.: Molecular typing of exfoliative
toxin-producing Staphylococcus aureus strains involved in epidermolytic infections. International
Journal of Medical Microbiology. 292: 541-545, 2003. IF2003 2,583.
Růžičková, V., Petráš, P.: Exfoliatiny Staphylococcus aureus původci epidermolytických infekcí. Zprávy CEM
(SZÚ, Praha). 12:171-174, 2003.
Růžičková, V.: Genomové ostrovy patogenity u bakterií. Biologické listy. 69: 1-14, 2004.
Hrstka, R., Růžičková, V., Petráš, P., Pantůček, R., Rosypal, S., Doškař, J.: Genotypic characterization of TSST1 producing strains of Staphylococcus aureus isolated in the Czech Republic. International Journal of
Medical Microbiology (revised manuscript-number: IJMM 09-04). IF 2,583.
Hrstka, R., Růžičková, V.: Molekulární typizace a identifikace toxinogenních kmenů Staphylococcus aureus. In:
Sborník příspěvků III. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Molekulární biologie a
biochemie v humánní a veterinární medicíně. Brno: Masarykova univerzita, s. 35-35, 1999.
Hrstka, R., Růžičková, V., Pantůček, R., Petráš, P., Doškař, J.: Detekce profágů u TSST-1 pozitivních kmenů
Staphylococcus aureus pomocí specifických sond. In: Abstrakty-Tomáškovy dny 2000. Vyd. XII.
konference mladých mikrobiologů. LF MU Brno, Mikrobiologický ústav LF MU a FN v Brně, s. 10 -11,
2000.
Růžičková, V., Pantůček, R., Petráš, P., Doškař, J., Rosypal, S.: Genomic and phenotypic properties of
exfoliatin-producing strains of Staphylococcus aureus implicated in two outbreaks of staphylococcal
scalded skin syndrome in the Czech Republic. In 9th International Symposium on Staphylococci and
Staphylococcal Infections. Kolding: JDS, s. 74-74, 2000.
Hrstka, R., Růžičková, V., Pantůček, R., Petráš, P., Doškař, J.: Genotype variability of TSST-1 positive
Staphylococcus aureus strains in the Czech Republic. In: Sborník příspěvků V. Pracovní setkání
biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita v Brně, s. 25-25, 2001.
18
Růžičková, V., Hradilová, J., Pantůček, R., Petráš, P., Doškař, J.: Makrorestrikční analýza genomu a výskyt
profágů u exfoliatin pozitivních kmenů Staphylococcus aureus. In: Sborník příspěvků V. Pracovní
setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita v Brně, s. 41-41, 2001.
Růžičková, V., Hradilová, J., Pantůček, R., Petráš, P., Sedláček, I., Doškař, J., Rosypal, S.: Genomová typizace
exfoliatin-pozitivních kmenů Staphylococcus aureus. In: Abstract book of the 22nd Congress of the
Czechoslovak Society for Microbiology - Health and Microorganisms. Košice - Praha : Czechoslovak
Society for Microbiology, s. 284-284, 2001.
Růžičková, V., Hrstka, R., Hradilová, J., Michalová, E., Mbaye, A. M., Petráš, P.: Molekulární identifikace genů
kódujících tři typy toxinů u Staphylococcus aureus. Genetická konference Perspektivy genetiky –
genomy a genová exprese, Brno 5.- 6. 2. 2002. Informační listy Genetické společnosti Gregora Mendela
24:38-38, 2002.
Michalová, E., Růžičková, V., Hradecká, H.: Detekce a lokalizace genetických determinant faktorů virulence u
Staphylococcus aureus pomocí molekulárních sond. In VII. Pracovní setkání biochemiků a
molekulárních biologů. Brno, Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity v Brně, s. 53, 2003.
Hradecká, H., Michalová, E., Růžičková, V.: Metoda přímé detekce specifických genů v koloniích bakterií. In:
Tomáškovy dny 2003. Vyd. LF MU Brno : Mikrobiologický ústav LF MU a FN v Brně, s. 8, 2003.
Růžičková, V., Pekarová, M., Petráš, P., Pantůček, R., Doškař, J.: Characterization of resident bacteriophages
and their role in conversion of exfoliative toxin A production in Staphylococcus aureus. 11th
International Symposium on Staphylococci & Staphylococcal Infections. Plenary Summaries & Poster
Abstracts, p. 204-204. Charleston, SC, USA. 2004.
Voller, J., Růžičková, V.: Multiplex polymerase chain reaction assay for identification of exfoliative toxinproducing Staphylococcus aureus strains. In: Sborník příspěvků VIII. Pracovní setkání biochemiků
a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita v Brně, s. 76-77, 2004.
Pekarová, M., Růžičková, V., Petráš, P.: Lyzogénna konverzia exfoliatívneho toxínu A u Staphylococcus aureus.
In: Abstrakty - Tomáškovy dny 2004. Vyd. XII konference. LF MU Brno: Mikrobiologický ústav LF MU
a FN v Brně, s. 16-16, 2004.
Pekarová, M., Růžičková, V.:Horizontal transfer of the eta gene in Staphylococcus aureus. In: Sborník příspěvků
VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita v Brně, s.
61-62, 2004.
Diplomové práce:
Mbaye Abdou Madjib: Molekulární charakterizace toxinogenních kmenů Staphylococcus aureus. 2000.
Školitelka: V. Růžičková.
Hradilová Jana: Studium genomové variability a molekulární identifikace toxin-pozitivních kmenů
Staphylococcus aureus. 2001. Školitelka: V. Růžičková.
Michalová Eva: Detekce genů kódujících faktory virulence u klinicky významných stafylokoků pomocí
specifických primerů a sond. 2002. Školitelka: V. Růžičková.
Pekarová Mária: Vliv lyzogenie na genetické vlastnosti Staphylococcus aureus. 2004. Školitelka: V. Růžičková.
Hrstka Roman: Genotypová variabilita TSST-1 produkujících kmenů Staphylococcus aureus. Školitel: J. Doškař.
Při analýze geonomu Staphylococcus aureus byly zjištěny unikátní nukleotidové sekvence, které byly
zaregistrovány v databázi GenBank:
Doškař, J., Schaffner, G., Kurzbauer, R., Klepárník, K., Oráčová, E., Pantůček, R.: Staphylococcus aureus
bacteriophage phi 3A phi12 major tail protein-like protein, phiSLT ORF116b-like protein, hypothetical
protein, and phi12 tail fiber protein-like protein genes, complete cds, accession number AF513855.
Submitted (20-MAY-2002) to GenBank databáze, 2002.
Pantůček, R., Oráčová, E. and Doškař, J.: Staphylococcus aureus bacteriophage phi 53 phiETA ORF57-like
protein, phiETA ORF58-like protein, phiETA ORF59-like protein, phiPVL ORF17-like protein, and
peptidoglycan hydrolase genes, complete cds, accession number AF513856. Submitted (20-MAY-2002) to
GenBank databáze, 2002.
Pantůček, R., Oráčová, E. and Doškař, J.: Staphylococcus aureus bacteriophage phi 77 phage terminase large
subunit, phiN315 phage protein-like protein, and phiN315 scaffolding protein-like protein genes, complete
cds, , accession number AF513857. Submitted (20-MAY-2002) to GenBank databáze, 2002.
19
Pantůček, R., Kvardová, V., Doškař, J.: Staphylococcus phage 187 putative protein genes, complete cds,
accession number AF515457. Submitted (24-MAY-2002) to GenBank databáze, 2002.
Pantůček, R.: Staphylococcus aureus bacteriophage phi 77 phiN315 phage protein-like protein and phiN315
structural phage protein-like protein genes, partial cds, accession number AY158000. Submitted (02-OCT2002) to GenBank databáze, 2002.
Kašpárek, P., Pantůček, R., Doškař, J.: Staphylococcus phage Twort major capsid protein (mcp) gene, complete
cds, accession number AY362039. Submitted (05-AUG-2003) to GenBank database, 2003.
7. Odchyt hematofágních členovců, hlodavců a roztočů z různých lokalit ČR, izolace
spirochet z těchto vektorů a screening genomu spirochet pomocí PCR
Hematofágní (krevsající) členovci a drobní hlodavci jsou přirozenými vektory a hostiteli
patogenních spirochet Borrelia burgdorferi. Tato bakterie je původcem závažného
multisystémového onemocnění lymeská borrelióza, jehož výskyt je i v našich podmínkách
velice častý. Veškeré studie zaměřené na problematiku přenosu tohoto onemocnění jsou proto
zdrojem informací pro potenciální pacienty, lékaře i badatele, kteří se výzkumem patogenních
agens zabývají.
V rámci tohoto výzkumného záměru byl za sledované období (1999 – 2004) prováděn
pravidelný sběr klíšťat Ixodes ricinus na parkové lokalitě Brno-Pisárky, a příležitostně také na
některých dalších lokalitách České republiky. Celkem se podařilo získat cca 3500 klíšťat
všech vývojových forem, výsledky sběrů byly statisticky zpracovány a vyhodnoceny.
Všechna klíšťata byla podrobena vyšetření na přítomnost spirochet (z uvedeného počtu
vykazovalo pozitivitu 230 klíšťat) a pomocí PCR pak konkrétně na přítomnost druhu Borrelia
sp. Vzorky spirochet z infikovaných klíšťat byly dále použity k izolačním pokusům za účelem
získání spirochetálních kultur, které lze využít jako významný biologický materiál k dalšímu
studiu.
Odchyt hlodavců byl prováděn především na lokalitě Studénka, kde bylo sledováno i
kvantitativní a druhové zastoupení těchto hlodavců. Za sledované období se podařilo odchytit
cca 440 hlodavců a hmyzožravců (rejsci), kteří byli také testováni na přítomnost spirochet se
zaměřením na Borrelia burgdorferi. Studium bylo doplněno sledováním přítomnosti spirochet
u ektoparazitů těchto hlodavců.
Od roku 2000 byla prováděná výzkumná činnost spojená s odchytem, sběrem a analýzou
vzorků obohacena o zástupce hemofágního hmyzu čeledí Simuliidae, Culicidae, Tabanidae,
Muscidae a další nehematofágní členovce (čeledi Trichoceridae, Limoniidae, Chironomidae,
Anisopodidae), u nichž se také podařilo spirochety nalézt.
Ke stanovení spirochet byly používány mikroskopické metody, v roce 2000 byla zavedena
izolace DNA nalezených spirochet a následná jednokroková „Nested PCR“ pro velmi citlivou
detekci druhů Borrelia burgdorferi sensu stricto, Borrelia garinii a Borrelia afzelii., později
byla k druhové identifikaci spirochet použita PCR s následnou restrikční analýzou.
Cílem této výzkumné části bylo získat dostatečné množství vektorů a hostitelů borrelií a
zjistit u nich přítomnost spirochet se zřetelem na Borrelia burgdorferi. Podařilo se získat 57
izolátů spirochet, z toho 34 izolátů z klíšťat, 18 izolátů z hlodavců, 4 izoláty z komárů a 1
izolát z roztoče. Z uvedeného počtu bylo 54 izolátů borrelií. Cíl byl jednoznačně splněn, navíc
se podařilo získat vůbec první výsledky v souvislosti s výzkumem exoparazitů volně žijících
hlodavců jakožto dalších možných vektorů patogenních spirochet, tj. organismů, ve kterých
by mohlo docházet k pomnožení borrelií.
Žákovská, A.: Monitoring of the presence of Borreliae in Ixodes ricinus ticks in Brno park Pisarky, Czech
Republic, Biológia, 55: 6, 2000. IF 0,208.
20
Žákovská, A., Dendis, M., Pejchalová, K.: Spirochaetes in Aedes species, Culex pipiens pipiens larvae and
hibernating Culex pipiens molestus mosquitoes detected with dark field microscopy (DFM) and
polymerase chain reaction (PCR) methods. Biológia, 55:6, 2000. IF 0,208.
Žákovská, A., Čapková, L., Pejchalová, K., Šikulová, S., Halouzka, J., Denis, M.: The study of presence of
spirochetes focused on Borrelia burgdorferi sensu lato with PCR method in haematophagous and non
haematophagous arthropods. Acta Parasitologica 45:215, 2000. IF 0,495
Žákovská, A.: Seasonal distribution of borreliae in Ixodes ricinus ticks in Brno park Pisárky. Scripta Fac. Sci.
Nat. Univ. Masaryk. Brno. Biology 26:33-42, 2000.
Čapková, L., Žákovská, A., Knoz, J., Dendis, M. & Šerý, O.: Further findings of spirochaetal mircroorganisms in
mosquitos and ticks in the Czech Republic. Biológia, Bratislava 57(3):389-394. 2002. IF 0,208.
Žákovská, A., Bašta, J., Horváth, R., Dendis, M., Pejchalová, K., Hulínská, D.:Incidence of Borrelia burgdorferi
sensu lato in Ixodes ricinus ticks using dark-field microscopy and subsequent single-step PCR. Scripta
Fac. Sci. Nat. Univ. Masaryk. Brun., vol. 28, 2002.
Žákovská, A., Nejedlá, P., Holíková, A., Dendis, M.: Positive Findings of Borrelia burgdorferi in Culex (culex)
pipiens pipiens Larvae in the Surrounding of Brno City determined using the PCR Method. Ann. Agric.
Environ. Med., 9: 1-3, 2002. IF 0,827.
Žákovská, A., Čapková, L., A Holíková, A.,Šerý, O.: The presence of Borrelia burgdorferi in Culex (Culex)
pipiens larvae proved by the PCR Metod. Scripta, Fac.Sci.Nat.Univ.Masaryk.Brun. 2002, vol. 28.,
2003.
Žákovská, A., Jörková, M., Šerý, O., Dendis, M.: Spirochaetes in Culex (C.) pipiens s. l. larvae. Biológia,
Bratislava, 59. 2., 283-287, 2004. IF 0,208.
Žákovská, A., Šerý O., Pejchalová K., Bašta J., Horváth R., Janouškovcová E., Halouzka J.: Monitoring of the
presence of Borrelia burgdorferi sensu lato in Ixodes ricinus ticks in the years 1996 - 1998 park Pisarky
(BRNO): Dark - field microscopy and PCR method. Proceeding. 3rd International Conference Tick and
Tick - Borne Pathogens, s.67, 1999.
Bašta, J., Žákovská, A., Horváth, R., Pejchalová, K., Hulínská, D.: Detection Borrelia burgdorferi sensu lato in
Ticks Ixodes ricinus Using Dark – field Microscopy and Subsequent Single – step PCR. VIII.
International Conference on Lyme Borreliosis nad other Emerging Tick – Borne Diseases, Munich,
Germany, June 20 – 24, s. 61, 1999.
Žákovská A., Čapková L., Dendis M.: The Following of Presence of pathogenic Spirochaetes Borrelia
burgdorferi sensu lato with the Method of PCR in haematophagic and non haematophagic Arthropods.
4thWorkshop of Biochemists and Molecular Biologists, Brno, Czech Republic 9.2., s. 67-68, 2000.
Žákovská A., Dendis M., Šerý O.: Sledování přítomnosti spirochet se zvláštním zřetelem na Borrelia burgdorferi
u hematofágních dipter čeledi Culicidae a roztočů v CHKO Poodří. "Příroda Poodří", Bartošovice,
Czech Republic, 14 – 15.4., s. 55-56, 2000.
Žákovská A., Dendis M., Janouškovcová E., Tesařová S.: Identification of Lyme borreliosis causal organism and
its manifestation at vectors and hosts by immunological methods (ELISA, CFR, PAGGE). 4thEFIS
Tatra immunology Conference, Tatranské Zruby Slovakia, 2 –7 September, s. 5, 2000.
Žákovská, L. Čapková, K. Pejchalová, S. Šikutová, M. Dendis, J. Halouzka: Studium přítomnosti spirochet
zaměřené na patogenní Borrelia burgdorferi u hematofágních a nehematofágních zastupců hmyzu.
Zoologické dny, Brno, ČR, 9. – 10.11. s. 93, 2000.
Čapková, L., R. Horváth, A. Žákovská: Identifikace spirochét se zaměřením na Borrelia burgdorferi v trávicím
traktu hematofágních a nehematofágních členovců. X. Tomáškovy dny, Brno, ČR, s. 20, 6.-8. červen
2001.
Pejchalová K., Šikutová S., Halouzka J., Žákovská A.: Sledování výskytu spirochet v hematofágních členovcích
čeledí Culicidae, Simuliidae, Tabanidae a Ixodidae použitím metod DFM a PCR a jejich následná
identifikace. VI. česko-slovenský kongres o infekčních chorobách s mezinárodní účastí, zámek
Mikulov, ČR, s. 68, 11.-14. září 2001.
Čapková L., Horváth R., Žákovská A.: Identification of Borrelia burgdorferi spirochetes in midgut of
haematophagous and non haematophagous arthropods. Scripta Medica (Brno) –75 (1):43-44, 2002.
Čapková L., Žákovská A., Janouškovcová, E., Knoz, J., Šerý, O., Dendis, M.: Presence of Borrelia burgdorferi
as a tick-borne pathogens in mosquitoes. 4th International Conference on Ticks and Ticks Borne
Pathogens. Banff, Alberta, Canada, 21-26 July 2002. P. 78-79, 2002.
Čapková L., Žákovská A., Knoz J., Dendis M., Šerý O.: Borrelia garinii in culex pipiens molestus mosquito and
other spirochaetes findings in culicidae mosquitoes. “VI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních
biologů”, 7.2.2002. Masarykova univerzita v Brně. Sborník příspěvků p. 14, 2002.
21
Mejzlíková, M., Martiníková, H., Žákovská, A.: Srovnání čtyřletého studia 1997-2000 aktivity a pozitivity na
Borrelia burgdorferi v Ixodes ricinus s rokem 2001. “VI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních
biologů”, 7.2.2002. Masarykova univerzita v Brně. Sborník příspěvků p. 54-55, 2002.
Šikutová S., Pejchalová. K. Halouzka J., Žákovská A.: Monitoring of presence of spirochetes in haematophagous
arthropods focused on Borrelia burgdoferi using DFM and PCR methods. Scripta Medica (Brno) –75
(1):40, 2002.
Žákovská, A., Jőrková, M., Halouzka, J., Dendis, M., Netušil, J.: Spirochaetes and pathogenic Borrelia
burgdorferi s.l. in mosquitoes (larva and adulds) in the Czech Republic. Current research in Zoonotic
Ecology and Epidemiology, Kalmar, Sweden, s. 8-36, 16-18 October 2003.
Žákovská, A., Čapková, L., Jurková M.: Pozitivní nálezy Borrelia burgdorferi s.l. v larvách i dospělcích komárů,
Český sjezd o infekčních nemocech, 16.-.18.10., Jihlava. Sborník p. 31, 2002.
Žákovská, A.., Martinková, H.: Long-term monitoring of the prevalence of spirochaete in Ixodes ricinus in
Pisárky lokality, Brno city. IX. European Multicoloquium of Parasitology, Valencia, Spain, s. 411, 18.- 23.
2004.
Netušil, J., Žákovská, A.: Přítomnost spirochety Borrelia burgdorferi sensu lato u roztočů parazitujících u
drobných hlodavců. Tomáškovy dny. Brno, ČR, s. 3, 4.- 6. 6. 2003.
Janouškovcová, E.., Pejchalová, K., Nejedlá, P., Žákovská, A., Halouzka, J., Dendis, M.: Výskyt patogenních
spirochét Borrelia burgdorferi na parkové lokalitě Brno-Pisárky. Česko-slovenská studentská vědecká
konference. Brno, ČR, s. 37, 1.5.2004.
Janouškovcová, E.., Pejchalová, K., Nejedlá, P., Žákovská, A., Halouzka, J., Dendis, M.: Druhové zastoupení
Borrelia burgdorferi na parkové lokalitě Brno-Pisárky. Tomáškovy dny. Brno, ČR, s. 31, 2.- 4. 6. 2004.
Žákovská, A., Martinková, H.: Long-term monitoring of the prevalence of spirochaete in Ixodes ricinus in
Pisárky lokality, Brno city. IX. European Multicoloquium of Parasitology, Valencia, Spain, s. 411, 18.23. 2004
Diplomové práce:
Justinová Lenka: Zpracování výsledků 3 letého pozorování promoření klíšťat spirochtami na lokalitě Pisárky.
2002. Školitel: A. Žákovská.
Stehlíková Martina: Monitorování výskytu spirochet v klíšťatech na lokalitě Pisárky v Brně. 2002. Školitel: A.
Žákovská.
Pejchalová Kateřina: Dynamika výskytu a identifikace spirochet v hematofágních členovcích. 2001. Školitel: A.
Žákovská.
Šikutová Silvie: Ekologie spirochet vybraných skupin hematofágních členovců. 2002. Školitel: A. Žákovská.
Čapková Lucie: Monitorování výskytu spirochet v hematofágních členovcích. 1999. Školitel: A. Žákovská.
Nejedlá Petra: Porovnání dynamiky výskytu Borrelií u klíšťat v lesoparku Pisárky v letech 1996-2001. Sledování
pozitivity na výskyt spirochet v hematofágních členovcích. 2003. Školitel: A. Žákovská.
Holíková Alena: Dynamika výskytu borrelií u klíšťat v lesoparku Pisárky v letech 1996-2001. Sledování
pozitivity na výskyt spirochet v hematofágních členovcích. 2003. Školitel: A. Žákovská.
Biedrawová Agáta.: Obsah slinných žláz u hematofágních členovců. 2003. Školitel: A. Žákovská.
Martiníková Hana: Zpracování výsledků 5 – letého pozorování promoření klíšťat spirochetami na lokalitě
Pisárky v Brně. 2003. Školitel: A. Žákovská.
Netušil Jakub: Přítomnost spirochet u roztočů a jejich hostitelů. 2003. Školitel: A. Žákovská.
Nejedlá Petra: Identifikace neznámých spirochét izolovaných z komárů. Školitel: A. Žákovská.
Netušil Jakub: Studium spirochét u exoparazitů hlodavců a jejich determinace. Školitel: A. Žákovská.
8. Analýza vzorků spirochet se zaměřením na záchyt a identifikaci Borrelia burgdorferi
sensu lato pomocí PCR (nested PCR), charakterizace těchto vzorků a sledování
jejich bílkovinného spektra včetně změn v rámci jednotlivých pasáží (SDS-PAGE).
Borrelia burgdorferi sensu lato představuje v současnosti komplex 11 borreliových
druhů, které mají průkazný vztah k lymeské borrelióze. V České republice se v hojné míře
vyskytují kmeny Borrelia garinii a Borrelia afzelii. Liší se genetickou strukturou, což se
projevuje v odlišném proteinovém složení. Zvláště proteiny vnější bakteriální membrány
jsou silné a významné antigeny, které hrají důležitou roli při vzájemném působení parazit –
22
hostitel. Charakterizace těchto proteinů je nezbytná jak k pochopení mechanismu
patogeneze, tak k objevení efektivních vakcín a imunodiagnostických testů k průkazu
lymeské borreliózy.
Proteinové složení získaných izolátů spirochet (borrelií) bylo sledováno pomocí
gradientové elektroforézy (SDS-PAGE). Tato metoda poskytuje screening až desítek proteinů,
které lze zjišťovat porovnáním s dostupnými referenčními borreliovými kmeny. Takto se
podařilo zjistit některé rozdíly mezi proteiny našich kmenů B. garinii a B. afzelii. V další fázi
byly takto studovány i změny proteinového složení u jednotlivých pasáží izolovaných kmenů
spirochet, a touto metodou tak bylo určeno u všech izolátů spektrum proteinů jakožto
možných antigenů způsobujících patogenní reakce v lidském organismu.
Zjišťování proteinů námi dostupnou metodou přináší mnoho zajímavých informací, ale
vzhledem k podobnosti proteinového složení nejen v rámci jednotlivých borreliových druhů,
ale i mezidruhově, a také naopak díky velkému hmotnostnímu rozpětí hlavních proteinů u
téhož druhu, slouží SDS-PAGE pouze k charakterizaci spirochet a nejde o metodu
identifikační. Identifikace všech 54 borreliových izolátů byla později provedena
průkaznějšími metodami (PCR, restrikční analýza). Výsledky zjištěného proteinového složení
tak představují ucelený soubor informací každého námi izolovaného spirochetálního kmene.
Pro souběžné zjišťování přítomnosti borrelií - B. burgdorferi sensu stricto, B. afzelii nebo
B. garinii v komárech, komářích larvách, klíšťatech a tkáních divoce žijících hlodavců byla
použita vysoce specifická a senzitivní „one tube nested“ PCR. Testováním bylo prokázáno, že
tato detekční metoda používaná v naší laboratoři dokáže zachytit ještě 5 borrelií ve vzorku.
Žákovská, A., E. Janouškovcová, M. Dendis and J. Halouzka: Identification of isolated strains of Borrelia afzelii
from rodent tissues using gradient PAGE and PCR methods. Scripta Fac. Sci. Nat. Univ. Masaryk. Brun.,
vol. 28:51-60, 2002.
Žákovská A., Halouzka J., Janouškovcová E., Horváth R. Changes in Protein Composition of Spirochete Isolates
during the Passage with the PAGGE method. VIII. International Conference on Lyme Borreliosis nad
other Emerging Tick – Borne Diseases, Munich, Germany, s. 85, June 20 – 24, 1999.
Janouškovcová, E., Mejzlíková, M., Pejchalová, K., Nejedlá, P., Halouzka, J., Žákovská, A.: Průkaz pozitivity
Ixodes ricinus na Borrelia burgdorferi na parkové lokalitě Pisárky, Brno metodou kultivace, DFM, PCR.
Pečenkovy epidemiologické dny. Poděbrady, ČR, s. 36, 24. – 26. 9. 2003.
Janouškovcová, E., A. Žákovská, M. Dendis: Identifikace Ag struktur patogenních spirochet Borrelia burgdorferi
a změny proteinového složení jednotlivých pasáží metodou SDS-gradient PAGE. X. Tomáškovy dny, Brno,
ČR, s. 11-12, 6.-8. červen 2001.
Šikutová, S., Pejchalová, K., Janouškovcová E., Čapková, L., Dendis1, M., and Žákovská, A.: The study of
presence and identification of spirochetes focused on Borrelia burgdorferi sensu lato with PCR and SDSPAGGE methods in haematophagous and non haematophagous arthropods, wild-living rodents.
5thWorkshop of Biochemists and Molecular Biologists. Brno, Czech Rep., s. 28, 14. 2. 2001.
Janouškovcová E., Žákovská A., Dendis M.: Identification of Ag structures of Borrelia burgdorferi and protein
changes of individual passages using SDS-gradient PAGGE. Scripta Medica (Brno) –75 (1):37, 2002.
Janouškovcová E., Žákovská A., Dendis M., Halouzka J., Šerý O.: Identifikace 33 izolátů spirochet a určení
patogenní borrelia burgdorferi metodami SDS-gradientová PAGE and PCR. “VI. Pracovní setkání
biochemiků a molekulárních biologů”, 7.2.2002. Masarykova univerzita v Brně. Sborník příspěvků p. 79,
2002.
Diplomové práce:
Janouškovcová Eva: Studium změn bílkovinného spektra spirochet jednotlivých pasáží. 2001. Školitel A.
Žákovská.
Mejzlíková Marie: PCR detekce patogenních spirochet v klíšťatech. 2003. Školitel A. Žákovská.
23
9. Analýza genomu získaných spirochet restrikční analýzou (PCR-RFLP) a stanovení
jejich genetické příbuznosti. Sekvencování DNA z kultur Borrelia burgdorferi
získaných z komárů, komářích larev, klíšťat a divoce žijících hlodavců, identifikace
jednotlivých antigenních struktur odpovědných za patogenitu spirochet
Genomika představuje v základním výzkumu velmi vhodný nástroj k identifikaci
neznámých infekčních agens. Genomová analýza našich vzorků spirochet pomocí restrikčních
endonukleáz byla prováděna dle možností současně se získáváním těchto vzorků, které tak
bylo možné určit do druhů.
Pomocí PCR-RFLP založené na detekci a amplifikaci specifické sekvence genu
kódujícího borreliový flagellin o velikosti 874 bp a jeho následném štěpení restrikční
endonukleázou AluI se podařilo identifikovat 52 druhů borrelií, 2 druhy byly identifikovány
na základě sekvenace.
Spirochetální kmeny získané z klíšťat Ixodes ricinus byly identifikovány jako Borrelia
afzelii, Borrelia garinii, Borrelia burgdorferi sensu stricto a podařilo se zachytit i směsné
infekce B. garinii + B. afzelii a B. garinii + B. burgdorferi sensu stricto. Dva druhy byly
sekvenováním identifikovány jako Borrelia valaisiana. Izoláty získané z divoce žijících
hlodavců (r. Apodemus, r. Microtus, r. Clethrionomys aj.) byly identifikovány jako B. afzelii a
B. garinii. Jediný izolát z roztoče (Haemogamasus sp.) představuje B. afzelii a velice vzácný
je jeden záchyt B. afzelii u komára Culex pipiens molestus. Těmito výsledky tak byl potvrzen
výskyt nejen hlavních borreliových druhů České republiky, ale i spektrum potenciálních
přenašečů borrelií.
Celá studie byla založena na standardizaci stanovení B. afzelii, B. garinii a B. burgdorferi
sensu stricto pomocí RFLP, která byla stěžejní metodou této části výzkumného záměru.
V roce 2003 však bylo zahájeno i studium neznámých spirochet založené na analýze OspC
genu, které je však v počátečním stádiu výzkumu. Cíle však byly splněny a soubor získaných
izolátů představuje vzácný biologický materiál pro další studie.
Janouškovcová, E., Žákovská A., Halouzka, J., Dendis, M: Occurrence of Borrelia afzelii and Borrelia garinii in
Ixodes ricinus Ticks from Southern Moravia, Czech Republic. Vector Borne Zoonotic Dis. 4 (1), 43-52,
2004.
Netušil, J., Žákovská, A., Horváth, R., Dendis, M.: The presence of Borrelia burgdorferi sensu lato in mites
parasiting at small rodents. Vector Borne and Zoonotic Dis. accepted manuskript.
Abstrakta z konferenc:í
Janouškovcová, E., Žákovská, A., Dendis, M.: Identifikace 33 izolátů spirochet a určení patogenní Borrelia
burgdorferi u vzorků izolovaných z roztočů, klíšťat, komárů a hlodavců. VI. česko-slovenský kongres o
infekčních chorobách s mezinárodní účastí, zámek Mikulov, ČR, s. 67, 11.-14. září 2001.
Janouškovcová, E., Žákovská, A., Dendis, M., Halouzka, J., Šerý, O.: Výskyt a identifikace patogenních
spirochet Borrelia burgdorferi izolovaných z klíšťat, roztočů, hlodavců a komárů. Zoologické dny.
Brno, Czech Rep., 14.-15. 2. 2002. Sborník p. 172, 2002.
Janouškovcová, E., Žákovská, A., Halouzka, J., Dendis, M.: Borrelia burgdorferi – identifikace izolátů
patogenních spirochet. III. zjazd MES SLS 11.-13.9.2002. Správy klinickej mikrobiologie, II/D: 46-47,
2002.
Janouškovcová, E., Žákovská, A., Halouzka, J., Dendis, M.: Identification of 33 isolated strains of Borrelia
burgdorferi obtained from various host and vectors using RFLP-PCR NAD gradient PAGE methods. 4th
International Conference on Ticks and Ticks Borne Pathogens. Banff, Alberta, Canada, 21-26 July
2002. P. 36, 2002.
24
Janouškovcová E., Žákovská A., Halouzka J., Dendis M. (2002): Identifikace 33 izolátů Borrelia burgdorferi
z různých hostitelů a vektorů metodami gradient-PAGE, PCR a RFLP. 18. Pečenkovy epidemiologické
dny, 24.-26. Září 2002, Pec pod Sněžkou. Sborník s. 72, 2002.
Janouškovcová, E., Žákovská, A., Halouzka, J., Dendis M.,: Borrelia burgdorferi – identifikace získaných
izolátů metodami PAGE, PCR a RFLP, XI. Tomáškovy dny 2002 Brno 5.-7.6.2002. Sborník p. 7-8,
2002.
Janouškovcová, E.., Pejchalová, K., Nejedlá, P., Žákovská, A., Halouzka, J., Dendis, M.: Druhové zastoupení
Borrelia burgdorferi na parkové lokalitě Brno-Pisárky. Tomáškovy dny. Brno, ČR, s. 31, 2.- 4. 6. 2004.
Pejchalová, K., Janouškovcová, E.., Nejedlá, P., Žákovská, A., Halouzka, J., Dendis, M.: Identification of
Borrelia burgdorferi from Ixodes ricinus from Southern Moravia, Czech Republic. CMI, 14thEuropean
Congress of Clinical Mikrobiology and Infection Diseases. Prague, CR, s. 660, 1.-4. 5. 2004.
Janouškovcová E., Pejchalová, K., Vostal K., Nejedlá, P. Holíková, A., Mejzlíková, M., Martinková, H.
Žákovská, A. Halouzka, J. Denis, M.: Species identification of Borrelia burgdorferi sensu lato from
tick, rodent, mite and mosquito isolates in the Czech Republic. IX. European Multicoloquium of
Parasitology, Valencia, Spain, s. 413, 18.- 23. 2004.
Janouškovcová Eva: Sledování přítomnosti spirochet a jejich identifikace u hematofágních a nehematofágních
členovců a obratlovců v ČR. 2004. Školitel: A. Žákovská.
Pejchalová Kateřina: Studium výskytu Borrelia burgdorferi u obratlovců. Školitel: A. Žákovská.
Vostal Karel: Studium výskytu Borrelia burgdorferi u hlodavců. Školitel: A. Žákovská.
10. Zavedení metodiky Western blot ke zjišťování antigenní schopnosti určitých
boreliových proteinů (tj. schopnosti vyvolat imunitní odpověď), sledování výskytu
borreliových protilátek a imunizace myší jednoho inbredního kmene stejným
boreliovým antigenem získaným z různých zdrojů (vektor, hostitel) s cílem
identifikovat, které antigeny se podílejí na imunitní odpovědi, a jak silná je jejich
odpověď
Zavedení metodiky Western blot v roce 2003 bylo základním krokem pro možnost
ověření přítomnosti antiborreliových protilátek v sérech různých organismů, které bylo
doposud sledováno pomocí metodik ELISA. Western blot byl použit především k potvrzování
pozitivity výskytu onemocnění LB u policejních psů, ale metoda bude dále využita ke
zjišťování antigenních schopností určitých borreliových proteinů vyvolat imunitní odpověď.
V roce 2004 jsme se kromě uvedených cílů zaměřili také na sledování či pokračování
sledování výskytu antiborreliových protilátek u hlodavců, kde bylo např. vyšetřeno 203
drobných hlodavců, z nichž 7 bylo na výskyt živé kultury borrelií pozitivních. Sledování
přítomnosti antiborreliových protilátek bude ale ještě dokončeno ELISA detekcí.
Do této části výzkumného záměru byly také zahrnuty imunizační pokusy. Ve snaze zjistit,
zda existují antigenní rozdílnosti u jednotlivých borreliových izolátů stejného druhu (B.
afzelii), které byly získány z různých zdrojů (klíště, komár, hlodavec), proběhly imunizační
pokusy na inbredních myších kmene BALB/C, a byly také shrnuty výsledky imunizačních
pokusů na divokých hlodavcích.
Vostal, K., Žákovská, A.: Two year study of Examination of Blood from Wild-living Rodents for the Presence of
Antiborrelian Antibodies, Ann Agric Environ Med. 10: 203-206, 2003.
Pejchalová K., Žákovská A., Fučík K., Schánilec P., 2004. Serological Confirmation of Borrelia burgdorferi
Infection in Dogs in the Czech Republic. Veterinary research communications, accepted manuscript.
25
Žákovská A., Nečasová M., Halouzka J., Janouškovcová E. Sledování pozitivity na výskyt spirochet se
zvláštním zřetelem na Borrelia burgdorferi v sérech, tkáních a orgánech divoce žijících hlodavců
v CHKO Poodří. "Příroda Poodří", Bartošovice, Czech Republic, 14 – 15.4.2000
Vostal K., Žákovská A.: The study of antiborrelian antibodies in 110 sera from students on various antigens of
borrelia burgdorferi s.l., International Conference on Lyme Borreliosis 15.-16.11 2001, Brussel,
Belgiím, s. 4, 2001.
Žákovská A., Halouzka J., Nečasová M., Šerý O.: Studium pozitivity na přítomnost patogenní Borrelia
burgdorferi u divokých zvířat – jako hostitelů pro přenašeče Lymeské borreliózy. 17. Pečenkovy
epidemiologické dny, Třeboň, ČR, s. 19-20, 9.-11. 10. 2001.
Vostal K. & Žákovská A.: Detekce přítomnosti protilátek proti Borrelia afzelii v krvi divoce žijících hlodavců,
Tomáškovy dny, 5. - 7. 6. 2002, Brno, Czech Republic. Sborník p. 10, 2002.
Vostal K., Žákovská A.: Detekce přítomnosti antiborreliových protilátek u hlodavců, Zoologické dny. Brno,
Czech Rep., 14.-15. 2. 2002. Sborník p. 172-173, 2002.
Žákovská, A., Vostal K., Nečasová M., Janouškovcová, E. (2002): Detection of the presence of anti-Borrelia
antibodies and isolation of Borrelia afzelii from tissue of wild rodents. 4th International Conference on
Ticks and Ticks Borne Pathogens. Banff, Alberta, Canada, 21-26 July 2002. P. 36-37, 2002.
Pejchalová, K., Vostal, K., Netušil, J.: Sledování reakce u psů a hlodavců na přítomnost Borrelia burgdorferi s.l.
a detekce této bakterie u parazitujících roztočů. VIII. Česko-slovenský kongres o infekčních nemocech.
Pec pod Sněžkou, ČR, s. 119, 23-26. 9. 2003.
Rusňáková, H., Benešová, J., Žákovská, A.: Tvorba specifických protilátek třídy IgM a IgG proti Borrelia afzelii
u laboratorně očkovaných myší. Zoologické dny. Brno, ČR, s. 112, 13.-14. 2. 2003.
Pejchalová, K., Žákovská, A., Schánilec, P.: Serological study of dogs for the presence of anti-borrelia
burgdorferi s.l. antibodies. 8thWorkshop of Biochemists and Molecular Biologists. Brno, Czech Rep., s.
29, January 2003.
Vostal, K., Žákovská, A.: Examination of blood from wild-living rodents for the presence of antiborrelian
antibodies. 7thWorkshop of Biochemists and Molecular Biologists. Brno, Czech Rep., s. 31, January
2003.
Vostal, K., Žákovská, A., Nečasová, M.: A five-year study of the presence of Borrelia burgdorferi and antibodies
to borrelia in small rodents. Current research in Zoonotic Ecology and Epidemiology, Kalmar, Sweden,
16-18 October 2003, s. 9-37, 2003.
Pejchalová, K., Vostal, K., Netušil., J., Žákovská, A., Schánilec, P.: Zjisťování přítomnosti protilátek proti
Borrelia burgdorferi sensu lato u služebních psů, hlodavců a detekce této bakterie u parazitujících
roztočích. Tomáškovy dny. Brno, ČR, s. 40, 2.- 4. 6. 2004.
Vostal, K., Netušil, J. Žákovská, A.: Přítomnost protilátek proti Borrelia burgdorferi sensu lato u hlodavců a
výskyt této spirochety v na nich parazitujících roztočích. Česko-slovenská studentská vědecká
konference. Brno, ČR, s. 92, 1.5.2004.
Pejchalová, K., Žákovská, A., Fučík, K., Schánilec, P.: Frekvence výskytu antiborreliových protilátek u populace
služebních psů. Česko-slovenská studentská vědecká konference. Brno, ČR, s. 59, 1.5.2004.
Pejchalová, K., Žákovská, A., Fučík, K., Schánilec, P.: Serological Confirmation of Borrelia burgdorferi
Infection in Dogs from the Czech Republic. IX. European Multicoloquium of Parasitology, Valencia,
Spain, s. 412, 18.- 23. 2004.
Vostal, K., Netušil, J., Žákovská, A.: Detection of antiborrelian antibodies in blood of small rodents and the
occurence of borreliae in mites parasiting on them. IX. European Multicoloquium of Parasitology,
Valencia, Spain, s. 414, 18.- 23. 2004.
Diplomové práce:
Tesařová Soňa: Sledování výskytu antiborreliových protilátek u divoce žijících zvířat. 2000. Školitel: A.
Žákovská.
Nečasová Marcela: Sledování výskytu antiborreliových protilátek v sérech hlodavců. 2000. Školitel: A.
Žákovská.
Rašková Gabriela: Využití imunologické metody Elisa k analýze vzorků sér k identifikaci patogenních
onemocnění. 2002. Školitel: A. Žákovská.
Vostal Karel.: Zaváděcí metodiky Elisa pro lékařské účely. 2002. Školitel: A. Žákovská.
Kudlová Manuela: Imunologické analýzy vzorků pacientů s nervovými potížemi, zaměřené na sledování
onemocnění Lymeská borrelióza. 2000. Školitel: A. Žákovská.
26
Rusňáková Helena: Analýza antigenních vlastností patogenní Borrelia burgdorferi s. l. izolované z různých
hostitelů imunologickými metodami. Školitel: A. Žákovská.
27
Genom rostlin (garant: doc. RNDr. Břetislav Brzobohatý, CSc.)
Studium vztahů mezi strukturou a funkcí vybraných klíčových proteinů metabolizmu a
signálních drah u rostlin
Pozornost byla věnována především studiu vztahů mezi strukturou a funkcí βglukozidázy Zm-p60.1, která uvolňuje biologicky aktivní formy cytokinů z jejich neaktivních
O- a N3-glukozidů. Byly vypracovány postupy její produkce v bakteriálním expresním
systému a jednokrokové purifikace. Dostupnost homogenního preparátu v miligramových
množstvích umožnila najít podmínky pro její krystalizaci. Krystalografická analýza vedla
k vyřešení trojrozměrné struktury. Počítačovou analýzou trojrozměrné struktury, která byla
nejprve získána matematickým modelováním a následně upřesněna krystalografickou
analýzou, jsme předpověděli aminokyselinové zbytky, které se pravděpodobně podílejí na
stabilizaci katalyticky aktivní formy enzymu, katalytickém kroku a determinaci substrátové
specificity. Místně cílenou mutagenezí a následnou molekulární a kinetickou analýzou mutant
jsme získali funkční potvrzení platnosti většiny těchto předpovědí. Současně jsme touto
cestou získali originální poznatky, které není možné dedukovat statickou analýzou struktury.
Byla započata podrobná analýza molekulární determinace specificity Zm-p60.1 vůči
aglykonové části substrátu. Místně řízenou metagenezí a analýzou kinetických parametrů
mutantních forem enzymu byly získány nové poznatky o úloze jednotlivých
aminokyselinových zbytků klastru F193-F200-F461-W373, který se podílí významným
způsobem na vazbě aglykonové části substrátu (Fohlerová et al., připravováno k publikaci).
Byly připraveny kokrystaly mutantní formy Zm-p60.1 (E186Q) se substrátem (dihydrozeatinO-glukozidem) a krystalografickou analýzou (synchrotron Grenobl) vyřešena jejich struktura,
která slouží pro určení strukturních determinant specificity rozpoznání O-glukozidů
cytokininů tímto enzymem (Marek et al., připravováno k publikaci).
Kuderová, A., Nanak, E., Truksa, M., Brzobohatý, B.: Use of Rifampicin in T7 RNA Polymerase-Driven
Expression of a Plant Enzyme. Rifampicin Improves Yield and Assembly. Protein Expression and
Purification, 16, 3:405-409, 1999. IF 1,822.
Zouhar, J., Nanak, E., Brzobohatý, B.: Expression, single step purification and matrix-assisted refolding of
cytokinin-specific beta-glucosidase. Protein Expression and Purification 17: 153 –162, 1999. IF 1,822.
Zouhar, J.: Afinitní chromatografie proteinů na vázaných kovových iontech. Chemické listy, 1999. IF 0,159.
Zouhar, J., Vévodová, J., Marek, J., Damborský, J., Su, X.-D., Brzobohatý, B.: Insights into the Functional
Architecture of the Catalytic Center of a Maize β-Glucosidase Zm-p60.1. Plant Physiology. ISSN 00320889, 127 (3): 973-985, 2001. IF 4,831.
Vévodová, J., Marek, J., Zouhar, J., Brzobohatý, B., and Su, X.-D.: Purification, Crystallization and Preliminary
X-ray Analysis of a Maize Cytokinin-glucoside-specific β-Glucosidase. Acta Crystallographica, Sect. D.,
ISSN 0907-4449, vol. D57, no. 1, pp. 140-142, 2000. IF 3,067.
Rotrekl, V., Nejedlá, E., Kučera, I., Abdallah, F., Palme, K., Brzobohatý, B.: The role of cysteine residues in
structure and enzyme activity of a maize beta-glucosidase. European Journal of Biochemistry, 1999. IF
3,578.
Vyhledávání genů kódujících proteiny se strukturními charakteristikami typickými pro
regulační proteiny a analýza jejich biologické funkce
Byla provedena počítačová analýza sekvencí rodin genů sensor-histidin kináz a
předpokládaných následných článků signálních řetězců těchto receptorů - AHP a ARR
v sekvenci genomu Arabidopsis thaliana. Byl vypracován software, který usnadňuje
28
optimalizaci primerů a PCR podmínek pro jednoznačnou identifikaci inzerčních mutant
v jednotlivých genech takto komplexních a sekvenčně blízce příbuzných rodin genů.
S využitím tohoto bioinformatického nástroje byly ve sbírkách linií Arabidopsis thaliana
mutagenizovaných transposony případně T-DNA identifikovány linie nesoucí inzerce v řadě
z těchto genů. Pro detailní charakterizaci byly vybrány linie nesoucí inzerce v genech CKI1,
AHP4, ARR4 a ARR21. Analýza těchto mutant vedla k porozumění biologické funkce
uvedených genů. V součinnosti s komplementárním projektem byla objevena funkce genu
CKI1 ve vývoji samičího gametofytu. Analýzou inzerční mutace v ARR4 byly získány
výsledky svědčící o účasti tohoto genu v signální dráze fytochromu. Byla provedena
molekulární a fyziologická charakterizace mutace v genu ARR21. Byla dokončena detailní
analýza expresního profilu genu ARR21 v průběhu životního cyklu Arabidopsis thaliana.
Zjištěná silná indukce exprese ARR21 v šešulích naznačuje možnou úlohu tohoto genu
v regulaci reproduktivního vývoje. Při analýze expresních profilů rodiny genů AHP u
Arabidopsis thaliana byl objeven orgánově specifický sestřih u genu AHP5 (Hradilová a
Brzobohatý, připravováno).
Horák, J., Brzobohatý, B., and Lexa, M.: Molecular and physiological characterization of an insertion mutant in
the ARR21 putative response regulator gene from Arabidopsis thaliana. Plant Biology, 5, 245-254, 2003.
IF2002 1,352.
Horák, J., Lexa, M.: Dvoukomponentní systémy: regulátory odpovědi a přenos signálu u Arabidopsis thaliana.
Biologické listy 67 (4), 297- 317, 2003.
Lexa, M., Horák, J., Brzobohatý, B.: Virtual PCR. Bioinformatics, ISSN 1367-4803, vol. 17, no. 2, pp. 192-193,
2001. IF 2,259.
Hejátko, J., Pernisová, M., Eneva, T., Palme, K., and Brzobohatý, B.: The putative sensor histidine kinase CKI1
is involved in female gametophyte development in Arabidopsis. Molecular Genetics and Genomics, 269,
443-453, 2003. IF2002 1,522.
Studium vlivu řízené ektopické exprese vybraných genů na vývoj rostlin
Byl vypracován systém regulovatelné exprese genu kódujícího klíčový enzym
biosyntézy cytokininů, IPT, v transgenních rostlinách Nicotiana tabacum a Arabidopsis
thaliana. Byly analyzovány vlivy exprese ipt v průběhu klíčení a časného vývoje semenáčků.
Změny ve spektru a hladinách endogenních cytokininů (CK) vykazují u obou rostlin řadu
společných rysů. Významná část fenotypových změn navozených zvýšenými hladinami CK je
však u těchto rostlin podstatně odlišná. Bylo prokázáno, že konstitutivní zvýšení hladin
endogenních cytokininů vede ke snížení hladin nitrát reduktázy v semenáčcích Nicotiana
tabacum. Vystavení semenáčků krátkému působení benzyladeninu eliminuje uvedený
inhibiční účinek konstitutivně zvýšených hladin endogenních cytokininů. Bylo prokázáno, že
zvýšení hladin cytokininů navozené aktivitou IPT vede ke zvýšení biosyntézy etylénu u
semenáčků Nicotiana tabacum. Byla zkoumána role interakce mezi působením cytokininů a
etylénu na fenotypové projevy navozené indukcí exprese ipt. Byl vyvinut a validován model
simulující dynamiku metabolitů endogenních cytokininů u semenáčků Nicotiana tabacum.
Lexa, M., Genkov, T. N. and Brzobohatý, B.: Inhibitory effects of elevated endogenous cytokinins on nitrate
reductase in ipt-expressing tobacco are eliminated by short-term exposure to benzyladenine. Physiologia
Plantarum, 115 (2):284-290, 2002. IF 1,760.
Lexa, M., Genkov, T.N., Malbeck, J., Macháčková, I., and Brzobohatý, B.: Dynamics of endogenous cytokinin
pools in tobacco seedlings: A modeling approach. Annals of Botany, 91(5):585-597, 2003. IF2002 1,476.
Šámalová, M., Brzobohatý, B., and Moore, I.: pOp6/LhGR: a stringently regulated and highly responsive gene
expression system for tobacco. The Plant Journal, in press, IF2003 5,914
29
Analýzy proteomu Arabidopsis thaliana při studiu role cytokininů v regulaci vývoje rostlin.
Byly rozpracovány metodiky extrakce celkových proteinů z Arabidopsis thaliana
kultivovaných za různých podmínek. Pro získané extrakty byly optimalizovány podmínky
separace proteinů dvourozměrnou elektroforézou. Ve spolupráci se zahraničním pracovištěm
byly srovnány metodiky vizualizace proteinových skvrn v gelech a jejich kompatibilita
s následnou identifikací proteinů metodou MALDI-TOF. Optimální podmínky byly využity
pro analýzu vlivu modifikací hladin endogenních cytokininů na dynamiku proteomu
Arabidopsis thaliana. Byla vypracována první databáze změn proteomu semenáčků
Arabidopsis thaliana kultivovaných za podmínek standardní fotoperiody v odpovědi na
změny hladin cytokininů.
Váňová, P., Chevalier, F., Böhmová, G., Konečná, H., Zdráhal, Z., Rossignol, M., Brzobohatý, B.: Effect of
endogenous cytokinin levels on the Arabidopsis thaliana proteome. In Chemica 43S Supplement (Collected
Reports of the Natural Science Faculty Palacký University Olomouc Czech Republic). Olomouc : Palacký
University, s. 24-24, 2004.
Váňová, P., Chevalier, F., Böhmová, G., Konečná, H., Zdráhal, Z., Rossignol, M., Brzobohatý, B.: Struktura
proteinových profilů rostlin Arabidopsis thaliana s rozdílnými hladinami endogenních cytokininů. In Československá studentská vědecká konference 1.5.2004. Sborník abstraktů. Brno, Česká republika : Masarykova
univerzita v Brně, s. 90-90, 2004.
Dále jsou uvedena abstrakta z konferencí, diplomové a disertační práce za všechny
předešlé části genomu rostlin
Beránek, M. - Jandík, P. - Bures, J. - Palicka, V. - Nejedlá, Eliška - Klánová, Jana. K-ras mutations in colorectal
carcinomas in the Czech republic. In IFCC-WorldLab´99. Firenze : Walter de Gruyter, Berlin, New York,
1999. od s. S 220, 1 s. Clinical Chemistry and Laboratory Medicine, vol.37. ISBN ISSN 1437-8523. MSM
143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
Beránek, Martin - Bureš, J. - Palička, Vladimír - Nejedlá, Eliška - Klánová, Jana. Detekce bodových mutací kras genu v bioptických vzorcích kolorektálního karcinomu. In Biochemie a molekulární biologie na prahu
nového tisíciletí. Brno : Masarykova univerzita, 2000. s. 4-5. 3. pracovní setkání biochemiků a
molekulárních biologů. ISBN 80-210-2266-3. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
Böhmová, Gabriela - Konečná, Hana - Váňová, Pavlína - Zdráhal, Zbyněk - Brzobohatý, Břetislav. Změny
proteinových spekter A. thaliana vyvolané zvýšením hladin endogenních cytokininů. In 1. Česká
proteomická konference. Liběchov : Ústav živočisné fyziologie a genetiky AVČR, 2004. s. 20-20. MSM
143100008, záměr.
Böhmová, Gabriela - Váňová, Pavlína - Konečná, Hana - Zdráhal, Zbyněk - Brzobohatý, Břetislav. Arabidopsis
thaliana proteome influenced by plant hormones cytokinins. In VIII.Pracovní setkání biochemiků a
molekulárních biologů. 1. vyd. Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2004. s. 23-23. ISBN 80-210-3321-5.
MSM 143100008, záměr.
Borkovcová, Petra - Zdráhal, Zbyněk - Konečná, Hana - Brzobohatý, Břetislav. The Receiver Domain: Attempts
at Biochemical Characterization. In VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů.
Přírodovědecká fakulta MU v Brně : Masarykova univerzita v Brně, 2003. s. 17-17. ISBN 80-210-3053-4.
MSM 143100008, záměr.
Brzobohatý, Břetislav - Genkov, Todor Nikolaev - Nejedlá, Eliška - Nejedlík, Jan - Dubová, Jaroslava Malbeck, Jiří - Vágner, Martin - Moore, Ian. Phenotype alterations accompanying activation of a cytokinin
biosynthesis gene, ipt, during germination and early seedling development in tobacco. In Plant Biology 2002
Final Program, Denver, Colorado, USA, August 3-7, 2002. Denver, USA : ASPB, 2002. s. 118-118.
IAA5004001, projekt VaV. KSK5052113, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
Genkov, Todor Nikolaev - Dubová, Jaroslava - Guo, Jianchun - Reková, Alena - Nejedlá, Eliška - Lexa, Matej Nejedlík, Jan - Malbeck, Jiří - Vágner, Martin - Moore, Ian - Brzobohatý, Břetislav. Tobacco and
30
Arabidopsis seedling development upon activation of ipt, a cytokinin biosynthesis gene. European Journal
of Biochemistry, Oxford : Blackwell Science, 269, Supp. 1s. 39-39. ISSN 0014-2956. 2002. IAA5004001,
projekt VaV. KSK5052113, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
Genkov, Todor Nikolaev - Dubová, Jaroslava - Guo, Jianchun - Reková, Alena - Nejedlá, Eliška - Lexa, Matej Nejedlík, Jan - Malbeck, Jiří - Vágner, Martin - Moore, Ian - Brzobohatý, Břetislav. Distinct responses to
activation of a cytokinin biosynthesis gene, ipt, in tobacco and Arabidopsis seedling development. In 13th
Congress of the Federation of European Societies of Plant Physiology, Hersonissos, Heraklion, Crete,
Greece, 2-6 September 2002, Book of Abstracts. Hersonissos, Greece : FESPP, 2002. s. 130-130.
Genkov, Todor Nikolaev - Vágner, Martin - Dubová, Jaroslava - Malbeck, Jiří - Moore, Ian - Brzobohatý,
Břetislav. INCREASED ETHYLENE PRODUCTION CAN ACCOUNT FOR SOME OF THE
PHENOTYPE ALTERATIONS ACCOMPANYING ACTIVATION OF A CYTOKININ BIOSYNTHESIS
GENE, IPT, DURING GERMINATION AND EARLY SEEDLING DEVELOPMENT IN TOBACCO. In
NATO ADVANCED RESEARCH WORKSHOP ON BIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY OF THE
PLANT HORMONE ETHYLENE 2002. Murcia (Spain) : A.G. Novograf, S.A, 2002. s. 86-86.
Hejátko, Jan - Borkovcová, Petra - Pernisová, Markéta - Taenzler, Petra - Palme, Klaus - Brzobohatý, Břetislav.
Mutations in CKI1 Block Female Gametophyte Development in Arabidopsis thaliana. In 13-th Congress of
the European Societies of Plant Physiology. Heraklion, Crete, Greece : 13th FESPP Congress Secretariat,
Department of Biology, University of Crete, 2002. s. 303-303. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr.
Hejátko, Jan - Borkovcová, Petra - Pernisová, Markéta - Taenzler, Petra - Palme, Klaus - Brzobohatý, Břetislav.
MUTATIONS IN CKI1 BLOCK FEMALE GAMETOPHYTE DEVELOPMENT IN ARABIDOPSIS
THALIANA. In Progress in Basic, Applied and Diagnostic Histochemistry. The 39-th Symposium with
International Participation. Brno, Česká republika : Masarykova univerzita v Brně pro Czech Society for
Histo- and Cytochemistry, Kamenice 3, Brno, 2002. s. 20-20. ISBN 80-210-2998-6. LN00A081, projekt
VaV. MSM 143100008, záměr.
Hejátko, Jan - Pernisová, Markéta - Dobešová, Romana - Horák, Jakub - Brzobohatý, Břetislav. Inzerční
mutageneze ve funkční genomice Arabidopsis thaliana. In Kniha abstrakt, 3. metodické dny, Žďárske vrchy,
Milovy. Praha : Česká společnost experimentální biologie rostlin, Ústav experimentální botaniky AV ČR,
2003. s. 23-23. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
Hejátko, Jan - Pernisová, Markéta - Eneva, Tinka - Palme, Klaus - Brzobohatý, Břetislav. Investigating the role
of sensor histidine kinase CKI1 in Arabidopsis using a reverse genetics approach. In Book of Abstracts,
Plant GEMs/GARNet, Plant Genomic European Meetings, York, U.K. York : Plant GEMS/GARNet, 2003.
s. 179-179. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
Hejátko, Jan - Pernisová, Markéta - Eneva, Tinka - Palme, Klaus - Brzobohatý, Břetislav. The gametophytic
expression of the gene for sensor histidine kinase CKI1 is essential for embryo sac formation in
Arabidopsis. In Book of Abstracts, Plant reproduction: from Mendel to molecular biology. Brno : MU Brno,
2003. s. 67-67. ISBN 80-210-3194-8. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt
VaV.
Hejátko, Jan - Pernisová, Markéta - Eneva, Tinka - Palme, Klaus - Brzobohatý, Břetislav. The putative sensor
histidine kinase CKI1 is involved in Arabidopsis female gametophyte development. In Book of Abstracts,
Plant Biology 2003. Hawai, USA : ASPB, 2003. s. 121-121. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr. VS96096, projekt VaV.
Hejátko, Jan - Pernisová, Markéta - Eneva, Tinka - Palme, Klaus - Brzobohatý, Břetislav. CKI1, a putative
sensor histidine kinase is essential for proper female gametophyte formation in Arabidopsis thaliana. In
Boook of Abstracts, Cytokinematics 2004, Microscopy of Live Cells in the Post Genomics Era. The 8th
Symposium on Light Microscopy & Live Cells in Hradec Kralove. Hradec Králové : RNDr. F. Skopec,
CSc.-NUCLEUS HK, 2004. s. 22-22. ISBN 80-86225-60-7. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008,
Hradilová, Jana - Brzobohatý, Břetislav. Tissue specific alternative splicing in the gene for AHP5, a histidinecontaining phosphotransfer protein from Arabidopsis thaliana. In IV. Mezioborové setkání mladých biologů,
biochemiků a chemiků, Chemické listy. Praha : Česká společnost chemická, 2004. s. 282-282. ISBN 00092770. MSM 143100008, záměr.
Hradilová, Jana - Brzobohatý, Břetislav. TISSUE SPECIFIC ALTERNATIVE SPLICING IN THE GENE FOR
AHP5, A HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOTRANSFER PROTEIN FROM ARABIDOPSIS
THALIANA. In VIII.Pracovní setkání biochemik a molekulárních biolog. 1. vyd. Brno : Masarykova
univerzita v Brn, 2004. od s. 25-26, 2 s. ISBN 80-210-3321-5. MSM 143100008, záměr.
31
Hradilová, Jana - Brzobohatý, Břetislav. Characterization of the expression pattren of the Arabidopsis AHP
factores gene family. Bratislava : Dni rastlinnej fyziológie X., 2004. 1 s. Book of abstract. MSM
143100008, záměr.
Kiran, Nagavalli Subbanna - Genkov, Todor Nikolaev - Malbeck, Jiří - Brzobohatý, Břetislav. APPROACHES
TO ELUCIDATING THE ROLE OF SUBCELLULAR COMPARTMENTATION IN THE
REGULATION OF CYTOKININ METABOLISM. In VI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních
biologů, Sborník příspěvků. Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2002. s. 64-64. ISBN 80-210-2777-0.
AV0Z5004920, záměr. GV206/96/K188, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
Kiran, Nagavalli Subbanna - Reková, Alena - Válková, Martina - Malbeck, Jiří - Brzobohatý, Břetislav. Ectopic
overexpression of a Maize beta-glucosidase Disrupts Cytokinin Metabolism in Transgenic Tobacco. In
Book of Abstracts, Plant Physiology Conference of Ph.D. Students and Young Scientists 2003. Brno :
Katedra anatomie a Fyziologie Rostlin, Masarykovy Univerzity, 2003. s. 133-135. ISBN 80-7157-676-X.
AV0Z5004920, záměr. GV206/96/K188, projekt VaV. IAA5004001, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr.
Overexpression of a Maize beta-glucosidase may Disrupt Cytokinin Homeostasis in Transgenic Tobacco. In
Sborník Příspěvků VII. Pracovní Setkání Biochemiků a Molekulárních Biologů. Brno : Katedra Biochemie
Masarykovy Univerzity, 2003. s. 23-23. ISBN 80-210-3053-4. AV0Z5004920, záměr. GV206/96/K188,
projekt VaV. IAA5004001, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
overexpression of a Maize beta-glucosidase Disrupts Cytokinin Metabolism in Transgenic Tobacco. In
Book of Abstracts, Plant Biology 2004. Florida, USA : Neuveden, 2004. s. 121-121. AV0Z5004920, záměr.
GV206/96/K188, projekt VaV. IAA5004001, projekt VaV. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr.
overexpression of a Maize beta-glucosidase Interferes with Cytokinin Homeostasis in Transgenic Tobacco.
In 18th IPGSA Conference, Book of Abstracts. Canberra, Australia : The Australian National University,
Canberra, Australia, 2004. s. 115-115. AV0Z5004920, záměr. GV206/96/K188, projekt VaV. IAA5004001,
projekt VaV. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
Kiran, Nagavalli Subbanna - Reková, Alena - Válková, Martina - Malbeck, Jiří - Brzobohatý, Břetislav.
Overexpression of a Maize beta-glucosidase Disrupts Cytokinin Metabolism in Transgenic Tobacco. In X.
Days of Plant Physiology, Book of Abstracts. Bratislava : Department of Plant Physiology, Comenius
University, Bratislava, 2004. s. 47-47. AV0Z5004920, záměr. GV206/96/K188, projekt VaV. IAA5004001,
projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
Kiran, Nagavalli Subbanna - Reková, Alena - Válková, Martina - Malbeck, Jiří - Brzobohatý, Břetislav.
Overexpression of a Maize beta-glucosidase Disrupts Cytokinin Metabolism in Transgenic Tobacco. In Acta
Physiologiae Plantarum - Supplement 14th FESPB Congress Book of Abstracts. Krakow : Polish Academy
of Sciences, 2004. od s. 51-52, 2 s. ISBN 0137-5881. AV0Z5004920, záměr. GV206/96/K188, projekt VaV.
IAA5004001, projekt VaV. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
Konečná, Hana. Modifikované syntetické oligonukleotidy. In Biochemie a molekulární biologie na prahu nového
tisíciletí. Brno : Masarykova univerzita, 2000. s. 74-75. IV. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních
biologů (přednáška). ISBN 80-210-2266-3. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
Konečná, Hana. Nový typ informační molekuly: PNA. In Biochemie a molekulární biologie na prahu nového
tisíciletí. Brno : Masarykova univerzita, 2000. s. 19-20. IV. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních
biologů (přednáška). ISBN 80-210-2266-3. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
Konečná, Hana - Nejedlá, Eliška - Paděrová, Eva - Zdráhal, Zbyněk - Brzobohatý, Břetislav. Centrální laboratoř
speciálních technik na Masarykově univerzitě. In VIII.Pracovní setkání biochemiků a molekulárních
biologů. 1. vyd. Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2004. s. 12-12. ISBN 80-210-3321-5. MSM
143100005, záměr. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
Lexa, Matej - Cheeseman, John M. Genetic manipulation of the location of nitrate reduction and its effects on
plant growth. In Plant Nutrition - Molecular Biology and Genetics. Dordrecht : Kluwer Academic
Publishers, 1999. s. 59-63. ISBN 0-7923-5716-7. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
Lexa, Matej - Genkov, Todor Nikolaev - Brzobohatý, Břetislav. Nitrate Reductase Activity in ipt-Expressing
Tobacco. In 17th International Conference on Plant Growth Substances, Brno, Czech Republic, July 1-6,
2001, Abstracts. Brno : Mendel University of Agriculture and Forestry, Brno, 2001. s. 189-189. ISBN 807157-518-6. MSM 143100008, záměr.
Lexa, Matej - Horák, Jakub - Rotkovská, Julie Olegivna - Brzobohatý, Břetislav. Insertional Mutants in
Arabidopsis Response Regulator Genes. In 17th International Conference on Plant Growth Substances,
Brno, Czech Republic, July 1-6, 2001, Abstracts. Brno : Mendel University of Agriculture and Forestry,
Brno, 2001. s. 148-148. ISBN 80-7157-518-6. GA204/99/D024, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
32
Marek, Jaromír - Vévodová, Jitka - Su, X.-D. - Zouhar, Jan - Brzobohatý, Břetislav. Crystallographic study of
the maize cytokinin glucoside-specific beta-glucosidase Zm-p60.1. In 19-th European Crystallographic
Meeting - Abstracts book. 2000. vyd. Nancy : Université Henri Poincaré, 2000. s. 246-246. MSM
143100008, záměr. VS96096, projekt VaV. Procházková, M. - Kuglík, Petr - Štěrba, Jaroslav. Detection of
prognostic genetic factors in neuroblastoma using fluorescence in situ hybridization (FISH). In 15th
Biological Days - Cells. Kopp, České Budějovice : J. Berger (Ed.), 1999. s. 111-111. ISBN 80-7232-069-6.
MSM 143100008, záměr.
Marek, Jaromír. Proteinová krystalografie v postgenomické éře. In Struktura 2001, Kolokvium Krystalografické
společnosti. Praha : CSCA, 2001. s. 20-20. Materials Structure, vol 8, no 1a, 2001. ISBN ISSN=1211-5894.
MSM 143100008, záměr.
Marek, Jaromír. Úvod do strukturní analýzy monokrystalů. In Kolokvium 2002. Praha : CSCA, 2002. s. 7-7.
ISBN ISSN: 1211-5894. MSM 143100008, záměr.
Marek, Jaromír - Zouhar, Jan - Vévodová, Jitka - Damborsky, Jiří - Su, X.-D. - Brzobohatý, Břetislav. Insights
into the functional architecture of the catalytic center of a maize beta-glucosidase Zm-p60.1. In IUCr. XIX
Congress - Abstracts, Volume I. Geneva : IUCr., 2002. od s. C106, 1 s. ISBN ISSN: 0108-7673. MSM
143100008, záměr.
Slaný, Michal - Zouhar, Jan - Brzobohatý, Břetislav. Identification of a Cysteine Residue Conferring Sensitivity
of a Maize â-Glukosidase to Silver Ion and Alkylation Treatment. In V. Pracovní setkání biochemiků a
molekulárních biologů, Sborník příspěvků, Brno 2001. Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2001. s. 2929. ISBN 80-210-2538-7. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
Slaný, Michal - Zouhar, Jan - Brzobohatý, Břetislav. THIOREDOXIN FUSION FACILITATES CORRECT
FOLDING IN MUTANTS OF A MAIZE BETA-GLUCOSIDASE ZM-P60.1 WHEN EXPRESSED IN E.
COLI. In VI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, Sborník příspěvků. Brno : Masarykova
univerzita v Brně, 2002. s. 74-75. ISBN 80-210-2777-0. GV206/96/K188, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr.
Trnková, Libuše - Friml, Jiří - Dračka, Oldřich. Elimination Voltammetry - Modern Electroanalytical Method for
Resolution of Overlapped Voltammetric Signals. In Modern Electroanalytical Methods. I. Pardubice :
Univerzita Pardubice, 1999. s. 40-40. ISBN 80-7194-212-X. GA511/95/1279, projekt VaV.
GV204/97/K084, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. MSM 143100011, záměr.
Váňová, Pavlína - Böhmová, Gabriela - Konečná, Hana - Zdráhal, Zbyněk - Brzobohatý, Břetislav. Twodimensional Electrophoresis in Analysis of Arabidopsis thaliana Proteome: A Beginning of a Long Story. In
VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Přírodovědecká fakulta MU : Masarykova
univerzita v Brně, 2003. od s. 37-38, 2 s. ISBN 80-210-3053-4. MSM 143100008, záměr.
Váňová, Pavlína - Chevalier, François - Böhmová, Gabriela - Konečná, Hana - Zdráhal, Zbyněk - Rossignol,
Michel - Brzobohatý, Břetislav. Effect of endogenous cytokinin levels on the Arabidopsis thaliana
proteome. In Chemica 43S Supplement (Collected Reports of the Natural Science Faculty Palacký
University Olomouc Czech Republic). Olomouc : Palacký University, 2004. s. 24-24. ISBN 80-244-0882-1.
MSM 143100008, záměr.
Váňová, Pavlína - Chevalier, Francois - Böhmová, Gabriela - Konečná, Hana - Zdráhal, Zbyněk - Rossignol,
Michel - Brzobohatý, Břetislav. Struktura proteinových profilů rostlin Arabidopsis thaliana s rozdílnými
hladinami endogenních cytokininů. In Česko-slovenská studentská vědecká konference 1.5.2004. Sborník
abstraktů. Brno, Česká republika : Masarykova univerzita v Brně, 2004. s. 90-90. ISBN 80-210-3376-2.
MSM 143100008, záměr.
Vojtíšková, Marie - Kadlecová, J. - Novotný, T. - Gaillyová, Renata - Konečná, Hana - Klánová, Jana - Semrád,
B. Molekulární diagnostika pacientů se syndromem prodlouženého QT intervalu. In Biochemie a
molekulární biologie na prahu nového tisíciletí. 2000. vyd. Brno : Masarykova univerzita, 2000. s. 83-84.
IV. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů (přednáška). ISBN 80-210-2266-3. MSM
Zouhar, Jan. Translational fusions - advancements in expression technology. In Biochemie a molekulární
biologie na prahu nového tisíciletí. 1. vyd. Brno : Masarykova univerzita, 2000. s. 39-39. IV. Pracovní
setkání biochemiků a molekulárních biologů (přednáška). ISBN 80-210-2266-3. MSM 143100008, záměr.
VS96096, projekt VaV.
Zouhar, Jan - Brzobohatý, Břetislav. His-patch Thioredoxin-fusion in Expression of Recombinant Plant Enzyme.
In Biochemie a molekulární biologie na prahu nového tisíciletí. 1. vyd. Brno : Masarykova univerzita, 2000.
s. 66-66. IV. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů (plakátové sdělení). ISBN 80-210-22663. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV. 143100008, záměr.
Zouhar, Jan - Slaný, Michal - Brzobohatý, Břetislav. Folding of native and mutant maize beta-glucosidase in E.
coli is facilitated by thioredoxin fusion. European Journal of Biochemistry, Oxford : Blackwell Science,
269, Supp. 1s. 77-77. ISSN 0014-2956. 2002. AV0Z5004920, záměr. GA203/02/0865, projekt VaV. MSM
143100008, záměr.
33
Diplomové práce:
Horák Jakub : Molekulárně-biologická studie dvoukomponentních systémů u vyšších rostlin. 2002. Školitel: M.
Lexa.
Klíma Petr: Úloha cytokininů v regulaci exprese homeogenů rodiny KN1 u rostlin. 2003. Školitel: B.
Brzobohatý.
Mazura Pavel: Funkční architektura aktivního centra kukuřičné β-glukozidázy. 2004. Školitel: B. Brzobohatý.
Nejedlík Jan: Studie citlivosti tabáku na dexamethason (jeden z možných induktorů transgenní exprese).
Testování transkripčního aktivačního systému pOp/LhG4 pro regulovanotelnou expresi transgenů
v transgenních rostlinách. 2000. Školitel: B. Brzobohatý.
Pernisová Markéta: Regulovatelné systémy exprese transgenu u Arabidopsis thaliana. 2000. Školitel: RNDr. B.
Brzobohatý.
Reková Alena: Molekulární klonování a charakterizace integračního lokusu T-DNA
u transgenní rostliny
tabáku vykazující buněčně autonomní pylovou sterilitu. 2002. Školitel: B. Brzobohatý.
Skříšovská Lenka: Studium funkce evolučně konzervovaných zbytků kyseliny glutamové a asparagové u
kukuřičné β-glukozidázy Zm-p60.1. Školitel: B. Brzobohatý
Šmeral Miloslav: Identifikace aminokyselinových zbytků zúčastňujících se na interakci β-glukozidázy Zm-p60.1
se substrátem. 2001. Školitel: B. Brzobohatý.
Disertační práce:
Borkovcová Petra: Molekulární a biochemická charakterizace vybraných členů rodiny „phosphorelay“
mediátorů, které se mohou účastnit přesunu signálu hormonu cytokininu u rostlin. Školitel: B. Brzobohatý.
Böhmová Gabriela: Dynamika změn proteomu v odpovědi na řízené modifikace hladin rostlinných hormonů
cytokininů. Školitel: B. Brzobohatý.
Bubeníčková Hana: Funkční analýza vybraných HPt genů u Arabidopsis thaliana.
Školitel: B. Brzobohatý.
Fohlerová Radka: Funkční architektura aktivního centra kukuřičné β-glukozidázy. Školitel: B. Brzobohatý.
Guo Jianchun - Čína: Regulated expression of ipt gene by pOp transcription system in Arabidopsis. 2003.
Hejátko Jan: Izolace a molekulární charakterizace mutantů Arabidopsis thaliana vykazujících defekty v kontrole
větvení. 2004. Školitel: B. Brzobohatý.
Horák Jakub: Molekulární mechanizmy účinků rostlinných hormonů cytokininů.
Hradilová Jana: Funkční analýza signálních drah cytokininů u Arabidopsis thaliana. Školitel: B. Brzobohatý.
Kiran N.S. - Indie: Role of sub-cellular compartmentation in the regulation of cytokinin metabolism and action.
Pernisová Markéta: Studium biologické funkce receptoru cytokininů CKI1. Školitel: B. Brzobohatý.
Reková Alena: Hormonální regulace exprese homeogenů u rostlin. Školitel: B. Brzobohatý.
Rotrekl Vladimír: Strukturní a funkční analýza kukuřičné β-glukosidasy. 1999. Školitel: I. Kučera, školitel –
specialista: B. Brzobohatý.
Souček Přemysl: Studium dominantních mutací navozených ektopickou expresí klíčového enzymu metabolismu
cytokininů (IPT) v transgenních rostlinách. Školitel: B. Brzobohatý.
Šámalová Markéta: Vliv řízené lokální nadprodukce cytokininů na vývojové procesy u tabáku. Školitel: B.
Brzobohatý.
Váňová Pavlína: Analýza proteomu Arabidopsis thaliana. Školitel: B. Brzobohatý.
Zouhar Jan: Biochemická charakterizace rekombinantních derivátů a bodových mutant kukuřičné β-glukozidázy.
2000. Školitel: I. Kučera, školitel specialista: B. Brzobohatý.
Identifikace a lokalizace genů zodpovědných za morfologické znaky a pozdnost u Arabidopsis
thaliana.
U Arabidopsis thaliana byly analyzovány různé typy T-DNA inzerčních mutantních linií,
mutantní linie získané klasickou mutagenezí a přírodní populace. Cílem těchto analýz byla
identifikace genů determinujících různé morfologické znaky a procesy rostlin. U T-DNA linií
jsme se zaměřili na metodiky využívající začleněného inzertu o známé sekvenci, u ostatních
34
mutací to byly různé fenotypové projevy a změny na úrovni DNA vzniklé v důsledku
mutageneze.
Jedním ze závěrů dlouhodobé genetické analýzy v segregující generaci F2 studovaných
inzerčních linií byl poznatek o značném úbytku mutantních (transgenních) fenotypů a zvýšení
počtu standardních (netransgenních) fenotypů. Byl stanoven fenotypový drift v četnostech
v generaci F2 při klasické rekombinační analýze T-DNA mutantů.
Jednou ze stěžejních metodik, která byla využita ke splnění stanoveného cíle, tj.
charakterizaci genů zodpovědných za konkrétní funkce v rostlinách, bylo genetické mapování
pomocí DNA markerů. Umožnilo lokalizovat do stávající genetické mapy A. thaliana
mutantní alely sledovaných genů a tím rozhodnout, zda se jedná o nově identifikované geny.
Bylo započato a postupně byla vypracována metodika genetického mapování pomocí
mikrosatelitů a CAPS markerů. Metoda byla postupně aplikována u inzerčních T-DNA
morfologických mutací s defektem ve struktuře trichomů kaktus, s defektem stavby květu a u
sedmi embryonálně letálních mutací. U šesti morfologických mutací A. thaliana získaných
klasickou mutagenezí (lucida, foliculiformis, chlorominuta, rotundata, lycopodioformis a
cupuliformis) byla lokalizace do genetické mapy výchozím bodem pro identifikaci
kandidátních genů a pozdější poziční klonování těchto genů.
U šesti mutantních genů způsobujících pozdní kvetení (dn, L4, L5, L6, Spi a M63) byla
provedena jejich lokalizace do vazbových skupin za použití metody mapování pomocí DNA
markerů. U těchto mutantů byly vyvozeny závěry o vlivu genetického pozadí na dobu do
kvetení a byl stanoven typ dědičnosti.
U všech analyzovaných T-DNA mutací byla studována kosegregace T-DNA s mutací
a stanoven počet začleněných kopií T-DNA v geonomu. U trichomové mutace byl metodou
plazmidové záchrany izolován fragment rostlinné DNA sousedící s inzertem.. Byl proveden
skríning nových inzerčních mutantních linií získaných vakuovou infiltrací Agrobacterium
tumefaciens a identifikovány další mutace v genech determinujících morfologické znaky a
embryonální letalitu. Byla dokončena analýza tří T-DNA mutací z ÚMBR (České
Budějovice). U jedné mutace byla zjištěna kosegregace inzertu s mutací, což umožnilo
následnou izolaci sekvence genu a jeho identifikaci.
Vzhledem k tomu, že řada mutací se projevovala embryonálně letálními defekty, byla
vypracována metodika analýzy embryogeneze prostřednictvím projasňování pletiv, s cílem
studia anatomie těchto defektů a porovnání se standardním průběhem embryogeneze. U osmi
studovaných embryonálně letálních mutací se pomocí této metody podařilo přesně lokalizovat
embryonální defekt.
Analýza reakce sedmi přírodních pozdně kvetoucích genotypů a 13 pozdně kvetoucích
mutantních linií na vernalizaci a demetylaci ukázala na možnost dvou různých drah vedoucích
k indukci kvetení, přičemž obě jsou regulovány demetylací DNA. Tyto dvě dráhy odpovídají
dvěma odlišným skupinám genů zúčastněných při indukci kvetení. Tyto geny byly zařazeny
do existujícího modelu regulace kvetení u Arabidopsis. Molekulárně-biologická analýza
generace F2 po křížení dvou T-DNA pozdně kvetoucích mutantů s odlišným genetickým
pozadím potvrdila očekávaný předpoklad o vlivu genetického pozadí Columbia na pozdnost u
těchto mutantů. Bylo zjištěno, že se jedná o gen FLC, jehož účinek na fenotypový projev
pozdnosti je závislý na genetickém pozadí. Naopak u mutace dn analýza na úrovni DNA
nepotvrdila účinek tohoto genu a byl tudíž vysloven předpoklad o vlivu jiných, doposud
necharakterizovaných, modifikátorových genů. Pomocí molekulárně-genetických metod byl
identifikován první modifikátorový gen u pozdně kvetoucího mutanta Spi. U pěti přírodních
pozdně kvetoucích linií bylo pomocí DNA markerů potvrzeno, že pozdnost je v těchto
populacích podmíněna dominantním genem FRI, který se nalézá na konci krátkého raménka
4. chromozomu.
35
Kocábek, T., Rakouský, S., Ondřej, M., Řepková, J., Relichová, J.: Identification and mapping of a T-DNA
induced flower mutation in Arabidopsis thaliana. Biol. Plantarum 42(3): 349-359, 1999. IF 0,413.
Relichová, J., Řepková, J.: Are T-DNA mutants amenable to standard recombination analysis? Biol. Plant. 43(1):
19-23, 2000. IF 0,413.
Lízal, P., Relichová, J.: The effect of day length, vernalization and DNA demethylation on the flowering time in
Arabidopsis thaliana. Physiologia Plantarum, Copenhagen: Munksgaard, 113, 1s. 121-127, 2001. IF 1,476.
Kyjovská, Z., Řepková, J., Relichová, J.: New embryo lethals in Arabidopsis thaliana: basic genetic and
morphological study. Genetica, 119(3), 317-325, 2003. IF 1,063.
Lízal, P., Relichová, J.: Localization of seven new late-flowering mutations on the genetic map of Arabidopsis
thaliana using a newly generated CAPS marker. Plant Science, Dublin: Elsevier Scientific Publisher, 167:
143-149, 2004. IF 1,652 .
Řepková, J., Hlaváčová, S., Lízal, P., Kyjovská, Z., Relichová, J.: Molecular mapping of some Arabidopsis
thaliana genes determining leaf shape and chlorophyll defects. Biológia (v tisku).
Kocábek, T., Řepková, J., Dudová, M., Hoyerová, K. Isolation and characterization of a novel mutant of gene for
pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein. Rukopis připraven k publikaci.
Kocábek, T., Rakouský, S., Řepková, J., Relichová, J.: Identification and mapping of the T-DNA tagged flower
mutation of Arabidopsis thaliana revealed the SUPERMAN epigenetic allele. Abstr. Third Symp. Ser.
Recent Advances in Plant Biotechnology, From Cells to Crops, Inst. Plant Genetics and Biotechnology
Nitra, Stará Lesná, Slovakia, 4.-10.9. 1999, p. 105, 1999.
Řepková, J., Relichová, J., Chytilová, E.: Stability of the T-DNA insertional embryonic lethal mutants in
Arabidopsis. Abstr. Third Symp. Ser. Recent Advances in Plant Biotechnology, From Cells to Crops, Inst.
Plant Genetics and Biotechnology Nitra, Stará Lesná, Slovakia, 4.-10.9. 1999, p.131, 1999.
Lízal, P., Relichová, J.: A genetic analysis of late flowering in Arabidopsis thaliana. In Biochemistry and
molecular biology on the threshold of a new century. Brno: Vydavatelství MU, s. 37-38, 2000.
Lízal, P., Relichová, J.: Expression of late flowering in Arabidopsis thaliana. In: Vortr. Pflanzenzüchtg.
Gottingen: Liddy Halm, Backhausstr. 9b, D-37081 Gottingen, s. 16-16, 2000.
Řepková, J., Relichová, J., Doleželová, H. Lukešová, M.:Genetic mapping in Arabidopsis thaliana: classical and
molecular techniques. Vortr. Pflanzenzűchtg. 47, 103, 2000.
Kyjovská, Z., Jungmannová, B., Řepková, J.: Cytological analysis of embryonic lethal T-DNA mutations in
Arabidopsis thaliana. Abstract. Professor Němec´s Cytological Day Brno, May 25th, 2000. Scripta Fac. Sci.
Natur. Univ. Masarykianae Brunensis – Biology 27: 62-63, 2001.
Řepková, J., Lízal, P., Relichová, J., Ryšávka, P., Kyjovská, Z., Doleželová, H.: Gene localization by means of
T-DNA tagging in Arabidopsis thaliana. Book of abstracts 4th Int. Symp. in the Series Recent Advances in
Plant Biotechnology, Třeboň September 17-21, Czech Republic, p. 97, 2001.
Hlaváčová S., Lízal P., Řepková J.: Využití molekulárních markerů při genetickém mapování mutací
Arabidopsis thaliana. Informační listy GSGM ISBN 1210-6267, Genetická konference, Brno, Česká
republika, únor 2002, s. 23, 2002.
Kyjovská Z., Řepková J.: T-DNA Arabidopsis thaliana mutants with disruption during embryo development.
ISBN 83-227-1950-7, XVIIth Internation Congress on Sexual Plant Reproduction, Lublin, Poland, 9 – 13
July 2002, p. 87, 2002.
Lízal, P., Cetkovská, K., Relichová, J.: Dědičnost genů pro pozdní kvetení a jejich interakce s geny odlišného
genetického pozadí u Arabidopsis thaliana. In Informační listy GSGM. Brno: GSGM, s. 26-26, 2002.
Řepková J., Lízal P., Kyjovská Z., Ryšávka P., Hlaváčová S.: Výsledky a zhodnocení aplikace DNA markerů při
genetickém mapování u Arabidopsis thaliana. Česko-slovenský workshop Využití molekulárních markerů
v biologii, šlechtění a uchování genových zdrojů rostlin, Šumperk, 4. - 6. listopadu 2002, s. 147-154, 2002.
Dadejová, M., Lízal, P., Relichová, J.: Analýza polymorfismu DNA markerů u přírodních pozdně kvetoucích
linii Arabidopsis thaliana. In VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. 1. vydání. Brno:
Masarykova univerzita v Brně, s. 42-43, 2 s., 2003.
Diplomové práce:
Bubeníčková Hana: Hodnocení stability embryonálně letálních mutací získaných inzerční mutagenezí u
Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. 1999. Školitel: J. Řepková.
Lukešová Miroslava: Genetická analýza inzerčních mutací ovlivňujících morfologii květu Arabidopsis thaliana.
2000. Školitel: J. Řepková.
36
Ryšávka Petr: Identifikace a analýza transgenních rostlin Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. 2001. Školitel: J.
Řepková.
Doleželová Heda: Lokalizace nových inzerčních mutací Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. do genetické mapy.
Kyjovská Zdeňka: Cytogenetická analýza embryonálně letálních mutací Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. 2001.
Školitel: J. Řepková.
Kocmánková Zuzana 2001: Selekce nových inzerčních mutací Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. Školitel: J.
Řepková
Komárková Tereza: Genetické mapování mutací Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. 2001. Školitel: J. Řepková.
Hlaváčová Sylvie: Genetické mapování genů Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. 2002. Školitel: J. Řepková.
Rozsívalová Pavla: Selekce nových inzerčních mutací Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. 2002. Školitel: J.
Řepková.
Kotnová Pavla: Selekce nových inzerčních mutací Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. 2002. Školitel: J. Řepková.
Krejčí Veronika: Identifikace genů Arabidopsis thaliana prostřednictvím nových T-DNA mutací. 2003. Školitel:
J. Řepková.
Bedřichová Jana: Identifikace a analýza T-DNA mutantů Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. pomocí Southernova
přenosu. 2004. Školitel: J. Řepková.
Dudová Markéta: Identifikace a charakterizace genů determinujících embryogenezi prostřednictvím T-DNA
mutací Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. Školitel: J. Řepková.
Centrální laboratoř speciálních technik molekulární biologie MU
Pracoviště doc. Brzobohatého zajišťovalo pro MU a širší akademickou veřejnost řadu
speciálních technik molekulární biologie. Významně se podílelo na vzniku a činnosti
společného pracoviště PřF a LF pro analýzu proteomu na MU, zejména zajištěním provozu
instrumentace pro MALDI-TOF MS a iontové pasti, která byla ve spolupráci s katedrou
biochemie kompletována v automatizovanou LC-MS jednotku.
37
Genom živočichů (garant: doc. RNDr. Jan Šmarda, CSc.)
Ve shodě s proponovaným výzkumným plánem byla provedena analýza signálních
procesů, které se v živočišné buňce podílejí na řízení proliferace, diferenciace a
programované buněčné smrti. Leukemické ptačí monoblasty BM2 byly modifikovány jednak
cílenými genetickými změnami (přenosem a expresí cizorodých genů) a jednak změnami
epigenetickými (indukcí acetylace histonů). Do buněk BM2 byly úspěšně přeneseny geny cjun, v-jun, c-fos, v-fos, CBP, p300, p53 a bcl-2. Po indukci jejich exprese byly vyhodnoceny
důsledky přítomnosti jejich proteinových produktů na diferenciaci, proliferaci a apoptózu
buněk BM2.Výsledky byly publikovány jako původní vědecké práce nebo jsou v současné
době v recenzním řízení . Výsledky byly rovněž prezentovány formou diplomových prací ,
doktorských disertačních prací (54-59) a formou ústních nebo plakátových sdělení na
vědeckých konferencích v České republice i v zahraničí.
Šmardová, J., Šmarda, J.: Mechanismy přestavby chromatinu. Biologické listy 66: 283-303, 2001.
Šmardová, J., Šmarda, J.: Buněčná linie BM2: model pro studium krvetvorby a leukemogeneze. Biologické listy
67:245-252, 2002.
Ševčíková S., Souček K., Kubala L., Bryja V., Šmarda J.: Differential effects of v-Jun and c-Jun proteins on vmyb-transformed monoblasts. Cell. Mol. Life Sci. 59: 1690-1705, 2002. IF 5,259.
Zahradníčková E., Souček K., Ševčíková S., Šmardová J., Šmarda J.: c-Fos but bot v-Fos protein induces
programmed cell death of v-myb-transformed monoblasts. Cellular and Molecular Life Sciences 60: 27362748, 2003. IF 4,995.
Beneš, P., Šmarda J.: Vimentin: příklad aktivního zapojení složky cytoskeletu do regulačních procesů buňky.
Biologické listy 69: 265-278, 2004.
Zahradníčková, E., Souček, K., Horváth, V., Šmarda, J.: Autophagy is preferred pathway of camptothecininduced programmed cell death of v-myb-transformed monoblasts. Cell Death and Differentiation
(submitted) IF 7,008.
Šmardová, J., Nemajerová, A., Navrátilová, J., Jurdic, P., Šmarda, J.: CBP sensitizes v-myb-transformed
monoblasts to differentiation inducers. Differentiation (submitted). IF 3,858.
Šmardová, J., Šmarda, J., Koptíková, J.: Functional variants of the p53 tumor suppressor. Differentiation
(submitted). IF 3,858.
Šmarda, J., Šmardová, J.: Cílené genetické a epigenetické modifikace leukemických buněk. Lékařská fakulta
MU, Brno (v tisku).
Nemajerová, A., Šmarda, J., Šmardová, J.: CBP is involved in regulation of differentiation of v-myb-transformed
monoblasts. Mendel-Brno Conference 2000. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics 17: 1177,
2000.
Kizek, R., Trnková, L., Ševčíková, S., Šmarda, J.: Stříbrná elektroda jako senzor pro sledování koncentrace
zinečnatých iontů v buněčných růstových médiích. Sborník konference II. Pracovní setkání fyzikálních
chemiků a elektrochemiků, Brno, 21, 2000.
Zahradníčková, E., Ševčíková, S., Souček, K., Šmarda, J.: The effects of Fos proteins on myeloid differentiation.
Sborník konference V. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, Brno, 26, 2001.
Ševčíková, S., Souček, K., Bryja, V., Šmarda, J.: Vliv proteinů Jun na růst a diferenciaci monoblastů
transformovaných onkogenem v-myb. Sborník konference XVI. Biologické dny, Olomouc, 75, 2001.
Zahradníčková, E., Ševčíková, S., Souček, K., Šmarda, J.: Vliv proteinů Fos na růst a diferenciaci monoblastů
transformovaných onkogenem v-myb. Sborník konference XVI. Biologické dny, Olomouc, 76, 2001.
Ševčíková, S., Zahradníčková, E., Souček, K., Šmarda, J.: v-Jun and v-Fos proteins induce dedifferentiation of
v-myb-transformed monoblasts. Book of Abstracts of the 17th Annual Meeting on Oncogenes, Frederick,
MD, USA, 171, 2001.
Navrátilová, J., Ševčíková, S., Vojtěšek, B., Šmarda, J.: Studium nádorově supresivních účinků proteinu p53 na
leukemické monoblasty BM2. Sborník konference VI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních
biologů, Brno, 27, 2002.
Navrátilová, J., Ševčíková, S., Šmarda, J.: Roscovitine-stabilized p53 suppresses growth and induces
differentiation of v-myb-transformed monoblasts. Sborník konference Cells IV, České Budějovice, 95,
2002.
38
Šmarda, J., Ševčíková, S., Souček, K., Zahradníčková, E.: The effects of Jun proteins on growth and
differentiation of v-myb-transformed monoblasts. 12th International Conference of the International Society
of Differentiation, Lyon, France. Differentiation 70: 347, 2002. IF 2,078.
Ševčíková, S., Souček, K., Bryja, V., Šmarda, J.: Vliv proteinů Jun na monoblasty transformované onkogenem
v-myb. Sigma-Aldrich konference mladých chemiků a biologů, 2002. Chemické listy 96: 234, 2002. IF =
0,336
Ševčíková, S:, Souček, K., Bryja, V., Šmarda, J.: Vliv proteinů Jun na růst a diferenciaci monoblastů
transformovaných onkogenem v-myb. Sborník konference VI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních
Nemajerová, A., Šmarda, J., Zatloukalová, J., Šmardová, J.: Differential effects of transcription coactivators
CBP and p300 in v-myb-transformed monoblasts. Sborník konference XVII. Biologické dny, Brno, 66,
2003.
Zahradníčková, E., Ševčíková, S., Souček, K., Kubala, L., Šmarda, J. Differential roles of Fos and Jun proteins
in regulation of differentiation and apoptosis of v-myb-transformed monoblasts. Book of Abstracts of the
conference Antibody-Based Therapeutics for Cancer. Keystone symposia, Banff, Alberta, Canada, 62, 2003.
Ševčíková, S., Šmarda, J., Beneš, P., Mechanismus suprese onkoproteinu v-Myb proteinem Jun v buňkách BM2:
Aktivace receptoru pro kyselinu retinovou. Sborník konference VII. Pracovní setkání biochemiků a
molekulárních biologů, Brno, 67, 2003.
Šmarda, J., Zahradníčková, E., Konečná, H., Zdráhal, Z., Šmardová, J.: Zrání monoblastů BM2 je doprovázeno
zvýšenou expresí vimentinu. Sborník konference VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních
Navrátilová, J., Vojtěšek, B., Šmarda, J.: Tumor suppressive effects of the of 53 protein in v-myb-transformed
monoblasts. Sborník konference XVII. Biologické dny, Brno, 65, 2003.
Beneš, P., Zahradníčková, E., Konečná, H., Zdráhal, Z., Šmarda, J. Zvýšená exprese vimentinu jako marker
diferenciace monoblastů BM2. Sborník konference VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních
Vaňhara, P., Bryja, V., Ševčíková, S., Šmarda, J.: Protein c-Jun indukuje expresi cyklinu A v monoblastech
BM2. Sborník konference VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, Brno, 19, 2004.
Zahradníčková, E., Souček, K., Šmarda, J.: Autofagie je preferovaným typem programované buněčné smrti u
monoblastů BM2 stimulovaných kamptotecinem. Sborník Česko-slovenské studentské vědecké konference,
Brno, 94, 2004.
Vaňhara, P., Bryja, V., Ševčíková, S., Šmarda, J.: Odlišný účinek proteinů c-Jun a v-Jun na expresi cyklinu A
v monoblastech BM2. Sborník Česko-slovenské studentské vědecké konference, Brno, 89, 2004.
Zahradníčková, E., Souček, K., Šmarda, J.: Programovaná buněčná smrt v-myb-transformovaných monoblastů je
nezávislá na kaspázách. Sigma-Aldrich IV. Konference mladých chemiků a biologů. Chemické listy 98:
312-313, 2004. IF 0,345.
Šmarda, J., Zahradníčková, E., Souček, K., Horváth, V.: Camptothecin induces autophagy of v-myb-transformed
monoblasts. 13th International Conference of the International Society of Differentiation, Honolulu, USA
Differentiation 72: 279, 2004. IF 3,858.
Diplomové práce:
Vodička Petr: Studium účinku retinoidových receptorů aktivovaných různými ligandy na onkoprotein v-Myb.
Molekulární biologie a genetika. 1999. Školitel: J. Šmarda.
Kohoutek Jiří: Optimalizace podmínek pro transfekci monoblastů transformovaných onkogenem v-myb.
Ševčíková Sabina: Úloha onkogenů fos a jun v myeloidní diferenciační dráze. Molekulární biologie a genetika.
1999. Školitel: J. Šmarda.
Bryja Vítězslav: Interakce proteinu v-Jun s metabolity kyseliny arachidonové. Molekulární biologie a genetika.
Schrumpfová Petra: Korelace diferenciace buněk BM2 a aktivity proteinu v-Myb. Molekulární biologie a
genetika. 2001. Školitel: J. Šmarda.
Fialová Markéta: Sledování specifických chromozomálních translokací u akutních myeloidních leukémií
technikou RT-PCR. Molekulární biologie a genetika. 2001. Školitel: J. Šmarda.
Sedláček Jiří: Vliv inhibitorů metabolismu kyseliny arachidonové na fenotyp leukemické linie BM2.
Navrátilová Jarmila: Studium vlivu produktů cizorodých genů na aktivitu proteinu v-Myb v buňkách BM2.
Vaňhara Petr: Mechanismus účinků proteinů Jun a Fos na regulaci buněčného cyklu leukemických buněk.
39
Horňák Miroslav: Využití kyseliny retinové pro indukci diferenciace monoblastů BM2. Molekulární biologie a
genetika. 2004. Školitel: J. Šmarda.
Zatloukalová Jiřina: Vliv zvýšené exprese koaktivátoru p300 na diferenciační potenciál transformovaných
kuřecích monoblastů. 2004. Školitel: J. Šmardová.
Ševčíková Sabina: Úloha proteinů Jun v myeloidní diferenciační dráze. Molekulární a buněčná biologie. 2003.
Školitel: J. Šmarda.
Nemajerová Alice: Studium transkripčního koaktivátoru CBP. Molekulární a buněčná biologie. 2003. Školitel: J.
Šmardová.
Pavlová Šárka: Funkční analýza nádorového supresoru p53. Molekulární a buněčná biologie. 2003. Školitel: J.
Šmardová.
Zahradníčková Eva: Studium podmínek suprese onkogenu v-myb. Molekulární a buněčná biologie. Školitel: J.
Šmarda.
Navrátilová Jarmila: Studium podmínek suprese onkogenu v-myb proteinem p53. Molekulární a buněčná
biologie. Školitel: J. Šmarda.
Váňa Petr: Změny proteomu v průběhu indukované diferenciace buněk BM2. Molekulární a buněčná biologie.
Výzkumná práce se odchýlila od původního plánu v tom, že se nepodařilo připravit transgenní
varianty lidské leukemické linie HL-60. Důvodem bylo selhání selekčního systému, který se
velmi dobře uplatňuje při selekci stabilních transfektantů buněk BM2, ale u buněk HL-60
nikoliv. Tento selekční systém je založen na současné expresi testovaného transgenu a
pomocného markeru CD4, který transfekovaným buňkám udílí citlivost na paramagnetické
kuličky potažené anti-CD4 protilátkou. Transfektanty buněk BM2 lze proto selektovat
v magnetickém poli. U buněk HL-60 je použití tohoto systému omezeno tím, že protein CD4
je přítomen na povrchu netransfekovaných buněk HL-60. Místo plánovaných studií lidských
buněk HL-60 jsme problematice lidského genomu místo věnovali dva přehledné články:
Šmarda, J.: Structure and function of erythropoietin. A review. Scripta Facultatis Scientiarum naturalium
Universitatis Masarykianae Brunensis 26: 27-32, 2000.
Beneš, P. :Polymorphism in the apolipoprotein(a) gene, plasma Lp(a) and cardiovascular risk. HeartDrug 3: 217224, 2003.
Nad rámec plánovaných úkolů jsme publikovali výsledky analýzy vlivu kolicinů E1 a E3
na monoblasty BM2 a nový způsob elektrochemické analýzy koncentrace zinečnatých
iontů v kultivačním médiu těchto buněk. Tyto experimenty s výzkumným plánem
bezprostředně souvisely.
Šmarda, J., Fialová, M., Šmarda, J. Jr.: Cytotoxic effects of colicins E1 and E3 on v-myb-transformed chicken
monoblasts. Folia Biologica (Praha) 47: 11-13, 2001. IF 0,351.
Kizek, R., Trnková, L., Ševčíková, S., Šmarda, J., Jelen, F.: Silver electrode as a sensor for determination of zinc
in cell cultivation medium. Anal. Biochem. 301: 8-13, 2002. IF 2,047.
V části projektu zaměřené na analýzu mutací v bakteriálním genu lacZ P-1152 u
transgenní Drosophila melanogaster byly v tomto modelovém systému podle plánu
indukovány mutace jednak standardním mutagenním činidlem N-nitroso-N-methylmočovinou
40
(MNU) a jednak chemickými látkami ze skupiny alifatických halogenovaných uhlovodíků.
V rámci řešení stanovených cílů bylo experimentálně sledováno celkem 21 chemických látek;
1,2-dibromoethane, 1-bromo-2-chloroethane, 1-iodopropane, 2,3-dichloropropene, 3-bromo1-propene, epibromhydrine, 2-iodobutane, 3-chloro-2-methylpropene, 1,2,3-trichloropropane,
1,2-dichloroethane, 1,2-dichlorobuthane, 1-chloro-2-methylpropane, 1,3-dichloropropane,
1,2-dichloropropane, 2-chloroethymethylether, 1-bromo-2-methylpropane, 1-chloropentane,
2-chloroacetonitrile, 2-chloropropane, 1,3-dibromopropane a 1-iodopentane. Výsledky testů
vztažené na počet zaznamenaných somatických mutací a rekombinací (SMART) byly
rozhodující při výběru vzorků pro amplifikace genu lacZ. Pro analýzu mutací v transgenu
byly použity metody SSCP a sekvencování DNA. Celkem bylo amplifikováno přibližně 900
vzorků DNA z potomků drozofil exponovaných výše uvedenými chemickými látkami. Při
detekci mutací metodami SSCP a TGGE byly u 14 vzorků zachyceny změny v sekvenci DNA
genu lacZ, které byly ve 4 případech potvrzeny sekvencováním DNA. Nebyly však zjištěny
žádné opakující se případy změn v sekvenci DNA. Výsledky testů byly dále modelovány
metodou QSAR pro odhad toxických a genotoxických vlastností chemických látek. V rámci
řešení projektu bylo takto modelováno již 26 alifatických halogenovaných uhlovodíků.
Popsanými metodickými přístupy jsme rovněž sledovali také mutace v lidském genomu, které
souvisejí se syndromem prodlouženého QT intervalu. Konkrétně se jednalo o mutace
v genech SCN5A, KCNE2 a KCNJ2. V genu SCNA5A byla nalezena SNP mutace C5607T
neměnící smysl kodonu u celkem 57 pacientů. Výsledky této práce v současné době
zpracováváme pro připravovanou publikaci. Kromě zmíněných původních vědeckých prací
byly výsledky analýzy mutací u transgenní Drosophila melanogaster uplatněny formou
diplomových prací, jedné doktorské disertační práce a formou ústních a plakátových sdělení
na vědeckých konferencích. Výsledky analýzy mutací genů spojených se syndromem
prodlouženého QT intervalu u člověka byly dosud popsány ve dvou diplomových pracích.
Chroust, K., Jowett, T., Farid-Wajidi, M.F., Huang, J., Ryskova, M., Wolf, R., Holoubek, I.:. Activation or
detoxification of mutagenic and carcinogenic compounds in transgenic Drosophila expressing human
glutathione S-transferase. Mutat. Res. 498: 169-179, 2001. IF 1,624.
Chroust, K., Pavlová, M., Prokop, Z., Mendel, J., Božková, K., Kubát, Z., Zajíčková, V., Damborský, J.:
Quantitative Structure-Activity Relationships for Toxicity and Genotoxicity of Halogenated Aliphatic
Compounds: Wing Spot Test of Drosophila melanogaster. Mutat. Res.: 2004 (submitted). IF 1,748.
Diplomové práce:
Hamplová Jaroslava: Konstrukce reparačně deficientního kmene transgenní Drosohila melanogaster nesoucí gen
pro glutathion S-transferázu. 1999. Školitel: K. Chroust.
Hykelová Vladimíra: Sledování mutací transgenní Drosophila melanogaster. 1999. Školitel: K. Chroust.
Martinů Pavlína: Transgenní Drosophila melanogaster nesoucí gen pro glutathion S-tranferázu na reparačně
deficientním pozadí genů mei-9 a mei-4l. 1999. Školitel: K. Chroust.
Pavlová Šárka: Detekce mutací transgenů Drosophila melanogaster pomocí metody SSCP. 1999. Školitel: K.
Chroust.
Papoušková Iva: Detekce polymorfizmu v bakteriálních kmenech a detekce mutací transgenu u Drosophila
melanogaster s využitím molekulárních metod. 2000. Školitel: K. Chroust.
Mendel Jan: Testy genotoxicity přírodních extraktů sinic a halogenovaných alifatických uhlovodíků na
Drosophila melanogaster. 2001. Školitel: K. Chroust.
Pavlová Martina: Toxicita a genotoxicity halogenovaných alifatických uhlovodíků na Drosophila melanogaster.
2001. Školitel: K. Chroust.
Skalická Kamila: Indukce a detekce mutací v transgenu u Drosophila melanogaster. 2001. Školitel: K. Chroust.
Žežulková Dita: Analýza stability transgenu u Drosophila melanogaster pomocí PCR a sekvenací. 2002. Školitel:
K. Chroust.
Kubát Zdeněk: Analýza mutací na fenotypové a molekulární úrovni u Drosophila melanogaster. 2003. Školitel:
K. Chroust.
41
Papoušek Ivo: Detekce mutací v genech spojených se syndromem prodlouženého QT intervalu. Školitel: K.
Chroust.
Sedláčková Jana: Detekce mutací v genech SCN5A a KCNE2 spojených s LQT syndromem. 2003. Školitel: K.
Chroust.
Raudenská Martina: Analýza mutací u genů spojených se syndromem prodlouženého QT intervalu. 2003.
Školitel: K. Chroust.
Pavlová, M., Mendel, J., Chroust, K.:Detection of genotoxic activity of volatile halogenated aliphatic
hydrocarbones. V. pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, Brno, 14.2. 2001. s. 59, 2001.
Skalická, K., Chroust, K.: Stability of transgene in Drosophila melanogaster by temperature gradient gel
elctrophoresis and sequencing. V. pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno, 14.2. 2001.
s. 55-56, 2001.
V části projektu zaměřené na analýzu genomu člověka metodami molekulární
cytogenetiky byly rozpracovány nové postupy techniky FISH umožňující detekci genetických
změn na úrovni chromozomů. Ve spolupráci s OLG FN Brno, KDO FN Brno a IHOK FN
Brno jsme řešením tohoto projektu dosáhli zavedení nových diagnostických postupů, které
jsou využívány v oblasti biomedicíny. V průběhu let 2000-2004 jsme postupně provedli řadu
pilotních studií zaměřených na rozpracování jednotlivých metod molekulární cytogenetiky a
jejich využití v klinické praxi; v roce 2000 jsme zavedli metodu komparativní genomové
hybridizace (CGH), v roce 2002 jsme se zaměřili na využití metody spektrálního
karyotypování (SKY), v roce 2003 jsme zavedli metodu FICTION (fluorescenční
imunofenotypizace a interfázní in situ hybridizace) a v roce 2004 jsme rozpracovali techniku
komparativní genové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH). Využití těchto technologií
vedlo k podstatnému zvýšení efektivity cytogenetické diagnostiky při detekci genetických
příčin vrozených vad a geneticky podmíněných patologických stavů jak v oblasti klinické
genetiky, tak v oblasti prediktivní onkologie.
Kuglík, P., Václavík, P., Oltová, A., Popelínská, E., Wernerová, V.: The identification of supernumerary marker
chromosomes in five patients by fluorescent in situ hybridization. Abstrakct. Cytogenet. Cell Genet. 85, 39,
1999. IF 1,162.
Diplomové práce:
Paseková Renata: Detekce mikrodelece 22q11 využitím techniky fluorescenční hybridizace in situ. 1999.
Školitel: P. Kuglík.
Václavík Petr: Identifikace vrozených markerových chromozomů člověka pomocí techniky fluorescenční
hybridizace in situ. 2000. Školitel: P. Kuglík.
Procházková Martina: Detekce prognosticky významných genetických markerů u neuroblastomu s využitím
interfázní fluorescenční in situ hybridizace (FISH). 2000. Školitel: P. Kuglík.
Radilová Hana: Využití molekulárně cytogenetických metod při diagnostice pacientů s PraderWilli/Angelmanovým syndromem. 2001. Školitel: P. Kuglík.
Sedláčková Martina: Aplikace molekulárně-cytogenetických metod při diagnostice u multiformního
glioblastomu. 2002. Školitel: P. Kuglík.
Adámková Lenka: Detekce Ph chromozomu u chronické myeloidní leukemie pomocí techniky fluorescenční
hybridizace in situ. 2002. Školitel: P. Kuglík.
Budínská Eva: Využití statistických metod při molekulárně cytogenetických analýzách genetických
patologických stavů. 2004. Školitel: P. Kuglík.
Dvořáková, E.: Charakterizace cytogenetických změn u multiformního glioblastomu pomocí metod
fluorescenční hybridizace in situ a spektrálního karyotypování. 2004. Školitel: P. Kuglík.
Stibor Erik: Stanovení plodič buněk pomocí fotometrických metod. 2003. Školitel: P. Kuglík.
Loja Tomáš: Optimalizace přípravy a zpracování preparátů pro molekulárně cytogenetické analýzy se
zaměřením na spektrální karyotypování. 2004. Školitel: P. Kuglík.
42
Procházková Martina: Identifikace specifických cytogenetických anomálií v genomu primárních kožních T
lymfomů. 2003. Doktorát pod dvojím vedením ČR-Francie. Školitelé: J. P. Merlio, P. Kuglík.
43
Nekódující oblasti genomu (garant: doc. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.)
Splnění cílů řešení je shrnuto do následujících tématických okruhů:
a) Mikrostruktura rostlinných a savčích telomer
Bylo zjištěno, že telomery nejsou zcela sekvenčně homogenní, a že kromě základního
sekvenčního motivu obsahují i jeho další varianty. Minoritní varianty mohou být klastrovány
na rozhraní telomera-subtelomera, nebo i uvnitř telomer, zřejmě jako důsledek
rekombinačních událostí na telomerách během evoluce. Rozmístění variantních sekvencí je
totiž druhově specifické.
Důležitým strukturním prvkem telomer savců a kvasinek je jednovláknový přesah G-bohatého
vlákna. Zjistili jsme (ve spolupráci s americkým partnerským pracovištěm), že telomery
rostlin Silene latifolia a Arabidopsis thaliana nesou G-přesahy o délce větší než 20-30
nukleotidů. Na rozdíl od telomer kvasinek a prvoků však u semenáčků Silene nese
detekovatelné přesahy jen asi polovina telomer. Zbývající frakce telomer Silene buď nenese
žádné přesahy, nebo jen přesahy kratší než 12 nt. G-přesahy byly pozorovány rovněž
v semenech a listech Silene – tkáních bez aktivity telomerázy. Tyto výsledky ukazují, že
neúplná replikace DNA opožďujícího se řetězce, a nikoli syntéza telomerázou, je primárním
mechanismem syntézy G-přesahů u rostlin. Překvapivé bylo zjištění, že frakce telomer
s detekovatelnými G-přesahy se snížila z 50% v semenáčcích na 35% v listech. Tento rozdíl
může odrážet zvýšenou citlivost G-přesahů k nukleázovému ataku v dospělých listech.
Narušení G-přesahů může fungovat jako prekursor katabolických procesů doprovázejících
senescenci listů.
Obecným rysem struktury chromatinu telomer je krátká, avšak pravidelná periodicita
nukleozomů (o 20-30 bp kratší než průměrná periodicita v daném genomu) a citlivost
krátkých oligonukleozomálních fragmentů k intranukleozomálnímu štěpení mikrokokovou
nukleázou. Na základě vlastních i literárních údajů jsme navrhli společně s prof. Trifonovem
(Izrael) tzv. sloupcový model uspořádání nukleozomů, který vysvětluje pozorované vlastnosti
telomerového chromatinu. Podle tohoto modelu je DNA rovnoměrně vinuta kolem sloupce
tvořeného navzájem spojenými histonovými oktamery. Pravidelnost struktury tak určují spíše
histon-histonové interakce než DNA-histonové interakce, poněvadž homogenní sled
telomerových repetic nevykazuje preferenční polohu vzhledem k nukleozomům. Tvorba
sloupcové struktury je dle našeho modelu kooperativním procesem, takže určitá minimální
délka chromatinového vlákna je nezbytná k dosažení termodynamické stability této struktury.
Stabilita struktury vzrůstá s délkou těchto sloupců.
Nejvýznamnější výsledky z oblasti studia rostlinných telomer a telomerázy (včetně exprese
telomerázy jako GFP-fúzního proteinu v A thaliana) byly shrnuty v kapitole knihy Telomeres
Telomerases and Cancer.
Krejčí, K., Koch, J.: An in Situ Study of Variant Telomeric Repeats in Human Chromosomes. Genomics, 58,
202-206, 1999. IF1999 3,386.
Říha, K., McKnight, T. D., Fajkus, J., Vyskot, B., and Shippen, D. E.: Analysis of the G-overhang structures on
plant telomeres: evidence for two distinct telomere architectures. Plant J. 23, 633-641, 2000. IF2000 5,629.
Fajkus, J. and Trifonov, E. N.: Columnar packing of telomeric nucleosomes. Biochem. Biophys. Res. Commun.,
280, 961-963, 2001. IF2001 2,946.
Monografie – kapitola:
Fajkus J., Zentgraf U.: Structure and Maintenance of Chromosome Ends in Plants. In: G. Krupp and R.
Parwaresch (eds.) Telomeres and Telomerases: Cancer and Biology. Landes Bioscience & Kluwer
Academic Press, pp. 314-331, 2002.
44
Krejčí, K., Koch, J.: In situ studies of human telomeres. Cytogenetics and Cell Genetics. Second European
Cytogenetics Conference July 3-6, Vienna, Austria. s. 749, 1999.
Riha, K., Vyskot, B., Fajkus, J. and Shippen, D.E.: Telomerase activity, telomere length and telomere structure
in the dicot plant Silene latifolia. Telomeres & Telomerase - Cold Spring Harbor Laboratory meeting,
March 25-28, 1999, Cold Spring Harbor, USA
Fajkus, J., Trifonov, E. N.: Columnar structure of telomeric chromatin. 12th Conversation in the Biomolecular
Stereodynamics, Albany, N.Y., USA, 19.-23.6. 2001. In: J. Biomol. Struct. Dyn., 18, , 1017-1018, 2001.
IF2001 1,243.
Fajkus, J., Sýkorová, E., Trifonov, E. N.: Columnar structure of telomeric chromatin. 2nd European workshop on:
Role of Telomeres and Telomerase in Cancer and Aging, Ladenburg, Germany 16.-18. 9. 2001. s.3, 2001.
Kubičárová, T.: Ďalšia charakterizácia telomérového chromatínu. XVI. Biologické dny “Aktuální témata
z buněčné a molekulární biologie”. Olomouc, Česká republika, 5.-7. 9. 2001. s. 16, 2001.
Fajkus, J.: What do we know about key players in the field of plant telomeres. Second workshop on Biophysics
of the Genome. Book of Abstracts p. 17, Hlohovec, Czech Republic 2. – 4. 4. 2003. Publikováno v rozšířené
formě rovněž v Biophysics of the Genome (Kozubek S. and Kozubek M., eds.), Masaryk University Brno
p.23-24, 2003.
Krejčí K., Mgr.: Detection of DNA Sequence Variants on Metaphase Chromosomes by in Situ Techniques.
2000. Školitel: E. Paleček, školitel specialista J. Fajkus.
b) Charakterizace telomer-asociovaných a dalších subtelomerových sekvencí DNA na
chromozómech modelových rostlin a charakterizace jejich nukleoproteinové
(chromatinové) struktury
V této oblasti bylo publikováno několik původních článků o charakterizaci subtelomerických
sekvencí u rostlin rodu Nicotiana a Silene. U získaných získaných sekvencí byly zjištěny
počty kopií v genomu, druhová specifita, varianty napojení na telomery a na další
subtelomerové sekvence. struktura chromatinu (periodicita nukleozomů a jejich translační
poloha vzhledem k sekvenci). U některých sekvencí (X43.1) byla zjištěna dvojí chromatinová
struktura – jednak struktura blízká struktuře chromatinu telomer o krátké periodicitě
nukleozomů, jednak typická heterochromatinová struktura s periodicitou nukleozomů
odpovídající průměrné v daném genomu. Některé ze sekvencí napojených přímo na telomery
(15Ssp) vykazovaly pouze nestabilní mononukleozomy bez specifické translační polohy, což
jsou rysy typické pro telomerový chromatin. Bylo dále zjištěno, že u všech analyzovaných
telomer-asociovaných sekvencí jsou místa napojení nenáhodná. Údaje získané na molekulární
úrovni byly ověřeny pomocí in situ hybridizace na metafázových chromozomech i natažených
vláknech DNA.
Horáková M, Fajkus J (2000) TAS49--a dispersed repetitive sequence isolated from subtelomeric regions of
Nicotiana tomentosiformis chromosomes. Genome 43:273-84 IF2000 1,610.
Sýkorová, E., Fajkus, J., Mikako, I., and Fukui, K.: Transition between two forms of heterochromatin at plant
subtelomeres. Chromosome Res. 9: 309-323, 2001. IF2001 1,835.
Sýkorová, E., Cartagena, J., Horáková, M., Fukui, K. and Fajkus, J.: Characterization of telomere-subtelomere
junctions in Silene latifolia. Mol Genet Genomics, 269, 13-20, 2003. IF2003 2,727.
Cartagena, J. A., Sykorova, E., Fajkus, J., Fukui, K.: In situ localization of short repetitive sequences on
extended DNA fibers of Silene latifolia. Asian Chromosome Colloquium, September 27-29, Beijing, China,
s.1, 2001.
45
Sýkorová, E., Horáková, M., Mikako, I., Fukui, K., Fajkus, J.: DNA and Chromatin Structure of TelomereSubtelomere Junctions in Silene latifolia. J.Biomol. Struct. Dyn., USA : Adenine press, 17, 6s. 1155-1155,
2000.
Horáková Mirka: Struktura a dynamika rostlinných telomer a subtelomer. obor Molek. a buněč. biologie. 2000.
Školitel: J. Fajkus.
Sýkorová Eva: Subtelomera - začátek konce chromosomu. Vědecká aspirantura v oboru biofyzika. 2001.
c) Charakterizace telomerázy a telomer-vazebných proteinů rostlin, jejich interakce a
úloha v syntéze telomer. Regulace telomerázy a její účast při reparaci DNA.
Na rozdíl od lidských somatických buněk je telomeráza v rostlinných buňkách přesně
regulována v závislosti na změnách v rychlosti buněčného dělení, což se projevuje mimo jiné
ve stabilitě délek telomer během vývoje rostliny. Abychom objasnili podstatu této regulace,
byl zjišťován vliv proteinových extraktů z buněčných jader rostlinných telomerázanegativních tkání na aktivitu telomerázy. Tyto pokusy ukázaly inhibici telomerázy, která byla
druhově nespecifická. Tato inhibice byla způsobena proteiny (40 kDa), které tvoří sekvenčně
specifické komplexy s G-bohatým telomerovým vláknem (viz výše), odolné k vysokým
koncentracím solí (0,6-1,0 M NaCl). Tvorbou komplexů se snižuje dostupnost G-řetězce pro
telomerázu. Jedná se o první popsané telomer-vazebné proteiny účastnící se regulace syntézy
telomer u rostlin.
Další studie telomer-vazebných proteinů byly provedeny na modelové rostlině Arabidopsis
thaliana, aby mohlo být s výhodou využito tehdy právě dokončeného genomového
sekvenačního projektu. Na základě vyhledávání orthologů známých telomer-vazebných
proteinů v rostlinných genomových databázích byla identifikována řada kandidátních
proteinů, u nichž byla následně testována in vitro afinita k telomerové sekvenci. Bylo však
třeba získat také údaje relevantní k jejich funkci na telomerách. K řešení tohoto problému
jsme sestavili soubor kandidátních telomer-vazebných proteinů A. thaliana pro analýzu jejich
protein-proteinových interakcí v kvasinkovém dvojhybridním systému. Naše výsledky
ukazují, že jeden z myb-like proteinů, AtTRP1, specificky interaguje s AtKu70, jehož úloha
v metabolismu telomer byla nedávno popsána. Analogicky ke známé interakci lidských
proteinů Ku70 a TRF2 naše výsledky naznačují, že AtTRP1 je pravděpodobným funkčním
homologem TRF2. Doména AtTRP1 zodpovědná za interakci s AtKu70 se nachází v úseku
aminokyselinové sekvence 80-269. Další protein AtTRB1, patřící do rodiny Smh (single myb
histone) vykazuje homo- i heteromerní interakce s proteiny Smh rodiny (AtTRB1, AtTRB2,
AtTRB3). Protein AtTRB1 dále interaguje s AtPot1, homologem oligonukleotid-vazebných
(OB-fold) proteinů, které vážou G-bohaté vlákno telomerové DNA. U člověka se protein
hPot1 kromě toho váže k telomerám i protein-proteinovou interakcí s komplexem TRF1, který
je zapojen do regulace délky telomer. Je možné, že protein AtTRB1 má obdobnou roli při
hromadění AtPot1 na telomerách.
Dále bylo zjištěno, že telomeráza se aktivně účastní reparačních procesů po indukované
fragmentaci genomu tabáku (tkáňové kultury BY-2) kademnatými ionty. Dochází
k několikanásobnému zvýšení její aktivity a současně k úplné obnově integrity genomu,
pokud je genotoxický stres odstraněn ve fázi, kdy je chromatin fragmentován na cca 100 kb
úseky, dříve než nastane jeho nukleosomální fragmentace.
46
Fulnečková, J., Fajkus, J: Inhibition of plant telomerase by telomere-binding proteins from nuclei of telomerasenegative tissues. FEBS Lett 467:305-310, 2000 IF2000 3,440.
Fojtová, M., Fulnečková, J., Fajkus, J., Kovařík, A.: Recovery of tobacco cells from cadmium stress is
accompanied by DNA repair and increased telomerase activity. J. Exp. Bot. 53: 2151-2158, 2002. IF2002
2,852.
Schrumpfová, P., Kuchař, M., Miková, G., Skříšovská, L., Kubičárová, T. and Fajkus, J.: Characterization of two
Arabidopsis thaliana myb-like proteins showing affinity to telomeric DNA sequence. Genome 47: 316-324,
2004. IF2003 1,861.
Kuchař, M. and Fajkus, J.: Interactions of putative telomere-binding proteins in Arabidopsis thaliana:
identification of functional TRF2 homolog in plants. FEBS Letters 578: 311-315, 2004. IF2003 3,609.
Fojtová, M., Fulnečková, J., Fajkus, J., Kovařík, A.: Reversibility of cadmium-induced apoptosis is associated
with increased level of telomerase activity in tobacco TBY-2 cells 12th Conversation in the Biomolecular
Stereodynamics, Albany, N.Y., USA, 19.-23.6. 2001 In: J. Biomol. Struct. Dyn., 18, 963, 2001. IF2001 1,243.
Fojtová, M., Fulnečková, J., Fajkus, J., Kovařík, A.: Reversal of cadmium induced apoptosis in plant cells is
associated with telomerase induction and DNA repair. 2nd European workshop on: Role of telomeres and
Telomerase in Cancer and Aging, Ladenburg, Germany 16.-18. 9. 2001. s. 1, 2001.
Fulnečková, J., Fajkus, J.: Telomere-binding Proteins from Nuclei of Telomerase-Negative Tissues Inhibit Plant
Telomerase (invited lecture). J.Biomol. Struct. Dyn., USA : Adenine press, 17, 6s. 1132-1132. 2000.
Fulnečková, J., Kubičárová, T., Fajkus, J.: Regulation of telomere maintenance in plants by telomere-binding
proteins. 2nd European workshop on: Role of telomeres and Telomerase in Cancer and Aging, Ladenburg,
Germany 16.-18. 9. 2001. s. 1, 2001.
Kubičárová, T., Fajkus, J.: Structural Biology of Telomeres. Setkání českých a slovenských strukturních biologů.
14.-16. 3. 2002 Nové Hrady, Česká Rep. Materials Structure 9, 13-14, 2002
Kuchař, M., Horáková, M., Zachová, D., Fajkus, J.: Searching for plant telomere-binding proteins using genomic
and proteomic approaches. VII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů, Sborník s. 27, Př. F. MU
Brno, Česká republika, 29.1. 2003.
Schrumpfová, P., Kuchař, M., Miková, G., Skříšovská, L., Kubičárová, T., Krejčí, L., Kunická, Z. and Fajkus, J.:
Characterisation of two Arabidopsis thaliana myb-like proteins showing affinity to telomeric DNA
sequence. VII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů, Sborník s. 33, Př.F. MU Brno, Česká
republika, 29.1. 2003.
Schrumpfová, P., Kuchař, M., Miková, G., Skříšovská, L., Kubičárová, T., Krejčí, L., Fajkus, J.:
Characterisation of two myb-like proteins showing affinity to telomeric DNA sequence from Arabidopsis
thaliana. Functional genomics and disease. No PT1/48, Hilton Hotel Prague, Czech Republic, May 14-17,
2003.
Fulnečková Jana: Nukleoproteinové komplexy telomer. 2001. Školitel: J. Fajkus.
Skříšovská Lenka: Studium proteinových interakcí pomocí dvojhybridního systému. Školitel: J. Fajkus.
Kuchař Milan: Charakterizace telomer-vazebných proteinů. 2004. Školitel: J. Fajkus.
Schrumpfová Petra: Analýza rostlinných telomer-vazebných proteinů a jejich interakcí. Školitel: J. Fajkus.
Miková-Rotková Gabriela: Studium regulace syntézy telomer s využitím genomických přístupů. Školitel: J.
Fajkus.
d) studium alternativních telomer a mechanismů jejich syntézy
Kromě syntézy telomer pomocí telomerázy existují u řady organismů (včetně rostlin a
člověka) alternativní mechanismy syntézy telomer. Podstatou těchto mechanismů mohou být
homologní rekombinace, replikace telomerových smyček za tvorby cirkulárních intermediátů,
retrotranspozice aj. Protože aktivace alternativních mechanismů syntézy telomer představuje
u člověka mechanismus rezistence k protinádorové léčbě na bázi inhibice telomerázy, má tato
oblast i perspektivní aplikační význam. Jako modelový systém pro výzkum rekombinačních
faktorů účastnících se metabolismu telomer byly použity kvasinky.
47
U rostlin byla existence alternativních telomer zjištěna u rostlin na základě rozsáhlé studie
více než 100 druhů rostlin náležejících do 29 různých čeledí v rámci řádu Asparagales.
Přitom byla identifikována fylogenetická skupina, která postrádá „typické“ rostlinné telomery
typu Arabidopsis (TTTAGGG)n. Pomocí hybridizací slot-blotů a fluorescenční in situ
hybridizace (FISH) bylo zjištěno, že typická telomerová sekvence zde byla částečně nebo
úplně nahrazena lidským typem telomerové sekvence (TTAGGG)n. Výjimku tvoří druhy rodu
Allium, které postrádají oba zmíněné typy telomer, stejně jako další známé minisatelitní
telomerové motivy. U druhů rodu Allium rovněž nebyla zjištěna aktivita telomerázy, ačkoli
směšovací pokusy prokázaly, že absence aktivity není důsledkem přítomnosti inhibitorů
telomerázy. Telomerázy rostlin s lidským typem telomer se vyznačovaly až 25% úrovní chyb
v syntéze. V této fylogenetické skupině Asparagales došlo tedy v důsledku mutace
telomerázy k náhradě syntézy telomer typu Arabidopsis syntézou telomer lidského typu o
nízké přesnosti. V dalším kroku (uvnitř čeledi Alliaceae, u rodu Allium) následně došlo i ke
ztrátě tohoto typu telomer.
Podobné studie v rámci čeledi dvojděložných rostlin Solanaceae ukázaly, že zástupci rodu
Cestrum a blízce příbuzných rodů Vestia a Sessea postrádají telomery typu Arabidopsis (které
jsou jinak typické např. pro rody Solanum a Nicotiana z téže čeledi) i telomery typické pro
obratlovce (TTAGGG)n. Asymetrická PCR však ukázala přítomnost krátkých úseků
(TTTAGGG) sekvence roztroušených v genomu. Protože tyto roztroušené telomerové
sekvence (ITS) jsou pravděpodobným pozůstatkem
původních telomer, bylo
charakterizováno jejich okolí s cílem nalézt sekvenci DNA, která tvoří současné telomery u
těchto rostlin. Byly nalezeny tři rodiny sekvencí, nazvané NA3G, BR23 a A/T- bohaté
minisatelity. Tyto vysoce repetitivní sekvence se vyskytují roztroušeně v genomu a jsou
klastrovány v několika chromozomových lokusech. Jejich asociace s ITS, které mohou
fungovat jako rekombinační „horká místa“, naznačuje dávné rekombinace a fúze
chromozomů, které mohly přispět ke vzniku neobvykle velkých chromozomů u rodu Cestrum.
Tyto sekvence jsou často uspořádány jako bloky NA3G-ITS-BR23, zanořené v oblasti A/Tbohatých minisatelitů. Konsensní sekvenci těchto minisatelitů 5’-T4-5AGCAG-3’ lze pokládat
za derivát typických telomerových sekvencí eukaryot. Tato sekvence se hojně vyskytuje na
koncích chromozomů rostlin rodů Cestrum, Vestia a Sessea, avšak chybí u blízce příbuzných
rodů, které mají typické telomerové sekvence. Mohlo by to znamenat, že amplifikace těchto
A/T-bohatých minisatelitních sekvencí představuje evoluční odpověď genomu na ztrátu
typických telomerových sekvencí.
Posledním typem alternativních telomer studovaných v rámci VZ byly telomery lineárních
mitochondriálních chromozomů kvasinky Candida parapsilosis. Ve spolupráci s UK
Bratislava byla získána kompletní sekvence mitochondriálního genomu této kvasinky (3x104
bp). Telomery této kvasinky tvoří tandemové repetice o délce jednotky 738 bp. Tvoří
telomerové smyčky a jejich udržování probíhá přes cirkulární intermediáty.
Publikace v odborných časopisech:
Sýkorová, E., Lim, K.Y., Kunická, Z., Chase, M.W., Bennett, M.D., Fajkus, J. and Leitch, A.R.: Telomere
variability in the monocotyledonous plant order Asparagales. Proc. R. Soc. Lond. B. 270, 1893-1904, 2003.
IF2003 3,544.
Sýkorová, E., Lim, K.Y., Chase, M.W., Knapp, S., Leitch, I.J., Leitch, A.R. and Fajkus, J.: The absence of
Arabidopsis-type telomeres in Cestrum and closely related genera Vestia and Sessea (Solanaceae): first
evidence from eudicots. Plant J. 34, 283-291, 2003. IF2003 5,914.
Kunická, Z.: Studium alternativních rostlinných telomer. Biologické listy 68, 203-206, 2003.
Sýkorová, E., Lim, K.Y., Fajkus, J., Leitch, A.R.: The signature of the Cestrum genome suggests an evolutionary
response to the loss of (TTTAGGG)n telomeres. Chromosoma 112, 164-172, 2003. IF2003 2,634.
Rotková, G., Skleničková, M., Dvořáčková, M., Sýkorová, E., Leitch, A.R., Fajkus, J.: An evolutionary change
in telomere sequence motif within the plant section Asparagales had significance for telomere nucleoprotein
complexes. Cytogenet Genome Res 107:132-138, 2004. IF2003 0,497.
48
Nosek, J., Novotná, M., Hlavatovičová, Z., Ussery, D.W., Fajkus, J., Tomáška, L.: Complete DNA sequence of
the linear mitochondrial genome of the pathogenic yeast Candida parapsilosis. Mol Genet Genomics 272:
173-180, 2004. IF2003 2,727.
Krejčí, L., Damborsky, J., Thomsen, B., Duno, M. and Bendixen, C.: Dissection of homologous recombination.
EMBO workshop “Functional organization of the Cell Nucleus”, Prague, August 9-12, s. 99,1999.
Krejčí, L., Damborský, J., Thomsen, B., Duno, M. and Bendixen, C.: Molecular dissection of homologous
recombination. 4th European Meiosis Meeting-FEBS advanced course 99-06, September 18-22, Obertraum,
Austria, 1999.
Krejci, L., Thomsen, B., Duno, M., Westergaard, O. & Bendixen, C.: Homomeric Interaction of the Mouse
Rad52 Protein. Mendel-Brno 2000, July 19-23, 2000, Brno, Czech Republic. J Biomol. Struct. Dyn. 17 (6),
1170, 2000. IF2000 1,826.
Sýkorová, E., Yoong Lim, K., Kunická, Z., Chase, M.W., Bennett, M.D., Fajkus, J. and Leitch, A.R.: Surprise at
chromosome termini of Asparagales plants. Second workshop on Biophysics of the Genome. Book of
Abstracts p. 44, Hlohovec, Czech Republic 2. – 4. 4. 2003. Publikováno v rozšířené formě rovněž
v Biophysics of the Genome (Kozubek S. and Kozubek M., eds.), p.71-73, Masaryk University Brno 2003.
Krejčí Lumír: Homologous recombination in yeast - Beginning at the break, break at the beginning. 2000.
Kunická Zuzana: Molekulární analýza typických a alternativních telomer. 2004. Školitel: J. Fajkus.
e) aplikace analýzy telomer a telomerázy v diagnostice nádorových onemocnění, vývoj a
aplikace nových diagnostických technik obecně
V rámci VZ jsme se snažili využít nově zavedených technik k biomedicínským (zejména
diagnostickým aplikacím). Současně byly získány i zajímavé výsledky badatelského
charakteru. Naše výsledky a výsledky, které jsme získali ve spolupráci s dánským
partnerským pracovištěm, poprvé ukázaly, že proces alternativního prodlužování telomer (za
účasti rekombinačních proteinů) se vzájemně nevylučuje s prodlužováním telomer pomocí
telomerázy. Na základě analýzy telomer leukemických pacientů technikami in situ bylo
zjištěno, že může docházet k mnohonásobné expanzi jednotlivých telomer, a to i v buňkách,
které vykazují aktivitu telomerázy. To bylo později potvrzeno zahraničními laboratořemi.
Byla prokázána dobrá korelace aktivity a exprese telomerázy s průběhem léčby dětských
leukémií. Podobná studie byla později provedena u pacientů s kolorektálním karcinomem.
V této studii i v paralelní studii prováděné na buněčných liniích se navíc ukázalo, že aktivita
telomerázy a exprese její katalytické podjednotky (hTERT) nemusí vždy korelovat. Důvodem
je alternativní sestřih hTERT mRNA, který produkuje kromě úplné délky několik delečních
variant, z nichž jedna dokonce aktivitu telomerázy inhibuje. Z toho důvodu je test na aktivitu
telomerázy informativnější, než sledování její exprese bez současné analýzy sestřihových
variant.
Pro rychlejší a přesnější stanovení aktivity telomerázy jsme proto vyvinuli dvojbarevnou
TRAP v reálném čase, která odstraňuje nutnost postamplifikačních kroků (PAGE, barvení,
denzitometrie), protože všechny údaje poskytuje přímo obslužný software zařízení pro realtime PCR. Navíc jsou údaje snímány v exponenciální fázi amplifikace, a proto odpovídají
kvantitativně lépe skutečnosti, než klasicky snímané údaje z plató fáze PCR.
Kromě těchto studií přímo souvisejících s analýzou telomer a telomerázy byly molekulárněbiologické metody aplikovány i na další problémy řešené na partnerských brněnských
medicínských pracovištích. Pomocí genomového sekvenování byla např. provedena detailní
analýza metylačního stavu CpG ostrova Pa-promotoru bcr-abl fúzního genu u CML pacientů
a buněčných linií (dosud byly známy pouze údaje o metylaci cílových míst restrikčních
endonukleáz). Byla zjištěna korelace mezi aktivitou telomerázy, metylačním stavem bcr-abl
49
genu a progresí onemocnění u pacientů s diagnózou CML. Naše studie ukazuje, že restrikční
analýza kombinovaná s PCR je schopná nalézt řídké případy hypermetylace, např. pro
diagnostické účely, ale neodráží dominující úroveň metylace v Ph’+ buňkách. Dále byla
zavedena molekulární diagnostika některých nervosvalových onemocnění (např. pletencové
svalové dystrofie).
Maláska, J., Skleničková, M., Krejčí, K., Bajer, M., Hrstková, H., Fajkusová, L., Fajkus, J.: Telomerase Activity
and Expression and Telomere Analysis in Situ in the Course of Treatment of Childhood Leukemias. Blood
Cells Mol. Dis. 26(5) 534-539, 2000. IF2000 2,897.
Fajkus, J., Šimíčková, M., Maláska, J.: Tiptoeing to chromosome tips: facts, promises and perils of today's
human telomere biology. Phil. Trans. R. Soc. Lond. Ser. B-Biol. Sci. 357:545-562, 2002. IF2002 3,410.
Fajkus J.: Genomika v koncích – pokroky a perspektivy v biologii telomer. Informační listy GSGM 25, 20-29,
2002.
Fajkus, J., Borský, M., Kunická, Z., Kovaříková, M., Dvořáková, D., Hofmanová, J., Kozubík, A.: Changes in
Telomerase Activity, Expression and Splicing in Response to Differentiation of Normal and Carcinoma
Colon Cells. Anticancer Res. 23, 1605-1612, 2003. IF2002 1,347.
Fajkus, J., Koppová, K., and Kunická, Z.: Dual-color real-time telomeric repeat amplification protocol.
BioTechniques 35, 912-914, 2003. IF2003 2,383.
Maláska, J., Kunická, Z., Borský, M., Skleničková, M., Novotná, M., Fajkusová, L., Žaloudík, J., Fajkus, J.:
Telomerase as a diagnostic and predictive marker in colorectal carcinoma. Neoplasma 51: 90-96, 2004.
IF2003 0,782.
Chrobakova, T., Hermanova, M., Kroupova, I., Vondráček, P., Marikova, T., Mazanec, R., Zamecnik, J., Stanek,
J., Havlova,M., Fajkusova, L.: Mutations in Czech LGMD2A patients revealed by analysis of calpain3
mRNA and their phenotypic outcome. Neuromuscul Disord. 14: 659-65, 2004. IF2003 2,894.
Fajkus, J., Skleničková, M., Koppová, K., Kunická, Z.: Proč je biologie telomer, ač módní, přesto užitečná?
Edukační sborník, XXVII. Brněnské onkologické dny a XVII. Konference pro sestry a laboranty, 22.-24.
května 2003 (zvaná přenáška otištěná v plném znění). Vydal Masarykův onkologický ústav v Brně 2003, J.
Žaloudík a R. Vyzula (eds.), str. 82-86, 2003.
Fajkus, J., Maláska J., Skleničková, M., Vyzula, R., Bajer, M. Hanke, I., Kala, Z. and Fajkusová, L.: Using
detection of telomerase activity and expression in oncology diagnostics. The Wilhelm Bernhard’s workshop
– 16th International Workshop on the Cell Nucleus. Prague, August 23-27, s. A27, 1999.
Maláska, J., Skleničková, M.: Telomeráza-aktivita a diagnostické použití u leukémií a solidních tumorů. 43.
Studentská vědecká konference LF MU, Brno, 12. 5. 1999. s. 16-17, 1999.
Fajkusová, L., Fajkus, J., Poláčková, K., Dvořáková, D., Krahulcová, E., Fulneček, J.: Detailní mapování
methylcytosinů v oblasti Pa promotoru bcr-abl lokusu u pacientů s diagnózou CML a dvou modelových
buněčných linií, K562 a BV173. XII. Český a slovenský hematologický a transfuziologický sjezd
s mezinárodní účastí. Olomouc 1.-4. září 1999. s. 221, 1999.
Maláska, J., Bajer, M., Hrstková, H., Bajerová, K., Michálek, J., Fajkus, J.: Sledování aktivity telomerázy
v průběhu léčby dětských leukémií. XII. Český a slovenský hematologický a transfuziologický sjezd
s mezinárodní účastí. Olomouc 1.-4. září 1999. s. 152, 1999.
Maláska J., Fajkus J., Bajer M., Hrstková H., Bajerová K., Michálek J., Fajkusová L., Vyzula R., Krejčí K.,
Skleničková M.: Telomerase Activity and Expression in the Course of Treatment of Acute Childhood
Leukemias Miami Nature Biotechnology Winter Symposium, February 5-9, 2000, Advances in Gene
Technology: DNA, RNA and CANCER, Miami USA. S. 29a, 2000.
Skleničková, M., Dvořáčková, M., Fajkus, J.: Využití in situ technik v analýze telomer nádorových buněk.
Analytická cytometrie II, konference s mezinárodní účastí. Sborník abstraktů s. 108, Brno, Česká republika,
11.-14. 5. 2003.
Diplomové práce:
Skleničková Marie: Stanovení aktivity telomerázy v diagnostice nádorových onemocnění. 1999. Školitel: J.
Fajkus.
Koppová Květa: Vztah aktivity telomerázy k buněčné proliferaci a diferenciaci. 2003. Školitel: J. Fajkus.
Zapletalová Eva: Molekulární diagnostika DMD, BMD a XLDC. 2003. Školitel: L. Fajkusová.
Prokopcová Jana: Analýza alternativních sestřihů v mRNA dystrofinového genu. 2004. Školitel: L. Fajkusová .
Chrobáková Táňa: Zavedení molekulární diagnostiky LGMD (limb-girdle muscular dystrophy) typu 2A a 2B.
2004. Školitel: L. Fajkusová.
50
Skleničková Marie: Využití analýzy telomer v onkologické diagnostice. 2003. Školitel: J. Fajkus.
Maláska Jan: Molekulární prediktivní markery v onkologii. 2004. Školitel: R. Vyzula, konzultant J. Fajkus.
Zapletalová Eva: Kvantitativní stanovení SMN1 a SMN2 genů u pacientů a heterogenních přenašečů spinální
muskulární atrofie. Školitel: L. Fajkusová.
f) Aplikace analýzy konců chromozómů v genetice a šlechtění rostlin - využití
variability ve struktuře telomer a subtelomer pro genotypizaci odrůd bramboru
Časté rekombinace, k nímž dochází v subtelomerových oblastech chromozómů, jsou
zdrojem vysoké variability těchto genomových domén. Proto jsme analyzovali telomerové
a telomer-asociované sekvence bramboru, a získané sekvence použili k navržení
sekvenčně-specifických primerů. Bylo ukázáno, že vhodné kombinace těchto primerů
umožňují spolehlivě odlišit jednotlivé odrůdy bramboru. Oproti často používané technice
RAPD mají sekvenčně specifické primery výhodu vyšší reprodukovatelnosti výsledků,
poněvadž PCR probíhá za vysoce specifických podmínek, což u arbitrárních primerů
možné není.
Fajkus J., Novotná, M., Ptáček, J.: Analysis of chromosome termini in potato varieties. Rostlinná výroba 48:
477-479, 2002. IF2002 0,333.
Fajkus, J., Neplechová, K., Sýkorová, E., Ptáček, J.: Využití variability struktury konců chromozomů pro
genotypizaci odrůd bramboru. Brmborářství XI(1): 2-3, 2004.
Fajkus, J., Ptáček J., Neplechová, K., Novotná, M.: Studium konců rostlinných chromozomů a jeho aplikace v
charakterizaci odrůd bramboru. In Vědecké práce 14 - Výzkumný ústav bramborářský Havlíčkův Brod.
Havlíčkův Brod, VÚB, s. 47-54, 2003.
51
2.2. Stručná souhrnná charakteristika dosažených cílů řešení, přínos
řešení výzkumného záměru
Přínos VZ vidíme v následujících oblastech:
1) vlastní vědecké výsledky dosažené v rámci VZ, které přispěly k rozvoji poznání a
vývoji či zavedení nových laboratorních metod a postupů.
2) těsnější spojení výzkumné a pedagogické práce
3) posílení vědecké spolupráce na národní i mezinárodní úrovni
4) personální rozvoj vědeckých týmů na VŠ
5) zlepšení přístrojového vybavení
Vlastní vědecké výsledky dosažené v rámci VZ, které přispěly k rozvoji
poznání a vývoji či zavedení nových laboratorních metod a postupů.
Řešení VZ (1999-2004) přispělo v týmu prof. Doškaře k rozvoji molekulární identifikace a
diagnostiky významných patogenních druhů bakterií způsobujících závažné infekce, které
představující v celosvětovém měřítku přetrvávající zdravotnický problém. Konkrétně se jedná
o:
•
•
•
•
Druhová diagnostika druhu S. aureus: Byla identifikována nukleotidová sekvence DNA specifická pro
druh S. aureus, která se stala základem pro přípravu originální molekulární sondy a PCR reakce
umožňující identifikaci klinických kmenů. V mezinárodním měřítku se jedná teprve o druhý případ
druhově specifické sekvence pro S. aureus s univerzálním použitím. Metoda založená na použití PCR
významně zpřesňuje a urychluje druhovou identifikaci kmenů druhu Staphylococcus aureus jako
nejvýznamnějšího patogenního druhu a umožňuje jeho jednoznačné odlišení od ostatních druhů r.
Staphylococcus, které se vyskytují v klinickém materiálu.
Typizace kmenů S. aureus založená na jejich profágovém profilu: Na základě komplexní srovnávací
analýzy genomů stafylokokových mírných bakteriofágů byly identifikovány nukleotidové sekvence
DNA specifické pro fágové druhy, které lyzogenizují kmeny druhu S. aureus. Tyto sekvence byly
použity k vypracování metody multiplex PCR pro stanovení profágového profilu kmenů S. aureus.
Jedná se o zcela novou a v celosvětovém měřítku prioritní typizační metodu, umožňující odlišit i velmi
blízce příbuzné kmeny. Účinnost této metody byla testována na klinických kmenech izolovaných
z nemocničního prostředí, kde byla prokázána její vysoká citlivost převyšující v určitých parametrech
citlivost ostatních genotypizačních metod.
Srovnání fenotypizačních a genotypizačních metod pro diagnostiku stafylokoků: Stafylokoky patří mezi
významné lidské i zvířecí patogeny, které způsobující řadu infekčních onemocnění. Rychlá a přesná
identifikace činitele vyvolávajícího onemocnění je nezbytný předpoklad účinné léčby. Moderní metody
na určování stafylokokových druhů jsou založeny na analýze jejich genomů. Za tímto účelem byla
vypracována a optimalizována řada metod určených pro molekulární identifikaci a typizaci patogenních
druhů stafylokoků. Výsledky umožnily komplexní genotypovou charakterizaci stafylokokových kmenů
způsobujících nozokomiální infekce v ČR. Byly doporučeny molekulárně genetické metody vhodné pro
diagnostiku jednotlivých skupin klinicky významných stafylokoků.
Genotypová analýza klinicky významných kmenů enterokoků rezistentních k antibiotikům: Byla
stanovena genetická příbuznost kmenů rodu Enterococcus rezistentních k vankomycinu (VRE),
izolovaných z klinického materiálu, komunitního prostředí a veterinární oblasti v regionu Olomouckého
kraje. Cílem analýz bylo formulovat hypotézu o zdroji a šíření VRE. Kmeny VRE izolované z
gastrointestinálního traktu osob jak v komunitním, tak nemocničním prostředí vykazují vysokou
genotypovou rozmanitost a jsou endogenního původu, naopak kmeny izolované ze závažného
klinického materiálu (např. hemokultury) vykazují v nemocničním prostředí vysokou příbuznost a lze
proto předpokládat jejich klonální šíření.
52
•
•
Identifikace a popis nových druhů stafylokoků a příbuzných druhů bakterií na základě jejich genotypové
analýzy: Cílem bylo přesně klasifikovat a taxonomicky zařadit atypické bakteriální kmeny rodů
Enterococcus, Staphylococcus a Macrococcus, které vykazovaly řadu fenotypových a genotypových
odlišností od dosud známých druhů. Na základě podrobné fenotypové a molekulárně biologické
charakteristiky bylo popsáno a validováno šest nových bakteriálních druhů - Enterococcus
haemoperoxidus a E. moraviensis, Macrococcus hajekii, M. brunensis a M. lamae, a Staphylococcus
saimirii.
Molekulární charakterizace a typizace toxinogenních kmenů Staphylococcus aureus: Toxinogenní
kmeny Staphylococcus aureus se vyznačují vysokou virulencí způsobenou jejich schopností produkovat
toxiny, které jsou u lidí příčinou závažných toxikóz. Molekulárně-genetickou analýzou genomu
klinických izolátů S. aureus byla zjištěna genotypová příbuznost ET- a TSST-1-pozitivních kmenů,
které byly příčinou epidermolýz a syndromu toxického šoku v různých lokalitách ČR. Diagnostika
toxinogenních kmenů byla zpřesněna novými PCR metodami a rychlou metodou detekce genů
virulence v koloniích stafylokoků. Experimentálně byl prokázán horizontální přenos genů pro exfoliatin
A mezi kmeny stafylokoků prostřednictvím fága, což významně přispívá k objasnění roli mírných
bakteriofágů ve vzniku virulentních kmenů a v evoluci druhu S. aureus.
•
Odchyt hematofágních členovců, hlodavců a roztočů z různých lokalit ČR, izolace spirochet z těchto
vektorů a screening genomu spirochet pomocí PCR: Cílem této výzkumné části bylo získat dostatečné
množství vektorů a hostitelů borrelií a zjistit u nich přítomnost spirochet se zřetelem na Borrelia
burgdorferi. Podařilo se získat 57 izolátů spirochet, z toho 34 izolátů z klíšťat, 18 izolátů z hlodavců, 4
izoláty z komárů a 1 izolát z roztoče. Z uvedeného počtu bylo 54 izolátů borrelií. Navíc se podařilo
získat vůbec první výsledky v souvislosti s výzkumem exoparazitů volně žijících hlodavců jakožto
dalších možných vektorů patogenních spirochet, tj. organismů, ve kterých by mohlo docházet
k pomnožení borrelií.
•
Analýza vzorků spirochet se zaměřením na záchyt a identifikaci Borrelia burgdorferi sensu lato pomocí
PCR (nested PCR), charakterizace těchto vzorků a sledování jejich bílkovinného spektra včetně změn
v rámci jednotlivých pasáží (SDS-PAGE): Proteinové složení získaných izolátů spirochet (borrelií) bylo
sledováno pomocí gradientové elektroforézy (SDS-PAGE). Takto se podařilo zjistit některé rozdíly
mezi proteiny našich kmenů B. garinii a B. afzelii. V další fázi byly takto studovány i změny
proteinového složení u jednotlivých pasáží izolovaných kmenů spirochet. Pro souběžné zjišťování
přítomnosti borélií - B. burgdorferi sensu stricto, B. afzelii nebo B. garinii v komárech, komářích
larvách, klíšťatech a tkáních divoce žijících hlodavců byla použita vysoce specifická a senzitivní one
tube nested PCR.
•
Analýza genomu získaných spirochet restrikční analýzou (PCR-RFLP) a stanovení jejich genetické
příbuznosti. Sekvencování DNA z kultur Borrelia burgdorferi získaných z komárů, komářích larev,
klíšťat a divoce žijících hlodavců, identifikace jednotlivých antigenních struktur odpovědných za
patogenitu spirochet: Spirochetální kmeny získané z klíšťat Ixodes ricinus byly identifikovány jako
Borrelia afzelii, Borrelia garinii, Borrelia burgdorferi sensu stricto a podařilo se zachytit i směsné
infekce B. garinii + B. afzelii a B. garinii + B. burgdorferi sensu stricto. Dva druhy byly sekvenováním
identifikovány jako Borrelia valaisiana. Izoláty získané z divoce žijících hlodavců (r. Apodemus, r.
Microtus, r. Clethrionomys aj.) byly identifikovány jako B. afzelii a B. garinii. Jediný izolát z roztoče
(Haemogamasus sp.) představuje B. afzelii a velice vzácný je jeden záchyt B. afzelii u komára Culex
pipiens molestus. Těmito výsledky tak byl potvrzen výskyt nejen hlavních borreliových druhů České
republiky, ale i spektrum potenciálních přenašečů borrelií. V roce 2003 však bylo zahájeno i studium
neznámých spirochet založené na analýze OspC genu, které je však ve stádiu výzkumu.
•
Zavedení metodiky Western blot ke zjišťování antigenní schopnosti určitých boreliových proteinů (tj.
schopnosti vyvolat imunitní odpověď) a imunizace myší jednoho inbredního kmene stejným boreliovým
antigenem získaným z různých zdrojů (vektor, hostitel) s cílem identifikovat, které antigeny se podílejí
na imunitní odpovědi, a jak silná je jejich odpověď: Zavedení metodiky Western blot v roce 2003 bylo
základním krokem pro možnost ověření přítomnosti antiborreliových protilátek v sérech různých
organismů. Metoda byla použita hlavně k potvrzení pozitivity výskytu onemocnění LB u policejních
psů, ale bude dále využita ke zjišťování antigenních schopnosti určitých borreliových proteinů vyvolat
imunitní odpověď. Podařilo se zjistit vysoký výskyt antiborreliových protilátek u hlodavců, ale
statisticky významné rozdíly v získání protilátek proti borreliím na základě imunizace myší stejným
borreliovým kmenem získaným z různých zdrojů zjištěny nebyly.
53
V týmu doc. Brzobohatého byla funkční analýza genomu zaměřena na identifikaci a
charakterizaci genů účastnících se klíčových regulačních a metabolických procesů růstu a
diferenciace rostlin analýzou příslušných sekvencí genomu Arabidopsis thaliana a dalších
modelových rostlin s cílem přispět k porozumění molekulární podstaty kontroly růstových a
diferenciačních procesů u rostlin na komplexní úrovni propojující fyziologii a genetiku
rostlin. Dosažení tohoto cíle zahrnovalo vytvoření nezbytných bioinformatických nástrojů
funkční genomiky K nejvýznamnějším výsledkům získaným přístupy funkční genomiky patří
objev role senzorové histidinkinázy CKI1 ve vývoji samičího gametofytu. Byla započata
systematická analýza funkce genů kódujících regulátory odpovědi. Na úrovni molekulární
charakterizace identifikovaných proteinů byly vytvořeny nezbytné metodické předpoklady
pro studium molekulární determinace katalytického působení β-glukozidázy, která se může
podílet na regulaci buněčného dělení uvolňováním biologicky aktivních forem cytokininů
z jejich neaktivních glukozidů a byly získány první poznatky o molekulární architektuře jejího
katalytického centra. Vzhledem ke zjištěné lokalizaci této β-glukozidázy v plastidech a
chloroplastech je pravděpodobné, že se může podílet na regulaci cirkadiánních změn
v hladinách glukozidů cytokininů v chloroplastech celistvých rostlin, které jsme zjistili při
řešení komplementárního projektu. Pro průkaz předpovězených funkcí genů na organizmální
úrovni byly etablovány nové systémy regulovatelné exprese transgenů u rostlin. V oblasti
studia vztahů mezi metabolismem a působením rostlinných hormonů na úrovni celistvých
rostlin byly získány nové poznatky v oblasti regulace aktivity nitrát reduktázy endogenními
cytokininy, byl vypracován a validován matematický model simulující metabolismus
cytokininů a byla započata analýza interakcí regulačních obvodů jednotlivých tříd hormonů.
Dále bylo identifikováno 6 nových embryonálně letálních mutací A. thaliana a lokalizován
defekt v průběhu embryogeneze. U jedné T-DNA mutace byl izolován gen a jeho sekvence,
podle níž byl gen charakterizován. Jedná se o gen kódující PPR protein.
Pomocí kolekce pozdně kvetoucích mutantů A. thaliana získaných na oddělení genetiky byla
charakterizována nová regulační dráha indukce kvetení (metylační dráha) a geny této
metylační dráhy byly zařazeny do existujícího modelu regulace kvetení. U mutantů byly
identifikovány nové modifikátorové geny pozdního kvetení u Arabidopsis thaliana. U
pozdních linií z přírodních populací bylo potvrzeno, že pozdnost je u těchto rostlin
determinována genem FRI.
Ve výzkumném týmu doc. Šmardy přispělo řešení výzkumného záměru k pochopení
významu určitých meziproteinových interakcí při regulaci proliferace, diferenciace a
apoptózy leukemických monoblastů transformovaných onkogenem v-myb. Byly nalezeny
podmínky, při kterých tyto leukemické buňky ztrácejí svůj leukemický charakter a (1)
obnovují svou fyziologickou schopnost diferenciace do monocytů a makrofágů (exprese p53,
c-jun a retinoidových receptorů RARα, RXRα) nebo (2) aktivují schopnost programované
buněčné smrti (exprese c-fos). Zvýšení hladiny histonových acetyltransferáz CBP a p300 sice
neumožnilo diferenciaci monoblastů BM2, ale významně zvýšilo jejich citlivost na induktory
kyselinu retinovou a forbolový ester TPA, které navozují zrání jiných typů leukemických
buněk. Rozvolnění struktury chromatinu acetylací histonů působením inhibitoru deacetyláz
trichostatinu A se podařilo vyvolat diferenciaci buněk BM2. Ze získaných výsledků vyplývá,
že posílením exprese určitých genů (např. činidly, která zbavují nukleotidové sekvence
inhibičních metylových skupin) a současným rozvolněním struktury chromatinu (např.
činidly, která zvyšují úroveň acetylace histonů), lze úspěšně dosáhnout eliminace
leukemického charakteru monoblastů transformovaných onkogenem v-myb. Podobné přístupy
však budou pravděpodobně účinné i při determinaci osudu jiných leukemických buněčných
typů.
54
Řešením výzkumného záměru jsme rovněž prokázali, že mutace vznikající ve
sledovaných transgenech (lacZ, glutathion S-transferáza) Drosophila melanogaster jsou
náhodné a jejich přenos do dalších generací je sporadický. Výsledky v oblasti sledování
somatických mutací a rekombinací po působení jmenovaných chemických látek ze skupiny
halogenovaných alifatických uhlovodíků prokázaly shodu se známými výsledky na jiných
modelových organizmech. Vedly k pochopení principu vzniku mutací a rekombinací
v genomu drozofil a vytvoření designu pro podrobnější zkoumání jejich účinků. Chemikálie,
které vyvolávají tvorbu více početných somatických mutací na úkor malých mutací a těch,
které vyvolávají ve větší míře tvorbu somatických rekombinací budou dále sledovány i
v souvislosti s jejich přenosem do dalších generací prostřednictvím transgenů.
Molekulárně cytogenetické metody vyvinuté pro analýzu lidského genomu přinesly
nové a přesnější poznatky o mechanismu vzniku chromozomových aberací a o důsledcích
vrozené i získané chromozomomové nestability pro patogenezi mnoha geneticky
podmíněných chorob. U vrozených chromozomových aberací jsme potvrdili, že systematické
využívání metod molekulární cytogeneticky v klinické genetice umožňuje efektivní skríning
aneuploidií chromozomů 13, 18, 21, X a Y pro účely preimplantační a prenatální diagnostiky,
odhalení příčin dalších syndromů a patologických stavů podmíněných chromozomovými
přestavbami (zejména mikrodeleční syndromy, delece subtelomerických oblastí chromozomů
u pacientů s PMR) či identifikaci nadbytečných markerových chromozomů.
U onkologických onemocnění nově zaváděné techniky molekulární cytogeneticky (zejména
metody CGH a SKY) potvrdily prognostický význam již známých specifických
chromozomových aberací (např. amplifikace onkogenu N-myc, del(1p36) u neuroblastomu) a
navíc pomohly odhalit nové, rekurentní chromozomové aberace s diagnostickým a
prognostickým významem u dětských solidních nádorů (např. gain(17q), del(11q) u
neuroblastomu, stanovení amplifikace c-myc u meduloblastomu). Vyšetření těchto
genetických markerů se stalo součásti vstupní diagnostiky pacientů KDO FN Brno.
V týmu doc. Fajkuse přispělo k rozvoji poznání v oblasti biologie telomer. Konkrétně se
jedná o:
• objasnění vnitřní struktury telomer a subtelomer: výskyt přesných a variantních
telomerových repetic, charakterizace řady subtelomerových sekvencí, popis specifické
struktury chromatinu telomer a telomer-asociovaných sekvencí pomocí sloupcového
modelu uspořádání nukleozomů, existence chromozom-specifických variant napojení
telomer na subtelomery; formulace hypotézy, že při shodné sekvenci telomer jsou to
právě varianty jejich napojení na subtelomery, případně variantní uspořádání
subtelomerových bloků sekvencí, které dodávají jednotlivým koncům chromozomů
individuální charakter a jsou podstatou specifické regulace na úrovni jednotlivých
telomer. Poruchy této regulace se mohou projevovat např. jako extrémní expanze jediné
telomery, ckterou jsme pozorovali u leukemických pacientů.
• regulace syntézy telomer: u rostlin byl detekován a částečně charakterizován historicky
první protein s regulační úlohou při syntéze telomer. Následně byly identifikovány další
telomer-vazebné proteiny a u některých zjištěna jejich role při regulaci syntézy telomer
na základě jejich protein-proteinových interakcí. U lidských embryonálních a
nádorových buněk tlustého střeva bylo zjištěno, že ačkoli oba typy buněk exprimují
telomerázu, při indukované diferenciaci je útlum aktivity rychlejší v embryonálních
buňkách díky další fungující regulaci na úrovni alternativního sestřihu mRNA pro
katalytickou podjednotku telomerázy hTERT. Alternativní sestřih hTERT mRNA byl
následně poprvé popsán i přímo ve vzorcích nádorů z pacientů s kolorektálním
karcinomem (předtím byl znám jen u buněčných linií).
55
•
objev alternativních telomer u rostlin: výsledek studia domnělé ztráty telomer u
rozsáhlé fylogeneticky definované skupiny rostlin řádu Asparagales a dvojděložných
rostlin rodu Cestrum. V molekulární evoluci telomer Asparagales byly zjištěny dva
evoluční zlomové body, v nichž byla nejprve v důsledku mutace telomerázy nahrazena
původní „rostlinná“ sekvence TTTAGGG sekvencí lidského typu TTAGGG, aby
v dalším bodě (uvnitř čeledi Alliaceae) došlo ke ztrátě i těchto sekvencí a aktivity
telomerázy. Tento objev otevírá zcela nové perspektivy: vzhledem k tomu, že rostliny se
vyznačují vysokou pestrostí produktů sekundárního metabolismu, mohou být rostliny
s lidským typem telomer cenným zdrojem inhibitorů telomerázy pro protinádorovou
léčbu.
• vývoj a aplikace nových molekulárně-diagnostických technik: tato oblast má nejjasnější
aplikační výstupy v případě zavedení analýzy délky telomer v nádorových buňkách
pomocí Q-FISH, popisu dvojbarevné varianty stanovení aktivity telomerázy v reálném
čase (dual-color RQ-TRAP) a zavedení molekulární diagnostiky některých
nervosvalových onemocnění a jejích přenašeček.
O uznání podílu laboratoře na poznání v oblasti biologie telomer v národním a mezinárodním
kontextu svědčí jednak úspěšná účast laboratoře v mezinárodních a národních spolupracích,
jednak udělená ocenění - Cena za výzkum MŠMT za rok 2000, Prémie O. Wichterleho 2002.
Těsnější spojení výzkumné a pedagogické práce
Do řešení VZ byli v široké míře zapojeni studenti magisterského programu oborů
Molekulární biologie a genetika a Obecná biologie a doktorského studijního programu oborů
Molekulární a buněčná biologie, Genetika a Biochemie formou řešení diplomových a
disertačních prací s tématikou bezprostředně se vztahující k problematice VZ. Celkem to bylo
94 diplomových prací a 55 doktorských disertačních prací (seznam – viz přílohy 3 a 4).
Studenti prezentovali výsledky své práce samostatně či jako spoluautoři také formou
přednáškových a posterových sdělení na tuzemských a mezinárodních konferencích a jsou též
spoluautory publikací v odborných časopisech (Přílohy 1 a 2).
Zřízením stálého akademického pracoviště, Laboratoře funkční genomiky a
proteomiky (LFGP), na Přírodovědecké fakultě MU z původních dvou výzkumných týmů
projektů Posílení výzkumu na VŠ bylo možné zahájit vědeckou výchovu dalších diplomantů a
studentů doktorského studijního programu. Pro studenty tak byla rozšířena nabídka zapojení
do řešení dalších výzkumných úkolů. Špičková infrastruktura spolu s erudicí pracovníků
získanou v rámci řešení výzkumného záměru tvoří solidní základ pro realizaci praktické
výuky genomiky a proteomiky na MU a byla využita při přípravě a výuce nových přednášek a
cvičení - Kurzu základů genomiky a Kurzu základů proteomiky. Dostupnost špičkové
infrastruktury spolu s dosaženými vědeckými výsledky se projevily mimo jiné i v zájmu
zahraničních doktorandů a post-doktorandů o dlouhodobé působení na pracovišti a zapojení
pracoviště do mezinárodních spoluprací.
Se započtením doby od zahájení řešení projektů Posílení výzkumu na VŠ stojí na konci řešení
této etapy VZ (8 let) už nejen úspěšní absolventi DSP, ale i mladí vědečtí pracovníci po
úspěšném absolvování zahraničních postdoktorandských stáží, jako významná posila
stávajících nebo slibný základ nových výzkumných týmů.
Posílení vědecké spolupráce na národní i mezinárodní úrovni
56
V průběhu řešení se úspěšně rozvíjela spolupráce s domácími i zahraničními pracovišti. Tato
spolupráce zahrnovala krátkodobé i dlouhodobější pobyty našich pracovníků na zahraničních
pracovištích a také v přímé spolupráci ve výzkumu především s výzkumnými pracovišti u nás.
Odrazililo se to zejména ve společných publikačních výstupech.
Nejtěsnější a nejintenzivnější spolupráce v rámci domácích pracovišť byla spolupráce
s Biofyzikálním ústavem AV ČR, kde díky pochopení vedení tohoto ústavu mohla část týmu
VZ pracovat v jejich prostorách (pracovní tým doc. Fajkuse). Dále se uskutečňovala
spolupráce s Českou sbírkou mikroorganismů MU, s pracovišti Fakultních nemocnic v Brně a
v Olomouci a se Státní referenční laboratoří pro stafylokoky v Praze, které poskytovaly týmu
zaměřenému na prokaryotický genom sbírkové a klinické kmeny pro genotypizační analýzy a
jejich diagnostiku klasickými metodami. Velmi těsná spolupráce také existovala a existuje
s Fakultní dětskou nemocnicí v Brně, kde na základě statutu společné laboratoře je umožněno
našim studentům a pracovníkům (doc. Kuglík) být výzkumně propojeni s problematikou
aktuální v klinické praxi (molekulárně cytogenetická vyšetření nádorů), ale též využívat
prostor nemocnice, který na fakultě citelně chybí. Z dalších domácích spolupracujících
pracovišť to byla dále spolupráce s Výzkumným ústavem zdraví dítěte, Výzkumným ústavem
bramborářským a Výzkumným ústavem pícninářským.
Co se týče zahraniční spolupráce, rozvíjela se po celou dobu řešení VZ spolupráce s Max
Planck Institutem v Kolíně nad Rýnem, kde pobývali na stáži pracovníci i studenti z týmu
doc. Brzobohatého. Prokazatelné výsledky v podobě společných projektů rozvíjejících
tématiku VZ a také v podobě společných publikací i zahraničními laboratořemi přinesly
spolupráce týmu doc. Fajkuse s Dept. Biotechnology, Osaka University; Dept. Biochemistry
and Biophysics, Texas A&M University; School of Biol. Sciences, Queen Mary University of
London; Jodrell lab., Royal Botanic Gardens Richmond, Weizmann Institute of Science,
Rehovot, Izrael. Nepřímo byly tyto spolupráce významné i pro postdoktorandské pobyty
absolventů DSP.
V návaznosti na získané výsledky u prokaryot (zejména využití bakterifoágů pro typizaci a
charakterizaci kmenů) bylo možné integrovat pracoviště prof. Doškaře do konsorcia předních
evropských laboratoří zaměřených na studium stafylokoků a vypracovat návrh společného
grantového projektu v rámci 6RP EU. Na tři z těchto pracovišť (Univerzita v Mnichově,
Univerzita v Gentu, Univerzita v Greifswaldu) byli vysláni též studenti na studijní pobyty,
v rámci nichž řešili problematiku VZ.
Personální rozvoj vědeckých týmů na VŠ
Velmi významným výstupem řešení VZ byl vznik zcela nového stálého akademického
pracoviště Přírodovědecké fakulty MU „Laboratoře funkční genomiky a proteomiky“(LFGP).
Toto pracoviště pod vedením doc. J. Fajkuse má nyní 44 pracovníků a 30 přepočtených
úvazků. V současné době z důvodů nedostatečných prostor sídlí na PřF část jeho pracovníků a
další část sídlí na Biofyzikálním ústavu AV ČR v Brně. Tato situace se zásadně zlepší a vyřeší
i z hlediska budoucího rozvoje výstavbou výzkumných pracovišť v nově budovaném
Kampusu MU v Bohunicích.
Na řešení VZ se od počátku podíleli určitou kapacitou jak učitelé kateder PřF MU, zejména Katedry genetiky a
molekulární biologie (KGMB), tak především výzkumné týmy vedené dr. Brzobohatým a dr. Fajkusem v rámci
programu MŠMT „Posílení výzkumu na VŠ“. Poté, co tento program skončil, byly oba výzkumné týmy
začleněny stabilně do fakultní struktury tím, že bylo zřízeno na sekci Biologie nové stálé pracoviště „Laboratoř
funkční genomiky a proteomiky“ (LFGP) s vedoucím dr. J. Fajkusem. Ostatní členové řešitelského týmu,
stávající učitelé kateder, byly sdruženi s částí svých pracovních úvazků do dočasného pracoviště (po dobu trvání
VZ) „Pracoviště výzkumu genomu“ (PVG) s vedoucí prof. J. Relichovou.
Z těchto důvodů je také rozpočet VZ od roku 2001veden odděleně ve dvou částech. Celková funkce řešitelského
týmu však tím nebyla nijak dotčena.
57
Personální složení týmu VZ uvádí příloha 6.
Zlepšení přístrojového vybavení
VZ jsou ve stávajícím systému financování výzkumu snad nejvýznamnějším zdrojem
investičních prostředků. Systematicky tak byla posilována infrastruktura MU v oblasti
špičkových technik molekulární biologie. Soustředění nákladné instrumentace a vysoce
kvalifikované obsluhy umožnilo zpřístupnit tyto techniky nejen pro potřeby všech skupin
podílejících se na řešení VZ, ale i pro ostatní pracoviště MU a dalších akademických a
vývojových pracovišť regionu.
Laboratoř doc. Brzobohatého přispělo zásadním způsobem k vybudování a personálnímu
zajištění činnosti Proteomické laboratoře MU, která je využívána řadou pracovišť PřF a LF
MU. S využitím této infrastruktury mohla tato laboratoř jako první v ČR započít s rozvojem
systematického výzkumu proteomiky hormonálních regulací u rostlin.
Vedle získaných špičkových vědeckých výsledků byla tedy rovněž rozvinuta infrastruktura
nezbytná pro aplikaci přístupů funkční genomiky a proteomiky pro řešení řady aktuálních
projektů soustředěných zejména v novém výzkumném záměru MU s názvem „Molekulární
podstata buněčných a tkáňových regulací“.
Konkrétně tento zdroj financování umožnil zakoupení řady unikátních zařízení, z nichž lze
jmenovat v rámci celého VZ :
• perfúzní chromatografu BioCad (Applied Biosystems), bez něhož by purifikace
telomer-vazebných proteinů z biol. materiálu byly těžko myslitelné.
• termocyklér pro real-time PCR (Corbett Res.) – první svého druhu na PřF MU, který
umožnil podstatně zpřesnit veškeré expresní analýzy a zavést výše zmíněnou
dvojbarevnou RQ-TRAP techniku.
• vybavení pro separaci komplexních směsí proteinů metodou dvourozměrné
elektroforézy
• zařízení pro PCR v reálném čase (RotorGene2000) pro analýzy exprese genů
• boxy Biohazard
• Ostatní zakoupené přístroje (fluorescenční mikroskop pro FISH (Olympus),
termocyklér se 4 bloky (MJ Res) a deskový sekvenátor (Genomyx), inkubátor CO2 a
další umožnily náhradu staršího vybavení nebo potřebné rozšíření jeho kapacity.
58
3. Nejvýznamnější výsledky řešení výzkumného záměru
V následující tabulce je uveden přehled všech publikačních výsledků za dobu řešení VY,
a to jak po jednotlivých zaměřeních (uvedeni jsou garanti zaměření), tak celkově za VZ.
Seznamy publikačních výstupů jsou v přílohách 1 až 5.
(U IF jsou uvedeny hodnoty buď aktuální v době vydání publikace nebo dodatečně doplněny dle posledních
údajů).
Doškař
Brzobohatý
Šmarda
Fajkus
Celkem
Publikace ve vědeckých časopisech – celkem 122
Výsledky dosažené výhradně řešením VZ
Počet publikací
10
23
Celkový IF
8,707
17,763
Průměrný IF na publ.
0,871
0,772
8
4,795
0,599
10
29,173
2,917
51
60,438
1,185
Výsledky dosažené řešením VZ a navazujících projektů
Počet publikací
21
22
7
Celkový IF
15,227
51,139
16,519
Průměrný IF na publ.
0,725
2,325
2,360
21
49,899
2,376
71
132,784
1,870
19
17
119
12
13
116
34
5
94
8
13
55
Abstrakta z konferencí – celkem 235
Výsledky dosažené výhradně řešením VZ
Počet abstrakt
45
38
Výsledky dosažené řešením VZ a navazujících projektů
Počet abstrakt
69
22
Diplomové práce – celkem 94
Počet dipl. prací
34
21
Dizertační práce – celkem 55
Počet dezert. prací
15
19
Monografie a popularizační články – celkem 13
59
3.1. Výsledky dosažené výhradně řešením VZ - výběr
odborné knihy nebo články v odborných knihách
•
•
•
•
•
Fajkus, Jiří - Zentgraf, Ulrike. Structure and Maintenance of Chromosome Ends in Plants. In Telomerases,
Telomeres and Cancer. Georgetown, New York : Landes Bioscience, Kluwer Academic, 2002. od
s. 314-331, 18 s. Molecular Biology Intelligence Unit 22. ISBN 0-306-47437-9. MSM 143100008,
záměr.
Marek, Jaromír - Trávníček, Z. Monokrystalová rentgenová strukturní analýza. první. Olomouc :
Vydavatelství Univerzity Palackého, 2002. 169 s. nedělí se na edice. ISBN 80-244-0551-2. MSM
143100008, záměr.
Relichová, Jiřina - Malina, Jaroslav. Panoráma biologické a sociokulturní antropologie 2: Genetika. Editor:
Jaroslav Malina. Brno (CZ) : Nadace Universitas Masarykiana v Brně, nakladatelství a
vydavatelství Nauma v Brně, 2000. 89 s. Modulové učební texty pro studenty antropologie.
Učební texty pro studenty antropologie a "příbuzných" oborů. ISBN 80-210-2473-9. MSM
143100008, záměr.
Rosypal, Stanislav - Doškař, Jiří - Pantůček, Roman - Kailerová, Jana - Relichová, Jiřina - Růžičková,
Vladislava - Šmarda, Jan - Šmarda, Jan - Štěpán, Jiří. TERMINOLOGIE MOLEKULÁRNÍ
BIOLOGIE. První vydání. Brno : Vydavatel Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc. Vodova 80,
612 00 Brno, 2001. 300 s. České odborné termíny, definice a anglické ekvival. ISBN 80-9025623-6. MSM 143100008, záměr.
Řepková, Jana - Relichová, Jiřina. Genetika rostlin. 1. vyd. Brno : Masarykova univerzita Brno, 2001. 269 s.
3489/Př-12/01-17/30. ISBN 80-210-2736-3. MSM 143100008, záměr.
články v impaktovaných vědeckých časopisech
•
•
•
•
•
•
•
•
•
Fajkus, Jiří - Trifonov, Edward N. Columnar Packing of Telomeric Nucleosomes. Biochemical and
Biophysical Research Communications, California : Academic Press, roč. 280, 4s. 961-963.
ISSN 0006-291X. 2001. MSM 143100008, záměr. IF 2,946
Fojtová, Miloslava - Fulnečková, Jana - Fajkus, Jiří - Kovařík, Aleš. Recovery of tobacco cells from
cadmium stress is accompanied by DNA repair and increased telomerase activity. Journal of
Experimental Botany, Oxford : OXFORD UNIV PRESS, roč. 53, 378s. 2151-2158. ISSN 00220957. 2002. MSM 143100008, záměr. IF 2,852
Horáková, Mirka - Fajkus, Jiří. TAS49-a dispersed repetitive sequence isolated from subtelomeric regions of
Nicotiana tomentosiformis chromosomes. Genome, Canada : NRC Canada, 43, 2s. 273-284.
ISSN 0831-2796. 2000. MSM 143100008, záměr. VS97032, projekt VaV. IF 1,610
Kuderová, Alena - Nanak, Elizabeth - Truksa, Martin - Brzobohatý, Břetislav. Use of Rifampicin in T7
RNA Polymerase-Driven Expression of a Plant Enzyme. Rifampicin Improves Yield and
Assembly. Protein Expression and Purification, San Diego, California : Academic Press, 16,
3s. 405-409. ISSN 1046-5928. 1999. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV. IF 1,822
Lízal, Pavel - Relichová, Jiřina. The effect of day length, vernalization and DNA demethylation on the
flowering time in Arabidopsis thaliana. PHYSIOLOGIA PLANTARUM, Copenhagen :
Munksgaard, 113, 1s. 121-127. ISSN 0031-9317. 2001. MSM 143100008, záměr. IF 1,476
Mlejnek, Petr - Kuglík, Petr. Induction of apoptosis in HL-60 cells by N(6)-benzyladenosine. J Cell
Biochem, London : Wiley-Liss, Inc., 77, 1, od s. 6-17, 12 s. 2000. MSM 143100008, záměr. IF
2,664
Růžičková, Vladislava - Pantůček, Roman - Petráš, Petr - Doškař, Jiří - Sedláček, Ivo - Rosypal, Stanislav.
Molecular typing of exfoliative toxin-producing Staphylococcus aureus strains involved in
epidermolytic infections. International Journal of Medical Microbiology, München, Germany :
Urban & Fischer Verlag, 292, 7-8s. 541-545. ISSN 1438-4221. 2003. MSM 143100008, záměr. IF
2,583
Šmardová, Jana - Nemajerová, Alice - Šmarda, Jan - Jurdic, Pierre - Kubala, Lukáš - Souček, Karel.
Trichostatin A suppresses transformation by the v-myb oncogene in BM2 cells. Journal of
Hematotherapy Stem Cell Research, Mary Ann Liebert, Inc., 12, 2, od s. 225-235, 11 s.
ISSN 1061-6128. 2003. MSM 143100008, záměr. IF 1,800
Švec, Pavel - Sedláček, Ivo - Pantůček, Roman - Devriese, Luc - Doškař, Jiří. Evaluation of ribotyping for
characterization and identification of Enterococcus haemoperoxidus and Enterococcus moraviensis
60
•
•
strains. FEMS Microbiology Letters, Amsterdam, Netherlands : Elsevier Science B. V., 203,
1s. 23-27. ISSN 0378-1097. 2001. MSM 143100008, záměr. IF 1,615
Zouhar, Jan - Nanak, Elizabeth - Brzobohatý, Břetislav. Expression, Single-Step Purification and MatrixAssisted Refolding of a Maize Cytokinin Glucoside-Specific beta-Glucosidase. Protein Expression
and Purification, San Diego, California : Academic Press, 1999, 17s. 153-162. ISSN 1046-5928.
1999. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV. IF 1,822
Žákovská, Alena - Nejedlá, Petra - Holíková, Alena - Dendis, Miloš. Positive Findings of Borrelia
burgdorferi in Culex (C.) pipiens pipiens Larvae in the Surrounding of Brno City determined using
the PCR Method. Annals of Agricultural and Environmental Medicine, Lublin : Instytut
Medycyny Wsi, 12, 9s. 1-3. 2002. MSM 143100008, záměr. IF 0,827
61
3.2. Výsledky dosažené řešením VZ a obsahově navazujících projektů
nebo grantů - výběr
články v impaktovaných vědeckých časopisech
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
Doškař, Jiří - Pallová, Petra - Pantůček, Roman - Rosypal, Stanislav - Růžičková, Vladislava - Pantůčková,
Pavla - Kailerová, Jana - Klepárník, Karel - Malá, Zdena - Boček, Petr. Genomic relatedness of
Staphylococcus aureus phages of the International Typing Set and detection of serogroup A, B,
and F prophages in lysogenic strains. Canadian Journal of Microbiology, Ottawa, Canada : N R C
Research Press, 46, 11s. 1066-1076. ISSN 0008-4166. 2000. GA301/97/1192, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. IF 1,105
Fajkus, Jiří - Šimíčková, Marta - Maláska, Jan. Tiptoeing to chromosome tips: facts, promises and perils of
today's human telomere biology. Phil. Trans. R. Soc. Lond. B, London : ROYAL SOC LONDON,
roč. 357, Aprils. 545-562. ISSN 0962-8436. 2002. GA301/99/0045, projekt VaV. IBS5004010,
projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 3, 410
Fajkus, Jiří - Borský, Marek - Kunická, Zuzana - Kovaříková, Martina - Dvořáková, Dana - Hofmanová,
Jiřina - Kozubík, Alois. Changes in Telomerase Activity, Expression and Splicing in Response to
Differentiation of Normal and Carcinoma Colon Cells. Anticancer Research, Athens : INT INST
ANTICANCER RESEARCH, Neuveden, 23s. 1605-1612. ISSN 0250-7005. 2003. IBS5004010,
projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 1,347
Hejátko, Jan - Pernisová, Markéta - Eneva, Tinka - Palme, Klaus - Brzobohatý, Břetislav. The putative
sensor histidine kinase CKI1 is involved in female gametophyte development in Arabidopsis.
Molecular Genetics and Genomics, 269, 4, od s. 443-453, 11 s. ISSN 1617-4615. 2003.
LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV. IF 1, 522
Horák, Jakub - Brzobohatý, Břetislav - Lexa, Matej. Molecular and Physiological Characterisation of an
Insertion Mutant in the ARR21 Putative Response Regulator Gene from Arabidopsis thaliana.
Plant Biology, Stuttgart : Thieme, Georg Thieme Verlag, 5, 3, od s. 249-254, 10 s. ISSN 14358603. 2003. GA204/99/D024, projekt VaV. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF
1,352
Chroust, Karel - Jowett, Trevor - Farid-Wajidi, Mustafa - Huang, Juan - Ryšková, Martina - Wolf, Ronald Holoubek, Ivan. Activation or detoxification of mutagenic and carcinogenic compounds in
transgenic Drosophila expressing human glutathione S-transferase. Mutation Research,
Amsterdam : Elsevier, 2001, 498(1-2)s. 169-179. ISSN 0165-1218. 2000. MSM 141100003,
záměr. MSM 143100008, záměr. IF 1,624
Kizek, René - Trnková, Libuše - Ševčíková, Sabina - Šmarda, Jan - Jelen, František. Silver Electrode as a
Sensor for Determination of Zinc in Cell Cultivation Medium. Analytical Biochemistry, San Diego
: Academic Press, 301, 2002s. 8-13. ISSN 0003-2697. 2002. GV204/97/K084, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. IF 2,047
Krejčí, Kateřina - Koch, Jorn. An in Situ Study of Variant Telomeric Repeats in Human Chromosomes.
Genomics, 58, 2s. 202-206. ISSN 0888-7543/99. 1999. GA301/99/0045, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. VS97032, projekt VaV. IF 3,386
Krejčí, Kateřina - Stentoft, Jesper - Koch, Jorn. Molecular Cytogenetics Investigation of The Telomers in a
Case of Philadelphia Positive B-ALL with a Single Telomere Expansion. Neoplasia, 1, 6s. 492497. ISSN 1522-8002. 1999. GA301/99/0045, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. VS97032,
projekt VaV. IF 5,917
Kuchař, Milan - Fajkus, Jiří. Interactions of putative telomere-binding prooteins in Arabidopsis thaliana:
identification of functional TRF2 homolog in plants. FEBS Letters, Netherlands : ELSEVIER
SCIENCE BV, 578, 3s. 311-315. ISSN 0014-5793. 2004. AV0Z5004920, záměr. GA204/02/0027,
Lexa, Matej - Horák, Jakub - Brzobohatý, Břetislav. Virtual PCR. Bioinformatics, Oxford : Oxford
University Press, 17, 2s. 192-193. ISSN 1367-4803. 2001. GA204/99/D024, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. IF 2,259
Lexa, Matej - Genkov, Todor Nikolaev - Brzobohatý, Břetislav. Inhibitory effects of elevated endogenous
cytokinins on nitrate reductase in ipt-expressing tobacco are eliminated by short-term exposure to
benzyladenine. PHYSIOLOGIA PLANTARUM, Copenhagen : Munksgaard, 115, 2s. 284-290.
62
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
ISSN 0031-9317. 2002. IAA5004001, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt
VaV. IF 1,760
Lízal, Pavel - Relichová, Jiřina. Localization of seven new late-flowering mutations on the genetic map of
Arabidopsis thaliana using a newly generated CAPS marker. Plant Science, Dublin : Elsevier
Scientific Publisher, 167, 167, od s. 143-149, 7 s. ISSN 0168-9452. 2004. GP521/02/P127, projekt
VaV. MSM 143100008, záměr. IF 1,652
Maláska, Jan - Skleničková, Marie - Krejčí, Kateřina - Fajkusová, Lenka - Bajer, Milan - Hrstková, Hana Fajkus, Jiří. Telomerase Activity and Expresion and Telomere Analysis in Situ in the Course of
Treatment of Childhood Leukemias. Blood Cells, Molecules and Diseases, Orlando, Florida :
Academic Press, 26, 5s. 534-539. ISSN 1079-9796. 2000. GA301/99/0045, projekt VaV. MSM
Mannerová, Sylva - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří - Švec, Pavel - Snauwaert, C. - Vancanneyt, M. Swings, J. - Sedláček, Ivo. Macrococcus brunensis sp. nov., Macrococcus hajekii sp. nov. and
Macrococcus lamae sp. nov., from the skin of llamas. International Journal of Systematic and
Evolutionary Microbiology, UK : Society for General Microbiology, 53, 5, od s. 1647-1654, 8 s.
ISSN 1466-5026. 2003. GA301/02/1505, projekt VaV. GP204/02/D099, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. IF 3,187
Marek, Jaromír - Hulová, Dagmar - Dostál, Jiří - Marek, Radek. Berberine formate-succinic acid (1/1). Acta
Crystallographica Section C: Crystal Structure, Chester, UK : International Union of
Crystallography, C59, 10, od s. o583-o585, 3 s. ISSN 0108-2701. 2003. GA203/02/0436, projekt
VaV. MSM 143100005, záměr. MSM 143100008, záměr. IF 3,067
Pantůček, Roman - Sedláček, Ivo - Doškař, Jiří - Rosypal, Stanislav. Complex genomic and phenotypic
characterization of the related species Staphylococcus carnosus and Staphylococcus
piscifermentans. International Journal of Systematic Bacteriology, UK : Society for General
Microbiology, 49, 3s. 941-951. ISSN 0020-7713. 1999. GA301/97/1192, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. IF 3,724
Pantůček, Roman - Doškař, Jiří - Růžičková, Vladislava - Kašpárek, Petr - Oráčová, Eva - Kvardová,
Veronika - Rosypal, Stanislav. Identification of bacteriophage types and their carriage in
Staphylococcus aureus. Archives of Virology, Wien : Springer-Verlag, 149, 9, od s. 1689-1703,
15 s. ISSN 0304-8608. 2004. GA301/02/1505, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 1,876
Rotrekl, Vladimír - Nejedlá, Eliška - Kučera, Igor - Abdallah, Fuad - Palme, Klaus - Brzobohatý, Břetislav.
The role of cysteine residues in structure and enzyme activity of a maize beta-glucosidase.
European Journal of Biochemistry, 266, 3s. 1056-1065. ISSN 0014-2956. 1999. IAA5004603,
projekt VaV. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV. IF 3,578
Schrumpfová, Petra - Kuchař, Milan - Rotková, Gabriela - Skříšovská, Lenka - Kubičárová, Tatiana Fajkus, Jiří. Characterization of two Arabidopsis thaliana myb-like proteins showing affinity to
telomeric DNA sequence. Genome, CANADA : NATL RESEARCH COUNCIL CANADA, 47,
March 2004, od s. 316-324, 9 s. ISSN 0831-2796. 2004. GA204/02/0027, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. IF 1,861
Sýkorová, Eva - Cartagena, Joyce - Horáková, Mirka - Fukui, Kiichi - Fajkus, Jiří. Characterization of
telomere-subtelomere junctions in Silene latifolia. In Mol Gen Genomics. New York : SpringerVerlag, 2003. s. 13-20. ISBN 1617-4615. GA204/02/0027, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
IF 2,727
Ševčíková, Sabina - Souček, Karel - Kubala, Lukáš - Bryja, Vítězslav - Šmarda, Jan. Differential effects of
v-Jun and c-Jun proteins on v-myb-transformed monoblasts. Cellular and Molecular Life Sciences,
Bäsel : Birkhaeuser Verlag, 59, 10s. 1690-1705. ISSN 1420-682X. 2002. GA301/01/0040, projekt
VaV. MSM 143100008, záměr. IF 5, 259
Sýkorová, Eva - Lim, Kar Yoong - Chase, Mark W. - Knapp, Sandra - Leitch, Ilia Judith - Leitch, Andrew
Rowland - Fajkus, Jiří. The absence of Arabidopsis-type telomeres in Cestrum and closely related
genera Vestia and Sessea (Solanaceae): first evidence from eudicots. Plant Journal, Oxford :
Blackwell Publishing Ltd, Neuveden, 34s. 283-291. ISSN 0960-7412. 2003. GA204/02/0027,
Sýkorová, Eva - Lim, K.Y. - Kunická, Zuzana - Chase, M.W. - Bennett, M.D. - Fajkus, Jiří - Leitch, A.R.
Telomere variability in the monocotyledonous plant order Asparagales. PROCEEDINGS OF THE
ROYAL SOCIETY OF LONDON SERIES B-BIOLOGICAL SCIENCES, London : ROYAL
SOC LONDON, Neuveden, 270s. 1893-1904. ISSN 0962-8452. 2003. GA204/02/0027, projekt
VaV. MSM 143100008, záměr. IF 3,544
Šmarda, Jan - Bryja, Vítězslav - Sedláček, Jiří - Zahradníčková, Eva - Ševčíková, Sabina - Pacherník, Jiří Souček, Karel - Hofmanová, Jiřina - Kozubík, Alois. Lipoxygenase inhibitors enhance tumor
suppressive effects of Jun proteins on v-myb-transformed monoblasts. Prostaglandins and other
63
•
•
•
lipid mediators, New York (USA) : Elsevier Science, 72, 3-4, od s. 131-145, 15 s. ISSN 00906980. 2003. GA301/01/0040, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 2,594
Štěpán, Jiří - Pantůček, Roman - Růžičková, Vladislava - Rosypal, Stanislav - Hájek, Václav - Doškař, Jiří.
Identification of Staphylococcus aureus based on PCR amplification of species specific genomic
826 bp sequence derived from a common 44-kb SmaI restriction fragment. Molecular and Cellular
Probes, London : Academic Press LTD., 15, 5s. 249-257. ISSN 0890-8508. 2001.
GA301/99/D075, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 1,744
Zahradníčková, Eva - Souček, Karel - Ševčíková, Sabina - Šmardová, Jana - Šmarda, Jan. c-Fos but not vFos protein induces programmed cell death of v-myb-transformed monoblasts. Cellular and
Molecular Life Sciences, Bäsel : Birkhaeuser Verlag, 60, 12, od s. 2736-2748, 13 s. ISSN 1420682X. 2003. GA301/01/0040, projekt VaV. GA301/03/1055, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr. IF 4,995
Zouhar, Jan - Vévodová, Jitka - Marek, Jaromír - Damborský, Jiří - Su, X.-D. - Brzobohatý, Břetislav.
Insights into the Functional Architecture of the Catalytic Center of a Maize Beta-Glucosidase Zmp60.1. Plant Physiology, USA : American Society of Plant Physiologists, 127, 3s. 973-985.
ISSN 0032-0889. 2001. MSM 143100005, záměr. MSM 143100008, záměr. IF 4,831
64
4. Náklady na řešení výzkumného záměru
Typ jiného zdroje
(veřejné jiné než inst.
Jiné zdroje
Rok
podpora, tuzemské
(tis. Kč)
neveřejné, zahraniční)
1999
7.587*
150 Hosp. činnost č. 5198
2000
12.617*
2001
16.905
2002
17.875
2003
19.246
2004
19.595
* V těchto letech byly souběžně řešeny grantové projekty s vlastním rozpočtem, které se však
staly součástí VZ (MSMT VS96096, MSMT VS97032)
Inst. podpora ze
státního rozpočtu
(tis. Kč)
5. Čerpání finančních prostředků v roce 2004
Popište alokaci finančních prostředků (odděleně prostředky z institucionální
podpory ze státního rozpočtu a z jiných zdrojů) – např. mzdové náklady, provozní
náklady, nákup služeb, náklady na pořízení drobného, resp. dlouhodobého
hmotného majetku, náklady na cestovné, režijní náklady apod. – a jejich čerpání
stručně věcně odůvodněte.
Investiční prostředky
V roce 2004 byly pořízeny z VZ tyto investice:
1.Stolní chlazená centrifuga Eppendorf, model 5810 R s výkyvným rotorem a adaptéry (165 128,- Kč).
Jde o univerzálně použitelné zařízení, které umožňuje separovat biomolekuly (DNA, RNA, proteiny)
v gravitačním poli při vysokých otáčkách a nízké teplotě. Zařízení je umístěno v laboratoři molekulární
fyziologie rostlin.
2. Sekvenátor Genomyx s fluorescenčním scannerem (50.000,- Kč) – přístroj zakoupen jako náhrada za
přístroj stejného typu, který je v provozu od r. 1998. Protože tento přístroj již firma Beckman přestala vyrábět a
nejsou k dispozici ani náhr. díly, využili jsme nabídky Endokrinologického ústavu na odkoupení jejich
nevyužitého přístroje za výhodnou cenu (asi 10 % pořizovací ceny), navíc včetně fluorescenčního scanneru,
který umožňuje nahradit radioizotopové značení značením fluorescenčním a aplikovat automatické vyhodnocení.
Zařízení je umístěno v laboratoři doc. Fajkuse.
3. Laboratorní mikroskop Olympus BX61 (748.132,- Kč) je využíván pro analýzu telomer a subtelomer
rostlinných a lidských buněk pomocí technik FISH, EDF-FISH, PRINS a dideoxy-PRINS. Byl použit např. k
získání letošních výsledků publikovaných v Cytogenet. Genome Res. (Rotková et al., 2004). Umístěn
v laboratoři doc. Fajkuse.
4. CCD kamera Axiocam MRm (213.680,-Kč) je používaná ve spojení s mikroskopem BX61.
5. Termocycler DNA EngineDyad 2 (383.000,-Kč) – jedná se o doplnění kapacity přístrojů pro PCR a RTPCR, byl již využit např. k získání cDNA telomeráz z rostlin, které syntetizují lidský typ telomer. Jedná se
ovšem o přístroj obecného využití ve výzkumu a diagnostice. (Laboratoř doc. Fajkuse).
6. Zařízení pro elektroforézu (59.000,- Kč) – běžné vybavení laboratoře – Laboratoř funkční genomiky a
proteomiky
65
7. Inkubátor (234.482,-Kč) Touto investicí byl nahrazen starý inkubátor, který byl po havárii neopravitelný.
Tento přístroj je nepostradatelný pro zajištění všech experimentů založených na kultivaci živočišných buněk. Je
umístěn na Katedře genetiky a molekulární biologie v laboratoři doc. Šmardy.
8. Zařízení pro elektroforézu proteinů (117.449,- Kč) bylo využito k analýze proteomu stafylokokových
bakteriofágů. V tomto roce se podařilo identifikovat několik strukturních proteinů, z nichž některé mají vliv na
rozmezí hostitele těchto bakteriofágů. Analýza funkce těchto proteinů byla provedena v korelaci s výsledky
získanými hmotovou spektrometrií a údaji o fágových genomových sekvencích. Přístroj je umístěn na katedře
genetiky a molekulární biologie v laboratoři prof. Doškaře.
9. Notebook ASUS (78.068,-Kč) je umístěn na oddělení genetiky Katedry genetiky a molekulární biologie.
66
Příloha 1
Publikace ve vědeckých časopisech
Abecední seznam publikací registrovaných v databázi RIV
1. Ahmed, M. - Schwendt, P. - Marek, Jaromír - Sivák, M. Synthesis, solution and crystal
structures of dinuclear vanadium(V) oxo monoperoxo complexes with mandelic acid:
(NR4)2[V2O2(O2)2(mand)2] . xH2O [R=H, Me, Et; MAND=mandelato(2-)=C8H6O3 2]. Polyhedron, Velká Británie : PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, OXFORD, 23,
4, od s. 655-663, 9 s. ISSN 0277-5387. 2004. MSM 143100008, záměr. IF 1,584
2. Ahmed, M. - Schwendt, P. - Sivák, M. - Marek, Jaromír. Synthesis and characterization of
vanadium(V) complexes with alpha-hydroxyhippuric acid. The X-ray crystal structure of
(NBu4)2[V2O2(O2)2(R-alpha-hhip) (S--hhip)].5H2O,[alpha-hhip = alphahydroxyhippurato(2-)]. Transition Metal Chemistry, Netherlands : Kluwer Academic
Publishers, 29, 6, od s. 675-680, 6 s. ISSN 0340-4285. 2004. MSM 143100008, záměr. IF
0,840
3. Beneš, Petr. Polymorphisms in the apolipoprotein(a) gene, plasma Lp(a) and
cardiovascular risk. HeartDrug, Basel, Switzerland : Karger, 3, 4, od s. 217-224, 8 s.
4. Beneš, Petr - Šmarda, Jan. Vimentin: příklad aktivního zapojení složky cytoskeletu do
regulačních procesů buňky. Biologické listy, Praha : Ústav molekulární genetiky AV ČR,
69, 4, od s. 265-278, 14 s. ISSN 0366-486. 2004. GP301/03/D022, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. IF 0,000
5. Beránek, Martin - Bureš, Jan - Palička, Vladimír - Jandík, Pavel - Langr, František Nejedlá, Eliška. A Relationship between K-ras Gene Mutations and Some Clinical and
Histologic Variables in Patients with Primary Colorectal Carcinoma. Clinical Chemistry
and Laboratory Medicine, Walter de Gruyter - Berlin - New York, 37, 7s. 723-727.
6. Bouchal, Pavel - Přecechtělová, Petra - Zdráhal, Zbyněk - Kučera, Igor. Protein
composition of Paracoccus denitrificans cells grown on various electron acceptors and in
the presence of azide. Proteomics, Weinheim : Wiley-VCH, 4, 9, od s. 2662-2671, 10 s.
ISSN 1615-9853. 2004. GA203/01/1589, projekt VaV. MSM 143100005, záměr. MSM
143100008, záměr. IF 5,766
7. Celer, V., Jr. - Celer, V. - Nejedlá, Eliška - Bertoni, G. - Peterhans, E. - Zanoni, R. G. The
Detection of Proviral DNA by Semi-nested Polymerase Chain Reaction and Phylogenetic
Analysis of Czech Maedi-Visna Isolates Based on gag Gene Sequences. J. Vet. Med. B,
Berlin : Blackwell Wiessenschafts-Verlag, 47, 2s. 203-215. ISSN 0931-1793. 2000.
GA524/97/0312, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 0,656
8. Čapková, Lucie - Žákovská, Alena - Knoz, Jan - Dendis, Miloš - Šerý, Omar. Further
findings of spirochaetal microorganism in mosquitoes and ticks in the Czech Republic.
Biologia, Bratislava (Slovensko) : Slovak Academy of Sciences, 57, 3s. 213-220.
9. Doškař, Jiří - Pallová, Petra - Pantůček, Roman - Rosypal, Stanislav - Růžičková,
Vladislava - Pantůčková, Pavla - Kailerová, Jana - Klepárník, Karel - Malá, Zdena Boček, Petr. Genomic relatedness of Staphylococcus aureus phages of the International
Typing Set and detection of serogroup A, B, and F prophages in lysogenic strains.
Canadian Journal of Microbiology, Ottawa, Canada : N R C Research Press, 46,
11s. 1066-1076. ISSN 0008-4166. 2000. GA301/97/1192, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr. IF 1,105
67
10. Doškař, Jiří. Prokaryotický genom. Informační listy Genetické společnosti Gregora
Mendela, Brno : Genetická společnost Gregora Mendela, 26, 1, od s. 26-31, 6 s.
ISSN 1210-6267. 2003. MSM 143100008, záměr. IF 0,000
11. Dubová, Jaroslava - Mlejnek, Petr - Brzobohatý, Břetislav. Dynamics of b-glucosidase
Zm-p60.1 Ectopic Expression during Transgenic Pollen Development: A Histochemic
Approach. General Physiology and Biophysics, Bratislava : Slovak Academy of Sciences,
18, Suppl. 1s. 112-116. ISSN 0231-5882. 1999. MSM 143100008, záměr. IF 0,259
12. Duno, M. - Bendixen, C. - Krejčí, Lumír - Thomsen, B. Targeted deletions created in
yeast vectors by recombinational excision. Nucletic Acids Research, G. B. : Oxford
University Press, 27, 8, od s. e1, 1 s. ISSN 0305 1048. 1999. MSM 143100008, záměr.
VS97032, projekt VaV. IF 6,575
13. Dvořáková, Dana - Krejčí, Pavel - Mayer, Jiří - Fajkus, Jiří - Hampl, Aleš - Dvořák, Petr.
Changes in the expression of FGFR3 in patients with chronic myeloid leukaemia
receiving transplants of allogeneic peripheral blood stem cells. British Journal of
Haematology, Oxford : Blackwell Science Ltd, roč. 113, Februarys. 832-835. ISSN 00071048. 2001. GA301/99/0045, projekt VaV. IBS5004010, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr. IF 3,267
14. Erdelská, Olga - Dubová, Jaroslava. Double fertilisation of angiosperms 1889-2000 (The
origin and significance of flowering plants double fertilisation). Biologia, Bratislava :
Slovenská akademie věd, 55, 4s. 311-319. ISSN 006-3088. 2000. MSM 143100008,
záměr. IF 0,208
15. Fajkus, Jiří - Trifonov, Edward N. Columnar Packing of Telomeric Nucleosomes.
Biochemical and Biophysical Research Communications, California : Academic Press,
roč. 280, 4s. 961-963. ISSN 0006-291X. 2001. MSM 143100008, záměr. IF 2,946
16. Fajkus, Jiří. Genomika v koncích - pokroky a perspektivy v biologii telomer. In
INFORMAČNÍ LISTY. Brno : Genetická společnost Gregora Mendela, 2002. s. 20-29.
Informační listy číslo 25. ISBN 1210-6267. MSM 143100008, záměr. IF 0,000
17. Fajkus, Jiří - Novotná, Marcela - Ptáček, Jiří. Analysis of chromosome termini in potato
varieties. ROSTLINNÁ VÝROBA, Česká republika : INST AGRICULTURAL FOOD
INFORMATION, roč. 48, 11s. 477-479. ISSN 0370-663X. 2002. MSM 143100008,
záměr. IF 0,333
18. Fajkus, Jiří - Šimíčková, Marta - Maláska, Jan. Tiptoeing to chromosome tips: facts,
promises and perils of today's human telomere biology. Phil. Trans. R. Soc. Lond. B,
London : ROYAL SOC LONDON, roč. 357, Aprils. 545-562. ISSN 0962-8436. 2002.
GA301/99/0045, projekt VaV. IBS5004010, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 3,
410
19. Fajkus, Jiří - Borský, Marek - Kunická, Zuzana - Kovaříková, Martina - Dvořáková, Dana
- Hofmanová, Jiřina - Kozubík, Alois. Changes in Telomerase Activity, Expression and
Splicing in Response to Differentiation of Normal and Carcinoma Colon Cells. Anticancer
Research, Athens : INT INST ANTICANCER RESEARCH, Neuveden, 23s. 1605-1612.
ISSN 0250-7005. 2003. IBS5004010, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 1,347
20. Fajkus, Jiří - Koppová, Květa - Kunická, Zuzana. Dual-color real-time telomeric repeat
amplification protocol. BioTechniques, United States : EATON PUBLISHING CO, 35,
5s. 912-914. ISSN 0736-6205. 2003. IBS5004010, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
IF 2,383
21. Fajkus, Jiří - Skleničková, Marie - Koppová, Květa - Kunická, Zuzana. Proč je biologie
telomer, ač módní, přesto užitečná? In XXVII. Brněnské onkologické dny. Brno :
Masarykův onkologický ústav v Brně 2003, 2003. s. 82-86. ISBN 80-239-0175-3.
IBS5004010, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 0,000
68
22. Fajkus, Jiří - Neplechová, Kamila - Sýkorová, Eva - Novotná, Marcela - Ptáček, Jiří.
Využití variability struktury konců chromozómů pro genotypizaci odrůd bramboru.
Bramborářství, Havlíčkův Brod : INTERES, XI., 1s. 2-3. ISSN 1211-2429. 2004.
23. Fajkusová, Lenka - Lukáš, Zdeněk - Tvrdíková, Miroslava - Kuhrová, Viera - Hájek, Jiří
- Fajkus, Jiří. Novel dystrophin mutations revealed by analysis of dystrophin mRNA:
alternative splicing suppresses the phenotypic effect of a nonsense mutation.
Neuromuscular Disordes, Amsterdam : Elsevier Science, roč. 11, 2s. 133-138. ISSN 09608966. 2001. MSM 143100008, záměr. IF 2,894
24. Fojtová, Miloslava - Fulnečková, Jana - Fajkus, Jiří - Kovařík, Aleš. Recovery of tobacco
cells from cadmium stress is accompanied by DNA repair and increased telomerase
activity. Journal of Experimental Botany, Oxford : OXFORD UNIV PRESS, roč. 53,
25. Fulnečková, Jana - Fajkus, Jiří. Inhibition of plant telomerase by telomere-binding
proteins from nuclei of telomerase-negatative tissues. FEBS letters : for the rapid
publication of short reports in biochemistry, biophysics and molecular biology,
Amsterdam : North-Holland, 467, 2-3s. 305-310. ISSN 0014-5793. 2000. MSM
26. Goltsev, Vasiliij - Genkov, Todor Nikolaev - Lexa, Matej - Ivanova, Iordanka. Effect of
benzyladenine, 4-PU-30 and thidiazuron on millisecond delayed and prompt chlorophyll
fluorescence of Dianthus caryophyllus L. axillary buds cultured in vitro. Scientia
Horticulturae, Amsterdam : Elsevier, 89, 1s. 41-55. ISSN 0304-4238. 2001. MSM
143100008, záměr. IF 0,543
27. Hájek, Václav - Pantůček, Roman - Kolář, Milan - Doškař, Jiří - Rosypal, Stanislav.
Comparison of MRSA-screen latex agglutination, conventional phenotypic methods and
mecA gene detection for identification of oxacilin resistance in staphylococci. Biologia,
Section: Cellular and Molecular Biology, Bratislava : Slovak Academy of Sciences, 57,
6s. 729-738. ISSN 1335-6399. 2002. GA301/02/1505, projekt VaV. GA301/99/D075,
28. Hejátko, Jan - Pernisová, Markéta - Eneva, Tinka - Palme, Klaus - Brzobohatý, Břetislav.
The putative sensor histidine kinase CKI1 is involved in female gametophyte development
in Arabidopsis. Molecular Genetics and Genomics, 269, 4, od s. 443-453, 11 s.
ISSN 1617-4615. 2003. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. VS96096,
projekt VaV. IF 1, 522
29. Horák, Jakub - Brzobohatý, Břetislav - Lexa, Matej. Molecular and Physiological
Characterisation of an Insertion Mutant in the ARR21 Putative Response Regulator Gene
from Arabidopsis thaliana. Plant Biology, Stuttgart : Thieme, Georg Thieme Verlag, 5, 3,
od s. 249-254, 10 s. ISSN 1435-8603. 2003. GA204/99/D024, projekt VaV. LN00A081,
30. Horák, Jakub - Lexa, Matej. Dvoukomponentni systemy: regulatory odpovedi a prenos
signalu u Arabidopsis thaliana. Biologické listy, Praha : ÚMG AV ČR, 67, 4, od s. 297317, 21 s. ISSN 0366-486. 2003. GA204/99/D024, projekt VaV. LN00A081, projekt
VaV. MSM 143100008, záměr. IF 0,000
31. Horáková, Mirka - Fajkus, Jiří. TAS49-a dispersed repetitive sequence isolated from
subtelomeric regions of Nicotiana tomentosiformis chromosomes. Genome, Canada :
NRC Canada, 43, 2s. 273-284. ISSN 0831-2796. 2000. MSM 143100008, záměr.
32. Chrobáková, Táňa - Hermanová, Markéta - Kroupová, Iva - Vondráček, Petr - Maříková,
Taťána - Mazanec, Radim - Zámečník, Josef - Staněk, Jan - Havlová, Miluše - Fajkusová,
Lenka. Mutations in Czech LGMD2A patients revealed by analysis of calpain3 mRNA
69
and their phenotypic outcome. Neuromuscular Disorders, United States : PERGAMONELSEVIER SCIENCE LTD, 14, 10s. 659-665. ISSN 0960-8966. 2004. MSM 143100008,
záměr. IF 2,894
33. Chroust, Karel - Jowett, Trevor - Farid-Wajidi, Mustafa - Huang, Juan - Ryšková, Martina
- Wolf, Ronald - Holoubek, Ivan. Activation or detoxification of mutagenic and
carcinogenic compounds in transgenic Drosophila expressing human glutathione Stransferase. Mutation Research, Amsterdam : Elsevier, 2001, 498(1-2)s. 169-179.
ISSN 0165-1218. 2000. MSM 141100003, záměr. MSM 143100008, záměr. If 1,624
34. Janouškovcová, Eva - Žákovská, Alena - Halouzka, Jiří - Dendis, Miloš. Infection
frequency of Borrelia genospecies in ticks (Ixodes ricinus) in few localities in the Czech
Republic. Scripta Fac. Sci. Nat. Univ. Masaryk. Brun., Biology, Brno : Masaryk
University., Brno : Masaryk University Printer, 28, od s. 41-50, 10 s. ISSN 80-210-31271. 2002. FRVŠ 541/03, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
IF 0,000
35. Janouškovcová, Eva - Žákovská, Alena - Halouzka, Jiří - Dendis, Miloš. Occurrence of
Borrelia afzelii and Borrelia garinii in Ixodes ricinus Ticks from Southern Moravia, Czech
Republic. Vector-Borne and Zoonotic Diseases, New York, USA : Mary Ann Liebert,
Inc., 4, 1, od s. 43-52, 10 s. ISSN 1530-3667. 2004. FRVŠ 541/03, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. MSM 143100010, záměr. IF 0,000
36. Kizek, René - Trnková, Libuše - Ševčíková, Sabina - Šmarda, Jan - Jelen, František.
Silver Electrode as a Sensor for Determination of Zinc in Cell Cultivation Medium.
Analytical Biochemistry, San Diego : Academic Press, 301, 2002s. 8-13. ISSN 00032697. 2002. GV204/97/K084, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 2,047
37. Kocábek, Tomáš - Rakouský, Slavomír - Ondřej, Miloš - Řepková, Jana - Relichová,
Jiřina. Identification and mapping of a T-DNA induced flower mutation in Arabidopsis
thaliana. Biologia Plantarum, Praha : Ústav experimentální botaniky AV ČR, 42, 3s. 349359. ISSN 0006-3134. 1999. MSM 143100008, záměr. IF 0,413
38. Konečná, Hana. Laboratoř molekulární fyziologie rostlin. Bulletin České společnosti pro
biochemii a molekulární biologii, Praha : ČSBMB, roč. 27, 1s. 50-51. ISSN 1211-2526.
1999. Profil Laboratoře. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV. IF 0,000
39. Kolář, Milan - Pantůček, Roman - Bardoň, Jan - Vágnerová, Iva - Typovská, H. - Válka,
Ivo - Doškař, Jiří. Occurrence of antibiotic-resistant bacterial strains isolated in poultry.
Veterinary Medicine - Czech, Brno : Veterinary Research Institute Brno, 47, 2-3s. 52-59.
ISSN 0375-8427. 2002. GA301/99/D075, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF
0,348
40. Kolář, Milan - Pantůček, Roman - Vágnerová, Iva - Kesselová, Michela - Sauer, Pavel Matoušková, I. - Růžičková, Vladislava - Doškař, Jiří. Genetická příbuznost kmenů
Enterococcus faecium VanA u pacientů s hemato-onkologickým onemocněním. Klinická
mikrobiologie a infekční lékařství, Praha : TRIOS, spol. s r.o., 9, 6, od s. 284-288, 5 s.
ISSN 1211-264X. 2003. GA301/02/1505, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF
0,000
41. Kolářová, Marie - Zavřelová, Miroslava - Beňa, František - Kolářová, Lenka. Význam
prevence infekcí v epidemiologii nádorů. Klinická onkologie, Brno : ApS Brno,s.r.o., 13,
zvl.číslo s. 34-36. ISSN 0862-495X. 2000. MSM 143100008, záměr. IF 0,000
42. Konečná, Hana - Brzobohatý, Břetislav. Navrhování sekvencí oligonukleotidů v
molekulární biologii. Bulletin ČSBMB, 2001, 1s. 39-39. ISSN 1211-2526. 2001. MSM
143100008, záměr. IF 0,000
43. Kopel, P. - Trávníček, Z. - Marek, Jaromír - Mrozinski, J. Syntheses and study on
nickel(II) complexes with thiodiglycolic acid and nitrogen-donor ligands. X-ray structures
of [Ni(bpy)(tdga)(H2O)]. 4H2O and [(en)Ni(mu-tdga)2Ni(en)].4H2O
70
(tdgaH2=thiodiglycolic acid). Polyhedron, Velká Británie : Elsevier Science Ltd., 23, 9,
od s. 1573-1578, 6 s. ISSN 0277-5387. 2004. GA203/02/0436, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. IF 1,584
44. Krejčí, Kateřina - Koch, Jorn. An in Situ Study of Variant Telomeric Repeats in Human
Chromosomes. Genomics, 58, 2s. 202-206. ISSN 0888-7543/99. 1999. GA301/99/0045,
45. Krejčí, Kateřina - Serakinci, N. - Koch, J. Telomeric repeat organization-a comparative in
situ study between man and rodent. Cytogenetics and Cell Genetics, Karger, 86, 34s. 204-211. ISSN 2004-4606. 1999. GA301/99/0045, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr. VS97032, projekt VaV. IF 1,162
46. Krejčí, Kateřina - Stentoft, Jesper - Koch, Jorn. Molecular Cytogenetics Investigation of
The Telomers in a Case of Philadelphia Positive B-ALL with a Single Telomere
Expansion. Neoplasia, 1, 6s. 492-497. ISSN 1522-8002. 1999. GA301/99/0045, projekt
VaV. MSM 143100008, záměr. VS97032, projekt VaV. IF 5,917
47. Kuderová, Alena - Nanak, Elizabeth - Truksa, Martin - Brzobohatý, Břetislav. Use of
Rifampicin in T7 RNA Polymerase-Driven Expression of a Plant Enzyme. Rifampicin
Improves Yield and Assembly. Protein Expression and Purification, San Diego, California
: Academic Press, 16, 3s. 405-409. ISSN 1046-5928. 1999. MSM 143100008, záměr.
48. Kuchař, Milan - Fajkus, Jiří. Interactions of putative telomere-binding prooteins in
Arabidopsis thaliana: identification of functional TRF2 homolog in plants. FEBS Letters,
Netherlands : ELSEVIER SCIENCE BV, 578, 3s. 311-315. ISSN 0014-5793. 2004.
AV0Z5004920, záměr. GA204/02/0027, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 3,609
49. Kunická, Zuzana. Studium alternativních rostlinných telomer. Biologické listy, roč. 68,
3s. 203-206. ISSN 0336-486. 2003. GA204/02/0027, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr. IF 0,000
50. Kurfürst, P. - Marek, Jaromír - Vančo, J. - Csöllei, J. 1-[2-Ethoxy-2-(3-methyl-1benzofuran-2-yl)ethyl]-4-(o-tolyl)piperazin-1-ium chloride. Acta Crystallographica
Section E: Structure Reports Online, Chester, England : IUCr, 60, 11, od s. o1989-o1991,
3 s. ISSN 1600-5368. 2004. MSM 143100008, záměr. IF 0,828
51. Kurfurst, P. - Marek, Jaromír - Vančo, J. - Csöllei, J. (R)-4-(4-Fluorophenyl)-1-[2hydroxy-2-(3-methyl-1-benzofuran-2-yl)ethyl]piperazinium chloride propan-1-ol solvate.
Acta Crystallographica Section C: Crystal Structure, Chester, UK : International Union of
Crystallography, 60, 7, od s. o494-o495, 2 s. ISSN 0108-2701. 2004. GA203/02/0436,
52. Kyjovská, Zdeňka - Řepková, Jana - Relichová, Jiřina. New embryo lethals in Arabidopsis
thaliana: basic genetic and morphological study. Genetica, Holandsko : Kluwer Academic
Publishers, 119, 3, od s. 317-325, 9 s. ISSN 0016-6707. 2003. MSM 143100008, záměr.
IF 1,063
53. Lexa, Matej - Horák, Jakub - Brzobohatý, Břetislav. Virtual PCR. Bioinformatics, Oxford
: Oxford University Press, 17, 2s. 192-193. ISSN 1367-4803. 2001. GA204/99/D024,
54. Lexa, Matej - Genkov, Todor Nikolaev - Brzobohatý, Břetislav. Inhibitory effects of
elevated endogenous cytokinins on nitrate reductase in ipt-expressing tobacco are
eliminated by short-term exposure to benzyladenine. PHYSIOLOGIA PLANTARUM,
Copenhagen : Munksgaard, 115, 2s. 284-290. ISSN 0031-9317. 2002. IAA5004001,
55. Lexa, Matej - Genkov, Todor Nikolaev - Malbeck, Jiří - Macháčková, Ivana - Brzobohatý,
Břetislav. Dynamics of Endogenous Cytokinin Pools in Tobacco Seedlings: A Modelling
Approach. Annals of Botany, Oxford : Oxford University Press, 91, 5s. 585-597.
71
ISSN 0305-7364. 2003. AV0Z5004920, záměr. IAA5004001, projekt VaV. LN00A081,
56. Lízal, Pavel - Relichová, Jiřina. The effect of day length, vernalization and DNA
demethylation on the flowering time in Arabidopsis thaliana. PHYSIOLOGIA
PLANTARUM, Copenhagen : Munksgaard, 113, 1s. 121-127. ISSN 0031-9317. 2001.
MSM 143100008, záměr. IF 1,476
57. Lízal, Pavel - Relichová, Jiřina. Localization of seven new late-flowering mutations on the
genetic map of Arabidopsis thaliana using a newly generated CAPS marker. Plant
Science, Dublin : Elsevier Scientific Publisher, 167, 167, od s. 143-149, 7 s. ISSN 01689452. 2004. GP521/02/P127, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 1,652
58. Maďarová, M. - Sivák, M. - Kuchta, L. - Marek, Jaromír - Benko, J. Molecular,
supramolecular and solution structures of peroxovanadium complexes with ON and O3N
donor set ligands: two new types of cationic-anionic peroxovanadium(V)
peroxovanadates(V). Dalton transactions : an international journal of organic chemistry,
Cambridge : The Royal Society of Chemistry, 2004, 20, od s. 3313-3320, 8 s. ISSN 14779226. 2004. MSM 143100008, záměr. IF 3,297
59. Maláska, Jan - Skleničková, Marie - Krejčí, Kateřina - Fajkusová, Lenka - Bajer, Milan Hrstková, Hana - Fajkus, Jiří. Telomerase Activity and Expresion and Telomere Analysis
in Situ in the Course of Treatment of Childhood Leukemias. Blood Cells, Molecules and
Diseases, Orlando, Florida : Academic Press, 26, 5s. 534-539. ISSN 1079-9796. 2000.
GA301/99/0045, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. VS97032, projekt VaV. IF 2,897
60. Maláska, Jan - Kunická, Zuzana - Borský, Marek - Skleničková, Marie - Novotná,
Marcela - Fajkusová, Lenka - Žaloudík, Jan - Fajkus, Jiří. Telomerase as a diagnostic and
predictive marker in colorectal carcinoma. Neoplasma, SLOVAKIA : VEDA, SLOVAK
ACADEMY SCIENCES, 51, 2, od s. 90-96, 7 s. ISSN 0028-2685. 2004. IBS5004010,
61. Maloň, M. - Trávníček, Z. - Maryško, M. - Zbořil, R. - Mašláň, M. - Marek, Jaromír Doležal, K. - Rolčík, J. - Kryštof, V. - Strnad, M. Metal complexes as anticancer agents 2.
Iron(III) and copper(II) bio-active complexes with N-6-benzylaminopurine derivatives.
Inorganica Chimica Acta, Oxford, UK : Elsevier Science, 323, 1-2s. 119-129. ISSN 00201693. 2001. GA203/00/0152, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 1,578
62. Mannerová, Sylva - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří - Švec, Pavel - Snauwaert, C. Vancanneyt, M. - Swings, J. - Sedláček, Ivo. Macrococcus brunensis sp. nov.,
Macrococcus hajekii sp. nov. and Macrococcus lamae sp. nov., from the skin of llamas.
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, UK : Society for
General Microbiology, 53, 5, od s. 1647-1654, 8 s. ISSN 1466-5026. 2003.
GA301/02/1505, projekt VaV. GP204/02/D099, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
IF 3,187
63. Marek, Jaromír - Hulová, Dagmar - Dostál, Jiří - Marek, Radek. Berberine formatesuccinic acid (1/1). Acta Crystallographica Section C: Crystal Structure, Chester, UK :
International Union of Crystallography, C59, 10, od s. o583-o585, 3 s. ISSN 0108-2701.
2003. GA203/02/0436, projekt VaV. MSM 143100005, záměr. MSM 143100008, záměr.
IF 3,067
64. Marek, Jaromír - Kopel, P. - Trávníček, Z. [N,N'-Bis(3-aminopropyl)ethylenediaminekappa4N,N',N'',N'''](trithiocyanurato-kappa2N,S)zinc(II) ethanol solvate. Acta
Crystallography, C59, 12, od s. m558-m560, 3 s. ISSN 0108-2701. 2003. GA203/02/0436,
65. Marek, Jaromír - Kopel, P. - Trávníček, Z. Tris(1,10-phenanthroline)sodium 2,4,6trimercapto-1,3,5-triazin-1-ide. Acta Crystallographica Section C: Crystal Structure,
72
Chester, UK : International Union of Crystallography, 59, 10, od s. m399-m401, 3 s.
ISSN 0108-2701. 2003. GA203/02/0436, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 3,067
66. Marek, Jaromír - Trávníček, Z. - Kopel, P. Diaquabis(1,10-phenanthrolinekappa2N,N')manganese(II) thiodiglycolate bis(1,10-phenanthrolinekappa2N,N')(thiodiglycolato-kappa2O,O')manganese(II) tridecahydrate. Acta
Crystallography, C59, 11, od s. m429-m431, 3 s. ISSN 0108-2701. 2003. GA203/02/0436,
67. Marek, Jaromír - Vančo, J. - Švajlenová, O. catena-Poly[potassium [copper(II)-muisothiocyanato-mu-N-salicylidene-beta-alaninato(2-)]]. Acta Crystallographica Section C:
Crystal Structure, Chester, UK : International Union of Crystallography, 2003, 12, od
s. m509-m511, 3 s. ISSN 0108-2701. 2003. GA203/02/0436, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. IF 3,067
68. Marek, Jaromír - Veselá, D. - Lišková, M. - Žemlička, M. Pomiferin. Acta
Crystallographica Section C, Velká Británie : International Union of Crystallography,
C59, 3, od s. o127-o128, 2 s. ISSN 0108-2701. 2003. GA203/02/0436, projekt VaV.
MSM 143100008, záměr. IF 3,067
69. Mlejnek, Petr - Kuglík, Petr. Induction of apoptosis in HL-60 cells by N(6)benzyladenosine. J Cell Biochem, London : Wiley-Liss, Inc., 77, 1, od s. 6-17, 12 s. 2000.
MSM 143100008, záměr. IF 2,664
70. Nedělník, Jan - Řepková, Jana. Genetické modifikace pícních jetelovin. Úroda, Praha,
2002, 12, od s. 28;29, 2 s. ISSN 0139-6013. 2002. MSM 143100008, záměr. IF 0,000
71. Nosek, Jozef - Novotná, Marcela - Hlavatovičová, Z. - Ussery, D.W. - Fajkus, Jiří Tomáška, L. Complete DNA sequence of the linear mitochondrial genome of the
pathogenic yeast Candida parapsilosis. Mol Gen Genomics, United States : SpringerVerlag, 272, 2s. 173-180. ISSN 1617-4615. 2004. AV0Z5004920, záměr. MSM
143100008, záměr. IF 2,727
72. Pantůček, Roman - Sedláček, Ivo - Doškař, Jiří - Rosypal, Stanislav. Complex genomic
and phenotypic characterization of the related species Staphylococcus carnosus and
Staphylococcus piscifermentans. International Journal of Systematic Bacteriology, UK :
Society for General Microbiology, 49, 3s. 941-951. ISSN 0020-7713. 1999.
73. Pantůček, Roman - Doškař, Jiří - Růžičková, Vladislava - Kašpárek, Petr - Oráčová, Eva Kvardová, Veronika - Rosypal, Stanislav. Identification of bacteriophage types and their
carriage in Staphylococcus aureus. Archives of Virology, Wien : Springer-Verlag, 149, 9,
od s. 1689-1703, 15 s. ISSN 0304-8608. 2004. GA301/02/1505, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. IF 1,876
74. Relichová, Jiřina - Bolormaa, Sandujimižid. Somaclonal variation and embryonic lethal
mutations in Arabidopsis. Scripta Fac. Sci. Nat. Univ. Masaryk. Brun., Biology, Brno :
Masaryk University, vol. 26, 26s. 13-16. ISSN 80-210-2241-8. 2000. MSM 143100008,
záměr. IF 0,000
75. Relichová, Jiřina - Řepková, Jana. Are the T-DNA mutants amenable to standard
recombination analysis? Biologia Plantarum, Praha : Ústav experimentální botaniky AV
ČR, 43, 1s. 19-23. ISSN 0006-3134. 2000. MSM 143100008, záměr. IF 0,413
76. Rotková, Gabriela - Skleničková, Marie - Dvořáčková, Martina - Sýkorová, Eva - Leitch,
Andrew Rowland - Fajkus, Jiří. An evolutionary change in telomere sequence motif
within the plant section Asparagales had significance for telomere nucleoprotein
complexes. Cytogenetic and Genome Research, Switzerland : KARGER, 107, 1-2s. 132138. ISSN 1424-8581. 2004. AV0Z5004920, záměr. GA204/02/0027, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. IF 0,497
73
77. Rotrekl, Vladimír - Nejedlá, Eliška - Kučera, Igor - Abdallah, Fuad - Palme, Klaus Brzobohatý, Břetislav. The role of cysteine residues in structure and enzyme activity of a
maize beta-glucosidase. European Journal of Biochemistry, 266, 3s. 1056-1065.
ISSN 0014-2956. 1999. IAA5004603, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. VS96096,
78. Růžičková, Vladislava - Pantůček, Roman - Petráš, Petr - Doškař, Jiří - Sedláček, Ivo Rosypal, Stanislav. Molecular typing of exfoliative toxin-producing Staphylococcus
aureus strains involved in epidermolytic infections. International Journal of Medical
Microbiology, München, Germany : Urban & Fischer Verlag, 292, 7-8s. 541-545.
ISSN 1438-4221. 2003. MSM 143100008, záměr. IF 2,583
79. Růžičková, Vladislava - Petráš, Petr. Exfoliatiny Staphylococcus aureus původci
epidermolytických infekcí. Zprávy CEM (SZÚ, Praha), Praha : Centrum epidemiol. a
mikrobiol. SZÚ, 12, 4, od s. 171-174, 4 s. ISSN 1211-7358. 2003. MSM 143100008,
záměr. IF 0,000
80. Růžičková, Vladislava. Genomové ostrovy patogenity u bakterií. Biologické listy, Praha :
ÚMG AV ČR, 69, 1, od s. 1-14, 14 s. ISSN 0366-486. 2004. MSM 143100008, záměr. IF
0,000
81. Řepková, Jana - Nedělník, Jan. Současný stav transgenoze pícních leguminóz. Czech
Journal of Genetics and Plant Breeding, Praha : Ústav zeměd. a potravin. informací, 35,
82. Říha, Karel - McKnight, Thomas - Fajkus, Jiří - Vyskot, Boris - Shippen, Dorothy E.
Analysis of the G-overhang structures on plant telomeres: evidence for two distinct
telomere architectures. The Plant Journal, Velká Británie : Blackwell Science Ltd, 23,
5s. 633-641. ISSN 0960-7412. 2000. MSM 143100008, záměr. VS97032, projekt VaV. IF
5,629
83. Schrumpfová, Petra - Kuchař, Milan - Rotková, Gabriela - Skříšovská, Lenka Kubičárová, Tatiana - Fajkus, Jiří. Characterization of two Arabidopsis thaliana myb-like
proteins showing affinity to telomeric DNA sequence. Genome, CANADA : NATL
RESEARCH COUNCIL CANADA, 47, March 2004, od s. 316-324, 9 s. ISSN 08312796. 2004. GA204/02/0027, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 1,861
84. Schwendt, P. - Ahmed, M. - Marek, Jaromír. Peroxovanadium(V) complexes of hydroxyhippuric acid. The X-ray crystal structure of (NPr4)2[V2O2(O2)2(alpha-hhip)2]
.5H2O, [alpha-hhip=alpha-hydroxyhippurato (2-) - C9H7NO4 (2-)]. Inorganic Chemistry
Communications, Netherlands : Elsevier Science, 7, 5, od s. 631-633, 3 s. ISSN 13877003. 2004. MSM 143100008, záměr. IF 1,513
85. Sýkorová, Eva - Fajkus, Jiří - Mikako, Ito - Fukui, Kiichi. Transition between two forms
of heterochromatin at plant subtelomeres. Chromosome Research, Dordrecht : Kluwer
Academic Publishers, roč. 9, Januarys. 309-323. ISSN 0967-3849. 2001. KSK5011112,
86. Sýkorová, Eva - Cartagena, Joyce - Horáková, Mirka - Fukui, Kiichi - Fajkus, Jiří.
Characterization of telomere-subtelomere junctions in Silene latifolia. In Mol Gen
Genomics. New York : Springer-Verlag, 2003. s. 13-20. ISBN 1617-4615.
87. Sýkorová, Eva - Lim, K. Yoong - Fajkus, Jiří - Leitch, Andrew R. The signature of the
Cestrum genome suggests an evolutionary response to the loss of (TTTAGGG)n
telomeres. Chromosoma, Germany : SPRINGER-VERLAG, 112, 4s. 164-172.
88. Sýkorová, Eva - Lim, Kar Yoong - Chase, Mark W. - Knapp, Sandra - Leitch, Ilia Judith Leitch, Andrew Rowland - Fajkus, Jiří. The absence of Arabidopsis-type telomeres in
Cestrum and closely related genera Vestia and Sessea (Solanaceae): first evidence from
74
eudicots. Plant Journal, Oxford : Blackwell Publishing Ltd, Neuveden, 34s. 283-291.
89. Sýkorová, Eva - Lim, K.Y. - Kunická, Zuzana - Chase, M.W. - Bennett, M.D. - Fajkus,
Jiří - Leitch, A.R. Telomere variability in the monocotyledonous plant order Asparagales.
PROCEEDINGS OF THE ROYAL SOCIETY OF LONDON SERIES B-BIOLOGICAL
SCIENCES, London : ROYAL SOC LONDON, Neuveden, 270s. 1893-1904. ISSN 09628452. 2003. GA204/02/0027, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 3,544
90. Ševčíková, Sabina - Souček, Karel - Kubala, Lukáš - Bryja, Vítězslav - Šmarda, Jan.
Differential effects of v-Jun and c-Jun proteins on v-myb-transformed monoblasts.
Cellular and Molecular Life Sciences, Bäsel : Birkhaeuser Verlag, 59, 10s. 1690-1705.
ISSN 1420-682X. 2002. GA301/01/0040, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. IF 5,
259
91. Šmarda, Jan. Structure and function of erythropoietin. A review. Scripta Fac. Sci. Nat.
Univ. Masaryk. Brun., Biology, Brno : Masaryk University, 26, 1s. 27-32. ISSN 80-2102241-8. 2000. MSM 143100008, záměr. IF 0,000
92. Šmarda, Jan - Fialová, Markéta - Šmarda, Jan. Cytotoxic effects of colicins E1 and E3 on
v-myb-transformed monoblasts. Folia Biologica, Praha : Akademie Věd České Republiky,
2001, 47s. 11-13. ISSN 0015-5500. 2001. MSM 143100008, záměr. IF 0,351
93. Šmarda, Jan - Bryja, Vítězslav - Sedláček, Jiří - Zahradníčková, Eva - Ševčíková, Sabina Pacherník, Jiří - Souček, Karel - Hofmanová, Jiřina - Kozubík, Alois. Lipoxygenase
inhibitors enhance tumor suppressive effects of Jun proteins on v-myb-transformed
monoblasts. Prostaglandins and other lipid mediators, New York (USA) : Elsevier
Science, 72, 3-4, od s. 131-145, 15 s. ISSN 0090-6980. 2003. GA301/01/0040, projekt
VaV. MSM 143100008, záměr. IF 2,594
94. Šmarda, Jan - Zahradníčková, Eva. Proteiny Fos: struktura, regulace, úloha v buňce.
Biologické listy, Praha : Ústav molekulární genetiky AV ČR, 68, 4, od s. 301-312, 12 s.
95. Šmardová, Jana - Šmarda, Jan. Mechanismy přestavby chromatinu. Biologické listy, Praha
: Ústav molekulární genetiky AV ČR, 66, 4s. 283-302. ISSN 0366-486. 2001. MSM
143100008, záměr. IF 0,000
96. Šmardová, Jana - Šmarda, Jan. Buněčná linie BM2: model pro studium úlohy proteinu vMyb v transformaci a diferenciaci. Biologické listy, Praha : Ústav molekulární genetiky
AV ČR, 67, 4s. 245-252. ISSN 0366-486. 2002. MSM 143100008, záměr. IF 0,000
97. Šmardová, Jana - Nemajerová, Alice - Šmarda, Jan - Jurdic, Pierre - Kubala, Lukáš Souček, Karel. Trichostatin A suppresses transformation by the v-myb oncogene in BM2
cells. Journal of Hematotherapy Stem Cell Research, Mary Ann Liebert, Inc., 12, 2, od
s. 225-235, 11 s. ISSN 1061-6128. 2003. MSM 143100008, záměr. IF 1,800
98. Šmardová, Jana - Šmarda, Jan - Koptíková, Jana. Funkní varianty nádorového supresoru
p53. Biologické listy, Praha : Ústav molekulární genetiky AV R, 69, 3, od s. 191-214,
24 s. ISSN 0366-486. 2004. MSM 143100008, záměr. IF 0,000
99. Štěpán, Jiří - Pantůček, Roman - Růžičková, Vladislava - Rosypal, Stanislav - Hájek,
Václav - Doškař, Jiří. Identification of Staphylococcus aureus based on PCR amplification
of species specific genomic 826 bp sequence derived from a common 44-kb SmaI
restriction fragment. Molecular and Cellular Probes, London : Academic Press LTD., 15,
5s. 249-257. ISSN 0890-8508. 2001. GA301/99/D075, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr. IF 1,744
100. Štěpán, Jiří - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří. Molecular diagnostics of clinically
important staphylococci (Review). Folia microbiologica, Praha : Mikrobiologický ústav
Praha AV ČR, 49, 4, od s. 353-386, 34 s. ISSN 0015-5632. 2004. GA301/02/1505, projekt
VaV. MSM 143100008, záměr. IF 0,857
75
101. Švajlenová, O. - Vančo, J. - Marek, Jaromír. Di-mu-aqua-bis[(N-salicylidene-betaalaninato-kappa3 O,N,O')copper(II)] urea disolvate. Acta Crystallographica Section C:
Crystal Structure, Chester, UK : International Union of Crystallography, 60, 6, od
s. m275-m277, 3 s. ISSN 0108-2701. 2004. GA203/02/0436, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. IF 0,828
102. Švec, Pavel - Luc, Devriese - Sedláček, Ivo - Margo, Baele - Marc, Vancanneyt Freddy, Haesebrouck - Jean, Swings - Doškař, Jiří. Enterococcus haemoperoxidus sp. nov.
and Enterococcus moraviensis sp. nov., isolated from water. International Journal of
Systematic and Evolutionary Microbiology, Reading, United Kingdom : Society for
General Microbiology, 51, 4s. 1567-1574. ISSN 1466-5026. 2001. MSM 143100008,
záměr. IF 3,187
103. Švec, Pavel - Sedláček, Ivo - Pantůček, Roman - Devriese, Luc - Doškař, Jiří.
Evaluation of ribotyping for characterization and identification of Enterococcus
haemoperoxidus and Enterococcus moraviensis strains. FEMS Microbiology Letters,
Amsterdam, Netherlands : Elsevier Science B. V., 203, 1s. 23-27. ISSN 0378-1097. 2001.
MSM 143100008, záměr. IF 1,615
104. Vašinová, M. - Marek, Jaromír - Vančo, J. - Suchý, V. Tlatlancuayin. Acta
Crystallographica Section E: Structure Reports Online, Chester, England : IUCr, 60, 11,
od s. o2019-o2021, 3 s. ISSN 1600-5368. 2004. GA203/02/0436, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. IF 3,067
105. Vévodová, Jitka - Marek, Jaromír - Zouhar, Jan - Brzobohatý, Břetislav - Su, X.-D.
Crystal structure of a cytokinic-glucoside-specific beta-glucosidase from Zea mays.
Biologické listy, Praha : Ústav molekulární genetiky AV ČR, 65, 3-4s. 250-252.
106. Vostal, Karel - Žákovská, Alena. Two-year study of examination of blood from wild
rodents for the presence of antiborrelian antibodies. Annals of Agricultural and
Environmental Medicine, 2003, 10, od s. 203-206, 4 s. ISSN 1232-1966. 2003. MSM
143100008, záměr. MSM 143100010, záměr. IF 0,851
107. Zahradníčková, Eva - Souček, Karel - Ševčíková, Sabina - Šmardová, Jana - Šmarda,
Jan. c-Fos but not v-Fos protein induces programmed cell death of v-myb-transformed
monoblasts. Cellular and Molecular Life Sciences, Bäsel : Birkhaeuser Verlag, 60, 12, od
s. 2736-2748, 13 s. ISSN 1420-682X. 2003. GA301/01/0040, projekt VaV.
108. Zouhar, Jan. Afinitní chromatografie proteinů na vázaných kovových iontech.
Chemické listy, Praha : Česká společnost chemická, 93, 11s. 683-685. ISSN 0009-2770.
1999. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV. IF 0,159
109. Zouhar, Jan - Nanak, Elizabeth - Brzobohatý, Břetislav. Expression, Single-Step
Purification and Matrix-Assisted Refolding of a Maize Cytokinin Glucoside-Specific betaGlucosidase. Protein Expression and Purification, San Diego, California : Academic
Press, 1999, 17s. 153-162. ISSN 1046-5928. 1999. MSM 143100008, záměr. VS96096,
110. Zouhar, Jan. Produkce rostlinného enzymu v bakteriálních expresních systémech.
Biologické listy, Praha : Ústav molekulární genetiky AV ČR, 65, 3-4s. 208-210.
111. Zouhar, Jan - Vévodová, Jitka - Marek, Jaromír - Damborský, Jiří - Su, X.-D. Brzobohatý, Břetislav. Insights into the Functional Architecture of the Catalytic Center of
a Maize Beta-Glucosidase Zm-p60.1. Plant Physiology, USA : American Society of Plant
Physiologists, 127, 3s. 973-985. ISSN 0032-0889. 2001. MSM 143100005, záměr. MSM
143100008, záměr. IF 4,831
76
112. Žákovská, Alena. Monitoring the presence of borreliae in Ixodes ricinus ticks in Brno
park Pisárky, Czech Republic. Biológia, Bratislava : Biológia, 2000, 6, od s. 657-662,
750 s. ISSN 0006-3088. 2000. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr. IF
0,208
113. Žákovská, Alena. Seasonal distribution of borreliae in Ixodes ricinus ticks in Brno
park Pisárky. Scripta Fac. Sci. Nat. Univ. Masaryk. Brun., Brno : Masarykova univerzita,
2000, 33s. 42-50. ISSN 80-210-2008-3. 2000. MSM 143100008, záměr. MSM
143100010, záměr. IF 0,000
114. Žákovská, Alena - Čapková, Lucie - Pejchalová, Kateřina - Šikutová, Silvie Halouzka, Jiří - Dendis, Miloš. The study of presence of spirochetes focused on Borrelia
burgdorferi s.l. with PCR method in haematophagous and non haematophagous
arthropods. Acta Parasitologica, Warszawa : W. Stefanski Institute of Parasitology, 45,
115. Žákovská, Alena - Dendis, Miloš - Pejchalová, Kateřina. Spirochaetes in Aedes
species, Culex pipiens pipiens larvae and hibernating Culex pipiens molestus mosquitoes
detected with dark field microscopy (DMF) and polymerase chain reaction (PCR)
methods. Biológia, Bratislava : Biológia, 55, 6, od s. 667-670, 750 s. ISSN 0006-3088.
2000. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr. IF 0,208
116. Žákovská, Alena - Nečasová, Marcela - Dendis, Miloš - Pechmann, Vladimír. The
study of spirochete positivity focused on Borrelia burgdorferi in sera and heart rinses and
tissues of wild-living rodents. Acta Parasitologica, Warszawa : W. Stefanski Institute of
Parasitology, 45, 3s. 218-218. ISSN 1230-2821. 2000. MSM 143100008, záměr. MSM
143100010, záměr. IF 0,495
117. Žákovská, Alena - Bašta, Jiří - Horváth, Radek - Dendis, Miloš - Pejchalová, Kateřina
- Hulínská, Dagmar. Incidence of Borrelia burgdorferisensu lato in Ixodes ricinus using
dark-field microscopy and subsequent single-step PCR. Scripta Fac. Sci. Nat. Univ.
Masaryk. Brun., Biology, Brno : Masaryk University, 26, ne, od s. x, 5 s. ISSN 80-2102786-X. 2002. MSM 143100008, záměr. IF 0,000
118. Žákovská, Alena - Čapková, Lucie - Holíková, Alena - Šerý, Omar. The presence of
Borrelia burgdorferi in Culex (culex) pipiens larvae proved by the PCR Metod. Scripta
Fac. Sci. Nat. Univ. Masaryk. Brun., Brno : Marykova Univerzita Brno, 2002, 28, od s. 13, 3 s. ISSN 80 -210 -2241. 2002. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr. IF
0,000
119. Žákovská, Alena - Janouškovcová, Eva - Dendis, Miloš - Halouzka, Jiří. Identification
of isolated strains of Borrelia from rodent tissues using gradient PAGE and PCR methods.
Scripta Fac. Sci. Nat. Univ. Masaryk. Brun., Biology, Brno : Masaryk University., Brno :
Masaryk University Printer, 28, od s. 51-60, 10 s. ISSN 80-210-3127-1. 2002. FRVŠ
541/03, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr. IF 0,000
120. Žákovská, Alena - Nejedlá, Petra - Holíková, Alena - Dendis, Miloš. Positive Findings
of Borrelia burgdorferi in Culex (C.) pipiens pipiens Larvae in the Surrounding of Brno
City determined using the PCR Method. Annals of Agricultural and Environmental
Medicine, Lublin : Instytut Medycyny Wsi, 12, 9s. 1-3. 2002. MSM 143100008, záměr.
IF 0,827
121. Žákovská, Alena - Jörková, Monika - Holíková, Alena. Summarised data of Borrelia
burgdorferi s.l. presence in larvae mosquitoes detected by PCR method in the Czech
Republic. Ecological Questions, Toruň : Uniwersitet Mikolaja Kopernika, Toruň, 4, 4, od
s. 47-51, 120 s. 2004. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr. IF 0,000
122. Žákovská, Alena - Jörková, Monika - Šerý, Omar - Dendis, Miloš. Spirochaetes in
Culex (C.) pipiens s.l. larvae. Biologia, Bratislava (Slovensko) : Slovak Academy of
77
Sciences, 59, 2004, od s. 283-287, 4 s. ISSN 0006-3088. 2004. MSM 143100008, záměr.
MSM 143100010, záměr. IF 0,208
78
Příloha 2
Abecední seznam registrovaný v databázi RIV
1. Andrysík, Zdeněk - Pacherník, Jiří - Šimek, Vladimír - Hofmanová, Jiřina - Kozubík,
Alois. The JUN N-terminal kinase activity in sub- and confluent human keratinocytes.
České Budějovice : Nakladatelství Koop, 1999. 1 s. 15th Biological Days. ISBN 807232-069-6. MSM 143100008, záměr.
2. Bašta, Jiří - Žákovská, Alena - Horváth, Radek - Pejchalová, Kateřina - Hulínská, D.
Detection Borrelia burgdorferi sensu lato in Ticks Ixodes ricinus Using Dark - field
Microscopy and Subsequent Single - step PCR. In Abstract book of VIII. Int.
Conference on Lyme Borreliosis. Prvni vydani. Munich : Munich - VIII.ICLB, 1999.
s. 61-61. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
3. Beneš, Petr - Zahradníčková, Eva - Konečná, Hana - Zdráhal, Zbyněk - Šmarda, Jan.
ZVÝŠENÁ EXPRESE VIMENTINU JAKO MARKER DIFERENCIACE
MONOBLASTŮ BM2. In VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních
biologů. Sborník abstraktů. 1. vyd. Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2004. s. 3-3.
ISBN 80-210-3321-5. GA301/03/1055, projekt VaV. GP301/03/D022, projekt VaV.
MSM 143100008, záměr.
4. Beránek, M. - Jandík, P. - Bures, J. - Palicka, V. - Nejedlá, Eliška - Klánová, Jana. Kras mutations in colorectal carcinomas in the Czech republic. In IFCC-WorldLab´99.
Firenze : Walter de Gruyter, Berlin, New York, 1999. od s. S 220, 1 s. Clinical
Chemistry and Laboratory Medicine, vol.37. ISBN ISSN 1437-8523. MSM
5. Beránek, Martin - Bureš, J. - Palička, Vladimír - Nejedlá, Eliška - Klánová, Jana.
Detekce bodových mutací k-ras genu v bioptických vzorcích kolorektálního
karcinomu. In Biochemie a molekulární biologie na prahu nového tisíciletí. Brno :
Masarykova univerzita, 2000. s. 4-5. 3. pracovní setkání biochemiků a molekulárních
biologů. ISBN 80-210-2266-3. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
6. Böhmová, Gabriela - Konečná, Hana - Váňová, Pavlína - Zdráhal, Zbyněk Brzobohatý, Břetislav. Změny proteinových spekter A. thaliana vyvolané zvýšením
hladin endogenních cytokininů. In 1. Česká proteomická konference. Liběchov : Ústav
živočisné fyziologie a genetiky AVČR, 2004. s. 20-20. MSM 143100008, záměr.
7. Böhmová, Gabriela - Váňová, Pavlína - Konečná, Hana - Zdráhal, Zbyněk Brzobohatý, Břetislav. Arabidopsis thaliana proteome influenced by plant hormones
cytokinins. In VIII.Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. 1. vyd.
Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2004. s. 23-23. ISBN 80-210-3321-5. MSM
143100008, záměr.
8. Borkovcová, Petra - Zdráhal, Zbyněk - Konečná, Hana - Brzobohatý, Břetislav. The
Receiver Domain: Attempts at Biochemical Characterization. In VII. Pracovní setkání
biochemiků a molekulárních biologů. Přírodovědecká fakulta MU v Brně :
Masarykova univerzita v Brně, 2003. s. 17-17. ISBN 80-210-3053-4. MSM
143100008, záměr.
9. Bryja, Vítězslav - Ševčíková, Sabina - Pacherník, Jiří - Souček, Karel - Kozubík, Alois
- Hofmanová, Jiřina - Šmarda, Jan. v-Jun effects on v-myb-transformed monoblasts
are modulated by metabolites of arachidonic acid. In Cells II. první. České Budějovice
: Kopp, 2000. s. 112-112. Cells II. ISBN 80-7232-120-X. MSM 143100008, záměr.
79
10. Brzobohatý, Břetislav - Genkov, Todor Nikolaev - Nejedlá, Eliška - Nejedlík, Jan Dubová, Jaroslava - Malbeck, Jiří - Vágner, Martin - Moore, Ian. Phenotype
alterations accompanying activation of a cytokinin biosynthesis gene, ipt, during
germination and early seedling development in tobacco. In Plant Biology 2002 Final
Program, Denver, Colorado, USA, August 3-7, 2002. Denver, USA : ASPB, 2002.
s. 118-118. IAA5004001, projekt VaV. KSK5052113, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr.
11. Cartagena, Joyce A. - Sýkorová, Eva - Fajkus, Jiří - Fukui, Kiichi. In situ localization
of short repetitive sequences on extended DNA fibers of Silene latifolia. In Asian
Chromosome Colloquium. Beijing (China) : Asian Chromosome Colloquium, 2001.
s. 1-1. MSM 143100008, záměr.
12. Čapková, Lucie - Horváth, Radek - Žákovská, Alena. Identifikace spirochét se
zaměřením na Borrelia burgdorferi v trávicím traktu hematofágních a
nehematofágních členovců. In X. Tomáškovy dny 2001. Brno : Mikrobiologický ústav
LF MU, 2001. s. 20-20. X. Tomáškovy dny 2001. MSM 143100008, záměr. MSM
143100010, záměr.
13. Čapková, Lucie - Horváth, Radek - Žákovská, Alena. Identification of Borrelia
burgdorferi spirochetes in midgut of haematophagous and non haematophagou
arthropods. Scripta Medica, Brno, CR, 75, 1s. 43-44. ISSN ISSN 1211-359. 2002.
MSM 143100008, záměr.
14. Čapková, Lucie - Žákovská, Alena - Janouškovcová, Eva - Knoz, Jan - Šerý, Omar Dendis, Miloš. Presence of Borrelia burgdorferi as a tick-borne pathogens in
mosquitoes. In 4th international conference on ticks and tick-borne pathogens. Banff
Alberta, Canada : University of Alberta, Conference Grant, Department of Biological
Sciences, Faculty of Science, 2002. s. 78-79. MSM 143100008, záměr.
15. Čapková, Lucie - Žákovská, Alena - Knoz, Jan - Dendis, Miloš - Šerý, Omar.
Přítomnost patogenní spirochety Borrelia garinii v hibernující samici komára Culex
(pipiens) molestus a další nálezy spirochet v komárech. In VI. Pracovní setkání
biochemiků a molekulárních biologů. Brno : Masarykova univerzita, 2002. s. 14-14.
MSM 143100008, záměr.
16. Dadejová, Martina - Lízal, Pavel - Relichová, Jiřina. Analýza polymorfismu DNA
markerů u přírodních pozdně kvetoucích linii Arabidopsis thaliana. In VII. Pracovní
setkání biochemiků a molekulárních biologů. 1. vydání. Brno : Masarykova univerzita
v Brně, 2003. od s. 42-43, 2 s. ISBN 80-210-3053-4. MSM 143100008, záměr.
17. Dobrakovová, Eva - Kolářová, Marie - Doškař, Jiří - Pantůček, Roman - Růžičková,
Vladislava. Kolonizace osob a prostředí popáleninového centra: Molekulární typizace
MRSA. In IX. mezinárodní konference nemocniční hygieny. Brno : Fakultní
nemocnice Brno, 2000. od s. xx, 1 s. GA301/99/D075, projekt VaV. MSM
143100008, záměr.
Vladislava - Pantůčková, Pavla - Kailerová, Jana. Preparation of specific probes
detecting prophages of serogroups A, B and F in lysogenic strains of Staphylococcus
aureus. In 9th International Symposium on Staphylococci and Staphylococcal
Infections. Kolding : JDS, 2000. s. 102-102. GA301/99/D075, projekt VaV. MSM
143100008, záměr.
Vladislava - Pantůčková, Pavla - Kailerová, Jana - Klepárník, Karel - Malá, Zdena Boček, Petr. Příprava specifických sond pro detekci profágů seroskupin A, B a F v
lyzogenních kmenech Staphylococcus aureus. In 4th Workshop of Biochemists and
Molecular Biologists. Biochemistry and molecular biology on the threshold of a new
80
century. 1. vydání, 2000. Brno : Masarykova univerzita, 2000. s. 47-48. ISBN 80-2102266-3. GA301/97/1192, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
20. Doškař, Jiří - Pantůček, Roman - Růžičková, Vladislava - Kašpárek, Petr - Eyer,
Luděk - Konečná, Hana - Zdráhal, Zbyněk - Preisler, Jan. Genomic and proteomic
characterization of the polyvalent staphylophage 812. In 11th International
Symposium on Staphylococci & Staphylococcal Infections. Plenary Summaries &
Poster Abstracts. Charleston, South Carolina, USA : Medical University of South
Carolina, 2004. s. 201-201. GA203/03/0515, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
21. Doškařová, Sylva - Sedláček, Ivo - Pantůček, Roman. Biochemická a molekulární
taxonomie grampozitivních koků izolovaných z kůže lam. In Konference mladých
mikrobiologů X. Tomáškovy dny 2001. Brno : Mikrobiologický ústav LF MU a FN u
sv. Anny v Brně, 2001. s. 19-19. Sborník souhrnů přednášek. GA301/99/D075, projekt
22. Doškařová, Sylva - Sedláček, Ivo - Pantůček, Roman. Nové druhy makrokoků
izolované z lam. In 22nd Congress of the Czechoslovak Society for Microbiology Health and Microorganisms. Košice - Praha : Czechoslovak Society for Microbiology,
2001. s. 148-148. Abstract Book. GA301/99/D075, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr.
23. Eyer, Luděk - Konečná, Hana - Zdráhal, Zbyněk - Preisler, Jan - Pantůček, Roman Doškař, Jiří. Analýza proteomu polyvalentního bakteriofága 812. In VIII. Pracovní
setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník abstraktů. 1. vydání. Brno :
Masarykova univerzita v Brně, 2004. od s. 45-46, 2 s. ISBN 80-210-3321-5.
GA203/03/0515, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
24. Fajkus, Jiří - Maláska, Jan - Skleničková, Marie - Vyzula, Rostislav - Bajer, Milan Hanke, Ivo - Fajkusová, Lenka. Using detection of telomerase activityand expression
in oncology diagnostics. In The Wilhelm Bernhard's workshop 16th Internatonal
Workshop on Cell Nucleus. Inst. of exp. medicine. Praha : Inst. of exp. medicine,
1999. od s. A27, 1 s. GA301/99/0045, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
25. Fajkus, Jiří - Sýkorová, Eva - Trifonov, Edward N. COLUMNAR STRUCTURE OF
TELOMERIC CHROMATIN. In Role of Telomeres and Telomerase in Cancer and
Aging. Heidelberg : DKFZ Heidelberg, 2001. s. 3-3. GA301/99/0045, projekt VaV.
MSM 143100008, záměr.
26. Fajkus, Jiří - Trifonov, Edward N. Columnar Structure Of Telomeric Chromatin. In
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. New York : Adenine Press, 2001.
s. 1017-1018. ISBN 0739-1102. GA301/99/0045, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr.
27. Fajkus, Jiří. Genomika v koncích - pokroky a perspektivy v biologii telomer. In
INFORMAČNÍ LISTY. Brno : Genetická společnost Gregora Mendela, 2002. s. 2029. Informační listy číslo 25. ISBN 1210-6267. MSM 143100008, záměr.
28. Fajkus, Jiří. What do we know about key players in the field of plant telomeres. In
Biophysics of the Genome. Brno : Masaryk University in Brno, 2003. s. 23-24.
ISBN 80-210-3226-X. GA204/02/0027, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
29. Fajkusová, Lenka - Fajkus, Jiří - Poláčková, Klára - Dvořáková, Dana - Krahulcová,
Eva - Fulneček, Jaroslav. P80/ detailní mapování methylcystosinů v oblasti Pa
promotoru BCR-ABL lokusu u pacientů s diagnózou CML a dvou modelových
buněčných linií, K562 a BV173. In Sborník abstrakt. 1. vyd. Olomouc : XII.Český a
Slovenský hematologický a transfuziologický sjezd s mezinárodní účastí, 1999. s. 221221. Sborník abstrakt. MSM 143100008, záměr. VS97032, projekt VaV.
81
30. Fajkusová, Lenka - Tvrdíková, Miroslava - Lukáš, Zdeněk - Fajkus, Jiří. Analysis of
dystrophin mRNA in patients with DMD,BMD and XLDC. In European Journal of
Human Genetics. Vienna : nature publishing group, 2001. s. 310-310. MSM
143100008, záměr.
31. Fojtová, Miloslava - Fulnečková, Jana - Fajkus, Jiří - Kovařík, Aleš. REVERSAL OF
CADMIUM INDUCED APOPTOSIS IN PLANT CELLS IS ASSOCIATED WITH
TELOMERASE INDUCTION AND DNA REPAIR. In Role of Telomeres and
Telomerase in Cancer and Aging. Heidelberg : DKFZ Heidelberg, 2001. s. 1-1. MSM
143100008, záměr.
32. Fojtová, Miloslava - Fulnečková, Jana - Fajkus, Jiří - Kovařík, Aleš. Reversibility of
cadmium-induced apoptosis is associated with increased level of telomerase activity in
tobacco TBY-2 cells. In Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. New York :
Adenine Press, 2001. s. 963-963. ISBN 0739-1102. MSM 143100008, záměr.
33. Fulnečková, Jana - Fajkus, Jiří. Telomere-binding Proteins from Nuclei of
Telomerase-Negative Tissues Inhibit Plant Telomerase (invited lecture). J.Biomol.
Struct. Dyn., USA : Adenine press, 17, 6s. 1132-1132. ISSN 0739-1102. 2000. MSM
34. Fulnečková, Jana - Kubičárová, Tatiana - Fajkus, Jiří. REGULATION OF
TELOMERE MAINTENANCE IN PLANTS BY TELOMERE-BINDING
PROTEINS. In Role of Telomeres and Telomerase in Cancer and Aging. Heidelberg :
DKFZ Heidelberg, 2001. s. 1-1. MSM 143100008, záměr.
35. Genkov, Todor Nikolaev - Dubová, Jaroslava - Guo, Jianchun - Reková, Alena Nejedlá, Eliška - Lexa, Matej - Nejedlík, Jan - Malbeck, Jiří - Vágner, Martin - Moore,
Ian - Brzobohatý, Břetislav. Tobacco and Arabidopsis seedling development upon
activation of ipt, a cytokinin biosynthesis gene. European Journal of Biochemistry,
Oxford : Blackwell Science, 269, Supp. 1s. 39-39. ISSN 0014-2956. 2002.
36. Genkov, Todor Nikolaev - Dubová, Jaroslava - Guo, Jianchun - Reková, Alena Nejedlá, Eliška - Lexa, Matej - Nejedlík, Jan - Malbeck, Jiří - Vágner, Martin - Moore,
Ian - Brzobohatý, Břetislav. Distinct responses to activation of a cytokinin
biosynthesis gene, ipt, in tobacco and Arabidopsis seedling development. In 13th
Congress of the Federation of European Societies of Plant Physiology, Hersonissos,
Heraklion, Crete, Greece, 2-6 September 2002, Book of Abstracts. Hersonissos,
Greece : FESPP, 2002. s. 130-130. IAA5004001, projekt VaV. KSK5052113, projekt
37. Genkov, Todor Nikolaev - Vágner, Martin - Dubová, Jaroslava - Malbeck, Jiří Moore, Ian - Brzobohatý, Břetislav. INCREASED ETHYLENE PRODUCTION CAN
ACCOUNT
FOR
SOME
OF
THE
PHENOTYPE
ALTERATIONS
ACCOMPANYING ACTIVATION OF A CYTOKININ BIOSYNTHESIS GENE,
IPT, DURING GERMINATION AND EARLY SEEDLING DEVELOPMENT IN
TOBACCO. In NATO ADVANCED RESEARCH WORKSHOP ON BIOLOGY
AND BIOTECHNOLOGY OF THE PLANT HORMONE ETHYLENE 2002. Murcia
(Spain) : A.G. Novograf, S.A, 2002. s. 86-86. IAA5004001, projekt VaV.
KSK5052113, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
38. Hejátko, Jan - Borkovcová, Petra - Pernisová, Markéta - Taenzler, Petra - Palme,
Klaus - Brzobohatý, Břetislav. Mutations in CKI1 Block Female Gametophyte
Development in Arabidopsis thaliana. In 13-th Congress of the European Societies of
Plant Physiology. Heraklion, Crete, Greece : 13th FESPP Congress Secretariat,
Department of Biology, University of Crete, 2002. s. 303-303. LN00A081, projekt
82
39. Hejátko, Jan - Borkovcová, Petra - Pernisová, Markéta - Taenzler, Petra - Palme,
Klaus - Brzobohatý, Břetislav. MUTATIONS IN CKI1 BLOCK FEMALE
GAMETOPHYTE DEVELOPMENT IN ARABIDOPSIS THALIANA. In Progress in
Basic, Applied and Diagnostic Histochemistry. The 39-th Symposium with
International Participation. Brno, Česká republika : Masarykova univerzita v Brně pro
Czech Society for Histo- and Cytochemistry, Kamenice 3, Brno, 2002. s. 20-20.
ISBN 80-210-2998-6. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
40. Hejátko, Jan - Pernisová, Markéta - Dobešová, Romana - Horák, Jakub - Brzobohatý,
Břetislav. Inzerční mutageneze ve funkční genomice Arabidopsis thaliana. In Kniha
abstrakt, 3. metodické dny, Žďárske vrchy, Milovy. Praha : Česká společnost
experimentální biologie rostlin, Ústav experimentální botaniky AV ČR, 2003. s. 2323. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
41. Hejátko, Jan - Pernisová, Markéta - Eneva, Tinka - Palme, Klaus - Brzobohatý,
Břetislav. Investigating the role of sensor histidine kinase CKI1 in Arabidopsis using a
reverse genetics approach. In Book of Abstracts, Plant GEMs/GARNet, Plant
Genomic European Meetings, York, U.K. York : Plant GEMS/GARNet, 2003. s. 179179. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
Břetislav. The gametophytic expression of the gene for sensor histidine kinase CKI1 is
essential for embryo sac formation in Arabidopsis. In Book of Abstracts, Plant
reproduction: from Mendel to molecular biology. Brno : MU Brno, 2003. s. 67-67.
ISBN 80-210-3194-8. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. VS96096,
projekt VaV.
Břetislav. The putative sensor histidine kinase CKI1 is involved in Arabidopsis female
gametophyte development. In Book of Abstracts, Plant Biology 2003. Hawai, USA :
ASPB, 2003. s. 121-121. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
Břetislav. CKI1, a putative sensor histidine kinase is essential for proper female
gametophyte formation in Arabidopsis thaliana. In Boook of Abstracts,
Cytokinematics 2004, Microscopy of Live Cells in the Post Genomics Era. The 8th
Symposium on Light Microscopy & Live Cells in Hradec Kralove. Hradec Králové :
RNDr. F. Skopec, CSc.-NUCLEUS HK, 2004. s. 22-22. ISBN 80-86225-60-7.
LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
45. Hlaváčová, Sylvie - Lízal, Pavel - Řepková, Jana. Využití molekulárních markerů při
genetickém mapování mutací Arabidopsis thaliana. In Informační listy. Brno :
Genetická společnost Gregora Mendela, 2002. s. 23-23. ISBN 1210-6267. MSM
143100008, záměr.
46. Hobza, Roman - Doškař, Jiří - Pantůček, Roman. Stanovení polymorfizmu genů pro
tvorbu koagulázy, rezistenci k meticilinu a 16S-23S mezerníkových oblastí rDNA
genů u Staphylococcus aureus metodou PCR. In 4th Workshop of Biochemists and
Molecular Biologists. Biochemistry and molecular biology on the threshold of a new
century. 1. vydání, 2000. Brno : Masarykova univerzita, 2000. s. 49-50. ISBN 80-2102266-3. GA301/97/1192, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
47. Holíková, Alena - Nejedlá, Petra - Dendis, Miloš - Pejchalová, Kateřina - Žákovská,
Alena. Čtyřleté studium výskytu Borrelia burgdorferi v klíšťatech na lokalitě Pisárky,
Brno. In X. Tomáškovy dny 2001. Brno : Mikrobiologický ústav LF MU, 2001. s. 2727. X. Tomáškovy dny 2001. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
83
Alena. 4-leté studium výskytu Borrelia burgdorferiu v klíštatech na parkové lokalitě
Pisárky, Brno. In VI. česko-slovenský kongres o infekčních chorobách. Mikulov :
Společnost infekčního lékařství, 2001. s. 66-156. Sborník abstrakt, 1. ISBN ISSN
1213-5011. MSM 143100008, záměr.
Alena. Four-year study of the presence of Borrelia burgdorferi in Ixodes ricinus ticks
in locality Pisárky, Brno. Scripta Medica, Brno, CR, 75, 1s. 49-49. ISSN ISSN 1211359. 2002. MSM 143100008, záměr.
50. Hradecká, Helena - Michalová, Eva - Růžičková, Vladislava. Metoda přímé detekce
specifických genů v koloniích bakterií. In Tomáškovy dny 2003. XII konference. LF
MU Brno : Mikrobiologický ústav LF MU a FN v Brně, 2003. s. 8-8. MSM
143100008, záměr.
51. Hradilová, Jana - Brzobohatý, Břetislav. Tissue specific alternative splicing in the
gene for AHP5, a histidine-containing phosphotransfer protein from Arabidopsis
thaliana. In IV. Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků,
Chemické listy. Praha : Česká společnost chemická, 2004. s. 282-282. ISBN 00092770. MSM 143100008, záměr.
52. Hradilová, Jana - Brzobohatý, Břetislav. TISSUE SPECIFIC ALTERNATIVE
SPLICING IN THE GENE FOR AHP5, A HISTIDINE-CONTAINING
PHOSPHOTRANSFER PROTEIN FROM ARABIDOPSIS THALIANA. In
VIII.Pracovní setkání biochemik a molekulárních biolog. 1. vyd. Brno : Masarykova
univerzita v Brn, 2004. od s. 25-26, 2 s. ISBN 80-210-3321-5. MSM 143100008,
záměr.
53. Hradilová, Jana - Brzobohatý, Břetislav. Characterization of the expression pattren of
the Arabidopsis AHP factores gene family. Bratislava : Dni rastlinnej fyziológie X.,
2004. 1 s. Book of abstract. MSM 143100008, záměr.
54. Hrstka, Roman - Růžičková, Vladislava. Molecular typing and detection of toxinproducing strains Staphylococcus aureus. In III. Pracovní setkání biochemiků a
molekulárních biologů. Molekulární biologie a biochemie v humánní a veterinární
medicíně. Brno : Masarykova univerzita, 1999. s. 35-35. ISBN 80-210-2266-3.
55. Hrstka, Roman - Růžičková, Vladislava - Pantůček, Roman - Petráš, Petr - Doškař,
Jiří. Detekce profágů u TSST-1 pozitivních kmenů Staphylococcus aureus pomocí
specifických sond. In Tomáškovy dny 2000 - sborník souhrnů přednášek. Brno :
Mikrobiologický ústav LF MU a FN u sv. Anny v Brně, 2000. s. 10-11. Konference
mladých mikrobiologů. GA301/99/D075, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
56. Hrstka, Roman - Růžičková, Vladislava - Pantůček, Roman - Petráš, Petr - Doškař,
Jiří. Genotype variability of TSST-1 positive Staphylococcus aureus strains in the
Czech Republic. In V. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno :
143100008, záměr.
57. Janouškovcová, Eva - Žákovská, Alena - Dendis, Miloš. Identifikace Ag struktur
patogenních spirochet Borrelia burgdorferi a změny proteinového složení jednotlivých
pasáží metodou SDS - gradient PAGE. In Sborník souhrnů přednášek, X.Tomáškovy
dny 2001. Brno : Mikrobiologický ústav LF MU, 2001. s. 11-12. MSM 143100008,
záměr. MSM 143100010, záměr.
58. Janouškovcová, Eva - Žákovská, Alena - Dendis, Miloš. Identifikace 33 izolátů
spirochet a určení patogenní Borrelia burgdorferi u vzorků izolovaných z roztočů,
klíšťat, komárů a hlodavců. In Sborník abstrakt, VI. česko-slovenský kongres o
84
infekčních chorobách. Brno : Společnost infekčního lékařství ČLS JEP, 2001. s. 6767. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
59. Janouškovcová, Eva - Žákovská, Alena - Halouzka, Jiří - Dendis, Miloš. Borrelia
burgdorferi - identifikace získaných izolátů metodami gradient PAGE, PCR a RFLP.
In Sborník souhrnů přednášek, XI. Tomáškovy dny 2002. Brno : Mikrobiologický
ústav LF MU v Brně a FN u sv. Anny v Brně, 2002. od s. 7-8, 2 s. FRVŠ 541/03,
projekt VaV. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
60. Janouškovcová, Eva - Žákovská, Alena - Halouzka, Jiří - Dendis, Miloš. Identification
of 33 isolated strains of Borrelia burgdorferi obtained from various hosts and vectors
using RFLP, PCR and gradient PAGE methods. In Program and Abstracts, 4th
International Conference on Ticks and Tickk-borne pathogens. Banff : University of
Alberta, 2002. s. 36-36. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
61. Janouškovcová, Eva - Žákovská, Alena - Dendis, Miloš. Identification of Ag
structures of Borrelia burgdorferi and protein changes of individual passages using
SDS-gradient PAGGE. Scripta Medica, Brno : Lékařská fakulta MU v Brně, 75,
1s. 37-37. 2002. MSM 143100008, záměr.
62. Janouškovcová, Eva - Žákovská, Alena - Dendis, Miloš - Halouzka, Jiří - Šerý, Omar.
Identification of 33 spirochaete isolates and determination of Borrelia burgdorferi
patogen strains using SDS-gradient PAGE and PCR method. In Sborník příspěvků,
VI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno : Masarykova
univerzita, 2002. s. 79-79. ISBN 80-210-2777-0. FRVŠ 541/03, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
63. Janouškovcová, Eva - Žákovská, Alena - Dendis, Miloš - Halouzka, Jiří - Šerý, Omar.
Výskyt a identifikace patogenních spirochet Borrelia burgdorferi izolovaných z
klíšťat, roztočů, hlodavců a komárů. In Abstrakta referátů z konference, Zoologické
dny. Brno : Ústav biologie obratlovců AV ČR, 2002. s. 172-172. MSM 143100008,
64. Janouškovcová, Eva - Žákovská, Alena - Halouzka, Jiří - Dendis, Miloš. Borrelia
burgdorferi - identifikace izolátů patogenních spirochet. Správy klinickej
mikrobiológie, Bratislava : Sekcia klinickej mikrobiológie, Mikrobiologickoepidemiologickej spoločnosti, Slovenskej lekárskej spoločnosti, II., D/2002, od s. 4647, 2 s. ISSN 1335-8219. 2002. FRVŠ 541/03, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
MSM 143100010, záměr.
65. Janouškovcová, Eva - Žákovská, Alena - Halouzka, Jiří - Dendis, Miloš. Identifikace
33 izolátů Borrelia burgdorferi z různých hostitelů a vektorů metodami gradientové
PAGE, PCR, PCR - RFLP. In Program a Sborník abstrakt, 18. Pečenkovy
epidemiologické dny 2002. Pec pod Sněžkou : Čs. lékařská společnost J.E. Purkyně,
2002. s. 72-72. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
66. Janouškovcová, Eva - Mejzlíková, Marie - Pejchalová, Kateřina - Nejedlá, Petra Halouzka, Jiří - Žákovská, Alena. Průkaz pozitivity Ixodes ricinus na Borrelia
burgdorferi na parkové lokalitě Pisárky, Brno metodou kultivace, DFM, PCR. In
Program a Sborník abstrakt, 19. Pečenkovy epidemiologické dny 2003. Poděbrady :
Česká lékařská společnost J. E. Purkyně, Společnost pro epidemiologii a
mikrobiologii, 2003. s. 36-36. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
67. Janouškovcová, Eva - Pejchalová, Kateřina - Nejedlá, Petra - Žákovská, Alena Halouzka, Jiří - Dendis, Miloš. Druhové zastoupení Borrelia burgdorferi na parkové
lokalitě Brno-Pisárky. In Sborník abstraktů, XIII. Tomáškovy dny 2004. Brno :
Mikrobiologický ústav LF MU a FN u sv. Anny v Brně, 2004. od s. 31-31, 1 s. FRVŠ
541/03, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
85
68. Janouškovcová, Eva - Pejchalová, Kateřina - Nejedlá, Petra - Žákovská, Alena Halouzka, Jiří - Dendis, Miloš. Výskyt patogenních spirochet Borrelia burgdorferi na
parkové lokalitě Brno-Pisárky. In Sborník abstraktů, Česko-slovenská studentská
vědecká konference. Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2004. s. 37-37. ISBN 80210-3376-2. FRVŠ 541/03, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010,
záměr.
69. Janouškovcová, Eva - Pejchalová, Kateřina - Vostal, Karel - Nejedlá, Petra - Holíková,
Alena - Mejzlíková, Marie - Martiníková, Hana - Žákovská, Alena - Halouzka, Jiří Dendis, Miloš. Species identification of Borrelia burgdorferi sensu lato from tick,
rodent, mite and mosquito isolates in the Czech Republic. In IX European
multicolloquium of parasitology. Valencia, Spain : European federation of
parasitologists, 2004. s. 413-413. ISBN 84-609-1732-0. MSM 143100008, záměr.
MSM 143100010, záměr.
70. Jurkovič, Dušan - Krajčovič, J. - Dušincký, R. - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří. PCR
identifikácia enterokokov izolovaných z bryndze. In Tomáškovy dny 2003 - sborník
abstraktů. Brno : Mikrobiologický ústav LF MU a FN u svaté Anny, 2003. s. 27-27.
MSM 143100008, záměr.
71. Kašpárek, Petr - Hobza, Roman - Kizek, René - Pantůček, Roman - Růžičková,
Vladislava - Hájek, Václav - Rosypal, Stanislav - Doškař, Jiří. Genotypová variabilita
kmenů Staphylococcus aureus rezistentních k oxacilinu. In III. Pracovní setkání
biochemiků a molekulárních biologů. Molekulární biologie a biochemie v humánní a
veterinární medicíně. Brno : Masarykova univerzita, 1999. s. 17-17. ISBN 80-2102266-3. GA301/97/1192, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
72. Kašpárek, Petr - Doškař, Jiří - Pantůček, Roman - Hájek, Václav - Rosypal, Stanislav.
Analýza plazmidů kmenů druhu Staphylococcus aureus lišících se rezistencí k
antibiotikům. In 4th Workshop of Biochemists and Molecular Biologists.
Biochemistry and molecular biology on the threshold of a new century. 1. vydání,
2000. Brno : Masarykova univerzita, 2000. s. 50-50. ISBN 80-210-2266-3. MSM
143100008, záměr.
73. Kašpárek, Petr - Pantůček, Roman - Rosypal, Stanislav - Doškař, Jiří. Analýza mutací
stafylokokového bakteriofága 812 vedoucích ke změně rozmezí hostitele. In 22nd
Congress of the Czechoslovak Society for Microbiology - Health and Microorganisms.
Košice - Praha : Czechoslovak Society for Microbiology, 2001. s. 197-197. Abstract
Book. MSM 143100008, záměr.
74. Kašpárek, Petr - Doškař, Jiří - Pantůček, Roman. Molekulární základ změny rozmezí
hostitele stafylokokového bakteriofága 812. In V. Pracovní setkání biochemiků a
molekulárních biologů. Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2001. s. 41-42. Sborník
příspěvků. ISBN 80-210-2538-7. MSM 143100008, záměr.
75. Kašpárek, Petr - Doškař, Jiří - Pantůček, Roman. Analýza genomu stafylokokového
bakteriofága 812. In Konference mladých mikrobiologů X. Tomáškovy dny 2001.
Brno : Mikrobiologický ústav LF MU a FN u sv. Anny v Brně, 2001. s. 15-15.
Sborník souhrnů a přednášek. Abstrakt: Scripta Medica (Brno) Vol. 75 (1, February
2002): s. 39. MSM 143100008, záměr.
76. Kašpárek, Petr - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří. Genome analysis of staphylococcal
bacteriophage 812. In VI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno
: Masarykova univerzita, 2002. s. 66-66. ISBN 80-210-2777-0. MSM 143100008,
záměr.
77. Kašpárek, Petr - Pantůček, Roman - Loessner, Martin J. - Zimmer, Markus - Doškař,
Jiří. Identifikace genu pro endolyzin polyvalentního stafylokokového bakteriofága
812. In VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno :
86
Masarykova univerzita, 2003. s. 43-43. ISBN 80-210-3053-4. MSM 143100008,
záměr.
78. Kesselová, Michaela - Pantůček, Roman - Vágnerová, Iva - Kolář, Milan - Sauer,
Pavel. Molekulárno-biologická analýza vankomycin rezistentných enterokokov. In
Tomáškovy dny 2003 - sborník abstraktů. Brno : Mikrobiologický ústav LF mU a FN
u svaté Anny, 2003. od s. 31-32, 2 s. MSM 143100008, záměr.
79. Kesselová, Michaela - Pantůček, Roman - Vágnerová, Iva - Kolář, Milan - Sauer,
Pavel. Význam molekulárno-biologických metód v problematike vankomycínrezistentných enterokokov. In Študentská vedecká konferencia organizovaná pri
príležitosti 50. výročia Slovenskej akadémie vied. Bratislava : Prírodovedecká fakulta
Univerzity Komenskeho, Bratislava, 2003. od s. x, 1 s. MSM 143100008, záměr.
80. Kiran, Nagavalli Subbanna - Genkov, Todor Nikolaev - Malbeck, Jiří - Brzobohatý,
Břetislav. APPROACHES TO ELUCIDATING THE ROLE OF SUBCELLULAR
COMPARTMENTATION
IN
THE
REGULATION
OF
CYTOKININ
METABOLISM. In VI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů,
Sborník příspěvků. Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2002. s. 64-64. ISBN 80210-2777-0. AV0Z5004920, záměr. GV206/96/K188, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr.
81. Kiran, Nagavalli Subbanna - Reková, Alena - Válková, Martina - Malbeck, Jiří Brzobohatý, Břetislav. Ectopic overexpression of a Maize beta-glucosidase Disrupts
Cytokinin Metabolism in Transgenic Tobacco. In Book of Abstracts, Plant Physiology
Conference of Ph.D. Students and Young Scientists 2003. Brno : Katedra anatomie a
Fyziologie Rostlin, Masarykovy Univerzity, 2003. s. 133-135. ISBN 80-7157-676-X.
AV0Z5004920, záměr. GV206/96/K188, projekt VaV. IAA5004001, projekt VaV.
MSM 143100008, záměr.
82. Kiran, Nagavalli Subbanna - Reková, Alena - Válková, Martina - Malbeck, Jiří Brzobohatý, Břetislav. Ectopic Overexpression of a Maize beta-glucosidase may
Disrupt Cytokinin Homeostasis in Transgenic Tobacco. In Sborník Příspěvků VII.
Pracovní Setkání Biochemiků a Molekulárních Biologů. Brno : Katedra Biochemie
Masarykovy Univerzity, 2003. s. 23-23. ISBN 80-210-3053-4. AV0Z5004920, záměr.
GV206/96/K188, projekt VaV. IAA5004001, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
83. Kiran, Nagavalli Subbanna - Reková, Alena - Válková, Martina - Malbeck, Jiří Brzobohatý, Břetislav. Ectopic overexpression of a Maize beta-glucosidase Disrupts
Cytokinin Metabolism in Transgenic Tobacco. In Book of Abstracts, Plant Biology
2004. Florida, USA : Neuveden, 2004. s. 121-121. AV0Z5004920, záměr.
GV206/96/K188, projekt VaV. IAA5004001, projekt VaV. LN00A081, projekt VaV.
MSM 143100008, záměr.
84. Kiran, Nagavalli Subbanna - Reková, Alena - Válková, Martina - Malbeck, Jiří Brzobohatý, Břetislav. Ectopic overexpression of a Maize beta-glucosidase Interferes
with Cytokinin Homeostasis in Transgenic Tobacco. In 18th IPGSA Conference,
Book of Abstracts. Canberra, Australia : The Australian National University,
Canberra, Australia, 2004. s. 115-115. AV0Z5004920, záměr. GV206/96/K188,
projekt VaV. IAA5004001, projekt VaV. LN00A081, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr.
85. Kiran, Nagavalli Subbanna - Reková, Alena - Válková, Martina - Malbeck, Jiří Brzobohatý, Břetislav. Overexpression of a Maize beta-glucosidase Disrupts
Cytokinin Metabolism in Transgenic Tobacco. In X. Days of Plant Physiology, Book
of Abstracts. Bratislava : Department of Plant Physiology, Comenius University,
Bratislava, 2004. s. 47-47. AV0Z5004920, záměr. GV206/96/K188, projekt VaV.
IAA5004001, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
87
86. Kiran, Nagavalli Subbanna - Reková, Alena - Válková, Martina - Malbeck, Jiří Brzobohatý, Břetislav. Overexpression of a Maize beta-glucosidase Disrupts
Cytokinin Metabolism in Transgenic Tobacco. In Acta Physiologiae Plantarum Supplement 14th FESPB Congress Book of Abstracts. Krakow : Polish Academy of
Sciences, 2004. od s. 51-52, 2 s. ISBN 0137-5881. AV0Z5004920, záměr.
GV206/96/K188, projekt VaV. IAA5004001, projekt VaV. LN00A081, projekt VaV.
MSM 143100008, záměr.
87. Kizek, René - Trnková, Libuše - Ševčíková, Sabina - Šmarda, Jan. Stříbrná elektroda
jako senzor pro sledování koncentrace zinečnatých iontů v buněčných médiích. In II.
pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. 1. vyd. Brno : Masarykova
univerzita Brno, 2000. s. 21-21. ISBN 80-210-2265-5. MSM 143100008, záměr.
88. Kocábek, Tomáš - Rakouský, Slavomír - Řepková, Jana - Relichová, Jiřina.
Identification and mapping of the T-DNA tagged flower mutation of Arabidopsis
thaliana revealed the SUPERMAN epigenetic allele. In From Cells to Crops. Nitra,
Slovenská republika : Inst. Plant Genetics and Biotechnology, 1999. s. 105-106. Abstr.
3rd Symp. Ser. Rec. Adv. Plant Biotechnol. MSM 143100008, záměr.
89. Kocábek, Tomáš - Rakouský, Slavomír - Řepková, Jana - Relichová, Jiřina.
Identification and mapping of the T-DNA tagged flower mutation of Arabidopsis
thaliana revealed the SUPERMAN epigenetic allele. Biologia, Bratislava : Slovak
Academy of Sciences, 54, Suppl. 7s. 43-43. ISSN 0006-3088. 1999. MSM
143100008, záměr.
90. Kolář, Milan - Vágnerová, Iva - Pantůček, Roman - Čermák, P. Impact of rational
antibiotic usage on occurrence of vancomycin-resistant enterococci in hematological
patients. Clinical Microbiology and Infection, Oxford : Blackwell Science, 7, Suppl
1s. 91-91. ISSN 1469-0691. 2001. 11th ECCMID Abstracts. GA301/99/D075, projekt
91. Kolář, Milan - Pantůček, Roman - Vágnerová, Iva - Kesselová, Michaela - Sauer,
Pavel - Matoušková, I. - Doškař, Jiří. Molecular-biology analysis of Enterococcus
faecium VanA strains in haemato-oncological patients. In 5th European Congress of
Chemotherapy and Infection. Greece : Federation of the European Societies for
Chemotherapy and for Infection, 2003. s. 106-106. MSM 143100008, záměr.
92. Kolář, Milan - Pantůček, Roman - Vágnerová, Iva - Kesselová, Michaela - Sauer,
Pavel - Matoušková, I. Molekulárně-biologická analýza kmenů Enterococcus faecium
VanA u pacientů s hemato-onkologickým onemocněním. In XVII. Olomoucké
hematlogické dny. Olomouc : Česká hematologická společnost ČLS JEP, 2003.
s. 137-137. MSM 143100008, záměr.
93. Kolář, Milan - Vágnerová, Iva - Pantůček, Roman - Kesselová, Michaela - Sauer,
Pavel. Zdroje a šíření vankomycin rezistentních enterokoků. Správy klinickej
mikrobiológie, Bratislava : Sekcia klinickej mikrobiológie, Mikrobiologickoepidemiologickej spoločnosti, Slovenskej lekárskej spoločnosti, 4, Suppl. B, od s. 2021, 2 s. ISSN 1335-8219. 2004. MSM 143100008, záměr.
94. Konečná, Hana. Modifikované syntetické oligonukleotidy. In Biochemie a
molekulární biologie na prahu nového tisíciletí. Brno : Masarykova univerzita, 2000.
s. 74-75. IV. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů (přednáška).
ISBN 80-210-2266-3. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
95. Konečná, Hana. Nový typ informační molekuly: PNA. In Biochemie a molekulární
biologie na prahu nového tisíciletí. Brno : Masarykova univerzita, 2000. s. 19-20. IV.
Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů (přednáška). ISBN 80-2102266-3. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
88
96. Konečná, Hana - Nejedlá, Eliška - Paděrová, Eva - Zdráhal, Zbyněk - Brzobohatý,
Břetislav. Centrální laboratoř speciálních technik na Masarykově univerzitě. In
VIII.Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. 1. vyd. Brno :
143100005, záměr. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
97. Krejčí, Kateřina - Koch, Jorn. In situ studies of human telomeres. In Abstracts of the
Second European Cytogenetics Conference. -. Viena, Austria : Karger, 1999. s. 749749. Cytogenetics and Cell Genetics, 1-2. GA301/99/0045, projekt VaV. MSM
98. Krejčí, Lumír - Damborský, Jiří - Thomsen, B. - Duno, M. - Bendixen, C. Dissection
of homologous recombination. In Embo Workshop Functional Organization of the
Cell Nucleus. 1. vyd. Praha : EMBO, 1999. s. 29-29. EMBO Workshop. MSM
99. Krejčí, Lumír - Damborský, Jiří - Thomsen, Bo - Duno, Morten - Bendixen, Christian.
Molecular Dissection of Homologous Recombination. In The Meiotic Process:
Nuclear Architecture, Recombination and Chromosomal Segregation. 1. vyd.
Obertraun, Upper Austria : FEBS, 1999. od s. -, 1 s. MSM 143100008, záměr.
100.
Krejčí, Lumír - Thomsen, Bo - Duno, Morten - Westergaard, Ole - Bendixen,
Christian. Homomeric Interaction Of the Mouse Rad52 Protein. J.Biomol. Struct.
Dyn., USA : Adenine press, 17, 6s. 1170-1170. ISSN 0739-1102. 2000. MSM
101.
Kubičárová, Tatiana. Further characterization of telomeric chromatin. In
Aktuální témata z buněčné a molekulární biologie. Olomouc : Univerzita Palackého v
Olomouci, 2001. s. 16-16. ISBN 80-244-0327-7. GA301/99/0045, projekt VaV.
IAC5004111, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
102.
Kubičárová, Tatiana - Fajkus, Jiří. Structural Biology of Telomeres. In
Materials Structure. Česká republika : Krystalografická společnost, Setkání českých a
slovenských strukturních biologů, 2002. s. 13-14. sv.9, číslo 1. ISBN 1211-5894.
MSM 143100008, záměr.
103.
Kuglík, Petr - Oltová, Alexandra - Gaillyová, Renata. Využití techniky
fluorescenční hybridizace in situ (FISH) v genetické diagnostice. In Pokroky v
lékařství a farmacii. Brno : MEFA, 1999. s. 70-70. MSM 143100008, záměr.
104.
Kuglík, Petr - Václavík, Pavel - Oltová, Alexandra - Popelínská, E. Wernerová, V. The identification of supernumerary marker chromosomes in five
patients by fluorescent in situ hybridization. Cytogenetics and Cell Genetics, Basel : S.
Karger AG, 85, 1s. 39-39. ISSN 0301-0171. 1999. MSM 143100008, záměr.
105.
Kuchař, Milan - Horáková, Mirka - Zachová, Dagmar - Fajkus, Jiří. Hledání
rostlinných telomer-vazebných proteinů prostřednictvím genomického a
proteomického přístupu. In VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních
biologů. Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2003. s. 27-27. ISBN 80-210-3053-4.
106.
Kyjovská, Zdeňka - Jungmannová, Barbara - Řepková, Jana. Cytological
analysis of embryonic lethal T-DNA mutations in Arabidopsis thaliana. In Scripta
Facultatis Scientiarum Naturalium Universitatis Masarykianae Brunensis, Biology.
Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2001. s. 62-63. ISBN 80-210-2590-5. MSM
143100008, záměr.
107.
Kyjovská, Zdeňka - Řepková, Jana. T-DNA Arabidopsis thaliana mutants with
disruption during embryo development. In XVIIth Internation Congress on Sexual
Plant Reproduction, Lublin, Poland, 9 - 13 July 2002. Lublin, Poland : Maria Curie-
89
Sklodowska University Press, Lublin, 2002. s. 87-87. ISBN 83-227-1950-7. MSM
143100008, záměr.
108.
Lexa, Matej - Cheeseman, John M. Genetic manipulation of the location of
nitrate reduction and its effects on plant growth. In Plant Nutrition - Molecular
Biology and Genetics. Dordrecht : Kluwer Academic Publishers, 1999. s. 59-63.
109.
Lexa, Matej - Genkov, Todor Nikolaev - Brzobohatý, Břetislav. Nitrate
Reductase Activity in ipt-Expressing Tobacco. In 17th International Conference on
Plant Growth Substances, Brno, Czech Republic, July 1-6, 2001, Abstracts. Brno :
Mendel University of Agriculture and Forestry, Brno, 2001. s. 189-189. ISBN 807157-518-6. MSM 143100008, záměr.
110.
Lexa, Matej - Horák, Jakub - Rotkovská, Julie Olegivna - Brzobohatý,
Břetislav. Insertional Mutants in Arabidopsis Response Regulator Genes. In 17th
International Conference on Plant Growth Substances, Brno, Czech Republic, July 16, 2001, Abstracts. Brno : Mendel University of Agriculture and Forestry, Brno, 2001.
s. 148-148. ISBN 80-7157-518-6. GA204/99/D024, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr.
111.
Lízal, Pavel - Relichová, Jiřina. A genetic analysis of late flowering in
Arabidopsis thaliana. In Biochemistry and molecular biology on the threshold of a
new century. Brno : Vydavatelství MU, 2000. s. 37-38. ISBN 80-210-2266-3. MSM
143100008, záměr.
112.
Lízal, Pavel - Relichová, Jiřina. Expression of late flowering in Arabidopsis
thaliana. In Vortr. Pflanzenzuchtg. Gottingen : Liddy Halm, Backhausstr. 9b, D-37081
Gottingen, 2000. s. 16-16. ISBN 0723-7812. MSM 143100008, záměr.
113.
Lízal, Pavel - Cetkovská, Kateřina - Relichová, Jiřina. Dědičnost genů pro
pozdní kvetení a jejich interakce s geny odlišného genetického pozadí u Arabidopsis
thaliana. In Informační listy GSGM. Brno : GSGM, 2002. s. 26-26. ISBN 1210-6267.
MSM 143100008, záměr.
114.
Maláska, Jan - Bajer, Milan - Hrstková, Hana - Bajerová, Kateřina - Michálek,
Jaroslav - Fajkus, Jiří. Sledování aktivity telomerázy v průběhu léčby dětských
leukémií. In Sborník abstrakt. 1. vyd. Olomouc : Fakultní nemocnice Olomouc, 1999.
s. 152-152. Sborník abstrakt. GA301/99/0045, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
115.
Maláska, Jan - Skleničková, Marie. Telomeráza - aktivita a diagnostické
použití u leukémií a solidních tumorů. In Abstrakta 43. Studentské vědecké
konference. 1. vyd. Brno : Lékařská fakulta MU, 1999. s. 16-17. Abstrakta.
GA301/99/0045, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. VS97032, projekt VaV.
116.
Maláska, Jan - Fajkus, Jiří - Bajer, Milan - Hrstková, Hana - Bajerová, Kateřina
- Michálek, Jaroslav - Fajkusová, Lenka - Vyzula, Rostislav - Krejčí, Kateřina Skleničková, Marie. Telomerase activity and expression in the course of treatment of
acute childhood leukemias. In Miami Nature Biotechnology Short Reporřts, Volume
11m, Advances in Gene Technology: DNA, RNA and CANCER. 2000. vyd. Oxford :
Oxford University Press, 2000. od s. S29a, 1 s. Proc. of 2000 Miami Nature Biotech.
Winter Symp. ISBN 1087-0156. GA301/99/0045, projekt VaV. MSM 143100008,
117.
Marek, Jaromír - Vévodová, Jitka - Su, X.-D. - Zouhar, Jan - Brzobohatý,
Břetislav. Crystallographic study of the maize cytokinin glucoside-specific betaglucosidase Zm-p60.1. In 19-th European Crystallographic Meeting - Abstracts book.
2000. vyd. Nancy : Université Henri Poincaré, 2000. s. 246-246. MSM 143100008,
záměr. VS96096, projekt VaV. Procházková, M. - Kuglík, Petr - Štěrba, Jaroslav.
90
Detection of prognostic genetic factors in neuroblastoma using fluorescence in situ
hybridization (FISH). In 15th Biological Days - Cells. Kopp, České Budějovice : J.
Berger (Ed.), 1999. s. 111-111. ISBN 80-7232-069-6. MSM 143100008, záměr.
118.
Marek, Jaromír. Proteinová krystalografie v postgenomické éře. In Struktura
2001, Kolokvium Krystalografické společnosti. Praha : CSCA, 2001. s. 20-20.
Materials Structure, vol 8, no 1a, 2001. ISBN ISSN=1211-5894. MSM 143100008,
záměr.
119.
Marek, Jaromír. Úvod do strukturní analýzy monokrystalů. In Kolokvium
2002. Praha : CSCA, 2002. s. 7-7. ISBN ISSN: 1211-5894. MSM 143100008, záměr.
120.
Marek, Jaromír - Zouhar, Jan - Vévodová, Jitka - Damborsky, Jiří - Su, X.-D. Brzobohatý, Břetislav. Insights into the functional architecture of the catalytic center
of a maize beta-glucosidase Zm-p60.1. In IUCr. XIX Congress - Abstracts, Volume I.
Geneva : IUCr., 2002. od s. C106, 1 s. ISBN ISSN: 0108-7673. MSM 143100008,
záměr.
121.
Martiníková, Hana - Mejzlíková, Marie - Žákovská, Alena - Šerý, Omar.
Průkaz pozitivity Ixodes ricinus na Borrelia burgdorferi metodou PCR. In XI.
Tomáškovy dny 2002. Brno : Ondřej Zahradníček, 2002. s. 9-9. MSM 143100008,
záměr.
122.
Mejzlíková, Marie - Martiníková, Hana - Žákovská, Alena. Srovnání čtyřletého
studia 1997-2000 aktivity a pozitivity na Borrelia burgdorferi v Ixodes ricinus s rokem
2001. In VI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno :
Masarykova univerzita, 2002. s. 54-55. MSM 143100008, záměr.
123.
Mejzlíková, Marie - Žákovská, Alena - Halouzka, Jiří - Dendis, Miloš. Průkaz
pozitivity Ixodes ricinus na Borrelia burgdorferi metodou kultivace, DFM, PCR. In
Zoologické dny. Brno : Ústav biologice obratlovců AVĆR, Brno, 2003. s. 212-455.
MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
124.
Michalová, Eva - Růžičková, Vladislava - Hradecká, Helena. Detekce a
lokalizace genetických determinant faktorů virulence u Staphylococcus aureus pomocí
molekulárních sond. In VII Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. 7.
vyd. Brno : Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity v Brně, 2003. s. 53-53.
ISBN 80-210-3053-4. MSM 143100008, záměr.
125.
Navrátilová, Jarmila - Ševčíková, Sabina - Šmarda, Jan. Roscovitine-stabilized
p53 suppresses growth and induces differentiation of v-myb-transformed monoblasts.
In Cells IV. České Budějovice : Kopp Publishing, 2002. s. 95-95. Cells IV. ISBN 807232-181-1. MSM 143100008, záměr.
126.
Navrátilová, Jarmila - Ševčíková, Sabina - Vojtěšek, Bořivoj - Šmarda, Jan.
Studium nádorově supresivních účinků proteinu p53 na leukemické monoblasty BM2.
In VI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno : Masarykova
univerzita v Brně, 2002. s. 27-27. Sborník příspěvků. ISBN 80-210-2777-0. MSM
143100008, záměr.
127.
Navrátilová, Jarmila - Vojtěšek, Bořivoj - Šmarda, Jan. Tumor suppressive
effects of the p53 protein in v-myb-transformed monoblasts BM2. In Memory in
Living Systems. Vyškov : Czechoslovak Biological Society, 2003. s. 65-65. ISBN 80210-3264-2. MSM 143100008, záměr.
128.
Nemajerová, Alice - Šmarda, Jan - Šmardová, Jana. CBP increases sensitivity
of v-myb-transformed monoblasts to phorbol ester. In Biochemistry and molecular
biology on the threshold of a new century. Brno : Vydavatelství MU, 2000. s. 41-41.
ISBN 80-210-2266-3. MSM 143100008, záměr.
129.
Nemajerová, Alice - Šmarda, Jan - Šmardová, Jana. CBP is involved in
regulation of differentiation of v-myb-transformed monoblasts. In Cells II. první.
91
České Budějovice : Kopp, 2000. s. 111-111. Cells II. ISBN 80-7232-120-X. MSM
143100008, záměr.
130.
Nemajerová, Alice - Šmarda, Jan - Zatloukalová, Jiřina - Šmardová, Jana.
Differential effects of transcription coactivators CBP and p300 on v-myb-transfromed
monoblasts. In Memory in Living Systems. Brno : Czechoslovak Biological Society,
2003. s. 66-66. ISBN 80-210-3264-2. MSM 143100008, záměr.
131.
Netušil, Jakub - Žákovská, Alena. Přítomnost spirochety Borrelia burgdorferi
sensu lato u roztočů parazitujících u drobných hlodavců. In XII. Tomáškovy dny. Brno
: Mikrobiologický ústav LF MU a FN u svaté Anny, 2003. s. 3-32. MSM 143100008,
132.
Oráčová, Eva - Kvardová, Veronika - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří. Detekce
profágů v kmenech Staphylococcus aurerus pomocí druhově specifických sond. In
22nd Congress of the Czechoslovak Society for Microbiology - Health and
Microorganisms. Košice - Praha : Czechoslovak Society for Microbiology, 2001.
s. 262-262. MSM 143100008, záměr.
133.
Oráčová, Eva - Kvardová, Veronika - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří. Detekce
profágů v kmenech Staphylococcus aureus pomocí multiplex PCR. Informační listy
Genetické společnosti Gregora Mendela, Brno : Genetická společnost Gregora
Mendela, 24, 1s. 37-37. ISSN 1210-6267. 2002. Genetická konference - Perspektivy
genetiky, genomy a genová exprese, Brno 5.-6. 2. 2002. GA301/02/1505, projekt
134.
Pantůček, Roman - Rosypalová, Alena - Doškař, Jiří - Kailerová, Jana Růžičková, Vladislava - Borecká, Pavla - Snopková, Šárka - Horváth, Radek - Götz,
Friedrich - Rosypal, Stanislav. Polyvalentní stafylokokový fág 812, jeho mutanty v
rozmezí hostitele a příbuzné polyvalentní fágy. Klinická biochemie a metabolismus,
Praha : Česká lékařská společnost J.E. Purkyně, 7, 1s. 66-67. ISSN 1210-7921. 1999.
MSM 143100008, záměr.
135.
Pantůček, Roman - Hájek, Václav - Sedláček, Ivo - Petráš, Petr - Švec, Pavel Růžičková, Vladislava - Rosypal, Stanislav - Kailerová, Jana - Faitová, Jitka Zahradníčková, Eva - Rybář, Roman - Doškař, Jiří. Characterization of oxacillinresistant coagulase-negative staphylococcal strains isolated in the Czech Republic. In
9th International Symposium on Staphylococci and Staphylococcal Infections.
Kolding : JDS, 2000. s. 104-104. GA301/99/D075, projekt VaV. MSM
136.
Pantůček, Roman - Petráš, Petr - Růžičková, Vladislava - Rybář, Roman Doškař, Jiří. Variabilita genomu kmenů multirezistentního poddruhu Staphylococcus
hominis subsp. novobiosepticus v České republice. In 22nd Congress of the
Czechoslovak Society for Microbiology - Health and Microorganisms. Košice - Praha
: Czechoslovak Society for Microbiology, 2001. s. 266-266. Abstract Book.
GA301/99/D075, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
137.
Pantůček, Roman - Rybář, Roman - Petráš, Petr - Sedláček, Ivo - Růžičková,
Vladislava - Doškař, Jiří. Charakterizace variability genomu kmenů nového
multirezistentního poddruhu Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus v České
republice. In V. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno :
143100008, záměr.
138.
Pantůček, Roman - Oráčová, Eva - Kvardová, Veronika - Růžičková,
Vladislava - Petráš, Petr - Doškař, Jiří. Multiplex PCR for detection of Staphylococcus
aureus prophages. In 10th International Symposium on Staphylococci and
Staphylococcal Infections. Tsukuba, Japan : Juntendo University, 2002. s. 66-66.
92
139.
Pantůček, Roman - Doškař, Jiří - Růžičková, Vladislava. Comparative phage
genomics of family Siphoviridae in Staphylococcus aureus. In 11th International
Carolina, 2004. s. 203-203. GA203/03/0515, projekt VaV. GA301/02/1505, projekt
140.
Pavlová, Martina - Mendel, Jan - Chroust, Karel. Sledování genotoxické
aktivity volatilních halogenovaných alifatických uhlovodíků. In V. Pracovní setkání
biochemiků a molekulárních biologů. Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2001.
s. 55-55. Sborník příspěvků. ISBN 80-210-2538-7. MSM 143100008, záměr.
141.
Pejchalová, Kateřina - Šikutová, Silvie - Halouzka, Jiří - Žákovská, Alena.
Sledování výskytu spirochet v hematofágních členovcích čeledí Culicidae, Simuliidae,
Tabanidae a Ixodidae použitím metod DFM a PCR a jejich následná identifikace. In
Sborník abstrakt. Brno : Společnost infekčního lékařství ČLS JEP, 2001. s. 68-68. VI.
česko-slovenský kongres o infekčních chorobách. MSM 143100008, záměr. MSM
143100010, záměr.
142.
Pejchalová, Kateřina - Vostal, Karel - Netušil, Jakub - Žákovská, Alena Schánilec, Libor. Zjišťování přítomnosti protilátek proti Borrelia burgdorferi sensu
lato u služebních psů a hlodavců a detekce této bakterie u parazitujících roztočů. In
XIII. konference mladých mikrobiologů, Tomáškovy dny 2004. Brno, Česká republika
: Ondřej Zahradníček, 2002. s. 40-40. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010,
záměr.
143.
Pejchalová, Kateřina - Vostal, Karel - Netušil, Jakub. Sledování reakce u psů a
hlodavců na přítomnost Borrelia burgdorferi s.l. a detekce této bakterie u
parazitujících roztočů. In VIII. Česko-slovenský kongres o infekčních nemocech sborník abstraktů. Hradec Králové : Společnost infekčního lékařství ČLS JEP, 2003.
144.
Pejchalová, Kateřina - Žákovská, Alena - Schánilec, Petr. Serological study of
dogs for the presence of anti-Borrelia burgdorferi s.l. antibodies. In VII. Pracovní
setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno : PřF MU, Brno, CR, 2003. s. 2929. MSM 143100008, záměr.
145.
Pejchalová, Kateřina - Žákovská, Alena - Schánilec, Pavel. Vyšetření sér
policejních psů na přítomnost antiborreliových protilátek metodou ELISA. In
Tomáškovy dny 2003. 2003. vyd. Brno : Mikrobiologický ústav LF MU a FN u svaté
Anny, 2003. s. 26-26. MSM 143100008, záměr.
146.
Pejchalová, Kateřina - Janouškovcová, Eva - Nejedlá, Petra - Žákovská, Alena
- Halouzka, Jiří - Dendis, Miloš. Identification of Borrelia burgdorferi from Ixodes
ricinus ticks from Southern Moravia, Czech Republic. Clinical Microbiology and
Infection, Oxford, UK : Eur. Soc. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 10, 3s. 660-660. 2004.
147.
Pejchalová, Kateřina - Žákovská, Alena - Fučík, Karel - Schánilec, Pavel.
Frekvence výskytu antiborreliových protilátek u populace služebních psů. In Československá studentská vědecká konference. Brno, Česká republika : Přírodovědecká
fakulta MU v Brně-biologická sekce, 2004. s. 59-59. ISBN 80-210-3376-2. MSM
143100008, záměr. MŠMT 1661700002.
148.
Pejchalová, Kateřina - Žákovská, Alena - Fučík, Karel - Schánilec, Pavel.
Serological confirmation of Borrelia burgdorferi infection in dogs from the Czech
Republic. In European Multicolloquium of Parasitology. Valencia, Spain : European
Federation of Parasitologists, 2004. od s. 414-412, 2 s. MSM 143100008, záměr.
MSM 143100010, záměr. MŠMT 1661700002.
93
149.
Pekarová, Mária - Růžičková, Vladislava. Horizontální přenos genu eta u
Staphylococcus aureus. In Sborník příspěvků VIII. Pracovní setkání biochemiků a
molekulárních biologů. Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2004. od s. 61-62, 2 s.
ISBN 80-210-3321-5. MSM 143100008, záměr.
150.
Pekarová, Mária - Růžičková, Vladislava - Petráš, Petr. Lyzogénna konverzia
exfoliativného toxínu A u Staphylococcus aureus. In Sborník příspěvků - Tomáškovy
dny 2004. Brno : Mikrobiologický ústav LF MU a FN, 2004. od s. 16-16, 1 s.
ISBN 00-000-0000-0. MSM 143100008, záměr.
151.
Petráš, Petr - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří. Genomic and phenotypic
variability of multiresistant strains Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus. In
10th International Symposium on Staphylococci and Staphylococcal Infections.
Tsukuba, Japan : Juntendo University, 2002. s. 65-65. GA301/02/1505, projekt VaV.
MSM 143100008, záměr.
152.
Pilousová, Lenka - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří. Příprava univerzální sondy
pro detekci profágů v kmenech Staphylococcus aureus. In VII. Pracovní setkání
biochemiků a molekulárních biologů. Brno : Masarykova univerzita, 2003. s. 65-66.
ISBN 80-210-3053-4. MSM 143100008, záměr.
153.
Preisler, Jan - Zdráhal, Zbyněk - Klepárník, Karel - Foret, František - Vrábel,
Patrik - Malá, Zdena - Doškař, Jiří - Pantůček, Roman - Růžičková, Vladislava Konečná, Hana - Krásenský, Pavel. Proteomic Analysis of Therapeutically Important
Bacteriophage 812 by Combination of Electrophoresis and Mass Spectrometry. In 51st
Annual Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics - Abstract book.
Montreal : American Society for Mass Spectrometry, 2003. s. 1152-1152.
154.
Rašková, Gabriela - Žákovská, Alena. Comparation of immune response of
different species of rodents after the antigenic stimulation of B.b. s.l. Physiol. Res.,
Praha : Institute of Physiology, Academy of Sci., 52, 3, od s. 38, XXX s. ISSN 00699463. 2003. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
155.
Relichová, Jiřina. Úvod do genetiky. In Veselská, Renata - Kuře, Josef. Lidský
genom; vědění, možnosti, souvislosti. Brno : Masarykova univerzita, 2000. s. 6-18.
Institut pro bioetiku. ISBN 80-210-2447-X. MSM 143100008, záměr.
156.
Rosypal, Stanislav - Štěpán, Jiří - Pantůček, Roman - Růžičková, Vladislava Hájek, Václav - Doškař, Jiří. Identification of Staphylococcus aureus based on PCR
amplification of species specific genomic 826 bp sequence derived from 44 kb SmaIrestriction fragment. In 9th International Symposium on Staphylococci and
Staphylococcal Infections. Kolding : JDS, 2000. s. 105-105. GA301/99/D075, projekt
157.
Rusňáková, Helena - Benešová, Jana - Žákovská, Alena. Tvorba specifických
protilátek třídy IgM a IgG proti Borrelia afzelii u laboratorně očkovaných myší. In
ZOOLOGICKË DNY Brno 2003, Sborník abstraktů z konference 13. - 14. února.
Brno : Üstav biologie obratlovců AV ČR, 2003. s. 212-212. ISBN 80-239-0073-0.
MSM 143100008, záměr.
158.
Růžičková, Vladislava - Pantůček, Roman - Petráš, Petr - Doškař, Jiří Rosypal, Stanislav. Genomic and phenotypic properties of exfoliatin-producing strains
of Staphylococcus aureus implicated in two outbreaks of staphylococcal scalded skin
syndrome in the Czech Republic. In 9th International Symposium on Staphylococci
and Staphylococcal Infections. Kolding : JDS, 2000. s. 74-74. GA301/99/D075,
159.
Růžičková, Vladislava - Hradilová, Jana - Pantůček, Roman - Petráš, Petr Doškař, Jiří. Makrorestrikční analýza genomu a výskyt profágů u exfoliatin-
94
pozitivních kmenů Stahylococcus aureus. In V. Pracovní setkání biochemiků a
molekulárních biologů. Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2001. s. 41-41. Sborník
příspěvků. ISBN 80-210-2538-7. MSM 143100008, záměr.
160.
Růžičková, Vladislava - Hradilová, Jana - Pantůček, Roman - Petráš, Petr Sedláček, Ivo - Doškař, Jiří - Rosypal, Stanislav. Genomová typizace exfoliatinpozitivních kmenů Staphylococcus aureus. In 22nd Congress of the Czechoslovak
Society for Microbiology - Health and Microorganisms. Košice - Praha :
Czechoslovak Society for Microbiology, 2001. s. 284-284. MSM 143100008, záměr.
161.
Růžičková, Vladislava - Hrstka, Roman - Hradilová, Jana - Michalová, Eva Mbaye, Abdou Madjib - Petráš, Petr. Molekulární identifikace genů kódujících tři typy
toxinů u Staphylococcus aureus. Genetická konference - Perspektivy genetiky,
genomy a genová exprese, Brno 5.-6. 2. 2002. Informační listy Genetické společnosti
Gregora Mendela, Brno : Genetická společnost Gregora Mendela, 24, 1s. 38-38.
ISSN 1210-6267. 2002. MSM 143100008, záměr.
162.
Růžičková, Vladislava - Pekarová, Mária - Petráš, Petr - Pantůček, Roman Doškař, Jiří. Characterization of resident bacteriophages and their role in conversion
of exfoliative toxin A production in Staphylococcus aureus. In 11th International
Carolina, 2004. s. 204-204. GA301/02/1505, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
163.
Řepková, Jana - Relichová, Jiřina - Chytilová, Eva. Stability of the T-DNA
insertional embryonic lethal mutants in Arabidopsis. Biologia, Bratislava : Slovak
Academy of Sciences, 54, Suppl. 7s. 52-53. ISSN 0006-3088. 1999. MSM
143100008, záměr.
164.
Řepková, Jana - Relichová, Jiřina - Chytilová, Eva. Stability of the T-DNA
insertional embryonic lethal mutants in Arabidopsis. In From Cells to Crops. Nitra,
Slovenská republika : Inst. Plant Genetics and Biotechnology, 1999. s. 131-131. Abstr.
3rd Symp. Ser. Rec. Adv. Plant Biotechnol. MSM 143100008, záměr.
165.
Řepková, Jana - Lízal, Pavel - Ryšávka, Petr - Kyjovská, Zdeňka - Doleželová,
Heda. Gene localization by means of T-DNA tagging in Arabidopsis thaliana. In 4th
International Symposium in the Series Recent Advances in Plant Biotechnology. Book
of Abstracts. Třeboň, Czech Republic : Institut of Plant Molecular Biology, Academy
of Science of the Czech Republic, České Bdějovice, 2001. s. 97-97. MSM 143100008,
záměr.
166.
Řepková, Jana - Lízal, Pavel - Kyjovská, Zdeňka - Ryšávka, Petr - Hlaváčová,
Sylvie. Výsledky a zhodnocení aplikace DNA markerů při genetickém mapování u
Arabidopsis thaliana. In Využití molekulárních markerů v biologii, šlechtění a
uchování genových zdrojů rostlin. Šumperk : Agritec,výzkum, šlechtění a služby,
s.r.o. Šumperk, 2002. od s. 147;154, 8 s. MSM 143100008, záměr.
167.
Říha, Karel - Vyskot, Boris - Fajkus, Jiří - Shippen, Dorothy. Telomerase
activity, telomere length and telomere structure in the dicot plant silene latifolia. In
Abstracts of telomeres and telomerase meeting. 1. vyd. Cold Spring Harbor : CSH
Laboratory, 1999. s. 132-132. MSM 143100008, záměr. VS97032, projekt VaV.
168.
Schrumpfová, Petra - Kuchař, Milan - Miková, Gabriela - Skříšovská, Lenka Kubičárová, Tatiana - Krejčí, Lumír - Fajkus, Jiří. Characterisation of two myb-like
proteins showing affinity to telomeric DNA sequence from Arabidopsis thaliana. In
Functional Genomics and Disease. Praha : ESF Programme, 2003. s. 85-85. MSM
143100008, záměr.
169.
Schrumpfová, Petra - Kuchař, Milan - Rotková, Gabriela - Skříšovská, Lenka Kubičárová, Tatiana - Krejčí, Lumír - Kunická, Zuzana - Fajkus, Jiří. Charakterizace
95
dvou myb-like proteinů z Arabidopsis thaliana, které vykazují afinitu k telomerickým
sekvencím. In VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno :
Masarykova univerzita v Brně, 2003. s. 33-33. ISBN 80-210-3053-4. GA204/02/0027,
170.
Skalická, Kamila - Chroust, Karel. Sledování stability transgenu u Drosophila
melanogaster pomocí teplotní gredientové gelové elektroforézy a sekvencování. In V.
Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno : Masarykova univerzita
v Brně, 2001. s. 55-56. Sborník příspěvků. ISBN 80-210-2538-7. MSM 143100008,
záměr.
171.
Skleničková, Marie - Krejčí, Kateřina - Maláska, Jan - Fajkus, Jiří. In Situ
Analysis of Telomeres in Haematological Malignancies. In European Journal of
Human Genetics. Vienna : nature publishing group, 2001. s. 135-136.
GA301/99/0045, projekt VaV. IBS5004010, projekt VaV. KSK5011112, projekt VaV.
MSM 143100008, záměr.
172.
Skleničková, Marie - Dvořáčková, Martina - Fajkus, Jiří. Využití in situ
technik v analýze telomer nádorových buněk. In Analytická cytometrie II. Brno :
Alois Kozubík, 2003. s. 108-109. ISBN 80-239-0520-1. MSM 143100008, záměr.
173.
Slaný, Michal - Zouhar, Jan - Brzobohatý, Břetislav. Identification of a
Cysteine Residue Conferring Sensitivity of a Maize â-Glukosidase to Silver Ion and
Alkylation Treatment. In V. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů,
Sborník příspěvků, Brno 2001. Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2001. s. 29-29.
174.
Slaný, Michal - Zouhar, Jan - Brzobohatý, Břetislav. THIOREDOXIN
FUSION FACILITATES CORRECT FOLDING IN MUTANTS OF A MAIZE
BETA-GLUCOSIDASE ZM-P60.1 WHEN EXPRESSED IN E. COLI. In VI.
Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, Sborník příspěvků. Brno :
Masarykova univerzita v Brně, 2002. s. 74-75. ISBN 80-210-2777-0.
GV206/96/K188, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
175.
Sýkorová, Eva - Horáková, Mirka - Mikako, I. - Fukui, K. - Fajkus, Jiří. DNA
and Chromatin Structure of Telomere-Subtelomere Junctions in Silene latifolia.
J.Biomol. Struct. Dyn., USA : Adenine press, 17, 6s. 1155-1155. ISSN 0739-1102.
2000. MSM 143100008, záměr. VS97032, projekt VaV.
176.
Sýkorová, Eva - Cartagena, Joyce - Horáková, Mirka - Fukui, Kiichi - Fajkus,
Jiří. Characterization of telomere-subtelomere junctions in Silene latifolia. In Mol Gen
Genomics. New York : Springer-Verlag, 2003. s. 13-20. ISBN 1617-4615.
177.
Sýkorová, Eva - Lim, Kar Yoong - Kunická, Zuzana - Chase, Mark W. Bennett, Michael D. - Fajkus, Jiří - Leitch, Andrew R. Surprise at chromosome termini
of Asparagales plants. In Biophysics of the Genome. Brno : Masaryk University i n
Brno, 2003. s. 71-73. ISBN 80-210-3226-X. GA204/02/0027, projekt VaV. MSM
143100008, záměr.
178.
Šerý, Omar. Alergické konjunktivitidy jsou spojeny se zvýšenou hladinou IgE
v slzách. In Kniha abstrakt 10. výročního sjezdu České oftalmologické společnosti.
První vydání. Praha : Galén, 2002. s. 104-104. ISBN 80-7262-177-7. MSM
143100008, záměr.
179.
Šerý, Omar - Hladilová, Renáta - Hlinomazová, Zuzana. DNA diagnostika
chlamydiových infekcí. In Mezinárodní konference Chlamydiové infekce. 1. vyd.
Praha : VMEST, a.s., 2003. s. 7-7. MSM 143100008, záměr.
180.
Ševčíková, Sabina - Souček, Karel - Bryja, Vítězslav - Šmarda, Jan. Vliv
proteinů Jun na růst a diferenciaci monoblastů transformovaných onkogenem v-myb.
96
In XVI. Biologické dny. Olomouc : Československá biologická společnost, 2001.
s. 75-75. ISBN 80-244-0327-7. GA301/01/0040, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr.
181.
Ševčíková, Sabina - Zahradníčková, Eva - Souček, Karel - Šmarda, Jan. v-Jun
and v-Fos proteins induce dedifferentiation of v-myb-transformed monoblasts. In The
Seventeenth Annual Meeting on Oncogene. Frederick, Maryland, USA : Foundation
for Advanced Cancer Studies, Inc., 2001. s. 171-171. GA301/01/0040, projekt VaV.
MSM 143100008, záměr.
182.
proteinů Jun na růst a diferenciaci monoblastů transformovaných onkogenem v-myb.
In VI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno : Masarykova
univerzita v Brně, 2002. s. 56-56. VI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních
bi. ISBN 80-210-2777-0. GA301/01/0040, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
183.
proteinů Jun na monoblasty transformované onkogenem v-myb. Chemické listy, Praha
: Česká společnost chemická, 96, 4s. 234-234. ISSN 0009-2770. 2002.
184.
Ševčíková, Sabina - Šmarda, Jan - Beneš, Petr. Mechanismus suprese
onkoproteinu v-myb proteinem jun v buňkách BM2: aktivace receptoru pro kyselinu
retinovou. In Sborník příspěvků, VII. pracovní setkání biochemiků a molekulárních
biologů. Brno, Czech Republic : Masaryk University, 2003. od s. 67-67, 1 s. ISBN 80210-3053-4. GA301/01/0040, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
185.
Šikutová, Silvie - Pejchalová, Kateřina - Halouzka, Jiří - Žákovská, Alena.
Monitorování přítomnosti spirochét v hematofágních členovcích se zaměřením na
Borrelia burgdorferi použitím metod DFM a PCR. In X. Tomáškovy dny 2001. Brno :
Mikrobiologický ústav LF MU, 2001. s. 16-16. X. Tomáškovy dny 2001. MSM
143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
186.
Šikutová, Silvie - Pejchalová, Kateřina - Janouškovcová, Eva - Čapková, Lucie
- Dendis, Miloš - Žákovská, Alena. The study of presence and identification of
spirochetes focused on Borrelia burgdorferi sensu lato with PCR and SDS-PAGGE
methods in haematophagous and non haematophagous arthropods, wild-living rodents.
In Sborník příspěvků, 5th Workshop of Biochemists and Molecular Biologists. Brno :
Masarykova univerzita v Brně, 2001. s. 28-28. FRVŠ 541/03, projekt VaV. MSM
143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
187.
Šikutová, Silvie - Pejchalová, Kateřina - Halouzka, Jiří - Žákovská, Alena.
Monitoring of presence of spirochetes in haematophagous arthropods focused on
Borrelia burgdorferi using DFM and PCR methods. Scripta Medica, Brno, CR, 75,
1s. 40-40. ISSN 1211-3395. 2002. MSM 143100008, záměr.
188.
Šmarda, Jan - Ševčíková, Sabina - Souček, Karel - Zahradníčková, Eva. The
effects of Jun proteins on growth and differentiation of v-myb-transformed
monoblasts. Differentiation, Berlin, Germany : Blackwell Verlag, 70, 7s. 347-347.
ISSN 0301-4681. 2002. GA301/01/0040, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
189.
Šmarda, Jan - Zahradníčková, Eva - Konečná, Hana - Zdráhal, Zbyněk Šmardová, Jana. Zrání monoblastů BM2 je doprovázeno zvýšenou expresí vimentinu.
In VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno : Masarykova
univerzita v Brně, 2003. s. 68-68. ISBN 80-210-3053-4. GA301/03/1055, projekt
190.
Šmarda, Jan - Zahradníčková, Eva - Souček, Karel - Horváth, Viktor.
Camptothecin induces autophagy of v-myb-transformed monoblasts. Differentiation,
97
Malden, MA 02148, USA : Blackwell Publishing, 72, 6s. 279-279. ISSN 0301-4681.
2004. GA301/03/1055, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
191.
Štěpán, Jiří - Pantůček, Roman - Růžičková, Vladislava - Rosypal, Stanislav Doškař, Jiří. Příprava DNA hybridizační sondy pro identifikaci kmenů druhu
Staphylococcus aureus. In III. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů.
Molekulární biologie a biochemie v humánní a veterinární medicíně. Brno :
Masarykova univerzita, 1999. s. 29-29. ISBN 80-210-2266-3. GA301/97/1192, projekt
192.
Štěpán, Jiří - Pantůček, Roman - Růžičková, Vladislava - Rosypal, Stanislav Doškař, Jiří. Příprava molekulární sondy pro identifikaci kmenů druhu Staphylococcus
aureus. In VIII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny '99. Brno :
Mikrobiologický ústav Lékařské fakulty Masarykovy univerzity a Fakultní nemocnice
u sv. Anny v Brně, 1999. s. 15-15. GA301/97/1192, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr.
193.
Štika, Jiří - Hofmanová, Jiřina - Šimek, Vladimír. Lipoxygenase metabolites
are negative regulators of differentiation induced by tumor necrosis factor-alpha. In
2nd International Scientific Conference. Lvov : Univesity of Lviv, ukraine, 2001.
s. 68-68. MSM 143100008, záměr.
194.
Trnková, Libuše - Friml, Jiří - Dračka, Oldřich. Elimination Voltammetry Modern Electroanalytical Method for Resolution of Overlapped Voltammetric Signals.
In Modern Electroanalytical Methods. I. Pardubice : Univerzita Pardubice, 1999.
s. 40-40. ISBN 80-7194-212-X. GA511/95/1279, projekt VaV. GV204/97/K084,
projekt VaV. MSM 143100008, záměr. MSM 143100011, záměr.
195.
Vaculová, Alena - Hofmanová, Jiřina - Kovaříková, Martina - Žďánský, P. Šimek, Vladimír - Kozubík, Alois. The Effects of N-3 and N-6 Polyunsaturated Fatty
Acids on Cytokinetic Parameters of Human Adenocarcinoma HT-29 Cell Line. České
Budějovice : Nakladateství Koop, 1999. 1 s. 15th Biological Days. ISBN 80-7232069-6. MSM 143100008, záměr.
196.
Vaňhara, Petr - Bryja, Vítězslav - Ševčíková, Sabina - Šmarda, Jan. Odlišný
účinek proteinů c-Jun a v-Jun na expresi cyklinu A v monoblastech BM2. In Československá studentská vědecká konference. Brno : Masarykova univerzita v Brně, 2004.
s. 89-89. ISBN 80-210-3376-2. MSM 143100008, záměr.
197.
Vaňhara, Petr - Bryja, Vítězslav - Ševčíková, Sabina - Šmarda, Jan. Protein cJun indukuje expresi cyklinu A v monoblastech BM2. In VIII. Pracovní setkání
biochemiků a molekulárních biologů. Sborník abstraktů. 1. vyd. Brno : Masarykova
univerzita v Brně, 2004. s. 19-19. ISBN 80-210-3321-5. MSM 143100008, záměr.
198.
Váňová, Pavlína - Böhmová, Gabriela - Konečná, Hana - Zdráhal, Zbyněk Brzobohatý, Břetislav. Two-dimensional Electrophoresis in Analysis of Arabidopsis
thaliana Proteome: A Beginning of a Long Story. In VII. Pracovní setkání biochemiků
a molekulárních biologů. Přírodovědecká fakulta MU : Masarykova univerzita v Brně,
2003. od s. 37-38, 2 s. ISBN 80-210-3053-4. MSM 143100008, záměr.
199.
Váňová, Pavlína - Chevalier, François - Böhmová, Gabriela - Konečná, Hana Zdráhal, Zbyněk - Rossignol, Michel - Brzobohatý, Břetislav. Effect of endogenous
cytokinin levels on the Arabidopsis thaliana proteome. In Chemica 43S Supplement
(Collected Reports of the Natural Science Faculty Palacký University Olomouc Czech
Republic). Olomouc : Palacký University, 2004. s. 24-24. ISBN 80-244-0882-1. MSM
143100008, záměr.
200.
Váňová, Pavlína - Chevalier, Francois - Böhmová, Gabriela - Konečná, Hana Zdráhal, Zbyněk - Rossignol, Michel - Brzobohatý, Břetislav. Struktura proteinových
profilů rostlin Arabidopsis thaliana s rozdílnými hladinami endogenních cytokininů. In
98
Česko-slovenská studentská vědecká konference 1.5.2004. Sborník abstraktů. Brno,
Česká republika : Masarykova univerzita v Brně, 2004. s. 90-90. ISBN 80-210-33762. MSM 143100008, záměr.
201.
Vojtíšková, Marie - Kadlecová, J. - Novotný, T. - Gaillyová, Renata Konečná, Hana - Klánová, Jana - Semrád, B. Molekulární diagnostika pacientů se
syndromem prodlouženého QT intervalu. In Biochemie a molekulární biologie na
prahu nového tisíciletí. 2000. vyd. Brno : Masarykova univerzita, 2000. s. 83-84. IV.
Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů (přednáška). ISBN 80-2102266-3. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV.
202.
Voller, Jiří - Růžičková, Vladislava. Multiplex PCR pro identifikaci
Staphylococcus aureus produkující exfoliatiny. In Sborník příspěvků VIII. Pracovní
setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno : Masarykova univerzita v Brně,
2004. od s. 76-77, 2 s. ISBN 80-210-3321-5. MSM 143100008, záměr.
203.
Vostal, Karel - Žákovská, Alena. The study of antiborrelian antibodies in 110
sera from students on various antigens of Borrelia burgdorferi s.l. In International
conference on Lyme borreliosis. Brussel : Rily group, Ottignies, Belgium, 2001. s. 44. MSM 143100008, záměr.
204.
Vostal, Karel - Žákovská, Alena. Detekce přítomnosti antiborreliových
protilátek u hlodavců. In Zoologické dny Brno 2002 - Abstrakta referátů z konference
14.-15. února 2002. Brno : Ústav biologie obratlovců AV ČR, 2002. s. 172-173.
ISBN 80-238-8270-8. MSM 143100008, záměr.
205.
Vostal, Karel - Žákovská, Alena. Detekce přítomnosti protilátek proti Borrelia
burgdorferi v krvi divoce žijících hlodavců. In XI. konference mladých mikrobiologů,
Tomáškovy dny 2002. Brno, Česká republika : Ondřej Zahradníček, 2002. s. 10-10.
MSM 143100008, záměr.
206.
Vostal, Karel - Žákovská, Alena. Examination of blood from wild-living
rodents for the presence of antioborrelian antibodies. In VII. Pracovní setkání
biochemiků a molekulárních biologů. Brno : PřF MU, Brno, CR, 2003. s. 31-31. MSM
143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
207.
Vostal, Karel - Žákovská, Alena - Nečasová, Marcela. A Five-year Study of the
Presence of Borrelia and Antibodies to Borrelia in Small Rodents. In Current research
in Zoonotic Ecology and Epidemiology. Kalmar : Society for Zoonotic Ecology and
Epidemiology, 2003. s. 9-37. MSM 143100008, záměr.
208.
Vostal, Karel - Netušil, Jakub - Žákovská, Alena. Detection of antiborrelian
antibodies in blood of small rodents and the occurence of borreliae in mites parasiting
on them. In IX European multicolloquium of parasitology. Valencia, Spain : European
federation of parasitologists, 2004. s. 414-414. ISBN 84-609-1732-0. MSM
143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
209.
Vostal, Karel - Netušil, Jakub - Žákovská, Alena. Přítomnost protilátek proti
Borrelia burgdorferi sensu lato u hlodavců a výskyt této spirochety v na nich
parazitujících roztočích. In Česko-slovenská studentská vědecká konference - sborník
abstraktů. Brno, Česká republika : Přírodovědecká fakulta MU Brně - Biologická
sekce, 2004. s. 92-92. ISBN 80-210-3376-2. MSM 143100008, záměr. MSM
143100010, záměr.
210.
Vostal, Karel - Netušil, Jakub - Žákovská, Alena - Daniel, Milan Janouškovcová, Eva. The presence of antibodies against Borrelia burgdorferi sensu
lato in rodents and occurence of this spirochaete in the mites parasitizing on them.
Clinical Microbiology and Infection, Oxford, UK : Eur. Soc. Clin. Microbiol. Infect.
Dis., 10, 3s. 660-660. 2004. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
99
211.
Zahradníčková, Eva - Ševčíková, Sabina - Souček, Karel - Šmarda, Jan. The
effects of Fos proteins on myeloid differentiation. In V. Pracovní setkání biochemiků a
molekulráních biologů. Brno : Masarykova univerzita, 2001. s. 26-26. ISBN 80-2102538-7. MSM 143100008, záměr.
212.
Zahradníčková, Eva - Ševčíková, Sabina - Souček, Karel - Šmarda, Jan. Vliv
proteinů Fos na růst a diferenciaci monoblastů transformovaných onkogenem v-myb.
In XVI. Biologické dny. Olomouc : Československá biologická společnost, 2001.
s. 76-76. ISBN 80-244-0327-7. GA301/01/0040, projekt VaV. MSM 143100008,
záměr.
213.
Zahradníčková, Eva - Ševčíková, Sabina - Souček, Karel - Kubala, Lukáš Šmarda, Jan. Differential roles of Fos and Jun proteins in regulation of differentiation
and apoptosis of v-myb-transformed monoblasts. In Antibody-based therapeutics for
cancer. Silverthorne, USA : Keystone Symposia, 2003. s. 62-62. ISBN 970-262-1230.
214.
Zahradníčková, Eva - Souček, Karel - Šmarda, Jan. Autofagie je preferovaným
typem programované buněčné smrti u monoblastů BM2 stimulovaných
kamptotecinem. In Česko-slovenská studentská vědecká konference. Brno :
Masarykova univerzita v Brně, 2004. s. 94-94. ISBN 80-210-3376-2. GA301/03/1055,
215.
Zahradníčková, Eva - Souček, Karel - Šmarda, Jan. Programovaná buněčná
smrt v-myb transformovaných monoblastů je nezávislá na kaspázách. Chemické listy,
Praha (Czech Republic) : Česká společnost chemická, 98, 5, od s. 312-313, 2 s.
ISSN 0009-2770. 2004. MSM 143100008, záměr.
216.
Zdráhal, Zbyněk - Konečná, Hana - Eyer, Luděk - Pantůček, Roman - Doškař,
Jiří - Preisler, Jan. Analysis of the polyvalent bacteriophage 812 proteome. In Book of
abstracts. Tokaj (Maďarsko) : Mass Spectrometry Department of the Chemical
Research Centrer of the Hungarian Academy of Sciences, 2004. s. 47-47.
ISBN 9637067108. GA203/03/0515, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
217.
Zouhar, Jan. Translational fusions - advancements in expression technology. In
Biochemie a molekulární biologie na prahu nového tisíciletí. 1. vyd. Brno :
Masarykova univerzita, 2000. s. 39-39. IV. Pracovní setkání biochemiků a
molekulárních biologů (přednáška). ISBN 80-210-2266-3. MSM 143100008, záměr.
218.
Zouhar, Jan - Brzobohatý, Břetislav. His-patch Thioredoxin-fusion in
Expression of Recombinant Plant Enzyme. In Biochemie a molekulární biologie na
prahu nového tisíciletí. 1. vyd. Brno : Masarykova univerzita, 2000. s. 66-66. IV.
Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů (plakátové sdělení). ISBN 80210-2266-3. MSM 143100008, záměr. VS96096, projekt VaV. 143100008, záměr.
219.
Zouhar, Jan - Slaný, Michal - Brzobohatý, Břetislav. Folding of native and
mutant maize beta-glucosidase in E. coli is facilitated by thioredoxin fusion. European
Journal of Biochemistry, Oxford : Blackwell Science, 269, Supp. 1s. 77-77.
ISSN 0014-2956. 2002. AV0Z5004920, záměr. GA203/02/0865, projekt VaV. MSM
143100008, záměr.
220.
Žákovská, Alena - Halouzka, Jiří - Janouškovcová, Eva - Horváth, Radek.
Changes in Protein Composition of Spirochaete Isolates during the passage with the
PAGGE method. In Abstract book of VIII. Int. Conference on Lyme Borreliosis. Prvni
vydani. Munich : Munich - VIII.ICLB, 1999. s. 85-9814310085. MSM 143100008,
221.
Žákovská, Alena - Nečasová, M. - Šerý, Omar - Horváth, R. - Pechmann, V.
The Following of Dynamics of Antibodies against Borrelia in the Sera of wild - living
100
Rodents. In Abstract Book of VII. International Conference on Lyme Borreliosis and
other Emerging Tick-Borne Diseases. 1999. vyd. Munich : VII.ICLB, Munich, 1999.
222.
Žákovská, Alena - Šerý, Omar - Pejchalová, Kateřina - Bašta, Jiří - Horváth,
Radek - Janouškovcová, Eva - Halouzka, Jiří. Monitoring of presence of Borrelia
burgdorferi sensu lato in Ixodes ricinus ticks in the years 1996-1998 in park Pisarky
(Brno): dark-field microscopy and PCR method. In Abstractbook of 3rd International
Conference TICK AND TICK-BORNE PATHOGENS: INTO THE 21st CENTURY.
první. Bratislava : Institute of Zoology, Slovak Academy of Sciences, 1999. s. 67-67.
ISBN 80-88780-29-2. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
223.
Žákovská, Alena - Čapková, Lucie - Dendis, Miloš. The following of presence
of pathogenic spirochaetes Borrelia burgdorferi sensu lato with the method of PCR in
haemotophagic and non haematophagic arthropods. In Biochemistry and molecular
biology on the treshold of a new century. 1. vyd. Brno : Masarykova univerzita, 2000.
od s. 67-68, 94 s. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
224.
Žákovská, Alena - Čapková, Lucie - Pejchalová, Kateřina - Šikutová, Silvie Dendis, Miloš - Halouzka, Jiří. Studium přítomnosti spirochet zaměřené na patogenní
Borrelia burgdorferi u hematofágních a nehematofágních zastupců hmyzu. In
Zoologické dny, Brno. Brno : Bryja J., Zukal J., Zoologické dny, 2000. s. 93-199.
Bryja J., Zukal J., Zoologické dny. FRVŠ 2000/920, záměr. MSM 143100008, záměr.
225.
Žákovská, Alena - Dendis, Miloš - Janouškovcová, Eva - Tesařová, Soňa.
Identification of Lyme borreliosis causal organism and its manifestation at vectors and
hosts by immunological methods (ELISA, CFR, PAGGE). In Book of Abstracts, 4th
EFIS Tatra immunology Conference. Praha : Institute of Molecular Genetics, 2000.
226.
Žákovská, Alena - Dendis, Miloš - Šerý, Omar. Sledování přítomnosti
spirochet se zvláštním zřetelem na Borrelia burgdorferi u hematofágních dipter čeledi
Culicidae a roztočů v CHKO Poodří. In Příroda Poodří. První vydání. Brno :
Masarykova Univerzita, 2000. s. 55-56. ISBN 80-210-2298-1. MSM 143100008,
227.
Žákovská, Alena - Janouškovcová, Eva - Halouzka, Jiří. Identification of Ag
structures of Borrelia spirochaetes and changes in their protein composition during
passages with the SDS - PAGGE method. In Biochemistry and molecular biology on
the treshold of a new century. Brno : Masarykova univerzita, 2000. od s. 67-67, 1 s.
ISBN 80-210-2266-3. FRVŠ 541/03, projekt VaV. MSM 143100008, záměr. MSM
143100010, záměr.
228.
Žákovská, Alena - Nečasová, Marcela - Halouzka, Jiří - Janouškovcová, Eva.
Sledování pozitivity na výskyt spirochet se zvláštním zřetelem na Borrelia burgdorferi
v sérech, tkáních a orgánech hlodavců v CHKO Poodří. In Sborník příspěvků, Příroda
Poodří. první. Brno : Masarykova Univerzita, 2000. s. 44-99. ISBN 80-210-2298-1.
229.
Žákovská, Alena - Halouzka, Jiří - Nečasová, Marcela - Šerý, Omar. Studium
pozitivity na přítomnost patogenní Borrelia burgdorferi u divokých zvířat - jako
hostitelů nebo přenašečů Lymeské borreliózy. In 17. Pečenkovy epidemiologické dny.
XXX : XXX, 2001. s. 19-20. 17. Pečenkovy epidemiologické dny. MSM 143100008,
230.
Žákovská, Alena - Čapková, Lucie - Jörková, Monika. Pozitivní nálezy
Borrelia burgdorfei s.l. v larvách i dospělcích komárů. In Čs. sjezd o infekčních
nemocech. Jihlava : infekční odd. nemocnice Jihlava, 2002. s. 31-31. MSM
143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
101
231.
Žákovská, Alena - Vostal, Karel - Nečasová, Marcela - Janouškovcová, Eva.
Detection of the presence of anti-Borrelia antibodies and isolation of Borrelia afzelii
from tissues of wild rodents. In Program and Abstracts, 4th International Conference
on Ticks and Tick-Borne Pathogens. Banff : University of Alberta, 2002. od s. 36-37,
2 s. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
232.
Žákovská, Alena - Jörková, Monika - Halouzka, Jiří - Dendis, Miloš - Netušil,
Jakub. Spirochaetes and pathogenic Borrelia burgdorferi s. l. in mosquitoes (larvae
and adults) in the Czech Republic. In Current research in Zoonotic Ecology and
Epidemiology. Kalmar : Society for Zoonotic Ecology and Epidemiology, 2003. s. 836. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
233.
Žákovská, Alena - Martiníková, Hana. Long-term monitoring of the prevalence
of spirochaete in Ixodes ricinus in Pisárky lokality, Brno city. In IX. European
Multicoloquium of Parasitology. Valencia, Spain : European Federation of
Parasitologists, 2004. s. 411-411. ISBN 84-609-1732-0. MSM 143100008, záměr.
MSM 143100010, záměr.
234.
Žákovská, Alena - Rusňáková, Helena - Benešová, Jana. Host response to
Borrelia afzelii in BALB/c mice. In IX. European Multicoloquium of Parasitology.
Valencia, Spain : European Federation of Parasitologists, 2004. s. 411-411. ISBN 84609-1732-0. MSM 143100008, záměr.
235.
Žákovská, Alena - Rusňáková, Helena - Benešová, Jana. Imunitní odpověď
proti Borrelia afzelii u myší kmene BALB/C. In Česko-slovenská studentská vědecká
konference. Brno : Přírodovědecká fakulta MU, Brno, 2004. s. 66-66. ISBN 80-2103376-2. MSM 143100008, záměr.
102
Příloha 3
Diplomové práce
Abecední seznam všech diplomových prací řešených a ukončených v letech 1999 až 2004
1. Abdou Madjib Mbaye: Molekulární charakterizace
Staphylococcus aureus. 2000. Školitel: V. Růžičková.
toxinogenních
kmenů
2. Adámková Lenka: Detekce filadelfského (Ph) chromozomu u pacientů s chronickou
myeloidní leukémií pomocí fluorescenční hybridizace in situ. 2002. Školitel:
P. Kuglík.
3. Bedřichová Jana: Identifikace a analýza T-DNA mutantů Arabidopsis thaliana
(L.) Heynh. pomocí Southernova přenosu. 2004. Školitel: J. Řepková.
4. Biedrawová Agata: Obsah slinných žláz u hematofágních členovců. 2003. Školitel:
A. Žákovská.
5. Bryja Vítězslav: Interakce proteinu v-Jun s metabolismem kyseliny arachidonové.
6. Bubeníčková Hana: Hodnocení stability embryonálně letálních mutací získaných
inzerční mutagenezí u Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. 1999. Školitel: J. Řepková.
7. Budínská Eva: Využití statistických metod při molekulárně cytogenetických analýzách
geneticky patologických stavů. 2004. Školitel: P. Kuglík.
8. Čapková Lucie: Monitorování výskytu spirochet v hematofágních členovcích. 1999.
Školitel: A. Žákovská.
9. Doleželová Heda: Lokalizace nových inzerčních mutací Arabidopsis thaliana
(L.) Heynh. do genetické mapy. 2001. Školitel: J. Řepková.
10. Dudová Markéta: Identifikace a charakterizace genů determinujících embryogenezi
prostřednictvím T-DNA mutací Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. 2004. Školitel:
J. Řepková.
11. Dvořáková Eva: Charakterizace cytogenetických změn u multiformního glioblastomu
pomocí metod fluorescenční hybridizace in situ. 2004. Školitel: P. Kuglík.
12. Eyer Luděk: Analýza proteomu polyvalentního bakteriofága. 2004. Školitel: J. Doškař.
13. Faitová Jitka: Molekulární identifikace a typizace kmenů druhu Staphylococcus
haemolyticus. 2000. Školitel: J. Doškař.
14. Fialová Markéta: Sledování chromozomálních translokací u akutních myeloidních
leukémií technikou RT-PCR. 2001. Školitel: J. Šmarda.
103
15. Hamplová Jaroslava: Konstrukce reparačně deficientního kmene transgenní
Drosophila melanogaster nesoucího gen pro glutathion S-transferázu. 1999. Školitel:
K. Chroust.
16. Hlaváčová Sylvie: Genetické mapování genů Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. 2002.
Školitel: J. Řepková.
17. Hobza Roman: Stanovení polymorfismu genů pro tvorbu koagulázy, rezistenci
k meticilinu a rDNA mezerníků u kmenů Staphylococcus aureus. 2000. Školitel:
J. Doškař.
18. Holíková Alena: Dynamika výskytu borrelií u klíšťat v lesoparku Pisárky v letech
1999-2001, sledování pozitivity na výskyt spirochet v hematofágních členovcích.
19. Horák Jakub : Molekulárně-biologická studie dvoukomponentních systémů u vyšších
rostlin. 2002. Školitel: M. Lexa.
20. Horňák Miroslav: Využití kyseliny retinové pro indukci diferenciace monoblastů
BM2. 2004. Školitel: J. Šmarda.
21. Hradecká Helena: Detekce a charakterizace termonukleázového genu u vybraných
druhů stafylokoků. 2003. Školitel: V. Růžičková.
22. Hradilová Jana: Studium genomové variability a molekulární identifikace toxinpozitivních kmenů Staphylococcus aureus. 2001. Školitel: V. Růžičková.
23. Hykelová Vladimíra: Sledování mutací transgenní Drosophila melanogaster. 1999.
24. Chrobáková Táňa: Zavedení molekulární diagnostiky LGMD (limb-girdle muscular
dystrophy) typu 2A a 2B. 2004. Školitel: L. Fajkusová.
25. Janouškovcová Eva: Studium změn bílkovinného spektra spirochet jednotlivých
pasáží. 2001. Školitel: A. Žákovská.
26. Justinová Lenka: Zpracování výsledků tříletého pozorování promoření klíšťat
v lokalitě Pisárky. 2002. Školitel: A. Žákovská.
27. Kašpárek Petr: Charakterizace plazmidů kmenů druhu Staphylococcus aureus
rezistentních k antibiotikům. 2000. Školitel: J. Doškař.
28. Klíma Petr: Úloha cytokininů v regulaci exprese homeogenů rodiny KN1 u rostlin.
2003. Školitel: B. Brzobohatý.
29. Kocmánková Zuzana: Selekce nových inzerčních mutací Arabidopsis thaliana
(L.) Heynh. 2001. Školitel: J. Řepková.
104
30. Kohoutek Jiří: Optimalizace podmínek transfekce monoblastů transformovaných
onkogenem v-myb. 1999. Školitel: J. Šmarda.
31. Komárková Tereza: Genetické mapování mutací Arabidopsis thaliana (L.) Heynh.
32. Koppová Květa: Vztah aktivity telomerázy k buněčné proliferaci a diferenciaci. 2003.
33. Kotnová Pavla: Selekce nových inzerčních mutací Arabidopsis thaliana (L.) Heynh.
34. Krejčí Veronika: Identifikace genů Arabidopsis thaliana prostřednictvím nových
T-DNA mutací. 2003. Školitel: J. Řepková.
35. Kubát Zdeněk: Detekce mutací v transgenu Drosophila melanogaster na fenotypové
a molekulární úrovni. 2003. Školitel: K. Chroust.
36. Kudlová Manuela: Imunologické analýzy vzorků pacientů s nervovými potížemi
zaměřené na sledování onemocnění Lymeská borrelióza. 2000. Školitel: A. Žákovská.
37. Kvardová Veronika: Charakterizace genomu stafylokokového bakteriofága 187
a příprava specifické sondy pro detekci profágů serologické skupiny L v kmenech
S. aureus. 2002. Školitel: J. Doškař.
38. Kyjovská Zdena: Cytogenetická analýza embryonálně letálních mutací Arabidopsis
thaliana (L.) Heynh. 2001. Školitel: J. Řepková.
39. Loja Tomáš: Optimalizace přípravy a zpracování preparátů pro molekulárně
cytogenetické analýzy se zaměřením na spektrální karyotypování. 2004. Školitel: P.
Kuglík.
40. Lukešová Miroslava: Genetická analýza inzerčních mutací ovlivňujících morfologii
květu A. thaliana. 2000. Školitel: J. Řepková.
41. Martiníková Hana: Zpracování výsledků 5–letého pozorování promoření klíšťat
spirochetami na lokalitě Pisárky v Brně. 2003. Školitel: A. Žákovská.
42. Martinů Pavlína: Transgenní Drosophila melanogaster nesoucí lidský gen pro
glutathion S-transferázu na reparačně deficientním pozadí genů mei-9 a mei-41. 1999.
43. Mazura Pavel: Funkční architektura aktivního centra kukuřičné β-glukozidázy. 2004.
44. Mbaye Abdou Madjib: Molekulární charakterizace
Staphylococcus aureus. 2000. Školitel: V. Růžičková.
toxinogenních
kmenů
105
45. Mejzlíková-Filipenská Marie: PCR detekce patogenních spirochet v klíšťatech. 2003.
46. Mendel Jan: Testy genotoxicity přírodních extraktů sinic a halogenovaných
alifatických uhlovodíků na Drosophila melanogaster. 2001. Školitel: K. Chroust.
47. Michalová Eva: Detekce genů kódujících faktory virulence u klinicky významných
stafylokoků pomocí specifických primerů a sond. 2002. Školitel: V. Růžičková.
48. Navrátilová Jarmila: Studium nádorově supresivních účinků proteinu p53 na
leukemické monoblasty BM2. 2002. Školitel: J. Šmarda.
49. Nečasová Marcela: Sledování výskytu antiborreliových protilátek v sérech hlodavců.
50. Nejedlá Petra: Porovnání dynamiky výskytu borrelií u klíšťat v lesoparku Pisárky
v letech 1996-2001, sledování pozitivity na výskyt spirochet v hematofágních
členovcích. 2003. Školitel: A. Žákovská.
51. Nejedlík Jan: Studie citlivosti tabáku na dexamethason (jeden z možných induktorů
transgenní exprese). Testování transkripčního aktivačního systému pOp/LhG4 pro
regulovanotelnou expresi transgenů v transgenních rostlinách. 2000. Školitel:
B. Brzobohatý.
52. Netušil Jakub: Přítomnost spirochet u roztočů a jejich hostitelů. 2003. Školitel:
A. Žákovská.
53. Oráčová Eva: Identifikace profágů v genomu Staphylococcus aureus pomocí
multiplex-PCR. 2002. Školitel: R. Pantůček.
54. Papoušková Iva: Detekce polymorfizmu v bakteriálních kmenech a detekce mutací
transgenu u Drosophila melanogaster s využitím molekulárních metod. 2000.
Školitel: Karel Chroust.
55. Paseková Renata: Detekce mikrodelece 22q11 využitím techniky hybridizace in situ.
1999. Školitel: P. Kuglík.
56. Pavlová Martina: Toxicita a genotoxicity halogenovaných alifatických uhlovodíků
u Drosophila melanogaster. 2001. Školitel: K. Chroust.
57. Pavlová Šárka: Detekce mutací transgenů Drosophila melanogaster pomocí metody
SSCP. 1999. Školitel: K. Chroust.
58. Pejchalová Kateřina: Dynamika výskytu a identifikace spirochet v hematofágních
členovcích. 2001. Školitel: A. Žákovská.
106
59. Pekarová Mária: Vliv lyzogenie na genetické vlastnosti Staphylococcus aureus. 2004.
Školitel: V. Růžičková.
60. Pernisová Markéta: Regulovatelné systémy exprese transgenu u Arabidopsis thaliana.
2000. Školitel: RNDr. B. Brzobohatý.
61. Pilousová Lenka: Příprava univerzální sondy pro detekci profágů v kmenech
Staphylococcus aureus. 2003. Školitel: J. Doškař.
62. Procházková Martina: Detekce prognosticky významných genetických markerů u
neuroblastomu s využitím interfázní fluorescenční in situ hybridizace. 2000. Školitel:
P. Kuglík.
63. Prokopcová Jana: Analýza alternativních sestřihů v mRNA dystrofinového genu.
2004. Školitel: L. Fajkusová.
64. Radilová Hana: Využití molekulárně cytogenetických metod při diagnostice pacientů
s Prader-Willi/Angelmanovým syndromem. 2001. Školitel: P. Kuglík.
65. Rašková Gabriela: Využití imunologické metody Elisa k analýze vzorků sér
k identifikaci patogenních onemocnění. 2002. Školitel: A. Žákovská.
66. Raudenská Martina: Analýza mutací genů spojených se syndromem prodlouženého
QT intervalu. 2003. K. Chroust.
67. Reková Alena: Molekulární klonování a charakterizace integračního lokusu T-DNA
u transgenní rostliny tabáku vykazující buněčně autonomní pylovou sterilitu. 2002.
68. Rozsívalová Pavla: Selekce nových inzerčních mutací Arabidopsis thaliana
69. Rusňáková Helena: Analýza antigenních vlastností patogenní Borrelia burgdorferi s. l.
izolované z různých hostitelů imunologickými metodami. 2003. Školitel:
A. Žákovská.
70. Rybář Roman: Genomová variabilita a typizace kmenů Staphylococcus hominis
izolovaných z klinického materiálu v České republice. 2001. Školitel: R. Pantůček.
71. Ryšávka Petr: Identifikace a analýza transgenních rostlin Arabidopsis thaliana
72. Sedláček Jiří: Vliv inhibitorů metabolismu kyseliny arachidonové na fenotyp
leukemické linie BM2. 2002. Školitel: J. Šmarda.
73. Sedláčková Jana: Detekce mutací v genech SCN5A a KCNE2 spojených s LQT
syndromem. 2003. Školitel: K. Chroust.
107
74. Sedláčková Martina: Využití metody komparativní genomové hybridizace (CGH) při
detekci rekurentních cytogenetických změn u pacientů s nádorovým onemocněním.
2002. Školitel: P. Kuglík.
75. Schrumpfová Petra: Korelace diferenciace buněk BM2 a aktivity proteinu v-Myb.
2001. Školitel: J. Šmarda
76. Skalická Kamila: Analýza mutací v transgenu Drosophila melanogaster pomocí
teplotní gradientové gelové elektroforézy (TGGE) a sekvencování. 2001. Školitel:
K. Chroust.
77. Skleničková M.: Stanovení aktivity telomerázy v diagnostice nádorových onemocnění.
1999. Školitel: J. Fajkus
78. Skříšovská Lenka: Studium funkce evolučně konzervovaných zbytků kyseliny
glutamové a asparagové u kukuřičné β-glukozidázy Zm-p60.1. Školitel: B.
Brzobohatý
79. Stehlíková Martina: Monitorování výskytu spirochet v klíšťatech na lokalitě Pisárky
v Brně. 2002. Školitel: A. Žákovská.
80. Stibor Erik: Stanovení ploidie nádorových buněk pomocí fotometrických metod. 2003.
Školitel: P. Kuglík.
81. Ščudlová Romana: Vliv diety se zvýšeným obsahem bílkovin a její přerušované
podávání na některé metabolické parametry u laboratorní myši. 2000. Školitel: V.
Šimek.
82. Ševčíková Sabina: Význam genů fos a jun v myeloidní diferenciaci. 1999. Školitel: J.
Šmarda.
83. Šikutová Silvie: Ekologie spirochet vybraných skupin hematofágních členovců. 2002.
84. Šmeral Miloslav: Identifikace aminokyselinových zbytků zúčastňujících se na
interakci β-glukozidázy Zm-p60.1 se substrátem. 2001. Školitel: B. Brzobohatý
85. Tesařová Soňa: Sledování výskytu antiborreliových protilátek u divoce žijících zvířat.
86. Zahradníčková Eva: Studium genomové variability kmenů
epidermidis rezistentních k oxacilinu. 2000. Školitel: R. Pantůček.
Staphylococcus
87. Václavík Petr: Identifikace nových markerových chromozomů člověka pomocí
fluorescenční hybridizace in situ. 2000. Školitel: P. Kuglík.
88. Vaňhara Petr: Mechanismus účinků proteinů Jun a Fos na regulaci buněčného cyklu
leukemických buněk. 2004. Školitel: J. Šmarda.
108
89. Voborníková Marie: Molekulární epidemiologie MRSA ve FN Brno Bohunice. 2004.
Školitel: R. Pantůček.
90. Vodička Petr: Studium účinků retinoidových receptorů aktivovaných různými ligandy
na onkoprotein v-Myb. 1999. Školitel: J. Šmarda.
91. Vostal Karel: Zaváděcí metodiky elisa pro lékařské účely. 2002. Školitel:
A. Žákovská.
92. Zapletalová Eva: Molekulární diagnostika DMD, BMD a XLDC. 2003. Školitel:
L. Fajkusová.
93. Zatloukalová Jiřina: Úloha transkripčního koaktivátoru p300 v buňkách BM2. 2004.
Školitel: J .Šmardová.
94. Žežulková Dita: Analýza stability transgenu u Drosophila melanogaster pomocí PCR
a sekvencování. 2002. Školitel: K. Chroust.
109
Příloha 4
Dizertační práce
Seznam všech disertačních prací ukončených případně ještě řešených v letech 1999 až
2004
1. Borkovcová Petra: Molekulární a biochemická charakterizace vybraných členů rodiny
„phosphorelay“ mediátorů, které se mohou účastnit přesunu signálu hormonu cytokininu
u rostlin. Školitel: B. Brzobohatý.
2. Böhmová Gabriela: Dynamika změn proteomu v odpovědi na řízené modifikace hladin
rostlinných hormonů cytokininů. Školitel: B. Brzobohatý.
3. Bubeníčková Hana: Funkční analýza vybraných HPt genů u Arabidopsis thaliana.
4. Doškařová-Mannerová Sylva: Molekulární taxonomie grampozitivních koků
izolovaných ze zvířat. 2004. Školitel: I. Sedláček, školitel -specialista: R. Pantůček.
5. Eyer Luděk: Analýza proteinů polyvalentních stafylofágů. Školitel: J. Doškař.
6. Fohlerová Radka: Funkční architektura aktivního centra kukuřičné β-glukozidázy.
7. Fulnečková Jana: Nukleoproteinové komplexy rostlinných telomer. 2001. Školitel:
Fajkus
J.
8. Guo Jianchun - Čína: Regulated expression of ipt gene by pOp transcription system in
Arabidopsis. 2003. Školitel: B. Brzobohatý.
9. Hejátko Jan: Izolace a molekulární charakterizace mutantů Arabidopsis thaliana
vykazujících defekty v kontrole větvení. 2004. Školitel: B. Brzobohatý.
10. Horák Jakub: Molekulární mechanizmy účinků rostlinných hormonů cytokininů.
11. Horáková Mirka: Struktura a dynamika rostlinných telomer a subtelomer. 2000. Školitel:
J. Fajkus.
12. Hradilová Jana: Funkční analýza signálních drah cytokininů u Arabidopsis thaliana.
13. Hrstka Roman: Genotypová variabilita TSST-1 produkujících kmenů Staphylococcus
aureus. Školitel: J. Doškař.
14. Chytilová Eva, Mgr.: Aktivace genů pomocí T-DNA tagging. 1999. Školitel: J.
Relichová
110
15. Janouškovcová Eva: Sledování přítomnosti spirochet a jejich identifikace u
hematofágních a nehematofágních členovců a obratlovců v ČR. 2004. Školitel: A.
Žákovská.
16. Jedličková Dagmar: Molekulární typizace patogenních stafylokoků. Školitel: J. Doškař.
17. Kašpárek Petr: Molekulární základ mutací polyvalentního fága týkající se jeho rozmezí
hostitele. Školitel: J. Doškař.
18. Kiran N.S. - Indie: Role of sub-cellular compartmentation in the regulation of cytokinin
metabolism and action. Školitel: B. Brzobohatý.
19. Krejčí Kateřina: Detection of DNA Sequence Variants on Metaphase Chromosomes by
in Situ Techniques. 1999. Školitel: E. Paleček, školitel-specialista: J. Fajkus.
20. Krejčí Lumír: Homologous recombination in yeast - Beginning at the break, break at the
beginning. 2000. Školitel: J. Fajkus.
21. Kuchař Milan: Charakterizace telomer-vazebných proteinů. 2004. Školitel: J. Fajkus.
22. Kunická Zuzana: Molekulární analýza typických a alternativních telomer. 2004. Školitel:
J. Fajkus.
23. Kyjovská Zdeňka: Genetická determinace embryogeneze Arabidopsis thaliana. Školitel:
J. Řepková.
24. Lízal Pavel: Studium exprese genů pro pozdní kvetení u Arabidopsis thaliana. 2001.
Školitel: J. Relichová.
25. Maláska Jan: Molekulární prediktivní markery v onkologii. 2004. Školitel R. Vyzula,
školitel – specialista: J. Fajkus.
26. Michalová Eva: Molekulární základ
Staphylococcus. Školitel: J. Doškař.
rezistence
k antibiotikům
u
kmenů
r.
27. Miková - Rotková Gabriela: Studium regulace syntézy telomer s využitím genomických
přístupů. Školitel: J. Fajkus.
28. Navrátilová Jarmila: Studium podmínek suprese onkogenu v-myb proteinem p53.
29. Nejedlá Petra: Identifikace neznámých spirochét izolovaných z komárů. Školitel: A.
Žákovská.
30. Nemajerová Alice: Studium transkripčního koaktivátoru CBP. 2003. Školitel:
Šmarda.
J.
111
31. Netušil Jakub: Studium spirochét u exoparazitů hlodavců a jejich determinace. Školitel:
A. Žákovská.
32. Pallová Petra: Příprava specifické sondy pro detekci profágů serologické skupiny B u
kmenů Staphylococcus aureus a její lokalizace na restrikční mapě fága 53. 2000.
Školitel: J. Doškař.
33. Papoušek Ivo: Detekce mutací v genech spojených se syndromem prodlouženého QT
intervalu. Školitel: K. Chroust.
34. Pavlová Šárka: Funkční analýza nádorového supresoru p53. 2003. Školitel: J. Šmardová.
35. Pejchalová Kateřina: Studium výskytu Borrelia burgdorferi u obratlovců. Školitel: A.
Žákovská.
36. Pernisová Markéta: Studium biologické funkce receptoru cytokininů CKI1. Školitel: B.
Brzobohatý.
37. Procházková Martina: Analýza specifických chromozomových změn u onkologických
onemocnění metodami molekulární cytogenetiky. 2003. Školitel: P. Kuglík a J.P.
Merlio.
38. Reková Alena: Hormonální regulace exprese homeogenů u rostlin. Školitel: B.
Brzobohatý.
39. Rotrekl Vladimír: Strukturní a funkční analýza kukuřičné β-glukosidasy. 1999. Školitel:
I. Kučera, školitel – specialista: B. Brzobohatý.
40. Rusňáková Helena: Studium imunitních reakcí po injikaci borreliového antigenu u myší.
41. Schrumpfová Petra: Analýza rostlinných telomer-vazebných proteinů a jejich interakcí.
42. Skleničková Marie: Využití analýzy telomer v onkologické diagnostice. 2003. Školitel:
J. Fajkus.
43. Skříšovská Lenka: Studium proteinových interakcí pomocí dvojhybridního systému.
studium ukončeno, přechod na PhD studium v zahraničí (ETH). Školitel: J. Fajkus.
44. Souček Přemysl: Studium dominantních mutací navozených ektopickou expresí
klíčového enzymu metabolismu cytokininů (IPT) v transgenních rostlinách. Školitel: B.
Brzobohatý.
45. Sýkorová Eva: Subtelomera - začátek konce chromosomu. 2001. Školitel: J. Fajkus.
46. Šámalová Markéta: Vliv řízené lokální nadprodukce cytokininů na vývojové procesy u
tabáku. Školitel: B. Brzobohatý.
112
47. Ševčíková Sabina: Význam genu jun v myeloidní diferenciaci. 2003. Školitel: J. Šmarda.
48. Štěpán Jiří: Příprava molekulární sondy a PCR-primerů pro identifikaci kmenů S.
aureus. 2001. Školitel: J. Doškař.
49. Švec Pavel: Molekulární taxonomie grampozitivních koků. 2001. Školitel: J. Doškař.
50. Váňa Petr: Změny proteomu v průběhu indukované diferenciace buněk BM2. Školitel: J.
Šmarda.
51. Váňová Pavlína: Analýza proteomu Arabidopsis thaliana. Školitel: B. Brzobohatý.
52. Vostal Karel: Studium výskytu Borrelia burgdorferi u hlodavců. Školitel: A. Žákovská.
53. Zahradníčková Eva: Studium podmínek suprese onkoproteinu v-Myb. Školitel: J.
Šmarda.
54. Zapletalová Eva: Kvantitativní stanovení SMN1 a SMN2 genů u pacientů a
heterogenních přenašečů spinální muskulární atrofie. Školitel: L. Fajkusová.
55. Zouhar Jan: Biochemická charakterizace rekombinantních derivátů a bodových mutant
kukuřičné β-glukozidázy. 2000. Školitel: I. Kučera, školitel specialista: B. Brzobohatý.
113
Příloha 5
Monografie, popularizační články apod.
Abecední seznam registrovaný v databázi RIV
1. Doškař, Jiří. Bakterie a jejich viry. Živa - časopis pro biologickou práci, Praha :
Academia, nakladatelství AV ČR, XLIX, 3s. 101-104. ISSN 0044-4812. 2001. MSM
143100008, záměr.
2. Doškař, Jiří. Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc. In Kapitoly z histórie československej
mikrbiológie II. Bratislava : Československá spoločnosť mikrobiologická, 2002. od
s. 294-298, 5 s. Kapitoly z histórie československej mikrbiológie 2. ISBN 80-968712-8-5.
MSM 143100008, záměr.
3. Fajkus, Jiří - Ptáček, Jiří - Neplechová, Kamila - Novotná, Marcela. Studium konců
rostlinných chromozomů a jeho aplikace v charakterizaci odrůd bramboru. Vědecká práce
14, Havlíčkův Brod : Výzkumný ústav Bramborářský Havlíčkův B., 14, 1s. 47-54.
ISSN 80-902567-8-3. 2004. GA204/02/0027, projekt VaV. MSM 143100008, záměr.
4. Fajkus, Jiří - Zentgraf, Ulrike. Structure and Maintenance of Chromosome Ends in Plants.
In Telomerases, Telomeres and Cancer. Georgetown, New York : Landes Bioscience,
Kluwer Academic, 2002. od s. 314-331, 18 s. Molecular Biology Intelligence Unit 22.
ISBN 0-306-47437-9. MSM 143100008, záměr.
5. Marek, Jaromír - Trávníček, Z. Monokrystalová rentgenová strukturní analýza. první.
Olomouc : Vydavatelství Univerzity Palackého, 2002. 169 s. nedělí se na edice. ISBN 80244-0551-2. MSM 143100008, záměr.
6. Relichová, Jiřina - Doškař, Jiří. Geny na prodej. Brno : Masarykova univerzita, 2000. 5 s.
3. ISBN 1211-3384. MSM 143100008, záměr.
7. Relichová, Jiřina - Malina, Jaroslav. Panoráma biologické a sociokulturní antropologie 2:
Genetika. Editor: Jaroslav Malina. Brno (CZ) : Nadace Universitas Masarykiana v Brně,
nakladatelství a vydavatelství Nauma v Brně, 2000. 89 s. Modulové učební texty pro
studenty antropologie. Učební texty pro studenty antropologie a "příbuzných" oborů.
ISBN 80-210-2473-9. MSM 143100008, záměr.
8. Relichová, Jiřina. Dysgenika a eugenika z pohledu moderní genetiky. Univerzitní noviny,
List Masarykovy univerzity a Nadace Universitas Masarykiana, Brno : Nadace UM, 11,
6s. 29-37. ISSN 1211-6866. 1999. MSM 143100008, záměr.
9. Rosypal, Stanislav - Doškař, Jiří - Pantůček, Roman - Kailerová, Jana - Relichová, Jiřina Růžičková, Vladislava - Šmarda, Jan - Šmarda, Jan - Štěpán, Jiří. TERMINOLOGIE
MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE. První vydání. Brno : Vydavatel Prof. RNDr. Stanislav
Rosypal, DrSc. Vodova 80, 612 00 Brno, 2001. 300 s. České odborné termíny, definice a
anglické ekvival. ISBN 80-902562-3-6. MSM 143100008, záměr.
10. Růžičková, Vladislava. Viry - původci nemocí člověka, zvířat a rostlin (1). Biologie,
chemie, zeměpis, Praha : SPN, 8, 3s. 113-118. ISSN 1210-3349. 1999. MSM 143100008,
záměr.
11. Růžičková, Vladislava. Viry - původci nemocí člověka, zvířat a rostlin (2). Biologie,
chemie, zeměpis, Praha : SPN, 8, 4s. 163-167. ISSN 1210-3349. 1999. MSM 143100008,
záměr.
12. Řepková, Jana - Relichová, Jiřina. Genetika rostlin. 1. vyd. Brno : Masarykova univerzita
Brno, 2001. 269 s. 3489/Př-12/01-17/30. ISBN 80-210-2736-3. MSM 143100008, záměr.
13. Žákovská, Alena - Šerý, Omar - Pejchalová, Kateřina - Horváth, Radek - Janouškovcová,
Eva - Halouzka, Jiří. Monitoring of Presence of Borrelia burgdorferi sensu lato in Ixodes
Ricinus Ticks in Park Pisárky (BRNO) in 1996-1998: Dark-field Microscopy and PCR
114
Method. In Ticks and Tick-borne Pathogens: Into the 21st Century. První vydání.
Bratislava : Institute of Zoology, Slovak Academy of Sciences, 2000. s. 97-103. 1.
ISBN 80-88780-35-7. MSM 143100008, záměr. MSM 143100010, záměr.
115
Příloha 6
Odborné a personální zabezpečení
Průměrný počet pracovníků a přepočtený počet úvazků v jednotlivých řešitelských týmech a
celkově za šest let řešení výzkumného záměru uvádí následující tabulka (podrobný rozpis
v jednotlivých letech řešení následuje na dalších stranách).
Počet pracovníků / Počet přepočtených úvazků (průměr za léta 1999-2004)
Doškař
Brzobohatý
Šmarda
Fajkus
Celkem cca
6,7 / 1,9
28,5 / 19,6
5,0 / 1,4
11,7 / 7,2
52 / 30
116
Rok 2004
Seznam pracovníků a jejich odborné zařazení ve členění podle jednotlivých problematik ukazuje
následující tabulka. Z poznámky jsou patrné personální změny. Tyto změny nebyly z hlediska řešení
problematiky podstatné.
Vysvětlivky:
LFGP – Laboratoř funkční genomiky a proteomiky
KGMB – Katedra genetiky a molekulární biologie
KFŽ – Katedra srovnávací fyziologie živočichů a obecné zoologie
KFAR – Katedra fyziologie a anatomie rostlin
PVG – Pracoviště výzkumu genomu
Jméno a tituly
Doškař Jiří, Prof. RNDr. CSc.
Pantůček Roman, Mgr. Ph.D.
Růžičková Vladislava, RNDr.CSc.
Žákovská Alena, Doc.RNDr. Ph.D.
Pracoviště
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KFŽ
Prac. zařazení, úvazek na VZ
Docent/Prof
0,3
Odborný asistent
0,3
Odborný asistent
0,3
Odb.asistent /doc
0,2
Káňová Kateřina
PVG-KGMB
Laborantka
0,5
Pozn.
Od 18.10.
MD
Brzobohatý Břetislav, Doc. RNDr. LFGP
CSc.
Hejátko Jan, Mgr., Ph.D.
LFGP
Konečná Hana, RNDr.
LFGP
Kuderová Alena, RNDr.CSc.
LFGP
Lexa Matej, Ing.Ph.D.
LFGP
VVV pracovník
0,5
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
VVV pracovník
0,5
1,0
1,0
1,0
Drbálková Eva
Nejedlá Eliška, RNDr.CSc.
Zouhar Jan, Mgr.
Kiran Nagavalli Subbanna, MSc.
Rotkovská Julie, Ing.
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
VVV pracovník
Odborný pracovník
1,0
1,0
0,5
1,0
1,0
Genkov Todor Nikolaev, PhD.
Urbánková Ivana, Mgr.
Koukalová Šárka
LFGP
LFGP
LFGP
VVV pracovník
1,0
Odborný pracovník
1,0
0,1 (do 30.9.)/0,5 Do 19.2.
Pernisová Markéta, Bc.
Bendová Renata
Janda Lubomír
Válková Martina
Paděrová Eva, Mgr.
Dobešová Romana
Zdráhal Zbyněk, RNDr.
Marek Jaromír, Doc. RNDr., CSc.
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
VVV pracovník
Laborantka
0,5
laborantka
Odborný pracovník
laborantka
Odborný pracovník
Docent
zahr. stáž,
do 31.8.
zahr. stáž
Od 19.3.
MD
zahr. stáž
MD
1,0
0,5
Od 1.7.
1,0
1,0
1,0
1,0
1,0
Do 19.9.
117
Lízal Pavel, RNDr. Ph.D.
Relichová Jiřina, Prof.RNDr.CSc.
Řepková Jana, RNDr.CSc.
Urbánková Jaroslava
Dubová Jaroslava, RNDr.CSc.
Hájková Martina, Ing.
Dudová Markéta, Mgr.
Kratochvílová Hana - Ryšavá
Soldánová Radka
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
LFGP-KFAR
LFGP-KFAR
PVG
LFGP
LFGP
Odborný asistent
Profesor
Odborný asistent
Laborantka
Odborný asistent
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Laborantka
Technik
0,3
0,4
0,3
0,5
0,2
0,2
0,3
0,5
1,0
Šmarda Jan, Doc. RNDr. CSc.
Chroust Karel, RNDr. Ing. Ph.D.
Kuglík Petr, Doc.RNDr.CSc.
Šmardová Jana, RNDr. CSc.
Beneš Petr, RNDr., Ph.D.
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG
PVG-KGMB
Docent
Odborný asistent
Odb. asistent/docent
Odborný pracovník
Odborný asistent
0,3
0,3
0,3
0,2
0,2
Fajkus Jiří, Doc.RNDr.CSc.
Fajkusová Lenka, RNDr.CSc.
Kubičárová Tatiana, Mgr.CSc.
Kuchař Milan, Mgr.
Kunická Zuzana, Ing.
Rotková - Miková Gabriela, Mgr.
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
VVV pracovník
VVV pracovník
VVV pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
0,5
0,5
1,0
1,0
0,5
0,5
Neplechová Kamila, RNDr.Ph.D.
Novotná Marcela
Schrumpfová Petra, Mgr.
Sýkorová Eva, Mgr.CSc.
Zachová Dagmar, RNDr.
Fulnečková Jana
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
Odborný pracovník
Technik
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
1,0
1,0
0,5
0,5
0,75
Skříšovská Lenka
LFGP
Šišková Helena
LFGP
Laborantka
1,0
Od 1.10.
Od
MD
2.6.
Od
1.1.
MD
Od.1.1.
zahr. stáž
Od. 1.3.
118
Rok 2003
Vysvětlivky:
Jméno a tituly
Doškař Jiří, Doc. RNDr. CSc.
Dendis Miloš, Mgr.
Šerý Omar, Mgr. Ph.D.
Žákovská Alena, RNDr. Ph.D.
Káňová Kateřina
Pracoviště
PVG-KGMB
PVG
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KFŽ
PVG-KFŽ
PVG-KGMB
Docent
0,3
Odborný pracovník
0,1
Odborný asistent
0,3
Odborný asistent
0,3
Odborný asistent
0,1
Odborný asistent
0,2
Laborantka
0,5
Brzobohatý Břetislav, RNDr.CSc.
Hejátko Jan, Mgr.
Lexa Matej, Ing.PhD
Drbálková Eva
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
VVV pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
VVV pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
0,5
0,5
1,0
1,0
1,0
0,5
1,0
Zouhar Jan, Mgr.
Urbánková Ivana, Mgr.
Petlanová Zuzana, RNDr.
Bendová Renata
Reková Alena
Válková Martina
Dobešová Romana
Kyjovská Zdenka, Mgr.
Kratochvílová Hana
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
LFGP-KFAR
LFGP-KFAR
PVG
LFGP
Odborný pracovník
VVV pracovník
Odborný pracovník
VVV pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
VVV pracovník
Laborantka
Odborný pracovník
laborantka
Odborný pracovník
laborantka
Odborný pracovník
Docent
Odborný asistent
Profesor
Odborný asistent
Laborantka
Odborný asistent
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Laborantka
0,5
1,0
1,0
1,0
1,0
0,75
1,0
0,5
1,0
1,0
1,0
1,0
1,0
1,0
0,3
0,4
0,3
0,5
0,2
0,2
0,3
0,5
Pozn.
od 1.7.
0,6 od 1.9.
do 30.6.
zahr. stáž
zahr. stáž
zahr. stáž
do 3.6.
do 28.2.
do 28.2.
119
Soldánová Radka
LFGP
Technik
1,0
od 21.7.
Kuglík Petr, RNDr.CSc.
Beneš Petr, RNDr., Ph.D.
Ševčíková Sabina, Mgr.
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG
PVG-KGMB
PVG
Docent
Odborný asistent
Odborný asistent
Odborný pracovník
Odborný asistent
Odborný pracovník
0,3
0,3
0,3
0,2
0,2
1,0
do 28.2.
Fajkus Jiří, RNDr.CSc.
Kuchař Milan, Mgr.
Rotková - Miková Gabriela, Mgr.
Novotná Marcela
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
VVV pracovník
VVV pracovník
VVV pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Technik
Odborný pracovník
Odborný pracovník
0,5
0,5
1,0
0,5
0,5
0,5
1,0
1,0
0,5
0,5
LFGP
Odborný pracovník
0,75
od
1.9.
zahr. stáž
120
Rok 2002
Vysvětlivky:
FGP – Pracoviště funkční genomiky a proteomiky
Jméno a tituly
Kašpárek Petr, Mgr.
Pracoviště
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KFŽ
PVG-KFŽ
Docent
0,2
Odborný pracovník
0,3
Odborný asistent
0,2
Odborný asistent
0,2
Odborný asistent
0,1
Odborný asistent
0,2
Hejátko Jan, Mgr.
Klánová Jana, RNDr.
Lexa Matej, Ing.PhD
FGP
LFGP
FGP
FGP
FGP
FGP
VVV pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
VVV pracovník
0,5
0,5
0,27
1,0
1,0
1,0
Drbálková Eva
Koukalová Šárka, Mgr.
Zouhar Jan, Mgr.
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
VVV pracovník
Odborný pracovník
VVV pracovník
0,5
1,0
1,0
0,5
1,0
1,0
1,0
Davidová - Urbánková Ivana, Mgr.
Bendová Renata
Reková Alena
Válková Martina
Dobešová Romana
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGM
PVG-KFAR
PVG-KFAR
Odborný pracovník
Odborný pracovník
VVV pracovník
Laborantka
Odborný pracovník
laborantka
Odborný pracovník
laborantka
Odborný pracovník
Docent
Odborný asistent
Profesor
Odborný asistent
Laborantka
Odborný asistent
Odborný pracovník
1,0
0,79
0,5
0.5
1.0
1,0
1,0
1,0
1,0
1,0
0,2
0,2
0,2
0,6
0,2
0,2
Pozn.
0,6 od 1.9.
do 30.9.02
0,6 od 1.9.
0,6 od 1.9.
do28.2.02
Od
7.9.
zahr. stáž
od1.12. 02
MD
zahr. stáž
Od 8.11
zahr. stáž
od1.10 1,0
od 1. 9. 02
od1.11. 02
0,6 od 1.9.
0,6 od 1.9.
0,6 od 1.9.
od 1.9.
121
Trávníčková Božena
PVG
PVG-KFAR
Odborný pracovník
Laborantka
0,3
0,2
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG
Docent
Odborný asistent
Odborný asistent
Odborný pracovník
0,2
0,2
0,2
0,2
Kuchař Milan, Mgr.
Miková Gabriela, Mgr.
Novotná Marcela
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
FGP
VVV pracovník
VVV pracovník
VVV pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Technik
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
0,5
0,5
1,0
0,5
0,5
0,5
1,0
1,0
0,88
0,5
0,70 od 1.9.
0,6 od 1.9.
0,6 od 1.9.
0,3 od 1.9.
122
Rok 2001
Vysvětlivky:
Jméno a tituly
Pracoviště
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KFŽ
PVG-KFŽ
Prac. zařazení, prům.
úvazek na VZ
Docent
Odborný pracovník
Laborantka
Odborný pracovník
Odborný asistent
Odborný asistent
Odborný asistent
Odborný asistent
roční poznám
ka
0,4
0,4
0,4
od 1.10.
0,3
0,4
0,4
0,2
0,2
Kailerová Jana, RNDr. CSc.
Káňová Kateřina - Konečná
Kašpárek Petr, Mgr.
Hejátko Jan, Mgr.
Lexa Matej, Ing.PhD
Bastlová Dana, RNDr.
Zouhar Jan, Mgr.
Davidová Ivana, Mgr.
Bendová Renata
Hradilová Jana, Mgr.
Vévodová, Jitka, Mgr.
Souček Přemysl, Mgr.
Machová Helena
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG-KFAR
PVG-KFAR
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Laborantka
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Docent
Odborný asistent
Profesor
Odborný asistent
Laborantka
Odborný asistent
Odborný pracovník
0,5
0,5
0,27
1,0
1,0
1,0
1,0
1,0
1,0
0,5
1,0
1,0
1,0
1,0
0,79
0,5
0,88
0,5
0,5
1,0
0,5
1,0
1,0
0,2
0,4
0,4
0,4
0,4
0,4
do 31.12.
od 1.2.MD
od 1.8.
od 1.10.
do 30.6.
od 1.9.
od 1.10.
od 1.10.
123
od 1.10.
PVG
PVG-KFAR
Odborný pracovník
Laborantka
0,3
0,4
Hořín Petr, Prof. RNDr. MVDr. CSc.
Ryšávka Petr, Mgr.
Šimek Vladimír, Prof.RNDr.CSc.
PVG-KGMB
PVG
PVG-KGMB
PVG-KGMB
PVG
PVG-KFŽ
PVG
Docent
Profesor
Odborný asistent
Odborný asistent
Odborný pracovník
Profesor
Odborný pracovník
0,4
0,1
0,4
0,4
0,3
0,2
0,2
Fajkusová Lenka, RNDr.
Fulnečková Jana, Mgr.
Krejčí Lumír, Mgr.
Kubičárová Tatiana, Mgr.
Miková Gabriela
Schrumpfová Petra
Skříšovská Lenka, Mgr.
Sýkorová Eva, Mgr.
Kuchař Milan, Mgr.
Novotná Marcela
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
LFGP
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Technik
0,5
0,5
1,0
1,0
1,0
0,88
0,5 od 1.7.
1,0 od 1.7.
0,5
0,5
0,5
1,0
1.10.-31.12.
1.10.-17.12
od 1.10.
124
Rok 2000
Vysvětlivky:
LMFR – Laboratoř molekulární fyziologie rostlin
ABVMK - Laboratoř analýzy biologicky významných molekulárních komplexů
Od 1. 9. 2000 byla sloučena pracoviště LMFR a ABVMK v jedno stálé akademické pracoviště Přírodovědecké
fakulty MU „Laboratoř funkční genomiky a proteomiky“ (LFGP), vedoucí dr. Fajkus. Zbývající kapacity VZ
byly od 1. 9. 2000 organizačně začleněny do nově vzniklého dočasného akademického pracoviště „Pracoviště
výzkumu genomu“ (PVG), vedoucí prof. Relichová.
Jméno a tituly
Káňová Kateřina - Konečná
Pantůček Roman, Mgr. PhD.
Šerý Omar, Mgr.
Žákovská Alena, RNDr. PhD.
Pracoviště Prac. zařazení, prům.
úvazek na VZ
KGMB
Docent
KGMB
Odborný pracovník
KGMB
Laborantka
KGMB
Odborný asistent
KGMB
Odborný asistent
KFŽ
Odborný asistent
KFŽ
Odborný asistent
0,3
0,3
0,3
0,3
0,3
0,2
0,3
Hejátko Jan, Mgr.
Lexa Matej, Ing.PhD
Bastlová Dana, RNDr.
Zouhar Jan, Mgr.
Bubeníčková Hana, Mgr.
Bendová Renata
Fajtová Jitka, Mgr.
Vévodová, Jitka, Mgr.
Lízal Pavel, Mgr.
Machová Helena
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
KGMB
KGMB
KGMB
KGMB
KFAR
0,5
0,5
1,0
1,0
1,0
1,0
1,0
1,0
1,0
0,5
1,0
1,0
1,0
0,5
1,0
0,5
1,0
0,5
0,5
0,4
0,15
0,3
0,3
0,2
0,3
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Laborantka
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Docent
VVV asistent
Profesor
Odborný asistent
Laborantka
Odborný asistent
roční poznámka
od 1. 12
do 30. 9.
od 20. 11.
od 1. 9
od 1. 5.
od 1. 9.
125
KFAR
KFAR
Odborný pracovník
Laborantka
0,3
0,2
KGMB
KGMB
KGMB
KFŽ
Docent
Odborný asistent
Odborný asistent
Profesor
0,3
0,3
0,3
0,2
Horáková Mirka, Mgr. (Hulánová)
Skleničková Marie, Mgr.
Krejčí Kateřina, Mgr. PhD.
Kuchař Milan, Mgr.
Novotná Marcela
ABVMK
ABVMK
ABVMK
ABVMK
ABVMK
ABVMK
ABVMK
ABVMK
ABVMK
ABVMK
ABVMK
ABVMK
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Odborný pracovník
Technik
0,5
0,5
0,5
0,5
1,0
1,0
0,3
0,5
0,3
0,3
0,8
1,0
od3.9. MD
od14.3.MD
od 1. 7.
od 1.11.
126
Rok 1999
Vysvětlivky:
LMFR – Laboratoř molekulární fyziologie rostlin
LAMK - Laboratoř analýzy biologicky významných molekulárních komplexů
A – Akademičtí pracovníci vykonávající kromě výzkumu i výuku
N – Neakademičtí pracovníci pracující na výzkumu
Jméno a tituly
Doškař Jiří, Doc.RNDr.CSc.
Pantůček Roman, Mgr. PhD.
Rosypal Stanislav, Prof.RNDr.DrSc.
Šerý Omar, Mgr.
Žákovská Alena, RNDr. PhD.
Pracoviště
KGMB
KGMB
KGMB
KGMB
KGMB
KFŽ
KFŽ
Prac. zařazení
Docent
Výzkumný pracovník
Odborný asistent
Profesor
Odborný asistent
Odborný pracovník 0,5
Odborný asistent
poznámka
Hejátko Jan, Mgr.
Lexa Matej, Ing.PhD
Mlejnek Petr, RNDr.CSc.
Zouhar Jan, Mgr.
Bubeníčková Hana, Mgr.
Reková Alena, Bc.
Lízal Pavel, Mgr.
Hermanová Klára, Ing.
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
LMFR
KGMB
KGMB
KGMB
KFAR
KFAR
KFAR
N
N
N
N
N
N
N
N
Odborný pracovník
N
N
N
N
Odborný pracovník
N
Odborný pracovník 0,5 N
Výzkumný pracovník 0,5 A
Profesor
A
Odborný asistent
A
Odborný asistent
A
A
Odborný pracovník
N
Šmarda Jan, Doc.RNDr.CSc.
Chroust Karel, RNDr.Ing.PhD.
KGMB
KGMB
KGMB
KGMB
KFŽ
Docent
Odborný asistent
Odborný asistent
Profesor
A
A
N
A
A
LAMK
N
A
N
A
A
A
N
A
do 31.8.99
do 31.3.99
od 1.1.99
od 1.1.99
od 8.11.99
od 1.10.99
od 1.5.99
od 10.5.99
do 31.8.99
od 1.10.99
127
Horáková Mirka, Mgr. (Hulánová)
Poláčková Klára, Bc.
Skleničková Marie, Mgr.
Krejčí Kateřina, Mgr. PhD.
LAMK
LAMK
LAMK
LAMK
LAMK
LAMK
LAMK
LAMK
LAMK
N
N
A
A
N
N
N
N
N
2.10.99MD
od 28.6.99
od 1.7.99
od 1.4.99
od 1.4.99
128

Závěrečná zpráva o řešení výzkumného záměru

Transkript

Podobné dokumenty

Zamer prodeje pudy fodor

My Website - Pilulka.sk